تحديد عمر الأحماض الأمينية
يُعدّ التأريخ بالأحماض الأمينية، أو التأريخ بالتماثل الضوئي ، تقنيةً تُستخدم لتقدير عمر العينات في علم الأحياء القديمة ، وعلم الحفريات الجزيئي ، وعلم الآثار ، وعلم الأدلة الجنائية ، وعلم الحفريات ، والجيولوجيا الرسوبية ، وغيرها من المجالات. تربط هذه التقنية التغيرات في جزيئات الأحماض الأمينية بالوقت المنقضي منذ تكوّنها. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
خلفية
كيمياء


الأحماض الأمينية هي مجموعة من المركبات العضوية التي تستخدمها الكائنات الحية لتخليق البروتينات . جميع الأحماض الأمينية (باستثناء الجلايسين ) [ 6 ] لها زوج واحد أو أكثر من المتصاوغات الفراغية ، وهي متصاوغات تشترك في نفس رتبة الرابطة ولكنها تختلف في ترتيبها في الفضاء ثلاثي الأبعاد. يُطلق على زوج معين من المتصاوغات الفراغية النشطة ضوئيًا وغير القابلة للتطابق كصور معكوسة اسم المتصاوغات المرآتية ؛ أما الأزواج التي لا تتطابق كصور معكوسة فتُسمى المتصاوغات غير المرآتية أو المتصاوغات المتماثلة . [ 7 ] قد تخضع المتصاوغات الفراغية للجزيء نفسه لتفاعلات (تُعرف باسم التماثل أو التماثل، حسب نوع زوج المتصاوغات الفراغية المعنية) [ 8 ] تُحوّلها إلى متصاوغات فراغية أخرى.
تتميز الأنظمة البيولوجية بانتقائيتها الفراغية ، حيث تفضل متصاوغات فراغية معينة للتفاعلات الكيميائية؛ وتحتفظ الكائنات الحية بجميع أحماضها الأمينية في صورها "اليسرى" ( L أو levo- ) (وهي حالة تُسمى التماثل الفراغي ) لأنها غير قادرة على استخدام الصور "اليمنى" ( D أو dextro- ) لتخليق البروتين. [ 6 ] [ 7 ] [ 3 ]
عندما يعجز الكائن الحي عن الحفاظ على توازن الأحماض الأمينية في تلك النسبة غير المتوازنة، كما يحدث عند موته أو فقدانه للأنسجة، فإن النظام يتجه نحو التوازن الكيميائي . ويتيح قياس تقدم هذا التفاعل التحويلي تقدير وقت وفاة الكائن الحي، مع مراعاة المتغيرات البيئية كالرطوبة ودرجة الحرارة. [ 6 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 9 ]
خصائص الأحماض الأمينية والظروف البيئية
الأحماض الأمينية الشائعة الاستخدام في تحليل تحديد عمر الأحماض الأمينية هي الليوسين، وحمض الأسبارتيك، والفالين، وحمض الجلوتاميك ، والدايستيريومر إيزوليوسين . [ 6 ]
تؤثر خصائص الأحماض الأمينية المختارة للتحليل على نوع التأريخ الممكن إجراؤه. تحدث تفاعلات تحويل الأحماض الأمينية بسرعات متفاوتة: يتحول حمض الأسبارتيك إلى مزيج راسيمي بسرعة كبيرة، ولذلك يُستخدم للعينات الحديثة التي تتطلب دقة عالية، [ 6 ] بينما يستغرق الفالين والليوسين وقتًا أطول بكثير للتحول إلى مزيج راسيمي ، وهما أكثر ملاءمة للحفريات القديمة. بالإضافة إلى ذلك، تتأثر معدلات هذه التفاعلات بدرجة الحرارة، وذلك تبعًا لنوع تفاعل التحويل المحدد. يتغير معدل تحول حمض الأسبارتيك إلى مزيج راسيمي مع تغيرات طفيفة في درجة الحرارة، بينما يكون معدل تحول الفالين إلى مزيج راسيمي أقل تأثرًا بدرجة الحرارة. [ 2 ] [ 6 ] [ 9 ]
إلى جانب ارتفاع درجات الحرارة الذي يُسرّع تفاعلات التحويل المتبادل، تؤثر متغيرات بيئية أخرى أيضًا على معدلات التفاعل. فالبيئات الرطبة تُنتج معدلات تفاعل أسرع، [ 3 ] وقد تُحفّز تفاعلات التحويل المتبادل بوجود الأحماض أو القواعد أو الكاتيونات المعدنية. [ 10 ] كما تُدخل الكائنات الحية أو التصنيفات المضيفة المختارة تحيزًا في تقديرات العمر. [ 11 ]
تتحول الأحماض الأمينية المرتبطة داخل الببتيدات ببطء أكبر من تلك الحرة أو التي تشغل الموقع الطرفي لسلاسل الببتيد. وتزداد درجة تحلل الببتيدات (وبالتالي سرعة الوصول إلى حالة التوازن) مع تقدم عمر الأحافير. [ 2 ] [ 10 ]
التطبيقات
يُستخدم التأريخ بالأحماض الأمينية في علم الآثار ، [ 4 ] وعلم الطبقات ، وعلم المحيطات ، والجغرافيا القديمة ، وعلم الأحياء القديمة ، وعلم المناخ القديم . [ 4 ] وتشمل هذه التطبيقات: ربط التواريخ، والتأريخ النسبي، وتحليل معدل الترسيب، ودراسات نقل الرواسب، [ 12 ] وعلم الأحياء القديمة الحفظي ، [ 13 ] وعلم الحفريات والمتوسط الزمني، [ 14 ] [ 15 ] [ 11 ] وتحديد مستوى سطح البحر، وإعادة بناء التاريخ الحراري. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]
يمكن استخدام التأريخ بالأحماض الأمينية لتحديد عمر العينات القديمة جدًا بحيث لا يُجدي معها التأريخ بالكربون المشع (الذي يتراوح مداه الأقصى بين 40 ألف سنة و0 ألف سنة)، أو الحديثة جدًا بحيث لا يُجدي معها التأريخ بالبوتاسيوم-أرجون (الذي يتراوح مداه بين 40 ألف سنة و150 ألف سنة). [ 4 ] [ 9 ] كما يُمكن التحقق من التأريخ بالكربون المشع وتقنيات التأريخ الأخرى بالمقارنة مع التأريخ بالأحماض الأمينية. [ 20 ] وقد أمكن في بعض الأحيان أيضًا استكمال نطاقات الاحتمالية الكبيرة، مثل تلك الناتجة عن التباين في مستويات الكربون -14 في جميع أنحاء المحيط الحيوي.
أسهمت دراسات العظام والأصداف والرواسب إسهامًا كبيرًا في السجل الأحفوري، بما في ذلك ما يتعلق بأشباه البشر . وقد أُجريت العديد من الدراسات في علم الأمراض القديمة والاختيار الغذائي، والجغرافيا الحيوانية القديمة والسكان الأصليين، والتصنيف وعلم الحفريات ، وقابلية الحمض النووي للحياة. كما تم تقييم التغيرات الثقافية البشرية وتأثيراتها على البيئات المحلية باستخدام هذه التقنية؛ وفي بعض الأحيان، يصبح من الممكن التمييز بين العظام والأصداف والبقايا المطبوخة وغير المطبوخة.
يلعب التماثل الفراغي للأحماض الأمينية دورًا في دراسات تدهور الأنسجة والبروتينات، وهو أمرٌ بالغ الأهمية في تطوير أساليب حفظ المتاحف. وقد أسفرت هذه الدراسات عن نماذج لتدهور المواد اللاصقة البروتينية وغيرها من البوليمرات الحيوية، بالإضافة إلى تطور نظام المسام المصاحب. ويُعدّ انخفاض قدرة الجسم على إصلاح نفسه أثناء الشيخوخة أمرًا بالغ الأهمية لدراسات الشيخوخة والأمراض المرتبطة بها ، كما يسمح بتحديد عمر الحيوانات الحية.
يمكن لعلم الطب الشرعي استخدام هذه التقنية لتقدير عمر الجثة [ 21 ] أو قطعة فنية لتحديد أصالتها.
طُرق
يتضمن تحليل التماثل الضوئي للأحماض الأمينية تحضير العينة، وعزل الحمض الأميني المطلوب، وقياس نسبة D:L الخاصة به. يشمل تحضير العينة تحديد البروتينات واستخلاصها وفصلها إلى أحماضها الأمينية المكونة لها، وذلك عادةً عن طريق طحن العينة متبوعًا بالتحلل المائي الحمضي. يمكن دمج ناتج التحلل المائي لمشتق الحمض الأميني مع مادة فلورية محددة للتماثل الضوئي ، وفصله بواسطة الاستشراب [ 4 ] أو الرحلان الكهربائي ، وتحديد نسبة D:L الخاصة بالحمض الأميني باستخدام الفلورة. بدلاً من ذلك، يمكن فصل الحمض الأميني المحدد بواسطة الاستشراب أو الرحلان الكهربائي، ودمجه مع كاتيون معدني ، وتحديد نسبة D:L باستخدام مطياف الكتلة .
يميل تحليل التماثل الضوئي التقليدي إلى الإبلاغ عن نسبة D- ألوإيزولوسين / L- إيزولوسين (نسبة A/I أو D/L). [ 4 ] يتميز هذا الزوج من المتصاوغات الفراغية بسهولة قياسه نسبيًا وفائدته الزمنية خلال العصر الرباعي . [ 22 ]
يمكن لتقنيات كروماتوغرافيا السائل عالي الأداء ذات الطور المعكوس قياس ما يصل إلى 9 أحماض أمينية مفيدة في علم تحديد العمر الجيولوجي على نطاقات زمنية مختلفة في كروماتوغرام واحد ( حمض الأسبارتيك ، حمض الجلوتاميك ، السيرين ، الألانين ، الأرجينين ، التيروسين ، الفالين ، الفينيل ألانين ، الليوسين ). [ 23 ] [ 24 ]
يعتمد تحديد عمر الأحماض الأمينية على افتراض أن جزء الأحماض الأمينية المدروسة كان نظامًا مغلقًا منذ تكوينه، دون أي تبادل مع محيطه. ويؤدي إزالة الأحماض الأمينية التي انتشرت في العينة من محيطها إلى تقليل تباين النتائج، وذلك بضمان إجراء التحليل على الجزء الأكثر تمثيلًا من الأحماض الأمينية فقط. قد تشمل طرق التنظيف هذه نقع عينات المعادن الحيوية المسحوقة في المُبيّض قبل استخلاص الأحماض الأمينية، مما يؤدي إلى تدمير الأحماض الأمينية في المناطق الأكثر مسامية وانفتاحًا، مع الحفاظ على الجزء المحصور داخل الحبيبات سليمًا. [ 25 ] [ 6 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ بادا، ج. ل. (1985). "تحديد عمر العظام الأحفورية باستخدام تقنية التماثل الضوئي للأحماض الأمينية". المراجعة السنوية لعلوم الأرض والكواكب . 13 : 241-268 . رمز Bibcode : 1985AREPS..13..241B . doi : 10.1146/annurev.ea.13.050185.001325 .
- 1 2 3 4 كانويرا إل، غارسيا-مارتينيز إم جيه، ياماس جيه إف، أورتيز جيه إي، توريس تي دي (2003). "حركية تحويل الأحماض الأمينية إلى متصاوغات فراغية (إبيميريزيشن) في عاج أسنان الدببة الأحفورية والحديثة" . المجلة الدولية للحركية الكيميائية . 35 (11): 576-591 . doi : 10.1002/kin.10153 .
- 1 2 3 4 بادا جيه إل، ماكدونالد جي دي (1995). "تحوّل الأحماض الأمينية إلى متصاوغات ضوئية على سطح المريخ: دلالات على حفظ الجزيئات الحيوية من كائنات حية منقرضة على سطح المريخ" . إيكاروس . 114 (1): 139-143 . Bibcode : 1995Icar..114..139B . doi : 10.1006/icar.1995.1049 . PMID 11539479 .
- 1 2 3 4 5 6 جونسون، بي جيه، وميلر، جي إتش (1997). "التطبيقات الأثرية لتماثل الأحماض الأمينية". علم الآثار . 39 (2): 265-287 . Bibcode : 1997Archa..39..265J . doi : 10.1111/j.1475-4754.1997.tb00806.x .
- ↑ سكارپوني د، كوفمان د، برايت ج، كواليفسكي م (أكتوبر 2008). "تحديد متوسط الزمن في تسلسلات الترسيب من الرتبة الرابعة: تأريخ تماثل الأحماض الأمينية المُعاير بالكربون المشع لأصداف الرخويات من العصر الرباعي المتأخر من سهل بو، إيطاليا" . ملخصات الجمعية الجيولوجية الأمريكية مع البرامج . 40 (6): 502. مؤرشف من الأصل في 22 يناير 2015.
تُقدم النتائج دليلاً قاطعاً على إمكانية تطبيق طرق تماثل الأحماض الأمينية كأداة لتقييم التغيرات في ديناميكيات الترسيب، ومعدلات الترسيب، ومتوسط الزمن، والدقة الزمنية للسجل الأحفوري، والآثار التافونومية عبر دورات الطبقات التسلسلية.
- 1 2 3 4 5 6 7 موراي-والاس، كولين ف.؛ هدايت، رحمادي؛ بيريبو، نعومي (22 أكتوبر 2024). "تطبيق تحويل الأحماض الأمينية إلى راسيميات لتحديد عمر المنخربات وتحديد الأحافير المعاد تشكيلها والرواسب المعاد تشكيلها" . مجلة أبحاث المنخربات . 54 (4): 375-393 . Bibcode : 2024JForR..54..375M . doi : 10.61551/gsjfr.54.4.375 . تاريخ الاسترجاع: 25 أغسطس 2025 .
- 1 2 بنكمان، كيرستي (12 أغسطس 2016). موسوعة علم الآثار الجيولوجية. سلسلة موسوعة علوم الأرض . دوردريخت سبرينغر. ص 14-15 .
- ↑ مكوي، دبليو دي (1987). "دقة التأريخ الجيولوجي للأحماض الأمينية وقياس درجات الحرارة القديمة". مراجعات علوم العصر الرباعي . 6 (1): 43-54 . Bibcode : 1987QSRv....6...43M . doi : 10.1016/0277-3791(87)90016-3 .
- 1 2 3 "المنهج" . مختبر تحديد العمر الجيولوجي للأحماض الأمينية . جامعة شمال أريزونا. مؤرشف من الأصل في 2 أكتوبر 2016.
- 1 2 باوم، روكي؛ سميث، غرانت ج. (نوفمبر 1986). "دراسة منهجية للأس الهيدروجيني على عملية التماثل الضوئي للأحماض الأمينية الحرة المحفزة بالأحماض والقواعد لتحديد الثوابت الستة، ثابت واحد لكل نوع من الأنواع الأيونية الثلاثة". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية (108): 7325-7327 . doi : 10.1021/ja00283a030 .
- 1 2 كوسنيك، إم. أ.، هوا، كيو.، كوفمان، دي. إس.، ووست، آر. إيه. (2009). "التحيز التافونومي والمتوسط الزمني في تجمعات موت الرخويات الاستوائية: فترات نصف عمر مختلفة للأصداف في رواسب الحاجز المرجاني العظيم". علم الأحياء القديمة . 35 (4): 565-586 . Bibcode : 2009Pbio...35..565K . doi : 10.1666/0094-8373-35.4.565 . S2CID 5839861 .
- ↑ كوسنيك وآخرون (2007). "اختلاط الرواسب والاضطراب الطبقي كما كشفته بنية أعمار أصداف التلينا في رواسب الحاجز المرجاني العظيم". الجيولوجيا . 35 (9): 811-814 . Bibcode : 2007Geo....35..811K . doi : 10.1130/G23722A.1 .
- ↑ كواليفسكي م، سيرانو ج. إي، فليسا ك. و، جودفريند ج. أ (2000). "إنتاجية دلتا ميتة سابقة: تريليونا صدفة عند مصب نهر كولورادو". جيولوجيا . 28 (12): 1059-1062 . Bibcode : 2000Geo....28.1059K . doi : 10.1130/0091-7613(2000)28 < 1059:DDFPTT > 2.0.CO ; 2 .
- ↑ كارول م، كواليفسكي م، سيمويس م ج، غودفريند ج أ (2003). "تقديرات كمية للمتوسط الزمني في تراكمات أصداف عضديات الأرجل من فصيلة تيريبراتوليد من جرف قاري استوائي حديث". علم الأحياء القديمة . 29 (3): 381-402 . Bibcode : 2003Pbio...29..381C . doi : 10.1666/0094-8373(2003)029 < 0381:QEOTIT > 2.0.CO ; 2. S2CID 131237779 .
- ↑ كيدويل إس إم، بيست إم إم، كوفمان دي إس (2005). "المفاضلات التافونومية في تجمعات الموت البحرية الاستوائية: التوسط الزمني التفاضلي، وفقدان الأصداف، والتحيز المحتمل في السحنات السيليسية مقابل السحنات الكربوناتية". الجيولوجيا . 33 (9): 729-732 . Bibcode : 2005Geo....33..729K . doi : 10.1130/G21607.1 .
- ↑ مكوي، دبليو دي (1987). "دقة التأريخ الجيولوجي للأحماض الأمينية وقياس درجات الحرارة القديمة". مراجعات علوم العصر الرباعي . 6 (1): 43-54 . Bibcode : 1987QSRv....6...43M . doi : 10.1016/0277-3791(87)90016-3 .
- ↑ أوتشيس إي إيه، مكوي دبليو دي، كلارك بي يو (1996). "تقديرات الأحماض الأمينية لتدرجات درجة الحرارة العرضية والتسلسل الزمني الجيولوجي لترسبات اللوس خلال العصر الجليدي الأخير، وادي المسيسيبي، الولايات المتحدة". نشرة الجمعية الجيولوجية الأمريكية . 108 (7): 892-903 . Bibcode : 1996GSAB..108..892O . doi : 10.1130/0016-7606(1996)108 < 0892:AAEOLT > 2.3.CO ; 2 .
- ↑ ميلر، جي إتش، ماجي، جي دبليو، جول، إيه جيه (1997). "التبريد الجليدي في خطوط العرض المنخفضة في نصف الكرة الجنوبي نتيجة لتحول الأحماض الأمينية إلى مزيج راسيمي في قشور بيض طائر الإيمو". مجلة نيتشر . 385 (6613): 241-244 . Bibcode : 1997Natur.385..241M . doi : 10.1038/385241a0 . S2CID 4312380 .
- ↑ كوفمان، د. س. (2003). "قياس درجة حرارة التربة القديمة باستخدام الأحماض الأمينية لأوستراكودا العصر الرباعي من حوض بونفيل، يوتا". مجلة مراجعات علوم العصر الرباعي . 22 ( 8-9 ): 899-914 . Bibcode : 2003QSRv...22..899K . doi : 10.1016/S0277-3791(03)00006-4 .
- ↑ ماكمينامين، إم. إيه.، بلانت، دي. جيه.، كفينفولدن، كيه. إيه.، ميلر، إس. إي.، ماركوس، إل. إف.، باردي، آر. آر. (1982). "الكيمياء الجيولوجية للأحماض الأمينية في عظام أحفورية من رواسب الأسفلت في رانشو لا بريا، كاليفورنيا". مجلة أبحاث العصر الرباعي . 18 (2): 174-183 . Bibcode : 1982QuRes..18..174M . doi : 10.1016/0033-5894(82)90068-0 .
- ↑ أوغينو تي، أوغينو إتش (أكتوبر 1988). "تطبيق عملية تحويل حمض الأسبارتيك إلى راسيمي في الأسنان غير البازغة والزائدة على طب الأسنان الشرعي". مجلة أبحاث طب الأسنان . 67 (10): 1319-1322 . doi : 10.1177/00220345880670101501 . PMID 3170888. S2CID 8664035 .
- ↑ "NEaar: North East Amino Acid Rasimization" . جامعة يورك.
- ↑ كوفمان، د. س.، ومانلي، و. ج. (1998). "إجراء جديد لتحديد نسب الأحماض الأمينية dl في الأحافير باستخدام كروماتوغرافيا السائل العكسي". مراجعات علوم العصر الرباعي . 17 (11): 987-1000 . Bibcode : 1998QSRv...17..987K . doi : 10.1016/S0277-3791(97)00086-3 .
- ↑ كوفمان دي إس (2000). وجهات نظر في جيوكيمياء الأحماض الأمينية والبروتينات . نيويورك: مطبعة جامعة أكسفورد. ص 145-160 .
- ↑ بنكمان، ك. إي. ، كوفمان، د. س.، مادي، د.، كولينز، م. ج. (فبراير 2008). "سلوك النظام المغلق للجزء داخل البلوري من الأحماض الأمينية في أصداف الرخويات" . علم التسلسل الزمني الرباعي . 3 ( 1-2 ): 2-25 . Bibcode : 2008QuGeo ... 3....2P . doi : 10.1016/j.quageo.2007.07.001 . PMC 2727006. PMID 19684879 .
روابط خارجية
المختبرات النشطة
- مختبر علم تحديد أعمار الأحماض الأمينية بجامعة شمال أريزونا، مؤرشف بتاريخ 31 مارس 2017 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
- مختبر علم تحديد عمر الأحماض الأمينية بجامعة ماساتشوستس
- مختبر تحديد العمر الجيولوجي للأحماض الأمينية بجامعة كولورادو
- مجموعة أبحاث جامعة ديلاوير
- جامعة يورك للأرشيف الحيوي
- مختبر علم الطبقات الجزيئية الحيوية في كلية مدريد للمناجم
- طريقة المواعدة
- طرق التأريخ الجيولوجي الزمني
