بوني بيرغر

بوني آن بيرغر (مواليد 1964 أو 1965 ^{[ 6 ]} ) عالمة رياضيات تطبيقية وعالمة حاسوب أمريكية ، وإحدى الباحثات المؤسسات لعلم الأحياء الجزيئي الحاسوبي . تشغل منصب أستاذة سيمونز للرياضيات في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا ، حيث ترأس مجموعة الحوسبة وعلم الأحياء في مختبر علوم الحاسوب والذكاء الاصطناعي . تشمل أبحاثها الخوارزميات ، والمعلوماتية الحيوية ^{[ 2 ]} ، وعلم الجينوم ، وعلم الأحياء البنيوي ، وحماية البيانات الجينومية؛ ومن أبرز إسهاماتها أول تحليل مقارن لجينوم الإنسان والفأر ^{[ 7 ]} ، والتنبؤ ببنية البروتين الحلزوني الملتف ^{[ 7 ]} ، وابتكار علم الجينوم المضغوط ^{[ 7 ]} .

وُلدت بيرغر ونشأت في ميامي . ^{[ 7 ] [ 8 ]} كان جدها لأبيها مهاجرًا يهوديًا قدم إلى الولايات المتحدة من روسيا في بداية الحرب العالمية الأولى ، وكان والدها رجل أعمال وعازف بيانو كلاسيكيًا، بينما كانت والدتها رئيسة دائرة التعليم اليهودي في أمريكا الشمالية. ^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]} خلال نشأتها، تحدثت الإسبانية ودرست العبرية، وأتقنتها بعد قضاء عدة أشهر في إسرائيل، ثم درست الروسية في الجامعة. ^{[ 7 ]} شجعها والدها على الاهتمام بالرياضيات منذ صغرها، وفي أول سنتين من المرحلة الثانوية، درست الرياضيات بوتيرة تناسبها، وأكملت حساب التفاضل والتكامل قبل انتقالها إلى مدرسة تحضيرية حيث كانت واحدة من فتاتين فقط تدرسان هذه المادة. ^{[ 7 ]}

حصلت على درجة البكالوريوس من جامعة برانديز عام ١٩٨٣، ودرجة الدكتوراه من معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا عام ١٩٩٠ تحت إشراف سيلفيو ميكالي . ^{[ ١٢ ] [ ٣ ]} في برانديز، اختارت في البداية دراسة اللغة الروسية، ثم علم النفس، قبل أن تكتشف شغفها بالبرمجة من خلال دورة في البرمجة الإحصائية بلغة فورتران ، وبعدها انتقلت إلى برنامج علوم الحاسوب الجديد في الجامعة. ^{[ ٧ ]} خلال دراستها في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا، تلقت أيضًا إرشادًا غير رسمي من عالم الرياضيات بيتر شور . ^{[ ٧ ]} فازت بجائزة ماتشي عام ١٩٨٩ عن بحثٍ حول الخوارزميات المتوازية ، نشرته مع زميلها الطالب جون رومبل في ندوة أسس علوم الحاسوب . ^{[ ١٣ ]}

بعد حصولها على درجة الدكتوراه، بقيت بيرغر في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا لإجراء أبحاث ما بعد الدكتوراه . وقد عرّفها مشرفها على أبحاث ما بعد الدكتوراه ، دانيال كليتمان ، أستاذ الرياضيات التطبيقية، على مشاكل في علم الأحياء الحاسوبي بعد استماعها إلى محاضرة ألقاها عالم الفيزياء الحيوية بجامعة ستانفورد، مايكل ليفيت، حول طي البروتين، مما دفع بيرغر إلى تحويل تركيزها نحو علم الأحياء. ^{[ 7 ]} كانت زميلة في معهد رادكليف بانتينغ في الفترة 1992-1993. ^{[ 7 ]} انضمت إلى هيئة التدريس في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا عام 1992 كأستاذة مساعدة في الرياضيات التطبيقية، مع تعيين مشترك في مختبر علوم الحاسوب. ^{[ 7 ]} نُشرت أبحاثها في المعلوماتية الحيوية في مجلات علمية رائدة محكمة، بما في ذلك مجلة ساينس ومجلة الخوارزميات . ^{[ 2 ] [ 14 ] [ 15 ]} من بين طلاب الدكتوراه السابقين لديها سيرافيم باتزوغلو ، ^{[ 3 ]} ليور باختر ، ^{[ 4 ]} مونا سينغ ، ^{[ 5 ]} مانوليس كيليس ، وفيل برادلي.

شغلت بيرغر منصب نائب رئيس الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB) ^{[ 16 ]} ورئيسة اللجنة التوجيهية لمشروع RECOMB . ^{[ 17 ]} وبصفتها نائبة رئيس الجمعية، أدارت ورش عمل حول عدم المساواة بين الجنسين في عام 2016، وعملت على زيادة تمثيل النساء والأقليات المهمشة بين زملاء الجمعية والحائزين على جوائزها. ^{[ 7 ]} وهي عضو منتسب في معهد برود ، وعضو هيئة تدريس في كلية العلوم الصحية والتكنولوجيا بجامعة هارفارد/معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا ، وعضو هيئة تدريس منتسبة في كلية الطب بجامعة هارفارد . ^{[ 18 ]} كما أنها عضو في هيئة التحرير التنفيذية لمجلة علم الأحياء الحاسوبي ، وفي هيئات تحرير مجلات Annual Review for Biomedical Data Science ، وGenome Biology ، و Bioinformatics ، و IEEE/ACM TCBB ، و Cell Systems . ^{[ 18 ]}

بدأت بيرغر مسيرتها البحثية في مجال الخوارزميات قبل أن تنتقل إلى علم الأحياء الجزيئي الحاسوبي خلال فترة ما بعد الدكتوراه في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. وقد شجعها مشرفها على أبحاث ما بعد الدكتوراه، دانيال كليتمان ، أستاذ الرياضيات التطبيقية ، على تطبيق الأساليب الحاسوبية على طي البروتينات بعد أن استمع إلى محاضرة ألقاها عالم الفيزياء الحيوية بجامعة ستانفورد، مايكل ليفيت، حول هذا الموضوع. ^{[ 7 ]} شكّل هذا التحول بداية برنامج بحثي امتد ليشمل أكثر من اثني عشر مجالًا فرعيًا على مدى العقود الثلاثة التالية.

في بداية مسيرتها المهنية، حصلت بيرغر على جائزة NSF Career Award وجائزة مارغريت بيتمان للمديرين من معاهد الصحة الوطنية الأمريكية . ^{[ 18 ]} وفازت بجائزة RECOMB Test of Time Award في عامي 2010 و2019. ^{[ 18 ]} كما فازت بيرغر بجائزة مارغريت أوكلي دايوف عام 1997. ^{[ 19 ]} وفي عام 1998 ، كانت متحدثة مدعوة في المؤتمر الدولي للرياضيات في برلين (لكنها لم تتمكن من الحضور شخصيًا). ^{[ 20 ]} وفي عام 1999، أُدرج اسم بيرغر ضمن قائمة أفضل 100 مبتكر نشرتها مجلة Technology Review . ^{[ 21 ]} وفي عام 2003، أصبحت بيرغر زميلة في جمعية آلات الحوسبة (ACM)، ^{[ 22 ]} وفي عام 2012، انتُخبت عضوًا في الأكاديمية الأمريكية للفنون والعلوم وزميلة في الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB). ^{[ 23 ] [ 24 ]} في عام 2016، انضمت بيرغر إلى كلية زملاء المعهد الأمريكي للهندسة الطبية والبيولوجية (AIMBE). ^{[ 25 ]} كما تم اختيارها ضمن دفعة زملاء الجمعية الأمريكية للرياضيات لعام 2019 "لمساهماتها في علم الأحياء الحاسوبي، والمعلوماتية الحيوية، والخوارزميات، ولإسهاماتها في التوجيه والإرشاد". ^{[ 26 ]} وحصلت أيضًا على دكتوراه فخرية من المدرسة الفيدرالية للفنون التطبيقية في لوزان (EPFL). وهي عضو في قسم الرياضيات بالجمعية الأمريكية لتقدم العلوم (AAAS). وقد مُنحت جائزة إنجازات كبار العلماء من الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB ) في عام 2019. ^{[ 1 ]} وفي عام 2020، ألقت محاضرة سونيا كوفاليفسكي التي نظمتها جمعية الرياضيات التطبيقية والصناعية ( AWM) بالتعاون مع جمعية الرياضيات الصناعية والتطبيقية ( SIAM) ، ^{[ 27 ]} وانتُخبت عضوًا في الأكاديمية الوطنية للعلوم. ^{[ 28 ]} انتُخبت زميلةً في جمعية الرياضيات الصناعية والتطبيقية ضمن دفعة عام 2022 من زملاء الجمعية، "لعملها الرائد في مجال البيولوجيا الجزيئية الحاسوبية، بما في ذلك علم الجينوم المقارن والضغط، واستنتاج الشبكات، وحماية البيانات الجينومية، والتنبؤ ببنية البروتين". ^{[ 29 ]}

بيرغر متزوجة من أستاذ معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا والرئيس التنفيذي لشركة أكاماي تكنولوجيز ، إف. طومسون لايتون . ^{[ 30 ] [ 31 ]} وقد وصفت أنها قللت من إنتاجها المنشور خلال فترة في منتصف حياتها المهنية أثناء تربية أطفالها، وقالت إنها عادت إلى إنتاجيتها الكاملة حوالي عام 2009. ^{[ 7 ]}