منصة التعبير عن الخميرة

منصة التعبير الجيني في الخميرة هي سلالة من الخميرة تُستخدم لإنتاج كميات كبيرة من البروتينات أو السكريات أو مركبات أخرى لأغراض البحث أو الصناعة. ورغم أن الخميرة غالبًا ما تتطلب موارد أكثر من البكتيريا للحفاظ عليها ، إلا أن بعض المنتجات لا يمكن إنتاجها إلا بواسطة خلايا حقيقية النواة كالخميرة، مما يستلزم استخدام منصة التعبير الجيني في الخميرة. وتختلف أنواع الخميرة في إنتاجيتها وقدراتها على إفراز البروتينات ومعالجتها وتعديلها. ولذلك، فإن أنواعًا مختلفة من الخميرة (أي منصات تعبير جيني مختلفة) تُناسب تطبيقات بحثية وصناعية مختلفة بشكل أفضل.

منتجات

منذ ظهور الهندسة الوراثية ، تم تطوير عدد من الكائنات الدقيقة لإنتاج منتجات بيولوجية. تُستخدم هذه المنتجات في الطب والصناعة لإنتاج أدوية مثل لقاحات التهاب الكبد ب أو الأنسولين . تشمل المنصات الشائعة لتطوير الأدوية وغيرها من المنتجات بكتيريا الإشريكية القولونية ، والعديد من أنواع الخميرة والخلايا الثديية (بما في ذلك، على وجه الخصوص، خلايا مبيض الهامستر الصيني ). بشكل عام، يجب أن يستوفي الكائن الدقيق المستخدم كمنصة للتعبير الجيني عدة معايير: يجب أن يكون قادرًا على النمو بسرعة في حاويات كبيرة، وإنتاج البروتينات بكفاءة (أي بأقل قدر من الموارد)، وأن يكون آمنًا، وفي حالة الأدوية، يجب أن ينتج ويعدل المنتجات لتكون جاهزة للاستهلاك البشري قدر الإمكان.

السلالات المستخدمة

تُعدّ الخمائر من الكائنات المضيفة الشائعة لإنتاج البروتينات من الحمض النووي المُعاد تركيبه . فهي تُتيح سهولة نسبية في التعديل الجيني ونموًا سريعًا يصل إلى كثافة خلوية عالية في بيئات زراعية رخيصة الثمن. وباعتبارها كائنات حقيقية النواة ، فهي قادرة على إجراء تعديلات على البروتينات، مثل الغلكزة، وهي تعديلات شائعة في الخلايا حقيقية النواة، ولكنها نادرة نسبيًا في البكتيريا. ولهذا السبب، تستطيع الخميرة إنتاج بروتينات معقدة تُطابق أو تُشابه إلى حد كبير البروتينات الأصلية من النباتات أو الثدييات. استندت أول منصة للتعبير الجيني في الخميرة إلى خميرة الخباز Saccharomyces cerevisiae . ومنذ ذلك الحين، دُرست العديد من منصات التعبير الجيني في الخميرة، وهي تُستخدم على نطاق واسع في تطبيقات متنوعة بناءً على خصائصها وقدراتها المختلفة. فعلى سبيل المثال، ينمو بعضها على نطاق واسع من مصادر الكربون، ولا يقتصر على الجلوكوز ، كما هو الحال مع خميرة الخباز. كما يُستخدم العديد منها في الهندسة الوراثية وإنتاج البروتينات الغريبة.

أركسولا أدينيفورانس

فطر Arxula adeninivorans (المعروف أيضًا باسم Blastobotrys adeninivorans ) هو خميرة ثنائية الشكل، أي أنه ينمو كخميرة متبرعمة حتى درجة حرارة 42 درجة مئوية، ولكنه ينمو كخيوط فطرية عند درجات حرارة أعلى. يتميز هذا الفطر بخصائص كيميائية حيوية فريدة، إذ يمكنه النمو على نطاق واسع من الركائز واستيعاب النترات. وقد طُوّرت سلالات منه قادرة على إنتاج مواد بلاستيكية طبيعية، كما استُخدمت في تطوير مستشعر حيوي للكشف عن هرمون الإستروجين في العينات البيئية.

كانديدا بويديني

تُعرف خميرة كانديدا بويديني بقدرتها على النمو على الميثانول (وهي ظاهرة تُسمى التغذية على الميثانول). ومثل أنواع أخرى من الخميرة التي تتغذى على الميثانول، مثل هانسنولا بوليمورفا وبيشيا باستوريس ، تُستخدم كمنصة لإنتاج البروتينات الخارجية. وقد سُجلت كميات من البروتين الخارجي المُفرز تصل إلى عدة غرامات . وقد تنبأت طريقة حسابية، تُسمى IPRO، مؤخرًا بحدوث طفرات غيّرت تجريبيًا خصوصية العامل المساعد لإنزيم مختزلة الزيلوز في كانديدا بويديني من NADPH إلى NADH. [ 1 ]

أوغاتيا بوليمورفا

تُعدّ خميرة Ogataea polymorpha (مرادفاتها Hansenula polymorpha أو Pichia angusta ) نوعًا آخر من الخمائر الميثيلية (انظر Candida boidinii ). تستطيع هذه الخميرة النمو على نطاق واسع من الركائز الأخرى، وهي مقاومة للحرارة وقادرة على استيعاب النترات (انظر أيضًا Kluyveromyces lactis ). وقد استُخدمت في إنتاج لقاحات التهاب الكبد B، والأنسولين، والإنترفيرون ألفا-2أ لعلاج التهاب الكبد C، بالإضافة إلى مجموعة من الإنزيمات التقنية.

كلوفيروميسيس لاكتيس

تُستخدم خميرة كلوفيروميسيس لاكتيس بانتظام في إنتاج الكفير . وهي قادرة على النمو على أنواع عديدة من السكريات، وأهمها اللاكتوز الموجود في الحليب ومصل اللبن. وقد استُخدمت بنجاح، من بين أمور أخرى، في إنتاج الكيموسين (وهو إنزيم موجود عادةً في معدة العجول) لصناعة الجبن. ويتم الإنتاج في خزانات تخمير بسعة 40,000 لتر.

Pichia pastoris

خميرة Pichia pastoris هي خميرة ميثيلية التغذية (انظر Candida boidinii و Hansenula polymorpha ). توفر هذه الخميرة منصة فعالة لإنتاج البروتينات الخارجية. تتوفر عناصر المنصة كمجموعة أدوات، وتُستخدم على نطاق واسع في الأوساط الأكاديمية لإنتاج البروتينات. وقد تم هندسة سلالات قادرة على إنتاج جزيئات N-جليكان بشرية معقدة (تتشابه جزيئات الجليكان في الخميرة مع تلك الموجودة في البشر، ولكنها ليست متطابقة).

Saccharomyces cerevisiae

خميرة الخباز (Saccharomyces cerevisiae) هي الخميرة التقليدية المستخدمة على نطاق واسع في صناعة البيرة والخبز. وغالبًا ما يُستخدم مصطلح "الخميرة" للإشارة إلى هذا النوع الواحد. وقد تم تطبيقها بنجاح كمنصة للتعبير الجيني في إنتاج الإنزيمات التقنية والمستحضرات الصيدلانية مثل الأنسولين ولقاحات التهاب الكبد ب.

يارويا ليبوليتيكا

تُعدّ خميرة يارويا ليبوليتيكا خميرة ثنائية الشكل (انظر أركسولا أدينينيفورانس ) قادرة على النمو على نطاق واسع من الركائز. ولذلك، فهي تتمتع بإمكانات عالية للتطبيقات الصناعية، ولكن لا توجد منتجات مُعاد تركيبها متوفرة تجاريًا حتى الآن.

يستخدم

تختلف منصات التعبير الجيني في الخميرة في عدة خصائص، بما في ذلك إنتاجيتها وقدرتها على إفراز البروتينات ومعالجتها وتعديلها، على سبيل المثال لا الحصر. ومع ذلك، تتشابه استخدامات جميع منصات التعبير الجيني في بعض الجوانب الأساسية.

الشكل 1. تصميم ووظائف نظام ناقل CoMed. يحتوي ناقل CoMed الأساسي على جميع عناصر الإشريكية القولونية اللازمة للتكاثر في نظام الإشريكية القولونية ، بالإضافة إلى نظام استنساخ متعدد (MCS) لدمج وحدات ARS وrDNA وعلامات الاختيار ووحدات كاسيت التعبير. ولهذا الغرض، تُحاط أجزاء ARS بمواقع تقييد Sac II و Bcu I، ومناطق rDNA بمواقع تقييد Bcu I و Eco 47III، وعلامات الاختيار بمواقع تقييد Eco 47III وSalI، وعناصر المحفز بمواقع تقييد Sal I و Apa I.

لإنتاج المنتج المطلوب، تُحوَّل سلالات الخميرة المناسبة باستخدام ناقل يحتوي على جميع العناصر الوراثية اللازمة لإنتاج المنتج البيولوجي المرغوب. يجب أن يحتوي الناقل أيضًا على علامة اختيار ، وهي ضرورية لتمييز الخميرة التي استقبلت الناقل بنجاح عن تلك التي لم تستقبله. كما يحتوي الناقل على عناصر DNA معينة تسمح للخميرة بدمج الحمض النووي الغريب في كروموسومها وتكراره. والأهم من ذلك، يحتوي الناقل على جزء مسؤول عن إنتاج المركب المطلوب، يُسمى كاسيت التعبير . يحتوي الكاسيت على تسلسل من العناصر التنظيمية التي تتحكم في كمية المنتج المُنتَج والظروف التي يتم فيها إنتاجه. يلي ذلك جين المنتج البيولوجي نفسه. وينتهي كاسيت التعبير بتسلسل إنهاء يوقف نسخ الجين المُعبَّر عنه.

مراجع

  1. خوري، غ. أ.؛ فازلينيا، هـ.؛ تشين، ج. و.؛ بانتازيس، ر. ج.؛ سيرينو، ب. س.؛ ماراناس، س. د. (أكتوبر 2009). "التصميم الحاسوبي لإنزيم اختزال الزيلوز من فطر كانديدا بويديني لتغيير خصوصية العامل المساعد" . علم البروتين . 18 (10): 2125-2138 . doi : 10.1002/pro.227 . PMC 2786976. PMID 19693930 .  
  • جيليسن جي (محرر) (2005) إنتاج البروتينات المؤتلفة - أنظمة التعبير الميكروبية وحقيقية النواة الجديدة. وايلي-في سي إتش، فاينهايم. ISBN 3-527-31036-3