الإشريكية القولونية

📅 آخر تحديث: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 11 صور
الموسوعة الحرة

الإشريكية القولونية ( تُلفظ / ˌɛʃəˈrɪkiəˈkoʊlaɪ / ، ESH - ə - RIK - ee - əKOH - lye ) [ 2 ] [ 3 ] هي بكتيريا سالبة الغرام ، لاهوائية اختيارية ، عصوية الشكل ، من جنس الإشريكية ، وتوجد عادةً في الأمعاء الغليظة للكائنات ذوات الدم الحار . [ 4 ] [ 5 ] تُشكل معظم سلالات الإشريكية القولونية جزءًا من الميكروبات الطبيعية في الأمعاء ، حيث تُمثل حوالي 0.1%، إلى جانب أنواع أخرى من البكتيريا اللاهوائية الاختيارية . [ 6 ] هذهالبكتيريا غير ضارة في الغالب، بل قد تكون مفيدة للإنسان. [ ٧ ] على سبيل المثال، تُفيد بعض سلالات الإشريكية القولونية مضيفيها بإنتاج فيتامين K2 [ ٨ ] أو بمنع استعمار الأمعاء بالبكتيريا الممرضة الضارة . تُعدّ هذه العلاقات التكافلية بين الإشريكية القولونية والإنسان نوعًا من العلاقات البيولوجية التكافلية ، حيث يستفيدكل من الإنسان والإشريكية القولونية من الآخر. [ ٩ ] [ ١٠ ] تُطرح الإشريكية القولونية في البيئة مع البراز. تنمو البكتيريا بكثافة في البراز الطازج في ظل ظروف هوائية لمدة ثلاثة أيام، لكن أعدادها تتناقص ببطء بعد ذلك. [ ١١ ]     

بعض الأنماط المصلية ، مثل EPEC و ETEC ، ممرضة، وتسبب تسممًا غذائيًا خطيرًا لدى مضيفيها. [ 12 ] يُعد الانتقال البرازي الفموي المسار الرئيسي الذي تُسبب من خلاله السلالات الممرضة من البكتيريا المرض. وتُعد هذه الطريقة في بعض الأحيان مسؤولة عن حوادث تلوث غذائي تستدعي سحب المنتجات من الأسواق. [ 13 ] تستطيع الخلايا البقاء على قيد الحياة خارج الجسم لفترة محدودة، مما يجعلها كائنات مؤشرة محتملة لاختبار العينات البيئية للكشف عن التلوث البرازي . [ 14 ] [ 15 ] ومع ذلك، فقد درست مجموعة متزايدة من الأبحاث بكتيريا الإشريكية  القولونية المستمرة بيئيًا ، والتي يمكنها البقاء على قيد الحياة لعدة أيام والنمو خارج جسم المضيف. [ 16 ]

يمكن زراعة هذه البكتيريا واستنباتها بسهولة وبتكلفة زهيدة في المختبر، وقد خضعت لدراسات مكثفة لأكثر من 60 عامًا. تُعدّ الإشريكية القولونية كائنًا  كيميائيًا غير ذاتي التغذية، ويجب أن يتضمن وسطها الكيميائي المحدد مصدرًا للكربون والطاقة . [ 17 ] تُعتبر الإشريكية القولونية أكثر الكائنات بدائية النواة نموذجيةً دراسةً ، ونوعًا مهمًا في مجالي التقانة الحيوية وعلم الأحياء الدقيقة ، حيث استُخدمت ككائن مضيف في معظم الأبحاث المتعلقة بالحمض النووي المؤتلف . في ظل الظروف الملائمة، لا يستغرق تكاثرها سوى 20 دقيقة. [ 18 ] 

علم الأحياء والكيمياء الحيوية

نموذج الانشطار الثنائي المتتالي في بكتيريا الإشريكية القولونية 

النوع والشكل

الإشريكية القولونية هي بكتيريا سالبة الغرام، لا هوائية اختيارية ، غير مكونة للأبواغ، من فصيلة القولونيات . [ 19 ] عادةً ما تكون خلاياها عصوية الشكل، ويبلغ طولها حوالي 2.0 ميكرومتر وقطرها 0.25-1.0 ميكرومتر ، وحجمها 0.6-0.7 ميكرومتر مكعب . [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ]  

تُصبغ بكتيريا الإشريكية القولونية بصبغة سالبة الغرام لأن جدارها الخلوي يتكون من طبقة رقيقة من الببتيدوغليكان وغشاء خارجي . أثناء عملية التلوين، تمتص الإشريكية  القولونية لون صبغة السافرانين المضادة وتتلون باللون الوردي. يوفر الغشاء الخارجي المحيط بالجدار الخلوي حاجزًا أمام بعض المضادات الحيوية ، بحيث لا تتضرر الإشريكية  القولونية من البنسلين . [ 17 ]

تتميز الأسواط ، التي تسمح للبكتيريا بالسباحة، بترتيب محيطي . [ 23 ] تلتصق الأسواط وتتلاشى على الزغيبات المعوية عبر جزيء التصاق يُعرف باسم الإنتيمين . [ 24 ]

الاسْتِقْلاب

تستطيع بكتيريا الإشريكية القولونية العيش على مجموعة واسعة من الركائز، وتستخدم التخمر الحمضي المختلط في ظروف لاهوائية، منتجةً اللاكتات ، والساكسينات ، والإيثانول ، والأسيتات ، وثاني أكسيد الكربون . ولأن العديد من مسارات التخمر الحمضي المختلط تُنتج غاز الهيدروجين ، فإن هذه المسارات تتطلب مستويات منخفضة من الهيدروجين، كما هو الحال عندما تعيش الإشريكية  القولونية مع كائنات حية تستهلك الهيدروجين، مثل الميثانوجينات أو البكتيريا المختزلة للكبريتات . [ 25 ]

بالإضافة إلى ذلك، يمكن إعادة برمجة عملية التمثيل الغذائي لبكتيريا الإشريكية القولونية بحيث تستخدم  ثاني أكسيد الكربون فقط كمصدر للكربون لإنتاج الكتلة الحيوية. بعبارة أخرى، يمكن تعديل عملية التمثيل الغذائي لهذه البكتيريا غيرية التغذية الإجبارية لتُظهر قدرات ذاتية التغذية من خلال التعبير غير المتجانس عن جينات تثبيت الكربون ، بالإضافة إلى إنزيم نازع هيدروجين الفورمات، وإجراء تجارب تطورية مخبرية. ويمكن تحقيق ذلك باستخدام الفورمات لاختزال نواقل الإلكترون وتوفير الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP) اللازم في مسارات البناء داخل هذه الكائنات ذاتية التغذية الاصطناعية. [ 26 ]

إعادة توزيع التدفقات بين مسارات هدم الجلوكوز الرئيسية الثلاثة: EMPP (أحمر)، EDP (أزرق)، وOPPP (برتقالي) عن طريق تعطيل pfkA والإفراط في التعبير عن جينات EDP (edd وeda).

تمتلك بكتيريا الإشريكية القولونية ثلاثة مسارات طبيعية لتحلل الجلوكوز: مسار EMPP ، ومسار EDP ، ومسار OPPP . يستخدم مسار EMPP عشر خطوات إنزيمية لإنتاج جزيئين من البيروفات ، وجزيئين من ATP ، وجزيئين من NADH لكل جزيء جلوكوز ، بينما يعمل مسار OPPP كمسار أكسدة لتخليق NADPH . على الرغم من أن مسار EDP هو الأكثر استقرارًا من الناحية الديناميكية الحرارية بين المسارات الثلاثة، إلا أن بكتيريا الإشريكية  القولونية لا تستخدمه في استقلاب الجلوكوز ، معتمدةً بشكل أساسي على مساري EMPP وOPPP. يبقى مسار EDP غير نشط في الغالب باستثناء فترة النمو بوجود الغلوكونات . [ 27 ]

تثبيط الكاتابوليت

عند نمو البكتيريا في وجود خليط من السكريات، فإنها غالبًا ما تستهلك هذه السكريات بالتتابع من خلال عملية تُعرف باسم تثبيط الاستقلاب . عن طريق تثبيط التعبير عن الجينات المسؤولة عن استقلاب السكريات الأقل تفضيلًا، تستهلك الخلايا عادةً السكر الذي يُحقق أعلى معدل نمو أولًا، ثم السكر الذي يُحقق ثاني أعلى معدل نمو، وهكذا. وبذلك، تضمن الخلايا استخدام مواردها الأيضية المحدودة لزيادة معدل النمو إلى أقصى حد. ومن الأمثلة الشائعة على ذلك في بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) نمو البكتيريا على الجلوكوز واللاكتوز ، حيث  تستهلك الإشريكية القولونية الجلوكوز قبل اللاكتوز . كما لوحظ تثبيط الاستقلاب في الإشريكية القولونية في وجود سكريات أخرى غير الجلوكوز ، مثل الأرابينوز والزيلوز والسوربيتول والرامنوز والريبوز . في بكتيريا الإشريكية القولونية ، يتم تنظيم تثبيط استقلاب الجلوكوز بواسطة نظام الفوسفوتراسفيراز ، وهو عبارة عن سلسلة فسفرة متعددة البروتينات تربط امتصاص الجلوكوز واستقلابه . [ 28 ]   

نمو الثقافة

مستعمرة من بكتيريا الإشريكية  القولونية تنمو

يحدث النمو الأمثل لبكتيريا الإشريكية  القولونية عند درجة حرارة 37 درجة مئوية (99 درجة فهرنهايت) ، ولكن بعض السلالات المختبرية قادرة على التكاثر عند درجات حرارة تصل إلى 49 درجة مئوية (120 درجة فهرنهايت) . [ 29 ] تنمو الإشريكية القولونية في مجموعة متنوعة من الأوساط المختبرية المحددة، مثل مرق الليزوجيني ، أو أي وسط يحتوي على الجلوكوز ، وفوسفات الأمونيوم أحادي القاعدة ، وكلوريد الصوديوم ، وكبريتات المغنيسيوم ، وفوسفات البوتاسيوم ثنائي القاعدة ، والماء . يمكن أن يكون النمو مدفوعًا بالتنفس الهوائي أو اللاهوائي ، باستخدام مجموعة كبيرة ومتنوعة من أزواج الأكسدة والاختزال ، بما في ذلك أكسدة حمض البيروفيك ، وحمض الفورميك ، والهيدروجين ، والأحماض الأمينية ، واختزال ركائز مثل الأكسجين ، والنترات ، والفومارات ، وثنائي ميثيل سلفوكسيد ، وثلاثي ميثيل أمين N-أكسيد . [ 30 ] تُصنف الإشريكية القولونية على أنها كائن حي لاهوائي اختياري . تستخدم هذه البكتيريا الأكسجين عند وجوده وتوفره. ومع ذلك، يمكنها الاستمرار في النمو في غياب الأكسجين عن طريق التخمر أو التنفس اللاهوائي . ويتم تنظيم نوع التنفس جزئيًا بواسطة نظام القوس الكهربائي . وتُعدّ القدرة على الاستمرار في النمو في غياب الأكسجين ميزةً للبكتيريا، لأن بقاءها يزداد في البيئات التي يغلب عليها الماء . [ 17 ]      

دورة الخلية

تنقسم دورة الخلية البكتيرية إلى ثلاث مراحل. تحدث المرحلة B بين اكتمال انقسام الخلية وبداية تضاعف الحمض النووي . وتشمل المرحلة C الوقت اللازم لتضاعف الحمض النووي الصبغي. أما المرحلة D فتشير إلى المرحلة بين انتهاء تضاعف الحمض النووي ونهاية انقسام الخلية. [ 31 ] يزداد معدل تضاعف بكتيريا الإشريكية القولونية عند  توفر المزيد من المغذيات. ومع ذلك، لا يتغير طول المرحلتين C وD، حتى عندما يصبح زمن التضاعف أقل من مجموع المرحلتين C وD. عند أسرع معدلات النمو، يبدأ التضاعف قبل اكتمال دورة التضاعف السابقة، مما يؤدي إلى ظهور شوكات تضاعف متعددة على طول الحمض النووي وتداخل دورات الخلية. [ 32 ]

يتبع عدد شوكات التضاعف في بكتيريا الإشريكية القولونية سريعة  النمو عادةً الصيغة 2n (حيث n = 1 أو 2 أو 3). يحدث هذا فقط إذا بدأ التضاعف في وقت واحد من جميع مواقع بدء التضاعف ، ويُشار إليه حينها بالتضاعف المتزامن . مع ذلك، لا تتضاعف جميع الخلايا في المزرعة بشكل متزامن. في هذه الحالة، لا تحتوي الخلايا على مضاعفات العدد 2 من شوكات التضاعف . ويُشار حينها إلى بدء التضاعف بأنه غير متزامن. [ 33 ] ومع ذلك، يمكن أن ينتج عدم التزامن عن طفرات في جينات مثل dnaA [ 33 ] أو بروتين DiaA المرتبط ببادئ التضاعف DnaA . [ 34 ]

على الرغم من أن بكتيريا الإشريكية القولونية  تتكاثر بالانشطار الثنائي، فإن الخليتين الناتجتين عن الانقسام الخلوي، واللتين تبدوان متطابقتين، غير متناظرتين وظيفيًا، حيث تعمل الخلية القطبية القديمة كخلية أمّ متقدمة في السن تُنتج ذرية متجددة باستمرار. [ 35 ] عند تعرضها لمستوى إجهاد مرتفع، قد يتجاوز تراكم الضرر في سلالة الإشريكية القولونية القديمة  عتبة الخلود لديها، مما يؤدي إلى توقف انقسامها وتحولها إلى خلية فانية. [ 36 ] الشيخوخة الخلوية عملية عامة، تؤثر على بدائيات النوى وحقيقيات النوى على حد سواء. [ 36 ]

التكيف الجيني

تمتلك بكتيريا الإشريكية القولونية والبكتيريا ذات الصلة القدرة على نقل الحمض النووي عبر الاقتران البكتيري أو النقل الفيروسي ، مما يسمح للمادة الوراثية بالانتشار أفقيًا بين أفراد المجموعة البكتيرية. وتُعدّ عملية النقل الفيروسي، التي تستخدم فيروسًا بكتيريًا يُسمى العاثية [ 37 ]، هي العملية التي ساهم فيها انتشار الجين المُشفّر لسم شيغا من بكتيريا الشيغيلا إلى الإشريكية القولونية في  إنتاج سلالة الإشريكية  القولونية O157:H7 ، وهي السلالة المُنتجة لسم شيغا من الإشريكية القولونية  .

تنوع

مستعمرات الإشريكية القولونية
بكتيريا الإشريكية القولونية النامية على أوساط الاستزراع الأساسية

تضمّ بكتيريا الإشريكية القولونية مجموعة هائلة من البكتيريا التي تُظهر تنوعًا جينيًا وظاهريًا كبيرًا. يُشير تسلسل الجينوم للعديد من عزلات الإشريكية القولونية  والبكتيريا ذات الصلة إلى ضرورة إعادة تصنيفها تصنيفيًا. مع ذلك، لم يُجرَ هذا التصنيف، ويعود ذلك في الغالب إلى أهميتها الطبية [ 38 ] ، ولا تزال الإشريكية القولونية واحدة  من أكثر أنواع البكتيريا تنوعًا: إذ لا تشترك جميع السلالات إلا في 20% فقط من الجينات الموجودة في جينوم الإشريكية  القولونية النموذجي [ 39 ] .

في الواقع، من وجهة نظر أكثر بناءً، ينبغي تصنيف أفراد جنس الشيغيلا ( الشيغيلا  الزحارية ، والشيغيلا  الفلكسنرية ، والشيغيلا  البويدية ، والشيغيلا  السونية ) كسلالات من الإشريكية  القولونية ، وهي ظاهرة تُعرف باسم التصنيفات المتخفية . [ 40 ] وبالمثل، فإن سلالات أخرى من الإشريكية القولونية (  مثل سلالة K-12 الشائعة الاستخدام في أبحاث الحمض النووي المؤتلف ) تختلف اختلافًا كافيًا بحيث تستحق إعادة تصنيفها.

التنوع الظاهري الملحوظ داخل سلالات الإشريكية القولونية المعزولة من المرضى المصابين بعدوى المسالك البولية.

السلالة هي مجموعة فرعية ضمن النوع تتميز بخصائص فريدة تميزها عن السلالات الأخرى . غالبًا ما لا يمكن اكتشاف هذه الاختلافات إلا على المستوى الجزيئي؛ ومع ذلك، فقد تؤدي إلى تغييرات في وظائف البكتيريا أو دورة حياتها. على سبيل المثال، قد تكتسب السلالة قدرة على إحداث المرض ، أو القدرة على استخدام مصدر كربون فريد ، أو القدرة على شغل بيئة بيئية محددة ، أو القدرة على مقاومة العوامل المضادة للميكروبات . غالبًا ما تكون سلالات الإشريكية  القولونية المختلفة متخصصة في عائل معين، مما يُمكّن من تحديد مصدر التلوث البرازي في العينات البيئية. [ 14 ] [ 15 ] على سبيل المثال، معرفة سلالات الإشريكية  القولونية الموجودة في عينة مياه تسمح للباحثين بوضع افتراضات حول ما إذا كان التلوث ناتجًا عن إنسان، أو حيوان ثديي آخر ، أو طائر .

الأنماط المصلية

مستعمرات الإشريكية القولونية على الأجار.
بكتيريا الإشريكية القولونية على أجار دم الأغنام

يُعدّ التصنيف المصلي أحد أنظمة التقسيم الشائعة لبكتيريا الإشريكية القولونية  ، ولكنه لا يعتمد على القرابة التطورية، ويستند إلى المستضدات السطحية الرئيسية (المستضد O: جزء من طبقة الليبوبوليسكاريد ؛ H: الفلاجيلين ؛ المستضد K : الكبسولة)، مثل O157:H7 . [ 41 ] ومع ذلك، يشيع ذكر الزمرة المصلية فقط ، أي المستضد O. ويُعرف حاليًا حوالي 190 زمرة مصلية. [ 42 ] تفتقر السلالات غير الممرضة، الشائعة الاستخدام في المختبرات البحثية، إلى المستضد O، وبالتالي لا يمكن تصنيفها مصليًا.

مرونة الجينوم وتطوره

كما هو الحال مع جميع الكائنات الحية، تتطور سلالات جديدة من الإشريكية القولونية  من خلال العمليات البيولوجية الطبيعية للطفرات ، وتضاعف الجينات ، والانتقال الأفقي للجينات ؛ وعلى وجه الخصوص، تم اكتساب 18% من جينوم سلالة المختبر MG1655 أفقيًا منذ انفصالها عن السالمونيلا . [ 43 ] تُعد سلالتا الإشريكية القولونية K-12 و B من أكثر الأنواع استخدامًا في المختبرات. تُطور بعض السلالات سمات قد تكون ضارة بالحيوان المضيف. تُسبب هذه السلالات الضارية عادةً نوبة إسهال غالبًا ما تكون محدودة ذاتيًا لدى البالغين الأصحاء ، ولكنها غالبًا ما تكون قاتلة للأطفال في الدول النامية. [ 44 ] أما السلالات الأكثر ضراوة، مثل O157:H7 ، فتُسبب أمراضًا خطيرة أو الوفاة لدى كبار السن، والأطفال الصغار جدًا، أو الأشخاص الذين يعانون من نقص المناعة . [ 44 ] [ 45 ]  

انفصل جنسي الإشريكية والسالمونيلا قبل حوالي 102 مليون سنة (بفاصل ثقة يتراوح بين 57 و176 مليون سنة)، وهو حدث لا علاقة له بالانفصال الأقدم بكثير (انظر: الزواحف الثديية ) لعوائلهما: إذ وُجدت الأولى في الثدييات، بينما وُجدت الثانية في الطيور والزواحف. [ 46 ] تبع ذلك انقسام سلف الإشريكية إلى خمسة أنواع ( الإشريكية ألبرتي ، والإشريكية القولونية ، والإشريكية فيرغسونية ، والإشريكية هيرمانية ، والإشريكية فولنيريس ). انقسم آخر سلف للإشريكية القولونية قبل ما بين 20 و30 مليون سنة. [ 1 ]         

أتاحت تجارب التطور طويل الأمد باستخدام بكتيريا الإشريكية القولونية، التي بدأها ريتشارد لينسكي عام 1988، مراقبة تطور الجينوم مباشرةً على مدى أكثر من 65000 جيل في المختبر. [ 47 ] فعلى  سبيل المثال ، لا تمتلك الإشريكية القولونية عادةً  القدرة على النمو هوائياً باستخدام السترات كمصدر للكربون ، وهو ما يُستخدم كمعيار تشخيصي للتمييز بينها وبين أنواع أخرى وثيقة الصلة بها، مثل السالمونيلا  . في هذه التجربة، طوّرت إحدى مجموعات الإشريكية القولونية، بشكل غير متوقع ، القدرة على استقلاب السترات هوائياً، وهو تحول تطوري كبير يحمل بعض سمات التنوع الميكروبي . 

صورة مجهرية إلكترونية ماسحة لمستعمرة بكتيريا الإشريكية  القولونية

في عالم الميكروبات، يمكن إقامة علاقة افتراس مشابهة لتلك الملاحظة في عالم الحيوان. وقد لوحظ أن بكتيريا الإشريكية القولونية (E.  coli) تُعد فريسة للعديد من المفترسات العامة، مثل بكتيريا ميكسوكوكس زانثوس (Myxococcus xanthus ). في هذه العلاقة بين المفترس والفريسة، يُلاحظ تطور متوازٍ لكلا النوعين من خلال تعديلات جينومية ومظهرية. في حالة الإشريكية القولونية  ، تطرأ هذه التعديلات على جانبين مرتبطين بضراوتها، وهما: إنتاج المخاط (الإنتاج المفرط لحمض الألجينات خارج الخلية) وكبح جين OmpT ، مما يُنتج في الأجيال اللاحقة تكيفًا أفضل لأحد النوعين، يُعاكسه تطور النوع الآخر، وفقًا لنموذج التطور المشترك الذي تُوضحه فرضية الملكة الحمراء . [ 48 ]

سلالة النمط الجديد

تُعدّ الإشريكية القولونية (E. coli ) النوع النمطي لجنس الإشريكية ( Escherichia )، وبدورها، تُعدّ الإشريكية الجنس النمطي لعائلة الأمعائيات (Enterobacteriaceae )، حيث لا يُشتق اسم العائلة من الجنس Enterobacter + "i" (هكذا وردت في الأصل) + " aceae "، بل من "enterobacterium" + "aceae" (مع العلم أن enterobacterium ليس جنسًا، بل اسمًا شائعًا بديلًا لبكتيريا معوية). [ 49 ] [ 50 ] [ 51 ]

يُعتقد أن السلالة الأصلية التي وصفها إيشريش قد فُقدت، ولذلك تم اختيار سلالة نمطية جديدة (نمط جديد) كممثل لها: السلالة النمطية الجديدة هي U5/41 T ، [ 52 ] والمعروفة أيضًا بالأسماء المسجلة DSM 30083 ، [ 53 ] وATCC 11775 ، [ 54 ] وNCTC 9001، [ 55 ] وهي ممرضة للدجاج ولها نمط مصلي O1:K1:H7 . [ 56 ] ومع ذلك، في معظم الدراسات، تم استخدام إما O157:H7 أو K-12 MG1655 أو K-12 W3110 كممثل لبكتيريا الإشريكية القولونية  . لم يتم تسلسل جينوم السلالة النمطية إلا مؤخرًا (2013). [ 52 ]

علم تطور سلالات الإشريكية  القولونية

تم عزل وتوصيف العديد من السلالات التابعة لهذا النوع. بالإضافة إلى النمط المصلي ( انظر أعلاه )، يمكن تصنيفها وفقًا لتطورها السلالي ، أي تاريخها التطوري المُستنتج، كما هو موضح أدناه حيث تم تقسيم النوع إلى ست مجموعات اعتبارًا من عام 2014. [ 57 ] [ 58 ] ويُؤدي استخدام تسلسلات الجينوم الكامل بشكل خاص إلى الحصول على أشجار تطورية مدعومة بقوة. [ 52 ] ويظل هيكل المجموعة التطورية قويًا في مواجهة الطرق والتسلسلات الأحدث، والتي تُضيف أحيانًا مجموعات جديدة، ليصل العدد إلى 8 أو 14 مجموعة اعتبارًا من عام 2023. [ 59 ] [ 60 ]

إن العلاقة بين المسافة التطورية ("القرابة") والأمراض ضئيلة، [ 52 ] فعلى سبيل المثال، جميع سلالات النمط المصلي O157:H7، التي تُشكّل فرعًا حيويًا ( "مجموعة حصرية") - المجموعة E أدناه - هي سلالات معوية نزفية (EHEC)، ولكن ليست جميع سلالات EHEC وثيقة الصلة. في الواقع، تندرج أربعة أنواع مختلفة من الشيغيلا ضمن سلالات الإشريكية  القولونية ( انظر أعلاه ) ، بينما تقع الإشريكية  ألبرتي والإشريكية فيرغسوني  خارج هذه المجموعة. في الواقع، وُضعت جميع أنواع الشيغيلا ضمن نوع فرعي واحد من الإشريكية  القولونية في دراسة جينومية تطورية شملت السلالة النمطية. [ 52 ] تنتمي جميع سلالات الإشريكية القولونية المستخدمة في الأبحاث بشكل شائع إلى المجموعة A  ، وهي مشتقة بشكل رئيسي من سلالة كليفتون K-12 (λ + F + ؛ O16)، وبدرجة أقل من سلالة دي هيريل " العصوية القولونية " (السلالة B ؛ O7).

طُرحت مقترحات عديدة لمراجعة التصنيف بما يتوافق مع علم الوراثة العرقي. [ 52 ] ومع ذلك، يتعين على جميع هذه المقترحات أن تراعي حقيقة أن اسم "شيغيلا" لا يزال شائع الاستخدام في الطب، وأن تجد سبلًا للحد من أي لبس قد ينجم عن إعادة التسمية. [ 61 ]

السالمونيلا المعوية

إي. ألبرتي

إي. فيرغسوني

المجموعة  ب2

الإشريكية القولونية SE15 (O150:H5. متعايشة)

الإشريكية القولونية E2348/69 (O127:H6. ممرضة معوية)

المجموعة  د

الإشريكية القولونية UMN026 (O17:K52:H18. ممرضة خارج الخلية)

الإشريكية القولونية (O19:H34. ممرضة خارج الخلية)

الإشريكية القولونية (O7:K1. ممرضة خارج الخلية)

المجموعة  هـ
الشيغيلا
المجموعة  ب1

الإشريكية القولونية E24377A (O139:H28. منتجة للذيفان المعوي)

المجموعة  أ

الإشريكية القولونية HS (O9:H4. متعايشة)

E. coli ATCC8739 (O146. Crook's E. coli used in phage work in 1950s)

مشتقات سلالة K - 12  

E. coli K-12 W3110 (O16. λ − F − سلالة بيولوجيا جزيئية "من النوع البري")

E. coli K-12 DH10b (O16. سلالة بيولوجيا جزيئية عالية الكفاءة الكهربائية)

E. coli K-12 DH1 (O16. سلالة بيولوجيا جزيئية ذات كفاءة كيميائية عالية)

E. coli K-12 MG1655 (O16. λ − F − سلالة بيولوجيا جزيئية "من النوع البري")

E. coli BW2952 (سلالة بيولوجيا جزيئية مؤهلة O16)

الإشريكية القولونية 101-1 (O? H?. EAEC)

مشتقات  السلالة B 

E. coli B REL606 (O7. سلالة بيولوجيا جزيئية عالية الكفاءة)

E. coli BL21-DE3 (سلالة بيولوجيا التعبير الجزيئي O7 مع بوليميراز T7 لنظام pET)

علم الجينوم

صورة لبكتيريا الإشريكية  القولونية باستخدام المجهر الإلكتروني المبكر

نُشر أول تسلسل كامل للحمض النووي لجينوم بكتيريا الإشريكية القولونية  (سلالة المختبر K-12 المشتقة MG1655) عام 1997. وهو جزيء حمض نووي دائري يبلغ طوله 4.6 مليون زوج قاعدي ، ويحتوي على 4288 جينًا مُشفِّرًا للبروتين (مُنظمة في 2584 أوبيرونًا )، وسبعة أوبيرونات للرنا الريبوسومي (rRNA)، و86 جينًا للرنا الناقل (tRNA). على الرغم من خضوعه لتحليل جيني مكثف لنحو 40 عامًا، إلا أن العديد من هذه الجينات ظلت مجهولة سابقًا. وُجد أن كثافة الترميز عالية جدًا، بمتوسط ​​مسافة بين الجينات يبلغ 118 زوجًا قاعديًا فقط. لوحظ أن الجينوم يحتوي على عدد كبير من العناصر الجينية القابلة للنقل ، والعناصر المتكررة، والبروفاجات الخفية ، وبقايا العاثيات . [ 62 ] معظم الجينات لها نسخة واحدة فقط. [ 63 ] 

يُعرف أكثر من ثلاثمائة تسلسل جينومي كامل لأنواع الإشريكية القولونية والشيغيلا . أُضيف تسلسل جينوم السلالة النمطية للإشريكية القولونية إلى هذه المجموعة قبل عام ٢٠١٤. [ ٥٢ ] تُظهر مقارنة هذه التسلسلات تنوعًا ملحوظًا؛ إذ يُمثل حوالي ٢٠٪ فقط من كل جينوم تسلسلات موجودة في جميع العزلات، بينما قد يختلف حوالي ٨٠٪ من كل جينوم بين العزلات. [ ٣٩ ] يحتوي كل جينوم فردي على ما بين ٤٠٠٠ و٥٥٠٠ جين، لكن العدد الإجمالي للجينات المختلفة بين جميع سلالات الإشريكية القولونية المُتسلسلة (الجينوم الشامل) يتجاوز ١٦٠٠٠ جين. وقد فُسِّر هذا التنوع الكبير في الجينات المكونة على أنه يعني أن ثلثي الجينوم الشامل للإشريكية القولونية نشأ في أنواع أخرى ووصل من خلال عملية النقل الجيني الأفقي. [ ٦٤ ]   

تسمية الجينات

تُسمى الجينات في بكتيريا الإشريكية القولونية  عادةً وفقًا للتسمية الموحدة التي اقترحها ديميريك وآخرون [ 65 ] . تتكون أسماء الجينات من اختصارات ثلاثية الأحرف، مشتقة من وظيفتها (إن عُرفت) أو نمطها الظاهري الطافر، وتُكتب بخط مائل. عندما تشترك عدة جينات في نفس الاختصار، يُشار إلى الجينات المختلفة بحرف كبير يلي الاختصار، ويُكتب أيضًا بخط مائل. على سبيل المثال، سُمي الجين recA نسبةً إلى دوره في إعادة التركيب المتماثل، مضافًا إليه الحرف A. أما الجينات ذات الصلة الوظيفية، فتُسمى recB و recC و recD ، وهكذا. تُسمى البروتينات باختصارات بأحرف كبيرة، مثل RecA و RecB ، إلخ. عند تسلسل جينوم سلالة الإشريكية  القولونية K-12 الفرعية MG1655، رُقمت جميع الجينات المعروفة أو المتوقعة المُشفرة للبروتينات (تقريبًا) وفقًا لترتيبها على الجينوم، واختُصرت بأرقام تبدأ بحرف b، مثل b2819 (= recD ). تم استحداث أسماء "b" نسبةً إلى فريد ب. لاتنر، الذي قاد جهود تسلسل الجينوم. [ 62 ] وتم تقديم نظام ترقيم آخر مع تسلسل سلالة فرعية أخرى من الإشريكية  القولونية K-12، وهي W3110، التي تم تسلسلها في اليابان، ولذا تستخدم أرقامًا تبدأ بـ JW... ( اليابانية W3110 )، مثل JW2787 (= recD ). [ 66 ] وبالتالي، recD = b2819 = JW2787. مع ذلك، تجدر الإشارة إلى أن معظم قواعد البيانات لها نظام ترقيم خاص بها، فمثلاً، تستخدم قاعدة بيانات EcoGene [ 67 ] الرمز EG10826 للجين recD . وأخيرًا، تُستخدم أرقام ECK تحديدًا للأليلات في سلالة MG1655 من الإشريكية  القولونية K-12. [ 67 ] ويمكن الحصول على قوائم كاملة بالجينات ومرادفاتها من قواعد بيانات مثل EcoGene أو Uniprot .

علم البروتينات

البروتينات

يُشير تسلسل جينوم الإشريكية القولونية إلى  وجود 4288 جينًا مُشفِّرًا للبروتينات، لم تُعرف وظيفة 38% منها في البداية. وتُظهر المقارنة مع خمسة ميكروبات أخرى مُتسلسلة وجود عائلات جينية واسعة الانتشار، بالإضافة إلى عائلات جينية محدودة الانتشار؛ كما يتضح وجود العديد من عائلات الجينات المتشابهة داخل الإشريكية القولونية .  وتحتوي أكبر عائلة من البروتينات المتماثلة على 80 ناقلًا من نوع ABC. ويتميز الجينوم ككل بتنظيم لافت للنظر فيما يتعلق بالاتجاه المحلي للتضاعف؛ حيث تتجه قواعد الجوانين، والنيوكليوتيدات قليلة العدد التي يُحتمل ارتباطها بالتضاعف وإعادة التركيب، ومعظم الجينات، وفقًا لهذا الاتجاه. ويحتوي الجينوم أيضًا على عناصر تسلسل الإدخال (IS)، وبقايا العاثيات، والعديد من البقع الأخرى ذات التركيب غير المعتاد، مما يُشير إلى مرونة الجينوم من خلال النقل الأفقي. [ 62 ]

أجرت العديد من الدراسات تجارب عملية على بروتيوم بكتيريا الإشريكية القولونية .  وبحلول عام 2006، تم تحديد 1627 بروتينًا (38%) من البروتينات المتوقعة ( إطارات القراءة المفتوحة ، ORFs) تجريبيًا. [ 68 ] وفي عام 2020، اكتشف ماتيوس وآخرون 2586 بروتينًا تحتوي على ببتيدين على الأقل (60% من إجمالي البروتينات). [ 69 ]

التعديلات اللاحقة للترجمة (PTMs)

على الرغم من أن عدد البروتينات البكتيرية التي تخضع لتعديلات ما بعد الترجمة (PTMs) أقل بكثير مقارنةً بالبروتينات حقيقية النواة ، إلا أن عددًا كبيرًا من البروتينات في بكتيريا الإشريكية القولونية (E.  coli ) يخضع لتعديلات. فعلى سبيل المثال، وجد بوتيل وآخرون (2018) 227 بروتينًا مُفسفرًا، منها 173 بروتينًا مُفسفرًا على الهيستيدين . وكانت غالبية الأحماض الأمينية المُفسفرة من نوع السيرين (1220 موقعًا)، مع وجود 246 موقعًا فقط على الهيستيدين ، و501 موقعًا مُفسفرًا على الثريونين، و162 موقعًا على التيروسين . [ 70 ]

التفاعل

تمت دراسة التفاعلات البروتينية لبكتيريا الإشريكية القولونية عن طريق تنقية التقارب وقياس الطيف الكتلي  ( AP / MS) وعن طريق تحليل التفاعلات الثنائية بين بروتيناتها.

معقدات البروتين . في دراسة أجريت عام 2006، تم تنقية 4339 بروتينًا من مزارع السلالة K-12، ووُجدت شركاء تفاعل لـ 2667 بروتينًا، كان العديد منها مجهول الوظيفة آنذاك. [ 71 ] وفي دراسة أخرى أجريت عام 2009، وُجد 5993 تفاعلًا بين بروتينات من نفس سلالة الإشريكية القولونية  ، إلا أن هذه البيانات أظهرت تداخلًا ضئيلًا مع بيانات دراسة 2006. [ 72 ]

التفاعلات الثنائية . أجرى راجاغوبالا وآخرون (2014) فحوصات منهجية باستخدام نظام الخميرة ثنائي الهجين مع معظم بروتينات الإشريكية  القولونية ، ووجدوا ما مجموعه 2234 تفاعلًا بين البروتينات. [ 73 ] كما دمجت هذه الدراسة التفاعلات الجينية وبنى البروتينات، ورسمت خريطة لـ 458 تفاعلًا ضمن 227 مركبًا بروتينيًا .

الميكروبات الطبيعية

تنتمي بكتيريا الإشريكية القولونية إلى مجموعة من البكتيريا تُعرف بشكل غير رسمي باسم الكوليفورم ، وتوجد في الجهاز الهضمي للحيوانات ذوات الدم الحار . [ 49 ] تستوطن الإشريكية القولونية عادةً  الجهاز الهضمي للرضيع خلال 40 ساعة من الولادة، حيث تصل إليه مع الطعام أو الماء أو من الأشخاص الذين يتعاملون معه. في الأمعاء، تلتصق الإشريكية القولونية بمخاط  الأمعاء الغليظة . وهي البكتيريا اللاهوائية الاختيارية الرئيسية في الجهاز الهضمي البشري. [ 74 ] ( البكتيريا اللاهوائية الاختيارية هي كائنات حية يمكنها النمو في وجود الأكسجين أو غيابه). وطالما لم تكتسب هذه البكتيريا عناصر وراثية تُشفّر عوامل ضراوة ، فإنها تبقى كائنات متعايشة غير ضارة . [ 75 ]

الاستخدام العلاجي

نظرًا لانخفاض تكلفتها وسرعة زراعتها وتعديلها في المختبرات، تُعدّ الإشريكية  القولونية منصة تعبير شائعة لإنتاج البروتينات المؤتلفة المستخدمة في العلاجات. ومن مزايا استخدامها مقارنةً بمنصات التعبير الأخرى أنها لا تُصدّر بطبيعتها الكثير من البروتينات إلى الحيز المحيط بالخلية ، مما يُسهّل استخلاص البروتين المطلوب دون تلوث متبادل. [ 76 ] وتُعدّ سلالات الإشريكية  القولونية K  -12 ومشتقاتها (DH1، DH5α، MG1655، RV308، وW3110) من أكثر السلالات استخدامًا في صناعة التقنية الحيوية . [ 77 ] تُستخدم سلالات الإشريكية القولونية غير الممرضة Nissle 1917 (EcN) (Mutaflor) والإشريكية القولونية O83 :K24:H31 (Colinfant) [ 78 ] [ 79 ] كعوامل بروبيوتيك في الطب، وخاصةً لعلاج أمراض الجهاز الهضمي المختلفة ، [ 80 ] بما في ذلك داء الأمعاء الالتهابي . [ 81 ] يُعتقد أن سلالة EcN قد تُعيق نمو مسببات الأمراض الانتهازية، بما في ذلك السالمونيلا وغيرها من مسببات الأمراض المعوية القولونية ، من خلال إنتاج بروتينات الميكروسين وإنتاج السايدروفورات . [ 82 ]   

دورها في المرض

معظم سلالات الإشريكية  القولونية لا تُسبب المرض، إذ تعيش بشكل طبيعي في الأمعاء، [ 83 ] لكن السلالات الضارية قد تُسبب التهاب المعدة والأمعاء ، والتهابات المسالك البولية ، والتهاب السحايا الوليدي ، والتهاب القولون النزفي، وداء كرون . [ 84 ] تشمل العلامات والأعراض الشائعة تقلصات شديدة في البطن، وإسهالًا، والتهاب القولون النزفي، وقيئًا، وحمى في بعض الأحيان. في حالات نادرة، تكون السلالات الضارية مسؤولة أيضًا عن نخر الأمعاء (موت الأنسجة) وانثقابها دون أن يتطور الأمر إلى متلازمة انحلال الدم اليوريمي ، أو التهاب الصفاق ، أو التهاب الضرع ، أو تسمم الدم ، أو الالتهاب الرئوي الناتج عن البكتيريا سالبة الغرام . يُعدّ الأطفال الصغار جدًا أكثر عرضة للإصابة بأمراض خطيرة، مثل متلازمة انحلال الدم اليوريمي؛ ومع ذلك، فإن الأفراد الأصحاء من جميع الأعمار مُعرّضون لخطر العواقب الوخيمة التي قد تنشأ نتيجة الإصابة بالإشريكية القولونية  . [ 74 ] [ 85 ] [ 86 ] [ 87 ]

بعض سلالات الإشريكية  القولونية ، مثل O157:H7، قادرة على إنتاج سم شيغا . يُسبب هذا السم استجابات التهابية في خلايا الأمعاء، مُخلّفًا آفات تُؤدي إلى الإسهال الدموي، وهو أحد أعراض عدوى الإشريكية القولونية المُنتجة لسم شيغا ( STEC  ). كما يُؤدي هذا السم إلى تدمير مُبكر لخلايا الدم الحمراء، مما يُسبب انسدادًا في الكلى، وهي الجهاز المسؤول عن ترشيح الدم. في حالات نادرة (عادةً لدى الأطفال وكبار السن)، قد يُسبب متلازمة انحلال الدم اليوريمي (HUS)، التي قد تُؤدي إلى الفشل الكلوي وحتى الوفاة. تشمل أعراض متلازمة انحلال الدم اليوريمي انخفاض عدد مرات التبول، والخمول، وشحوب الخدين وداخل الجفون السفلية. يُعاني 25% من مرضى متلازمة انحلال الدم اليوريمي من مضاعفات في الجهاز العصبي، والتي بدورها تُسبب السكتات الدماغية . بالإضافة إلى ذلك، يتسبب هذا الإجهاد في تراكم السوائل (نتيجةً لتوقف الكليتين عن العمل)، مما يؤدي إلى وذمة حول الرئتين والساقين والذراعين. هذا التراكم المتزايد للسوائل، وخاصةً حول الرئتين، يعيق عمل القلب، مما يسبب ارتفاعًا في ضغط الدم. [ 88 ] [ 86 ] [ 87 ]

تُعدّ الإشريكية القولونية  المسببة لالتهابات المسالك البولية (UPEC) أحد الأسباب الرئيسية لهذه الالتهابات . [ 89 ] وهي جزء من الميكروبات الطبيعية في الأمعاء، ويمكن أن تنتقل إلى الجسم بطرق عديدة. وبالنسبة للنساء تحديدًا، قد يؤدي اتجاه المسح بعد التبرز (المسح من الخلف إلى الأمام) إلى تلوث فتحات الجهاز البولي التناسلي بالبراز. كما يمكن أن يُدخل الجماع الشرجي هذه البكتيريا إلى مجرى البول لدى الرجال، وعند الانتقال من الجماع الشرجي إلى المهبلي، قد يُدخل الرجل أيضًا الإشريكية القولونية المسببة لالتهابات المسالك البولية إلى الجهاز البولي التناسلي لدى النساء.

تُعدّ الإشريكية القولونية  المنتجة للذيفان المعوي (ETEC) السبب الأكثر شيوعًا لإسهال المسافرين ، حيث تصل حالات الإصابة بها إلى 840  مليون حالة سنويًا في البلدان النامية حول العالم. تنتقل هذه البكتيريا عادةً عبر الطعام أو مياه الشرب الملوثة، وتلتصق ببطانة الأمعاء ، حيث تفرز أحد نوعين من الذيفانات المعوية ، مما يؤدي إلى إسهال مائي. ويكون معدل الإصابة وشدتها أعلى بين الأطفال دون سن الخامسة، حيث تصل الوفيات إلى 380 ألف حالة سنويًا. [ 90 ]

في مايو/أيار 2011، تسببت سلالة واحدة من بكتيريا الإشريكية  القولونية ، O104:H4 ، في تفشي عدوى بكتيرية بدأت في ألمانيا . تُعد بعض سلالات الإشريكية  القولونية سببًا رئيسيًا للأمراض المنقولة بالغذاء . بدأ التفشي عندما أُصيب عدد من الأشخاص في ألمانيا ببكتيريا الإشريكية القولونية النزفية المعوية (EHEC)  ، مما أدى إلى متلازمة انحلال الدم اليوريمي (HUS)، وهي حالة طبية طارئة تتطلب علاجًا عاجلًا. انتشر التفشي إلى 15 دولة أخرى، بما في ذلك مناطق في أمريكا الشمالية. [ 91 ] في 30 يونيو/حزيران 2011، أعلن المعهد الاتحادي الألماني لتقييم المخاطر (BfR) ، وهو معهد اتحادي تابع لوزارة الغذاء والزراعة وحماية المستهلك الألمانية ، أن بذور الحلبة المصرية يُرجح أنها كانت سبب تفشي بكتيريا الإشريكية القولونية النزفية المعوية . [ 92 ]

أظهرت بعض الدراسات غياب بكتيريا الإشريكية القولونية  في البكتيريا المعوية لدى الأفراد المصابين باضطراب التمثيل الغذائي المعروف باسم بيلة الفينيل كيتون . ويُفترض أن غياب هذه البكتيريا الطبيعية يُضعف إنتاج فيتاميني ب 2 (الريبوفلافين) وك 2 (الميناكينون) الأساسيين، وهما فيتامينان لهما دورٌ في العديد من الوظائف الفسيولوجية لدى الإنسان، مثل استقلاب الخلايا والعظام، وبالتالي يُسهم في الإصابة بهذا الاضطراب. [ 93 ]

تُعرف الإشريكية القولونية  المقاومة للكاربابينيم ( الإشريكية القولونية المنتجة للكاربابينيميز )  بمقاومتها لمضادات الكاربابينيم ، التي تُعتبر الخيار الأخير لعلاج مثل هذه العدوى. وتعود مقاومتها إلى إنتاجها إنزيمًا يُسمى الكاربابينيميز، والذي يُعطّل جزيء الدواء. [ 94 ]

فترة الحضانة

تُسمى الفترة الزمنية بين تناول بكتيريا الإشريكية القولونية المنتجة لسموم شيغا (STEC) والشعور بالمرض "فترة الحضانة". عادةً ما تكون فترة الحضانة من 3 إلى 4 أيام بعد التعرض، ولكنها قد تكون أقصر من ذلك، تصل إلى يوم واحد، أو أطول، تصل إلى 10 أيام. غالبًا ما تبدأ الأعراض ببطء بألم خفيف في البطن أو إسهال غير دموي يتفاقم على مدى عدة أيام. في حال حدوث متلازمة انحلال الدم اليوريمي (HUS)، فإنها تتطور في المتوسط ​​بعد 7 أيام من ظهور الأعراض الأولى، عندما يبدأ الإسهال بالتحسن. [ 95 ]

تشخبص

يُشخَّص الإسهال المعدي ويُحدَّد مقاومة المضادات الحيوية عن طريق زراعة عينة من البراز، تليها اختبارات حساسية المضادات الحيوية . تستغرق زراعة مسببات الأمراض المعوية مدة تتراوح بين يومين وعدة أسابيع. تختلف حساسية (إيجابية حقيقية) وخصوصية (سلبية حقيقية) زراعة البراز باختلاف مسبب المرض، مع العلم أن بعض مسببات الأمراض البشرية لا يمكن زراعتها . بالنسبة للعينات التي أظهرت نتائج إيجابية في الزراعة، يستغرق اختبار مقاومة المضادات الحيوية من 12 إلى 24 ساعة إضافية.

تستطيع اختبارات التشخيص الجزيئي الحالية في نقاط الرعاية تحديد بكتيريا الإشريكية القولونية ومقاومتها للمضادات الحيوية في السلالات المُحددة بسرعة أكبر بكثير من اختبارات الزرع والحساسية. ويمكن لمنصات المصفوفات الدقيقة تحديد سلالات الإشريكية القولونية الممرضة وجينات مقاومة المضادات الحيوية الخاصة بها في غضون ساعتين أو أقل بحساسية ونوعية عاليتين، إلا أن حجم لوحة الاختبار (أي إجمالي مسببات الأمراض وجينات مقاومة المضادات الحيوية) محدود. ويجري حاليًا تطوير منصات تشخيص الأمراض المعدية الحديثة القائمة على علم الجينوم البيئي للتغلب على القيود المختلفة للزرع وجميع تقنيات التشخيص الجزيئي المتاحة حاليًا.   

علاج

يرتكز العلاج بشكل أساسي على تقييم الجفاف وتعويض السوائل والكهارل. وقد ثبت أن إعطاء المضادات الحيوية يُقصر مدة المرض وفترة إفراز الإشريكية القولونية المنتجة للذيفان المعوي (  ETEC ) لدى البالغين في المناطق الموبوءة وفي حالات إسهال المسافرين، على الرغم من تزايد معدل مقاومة المضادات الحيوية الشائعة الاستخدام، ولذا لا يُنصح بها عمومًا. [ 96 ] يعتمد المضاد الحيوي المستخدم على أنماط الحساسية في المنطقة الجغرافية المعنية. حاليًا، تُعد الفلوروكينولونات أو أزيثروميسين من المضادات الحيوية المفضلة ، مع دور متزايد للريفاكسيمين . يُعد الريفاكسيمين، وهو مشتق شبه اصطناعي من الريفاميسين، مضادًا حيويًا فعالًا وجيد التحمل لعلاج البالغين المصابين بإسهال المسافرين غير الغازي. وقد كان الريفاكسيمين أكثر فعالية بشكل ملحوظ من الدواء الوهمي، ولم يكن أقل فعالية من السيبروفلوكساسين في تقليل مدة الإسهال. في حين أن الريفاكسيمين فعال في علاج المرضى المصابين بإسهال المسافرين الناتج عن بكتيريا الإشريكية القولونية، إلا أنه يبدو غير فعال في علاج المرضى المصابين بمسببات الأمراض المعوية  الالتهابية أو الغازية . [ 97 ]

وقاية

تُعدّ بكتيريا الإشريكية القولونية المنتجة  للذيفان المعوي (ETEC) النوعَ الذي تُركّز عليه معظم جهود تطوير اللقاحات. توفر الأجسام المضادة ضدّ ذيفان الكوليرا (LT) وعوامل التكوّن الرئيسية (CFs) لبكتيريا ETEC حمايةً ضدّ عوامل التكوّن المتماثلة المنتجة لذيفان الكوليرا (LT) والتي تُعبّر عن بكتيريا ETEC. وقد طُوّرت لقاحات فموية مُعطّلة تتكوّن من مستضدّ الذيفان وخلايا كاملة، مثل لقاح الكوليرا المُرخّص المُصنّع من الوحدة الفرعية B المُعاد تركيبها (rCTB) والخلايا الكاملة (Dukoral). لا توجد حاليًا لقاحات مُرخّصة لبكتيريا ETEC، على الرغم من وجود العديد منها في مراحل تطوير مختلفة. [ 98 ] في تجارب سريرية مختلفة، وفّر لقاح الكوليرا المُصنّع من الوحدة الفرعية B المُعاد تركيبها (rCTB) والخلايا الكاملة (WC) حمايةً عالية (85-100%) على المدى القصير. وقد أظهرت التجارب السريرية أن لقاحًا فمويًا مُرشّحًا لبكتيريا ETEC يتكوّن من الوحدة الفرعية B المُعاد تركيبها (rCTB) وبكتيريا الإشريكية القولونية المُعطّلة  بالفورمالين والتي تُعبّر عن عوامل التكوّن الرئيسية، آمن وفعّال في تحفيز المناعة ضدّ الإسهال الحادّ لدى المسافرين الأمريكيين، ولكنه غير فعّال ضدّ إسهال بكتيريا ETEC لدى الأطفال الصغار في مصر . يخضع لقاح معدل ضد بكتيريا الإشريكية القولونية المسببة للإسهال (ETEC)، يتكون من سلالات معاد تركيبها من بكتيريا الإشريكية القولونية التي تفرط في التعبير عن عوامل التكاثر الرئيسية، بالإضافة إلى ذيفان هجين يشبه ذيفان LT ويسمى LCTBA، للاختبارات السريرية.  [ 99 ] [ 100 ]

تشمل طرق الوقاية الأخرى المثبتة من انتقال بكتيريا الإشريكية القولونية  غسل اليدين وتحسين الصرف الصحي ومياه الشرب، إذ ينتقل المرض عن طريق التلوث البرازي للأغذية ومصادر المياه. إضافةً إلى ذلك، يُعد طهي اللحوم جيدًا وتجنب تناول المشروبات النيئة غير المبسترة، مثل العصائر والحليب، من الطرق الأخرى المثبتة للوقاية من الإشريكية القولونية  . وأخيرًا، ينبغي تجنب التلوث المتبادل للأواني وأماكن العمل عند تحضير الطعام. [ 101 ]

الكائنات النموذجية في أبحاث علوم الحياة

بكتيريا الإشريكية القولونية ، ٢٠٢١، رسم توضيحي لديفيد إس. جودسيل، بنك بيانات البروتين RCSB. تُظهر هذه اللوحة مقطعًا عرضيًا لخلية من بكتيريا الإشريكية القولونية . يظهر جدار الخلية المميز ذو الغشائين، الخاص بالبكتيريا سالبة الغرام، باللون الأخضر، مع العديد من سلاسل الليبوبوليسكاريد الممتدة من السطح وشبكة من خيوط الببتيدوغليكان المتشابكة بين الغشائين. يشكل جينوم الخلية "نوكليودًا" غير محدد المعالم، يظهر هنا باللون الأصفر، ويتفاعل مع العديد من البروتينات الرابطة للحمض النووي، الموضحة باللونين البني والبرتقالي. تشغل الجزيئات الكبيرة القابلة للذوبان، مثل الريبوسومات (الملونة باللون الأرجواني المحمر)، معظم المساحة المحيطة بالنوكليود.

بسبب تاريخها الطويل في الاستزراع المختبري وسهولة التعامل معها، تلعب بكتيريا الإشريكية القولونية  دورًا هامًا في الهندسة البيولوجية الحديثة وعلم الأحياء الدقيقة الصناعي . [ 102 ] وقد شكّل عمل ستانلي نورمان كوهين وهربرت بوير على بكتيريا الإشريكية القولونية  ، باستخدام البلازميدات وإنزيمات التقييد لإنتاج الحمض النووي المؤتلف ، أساسًا للتكنولوجيا الحيوية. [ 103 ]

تُعدّ بكتيريا الإشريكية القولونية مضيفًا متعدد الاستخدامات لإنتاج البروتينات غير المتجانسة ، [ 104 ] وقد طُوّرت أنظمة تعبير بروتيني متنوعة تسمح بإنتاج البروتينات المؤتلفة في هذه البكتيريا . يستطيع الباحثون إدخال الجينات إلى الميكروبات باستخدام البلازميدات التي تسمح بالتعبير عن البروتين بمستويات عالية، ويمكن إنتاج هذا البروتين بكميات كبيرة في عمليات التخمير الصناعية . كان من أوائل التطبيقات المفيدة لتقنية الحمض النووي المؤتلف التلاعب ببكتيريا الإشريكية القولونية لإنتاج الأنسولين البشري . [ 105 ]  

تم بنجاح التعبير عن العديد من البروتينات التي كان يُعتقد سابقًا أنها صعبة أو مستحيلة في بكتيريا الإشريكية القولونية  (E.  coli) بشكلها المطوي . على سبيل المثال، يمكن إنتاج البروتينات التي تحتوي على روابط ثنائية الكبريتيد متعددة في الفراغ المحيط بالبلازما أو في سيتوبلازم الطفرات التي تم جعلها مؤكسدة بدرجة كافية لتكوين روابط ثنائية الكبريتيد، [ 106 ] بينما تم التعبير عن البروتينات التي تتطلب تعديلات ما بعد الترجمة ، مثل الغلكزة، من أجل الاستقرار أو الوظيفة، باستخدام نظام الغلكزة المرتبط بالنيتروجين الخاص ببكتيريا كامبيلوباكتر جيجوني (Campylobacter jejuni) المُهندس في بكتيريا الإشريكية القولونية  . [ 107 ] [ 108 ] [ 109 ]

استُخدمت خلايا الإشريكية القولونية المعدلة  في تطوير اللقاحات ، والمعالجة الحيوية ، وإنتاج الوقود الحيوي ، [ 110 ] والإضاءة، وإنتاج الإنزيمات المثبتة . [ 104 ] [ 111 ]

السلالة K-12 هي شكل متحور من بكتيريا الإشريكية القولونية ( E.  coli) تُفرط في التعبير عن إنزيم الفوسفاتاز القلوي (ALP). [ 112 ] تنشأ الطفرة نتيجة خلل في الجين المسؤول عن ترميز هذا الإنزيم باستمرار. يُقال إن الجين الذي يُنتج ناتجًا دون أي تثبيط يتمتع بنشاط تكويني . يُستخدم هذا الشكل المتحور تحديدًا لعزل وتنقية الإنزيم المذكور. [ 112 ]

تُستخدم سلالة OP50 من الإشريكية القولونية للحفاظ على مزارع Caenorhabditis elegans .

السلالة JM109 هي شكل متحور من بكتيريا الإشريكية القولونية  ، تفتقر إلى جيني recA وendA. يمكن استخدام هذه السلالة في فحص الخلايا باستخدام تقنية التلوين الأزرق/الأبيض عندما تحمل الخلايا جين عامل الخصوبة. [ 113 ] يقلل غياب جين recA من احتمالية التقييد غير المرغوب فيه للحمض النووي المستهدف، بينما يمنع غياب جين endA تحلل الحمض النووي البلازميدي. لذا، تُعد السلالة JM109 مفيدة لأنظمة الاستنساخ والتعبير الجيني.

الكائن النموذجي

صورة مجهرية لأيونات الهيليوم تُظهر عاثية T4 وهي تُصيب بكتيريا الإشريكية القولونية  . بعض العاثيات الملتصقة لها ذيول منكمشة، مما يدل على أنها حقنت حمضها النووي في الخلية المضيفة. يبلغ  عرض الخلايا البكتيرية حوالي 0.5 ميكرومتر. [ 114 ]

تُستخدم بكتيريا الإشريكية القولونية ( E. coli) بشكل متكرر ككائن نموذجي في دراسات علم الأحياء الدقيقة . تتميز السلالات المُستزرعة (مثل E.  coli K12) بتكيفها الجيد مع بيئة المختبر، وعلى عكس السلالات البرية ، فقدت قدرتها على النمو في الأمعاء. تفقد العديد من السلالات المختبرية قدرتها على تكوين الأغشية الحيوية . [ 115 ] [ 116 ] تحمي هذه الخصائص السلالات البرية من الأجسام المضادة والهجمات الكيميائية الأخرى، ولكنها تتطلب استهلاكًا كبيرًا للطاقة والموارد. غالبًا ما تُستخدم الإشريكية القولونية ككائن  حي دقيق نموذجي في أبحاث طرق معالجة المياه وتعقيمها الحديثة، بما في ذلك التحفيز الضوئي . باستخدام طرق العد القياسية على الأطباق ، بعد التخفيفات المتسلسلة، والنمو على أطباق هلام الأغار، يمكن تقييم تركيز الكائنات الحية القابلة للحياة أو وحدات تكوين المستعمرات (CFUs) في حجم معروف من المياه المعالجة، مما يسمح بالتقييم المقارن لأداء المواد. [ 117 ]

في عام 1946، وصف جوشوا ليدربيرغ وإدوارد تاتوم لأول مرة ظاهرة الاقتران البكتيري باستخدام بكتيريا الإشريكية القولونية  كنموذج، [ 118 ] ولا تزال هذه البكتيريا النموذج الأساسي لدراسة الاقتران. [ 119 ] شكلت الإشريكية القولونية جزءًا  لا يتجزأ من التجارب الأولى لفهم علم وراثة العاثيات، [ 120 ] واستخدم باحثون رواد، مثل سيمور بنزر ، الإشريكية  القولونية وعاثية T4 لفهم بنية الجينات. [ 121 ] قبل أبحاث بنزر، لم يكن معروفًا ما إذا كان الجين ذا بنية خطية أم متفرعة. [ 122 ]

كانت بكتيريا الإشريكية القولونية واحدة من أوائل الكائنات الحية التي تم تحديد تسلسل جينومها؛ وقد تم نشر الجينوم الكامل لبكتيريا الإشريكية  القولونية K12 بواسطة مجلة ساينس في عام 1997. [ 62 ]

MDS42

في الفترة من عام 2002 إلى عام 2010، ابتكر فريقٌ في الأكاديمية الهنغارية للعلوم سلالةً من بكتيريا الإشريكية القولونية تُسمى MDS42، والتي تُباع الآن من قِبل شركة Scarab Genomics في ماديسون، ويسكونسن، تحت اسم "Clean Genome E.  coli " [ 123 ]. وقد أُزيل 15% من جينوم السلالة الأصلية ( E.  coli K-12 MG1655) لتحسين كفاءة البيولوجيا الجزيئية، وذلك بإزالة عناصر الإدخال (IS ) والجينات الكاذبة والفيروسات ، مما أدى إلى تحسين الحفاظ على الجينات السامة المشفرة على البلازميد، والتي غالبًا ما تُعطَّل بواسطة العناصر المتحركة (الترانسبوزونات). [ 124 ] [ 125 ] [ 126 ] ولم تُجرَ أي تغييرات على الكيمياء الحيوية وآلية التضاعف.

من خلال تقييم إمكانية دمج تقنيات النانو مع علم البيئة الطبيعية ، يمكن توليد بيئات معقدة بتفاصيل دقيقة على المستوى النانوي. [ 127 ] على هذه النظم البيئية الاصطناعية ، أُجريت تجارب تطورية باستخدام بكتيريا الإشريكية القولونية لدراسة الفيزياء الحيوية المكانية للتكيف في  جغرافية حيوية جزرية على شريحة.

في دراسات أخرى، استُخدمت بكتيريا الإشريكية القولونية  غير الممرضة ككائن حي نموذجي لفهم تأثيرات انعدام الجاذبية المُحاكى (على الأرض) عليها. [ 128 ] [ 129 ]

الاستخدامات في الحوسبة البيولوجية

منذ عام 1961، اقترح العلماء فكرة استخدام الدوائر الجينية في المهام الحسابية. وقد أتاح التعاون بين علماء الأحياء وعلماء الحاسوب تصميم بوابات منطقية رقمية على استقلاب بكتيريا الإشريكية القولونية  . ولأن أوبيرون اللاكتوز عملية ثنائية المراحل، يُستخدم التنظيم الجيني في البكتيريا لتحقيق وظائف الحوسبة. وتُتحكم هذه العملية في مرحلة نسخ الحمض النووي إلى الحمض النووي الريبوزي الرسول. [ 130 ]

تُجرى دراسات لمحاولة برمجة بكتيريا الإشريكية القولونية لحل  مسائل رياضية معقدة، مثل مسألة مسار هاميلتون . [ 131 ]

تم تطوير جهاز حاسوب للتحكم في إنتاج البروتين في بكتيريا الإشريكية القولونية داخل  خلايا الخميرة . [ 132 ] كما تم تطوير طريقة لاستخدام البكتيريا كشاشة عرض LCD . [ 133 ] [ 134 ]

في يوليو 2017، أظهرت تجارب منفصلة أُجريت على بكتيريا الإشريكية القولونية  ونُشرت في مجلة Nature إمكانية استخدام الخلايا الحية في مهام الحوسبة وتخزين المعلومات. [ 135 ] وقد طوّر فريقٌ مُشكّلٌ بالتعاون مع باحثين من معهد التصميم الحيوي بجامعة ولاية أريزونا ومعهد وايس للهندسة المستوحاة من علم الأحياء بجامعة هارفارد، حاسوبًا حيويًا داخل بكتيريا الإشريكية القولونية  يستجيب لاثني عشر مُدخلًا. أطلق الفريق على هذا الحاسوب اسم "الحاسوب الريبي" نظرًا لتكوينه من الحمض النووي الريبي . [ 136 ] [ 137 ] في الوقت نفسه، بحث باحثون من جامعة هارفارد إمكانية تخزين المعلومات في البكتيريا بعد نجاحهم في أرشفة الصور ومقاطع الفيديو في الحمض النووي لخلايا الإشريكية القولونية الحية.  [ 138 ] [ 139 ] في عام 2021، أجرى فريقٌ بقيادة عالم الفيزياء الحيوية سانغرام باغ دراسةً على بكتيريا الإشريكية القولونية لحلّ  مسائل متاهة 2 × 2 لاستكشاف مبدأ الحوسبة الموزعة بين الخلايا. [ 140 ] [ 141 ]

تاريخ

في عام 1885، اكتشف طبيب الأطفال الألماني النمساوي تيودور إيشيريش هذا الكائن الحي في براز الأفراد الأصحاء. أطلق عليه اسم بكتيريا القولون الشائعة (Bacterium coli commune) لوجوده في القولون. صنّفت التصنيفات المبكرة للكائنات بدائية النواة هذه البكتيريا ضمن عدد قليل من الأجناس بناءً على شكلها وحركتها (في ذلك الوقت، كان تصنيف إرنست هيكل للبكتيريا ضمن مملكة البدائيات (Monera ) هو السائد). [ 100 ] [ 142 ] [ 143 ]

كانت بكتيريا القولون (Bacterium coli) هي النوع النمطي لجنس البكتيريا (Bacterium) الذي أصبح الآن غير صالح، وذلك عندما تبيّن أن النوع النمطي السابق ( بكتيريا ثلاثية الحويصلات ) كان مفقودًا. [ 144 ] بعد مراجعة جنس البكتيريا ، أعاد ميغولا تصنيفها إلى عصية القولون (Bacillus coli) في عام 1895 [ 145 ] ، ثم أعاد تصنيفها لاحقًا في الجنس المُستحدث الإشريكية (Escherichia) ، الذي سُمّي تيمنًا بمكتشفها الأصلي، ألدو كاستيلاني وألبرت جون تشالمرز . [ 146 ]

في عام 1996، تفشى التسمم الغذائي ببكتيريا الإشريكية  القولونية في ويشاو، اسكتلندا، مما أسفر عن وفاة 21 شخصًا. [ 147 ] [ 148 ] وقد تجاوز عدد الوفيات هذا الرقم في عام 2011، عندما تفشى مرض الإشريكية  القولونية O104:H4 في ألمانيا، والذي ارتبط ببراعم الحلبة العضوية ، مما أسفر عن وفاة 53 شخصًا.

في عام 2024، حدث تفشي للتسمم الغذائي ببكتيريا الإشريكية  القولونية في جميع أنحاء الولايات المتحدة، وقد ارتبط ذلك بالجزر العضوي المزروع في الولايات المتحدة، مما تسبب في حالة وفاة واحدة وعشرات الإصابات. [ 149 ]

الاستخدامات

تُستخدم بكتيريا الإشريكية القولونية في العديد من التطبيقات العملية إلى جانب استخدامها كناقل للتجارب والعمليات الجينية. فعلى سبيل المثال، يمكن استخدامها لإنتاج البروبان الاصطناعي وهرمون النمو البشري المُعاد تركيبه .  [ 150 ] [ 151 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 ليكوينتر جي، رشدي إل، دارلو بي، دينامور إي (ديسمبر 1998). "التصنيف الجزيئي لبكتيريا الإشريكية القولونية باستخدام اختبار اختلاف طول عدم التطابق" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 15 (12): 1685-95 . doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025895 . PMID 9866203 . 
  2. ↑ "coli" . قاموس أكسفورد الإنجليزي ( الطبعة الإلكترونية). مطبعة جامعة أكسفورد. (يشترط الاشتراك أو عضوية المؤسسة المشاركة .)
  3. ↑ ويلز، جيه سي (2000) قاموس لونغمان للنطق. هارلو [إنجلترا]، بيرسون للتعليم المحدودة.
  4. ↑ تينايلون أو، سكورنيك د، بيكارد ب، دينامور إي (مارس 2010). "علم الوراثة السكانية لبكتيريا الإشريكية القولونية المتعايشة". مراجعات الطبيعة. علم الأحياء الدقيقة . 8 (3): 207-217 . doi : 10.1038/nrmicro2298 . PMID 20157339. S2CID 5490303 .  
  5. ↑ سينغلتون، ب. (1999). البكتيريا في علم الأحياء والتكنولوجيا الحيوية والطب (الطبعة الخامسة ). وايلي. الصفحات 444-454 . ISBN   978-0-471-98880-9.
  6. ↑ إيكبرغ، بي. بي.، وبيك، إي. إم.، وبرنشتاين، سي. إن.، وبوردوم، إي.، وديثليفن، إل.، وسارجنت، إم.، وآخرون . (يونيو 2005). "تنوع الميكروبات المعوية البشرية" . مجلة ساينس . 308 (5728): 1635-1638 . رمز Bibcode : 2005Sci... 308.1635E . doi : 10.1126/science.1110591 . PMC 1395357. PMID 15831718 .   
  7. ↑ مارتينسون جيه إن في، وووك إس تي (2020). " استيطان الإشريكية القولونية في أمعاء البالغين الأصحاء" . إيكوسال بلس . 9 (1). doi : 10.1177/003335490512000211 . PMC 7523338. PMID 32978935 .  
  8. ↑ بنتلي ر، ميغاناثان ر (سبتمبر 1982). " التخليق الحيوي لفيتامين ك (ميناكينون) في البكتيريا" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 46 (3): 241-280 . doi : 10.1128/ecosalplus.ESP-0003-2020 . PMC 281544. PMID 6127606 .  
  9. ↑ هودو إس، غينيو جيه، سيرفين إيه إل (يوليو 2001). " سلالات الإشريكية القولونية التي تستوطن الجهاز الهضمي تحمي الفئران الخالية من الجراثيم من عدوى السالمونيلا التيفية " . مجلة الأمعاء . 49 (1): 47-55 . doi : 10.1136/gut.49.1.47 . PMC 1728375. PMID 11413110 .  
  10. ↑ ريد، جي.، هوارد، ج.، غان، ب.س. (سبتمبر 2001). "هل يمكن للتداخل البكتيري أن يمنع العدوى؟". اتجاهات في علم الأحياء الدقيقة . 9 (9): 424-428 . Bibcode : 2001TrMic...9..424R . doi : 10.1016/S0966-842X(01)02132-1 . PMID 11553454 . 
  11. ↑ راسل جيه بي، جارفيس جي إن (أبريل 2001). "آليات عملية لقطع دورة حياة الإشريكية القولونية في الفم والبراز " . مجلة علم الأحياء الدقيقة الجزيئي والتكنولوجيا الحيوية . 3 (2): 265-272 . PMID 11321582 . 
  12. ↑ "الإشريكية القولونية" . المركز الوطني للأمراض المعدية الناشئة والحيوانية المنشأ التابع لمراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 أكتوبر 2012 .
  13. ↑ فوغت، آر. إل.، وديبولد، إل. (2005). " تفشي بكتيريا الإشريكية القولونية O157:H7 المرتبط باستهلاك اللحم المفروم، يونيو-يوليو 2002" . تقارير الصحة العامة . 120 (2): 174-178 . doi : 10.1177/003335490512000211 . PMC 1497708. PMID 15842119 .  
  14. 1 2 فينغ ب، ويغانت س، غرانت م (1 سبتمبر 2002). "تعداد بكتيريا الإشريكية القولونية وبكتيريا القولونيات" . الدليل التحليلي البكتيري (الطبعة الثامنة) . إدارة الغذاء والدواء/مركز سلامة الأغذية والتغذية التطبيقية. مؤرشف من الأصل في 19 مايو 2009. تم الاطلاع عليه في 25 يناير 2007 .
  15. 1 2 تومسون أ (4 يونيو 2007). "تزدهر بكتيريا الإشريكية القولونية في رمال الشاطئ" . لايف ساينس . تم الاسترجاع في 3 ديسمبر 2007 .
  16. ↑ مونتياليغري إم سي، روي إس، بوني إف، حسين إم آي، نواب دانشمند تي، كادوف إل، وآخرون . (ديسمبر 2018). "عوامل الخطر للكشف عن بكتيريا الإشريكية القولونية المقاومة للمضادات الحيوية والممرضة، وبقائها، ونموها في تربة المنازل في المناطق الريفية في بنغلاديش" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 84 (24) e01978-18: e01978–18. Bibcode : 2018ApEnM..84E1978M . doi : 10.1128/AEM.01978-18 . PMC 6275341. PMID 30315075 .   
  17. 1 2 3 تورتورا، جي (2010). علم الأحياء الدقيقة: مقدمة . سان فرانسيسكو، كاليفورنيا: بنجامين كامينغز. الصفحات 85-87 ، 161، 165. ISBN  978-0-321-55007-1.
  18. ↑ "البكتيريا" . موقع علم الأحياء الدقيقة على الإنترنت. مؤرشف من الأصل بتاريخ 27 فبراير 2014. تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 فبراير 2014 .
  19. ↑ "الإشريكية القولونية" . ريدوربيت. 15 أبريل 2011. تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 نوفمبر 2013 .
  20. ↑ "حقائق عن الإشريكية القولونية : الأبعاد، كما نوقشت في البكتيريا: تنوع بنية البكتيريا" . موسوعة بريتانيكا . تم الاطلاع عليه بتاريخ 25 يونيو 2015 .
  21. ↑ يو إيه سي، لو جيه إف، يو إس، كونغ إس كيه، تشان تي إف (يناير 2014). "مراقبة نمو البكتيريا باستخدام استشعار النبض المقاوم القابل للضبط بتقنية تعتمد على المسام". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والتكنولوجيا الحيوية . 98 (2): 855-862 . doi : 10.1007/s00253-013-5377-9 . PMID 24287933. S2CID 2956197 .  
  22. ↑ كوبيتشيك ، هـ. إي. (يناير 1990). "زيادة حجم الخلية في الإشريكية القولونية بعد التحول إلى بيئات غنية" . مجلة علم البكتيريا . 172 (1): 94-101 . doi : 10.1128/jb.172.1.94-101.1990 . PMC 208405. PMID 2403552 .  
  23. ↑ دارنتون، ن. س.، تيرنر، ل.، روجيفسكي، س.، بيرغ، هـ. س. (مارس 2007). " حول عزم الدوران والتقلب في بكتيريا الإشريكية القولونية السابحة" . مجلة علم البكتيريا . 189 (5): 1756-1764 . Bibcode : 2007JBact.189.1756D . doi : 10.1128/JB.01501-06 . PMC 1855780. PMID 17189361 .  
  24. ↑ " E. coli O157 في أمريكا الشمالية - microbewiki" .
  25. ↑ مادجان إم تي، مارتينكو جيه إم (2006). بيولوجيا الكائنات الدقيقة لبروك ( الطبعة الحادية عشرة). بيرسون. ISBN  978-0-13-196893-6.
  26. ↑ جليزر إس، بن نيسان آر، بار أون واي إم، أنتونوفسكي إن، نور إي، زوهار واي، وآخرون . (نوفمبر 2019). "2" . خلية . 179 (6): 1255-1263.e12. دوى : 10.1016/j.cell.2019.11.009 . بمك 6904909 . بميد 31778652 .   
  27. ↑ هولينشيد دبليو دي، رودريغيز إس، مارتن إتش جي، وانغ جي، بايدو إي إي، سال كي إل، وآخرون . (10 أكتوبر 2016). "طفرات pfk" . التكنولوجيا الحيوية للوقود الحيوي . 9 (1): 212. doi : 10.1186/s13068-016-0630-y . PMC 5057261. PMID 27766116 .   
  28. ↑ عمار إي إم، وانغ إكس، راو سي في (يناير 2018). "تنظيم الأيض في بكتيريا الإشريكية القولونية أثناء نموها على مخاليط من السكريات غير الجلوكوزية: الأرابينوز، واللاكتوز، والزيلوز" . التقارير العلمية . 8 (1) 609. Bibcode : 2018NatSR...8..609A . doi : 10.1038/ s41598-017-18704-0 . PMC 5766520. PMID 29330542 .  
  29. ↑ فوتادار يو، زافيلوف بي، تيراسيو إل (2005). " نمو الإشريكية القولونية في درجات حرارة مرتفعة". مجلة علم الأحياء الدقيقة الأساسي . 45 (5): 403-404 . doi : 10.1002/jobm.200410542 . PMID 16187264. S2CID 44876092 .  
  30. ↑ إنجليدو ، دبليو جيه، وبول، آر كيه (سبتمبر 1984). "سلاسل التنفس في الإشريكية القولونية " . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 48 (3): 222-271 . doi : 10.1128/MMBR.48.3.222-271.1984 . PMC 373010. PMID 6387427 .  
  31. ↑ وانغ جيه دي، ليفين بي إيه (نوفمبر 2009). "الأيض، نمو الخلايا، ودورة الخلية البكتيرية" . مراجعات الطبيعة. علم الأحياء الدقيقة . 7 (11): 822-27 . doi : 10.1038/nrmicro2202 . PMC 2887316. PMID 19806155 .  
  32. ↑ كوبر إس، وهيلمستيتر سي إي (فبراير 1968). "تضاعف الكروموسوم ودورة انقسام الإشريكية القولونية B/r". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 31 (3): 519-40 . Bibcode : 1968JMBio..31..519C . doi : 10.1016/0022-2836(68)90425-7 . PMID 4866337 . 
  33. 1 2 سكارستاد ك، بوي إي، ستين إتش بي (يوليو 1986). "توقيت بدء تضاعف الكروموسوم في خلايا الإشريكية القولونية الفردية" . مجلة EMBO . 5 (7): 1711-1717 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04415.x . PMC 1166998. PMID 3527695 .  
  34. ↑ إيشيدا تي، أكيميتسو إن، كاشيوكا تي، هاتانو إم، كوبوتا تي، أوغاتا واي، وآخرون . (أكتوبر 2004). "DiaA، وهو بروتين جديد مرتبط بـDnaA، يضمن البدء في الوقت المناسب لتكرار كروموسوم الإشريكية القولونية " . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (44): 45546–55 . دوى : 10.1074/jbc.M402762200 . بميد 15326179 .  
  35. ↑ ستيوارت إي جيه، مادن آر، بول جي، تادي إف (فبراير 2005). "الشيخوخة والموت في كائن حي يتكاثر بالانقسام المتماثل شكليًا" . مجلة PLOS Biology . 3 (2) e45. doi : 10.1371/journal.pbio.0030045 . PMC 546039. PMID 15685293 .  
  36. 1 2 بروينسا إيه إم، رانغ سي يو، تشيو إيه، شي سي، تشاو إل (مايو 2019). "شيخوخة الخلايا تحافظ على خلودها في وجود مستويات مميتة من الضرر" . مجلة PLOS Biology . 17 (5) e3000266. doi : 10.1371/journal.pbio.3000266 . PMC 6532838. PMID 31120870 .  
  37. ↑ بروسو هـ، كانشايا س، هاردت و.د. (سبتمبر 2004). "العاثيات وتطور مسببات الأمراض البكتيرية: من إعادة ترتيب الجينوم إلى التحول الليزوجيني" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 68 (3): 560-602 ، جدول المحتويات. doi : 10.1128/MMBR.68.3.560-602.2004 . PMC 515249. PMID 15353570 .  
  38. ↑ كريج، ن. ر.، وهولت، ج. ج.، محرران. (1984). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 1 ( الطبعة الأولى). بالتيمور: شركة ويليامز وويلكنز. الصفحات 408-420 . ISBN    978-0-683-04108-8.
  39. 1 2 لوكيانسينكو، أو.، واسينار، ت.م.، أوسيري، د.و. (نوفمبر 2010). "مقارنة 61 جينومًا متسلسلًا من الإشريكية القولونية" . علم البيئة الميكروبية . 60 (4): 708-20 . Bibcode : 2010MicEc..60..708L . doi : 10.1007/s00248-010-9717-3 . PMC 2974192. PMID 20623278 .  
  40. ↑ لان ر، ريفز ب ر (سبتمبر 2002). "الإشريكية القولونية متنكرة: الأصول الجزيئية للشيغيلا ". الميكروبات والعدوى . 4 (11): 1125-1132 . doi : 10.1016/S1286-4579(02)01637-4 . PMID 12361912 . 
  41. ↑ أورسكوڤ، إي.، أورسكوڤ، إف.، جان، بي.، جان، ك. (سبتمبر 1977). " علم الأمصال، والكيمياء، وعلم الوراثة لمستضدات O وK في الإشريكية القولونية " . مراجعات علم البكتيريا . 41 (3): 667-710 . doi : 10.1128/MMBR.41.3.667-710.1977 . PMC 414020. PMID 334154 .  
  42. ↑ ستينوتز ر، وينتروب أ، ويدمالم ج (مايو 2006). "بنية مستضدات عديد السكاريد O في الإشريكية القولونية" . مجلة FEMS لاستعراضات علم الأحياء الدقيقة . 30 (3): 382-403 . Bibcode : 2006FEMMR..30..382S . doi : 10.1111/j.1574-6976.2006.00016.x . PMID 16594963 . 
  43. ↑ لورانس، ج. ج.، وأوشمان، هـ. (أغسطس 1998). "علم الآثار الجزيئي لجينوم الإشريكية القولونية " . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (16): 9413-17 . Bibcode : 1998PNAS...95.9413L . doi : 10.1073 / pnas.95.16.9413 . PMC 21352. PMID 9689094 .  
  44. 1 2 ناتارو جيه بي، كابر جيه بي ( يناير 1998). " الإشريكية القولونية المسببة للإسهال " . مراجعات علم الأحياء الدقيقة السريرية . 11 (1): 142-201 . doi : 10.1128/CMR.11.1.142 . PMC 121379. PMID 9457432 .  
  45. ^ Viljanen MK، Peltola T، Junnila SY، Olkkonen L، Järvinen H، Kuistila M، Huovinen P (أكتوبر 1990). “تفشي الإسهال بسبب الإشريكية القولونية O111: B4 لدى أطفال المدارس والبالغين: رابطة التفاعل الشبيه بمستضد Vi”. لانسيت . 336 (8719): 831–34 . دوى : 10.1016/0140-6736(90)92337-H . بميد 1976876 . S2CID 23087850 .  
  46. ↑ باتيستوزي، ف. يو.، فيجاو، أ.، هيدجز، س. ب. (نوفمبر 2004). "مقياس زمني جينومي لتطور بدائيات النوى: رؤى حول أصل إنتاج الميثان، والتغذية الضوئية، واستيطان اليابسة" . مجلة بي إم سي لعلم الأحياء التطوري . 4 44. doi : 10.1186/1471-2148-4-44 . PMC 533871. PMID 15535883 .  
  47. ↑ هولمز ب (9 يونيو 2008). "البكتيريا تُحدث تحولاً تطورياً كبيراً في المختبر" . مجلة نيو ساينتست . مؤرشف من الأصل في 28 أغسطس 2008.
  48. ↑ ناير آر آر، فاس إم، ويلغوس إس، صن إل، يو واي إن، فيليسر جي جي (سبتمبر 2019). " التطور المشترك بين المفترس والفريسة في البكتيريا يُسرّع تطور الجينوم ويُفضّل آليات الدفاع المرتبطة بالضراوة لدى الفرائس" . نيتشر كوميونيكيشنز . 10 (1) 4301. Bibcode : 2019NatCo..10.4301N . doi : 10.1038/s41467-019-12140-6 . PMC 6754418. PMID 31541093 .  
  49. 1 2 برينر دي جيه، كريج إن آر، ستالي جيه تي (26 يوليو 2005) [1984 (ويليامز وويلكنز)]. غاريتي جي إم (محرر). غاما بروتيوبكتيريا . دليل بيرجي لعلم البكتيريا المنهجي. المجلد 2ب ( الطبعة الثانية). نيويورك: سبرينغر. ص 1108. ISBN    978-0-387-24144-9رقم المكتبة البريطانية: GBA561951.
  50. ↑ يوزيبي، جيه بي (أبريل 1997). "قائمة بأسماء البكتيريا المعتمدة في التسمية: ملف متاح على الإنترنت" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 47 (2): 590-592 . doi : 10.1099/00207713-47-2-590 . PMID 9103655 . 
  51. ↑ "حفظ اسم عائلة Enterobacteriaceae، واسم الجنس النمطي، وتحديد النوع النمطي" . النشرة الدولية لتسمية وتصنيف البكتيريا . 8 (1): 73-74 . 1 يناير 1958. doi : 10.1099/0096266X-8-1-73 .
  52. 1 2 3 4 5 6 7 ماير-كولثوف جيه بي، هانكه آر إل، بيترسن جيه، شوينر سي، مايكل في، فيبيغ إيه، وآخرون (2013). "التسلسل الجينومي الكامل لسلالة DSM 30083(T)، السلالة النمطية (U5/41(T)) من الإشريكية القولونية ، واقتراح لتحديد الأنواع الفرعية في التصنيف الميكروبي" . معايير في العلوم الجينومية . 9 2. doi : 10.1186/1944-3277-9-2 . PMC 4334874. PMID 25780495 .   
  53. ↑ "التفاصيل: DSM-30083" . dsmz.de. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يناير 2017 .
  54. ^ "الإشريكية القولونية (ميجولا) كاستيلاني وتشالمرز ATCC 11775&tra" . atcc.org . مؤرشفة من الأصلي في 4 ديسمبر 2012 . تم الاسترجاع 10 يناير 2017 .
  55. ↑ "الإشريكية" . LPSN . تم الاسترجاع في 6 فبراير 2011 .
  56. ^ "الإشريكية القولونية (ميجولا 1895) كاستيلاني وتشالمرز 1919" . كتالوج JCM .
  57. ↑ سيمز، جي إي، وكيم، إس إتش (مايو 2011). "التصنيف الجيني الكامل لمجموعة الإشريكية القولونية/الشيغيلا باستخدام أنماط تردد السمات (FFPs)" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 108 (20): 8329-34 . Bibcode : 2011PNAS..108.8329S . doi : 10.1073/pnas.1105168108 . PMC 3100984. PMID 21536867 .  
  58. ↑ برزوسزكيويتش إي، ثورمر أ، شولدس ج، ليمباخ أ، ليسيغانغ هـ، ماير إف دي، وآخرون (ديسمبر 2011). "تحليلات تسلسل الجينوم لعزلتين من تفشي الإشريكية القولونية الأخير في ألمانيا تكشف عن ظهور نمط ممرض جديد: الإشريكية القولونية المعوية التجميعية النزفية (EAHEC)" . أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 193 (12): 883-91 . Bibcode : 2011ArMic.193..883B . doi : 10.1007/ s00203-011-0725-6 . PMC 3219860. PMID 21713444 .   
  59. ↑ كوه إكس بي، شين زد، وو سي إف، يو واي، لون إتش آي، تشيونغ إس دبليو، وآخرون (2022). " التنوع الجيني والبيئي لبكتيريا الإشريكية القولونية وسلالات الإشريكية الخفية في البيئات المائية شبه الاستوائية" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 13 811755. doi : 10.3389/fmicb.2022.811755 . PMC 8891540. PMID 35250929 .   
  60. ↑ أبرام ك، أوداوندو ز، بليكر س، وانشاي ف، واسينار ت م، روبسون م س، أوسيري د و (يناير 2021). "تحليلات جينومات الإشريكية القولونية باستخدام برنامج MASH تكشف عن 14 مجموعة تطورية متميزة" . مجلة كوميونيكيشنز بيولوجي . 4 (1) 117. doi : 10.1038/s42003-020-01626-5 . PMC 7838162. PMID 33500552 .  
  61. ↑ كوبو-سيمون م، هارت ر، أوشمان هـ (يناير 2023). "الإشريكية القولونية: ما هي وأيها؟" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 40 (1) msac273. doi : 10.1093/molbev/msac273 . PMC 9830988. PMID 36585846 .  
  62. 1 2 3 4 بلاتنر إف آر، بلانكيت جي، بلوخ سي إيه، بيرنا إن تي، بورلاند في، رايلي إم، وآخرون . (سبتمبر 1997). "التسلسل الجينومي الكامل لبكتيريا الإشريكية القولونية K-12" . مجلة ساينس . 277 (5331): 1453-1462 . doi : 10.1126/science.277.5331.1453 . PMID 9278503 .  
  63. ↑ ميلو ر، فيليبس ر. "كم عدد نسخ جين الحمض النووي الريبوزي في الجينوم؟" . book.bionumbers.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 20 يونيو 2024 .
  64. ↑ زاكسيباييفا ، أو.، ودوليتل، دبليو. إف. (أبريل 2011). "نقل الجينات الأفقي" . علم الأحياء الحالي . 21 (7): R242–46. Bibcode : 2011CBio...21.R242Z . doi : 10.1016/j.cub.2011.01.045 . PMID 21481756. S2CID 14499247 .  
  65. ↑ ديميريك م، أديلبيرغ إي إيه، كلارك إيه جيه، هارتمان بي إي (يوليو 1966). "اقتراح لتسمية موحدة في علم الوراثة البكتيرية" . علم الوراثة . 54 (1): 61-76 . doi : 10.1093/genetics/54.1.61 . PMC 1211113. PMID 5961488 .  
  66. ↑ هاياشي ك، مورووكا ن، ياماموتو ي، فوجيتا ك، إيسونو ك، تشوي س، وآخرون (2006). "تسلسلات جينومية عالية الدقة لسلالتي الإشريكية القولونية K-12 ، MG1655 وW3110" . بيولوجيا الأنظمة الجزيئية . 2 2006.0007. doi : 10.1038/msb4100049 . PMC 1681481. PMID 16738553 .   
  67. 1 2 Zhou J, Rudd KE (يناير 2013). "EcoGene 3.0" . Nucleic Acids Research . 41 (عدد قواعد البيانات): D613–24. doi : 10.1093/nar/ gks1235 . PMC 3531124. PMID 23197660 .  
  68. ↑ هان إم جيه، لي إس واي (يونيو 2006). " بروتيوم الإشريكية القولونية : الماضي والحاضر والآفاق المستقبلية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 70 (2): 362-439 . Bibcode : 2006MMBR...70..362H . doi : 10.1128/MMBR.00036-05 . PMC 1489533. PMID 16760308 .  
  69. ↑ ماتيوس أ، هيفلر جي، بوبونيس جي، كورزاوا إن، شاه إم، ميتوش ك، وآخرون . (ديسمبر 2020). "المشهد البروتيني الوظيفي للإشريكية القولونية " . طبيعة . 588 (7838): 473– 478. بيب كود : 2020Natur.588..473M . دوى : 10.1038/s41586-020-3002-5 . بمك 7612278 . بميد 33299184 .   
  70. ↑ بوتيل سي إم، لين إم إتش، هيك إيه جيه، ليمير إس (مارس 2018). "كشف عن فسفرة الهيستيدين واسعة النطاق في البروتينات البكتيرية باستخدام علم البروتينات القائم على قياس الطيف الكتلي". نيتشر ميثودز . 15 (3): 187-190 . doi : 10.1038/nmeth.4580 . hdl : 1874/362159 . PMID 29377012. S2CID 3367416 .  
  71. ↑ عارف الزمان م، مايدا م، إيتوه أ، نيشيكاتا ك، تاكيتا س، سايتو ر، وآخرون . (مايو 2006). " تحديد واسع النطاق لتفاعل البروتين-بروتين في الإشريكية القولونية K-12" . أبحاث الجينوم . 16 (5): 686-91 . doi : 10.1101/gr.4527806 . PMC 1457052. PMID 16606699 .   
  72. ^ هو جين تاو، جانجا إس سي، بابو إم، دياز-ميجيا جي جيه، بوتلاند جي، يانغ دبليو، وآخرون . (أبريل 2009). ليفتشينكو أ (محرر). "الأطلس الوظيفي العالمي للإشريكية القولونية يشمل البروتينات غير المميزة سابقًا" . بلوس علم الأحياء . 7 (4) هـ96. دوى : 10.1371/journal.pbio.1000096 . بمك 2672614 . بميد 19402753 .   
  73. ^ راجاجوبالا إس في، سيكورسكي بي، كومار أ، موسكا آر، فلاسبلوم جي، أرنولد آر، وآخرون . (مارس 2014). "مشهد التفاعل الثنائي بين البروتين والبروتين في الإشريكية القولونية " . التكنولوجيا الحيوية الطبيعية . 32 (3): 285-90 . دوى : 10.1038/nbt.2831 . بمك 4123855 . بميد 24561554 .   
  74. 1 2 تودار ك. " الإشريكية القولونية الممرضة " . كتاب علم البكتيريا الإلكتروني . قسم علم البكتيريا، جامعة ويسكونسن-ماديسون. مؤرشف من الأصل في 29 يوليو 2018. تم الاطلاع عليه في 30 نوفمبر 2007 .
  75. ↑ إيفانز الابن، دي جيه، وإيفانز، دي جي. "الإشريكية القولونية" . علم الأحياء الدقيقة الطبية، الطبعة الرابعة . فرع جامعة تكساس الطبي في جالفستون. مؤرشف من الأصل في 2 نوفمبر 2007. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2007 .
  76. ↑ غيريرو مونتيرو، إي.، دولاتا، ك.م.، شلوتر، ر.، مالهيرب، ج.، سيفرز، س.، زولكه، د.، وآخرون . (يناير 2019). "تحليل البروتينات المقارن في سلالة CyDisCo من الإشريكية القولونية يحدد استجابات الإجهاد المتعلقة بإنتاج البروتين، والإجهاد التأكسدي، وتراكم البروتين المطوي بشكل خاطئ" . مصانع الخلايا الميكروبية . 18 (1) 19. doi : 10.1186/s12934-019-1071-7 . PMC 6350376. PMID 30696436 .   
  77. ↑ سيلاس كاستينيراس تي، ويليامز إس جي، هيتشكوك إيه جي، سميث دي سي (أغسطس 2018). " هندسة سلالات الإشريكية القولونية لإنتاج منتجات صيدلانية حيوية متقدمة" . رسائل علم الأحياء الدقيقة FEMS . 365 (15). doi : 10.1093/femsle/fny162 . PMID 29982628. S2CID 51602230 .  
  78. ↑ فاسينار ، تي إم (سبتمبر 2016). " الإشريكية القولونية " . المجلة الأوروبية لعلم الأحياء الدقيقة والمناعة . 6 (3): 147-161 . doi : 10.1556/1886.2016.00029 . PMC 5063008. PMID 27766164 .  
  79. ↑ لودينوفا-زادنيكوفا ر، كوكروفسكا ب، تلاسكالوفا-هوجينوفا هـ (يوليو 2003). "إن تناول البروبيوتيك إشريكية قولونية عن طريق الفم بعد الولادة يقلل من وتيرة الحساسية والعدوى المتكررة لاحقًا في الحياة (بعد 10 و20 عامًا)". الأرشيف الدولي للحساسية والمناعة . 131 (3): 209-211 . doi : 10.1159/000071488 . PMID 12876412. S2CID 19686481 .  
  80. ↑ غروزدانوف ل، راش س، شولز ج، سونينبورن يو، غوتشالك ج، هاكر ج، دوبريندت يو (أغسطس 2004). " تحليل بنية جينوم سلالة الإشريكية القولونية غير الممرضة البروبيوتيكية نيسل 1917" . مجلة علم البكتيريا . 186 (16): 5432-41 . Bibcode : 2004JBact.186.5432G . doi : 10.1128/JB.186.16.5432-5441.2004 . PMC 490877. PMID 15292145 .  
  81. ^ كامادا ن، إينوي ن، هيساماتسو تي، أوكاموتو إس، ماتسوكا ك، ساتو تي، وآخرون . (مايو 2005). " سلالة الإشريكية القولونية غير المسببة للأمراض Nissle1917 تمنع التهاب القولون الحاد والمزمن في الفئران". أمراض الأمعاء الالتهابية . 11 (5): 455-63 . دوى : 10.1097/01.MIB.0000158158.55955.de . بميد 15867585 . S2CID 23386584 .   
  82. ↑ شاربونو إم آر، إيزابيلا في إم، لي إن، كورتز سي بي (أبريل 2020). "تطوير فئة جديدة من العلاجات البكتيرية الحية المُهندسة لعلاج الأمراض البشرية" . نيتشر كوميونيكيشنز . 11 (1) 1738. Bibcode : 2020NatCo..11.1738C . doi : 10.1038/s41467-020-15508-1 . PMC 7142098. PMID 32269218 .  
  83. ↑ "الإشريكية القولونية" . مايو كلينك . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يناير 2017 .
  84. ↑ باومغارت م، دوغان ب، ريشنيو م، ويتزمان ج، بوسورث ب، يانتيس ر، أورسي ر.هـ، ويدمان م، ماكدونو ب، كيم س.ج، بيرغ د، شوكين ي، شيرل إ، سيمبسون ك.و (سبتمبر 2007). "تحليل مستقل عن الزراعة لغشاء اللفائفي المخاطي يكشف عن زيادة انتقائية في بكتيريا الإشريكية القولونية الغازية ذات السلالة الجديدة مقارنةً بنقص المطثيات في داء كرون الذي يصيب اللفائفي" . مجلة ISME . 1 (5): 403-418 . Bibcode : 2007ISMEJ...1..403B . doi : 10.1038/ismej.2007.52 . PMID 18043660 . 
  85. ↑ ليم جيه واي، يون جيه، هوفد سي جيه (يناير 2010). "نظرة عامة موجزة على الإشريكية القولونية O157:H7 وبلازميدها O157" . مجلة علم الأحياء الدقيقة والتكنولوجيا الحيوية . 20 (1): 5-14 . doi : 10.4014/jmb.0908.08007 . PMC 3645889. PMID 20134227 .  
  86. 1 2 "الإشريكية القولونية" . منظمة الصحة العالمية . 7 فبراير 2018.
  87. 1 2 "عدوى الإشريكية القولونية" . مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها في الولايات المتحدة . 15 يونيو 2018. مؤرشف من الأصل في 1 فبراير 2014.
  88. ↑ "متلازمة انحلال الدم اليوريمي (HUS)" . مايو كلينك .
  89. ↑ "الإشريكية القولونية المسببة لالتهابات المسالك البولية: العامل الممرض الأبرز لالتهابات المسالك البولية" . دار نشر نوفا. مؤرشف من الأصل في 2 ديسمبر 2013. تم الاطلاع عليه في 27 نوفمبر 2013 .
  90. ↑ كروكسن إم إيه، لو آر جيه، شولز آر، كيني كيه إم، فلودارسكا إم، فينلي بي بي (أكتوبر 2013). " التطورات الحديثة في فهم الإشريكية القولونية الممرضة المعوية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة السريرية . 26 (4): 822-880 . doi : 10.1128/CMR.00022-13 . PMC 3811233. PMID 24092857 .  
  91. ↑ "تفشي عدوى الإشريكية القولونية O104:H4: التحديث 29" . منظمة الصحة العالمية. 7 يوليو 2011. مؤرشف من الأصل في 8 أغسطس 2011.
  92. ↑ "Samen von Bockshornklee mit hoher Wahrscheinlichkeit für EHEC O104:H4 Ausbruch verantwortlich" [ بذور الحلبة ذات احتمالية عالية لـ EHEC O104: H4 المسؤول عن التفشي ] (PDF) (بالألمانية). Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR) (المعهد الاتحادي لتقييم المخاطر). 30 يونيو 2011 . تم الاسترجاع 17 يوليو 2011 .
  93. ↑ الزيود و، ناصر الدين أ، الجراجرة ح، ساكت م (نوفمبر 2019). "الإشريكية القولونية لدى الأطفال المصابين ببيلة الفينيل كيتون" . ميكروبات جديدة وعدوى جديدة . 32 100616. doi : 10.1016/j.nmni.2019.100616 . PMC 6859276. PMID 31763047 .  
  94. ↑ غيث د.م، محمد ز.ك، فرحات م.ج، أبو القاسم شاهين و، محمد ح.و (مارس 2019). "استعمار الميكروبات المعوية ببكتيريا معوية منتجة للكاربابينيميز في وحدات العناية المركزة للأطفال في القاهرة، مصر" . المجلة العربية لأمراض الجهاز الهضمي . 20 (1): 19-22 . doi : 10.1016/j.ajg.2019.01.002 . PMID 30733176. S2CID 73444389 .  
  95. ↑ "معلومات عامة | الإشريكية القولونية " . مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها في الولايات المتحدة . تم الاطلاع عليه بتاريخ 19 أبريل 2017 .
  96. ↑ مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها في الولايات المتحدة. "الإشريكية القولونية المنتجة للذيفان المعوي (ETEC)" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 يوليو 2016 .
  97. ↑ العبري، س. س.، بيتشينغ، ن. ج.، ناي، ف. ج. (يونيو 2005). "إسهال المسافرين". مجلة لانسيت للأمراض المعدية . 5 (6): 349-360 . doi : 10.1016/S1473-3099(05)70139-0 . PMID 15919621 . 
  98. ↑ بورجوا، أ. ل.، ويرزبا، ت. ف.، ووكر، ر. إ. (يونيو 2016). "حالة البحث والتطوير للقاح ضد الإشريكية القولونية المنتجة للذيفان المعوي" . مجلة اللقاحات . 34 (26): 2880-2886 . doi : 10.1016/j.vaccine.2016.02.076 . PMID 26988259 . 
  99. ↑ سفينرهولم، أ.م. (فبراير 2011). " من الكوليرا إلى تطوير لقاح الإشريكية القولونية المنتجة للذيفان المعوي (ETEC)" . المجلة الهندية للبحوث الطبية . 133 (2): 188-196 . PMC 3089050. PMID 21415493 .  
  100. 1 2 Farrar J, Hotez P, Junghanss T, Kang G, Lalloo D, White NJ, eds. (2013). أمراض مانسون الاستوائية ( الطبعة 23). أكسفورد: إلسيفير/سوندرز. ISBN  978-0-7020-5306-1.
  101. ↑ "معلومات عامة - الإشريكية القولونية " . مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها . تم الاطلاع عليه بتاريخ 25 مايو 2017 .
  102. ↑ لي، إس واي (مارس 1996). "زراعة الإشريكية القولونية بكثافة خلوية عالية ". اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 14 (3): 98-105 . doi : 10.1016/0167-7799(96)80930-9 . PMID 8867291 . 
  103. ↑ روسو إي (يناير 2003). "ميلاد التقنية الحيوية" . مجلة نيتشر . 421 (6921): 456-457 . Bibcode : 2003Natur.421..456R . doi : 10.1038/ nj6921-456a . PMID 12540923. S2CID 4357773 .  
  104. 1 2 كورنيليس ب (أكتوبر 2000). "التعبير عن الجينات في مختلف أقسام الإشريكية القولونية". الرأي الحالي في التكنولوجيا الحيوية . 11 (5): 450-54 . doi : 10.1016/S0958-1669(00)00131-2 . PMID 11024362 . 
  105. ↑ توف آي (1994). "تقنية الحمض النووي المؤتلف في تصنيع الأنسولين البشري" . ليتل تري بي تي واي المحدودة . تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 نوفمبر 2007 .
  106. ↑ بيسيت، بي. إتش.، أسلوند، إف.، بيكويث، ج.، جورجيو، ج. (نوفمبر 1999). "الطي الفعال للبروتينات ذات الروابط ثنائية الكبريتيد المتعددة في سيتوبلازم الإشريكية القولونية " . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 (24): 13703-13708 . Bibcode : 1999PNAS...9613703B . doi : 10.1073/pnas.96.24.13703 . PMC 24128. PMID 10570136 .  
  107. ↑ إيسن ج، كواريك م، ديليتوسو س، تانر س، واكر م، ثوني-ماير ل (أغسطس 2010). " إنتاج لقاحات البروتين السكري في الإشريكية القولونية " . مصانع الخلايا الميكروبية . 9 (61) 61. doi : 10.1186/1475-2859-9-61 . PMC 2927510. PMID 20701771 .  
  108. ↑ واكر م، لينتون د، هيتشن ب ج، نيتا-لازار م، هاسلام س م، نورث س ج، وآخرون . (نوفمبر 2002). "الارتباط بالجليكوزيل N في كامبيلوباكتر جيجوني ونقله الوظيفي إلى الإشريكية القولونية ". مجلة ساينس . 298 (5599): 1790-193 . Bibcode : 2002Sci...298.1790W . doi : 10.1126/science.298.5599.1790 . PMID 12459590 .  
  109. ↑ هوانغ سي جيه، لين إتش، يانغ إكس (مارس 2012). "الإنتاج الصناعي للعلاجات المؤتلفة في الإشريكية القولونية وتطوراتها الحديثة" . مجلة علم الأحياء الدقيقة والتكنولوجيا الحيوية الصناعية . 39 (3): 383-399 . Bibcode : 2012JIMB...39..383H . doi : 10.1007/s10295-011-1082-9 . PMID 22252444. S2CID 15584320 .  
  110. ↑ سامرز ر (24 أبريل 2013). "البكتيريا تنتج أول وقود حيوي شبيه بالبنزين على الإطلاق" . مجلة نيو ساينتست . تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 أبريل 2013 .
  111. ↑ هالفيرسون، نيك (15 أغسطس 2013). "مصباح كهربائي يعمل بالبكتيريا بدون كهرباء" . مؤرشف من الأصل في 25 مايو 2016. تم الاطلاع عليه في 22 أكتوبر 2013 .
  112. 1 2 نينفا إيه جيه، بالو دي بي (2009). مناهج المختبر الأساسية للكيمياء الحيوية والتكنولوجيا الحيوية . وايلي. ص 230. ISBN  978-0-470-08766-4.
  113. ↑ كوي ي، تشو ب، بنغ ج، بنغ م، تشو ي، لين ي، ليو ل (مايو 2008). "استنساخ وتحليل تسلسل وتعبير الحمض النووي المكمل (cDNA) المشفر لمسبب الحساسية الرئيسي لعث غبار المنزل، Der f 1، في الإشريكية القولونية " . المجلة البرازيلية للبحوث الطبية والبيولوجية = Revista Brasileira de Pesquisas Medicas e Biologicas . 41 (5): 380–388 . doi : 10.1590/s0100-879x2008000500006 . PMID 18545812 . 
  114. ↑ ليبانين م، سوندبيرغ ل ر، لانتو إ، دي فريتاس ألميدا ج م، بابونين ب، ماسيلتا إ ج (أغسطس 2017). " تصوير مستعمرات البكتيريا وتفاعل العاثيات مع البكتيريا بدقة دون النانومتر باستخدام مجهر أيون الهيليوم" . أنظمة حيوية متقدمة . 1 (8) 1700070. doi : 10.1002/adbi.201700070 . PMID 32646179. S2CID 90960276 .  
  115. ↑ فوكس، سي. أ.، وشيرتليف، م.، وستودلي، ب.، وكوسترتون، ج. و. (فبراير 2005). "هل يمكن لسلالات المختبر المرجعية أن تعكس مسببات الأمراض في "العالم الحقيقي"؟" . اتجاهات في علم الأحياء الدقيقة . 13 (2): 58-63 . Bibcode : 2005TrMic..13...58F . doi : 10.1016/j.tim.2004.11.001 . PMID 15680764. S2CID 8765887 .  
  116. ↑ فيدال، أو.، لونجين، ر.، بريجينت-كومباريه، س.، دوريل، س.، هورمان، م.، ليجون، ب. (مايو 1998). "عزل سلالة متحولة من الإشريكية القولونية K-12 قادرة على تكوين أغشية حيوية على أسطح خاملة: دور أليل جديد من ompR يزيد من تعبير curli" . مجلة علم البكتيريا . 180 (9): 2442-2449 . doi : 10.1128/JB.180.9.2442-2449.1998 . PMC 107187. PMID 9573197 .  
  117. ↑ هاناور د، ميكيلازي م، شينو ج، ليونيلي س، سوريل س س (ديسمبر 2011). "تأثير ظروف الحرق على خصائص أغشية ثاني أكسيد التيتانيوم المترسبة كهربائيًا على ركائز الجرافيت". مجلة الجمعية الأوروبية للخزف . 31 (15): 2877-85 . arXiv : 1303.2757 . doi : 10.1016/j.jeurceramsoc.2011.07.007 . S2CID 93406448 . 
  118. ↑ ليدربيرغ ج ، تاتوم إي إل (أكتوبر 1946). "إعادة تركيب الجينات في الإشريكية القولونية " (ملف PDF) . مجلة نيتشر . 158 (4016): 558. Bibcode : 1946Natur.158..558L . doi : 10.1038/158558a0 . PMID 21001945. S2CID 1826960. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) في 5 يوليو 2003.  المصدر: المكتبة الوطنية للطب - أوراق جوشوا ليدربيرغ
  119. ↑ النشاط البيولوجي للبلورات . ص 169. 
  120. ↑ سوسمان م (مارس 1995). " دورة العاثيات في كولد سبرينغ هاربور (1945-1970): ذكرى مرور 50 عامًا" . علم الوراثة . 139 (3): 1101-1106 . doi : 10.1093/genetics/139.3.1101 . PMC 1206443. PMID 7768426. مؤرشف من الأصل في 16 سبتمبر 2006.  
  121. ↑ بنزر، س. (مارس 1961). "حول طوبوغرافيا البنية الجينية الدقيقة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 47 (3): 403-415 . Bibcode : 1961PNAS...47..403B . doi : 10.1073 / pnas.47.3.403 . PMC 221592. PMID 16590840 .  
  122. ↑ "حقائق عن بكتيريا الإشريكية القولونية " . موسوعة الحياة . تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 نوفمبر 2013 .
  123. ↑ "موقع شركة Scarab Genomics LLC الإلكتروني" .
  124. ↑ أومينهوفر ك، فيهير ت، باليكو ج، أيايدين ف، بوسفاي ج، بلاتنر ف ر، بوسفاي ج (مايو 2010). "انخفاض قابلية تطور الإشريكية القولونية MDS42، وهي هيكل خلوي خالٍ من IS لتطبيقات البيولوجيا الجزيئية والتركيبية" . مصانع الخلايا الميكروبية . 9 38. doi : 10.1186/1475-2859-9-38 . PMC 2891674. PMID 20492662 .  
  125. ↑ بوسفاي جي، بلانكيت جي، فيهير تي، فريش دي، كيل جي إم، أومينهوفر كيه، وآخرون . (مايو 2006). "الخصائص الناشئة لبكتيريا الإشريكية القولونية ذات الجينوم المختزل". مجلة ساينس . 312 (5776): 1044-1046 . رمز Bibcode : 2006Sci...312.1044P . doi : 10.1126/science.1126439 . PMID 16645050. S2CID 43287314 .   
  126. ↑ كوليسنيتشينكو ف، بلانكيت ج، هيرينغ سي دي، فيهير ت، بوسفاي ج، بلاتنر إف آر، بوسفاي ج (أبريل 2002). " هندسة جينوم مُختزل لبكتيريا الإشريكية القولونية" . أبحاث الجينوم . 12 (4): 640-47 . doi : 10.1101/gr.217202 . PMC 187512. PMID 11932248 .  
  127. ↑ كييمر، جيه إي، وغالاجدا، بي، ومولدون، سي، وبارك، إس، وأوستن، آر إتش (نوفمبر 2006). " التجمعات البكتيرية في البيئات النانوية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (46): 17290-95 . Bibcode : 2006PNAS..10317290K . doi : 10.1073/pnas.0607971103 . PMC 1635019. PMID 17090676 .  
  128. ↑ تيرومالاي إم آر، كارويا إف، تران كيو، ستيبانوف في جي، بروس آر جيه، أوت إم، بيرسون دي إل، فوكس جي إي (مايو 2017). "تكيف خلايا الإشريكية القولونية المزروعة في بيئة محاكاة انعدام الجاذبية لفترة طويلة هو تكيف ظاهري وجينومي" . مجلة npj Microgravity . 3 (15) 15. doi : 10.1038/s41526-017-0020-1 . PMC 5460176. PMID 28649637 .  
  129. ↑ تيرومالاي إم آر، كارويا إف، تران كيو، ستيبانوف في جي، بروس آر جيه، أوت إم، بيرسون دي إل، فوكس جي إي (يناير 2019). "تقييم مقاومة المضادات الحيوية المكتسبة في بكتيريا الإشريكية القولونية المعرضة لظروف انعدام الجاذبية المنخفضة طويلة الأمد مع التعرض للمضادات الحيوية في بيئة خلفية" . mBio . 10 ( e02637-18) e02637-18. Bibcode : 2019mBio...1063718T . doi : 10.1128/mBio.02637-18 . PMC 6336426. PMID 30647159 .  
  130. ↑ هايز ب (6 فبراير 2017). "الحوسبة تنبض بالحياة" . مجلة ساينتست الأمريكية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 نوفمبر 2021 .
  131. ↑ بومغاردنر ج، آكر ك، أديفوي أو، كراولي إس تي، ديلواتش دبليو، ديكسون جيه أو، وآخرون . (يوليو 2009). " حل مسألة مسار هاميلتوني باستخدام حاسوب بكتيري" . مجلة الهندسة البيولوجية . 3 11. doi : 10.1186/1754-1611-3-11 . PMC 2723075. PMID 19630940 .   
  132. ↑ ميلياس-أرجيتيس أ، سامرز س، ستيوارت-أورنشتاين ج، زوليتا إ، بينكوس د، السماد ح، وآخرون . (نوفمبر 2011). "التغذية الراجعة الحاسوبية لتنظيم دائرة التعبير الجيني في الجسم الحي" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 29 (12): 1114-1116 . doi : 10.1038/nbt.2018 . PMC 4565053. PMID 22057053 .   
  133. ↑ سوير إي. "الخميرة المُتحكَّم بها بواسطة الحاسوب وشاشة LCD لبكتيريا الإشريكية القولونية | بيولوجيا 2.0 | تعلّم العلوم على موقع Scitable" . www.nature.com . تاريخ الاطلاع: 28 نوفمبر 2021 .
  134. ↑ بريندل أ، سامايوا ب، رازينكوف إ، دانينو ت، تسيمرينغ إل إس، هاستي ج (ديسمبر 2011). "مصفوفة استشعار من 'وحدات البكسل الحيوية' الجينية المقترنة جذريًا"" . Nature . 481 (7379): 39– 44. doi : 10.1038/nature10722 . PMC 3259005 . PMID 22178928 .  
  135. ↑ والتز إي (23 أغسطس 2017). "حاسوب حيوي وذاكرة مبنيان داخل بكتيريا حية" . مجلة IEEE Spectrum . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 نوفمبر 2021 .
  136. ↑ والتز إي (26 يوليو 2017). "أوامر حاسوبية بيولوجية معقدة للخلايا الحية" . مجلة IEEE Spectrum . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 نوفمبر 2021 .
  137. ↑ غرين، أ. أ.، كيم، ج.، ما، د.، سيلفر، ب. أ.، كولينز، ج. ج.، ين، ب. (أغسطس 2017). " حسابات منطقية خلوية معقدة باستخدام أجهزة الحوسبة الريبوزية" . مجلة نيتشر . 548 (7665): 117-121 . Bibcode : 2017Natur.548..117G . doi : 10.1038/nature23271 . PMC 6078203. PMID 28746304 .  
  138. ↑ والتز إي (12 يوليو 2017). "علماء يخزنون بيانات الفيديو في الحمض النووي للكائنات الحية" . مجلة IEEE Spectrum . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 نوفمبر 2021 .
  139. ↑ شيبمان إس إل، نيفالا جيه، ماكليس جيه دي، تشيرش جي إم (يوليو 2017). "ترميز فيلم رقمي في جينومات مجموعة من البكتيريا الحية باستخدام تقنية كريسبر-كاس" . مجلة نيتشر . 547 (7663): 345-349 . Bibcode : 2017Natur.547..345S . doi : 10.1038/nature23017 . PMC 5842791. PMID 28700573 .  
  140. ↑ ساركار ك، تشاكرابورتي س، بونيرجي د، باغ س (أكتوبر 2021). "الحوسبة الموزعة باستخدام البكتيريا المُهندسة وتطبيقها في حل مسائل المتاهة 2 × 2 المُولدة كيميائيًا". مجلة ACS للبيولوجيا التركيبية . 10 (10): 2456-2464 . doi : 10.1021/acssynbio.1c00279 . PMID 34543017. S2CID 237583555 .  
  141. ↑ روبرتس، س. (9 نوفمبر 2021). " حاسوب حيوي من بكتيريا الإشريكية القولونية يحل متاهة من خلال مشاركة العمل" . مجلة إم آي تي ​​للتكنولوجيا . تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 نوفمبر 2021 .
  142. ^ هيكل إي (2010) [1867]. مورفولوجية عامة للكائنات الحية . رايمر، برلين. رقم ISBN 978-1-144-00186-3.
  143. ^ إيشيريتش تي (1885). "Die Darmbakterien des Neugeborenen und Säuglinge" . فورتشر. ميد . 3 : 515 - 22.
  144. ↑ بريد آر إس، كون إتش جيه (مايو 1936). " وضع المصطلح العام بكتيريا إهرنبرغ 1828" . مجلة علم البكتيريا . 31 (5): 517-18 . doi : 10.1128/JB.31.5.517-518.1936 . PMC 543738. PMID 16559906 .  
  145. ^ ميجولا دبليو (1895). "البكتيريا (Stabchenbacterien)". في Engerl A، Prantl K (محرران). Die Naturlichen Pfanzenfamilien، W. Engelmann، Leipzig، Teil I، Abteilung Ia . ص 20 – 30. 
  146. ↑ كاستيلاني أ، تشالمرز أ ج (1919). دليل الطب الاستوائي ( الطبعة الثالثة). نيويورك: ويليامز وود وشركاه. 
  147. ↑ «شريف ينتقد جزارًا مصابًا ببكتيريا الإشريكية القولونية » . بي بي سي نيوز . 19 أغسطس 1998.
  148. ↑ "الجزار الذي كذب" . هيرالد سكوتلاند . 20 أغسطس 1998. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 أكتوبر 2021 .
  149. ↑ ماسكارينهاس، ل. (17 نوفمبر 2024). "تفشي بكتيريا الإشريكية القولونية المرتبط بالجزر العضوي يُسفر عن وفاة شخص وإصابة العشرات في جميع أنحاء الولايات المتحدة". سي تي في نيوز / سي إن إن . مؤرشف من الأصل في 17 نوفمبر 2024. تم الاطلاع عليه في 17 نوفمبر 2024 .
  150. ↑ سونغ هـ، جيانغ ج، وانغ إكس، تشانغ ج (مارس 2017). "التعبير عن هرمون النمو البشري المؤتلف عالي النقاء (rhGH) في الإشريكية القولونية تحت محفز phoA" . الهندسة الحيوية . 8 (2): 147-153 . doi : 10.1080/21655979.2016.1212137 . PMC 5398570. PMID 27459425 .  
  151. ↑ كالييو ب، باستور أ، ثيل ك، أختار م ك، جونز ب ر (سبتمبر 2014). "مسار مُهندس للتخليق الحيوي للبروبان المتجدد" . نيتشر كوميونيكيشنز . 5 (1) 4731. Bibcode : 2014NatCo...5.4731K . doi : 10.1038/ncomms5731 . PMC 4164768. PMID 25181600 .