التخصص الكيميائي
التخصص الكيميائي هو قدرة موقع الارتباط في جزيء كبير (مثل البروتين ) على الارتباط بروابط محددة . وكلما قل عدد الروابط التي يمكن للبروتين الارتباط بها، زاد تخصصه.
تصف الخصوصية قوة الارتباط بين بروتين معين وربيطة. ويمكن وصف هذه العلاقة بثابت تفكك ، الذي يحدد التوازن بين حالتي الارتباط وعدم الارتباط في نظام البروتين-الربيطة. [ 1 ] في سياق إنزيم واحد وزوج من جزيئات الارتباط، يمكن مقارنة الربيطتين (بالنسبة للإنزيم) من حيث قوة الارتباط بهما، بناءً على ثوابت تفككهما. (القيمة الأقل تدل على ارتباط أقوى).
لا ترتبط خصوصية مجموعة من الروابط بقدرة الإنزيم على تحفيز تفاعل معين، حيث يكون الرابط بمثابة ركيزة. [ 1 ]
إذا كان لإنزيم معين خصوصية كيميائية عالية، فهذا يعني أن مجموعة الروابط التي يرتبط بها محدودة، بحيث لا يمكن أن تحدث أحداث الارتباط أو التحفيز بمعدل ملحوظ مع جزيئات إضافية.
من الأمثلة على أزواج البروتين-الرابط التي تتميز بنشاط ارتباط عالي التخصص نظام الجسم المضاد - المستضد . [ 2 ] يؤدي نضج الألفة عادةً إلى تفاعلات عالية التخصص، بينما تكون الأجسام المضادة الساذجة غير انتقائية وترتبط بعدد أكبر من الروابط. [ 3 ] في المقابل، يُعد نظام السيتوكروم P450 مثالًا على نظام بروتين-رابط قادر على الارتباط بالركائز وتحفيز تفاعلات متعددة بكفاءة، ويمكن اعتباره إنزيمًا غير انتقائي نظرًا لتخصصه الواسع تجاه روابط متعددة. البروتيازات هي مجموعة من الإنزيمات التي تُظهر نطاقًا واسعًا من تخصصات التحلل. تعمل البروتيازات غير الانتقائية كإنزيمات هضمية تُحلل الببتيدات بشكل غير انتقائي، بينما تشارك البروتيازات عالية التخصص في مسارات الإشارات الخلوية. [ 4 ]
أساس
ملزم
تؤثر التفاعلات بين البروتين والرابط بشكل كبير على خصوصية الارتباط بينهما. ومن المعروف أن التفاعلات الكهروستاتيكية والتفاعلات الكارهة للماء هي الأكثر تأثيرًا في تحديد مصدر خصوصية الارتباط بين جزيئين. [ 5 ] غالبًا ما ترتبط قوة هذه التفاعلات بين البروتين والرابط ارتباطًا إيجابيًا بخصوصية ارتباطهما المتبادل.
تعتمد خصوصية عملية الارتباط بشكل كبير على مرونة الجزيئات المرتبطة. فالبروتين الصلب محدود للغاية في إمكانيات ارتباطه، بينما يستطيع البروتين المرن تكييف بنيته مع عدد أكبر من الروابط، وبالتالي يكون أكثر تنوعًا في الارتباط. ولأن عملية الارتباط تؤدي عادةً إلى تصلب كلا الجزيئين المرتبطين في المركب، فإن ارتباط البروتين المرن غالبًا ما يصاحبه انخفاض في الإنتروبيا. وهذا هو السبب الرئيسي للارتباط الإيجابي المتكرر بين ألفة الارتباط وخصوصيته. تُظهر الأجسام المضادة ارتباطًا قويًا بين الصلابة والخصوصية. [ 6 ] [ 3 ] ويمتد هذا الارتباط إلى ما هو أبعد من موقع ارتباط الأجسام المضادة [ 7 ].
التحفيز
تشير خصوصية الإنزيم إلى التفاعلات بين أي إنزيم معين وركيزته المقابلة. بالإضافة إلى خصوصية ارتباطه بالركائز، فإن التقارب والتوجيه الصحيحين، فضلاً عن ارتباطه بالحالة الانتقالية، يوفران مستوى إضافيًا من خصوصية الإنزيم.
الأنواع
تختلف الإنزيمات في مدى تخصصها في الارتباط بالركائز، وذلك لأداء وظائف فيزيولوجية محددة. قد تحتاج بعض الإنزيمات إلى أن تكون أقل تخصصًا، وبالتالي قد ترتبط بالعديد من الركائز لتحفيز التفاعل. من ناحية أخرى، تتطلب بعض الوظائف الفيزيولوجية تخصصًا دقيقًا للغاية للإنزيم تجاه ركيزة واحدة محددة لحدوث التفاعل بشكل صحيح وظهور النمط الظاهري الفيزيولوجي. تختلف أنواع التصنيفات المختلفة بناءً على تخصصها تجاه الركائز. وبشكل عام، تُقسم إلى أربع مجموعات: التخصص المطلق، والتخصص الجماعي، والتخصص المرتبط، والتخصص الفراغي.
تحديد مطلق
يمكن تعريف التخصص المطلق بأنه حصري، حيث يعمل الإنزيم على ركيزة محددة واحدة فقط. [ 8 ] تحفز الإنزيمات ذات التخصص المطلق تفاعلاً واحداً فقط مع ركيزتها المحددة. على سبيل المثال، اللاكتاز إنزيم متخصص في تحلل اللاكتوز إلى سكرين أحاديين، هما الجلوكوز والجلاكتوز. مثال آخر هو الجلوكوكيناز ، وهو إنزيم يشارك في فسفرة الجلوكوز إلى جلوكوز-6-فوسفات. ينشط هذا الإنزيم بشكل أساسي في الكبد، وهو النظير الإنزيمي الرئيسي للهيكسوكيناز . [ 9 ] يشير تخصصه المطلق إلى أن الجلوكوز هو الهكسوز الوحيد القادر على أن يكون ركيزته، على عكس الهيكسوكيناز الذي يستوعب العديد من الهكسوزات كركائز له.
خصوصية المجموعة
تحدث الخصوصية الجماعية عندما يتفاعل الإنزيم فقط مع الجزيئات التي تحتوي على مجموعات وظيفية محددة، مثل البنى العطرية ومجموعات الفوسفات والميثيل. [ 10 ] ومن الأمثلة على ذلك إنزيم البيبسين ، وهو إنزيم أساسي في هضم الأطعمة التي نتناولها، حيث يقوم بتحليل الروابط الببتيدية بين الأحماض الأمينية الكارهة للماء، مع تمييزه للسلاسل الجانبية العطرية مثل الفينيل ألانين والتريبتوفان والتيروسين . مثال آخر هو إنزيم الهيكسوكيناز ، وهو إنزيم يشارك في عملية تحلل الجلوكوز ، حيث يقوم بفسفرة الجلوكوز لإنتاج جلوكوز-6-فوسفات . يُظهر هذا الإنزيم خصوصية جماعية من خلال السماح له بتفاعل العديد من السكريات السداسية (سكريات مكونة من 6 ذرات كربون) كركائز له. [ 11 ] يُعد الجلوكوز أحد أهم الركائز في المسارات الأيضية التي تشمل الهيكسوكيناز نظرًا لدوره في تحلل الجلوكوز، ولكنه ليس الركيزة الوحيدة التي يمكن للهيكسوكيناز أن يحفز التفاعل معها.
خصوصية الرابطة

تختلف خصوصية الرابطة عن خصوصية المجموعة، إذ أنها تتعرف على أنواع معينة من الروابط الكيميائية . وهذا يختلف عن خصوصية المجموعة، لأنها لا تعتمد على وجود مجموعات وظيفية معينة لتحفيز تفاعل معين، بل على نوع رابطة معين (على سبيل المثال، رابطة ببتيدية).
التخصص الفراغي

هذا النوع من التخصص حساس للنشاط البصري للركيزة من حيث التوجيه. تختلف الجزيئات الفراغية في طريقة دورانها للضوء المستقطب، أو في توجيهات الروابط (انظر روابط ألفا وبيتا جليكوسيدية). ترتبط الإنزيمات المتخصصة فراغيًا بالركائز التي تحمل هذه الخصائص. على سبيل المثال، يتفاعل إنزيم بيتا جليكوسيداز فقط مع روابط بيتا جليكوسيدية الموجودة في السليلوز، وليس الموجودة في النشا والجليكوجين ، اللذين يحتويان على روابط ألفا جليكوسيدية. هذا الأمر مهم في كيفية هضم الثدييات للطعام. على سبيل المثال، يوجد إنزيم الأميليز في لعاب الثدييات، وهو متخصص فراغيًا في روابط ألفا، ولهذا السبب تستطيع الثدييات استخدام النشا والجليكوجين بكفاءة كمصدر للطاقة، ولكن ليس السليلوز (لأنه يحتوي على رابطة بيتا).
عزيمة
يُعرف ثابت تفكك التوازن المحدد لتكوين معقد الإنزيم والركيزة باسم. يتم استخدامه كمقياس للتقارب، حيث تشير القيم الأعلى إلى تقارب أقل.
بالنسبة للمعادلة المعطاة (E = الإنزيم، S = الركيزة، P = الناتج)،
سيكون مكافئًا لـ، أينوتمثل معدلات التفاعل الأمامي والخلفي، على التوالي، في تحويل كل من E و S إلى مركب الركيزة الإنزيمية.
تسمح نظرية المعلومات بتعريف أكثر كمية للخصوصية من خلال حساب الإنتروبيا في طيف الارتباط. [ 4 ]
تطبيق على حركية الإنزيمات
يمكن إيجاد التخصص الكيميائي للإنزيم تجاه ركيزة معينة باستخدام متغيرين مشتقين من معادلة مايكليس-مينتين .يُقارب ثابت تفكك معقدات الإنزيم والركيزة.يمثل معدل الدوران، أو عدد التفاعلات التي يحفزها الإنزيم بالنسبة لكمية الإنزيم.زيادةيُعرف هذا بثابت التخصص ، وهو مقياس لمدى انجذاب الركيزة لإنزيم معين. يُعرف أيضًا بكفاءة الإنزيم، وتكشف هذه العلاقة عن تفضيل الإنزيم لركيزة معينة. كلما ارتفع ثابت التخصص للإنزيم، زاد تفضيله لتلك الركيزة.
دلالة
أهمية البحث الطبي
توفر الخصوصية الإنزيمية رؤى مفيدة حول بنية الإنزيم ، والتي تحدد في نهاية المطاف الوظائف الفيزيولوجية وتلعب دورًا فيها. [ 12 ] كما قد توفر دراسات الخصوصية معلومات عن الآلية التحفيزية.
تُعدّ الخصوصية عاملاً بالغ الأهمية في اكتشاف الأدوية الجديدة وفي مجال البحوث السريرية، حيث تُختبر الأدوية الجديدة للتأكد من خصوصيتها تجاه الجزيء المستهدف في جولات متعددة من التجارب السريرية. يجب أن تحتوي الأدوية على تراكيب شديدة الخصوصية لتقليل احتمالية حدوث آثار جانبية غير مرغوب فيها قد تُسبب أعراضًا غير مرغوب فيها لدى المريض. تعتمد فعالية الأدوية على خصوصية الجزيئات والتركيبات المصممة لتثبيط أهداف جزيئية محددة. [ 1 ] يتقدم اكتشاف الأدوية الجديدة من خلال تجارب تتضمن مركبات شديدة الخصوصية. على سبيل المثال، يتمثل الأساس الذي يجب أن تُثبت به الأدوية بنجاح في قدرتها على الارتباط بالمستقبل المستهدف في البيئة الفيزيولوجية بخصوصية عالية، بالإضافة إلى قدرتها على نقل إشارة تُحدث تأثيرًا بيولوجيًا إيجابيًا ضد المرض أو العلة التي يُراد للدواء علاجها. [ 13 ]
التطبيقات
تعتمد التقنيات العلمية، مثل التلوين المناعي، على الخصوصية الكيميائية. يستغل التلوين المناعي الخصوصية الكيميائية للأجسام المضادة للكشف عن بروتين معين على المستوى الخلوي. [ 14 ] ومن التقنيات الأخرى التي تعتمد على الخصوصية الكيميائية تقنية التلطيخ الغربي، والتي تُستخدم للكشف عن بروتين معين في الأنسجة. تتضمن هذه التقنية الفصل الكهربائي الهلامي، يليه نقل العينة إلى غشاء مُلوّن بالأجسام المضادة. تتميز الأجسام المضادة بتخصصها للبروتين المستهدف، وتحتوي على علامة فلورية تُشير إلى وجود هذا البروتين. [ 15 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 إيتون، بروس إي؛ غولد، لاري؛ زيتشي، دومينيك أ. (1995-10-01). "لنكن أكثر تحديدًا: العلاقة بين التخصص والألفة" . الكيمياء والبيولوجيا . 2 (10): 633-638 . doi : 10.1016/1074-5521(95)90023-3 . PMID 9383468 .
- ↑ تانفورد، تشارلز (1968). "الأساس الكيميائي لتنوع الأجسام المضادة وخصوصيتها". حسابات البحوث الكيميائية . 1 (6): 161-167 . doi : 10.1021/ar50006a001 .
- 1 2 فرنانديز-كوينتيرو، مونيكا ل.؛ جورج، غاي؛ فارغا، يانوس م.؛ ليدل، كلاوس ر. (2021). " المجموعات في المحلول كنموذج جديد للتنبؤ ببنية الأجسام المضادة وتصميمها" . mAbs . 13 (1) e1923122. doi : 10.1080/19420862.2021.1923122 . PMC 8158028. PMID 34030577 .
- 1 2 فوكس، جوليان إي.؛ فون غرافنشتاين، سوزان؛ هوبر، رولاند جي.؛ مارغريتر، مايكل أ.؛ سبيتزر، غودرون م.؛ والنوفر، هانز جي.؛ ليدل، كلاوس ر. (18 أبريل 2013). "إنتروبيا الانقسام كمقياس كمي لخصوصية البروتياز" . PLOS Comput Biol . 9 (4) e1003007. Bibcode : 2013PLSCB...9E3007F . doi : 10.1371/journal.pcbi.1003007 . ISSN 1553-7358 . PMC 3630115. PMID 23637583 .
- ^ والدنر ، بيرجيت جي. كرامل، يوهانس؛ كاهلر، أورسولا؛ سبين ، الكسندر. شوبيرل، مايكل. بودويتز، مارين؛ كروسياني، غابرييل؛ ليدل، كلاوس ر. (2018). "التعرف الكهروستاتيكي في الركيزة المرتبطة بالبروتياز السيري" . مجلة التعرف الجزيئي . 31 (10) هـ2727. دوى : 10.1002/jmr.2727 . بمك 6175425 . بميد 29785722 .
- ↑ فرنانديز-كوينتيرو، مونيكا ل.؛ لوفلر، يوهانس ر.؛ كراميل، يوهانس؛ كاهلر، أورسولا؛ كامينيك، آنا س.؛ ليدل، كلاوس ر. (2019). " توصيف تنوع التجمعات التوافقية لحلقة CDR-H3 وعلاقتها بخصائص ارتباط الأجسام المضادة" . مجلة فرونتيرز إن إيمونولوجي . 9 : 3065. doi : 10.3389/fimmu.2018.03065 . PMC 6330313. PMID 30666252 .
- ↑ فرنانديز-كوينتيرو، مونيكا ل.؛ لوفلر، يوهانس ر.؛ باخر، ليزا م.؛ وايبيل، فرانز؛ سيدلر، كلاريسا أ.؛ ليدل، كلاوس ر. (2020). "التصلب الموضعي والعام عند نضج ألفة الأجسام المضادة" . مجلة فرونتيرز في العلوم البيولوجية الجزيئية . 7 : 182. doi : 10.3389/fmolb.2020.00182 . PMC 7426445. PMID 32850970 .
- ↑ "تخصص الإنزيم" (ملف PDF) . مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 2016-05-08.
- ↑ "GCK glucokinase [ Homo sapiens (human) ] - Gene - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 12 يونيو 2016 .
- ↑ "مركز MSOE لنمذجة الجزيئات الحيوية - دروس Jmol لبنية البروتين">" . cbm.msoe.edu . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2016-06-02 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2016-05-19 .
- ↑ سينر، أ؛ جيروا، م.هـ؛ دوفران، س.ب؛ مالايس، و.ج (1985-09-01). "التخصص الأنوميري لنشاطي الهيكسوكيناز والجلوكوكيناز في الكبد والخلايا المنتجة للأنسولين" . مجلة الكيمياء الحيوية . 230 (2): 345-351 . doi : 10.1042/bj2300345 . ISSN 0264-6021 . PMC 1152624. PMID 3902008 .
- ↑ باي، نا؛ ليري، جولي أ. (2004-02-01). "تحديد ثوابت خصوصية الإنزيم/الركيزة باستخدام مقايسة ESI-MS متعددة الركائز". مجلة الجمعية الأمريكية لعلم قياس الطيف الكتلي . 15 (2): 233-243 . Bibcode : 2004JASMS..15..233P . doi : 10.1016/j.jasms.2003.10.009 . PMID 14766290 .
- ↑ "نظرية مستقبلات الدواء [ TUSOM | Pharmwiki ] " . tmedweb.tulane.edu . تم الاطلاع عليه بتاريخ 11-06-2016 .
- ↑ مايتي، بيسواناث؛ شيف، ديفيد؛ فيشر، روري أ. (2013-01-01). "التلوين المناعي". أساليب المختبر في بيولوجيا الخلية - التصوير . المجلد 113. الصفحات 81-105 . doi : 10.1016/B978-0-12-407239-8.00005-7 . ISBN 978-0-12-407239-8ISSN 0091-679X . PMID 23317899 .
- ↑ باس، جيه جيه؛ ويلكنسون، دي جيه؛ رانكين، دي؛ فيليبس، بي إي؛ شيفشيك، إن جيه؛ سميث، كيه؛ أثيرتون، بي جيه (5 يونيو 2016). "نظرة عامة على الاعتبارات التقنية لتطبيقات التلطيخ الغربي في البحوث الفيزيولوجية" . المجلة الإسكندنافية للطب والعلوم في الرياضة . 27 (1): 4-25 . doi : 10.1111/sms.12702 . ISSN 1600-0838 . PMC 5138151. PMID 27263489 .
- الروابط الكيميائية
- بنية البروتين
