إنزيم EPSP سينثاز
إنزيم سينثاز 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات ( EPSP ) هو إنزيم تنتجه النباتات والكائنات الدقيقة . يحفز إنزيم EPSPS التفاعل الكيميائي التالي :
- فوسفينول بيروفات (PEP) + 3-فوسفو شيكيمات (S3P) ⇌ فوسفات + 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات (EPSP)
وبالتالي، فإن الركيزتين لهذا الإنزيم هما فوسفينول بيروفات (PEP) و3-فوسفوشيكيمات، في حين أن منتجيه هما الفوسفات و5 -إينول بيروفيلشيكيمات-3-فوسفات.
يغيب هذا الإنزيم عن الجينومات الحيوانية، مما يجعله هدفًا جذابًا لمبيدات الأعشاب مثل الغليفوسات . وقد تم إدخال نسخة مقاومة للغليفوسات من جين هذا الإنزيم في محاصيل معدلة وراثيًا .
التسمية
ينتمي هذا الإنزيم إلى عائلة الترانسفيرازات ، وتحديدًا تلك التي تنقل مجموعات الأريل أو الألكيل باستثناء مجموعات الميثيل . الاسم النظامي لهذه الفئة من الإنزيمات هو فوسفينول بيروفات: 3-فوسفوشيكيمات 5- O- (1-كربوكسي فينيل)-ترانسفيراز . ومن الأسماء الشائعة الأخرى:
- إنزيم سينثاز 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات،
- إنزيم سينثاز 3-إينول بيروفيل شيكيمات 5-فوسفات،
- إنزيم سينثاز فوسفات حمض 3-إينول بيروفيل شيكيميك،
- إنزيم سينثاز 5′-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات،
- إنزيم سينثاز 5-إينول بيروفيل-3-فوسفوشيكيمات،
- إنزيم سينثاز 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات،
- إنزيم سينثاز حمض 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفوريك،
- إنزيم سينثاز فوسفات إينول بيروفيل شيكيمات، و
- 3-فوسفوشيكيمات 1-كربوكسي فينيل ترانسفيراز.
بناء
إنزيم EPSP synthase هو إنزيم أحادي الوحدة بكتلة جزيئية تقارب 46000. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] يتكون من نطاقين متصلين بخيوط بروتينية تعمل كمفصل، مما يسمح للنطاقين بالاقتراب من بعضهما. عندما يرتبط الركيزة بالإنزيم، يؤدي التغير في بنيته إلى تثبيت النطاقين حول الركيزة في الموقع النشط.
يُصنَّف إنزيم EPSP synthase إلى مجموعتين بناءً على حساسيته للجليفوسات. إنزيمات الفئة الأولى، الموجودة في النباتات وبعض أنواع البكتيريا، تُثبَّط بتركيزات منخفضة من الجليفوسات (بالميكرومول). أما إنزيمات الفئة الثانية، الموجودة في أنواع أخرى من البكتيريا، فهي مقاومة لتثبيط الجليفوسات. [ 5 ]
مسار شيكيمات
يشارك إنزيم EPSP synthase في التخليق الحيوي للأحماض الأمينية العطرية فينيل ألانين ، وتيروسين ، وتربتوفان عبر مسار الشيكيمات في البكتيريا والفطريات والنباتات. يُنتَج إنزيم EPSP synthase فقط بواسطة النباتات والكائنات الدقيقة؛ ولا يوجد الجين المسؤول عن ترميزه في جينوم الثدييات . [ 6 ] [ 7 ] تحتوي البكتيريا المعوية لبعض الحيوانات على إنزيم EPSPS. [ 8 ]
رد فعل
يحفز إنزيم EPSP synthase التفاعل الذي يحول شيكيمات-3-فوسفات بالإضافة إلى فوسفينول بيروفات إلى 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات (EPSP) عبر وسيط رباعي السطوح شبيه بالأسيتال . [ 9 ] [ 10 ] تشارك الأحماض الأمينية القاعدية والحمضية في الموقع النشط في نزع بروتون مجموعة الهيدروكسيل من PEP وفي خطوات تبادل البروتون المتعلقة بالوسيط رباعي السطوح نفسه، على التوالي. [ 11 ]
![]()
أظهرت دراسات حركية الإنزيم لهذا التفاعل التسلسل المحدد وطاقة كل خطوة من خطوات العملية. [ 12 ] يعمل الليسين المتعادل الشحنة (lys-22) كقاعدة عامة ، حيث يزيل بروتون مجموعة الهيدروكسيل في S3P، مما يسمح للأنيون الأكسجيني الناتج بمهاجمة ذرة الكربون الأكثر محبة للإلكترونات في PEP. يعمل حمض الجلوتاميك (glu-341) كحمض عام عن طريق منح بروتون . ثم يعمل glu-341 منزوع البروتون كقاعدة، حيث يستعيد بروتونه، ويتم فصل مجموعة S3P وبروتنتها بواسطة الليسين المبرتن.
هدف مبيد الأعشاب
يُعدّ إنزيم EPSP synthase الهدف البيولوجي لمبيد الأعشاب غليفوسات. يعمل الغليفوسات كمثبط تنافسي لهذا الإنزيم، حيث يعمل كجزيء وسيط يرتبط بمركب EPSPS-S3P بقوة أكبر من ارتباطه بـ PEP، مما يُثبّط مسار الشيكيمات . يؤدي هذا الارتباط إلى تثبيط عملية التحفيز الإنزيمي وإيقاف المسار. في النهاية، ينتج عن ذلك موت الكائن الحي بسبب نقص الأحماض الأمينية العطرية اللازمة لبقائه. [ 5 ] [ 13 ]
تمكن علماء شركة مونسانتو، بعد تجارب عديدة، من تحديد نسخة من الإنزيم تتميز بمقاومتها لمبيد الغليفوسات وكفاءتها الكافية لتحفيز نمو النبات بشكل مناسب، وذلك في سلالة من بكتيريا الأجروبكتيريوم تُسمى CP4 ( Q9R4E4 ). وقد وُجدت هذه السلالة CP4 حيةً في عمود تغذية بالنفايات في منشأة لإنتاج الغليفوسات. وتم إدخال إنزيم سينثاز EPSP الخاص بسلالة CP4 في العديد من المحاصيل المعدلة وراثيًا . [ 5 ] [ 14 ]
مراجع
- ↑ بريستمان، إم. أ.، هيلي، إم. إل.، فونكه، تي.، بيكر، أ.، شونبرون، إي. (أكتوبر 2005). "الأساس الجزيئي لعدم حساسية تفاعل إنزيم 5-إينول بيروفيل شيكيمات 3-فوسفات سينثاز مع الشيكيمات للجليفوسات" . رسائل FEBS . 579 (25): 5773-5780 . Bibcode : 2005FEBSL.579.5773P . doi : 10.1016/j.febslet.2005.09.066 . PMID : 16225867. S2CID : 26614581 .
- ↑ جولدزبرو، ب. (1990). "تضخيم الجينات في خلايا التبغ المقاومة للجليفوسات". علوم النبات . 72 (1): 53-62 . Bibcode : 1990PlnSc..72...53G . doi : 10.1016/0168-9452(90)90186-r .
- ↑ عبد المجيد، س. س.، سميث، و. و.، بيلد، ج. س. (ديسمبر 1985). "بلورة إنزيم سينثاز 5-إينول بيروفيل شيكيمات 3-فوسفات من الإشريكية القولونية ". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 186 (3): 673. doi : 10.1016/0022-2836(85)90140-8 . PMID 3912512 .
- ↑ ريم، جيه إي، شتاينروكن، إتش سي، بورتر، سي إيه، سيكورسكي، جيه إيه (مايو 1988). "تنقية وخصائص إنزيم 5-إينول بيروفيل شيكيمات-3-فوسفات سينثاز من بادرات نبات الذرة الرفيعة ثنائية اللون النامية في الظلام" . علم وظائف النبات . 87 (1): 232-238 . doi : 10.1104/pp.87.1.232 . PMC 1054731. PMID 16666109 .
- 1 2 3 بولجيوني إل، شونبرون إي، سيهل دي (أغسطس 2011). "الأساس الجزيئي لمقاومة الغليفوسات - مناهج مختلفة من خلال البروتين" . مجلة FEBS . 278 (16): 2753-2766 . doi : 10.1111/j.1742-4658.2011.08214.x . PMC 3145815. PMID 21668647 .
- ↑ فونكه تي، هان إتش، هيلي-فريد إم إل، فيشر إم، شونبرون إي (أغسطس 2006). " الأساس الجزيئي لمقاومة محاصيل راوند أب ريدي لمبيدات الأعشاب" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (35): 13010-13015 . Bibcode : 2006PNAS..10313010F . doi : 10.1073 / pnas.0603638103 . JSTOR 30050705. PMC 1559744. PMID 16916934 .
- ↑ مايدا، هـ.، ودوداريفا، ن. (2012). "مسار الشيكيمات وتخليق الأحماض الأمينية العطرية في النباتات". المراجعة السنوية لبيولوجيا النبات . 63 (1): 73-105 . Bibcode : 2012AnRPB..63...73M . doi : 10.1146/annurev-arplant-042811-105439 . PMID 22554242.
تتكون مسارات الأحماض الأمينية العطرية من مسار الشيكيمات (مسار ما قبل الكورزمات) ومسارات ما بعد الكورزمات الفردية المؤدية إلى التربتوفان والفينيل ألانين والتيروسين... توجد هذه المسارات في البكتيريا والفطريات والنباتات وبعض الطلائعيات، ولكنها غائبة في الحيوانات. لذلك، تعتبر الأحماض الأمينية الأساسية وبعض مشتقاتها (الفيتامينات) عناصر غذائية أساسية في النظام الغذائي البشري، على الرغم من أنه في الحيوانات يمكن تصنيع التيروسين من الفينيل ألانين بواسطة هيدروكسيلاز الفينيل ألانين... كما أن غياب مسارات الأحماض الأمينية الأساسية في الحيوانات يجعل هذه المسارات أهدافًا جذابة للعوامل المضادة للميكروبات ومبيدات الأعشاب.
- ↑ سيرديرا، أ. ل.، ودوك، س. أ. (2006). "الوضع الراهن والآثار البيئية للمحاصيل المقاومة للجليفوسات: مراجعة". مجلة جودة البيئة . 35 (5): 1633-1658 . Bibcode : 2006JEnvQ..35.1633C . doi : 10.2134/jeq2005.0378 . PMID 16899736 .
- ↑ فوردوي، سي إم، وأندرسون، كيه إس (2010). "8.18.4.1.1. إنزيم سينثاز EPSP: وسيط إنزيمي لفوسفات الكيتال رباعي السطوح". المنتجات الطبيعية الشاملة II. الكيمياء والبيولوجيا . وحدة مرجعية في الكيمياء والعلوم الجزيئية والهندسة الكيميائية. المجلد 8. الصفحات 663-688 . doi : 10.1016/B978-008045382-8.00158-1 .
- ↑ أندرسون كيه إس، سامونز آر دي، ليو جي سي، سيكورسكي جيه إيه، بينيسي إيه جيه، جونسون كيه إيه (فبراير 1990). "ملاحظة الوسيط رباعي السطوح لإنزيم EPSP synthase المرتبط بالموقع النشط للإنزيم بواسطة الرنين المغناطيسي النووي للكربون-13". الكيمياء الحيوية . 29 (6): 1460-1465 . doi : 10.1021/bi00458a017 . PMID 2334707 .
- ↑ بارك هـ، هيلسنبيك جيه إل، كيم إتش جيه، شاتلورث دبليو إيه، بارك واي إتش، إيفانز جيه إن، وآخرون . (فبراير 2004). "دراسات بنيوية لإنزيم سينثاز EPSP من المكورات الرئوية في الحالة غير المرتبطة، والحالة المرتبطة بالوسيط رباعي السطوح ، والحالة المرتبطة بـ S3P-GLP" . علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 51 (4): 963-971 . doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03885.x . PMID 14763973. S2CID 45549442 .
- ↑ أندرسون، ك.س.، سيكورسكي، ج.أ.، جونسون، ك.أ. (سبتمبر 1988). "مركب وسيط رباعي الأوجه في تفاعل إنزيم EPSP synthase تم رصده بواسطة حركية الإخماد السريع". الكيمياء الحيوية . 27 (19): 7395-7406 . doi : 10.1021/bi00419a034 . PMID 3061457 .
- ↑ شونبرون إي، إشنبرغ إس، شاتلوورث دبليو إيه، شلوس جيه في، أمراين إن، إيفانز جيه إن، وآخرون . (فبراير 2001). "تفاعل مبيد الأعشاب غليفوسات مع إنزيمه المستهدف، سينثاز 5-إينول بيروفيل شيكيمات 3-فوسفات، بتفصيل ذري" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 98 (4): 1376-1380 . Bibcode : 2001PNAS...98.1376S . doi : 10.1073/pnas.98.4.1376 . PMC 29264. PMID 11171958 .
- ↑ غرين، جيه إم، وأوين، إم دي (يونيو 2011). "المحاصيل المقاومة لمبيدات الأعشاب: فوائدها وقيودها في إدارة الأعشاب المقاومة لمبيدات الأعشاب" . مجلة الكيمياء الزراعية والغذائية . 59 (11): 5819-5829 . Bibcode : 2011JAFC...59.5819G . doi : 10.1021/jf101286h . PMC 3105486. PMID 20586458 .
للمزيد من القراءة
- موريل إتش، كلارك إم جيه، نولز بي إف، سبرينسون دي بي (يناير 1967). "التخليق الإنزيمي لحمض الكوريزميك وحمض البريفينيك من فوسفات حمض 3-إينول بيروفيل شيكيميك" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 242 (1): 82-90 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)96321-0 . PMID 4289188 .
- EC 2.5.1
- إنزيمات ذات بنية معروفة
