علم المناعة الحاسوبي

📅 آخر تحديث: ٣٠ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣٠ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

علم المناعة الحاسوبي هو فرع من فروع علم المناعة يُطبّق الأساليب الحاسوبية لتحليل البيانات المتعلقة بالمناعة ونمذجة عمليات الجهاز المناعي . [ 1 ] ولأن الجهاز المناعي يتكون من خلايا وجزيئات وشبكات إشارات مترابطة بشكل وثيق، فإن العديد من آلياته معقدة ويصعب دراستها باستخدام الأساليب التجريبية وحدها. [ 2 ] يهدف علم المناعة الحاسوبي إلى تمثيل هذه العمليات المناعية كمسائل حاسوبية يمكن دراستها باستخدام الخوارزميات والنماذج الإحصائية والتقنيات القائمة على البيانات. [ 3 ] [ 4 ]

مقدمة

يُعدّ الجهاز المناعي، الذي يحمي الجسم من العدوى ومسببات الأمراض الضارة والمواد الغريبة الأخرى، نظامًا بيولوجيًا معقدًا ، [ 5 ] [ 6 ] وتُعتبر دراسته من أكثر المجالات تحديًا في علم الأحياء والطب . [ 7 ] ويسعى البحث في علم المناعة إلى فهم الآليات الكامنة وراء الاستجابات المناعية ودعم تطوير اللقاحات والعلاجات لمجموعة واسعة من الأمراض. [ 8 ] ومع ذلك، لا تزال جوانب عديدة من الجهاز المناعي صعبة البحث، [ 9 ] نظرًا لأن التفاعلات بين الخلايا المناعية والجزيئات ومسارات الإشارات ديناميكية للغاية ولم تُفهم بالكامل بعد. [ 10 ]

في الوقت نفسه، أدت التطورات في تقنيات التجارب عالية الإنتاجية وتقنيات "الأوميكس" إلى زيادة كبيرة في حجم البيانات المناعية وتعقيدها. [ 11 ] [ 12 ] فعلى سبيل المثال، أدى تسلسل جينومات الإنسان والكائنات النموذجية [ 13 ] [ 14 ] إلى توليد مجموعات بيانات ضخمة ذات صلة بعلم المناعة، بينما تم الإبلاغ عن البيانات الوظيفية والسريرية على نطاق واسع في الأدبيات العلمية وتسجيلها في البيئات السريرية. [ 15 ] ولمعالجة هذه التحديات والفرص، تم استخدام مناهج حسابية لتنظيم وتحليل مجموعات البيانات واسعة النطاق هذه، مما ساهم في ظهور علم المناعة الحسابي. [ 16 ] ويمكن أن توفر مخرجات هذه التحليلات رؤى جديدة حول وظيفة الجهاز المناعي، وآليات الأمراض، وتطوير اللقاحات والعلاجات. [ 17 ]

تاريخ

يمكن تتبع المساهمات المبكرة في علم المناعة الحاسوبي إلى أواخر القرن التاسع عشر، عندما قدم بيوتر ديميترييفيتش إنكو إطارًا احتماليًا لوصف انتشار الأمراض المعدية، بما في ذلك الحصبة ، وهو ما يمثل أحد أوائل المناهج العشوائية لنمذجة الأوبئة. [ 18 ] وفي وقت لاحق، في أوائل القرن العشرين، تقدم هذا المجال من خلال التطبيقات المبكرة للنمذجة الرياضية على الأمراض المعدية مثل الملاريا ، مع التركيز على فهم أنماط انتقال المرض. [ 19 ] [ 20 ]

خلال القرن العشرين، ازداد استخدام الرياضيات والإحصاء والأساليب الحسابية في دراسات الجهاز المناعي والعمليات المرضية بشكل مطرد. وقد ساهمت هذه التطورات في ظهور علم المناعة الحاسوبي كمجال متعدد التخصصات يطبق المناهج الحسابية على المسائل المناعية.

قاعدة بيانات المناعة

أدى النمو السريع في حجم وتعقيد البيانات المناعية إلى تطوير قواعد بيانات متخصصة لتخزين البيانات وتنظيمها وتحليلها. وتتسم هذه البيانات بتنوعها الكبير، وعادةً ما تُنظّم في قواعد بيانات مصممة لدعم مجالات بحثية مختلفة.

تم تطوير مجموعة واسعة من قواعد البيانات المناعية لتخزين هذه البيانات وتنظيمها، مما يدعم نمو علم المناعة الحاسوبي من خلال تمكين تحليل هذه الموارد واستخدامها لتوليد معارف جديدة. يقدم الجدول أدناه أمثلة مختارة لقواعد البيانات المناعية واسعة الانتشار والموثوقة.

قاعدة البياناتوصفمراجع
IEDBقاعدة بيانات للمواقع المستضدية التي تم التحقق منها تجريبياً وبيانات ارتباط معقد التوافق النسيجي الرئيسي .[ 21 ]
الكمانقاعدة بيانات وتحليل اللقاحات عبر الإنترنت[ 22 ] [ 23 ]
IMGTمورد متكامل لبيانات علم المناعة الوراثية، بما في ذلك الغلوبولينات المناعية ومستقبلات الخلايا التائية وMHC.[ 24 ] [ 25 ]
إيبي-آي بي ديمورد متكامل لقواعد بيانات تعدد أشكال الجينات المناعية، بما في ذلك HLA وKIR وMHC[ 26 ] [ 27 ]
مسببات الحساسيةقاعدة بيانات لتسمية مسببات الحساسية الموحدة للبروتينات المسببة للحساسية المرتبطة بالغلوبولين المناعي E[ 28 ]
الاستيرادقاعدة بيانات شاملة وبوابة تحليلية لأبحاث علم المناعة.[ 29 ]
قاعدة بيانات القديسينقاعدة بيانات شاملة للأجسام المضادة الهيكلية لنمذجة الأجسام المضادة وتصميمها وتحليل تفاعل الأجسام المضادة مع المستضدات.[ 30 ]
أطلس المناعة السرطانيةقاعدة بيانات شاملة لبيانات علم المناعة الجينية للسرطان.[ 31 ]

أدوات

في مجال علم المناعة الحاسوبي، طُوِّرت مجموعة واسعة من الأدوات لدعم تحليل البيانات المناعية ونمذجتها وتفسيرها. تُتيح هذه الأدوات، التي تُستخدم غالبًا بالتزامن مع قواعد بيانات متخصصة، دراسة عمليات الجهاز المناعي المعقدة وتُسهِّل عمليات المحاكاة المتقدمة للاستجابات المناعية. ترد أمثلة نموذجية لهذه الأدوات في الجدول أدناه.

أداةوصفمراجع
أدوات IEDBأدوات التنبؤ بالبروتينات المستضدية وتحليلها للخلايا البائية والتائية[ 21 ]
IMGT/V-QUESTأداة لتحليل تسلسلات الغلوبولين المناعي ومستقبلات الخلايا التائية[ 32 ] [ 33 ]
أدوات المعلوماتية المناعية في جامعة الدنمارك التقنيةمجموعة من الأدوات القائمة على الويب للتنبؤ بالخصائص المناعية وتحليلها، بما في ذلك الحواتم، وربط معقد التوافق النسيجي الرئيسي، والتفاعلات المناعية.[ 34 ]
إيغ بلاستأداة لتحليل تسلسلات الغلوبولين المناعي ومستقبلات الخلايا التائية، بما في ذلك تعيين ومحاذاة جينات V(D)J.[ 35 ]
أبيسيسقاعدة بيانات وأداة تحليل لتسلسلات وهياكل الأجسام المضادة، بما في ذلك شرح مناطق الغلوبولين المناعي.[ 36 ]
ذخيرة الموسيقىمجموعة أدوات لتحليل المناعة على مستوى الخلية الواحدة[ 37 ]

التطبيقات

الحساسية

تُمثل الحساسية مجالًا هامًا في علم المناعة، إذ تتسم الاستجابات المناعية بتفاوت كبير بين الأفراد، حتى أولئك الذين يتشابهون في تركيبهم الجيني. يشمل تقييم قدرة البروتين على إحداث الحساسية عادةً ثلاثة جوانب رئيسية: القدرة على إثارة الاستجابة المناعية، والتفاعل المتبادل، والأعراض السريرية. ترتبط القدرة على إثارة الاستجابة المناعية بشكل أساسي بتنشيط الخلايا البائية والتائية المنتجة للغلوبولين المناعي E (IgE) استجابةً لمسببات حساسية محددة. ونتيجةً لذلك، تركز العديد من الدراسات على تحديد مواقع الارتباط على الخلايا البائية والتائية، بالإضافة إلى الخصائص البنيوية لمسببات الحساسية التي تؤثر على قدرتها على إحداث الحساسية.

تُستخدم مناهج علم المناعة الحاسوبية بشكل متزايد للتنبؤ بقدرة البروتينات على إحداث الحساسية ودعم تقييم البروتينات الجديدة، لا سيما في تطبيقات الأغذية والتكنولوجيا الحيوية. [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] تدمج هذه الأساليب قواعد البيانات المناعية مع أدوات التنبؤ لتحديد مسببات الحساسية المحتملة وتقييم التفاعلات المتبادلة.

النمذجة الحاسوبية للجهاز المناعي

لعبت النمذجة الحاسوبية دورًا هامًا في تحسين فهمنا للأمراض وديناميكيات الاستجابات المناعية. ونظرًا لتعقيد الجهاز المناعي، يمكن استخدام الأطر الرياضية والخوارزميات والتقنيات الحاسوبية لتمثيله في نماذج مبسطة وقابلة للتفسير، مما يسهل التحليل والتنبؤ بشكل أعمق. [ 41 ] [ 42 ]

فعلى سبيل المثال، استُخدمت النماذج الرياضية لدراسة الديناميكيات داخل المضيف والانتقاء المناعي في الملاريا، مما يوفر رؤى حول كيفية إفلات مسببات الأمراض من الاستجابات المناعية وتأسيس عدوى مستمرة. [ 43 ]

يُعد تحليل مسارات معالجة المستضدات وعرضها تطبيقًا هامًا آخر للنمذجة الحاسوبية في المعلوماتية المناعية. في هذه العملية، تتحلل البروتينات المشتقة من مسببات الأمراض إلى أجزاء ببتيدية أصغر، تُعرف باسم الحواتم ، والتي تُنقل بعد ذلك إلى الشبكة الإندوبلازمية بواسطة بروتينات مثل TAP. داخل هذا الحيز، ترتبط الببتيدات بجزيئات MHC، ثم تُعرض على سطح الخلية لتتعرف عليها الخلايا التائية. يمكن تمثيل هذا المسار البيولوجي متعدد الخطوات باستخدام نماذج حاسوبية [ 44 ] تتضمن عمليات رئيسية مثل التحلل البروتيني، وكفاءة نقل الببتيدات، وقوة ارتباطها بجزيئات MHC. من خلال محاكاة هذه الخطوات، تُمكّن هذه النماذج من التنبؤ بالببتيدات الأكثر احتمالًا للعرض على الجهاز المناعي. أصبحت هذه الأساليب أدوات أساسية في البحوث المناعية، وتُستخدم على نطاق واسع في التنبؤ بالحواتم، وتقييم الاستجابة المناعية، والتصميم العقلاني للقاحات.

تحديد مواقع الإبيتوب

المستضدات هي مناطق يتعرف عليها الجهاز المناعي، وتتوافق مع أجزاء محددة من المستضد الذي يتعرف عليه الجهاز المناعي. [ 45 ] يلعب تحديد هذه المناطق دورًا هامًا في تصميم اللقاحات وتطوير الأجسام المضادة. ومع تقدم الأساليب الحسابية، أصبح تحديد المستضدات وتحليلها أكثر كفاءة وأسهل استخدامًا.

في هذا السياق، دعم المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية الأبحاث المتعلقة بالمستضدات من خلال تمويل تطوير وتوسيع قاعدة بيانات المستضدات المناعية (IEDB)، وهي مورد متاح للجمهور للمستضدات التي تم التحقق منها تجريبياً، والتي تدمج بيانات تجريبية واسعة النطاق وتدعم الأبحاث في تطوير اللقاحات والعلاجات. [ 46 ]

تصميم اللقاح

لقد سهّلت علم المناعة الحاسوبي بشكل كبير عملية تصميم اللقاحات من خلال تقليل الوقت والتكلفة المرتبطين بتطويرها. ويُمكّن علم المعلوماتية المناعية، الذي يدمج علم المناعة مع العلوم الحاسوبية، من تحديد المكونات المستضدية الرئيسية، بالإضافة إلى تصميم وتقييم وتحسين اللقاحات المرشحة.

في السنوات الأخيرة، طبّقت العديد من الدراسات مناهج المعلوماتية المناعية في تصميم اللقاحات ضد طيف واسع من مسببات الأمراض، بما في ذلك الليبتوسبيرا (داء الليبتوسبيرات)، [ 47 ] والبروسيلا، [ 48 ] وفيروس الأنف البشري من النوع C، [ 49 ] وفيروس الميتابنوموفيروس البشري، [ 50 ] [ 51 ] وفيروس حمى الخنازير الأفريقية، [ 52 ] والملوية البوابية، [ 53 ] وفيروس سارس-كوف-2، [ 54 ] وأنواع الليشمانيا المرتبطة بداء الليشمانيات الحشوي. [ 55 ] هذه الأمثلة توضيحية، وقد أُجري عدد كبير من الدراسات حول أمراض معدية متنوعة.

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ غوارا، فيديريكا؛ كولومبو، جورجيو (22 أغسطس/آب 2023). "الأساليب الحسابية في علم المناعة واللقاحات: تصميم وتطوير الأجسام المضادة والمستضدات" . مجلة نظرية الكيمياء والحساب . 19 (16): 5315-5333 . Bibcode : 2023JCTC...19.5315G . doi : 10.1021/acs.jctc.3c00513 . ISSN 1549-9618 . PMC 10448727. PMID 37527403 .   
  2. ↑ تشانغ، كريستوفر (2022-01-01)، "علم المناعة الأساسي" ، الأمراض التحسسية والمناعية ، دار النشر الأكاديمية، الصفحات 43-88 ، doi : 10.1016/B978-0-323-95061-9.00003-5 ، ISBN  978-0-323-95061-9تم الاطلاع عليه بتاريخ 24 أبريل 2026
  3. ↑ هوساكوفا، مارتينا (2015). "مكافحة الأمراض المعدية باستخدام علم المناعة الحاسوبي" . في: نونيز، مانويل؛ نغوين، نغوك ثانه؛ كاماتشو، ديفيد؛ تراوينسكي، بوغدان (محررون). الذكاء الجماعي الحاسوبي . سلسلة محاضرات في علوم الحاسوب. المجلد 9330. تشام: دار نشر سبرينغر الدولية. الصفحات 398-407 . doi : 10.1007/978-3-319-24306-1_39 . ISBN   978-3-319-24306-1.
  4. ↑ تومار، نامراتا؛ دي، راجات ك. (2014)، "علم المناعة المعلوماتي: مراجعة موجزة"، في دي، راجات ك.؛ تومار، نامراتا (محرران)، علم المناعة المعلوماتي ، المجلد 1184، نيويورك، نيويورك: سبرينغر، الصفحات 23-55 ، doi : 10.1007/978-1-4939-1115-8_3 ، ISBN   978-1-4939-1115-8PMID 25048118​ 
  5. ^ وانغ ، رويوان. لان، كايني؛ بن لاغا، كامل؛ كامارا، نيلز أولسن سارايفا؛ ميلر، هيذر. كوبو، ماساتو؛ هيجارد، ستيفن. لي، باميلا؛ يانغ، لو؛ فورسمان، هوامي؛ لي، شينغروي؛ تشاي، زيمين؛ ليو ، تشاوهونغ (2024/09/15). "التفاعل بين جهاز المناعة الفطري والجهاز المناعي التكيفي" . ميدكوم . 5 (10) هـ714. دوى : 10.1002/mco2.714 . ردمك 2688-2663 . بمك 11401974 . بميد 39286776 .   
  6. ^ هوانغ نجوين، كيم هان؛ لو، نغي فينه؛ نجوين، فوك هوانج؛ نجوين، هين هاو ثي؛ هوانغ، دوي ماي؛ هيونه ، شين دينه (2025/01/13). "جهاز المناعة البشري: استكشاف التنوع بين الأفراد والمجموعات السكانية" . هيليون . 11 (2) هـ41836. بيب كود : 2025هيلي..1141836هـ . دوى : 10.1016/j.heliyon.2025.e41836 . ISSN 2405-8440 . بمك 11795082 . بميد 39911431 .   
  7. ↑ ألفونسو-غونزاليس، لوسيا؛ فرنانديز، فرانسيسكو ج.؛ فيغا، م. كريستينا (2025-09-05). "علم المناعة النظمي: عندما يلتقي علم الأحياء النظمي بعلم المناعة" . مجلة فرونتيرز إن إيمونولوجي . 16 1630488. doi : 10.3389/fimmu.2025.1630488 . ISSN 1664-3224 . PMC 12447193. PMID 40977698 .   
  8. ↑ بوليندران، ب.؛ ديفيس، م.م. (2020). "العلم" . مجلة ساينس . 369 (6511). doi : 10.1126/science.aay4014 . PMC 7872131. PMID 32973003. تاريخ الاسترجاع: 24 أبريل 2026 .  
  9. ↑ شيندي، سنيال ب.؛ كورهيكار، مانيش ب. (2018-02-20). "مراجعة بيولوجيا الأنظمة للجهاز المناعي باستخدام نماذج قائمة على العوامل" . بيولوجيا الأنظمة IET . 12 (3): 83-92 . doi : 10.1049/iet-syb.2017.0073 . ISSN 1751-8849 . PMC 8687247. PMID 29745901 .   
  10. ↑ دايرون، مارك (13 سبتمبر 2022). " الجهاز المناعي كنظام علاقات" . مجلة فرونتيرز إن إيمونولوجي . 13 984678. doi : 10.3389/fimmu.2022.984678 . ISSN 1664-3224 . PMC 9513551. PMID 36177051 .   
  11. ↑ فيتورينو، روي (2024-09-06). "تحويل البحوث السريرية: قوة تكامل علم الجينوم عالي الإنتاجية" . بروتومز . 12 ( 3): 25. doi : 10.3390/proteomes12030025 . ISSN 2227-7382 . PMC 11417901. PMID 39311198 .   
  12. ↑ كيسكيتالو، سالا؛ سيبانين، ميكو آر جيه؛ ديل سول، أنطونيو؛ فارجوسالو، ماركو (18 فبراير 2025). "من النادر إلى الأكثر شيوعًا: الدور الناشئ لعلم الجينوم في تحسين فهم وعلاج حالات الالتهاب الشديد وفرط الالتهاب" . مجلة الحساسية والمناعة السريرية . 155 (5): 1435-1450 . doi : 10.1016/j.jaci.2025.02.011 . ISSN 0091-6749 . PMID 39978687 .  
  13. ↑ روين، ل.؛ ماهايراس، ج.؛ هود، ل. (1997). "العلم" . مجلة ساينس . 278 (5338): 605-607 . doi : 10.1126/science.278.5338.605 . PMID 9381170. تاريخ الاسترجاع: 24 أبريل 2026 . 
  14. ↑ فينتر، جيه سي؛ وآخرون (2001). "العلم" . مجلة ساينس . 291 (5507): 1304-1351 . doi : 10.1126/science.1058040 . PMID 11181995. تاريخ الاسترجاع: 24 أبريل 2026 .  
  15. ↑ تشو، شياوجينغ؛ تشانغ، بوين؛ كوكين، فاليري إيه سي إم؛ غوبتا، مانوج كومار؛ لي، يانغ (2021-06-11). " مناهج متعددة الأوميات في البحوث المناعية" . مجلة فرونتيرز إن إيمونولوجي . 12 668045. doi : 10.3389/fimmu.2021.668045 . ISSN 1664-3224 . PMC 8226116. PMID 34177908 .   
  16. ↑ ماركس، فيفيان (12 يونيو 2013). "التحديات الكبرى للبيانات الضخمة" . مجلة نيتشر . 498 (7453): 255-260 . doi : 10.1038/498255a . ISSN 1476-4687 . PMID 23765498 .  
  17. ^ بولا، آنا كارولينا سيلفا؛ سبانو دا سيلفا، أليساندرا؛ برادو سيرينو، برونو؛ دياس، ماريا فرناندا ريبيرو؛ ليل دا سيلفا ، مانويلا (2025/10/07). "الطرق الحسابية في المعلوماتية المناعية: اكتشاف الحاتمة والتطبيقات التشخيصية" . ايه سي اس أوميغا . 10 (39): 44816-44839 . دوى : 10.1021/acsomega.5c05538 . بمك 12508925 . بميد 41078745 .  
  18. ↑ إنكو، ب.د. (1989). "حول مسار أوبئة بعض الأمراض المعدية" . المجلة الدولية لعلم الأوبئة . 18 (4): 749-755 . doi : 10.1093/ije/18.4.749 . ISSN 0300-5771 . PMID 2695472 .  
  19. ↑ روس، ر. (1 فبراير 1916). "تطبيق نظرية الاحتمالات على دراسة علم الأمراض المسبق. الجزء الأول" . وقائع الجمعية الملكية أ . 92 (638): 204-230 . رمز Bibcode : 1916RSPSA..92..204R . doi : 10.1098/rspa.1916.0007 .
  20. ↑ روس، رونالد (1910). الوقاية من الملاريا . نيويورك، إي بي داتون وشركاه.
  21. 1 2 فيتا، راندي؛ بلازيسكا، نينا؛ ماراما، دانيال؛ أعضاء فريق تنسيق قاعدة بيانات IEDB؛ شاكلفورد، ديبورا؛ زالمان، ليورا؛ فوس، غابرييل؛ زاريبسكي، لورا؛ تشان، كينيث؛ ريردون، برايان؛ فيتزباتريك، سيدني؛ بوس، ماثيو؛ كولمان، سارة؛ سيدويك، كايتلين؛ إدواردز، ليندي (2025-01-06). "قاعدة بيانات IEMUNIDB: تحديث 2024" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 53 (D1): D436– D443. doi : 10.1093/nar/gkae1092 . ISSN 0305-1048 . PMC 11701597. PMID 39558162 .   
  22. ↑ هي، يونغكون؛ راز، ريبيكا؛ سايرز، سامانثا؛ لين، يو؛ تود، توماس؛ هور، جونغوك؛ لي، شينا؛ باتيل، موكتي؛ تشاو، بويانغ؛ تشونغ، مونيكا؛ أوسترو، جوزيف؛ سيلورا، أندرو؛ دونغاراني، بريا؛ أوليس، غيرلان؛ كوشار، كانيكا (يناير 2014). "تحديثات على قاعدة بيانات لقاح VIOLIN ونظام التحليل عبر الإنترنت" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 42 (D1): D1124– D1132. doi : 10.1093/nar/gkt1133 . ISSN 0305-1048 . PMC 3964998. PMID 24259431 .   
  23. ↑ شيانغ، ز.؛ تود، ت.؛ كو، ك.ب.؛ كوفاسيتش، ب.ل.؛ لارسون، س.ب.؛ تشين، ف.؛ هودجز، أ.ب.؛ تيان، ي.؛ أولينزيك، إ.أ.؛ تشاو، ب.؛ كولبي، ل.أ.؛ راش، هـ.ج.؛ جيلسدورف، ج.ر.؛ جورديان، ج.و.؛ هي، ي. (23-12-2007). "VIOLIN: شبكة معلومات وبحوث اللقاحات على الإنترنت" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 36 (قاعدة البيانات): D923– D928. doi : 10.1093/nar/gkm1039 . ISSN 0305-1048 . PMC 2238972. PMID 18025042 .   
  24. ^ سانو، جاوسو؛ زيتون، جلهم؛ مانسو، تاسيانا؛ عيدي، ميلاد؛ بتول، شمسة؛ كوشواها، أنجانا؛ جراند، فرانسوا؛ كروز، ميريام. فايلان، أكسل. الدباغ، شهرزاد؛ عبد الله، نيكا؛ جورجا، ماريا؛ باباداكي، أريادني؛ سيديري، إيفيجينيا؛ سامادوفا ، توركان (2026/01/06). "IMGT® على نطاق واسع: أدوات عادلة وديناميكية وآلية لتحليل موضع المناعة" . أبحاث الأحماض النووية . 54 (د1): د1119 – د1132. دوى : 10.1093/نار/gkaf1024 . ISSN 0305-1048 . بمك 12807764 . بميد 41091930 .   
  25. ^ مانسو، تاسيانا. فولش، جيرالدين؛ جوديتشيلي، فيرونيك؛ جبادو-مشالود، جمانا؛ كوشواها، أنجانا؛ نجويفاك نغوني، فيفيان؛ جورجا، ماريا؛ باباداكي، أريادني؛ الدباغ، شهرزاد؛ بيجورييه، بيرين؛ بيرتينياك، مورغان. الهادي السلجوقي، صيدا؛ شنتلي، إيمين؛ شيروالي، كريمة؛ عوينتي، صفا (2022-01-07). "قواعد بيانات IMGT® والأدوات ذات الصلة وموارد الويب من خلال ثلاثة محاور رئيسية للبحث والتطوير" . أبحاث الأحماض النووية . 50 (د1): د1262 – د1272. دوى : 10.1093/نار/gkab1136 . ISSN 0305-1048 . PMC 8728119 . PMID 34875068 .   
  26. ↑ روبنسون، جيمس؛ هاليول، جيسون أ.؛ ماكويليام، هاميش؛ لوبيز، رودريغو؛ مارش، ستيفن جي إي (23 نوفمبر 2012). "قاعدة بيانات تعدد الأشكال المناعية (IPD)" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (D1): D1234– D1240 . doi : 10.1093/nar/gks1140 . ISSN 0305-1048 . PMC 3531162. PMID 23180793 .   
  27. ↑ باركر، دومينيك جيه؛ ماكاري، جوزيبي؛ جورجيو، زينيا؛ كوبر، مايكل أ؛ فليسيك، بول؛ روبنسون، جيمس؛ مارش، ستيفن جي إي (2023-01-06). "قاعدة بيانات IPD-IMGT/HLA" . أبحاث الأحماض النووية . 51 (D1): D1053– D1060 . doi : 10.1093/nar/gkac1011 . ISSN 0305-1048 . PMC 9825470. PMID 36350643 .   
  28. ^ رادوير، كريستيان. جاديرماير، غابرييل؛ جودمان، ريتشارد إي. سترة من آلان؛ جابي، يوتا؛ لوباتا، أندرياس L.؛ بوميس، آنا؛ راولف، مونيكا؛ سانتوس، كيتي س.؛ زقزوك، جوزيفينا؛ تشانغ، يوتشو. فيتي، جوانا؛ اللجنة الفرعية لتسمية مسببات الحساسية التابعة لمنظمة الصحة العالمية/IUIS (مارس 2026). "مسببات الحساسية الجديدة التي وافقت عليها اللجنة الفرعية لتسمية مسببات الحساسية التابعة لمنظمة الصحة العالمية / IUIS في 2021-2024 وأهميتها بالنسبة للتشخيص والتنظيم والأبحاث المستقبلية. تقرير فرقة عمل EAACI " . الحساسية . 81 (3): 684-699 . دوى : 10.1111 / all.70166 . ISSN 0105-4538 . PMC 12954567 . PMID 41319011 .   
  29. ↑ بهاتاشاريا، سانشيتا؛ دان، باتريك؛ توماس، كريستيل ج.؛ سميث، باري؛ شيفر، هنري؛ تشين، جيمينغ؛ هو، زيتشنغ؛ زالوكوسكي، كيلي أ.؛ شانكار، رافي د.؛ شين-أور، شاي س.؛ طومسون، إليزابيث؛ وايزر، جيفري؛ بوت، أتول ج. (27-02-2018). "ImmPort، نحو إعادة توظيف بيانات المقايسات المناعية المتاحة للجميع في البحوث الانتقالية والسريرية" . البيانات العلمية . 5 (1): 180015. Bibcode : 2018NatSD...580015B . doi : 10.1038/sdata.2018.15 . ISSN 2052-4463 . PMC 5827693. PMID 29485622 .   
  30. ↑ هوانغ، شياوتشيانغ؛ تشو، جون؛ تشن، شوانغ؛ شيا، شياوفنغ؛ تشن، يوجين؛ شو، جي (30-06-2025). " SAAINT-DB: قاعدة بيانات شاملة للأجسام المضادة الهيكلية لنمذجة وتصميم الأجسام المضادة" . مجلة Acta Pharmacologica Sinica . 46 (12): 3365–3375 . doi : 10.1038/s41401-025-01608-5 . ISSN 1745-7254 . PMC 12644554. PMID 40588511 .   
  31. ↑ شاروينتونغ، بورنبيمول؛ فينوتيلو، فرانشيسكا؛ أنجيلوفا، ميهايلا؛ ماير، كليمنس؛ إفريموفا، ميرجانا؛ ريدر، ديتمار؛ هاكل، هوبرت؛ تراجانوسكي، زلاتكو (2017-01-03). "تحليلات المناعة الجينية الشاملة للسرطان تكشف عن علاقات النمط الجيني بالنمط الظاهري المناعي ومؤشرات الاستجابة لحصار نقاط التفتيش المناعية" . تقارير الخلية . 18 (1): 248-262 . doi : 10.1016/j.celrep.2016.12.019 . ISSN 2211-1247 . PMID 28052254 .  
  32. ↑ جيوديتشيلي، فيرونيك؛ بروشيه، كزافييه؛ ليفرانك، ماري-بول (2011-06-01). "IMGT/V-QUEST: تحليل IMGT المعياري لتسلسلات النيوكليوتيدات للغلوبولين المناعي (IG) ومستقبلات الخلايا التائية (TR)" . بروتوكولات كولد سبرينغ هاربور . 2011 (6): 695-715 . doi : 10.1101/pdb.prot5633 . ISSN 1940-3402 . PMID 21632778 .  
  33. ↑ لي، شو؛ ليفرانك، ماري-بول؛ مايلز، جون جيه؛ علميار، إلطاف؛ جيوديتشيلي، فيرونيك؛ دورو، باتريس؛ فريمان، جيه. دوغلاس؛ كوربين، فنسنت دي إيه؛ شيرلينك، جان-بيير؛ فروهمان، مايكل إيه؛ كاميرون، بول يو؛ بليبانسكي، ماغدالينا؛ لوفلاند، بروس؛ بوروز، سكوت آر؛ بابنفوس، أنتوني تي. (2013-09-02). "نموذج IMGT/HighV QUEST لتنوع النمط المستنسخ لمستقبلات الخلايا التائية IMGT والتوصيف المناعي للجيل التالي من الذخيرة" . Nature Communications . 4 (1): 2333. Bibcode : 2013NatCo...4.2333L . doi : 10.1038/ncomms3333 . ISSN 2041-1723 . PMC 3778833. PMID 23995877 .​   
  34. ↑ "أدوات وخدمات المعلوماتية الحيوية" . DTU Health Tech . تم الاسترجاع في 16 أبريل 2026 .
  35. ↑ يي، جيان؛ ما، نينغ؛ مادن، توماس ل.؛ أوستيل، جيمس م. (2013-07-01). "IgBLAST: أداة لتحليل تسلسل النطاق المتغير للغلوبولين المناعي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (W1): W34– W40 . doi : 10.1093/nar/gkt382 . ISSN 1362-4962 . PMC 3692102. PMID 23671333 .   
  36. ↑ سوينديلز، مارك ب.؛ بورتر، كريغ ت.؛ كوتش، ماثيو؛ هيرست، جاكوب؛ أبهيناندان، ك. ر.؛ نيلسن، ينس هـ.؛ ماكيندو، غاري؛ هيذرينغتون، جيمس؛ مارتن، أندرو س. ر. (2017-02-03). "abYsis: تسلسل الأجسام المضادة وبنيتها المتكاملة - الإدارة والتحليل والتنبؤ" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . موارد الحوسبة للبيولوجيا الجزيئية. 429 (3): 356-364 . doi : 10.1016/j.jmb.2016.08.019 . ISSN 0022-2836 . PMID 27561707 .  
  37. ↑ بورتشردينغ، نيكولاس؛ بورمان، نيكولاس ل.؛ كراوس، غلوريا (15 يونيو 2020)، "scRepertoire: مجموعة أدوات قائمة على لغة R لتحليل مستقبلات المناعة أحادية الخلية"، F1000Research ، 9 : 47، doi : 10.12688/f1000research.22139.2 ، PMC 7400693 ، PMID 32789006  
  38. ↑ سارلكيفار، فائزة؛ مالك، حامد؛ اللهياري فرد، نجف (9 يناير 2025). "AllerTrans: طريقة تعلم عميق للتنبؤ بقدرة تسلسلات البروتين على إحداث الحساسية" . طرق وبروتوكولات علم الأحياء . 10 (1) bpaf040. doi : 10.1093/biomethods/bpaf040 . ISSN 2396-8923 . PMC 12254128. PMID 40656558 .   
  39. ↑ نغوين، مينه ن؛ كروتز، نورا ل؛ ليمفيبوفاد، فاشيراني؛ لوباتا، أندرياس ل؛ جيربيريك، جي فرانك؛ ماورر-ستروه، سيباستيان (2022-07-05). "AllerCatPro 2.0: خادم ويب للتنبؤ بإمكانية تسبب البروتينات بالحساسية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 50 (W1): W36– W43 . doi : 10.1093/nar/gkac446 . ISSN 0305-1048 . PMC 9252832. PMID 35640594 .   
  40. ↑ كيملر، إيمانويل؛ فاث، إيما كاثرين؛ بريسنر، روبرت؛ بانيرجي، بريانكا (2025-07-07). "AllergyPred: خادم ويب للتنبؤ بمسببات الحساسية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 53 (W1): W4– W10. doi : 10.1093/nar/gkaf383 . ISSN 0305-1048 . PMC 12230706. PMID 40326517 .   
  41. ↑ بوخريل، شيخار؛ شارما، نيكيتا؛ ثاكوري، روشان راج بهادور سينغ (22-02-2026). بنتوت، سفيان (محرر). "النماذج الرياضية وتطبيقاتها في فهم ديناميكيات الأمراض المعدية" . مجلة الرياضيات التطبيقية . 2026 (1) 3007179. doi : 10.1155/jama/3007179 . ISSN 1110-757X . 
  42. ↑ خافيير، جواو ب.؛ مونك، جوناثان م.؛ بوديل، سوغات؛ نورسيجيان، تشارلز ج.؛ ساستري، أناند ف.؛ لياو، تشين؛ بينتو، خوسيه؛ سوشارد، مارك أ.؛ أرييتا-أورتيز، ماريو ل.؛ بيترسون، إليزا جونيور؛ باليغا، نيتين س.؛ ستويغر، توماس؛ روفين، فيليسيا؛ ريتشاردسون، ريس أ.ك.؛ غاو، كاثرين أ. (2022-03-16). "نماذج رياضية لدراسة بيولوجيا مسببات الأمراض والأمراض المعدية التي تسببها" . iScience . 25 (4) 104079. Bibcode : 2022iSci...25j4079X . doi : 10.1016/j.isci.2022.104079 . ISSN 2589-0042 . PMC 8961237. PMID 35359802 .​   
  43. ↑ نورت، ساندر ب. فان؛ نونيس، مارتا س.؛ ويدال، غاريث د.؛ هفيد، لارس؛ غوميز، م. غابرييلا م. (22-03-2010). "الاختيار المناعي والتنافس داخل العائل يُمكنهما تشكيل مجموعة مستضدات السطح المتغيرة في بلازموديوم فالسيباروم - نموذج رياضي" . PLOS ONE . 5 (3) e9778. Bibcode : 2010PLoSO...5.9778V . doi : 10.1371/journal.pone.0009778 . ISSN 1932-6203 . PMC 2842302. PMID 20339540 .   
  44. ↑ "مجلات سيج: اكتشف أبحاثًا عالمية المستوى" . مجلات سيج . doi : 10.3233/ISB-00010 . تاريخ الاسترجاع: 21 أبريل 2026 .
  45. ^ روحبارفار باسمنج، اسماعيل. ردمان بجوح، سوزان؛ إبراهيمي فلاح، أفسان؛ ناجيان، رافع؛ رحيمي، الميرا؛ أتيغي، حسين؛ غيابي، شادان؛ غيابي، شميم (2025-01-03). “تصميم اللقاح الحاسوبي القائم على الحاتمة مع نهج المعلوماتية الحيوية؛ مراجعة” . هيليون . 11 (1) هـ41714. بيب كود : 2025هيلي..1141714 B . دوى : 10.1016/j.heliyon.2025.e41714 . ISSN 2405-8440 . بمك 11761309 . بميد 39866399 .   
  46. ↑ ماكوري-شميدت، مادلين (2026-04-07). "سيحصل معهد لا جولا للمناعة على ما يصل إلى 17.6 مليون دولار لدعم قاعدة بيانات حيوية للابتكار الطبي الحيوي" . معهد لا جولا للمناعة . تاريخ الاسترجاع: 2026-04-20 .
  47. ↑ سيثي، غونيسوار؛ كيم، يونغ كيو؛ هان، سو تشول؛ هوانغ، جيونغ هو (28 يناير 2025). " تصميم لقاح متعدد الوحدات الفرعية واسع النطاق ضد داء البريميات باستخدام المعلوماتية المناعية والأساليب البنيوية" . مجلة فرونتيرز إن إيمونولوجي . 15 1503853. doi : 10.3389/fimmu.2024.1503853 . ISSN 1664-3224 . PMC 11811080. PMID 39936152 .   
  48. ^ لي تشوانغ. تشو، يويجي؛ تشى، شينغ شينغ؛ تشاي، زينجلونج؛ لو، جياروي؛ شانغ، كايو؛ تيان، تينجتينج؛ شي، هويدونغ؛ لي، مينجزي؛ شو، رويكسوي؛ بو، فولينغ. كوانغ، جونيو؛ تشانغ ، فنغبو (2025/11/06). "تصميم لقاح BCG المؤتلف متعدد الحلقات الذي يستهدف البروسيلا OMP31 و LptE و VirB2 في مناهج المعلوماتية المناعية" . بلوس واحد . 20 (11) هـ0334843. بيب كود : 2025PLoSO..2034843L . دوى : 10.1371/journal.pone.0334843 . ردمك 1932-6203 . بمك 12591482 . PMID 41196893 .   
  49. ↑ مأمون، تاج الإسلام؛ علي، محمد أحد؛ حسين، محمد نزمول؛ الرحمن، جيلور. إسلام، محمد أنورول؛ عقيب، محمد غلام؛ زمان، كمروز؛ الرحمن، محمد مسدور؛ حسين، فردوس محمد الطاف؛ ابنموسى، سمير؛ بورهية، محمد؛ داود، تركي م. (2025-01-07). "تصميم لقاح مرشح متعدد الحلقات ضد فيروس الأنف البشري C باستخدام نهج المعلوماتية المناعية" . الحدود في علم المناعة . 15 1364129. دوى : 10.3389/fimmu.2024.1364129 . ردمك 1664-3224 . بمك 11747413 . بميد 39840071 .   
  50. ↑ سينغمار، أجاي كومار؛ غويال، فينود؛ كوماري، سانتوش؛ غريوال، سابنا (13 ديسمبر 2025). "تصميم لقاح mRNA متعدد الإبيبتوب لمكافحة فيروس ميتابنوموفيروس البشري بناءً على تسلسل توافقي باستخدام علم اللقاحات العكسي" . مجلة التصميم الجزيئي بمساعدة الحاسوب . 40 (1): 20. doi : 10.1007/s10822-025-00732-y . ISSN 1573-4951 . 
  51. ↑ بخاري، خلود (22-11-2025). "تصميم لقاح متعدد الإبيتوب ضد فيروس ميتابنوموفيروس البشري عبر علم اللقاحات العكسي والنمذجة الجزيئية" . التقارير العلمية . 15 (1) 45014. Bibcode : 2025NatSR..1545014B . doi : 10.1038/ s41598-025-28522-4 . ISSN 2045-2322 . PMC 12749620. PMID 41274916 .   
  52. ^ فينكاتيسواران، ديثيا؛ براكاش، أنويشا؛ نجوين، كوينه آنه؛ سونتيسوكوواتانا، رويبيم؛ أتابا، ورانيا؛ تانتيتوفانونت، أنغكانا؛ نيلوبول، دخريت (2025-05-08). "تصميم لقاح متعدد الحواتم ضد فيروس حمى الخنازير الأفريقية باستخدام مدخل المعلوماتية المناعية" . التقارير العلمية . 15 (1): 16044. بيب كود : 2025NatSR..1516044V . دوى : 10.1038/s41598-025-00705-z . ISSN 2045-2322 . بمك 12062365 . بميد 40341420 .   
  53. ↑ رزاق، عبد؛ أحمد، فيروز؛ محمود، محمد توسليم (30-09-2025). "تطوير لقاح متعدد الإبيتوب ضد جرثومة الملوية البوابية باستخدام تقنية saRNA مبتكرة من خلال نهج المعلوماتية المناعية" . التقارير العلمية . 15 (1): 33753. Bibcode : 2025NatSR..1533753R . doi : 10.1038/ s41598-025-99512-9 . ISSN 2045-2322 . PMC 12484783. PMID 41028278 .   
  54. ^ أديلوسي، تيميتوب إسحاق؛ أوغونلانا، عابدين توندي؛ أويول، مويوسولوا بريشيوس؛ أوجو، تايو أوريولوا؛ أولاوبا، أولاميد توسين؛ أولاديبو، إيليا كولاولي؛ عكاش، شونيل؛ ابنموسى، سمير؛ بورهية، محمد؛ جردان، يوسف أ. بن؛ سيتوتاو ، باي (2025/01/20). "تصميم لقاح مبتكر متعدد الوحدات محفوظ يستهدف بروتين سكري SARS-CoV-2 والبروتين النووي من خلال المعلومات المناعية" . التقارير العلمية . 15 (1): 2563. بيب كود : 2025NatSR..15.2563A . دوى : 10.1038/s41598-024-72495-9 . ISSN 2045-2322 . PMC 11747174. PMID 39833186 .​   
  55. ↑ بانيشي، مريم؛ صادقي، محبوبة؛ الهاشمي، سمانة؛ ألسيدو، كلوديا؛ مورو، أنطونيو؛ مانزانو رومان، راؤول؛ سافاردشتكي، أمير؛ الرشيدي، سجاد (2025-11-10). "تصميم مستضد جديد متعدد الحواتم لتشخيص داء الليشمانيات الحشوي باستخدام نهج المعلوماتية المناعية" . التقارير العلمية . 15 (1): 39308. بيب كود : 2025NatSR..1539308B . دوى : 10.1038/s41598-025-23012-z . ISSN 2045-2322 . بمك 12603214 . بميد 41214019 .