بيوي

نطاق piwi لبروتين argonaute المرتبط بـ siRNA ، وهو أحد مكونات مركب إسكات الجينات المحفز بواسطة RNA والذي يتوسط إسكات الجينات عن طريق تداخل RNA .
تحتوي جميع بروتينات Piwi البشرية وبروتينات argonaute على نفس نطاقات ربط الحمض النووي الريبي، PAZ و Piwi. [ 2 ]
تفاعلات Piwi-piRNA: داخل النواة، يشارك هذا المسار في مثيلة الحمض النووي (A)، ومثيلة الهيستون H3K9 من خلال التفاعلات مع بروتين الهيتروكروماتين 1 (HP1) وإنزيم مثيل ترانسفيراز الهيستون H3K9 (B). يتفاعل مسار Piwi-piRNA أيضًا مع مُبادر الترجمة elF (C). [ 3 ]

تم تحديد جينات Piwi (أو PIWI ) كبروتينات تنظيمية مسؤولة عن تمايز الخلايا الجذعية والخلايا الجنسية . [ 4 ] Piwi هو اختصار لـ P -element Induced WImpy testis [ a ] في ذبابة الفاكهة . [ 6 ] بروتينات Piwi هي بروتينات محفوظة للغاية ترتبط بالحمض النووي الريبوزي (RNA) وتوجد في كل من النباتات والحيوانات. [ 7 ] تنتمي بروتينات Piwi إلى عائلة Argonaute /Piwi، وقد صُنفت كبروتينات نووية. أشارت الدراسات التي أُجريت على ذبابة الفاكهة أيضًا إلى أن بروتينات Piwi لا تمتلك نشاطًا قاطعًا يُعزى إلى وجود نطاق Piwi. [ 8 ] بالإضافة إلى ذلك، يرتبط Piwi ببروتين الهيتروكروماتين 1 ، وهو مُعدِّل فوق جيني، وتسلسلات مُكمِّلة لـ piRNA. هذه مؤشرات على الدور الذي يلعبه Piwi في التنظيم فوق الجيني. يُعتقد أيضًا أن بروتينات Piwi تتحكم في التكوين الحيوي لـ piRNA حيث أن العديد من البروتينات الشبيهة بـ Piwi تحتوي على نشاط تقطيع يسمح لبروتينات Piwi بمعالجة piRNA السلف إلى piRNA ناضج.

بنية البروتين ووظيفته

تم تحديد بنية العديد من بروتينات Piwi و Argonaute (Ago). بروتينات Piwi هي بروتينات رابطة للحمض النووي الريبوزي (RNA) تتكون من نطاقين أو ثلاثة نطاقات : يرتبط نطاق PAZ الطرفي N بالنهاية 3' للحمض النووي الريبوزي الدليل؛ ويرتبط نطاق MID الأوسط بمجموعة الفوسفات 5' للحمض النووي الريبوزي؛ ويعمل نطاق PIWI الطرفي C كإنزيم نوكلياز داخلي RNase H قادر على قطع الحمض النووي الريبوزي. [ 9 ] [ 10 ] تُعد جزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي (miRNAs) هي شركاء بروتينات Ago من الحمض النووي الريبوزي الصغير . تستخدم بروتينات Ago جزيئات miRNAs لكبت الجينات بعد النسخ، أو تستخدم جزيئات الحمض النووي الريبوزي المتداخلة الصغيرة (siRNAs) في آليات كبت الجينات أثناء النسخ وبعده. تتفاعل بروتينات Piwi مع جزيئات piRNAs (28-33 نيوكليوتيدًا) الأطول من جزيئات miRNAs و siRNAs (حوالي 20 نيوكليوتيدًا)، مما يشير إلى أن وظائفها تختلف عن وظائف بروتينات Ago. [ 9 ]

بروتينات بيوي البشرية

يوجد حاليًا أربعة بروتينات بشرية معروفة تُسمى بروتين Piwi، وهي: بروتين PIWI-like 1، وبروتين PIWI-like 2، وبروتين PIWI-like 3، وبروتين PIWI-like 4. تحتوي جميع بروتينات Piwi البشرية على نطاقين لربط الحمض النووي الريبوزي (RNA)، هما PAZ وPiwi. تتميز بروتينات PIWI-like الأربعة بموقع ربط واسع ضمن نطاق PAZ، مما يسمح لها بالارتباط بمجموعة 2'-OCH3 الضخمة الموجودة في الطرف 3' من الحمض النووي الريبوزي (RNA) المتفاعل مع بروتين Piwi . [ 11 ]

أحد النظائر البشرية الرئيسية ، والذي يُعتقد أن زيادة التعبير عنه متورطة في تكوين أورام مثل الأورام المنوية ، يُطلق عليه اسم hiwi ( اختصارًا لـ h human p iwi ). [ 12 ]

وقد أطلق على البروتينات المتماثلة في الفئران اسم miwi (اختصارًا لـ mouse piwi ) . [ 13 ]

دورها في الخلايا الجرثومية

تؤدي بروتينات PIWI دورًا حاسمًا في الخصوبة ونمو الخلايا الجنسية لدى الحيوانات والهدبيات. وقد تم مؤخرًا تحديدها كمكون من مكونات الحبيبات القطبية، ويبدو أن بروتينات PIWI تتحكم في تكوين الخلايا الجنسية بشكل كبير، لدرجة أنه في غيابها يحدث انخفاض ملحوظ في تكوين هذه الخلايا. وقد لوحظت نتائج مماثلة مع نظائر PIWI في الفئران، وهي MILI وMIWI وMIWI2. ومن المعروف أن هذه النظائر موجودة في عملية تكوين الحيوانات المنوية. يُعبر عن بروتين Miwi في مراحل مختلفة من تكوين الخلايا المنوية الأولية واستطالة الخلايا المنوية، بينما يُعبر عن بروتين Miwi2 في خلايا سيرتولي . وقد عانت الفئران التي تفتقر إما إلى بروتين Mili أو Miwi-2 من توقف نمو الخلايا الجذعية المنوية، بينما عانت الفئران التي تفتقر إلى بروتين Miwi-2 من تدهور في الخلايا المنوية الأولية. [ 14 ] ويبدو أن تأثيرات بروتينات PIWI في الخلايا الجنسية لدى الإنسان والفأر تنبع من مشاركتها في تنظيم الترجمة، حيث من المعروف أن بروتين PIWI والحمض النووي الريبوزي الصغير غير المشفر، المعروف باسم الحمض النووي الريبوزي المتفاعل مع PIWI (piRNA)، يتشاركان في تجزئة عديدات الريبوسومات. يحفز مسار piwi-piRNA أيضًا تكوين الكروماتين المغاير في السنتروميرات ، [ 15 ] مما يؤثر على عملية النسخ. ويبدو أن هذا المسار يحمي الجينوم أيضًا. وقد لوحظ لأول مرة في ذبابة الفاكهة، حيث أدت مسارات piwi-piRNA الطافرة إلى زيادة مباشرة في انقطاعات الحمض النووي المزدوج في الخلايا الجرثومية المبيضية. وقد يكون دور مسار piwi-piRNA في إسكات العناصر المتحركة مسؤولاً عن انخفاض انقطاعات الحمض النووي المزدوج في الخلايا الجرثومية.

دورها في تداخل الحمض النووي الريبوزي

يُعد نطاق بيوي [ 16 ] نطاقًا بروتينيًا موجودًا في بروتينات بيوي وعدد كبير من البروتينات المرتبطة بالأحماض النووية ، وخاصة تلك التي ترتبط بالحمض النووي الريبي (RNA) وتقطعه . وتتمثل وظيفة هذا النطاق في التحلل المائي للحمض النووي الريبي أحادي السلسلة، الموجه بواسطة الحمض النووي الريبي ثنائي السلسلة، وقد تم تحديد هذه الوظيفة في عائلة بروتينات أرجونوت [ 1 ] . تُعد بروتينات أرجونوت، وهي أكثر عائلات البروتينات المرتبطة بالأحماض النووية دراسةً، إنزيمات شبيهة بـ RNase H ، وتؤدي الوظائف التحفيزية لمركب إسكات الحمض النووي الريبي المُحفز (RISC). في عملية التداخل الريبي الخلوية المعروفة ، يستطيع بروتين أرجونوت في مركب RISC الارتباط بكل من الحمض النووي الريبي المتداخل الصغير (siRNA) المُنتج من الحمض النووي الريبي ثنائي السلسلة الخارجي ، والحمض النووي الريبي الميكروي (miRNA) المُنتج من الحمض النووي الريبي غير المشفر الداخلي ، وكلاهما يُنتج بواسطة إنزيم الريبونيوكلياز دايسر ، لتكوين مركب RNA-RISC. يرتبط هذا المركب بالحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) ذي القواعد المزدوجة المتكاملة ويقطعه ، مما يؤدي إلى تدميره ومنع ترجمته إلى بروتين. تحتوي نطاقات بروتين بيوي المتبلورة على موقع ارتباط قاعدي محفوظ للطرف 5' من الحمض النووي الريبوزي المرتبط؛ وفي حالة بروتينات الأرجونوت التي ترتبط بخيوط الحمض النووي الريبوزي المتداخل الصغير (siRNA)، يتم تثبيت آخر قاعدة نيوكليوتيدية غير مزدوجة في الحمض النووي الريبوزي المتداخل الصغير أيضًا عن طريق تكديس القواعد - تفاعلات بين القاعدة وبقايا التيروسين المجاورة . [ 17 ]

تشير الأدلة الحديثة إلى أن الدور الوظيفي لبروتينات بيوي في تحديد الخلايا الجنسية يعود إلى قدرتها على التفاعل مع الحمض النووي الريبوزي الميكروي (miRNA). ويبدو أن مكونات مسار الحمض النووي الريبوزي الميكروي موجودة في بلازما القطب، وتلعب دورًا رئيسيًا في التطور المبكر وتكوين الشكل في أجنة ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر) ، حيث دُرست عملية الحفاظ على الخلايا الجنسية على نطاق واسع. [ 18 ]

piRNAs وإسكات العناصر المتحركة

تم تحديد فئة جديدة من جزيئات miRNA الأطول من المتوسط، تُعرف باسم جزيئات RNA المتفاعلة مع بروتين Piwi (piRNAs)، في خلايا الثدييات ، ويبلغ طولها حوالي 26-31 نيوكليوتيدًا مقارنةً بجزيئات miRNA أو siRNA الأكثر شيوعًا التي يبلغ طولها حوالي 21 نيوكليوتيدًا. تُعبر هذه الجزيئات بشكل رئيسي في الخلايا المنوية في خصيتي الثدييات. [ 19 ] لكن الدراسات أشارت إلى إمكانية وجود تعبير عن piRNA في الخلايا الجسدية المبيضية والخلايا العصبية في اللافقاريات، بالإضافة إلى العديد من الخلايا الجسدية الأخرى في الثدييات. تم تحديد piRNAs في جينومات الفئران والجرذان والبشر ، مع تنظيم جينومي "متكتل" غير عادي [ 20 ] قد ينشأ من مناطق متكررة في الجينوم مثل العناصر المتحركة الرجعية أو المناطق المنظمة عادةً في الكروماتين المغاير ، والتي تُشتق عادةً حصريًا من السلسلة المضادة للحمض النووي الريبي ثنائي السلسلة. [ 21 ] وبناءً على ذلك، تم تصنيف piRNAs على أنها جزيئات RNA صغيرة متداخلة مرتبطة بالتكرار ( rasiRNAs ). [ 22 ]

على الرغم من أن عملية تكوينها الحيوي لم تُفهم جيدًا بعد، يُعتقد أن جزيئات piRNA وبروتينات Piwi تُشكل نظامًا داخليًا لكبح التعبير عن العناصر الوراثية الأنانية مثل العناصر المتنقلة الرجعية، وبالتالي منع منتجات الجينات لهذه التسلسلات من التدخل في تكوين الخلايا الجنسية. [ 21 ] [ 23 ]

الحواشي

  1. كلمة "Wimpy" نفسها مشتقة منلون العيون الأبيض" و"العجز الجنسي " [أو العقم الشديد]. أُضيفت الياء كلاحقة لتكوين كلمة أكثر سهولة في النطق وأكثر ترابطًا. [ 5 ]

مراجع

  1. 1 2 ريفاس إف في، توليا إن إتش، سونغ جي جي، وآخرون  . (أبريل 2005). “Argonaute2 المنقى و siRNA يشكلان RISC البشري المؤتلف”. نات. هيكل. مول. بيول . 12 (4): 340-9 . دوى : 10.1038/nsmb918 . بميد 15800637 . S2CID 2021813 .  
  2. " Uniprot: قاعدة البيانات المعرفية العالمية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (D1): D158– D169. 2017. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . PMC 5210571. PMID 27899622 .  
  3. ليندسي ك (2013). "Piwi-RNAs، حماة الجينوم" . Bio-Synthesis, Inc.
  4. كوكس دي إن، تشاو إيه، لين إتش (2000). "يشفر جين piwi عاملًا نوويًا بلازميًا ينظم نشاطه عدد الخلايا الجذعية الجرثومية ومعدل انقسامها". التطور . 127 (3): 503-14 . doi : 10.1242/dev.127.3.503 . PMID 10631171 . 
  5. روس آر جيه، وينر إم إم، لين إتش (2014). "بروتينات PIWI وRNA المتفاعلة مع PIWI في جسم الخلية" . نيتشر . 505 ( 7483): 353-359 . Bibcode : 2014Natur.505..353R . doi : 10.1038/nature12987 . PMC 4265809. PMID 24429634 .  
  6. لين هـ، سبرادلينغ أ.س. (1997). "مجموعة جديدة من طفرات بوميليو تؤثر على الانقسام غير المتماثل للخلايا الجذعية الجرثومية في مبيض ذبابة الفاكهة". التطور . 124 (12): 2463-2476 . doi : 10.1242/dev.124.12.2463 . PMID 9199372 . 
  7. كوكس دي إن، تشاو إيه، بيكر جيه، تشانغ إل، تشياو دي، لين إتش (1998). " فئة جديدة من الجينات المحفوظة تطوريًا والمحددة بواسطة بروتين بيوي ضرورية للتجديد الذاتي للخلايا الجذعية" . جينز ديف . 12 (23): 3715-27 . doi : 10.1101/gad.12.23.3715 . PMC 317255. PMID 9851978 .  
  8. داريكارير ن، ليو ن، واتانابي ت، لين هـ (2013). "وظيفة بروتين Piwi، وهو بروتين نووي من عائلة Piwi/Argonaute، مستقلة عن نشاطه في تقطيع البروتينات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 110 (6): 1297-1302 . Bibcode : 2013PNAS..110.1297D . doi : 10.1073/pnas.1213283110 . PMC 3557079. PMID 23297219 .  
  9. 1 2 زينغ، لي؛ تشانغ، تشيانغ؛ يان، كيلي؛ تشو، مينغ مينغ (2011-06-01). "رؤى هيكلية حول تعرف نطاق PAZ الشبيه بـ PIWI-1 البشري على piRNA" . البروتينات : التركيب، الوظيفة، والمعلوماتية الحيوية . 79 (6): 2004-2009 . doi : 10.1002/prot.23003 . ISSN 1097-0134 . PMC 3092821. PMID 21465557 .   
  10. وي، كاي-فا؛ وو، لينغ-جوان؛ تشين، جوان؛ تشين، يان-فينغ؛ شي، داو-شين (أغسطس 2012). "تحليلات التطور البنيوي والتنوع الوظيفي لبروتين الأرجونوت". مجلة الكيمياء الحيوية الخلوية . 113 (8): 2576-2585 . doi : 10.1002/jcb.24133 . ISSN 1097-4644 . PMID 22415963. S2CID 25990631 .   
  11. تيان واي، سيمانشو دي، ما جيه، باتيل دي (2010). "الأساس البنيوي للتعرف على الطرف 3' المُعدَّل بمجموعة ميثيل 2'-O لجزيئات piRNA بواسطة نطاقات Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille)" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 108 (3): 903-910 . doi : 10.1073/pnas.1017762108 . PMC 3024652. PMID 21193640 .  
  12. كياو د، زيمان أ.م، دينغ و، لويينغا ل.هـ، لين هـ (2002). "التوصيف الجزيئي لجين hiwi، وهو عضو بشري من عائلة جينات piwi، ويرتبط فرط التعبير عنه بأورام الخلايا المنوية" . مجلة Oncogene . 21 (25): 3988-99 . doi : 10.1038/sj.onc.1205505 . PMID 12037681 . 
  13. دينغ و، لين هـ (2002). "miwi، وهو نظير فأري لـ piwi، يشفر بروتينًا سيتوبلازميًا أساسيًا لتكوين الحيوانات المنوية" . خلية التطور . 2 (6): 819-30 . doi : 10.1016/s1534-5807(02)00165-x . PMID 12062093 . 
  14. ماني إس، جوليانو سي (2013). "فك تشابك الشبكة: الوظائف المتنوعة لمسار PIWI/piRNA" . مجلة التكاثر والتطور الجزيئي . 80 (8): 632-664 . doi : 10.1002 / mrd.22195 . PMC 4234069. PMID 23712694 .  
  15. تومسون تي، لين إتش (2009). " التكوين الحيوي ووظيفة بروتينات PIWI وpiRNAs: التقدم والتوقعات" . المجلة السنوية لعلم الأحياء الخلوي والتطوري . 25 : 355-376 . doi : 10.1146/annurev.cellbio.24.110707.175327 . PMC 2780330. PMID 19575643 .  
  16. سيروتي إل، ميان إن، باتمان إيه (أكتوبر 2000). "المجالات في بروتينات إسكات الجينات وتمايز الخلايا: مجال PAZ الجديد وإعادة تعريف مجال Piwi". مجلة Trends in Biochemical Sciences ، 25 (10): 481-482 . doi : 10.1016/S0968-0004(00)01641-8 . PMID 11050429 . 
  17. ما جيه، يوان واي، مايستر جي، باي واي، توشل تي، باتيل دي (2005). "الأساس البنيوي للتعرف النوعي على الطرف 5' من الحمض النووي الريبوزي الدليل بواسطة بروتين Piwi من A. fulgidus" . Nature . 434 ( 7033): 666–70 . Bibcode : 2005Natur.434..666M . doi : 10.1038/nature03514 . PMC 4694588. PMID 15800629 .  
  18. ميغوش إتش بي، كوكس دي إن، كامبل سي، لين إتش (2006). "دور بروتين PIWI وآلية miRNA في تحديد الخلايا الجرثومية في ذبابة الفاكهة" . بيولوجيا حالية . 16 (19): 1884-1894 . Bibcode : 2006CBio...16.1884M . doi : 10.1016/j.cub.2006.08.051 . PMID 16949822. S2CID 6397874 .  
  19. كيم، ف. ن. (2006). "الحمض النووي الريبوزي الصغير أصبح أكبر: الحمض النووي الريبوزي المتفاعل مع بروتين Piwi (piRNAs) في خصيتي الثدييات" . جينز ديف . 20 (15): 1993-1997 . doi : 10.1101/gad.1456106 . PMID 16882976 . 
  20. جيرارد أ، ساشيداناندام ر، هانون جي جي، كارميل إم إيه (2006). "فئة من الحمض النووي الريبوزي الصغير خاصة بالخلايا الجرثومية ترتبط ببروتينات Piwi في الثدييات". نيتشر . 442 ( 7099): 199-202 . Bibcode : 2006Natur.442..199G . doi : 10.1038/nature04917 . PMID 16751776. S2CID 3185036 .  
  21. 1 2 فاجين، في. في.، سيغوفا، أ.، لي، سي.، سيتز، هـ.، غفوزديف، في.، زامور، ب. د. (2006). "مسار مميز للحمض النووي الريبوزي الصغير يُسكت العناصر الوراثية الأنانية في الخلايا الجرثومية". مجلة ساينس . 313 (5785): 320-324 . رمز Bibcode : 2006Sci...313..320V . doi : 10.1126/science.1129333 . PMID 16809489. S2CID 40471466 .  
  22. سايتو ك، نيشيدا ك م، موري ت، كاوامورا ي، ميوشي ك، ناغامي ت، سيومي ه، سيومي م س (2006). " ارتباط محدد لبروتين Piwi مع جزيئات rasiRNA المشتقة من عناصر النسخ العكسي ومناطق الكروماتين المغاير في جينوم ذبابة الفاكهة" . جينز ديف . 20 (16): 2214-2222 . doi : 10.1101/gad.1454806 . PMC 1553205. PMID 16882972 .  
  23. أوزاتا دي إم، جاينتدينوف آي، زوش إيه، فيليب دي، زامور بي دي (2019). "الحمض النووي الريبوزي المتفاعل مع بروتين PIWI: جزيئات صغيرة ذات وظائف كبيرة" (ملف PDF) . مجلة Nature Reviews Genetics . 20 (2): 89-108 . doi : 10.1038/s41576-018-0073-3 . PMID 30446728. S2CID 53565676 .