تكرار رباعي الببتيد

يُعدّ تكرار الببتيد الرباعي ( TPR ) نمطًا بنيويًا . يتكون من تكرار متتالي لـ 34 حمضًا أمينيًا، وهو نمط متكرر في مجموعة واسعة من البروتينات . يوجد هذا النمط في مصفوفات متتالية تتراوح بين 3 و16 نمطًا، ^{[ 1 ]} والتي تُشكّل هياكل داعمة لتسهيل التفاعلات بين البروتينات، وغالبًا ما تُساهم في تجميع مُركّبات بروتينية مُتعددة. عادةً ما تتشابك هذه التكرارات من أزواج الحلزون ألفا لتُشكّل نطاقًا لولبيًا خطيًا واحدًا يُسمى نطاق TPR . تشمل البروتينات التي تحتوي على هذه المجالات الوحدات الفرعية لمركب تعزيز الطور الانفصالي (APC) cdc16 و cdc23 و cdc27 ، والوحدة الفرعية لأكسيداز NADPH p67-phox ، والبروتينات المناعية المرتبطة بـ hsp90 ، وعوامل النسخ ، وبروتين كيناز R (PKR)، والمستقبل الرئيسي لاستيراد بروتين مصفوفة البيروكسيسوم PEX5 ، وبروتين أرجينين ميثيل ترانسفيراز 9 (PRMT9)، وبروتينات الاستيراد الميتوكوندري.

كان تحديد بنية بروتين PP5 أول بنية يتم تحديدها. وقد أظهرت البنية التي تم حلها باستخدام تقنية حيود الأشعة السينية بواسطة داس وزملاؤه أن تسلسل TPR يتكون من زوج من حلزونات ألفا متوازية عكسيًا. ^{[ 2 ]} احتوت بنية PP5 على 3 تكرارات متتالية من TPR، مما يدل على أن تكرارات TPR المتسلسلة تشكل بنية لولبية حلزونية ألفا .

تتميز بنية TPR النموذجية بتفاعلات بين الحلزونين A وB من النمط الأول والحلزون A' من TPR التالي. على الرغم من أن طبيعة هذه التفاعلات قد تختلف، إلا أن الحلزونين الأولين من نمط TPR عادةً ما يكون لهما زاوية تعبئة تبلغ حوالي 24 درجة ضمن نمط واحد. يؤدي تكرار أكثر من ثلاثة أنماط TPR إلى تكوين حلزون فائق يميني يتميز بسطح مقعر وآخر محدب، وعادةً ما يشارك السطح المقعر في ارتباط الليجاند. ^{[ 1 ] [ 3 ]}

من حيث التسلسل، يحتوي بروتين TPR على مزيج من بقايا الأحماض الأمينية الكارهة للماء الصغيرة والكبيرة، ومع ذلك، لا توجد مواقع ثابتة تمامًا. توجد بعض البقايا التي تُحفظ عادةً، بما في ذلك التربتوفان 4، والليوسين 7، والجليسين 8، والتيروسين 11، والألانين 20، والفينيل ألانين 24، والألانين 27، والبرولين 32. من بين هذه البقايا الثمانية، يميل الألانين في المواقع 8 و20 و27 إلى أن يكون أكثر حفظًا. أما المواقع الأخرى، فتميل إلى تفضيل الأحماض الأمينية الصغيرة أو الكبيرة أو العطرية بدلًا من بقايا محددة. بين الحلزونات، يلعب حفظ البقايا دورًا بنيويًا أكبر، حيث توجد بقايا تكسر الحلزون. بين بروتينات TPR المتجاورة، تؤدي البقايا أدوارًا ذات آثار بنيوية ووظيفية. ^{[ 1 ]}

تشمل الجينات البشرية التي تشفر البروتينات التي تحتوي على هذا النمط ما يلي:

• AAG2 ، ANAPC7
• BBS4
• الكابينة 1 ، مركز السيطرة على الأمراض 16 ، مركز السيطرة على الأمراض 23 ، مركز السيطرة على الأمراض 27 ، CNOT10 ، CTR9
• DNAJC3 ، DNAJC7 ، DYX1C1
• FAM10A4 ، FAM10A5 ، FKBP4 ، FKBP5 ، FKBP8 ، FKBPL
• GPSM1 ، GPSM2 ، GTF3C3
• IFIT1 ، IFIT1L ، IFIT2 ، IFIT3 ، IFIT5 ، IFT140 ، IFT88
• KLC1 ، KLC2 ، KLC3 ، KLC4 ، KNS2
• LONRF2
• NARG1 ، NARG1L ، NASP ، NCF2 ، NFKBIL2 ، NOXA1 ، NPHP3
• OGT
• PEX5 ، PEX5L ، PPID ، PPP5C ، PRPF6
• RANBP2 ، RANBP2L2 ، RANBP2L6 ، RAPSN ، RGPD5 ، RGPD7 ، RPAP3
• SGTA ، SGTB ، SH3TC1 ، SH3TC2 ، SPAG1 ، SRP72 ، ST13 ، STIP1 ، STUB1 ، SUGT1
• TMTC1 ، TMTC2 ، TMTC3 ، TMTC4 ، TOMM34 ، TOMM70A
• TTC1 ، TTC3 ، TTC4 ، TTC5 ، TTC6 ، TTC7A ، TTC7B ، TTC8 ، TTC9C ، TTC12 ، TTC13 ، TTC14 ، TTC15 ، TTC16 ، TTC17 ، TTC18 ، TTC21A ، TTC21B ، TTC22 ، TTC24 ، TTC25 ، TTC27 ، TTC28 ، TTC29 ، TTC30A ، TTC30B ، TTC31 ، TTC33 ، TTC37
• UNC45A ، UNC45B ، UTX ، UTY
• WDTC1
• ZC3H7B

• مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة فئة الزخارف LIG_TPR
• مورد النمط الخطي حقيقي النواة فئة النمط TRG_PTS1