بوليميراز الحمض النووي الريبوزي الثاني

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 6 صور
الموسوعة الحرة
وظيفة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني (النسخ). باللون الأخضر: خيط الحمض النووي الريبي الذي تم تصنيعه حديثًا بواسطة الإنزيم

بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني ( RNAP II و Pol II ) هو مركب متعدد البروتينات ينسخ الحمض النووي الريبي إلى سلائف الحمض النووي الريبي الرسول (mRNA) ومعظم الحمض النووي الريبي النووي الصغير (snRNA) والحمض النووي الريبي الصغير . [1] [2] وهو أحد إنزيمات RNAP الثلاثة الموجودة في نواة الخلايا حقيقية النواة . [3] مركب 550 كيلو دالتون من 12 وحدة فرعية، RNAP II هو النوع الأكثر دراسة من بوليميراز الحمض النووي الريبي . هناك حاجة إلى مجموعة واسعة من عوامل النسخ حتى يرتبط بمحفزات الجينات السابقة ويبدأ النسخ.

اكتشاف

بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني لخميرة Saccharomyces cerevisiae يتكون من جميع الوحدات الفرعية الـ 12. [4]

اقترحت الدراسات المبكرة وجود حد أدنى من اثنين من بوليميرات الحمض النووي الريبي: أحدهما يقوم بتصنيع الحمض النووي الريبي الريبوسومي في النوية ، والآخر يقوم بتصنيع الحمض النووي الريبي الآخر في البلازما النووية ، وهو جزء من النواة ولكن خارج النوية. [5] في عام 1969، اكتشف الكيميائيون الحيويون روبرت جي. رودر وويليام روتر أن هناك ما مجموعه ثلاثة بوليميرات نووية RNA مميزة ، وبوليميراز RNAP إضافي كان مسؤولاً عن نسخ نوع ما من الحمض النووي الريبي في البلازما النووية. [6] تم الحصول على النتيجة باستخدام كروماتوغرافيا التبادل الأيوني عبر حبيبات سيفادكس المغلفة بـ DEAE . فصلت التقنية الإنزيمات حسب ترتيب عمليات الإيلوشن المقابلة، Ι، ΙΙ، ΙΙΙ، عن طريق زيادة تركيز كبريتات الأمونيوم. تمت تسمية الإنزيمات وفقًا لترتيب عمليات الإيلوشن، RNAP I ، RNAP II، RNAP IΙI . [3] أظهر هذا الاكتشاف وجود إنزيم إضافي موجود في النواة، مما سمح بالتمييز بين RNAP II وRNAP III. [7]

يخضع بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني (RNAP2) لتوقف نسخي منظم أثناء الاستطالة المبكرة. وقد أظهرت دراسات مختلفة أن تعطيل استطالة النسخ متورط في السرطان والتنكس العصبي وتأخر ظهور فيروس نقص المناعة البشرية وما إلى ذلك [8]

وحدات فرعية

بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني حقيقيات النوى من الخميرة Saccharomyces cerevisiae ، معرف قاعدة بيانات البروتينات [9] الوحدات الفرعية الملونة: RPB3 - برتقالي ، RPB11 - أصفر ، RPB2 - قمح ، RPB1 - أحمر ، RPB6 - وردي ، الوحدات الفرعية السبع المتبقية ملونة باللون الرمادي.

تم تنقية بوليميراز الحمض النووي الريبي الأساسي الحقيقي أولاً باستخدام اختبارات النسخ. [10] يحتوي الإنزيم المنقى عادةً على 10-12 وحدة فرعية (12 في البشر والخميرة) وهو غير قادر على التعرف على المحفز المحدد. [11] من المعروف وجود العديد من التفاعلات بين الوحدات الفرعية. [12]

  • وحدة RPB1 من بوليميراز الحمض النووي الريبي الموجه II - وهو إنزيم يتم ترميزه في البشر بواسطة جين POLR2A وفي الخميرة بواسطة RPO21. RPB1 هي أكبر وحدة فرعية من بوليميراز الحمض النووي الريبي II. تحتوي على مجال طرفي كربوكسي (CTD) يتكون من ما يصل إلى 52 تكرارًا من الببتيد السباعي (YSPTSPS) ضروري لنشاط البوليميراز. [13] تم اكتشاف CTD لأول مرة في مختبر CJ Ingles في جامعة تورنتو ومن قبل JL Corden في جامعة جونز هوبكنز . بالاشتراك مع العديد من وحدات البوليميراز الأخرى، تشكل وحدة RPB1 مجال ربط الحمض النووي للبوليميراز، وهو أخدود يتم فيه نسخ قالب الحمض النووي إلى RNA. [14] تتفاعل بقوة مع RPB8. [12]
  • RPB2 ( POLR2B ) - ثاني أكبر وحدة فرعية والتي عند اتحادها مع وحدتين فرعيتين أخريين على الأقل من البوليميراز تشكل بنية داخل البوليميراز تحافظ على الاتصال في الموقع النشط للإنزيم بين قالب الحمض النووي والحمض النووي الريبي المصنّع حديثًا. [15]
  • RPB3 ( POLR2C ) – ثالث أكبر وحدة فرعية. توجد كثنائي غير متماثل مع وحدة فرعية أخرى من البوليميراز، POLR2J، تشكل مجموعة فرعية أساسية. تتفاعل RPB3 بقوة مع RPB1-5، 7، 10-12. [12]
  • وحدة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثانية B4 (RPB4) - المشفرة بواسطة جين POLR2D [16] هي رابع أكبر وحدة فرعية وقد يكون لها دور وقائي من الإجهاد.
  • RPB5 – يتم ترميزه في البشر بواسطة جين POLR2E . يوجد جزيئان من هذه الوحدة الفرعية في كل بوليميراز RNA II. [17] يتفاعل RPB5 بقوة مع RPB1 وRPB3 وRPB6. [12]
  • RPB6 ( POLR2F ) – يشكل بنية مع وحدتين فرعيتين أخريين على الأقل تعمل على تثبيت بوليميراز النسخ على قالب الحمض النووي. [18]
  • RPB7 – مشفر بواسطة POLR2G وقد يلعب دورًا في تنظيم وظيفة البوليميراز. [19] يتفاعل RPB7 بقوة مع RPB1 وRPB5. [12]
  • RPB8 ( POLR2H ) – يتفاعل مع الوحدات الفرعية RPB1-3 و5 و7 . [12]
  • RPB9 - الأخدود الذي يتم فيه نسخ قالب DNA إلى RNA يتكون من RPB9 ( POLR2I ) وRPB1.
  • RPB10 – منتج الجين POLR2L . يتفاعل مع RPB1-3 و5، ويتفاعل بقوة مع RPB3. [12]
  • RPB11 - تتكون الوحدة الفرعية RPB11 نفسها من ثلاث وحدات فرعية في البشر: POLR2J (RPB11-a)، و POLR2J2 (RPB11-b)، وPOLR2J3 [20] (RPB11-c).
  • RPB12 – يتفاعل أيضًا مع RPB3 وهو RPB12 ( POLR2K ). [12]

حَشد

يشارك RPB3 في تجميع بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني. [21] يظهر مركب فرعي من RPB2 وRPB3 بعد فترة وجيزة من تخليق الوحدة الفرعية. [21] يتفاعل هذا المركب لاحقًا مع RPB1. [21] تتفاعل RPB3 وRPB5 وRPB7 مع نفسها لتكوين ثنائيات متماثلة، ويستطيع RPB3 وRPB5 معًا الاتصال بجميع وحدات RPB الفرعية الأخرى، باستثناء RPB9. [12] يرتبط RPB1 بقوة فقط بـ RPB5. [12] تتصل الوحدة الفرعية RPB1 أيضًا بـ RPB7 وRPB10، وبشكل أضعف ولكن بكفاءة أكبر مع RPB8. [12] بمجرد دخول RPB1 إلى المجمع، يمكن لوحدات فرعية أخرى مثل RPB5 وRPB7 الدخول، حيث يرتبط RPB5 بـ RPB6 وRPB8 ويجلب RPB3 RPB10 وRPB 11 وRPB12. [12] قد يدخل RPB4 وRPB9 بمجرد تجميع معظم المجمع. يشكل RPB4 مجمعًا مع RPB7. [12]

الحركية

يمكن للإنزيمات تحفيز ما يصل إلى عدة ملايين من التفاعلات في الثانية. تعتمد معدلات الإنزيم على ظروف المحلول وتركيز الركيزة. مثل الإنزيمات الأخرى، يحتوي POLR2 على منحنى تشبع وسرعة قصوى ( V max ). لديه Km (تركيز الركيزة المطلوب لنصف V max ) و k cat (عدد جزيئات الركيزة التي يتعامل معها موقع نشط واحد في الثانية). يتم إعطاء ثابت الخصوصية بواسطة k cat / K m . الحد الأقصى النظري لثابت الخصوصية هو حد الانتشار حوالي 10 8 إلى 10 9 ( M −1 s −1 )، حيث يؤدي كل تصادم للإنزيم مع ركيزته إلى تحفيز. في الخميرة، يمكن أن تؤدي الطفرة في مجال Trigger-Loop لأكبر وحدة فرعية إلى تغيير حركية الإنزيم. [22]

يتحول بوليميراز الحمض النووي الريبي البكتيري، وهو قريب من بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني، بين الحالات غير النشطة والنشطة عن طريق الانتقال ذهابًا وإيابًا على طول الحمض النووي. [23] تركيزات [NTP] eq = 10 ميكرومولار GTP و10 ميكرومولار UTP و5 ميكرومولار ATP و2.5 ميكرومولار CTP، تنتج متوسط ​​معدل استطالة، رقم دوران، ~1 bp (NTP) -1 لـ RNAP البكتيري، وهو قريب من بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني. [23]

بوليميراز الحمض النووي الريبوزي الثاني (RNA Polymerase II) الرمادي. تفاعل ألفا-أمانيتين (أحمر).

يخضع بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني لتوقف مشترك في النسخ أثناء استطالة النسخ. [24] [25] هذا التوقف واضح بشكل خاص في النيوكليوسومات، وينشأ جزئيًا من خلال دخول البوليميراز في حالة تراجع غير كفؤة نسخيًا. [24] تتراوح مدة هذه التوقفات من ثوانٍ إلى دقائق أو أكثر، ويمكن تعزيز الخروج من التوقفات الطويلة الأمد من خلال عوامل الاستطالة مثل TFIIS. [26] بدوره، يؤثر معدل النسخ على ما إذا كانت الهستونات في النيوكليوسومات المنسوخة يتم إخراجها من الكروماتين، أو إعادة إدخالها خلف البوليميراز النسخي. [27]

ألفا أمانيتين

يتم تثبيط بوليميراز الحمض النووي الريبي II بواسطة ألفا أمانيتين [28] والأماتوكسينات الأخرى . ألفا أمانيتين مادة شديدة السمية توجد في العديد من الفطريات. [5] لسم الفطر تأثيرات مختلفة على كل من بوليميراز الحمض النووي الريبي: الأول والثاني والثالث. لا يستجيب RNAP I تمامًا للمادة وسيعمل بشكل طبيعي بينما يتمتع RNAP III بحساسية معتدلة. ومع ذلك، يتم تثبيط RNAP II تمامًا بواسطة السم. يثبط ألفا أمانيتين RNAP II من خلال تفاعلات قوية في "قمع" الإنزيم و"الشق" ومناطق "الجسر الحلزوني ألفا " الرئيسية لوحدة RPB-1. [29]

الهولوإنزيم

إن إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي II هو شكل من أشكال إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي II في حقيقيات النوى والذي يتم تجنيده لمحفزات الجينات المشفرة للبروتين في الخلايا الحية. [11] وهو يتكون من إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي II، ومجموعة فرعية من عوامل النسخ العامة ، والبروتينات التنظيمية المعروفة باسم بروتينات SRB.

يُشار إلى جزء من تجميع الهولوإنزيم باسم مجمع ما قبل البدء ، لأن تجميعه يحدث على مُحفِّز الجين قبل بدء النسخ . يعمل مجمع الوسيط كجسر بين بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني وعوامل النسخ.

التحكم عن طريق بنية الكروماتين

هذا مخطط لآلية نموذجية لخلايا الخميرة والتي من خلالها يساعد هيكل الكروماتين وتعديل الهيستون بعد الترجمة في تنظيم وتسجيل نسخ الجينات بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني .

يقدم هذا المسار أمثلة على التنظيم في نقاط النسخ التالية:

  • ما قبل البدء (الترويج بواسطة Bre1، تعديل الهيستون)
  • البدء (الترويج بواسطة TFIIH، تعديل Pol II والترويج بواسطة COMPASS، تعديل الهيستون)
  • الاستطالة (الترويج بواسطة Set2، تعديل الهيستون)

يشير هذا إلى مراحل مختلفة من العملية باعتبارها خطوات تنظيمية. ولم يثبت استخدام هذه الخطوات للتنظيم، ولكن من المرجح جدًا أن يكون ذلك صحيحًا.

يمكن تلخيص محفزات استطالة RNA Pol II في 3 فئات.

  1. العوامل المؤثرة على الاعتقال والتي تعتمد على الدواء/التسلسل (البروتينات المتداخلة المختلفة)
  2. العوامل الموجهة لبنية الكروماتين (معدلات ما بعد النسخ للهيستون، على سبيل المثال، ميثيل ترانسفيرازات الهيستون)
  3. عوامل تحسين تحفيز RNA Pol II (مختلف البروتينات المتداخلة وعوامل مساعدة Pol II؛ انظر RNA polymerase II).

آليات النسخ

  • العوامل الموجهة لبنية الكروماتين:
    (HMTs ( H istone Methyl Transferases )):
    COMPASS§† – ( مجمع COM من بروتينات AS المرتبطة بـ S et1) – ميثيلات الليسين 4 من الهيستون H3: مسؤولة عن قمع/إسكات النسخ. جزء طبيعي من نمو الخلايا وتنظيم النسخ داخل RNAP II. [30]
  • Set2 – ميثيلات الليسين 36 من الهستون H3: يشارك Set2 في تنظيم استطالة النسخ من خلال اتصاله المباشر مع CTD. [31]
    (مثال غير ذي صلة ومثير للاهتمام: Dot1*‡ – ميثيلات الليسين 79 من الهستون H3.)
  • Bre1 – يوبيكويتين (يضيف يوبيكويتين إلى) الليسين 123 من الهستون H2B. يرتبط بالبدء المسبق ويسمح بربط RNA Pol II.

المجال الطرفي C

يتم إلحاق الطرف الطرفي C لـ RPB1 لتشكيل المجال الطرفي C (CTD). يتكون المجال الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي II عادةً من ما يصل إلى 52 تكرارًا من التسلسل Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser. [32] يمتد المجال من قلب إنزيم RNAPII إلى قناة الخروج، وهذا التموضع فعال بسبب تحريضه "لتفاعلات معالجة الحمض النووي الريبي، من خلال التفاعلات المباشرة أو غير المباشرة مع مكونات آلية معالجة الحمض النووي الريبي". [33] لا يوجد مجال CTD في بوليميراز الحمض النووي الريبي I أو بوليميراز الحمض النووي الريبي III. [3] تم اكتشاف بوليميراز الحمض النووي الريبي CTD لأول مرة في مختبر CJ Ingles في جامعة تورنتو وأيضًا في مختبر J Corden في جامعة جونز هوبكنز أثناء عمليات تسلسل الحمض النووي المشفر لوحدة RPB1 من بوليميراز الحمض النووي الريبي من الخميرة والفئران على التوالي. غالبًا ما ترتبط بروتينات أخرى بالمجال الطرفي C لبوليميراز الحمض النووي الريبي من أجل تنشيط نشاط البوليميراز. إن المجال البروتيني هو الذي يشارك في بدء النسخ، وتغطية نسخة الحمض النووي الريبي ، والارتباط بالوصلة من أجل ربط الحمض النووي الريبي . [13]

فسفرة CTD

يوجد بوليميراز الحمض النووي الريبي II في شكلين غير مفسفر ومفسفر، IIA وIIO على التوالي. [5] [3] يسهل الانتقال بين الشكلين وظائف مختلفة للنسخ. يتم تحفيز فسفرة CTD بواسطة أحد عوامل النسخ العامة الستة ، TFIIH . يخدم TFIIH غرضين: أحدهما فك الحمض النووي في موقع بدء النسخ والآخر هو الفسفرة. ينضم بوليميراز الشكل IIA إلى مجمع ما قبل البدء، ويُقترح هذا لأن IIA يرتبط بألفة أعلى مع TBP ( بروتين ربط صندوق TATA )، الوحدة الفرعية لعامل النسخ العام TFIID ، من شكل بوليميراز IIO. يسهل بوليميراز الشكل IIO استطالة سلسلة الحمض النووي الريبي. [5] تتم طريقة بدء الاستطالة عن طريق فسفرة السيرين في الموضع 5 (Ser5)، عبر TFIIH. يقوم Ser5 المفسفر حديثًا بتجنيد الإنزيمات لتغطية نهاية 5' من RNA المُصنَّع حديثًا و"عوامل المعالجة 3' لمواقع poly(A) ". [33] بمجرد فسفرة السيرين الثاني، Ser2، يتم تنشيط الاستطالة. لإنهاء الاستطالة، يجب أن يحدث إزالة الفسفرة. بمجرد إزالة الفسفرة من المجال تمامًا، يتم "إعادة تدوير" إنزيم RNAP II ويحفز نفس العملية مع موقع بدء آخر. [33]

إصلاح إعادة التركيب المقترن بالنسخ

قد يؤدي تلف الحمض النووي التأكسدي إلى منع نسخ بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني ويسبب كسر الخيوط. وقد تم وصف عملية إعادة التركيب المرتبطة بالنسخ القالبي للحمض النووي الريبي والتي يمكن أن تحمي من تلف الحمض النووي. [34] أثناء مراحل G1/G0 من دورة الخلية ، تظهر الخلايا تجميعًا لعوامل إعادة التركيب المتجانسة عند كسر الخيوط المزدوجة داخل المناطق التي يتم نسخها بنشاط. ويبدو أن النسخ يقترن بإصلاح كسر الخيوط المزدوجة للحمض النووي عن طريق إعادة التركيب المتجانس القالبي للحمض النووي الريبي. تعيد عملية الإصلاح هذه بكفاءة ودقة ربط كسر الخيوط المزدوجة في الجينات التي يتم نسخها بنشاط بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني.

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ Kornberg RD (ديسمبر 1999). "التحكم النسخي في حقيقيات النوى". الاتجاهات في علم الأحياء الخلوية . 9 (12): M46–9. doi : 10.1016/S0962-8924(99)01679-7 . PMID  10611681.
  2. ^ Sims RJ, Mandal SS, Reinberg D (يونيو 2004). "أبرز ما توصل إليه علم النسخ بوساطة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني". الرأي الحالي في علم الأحياء الخلوي . 16 (3): 263–71. doi : 10.1016/j.ceb.2004.04.004 . PMID  15145350.
  3. ^ abcd Young, Richard A. (2003-11-28). "RNA Polymerase II". Annual Review of Biochemistry . 60 (1): 689–715. doi :10.1146/annurev.bi.60.070191.003353. PMID  1883205.
  4. ^ ماير با، يي ب، تشانغ م، سو م ه، فو ج (يونيو 2006). "تقسيم بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني باستخدام ذرات الزنك المرتبطة جوهريًا: نموذج هيكلي محدث". هيكل . 14 (6): 973-82. doi : 10.1016/j.str.2006.04.003 . PMID  16765890.
  5. ^ abcd Weaver, Robert Franklin (2012-01-01). علم الأحياء الجزيئي . McGraw-Hill. ISBN 9780073525327. OCLC  789601172.
  6. ^ Roeder RG, Rutter WJ (أكتوبر 1969). "أشكال متعددة من بوليميراز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي في الكائنات حقيقية النواة". مجلة الطبيعة . 224 (5216): 234–7. رمز Bibcode :1969Natur.224..234R. doi :10.1038/224234a0. PMID  5344598. S2CID  4283528.
  7. ^ Roeder RG, Rutter WJ (أكتوبر 1969). "أشكال متعددة من بوليميراز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي في الكائنات حقيقية النواة". مجلة الطبيعة . 224 (5216): 234–7. رمز Bibcode :1969Natur.224..234R. doi :10.1038/224234a0. PMID  5344598. S2CID  4283528.
  8. ^ Cermakova, Katerina; Demeulemeester, Jonas; Lux, Vanda; Nedomova, Monika; Goldman, Seth R.; Smith, Eric A.; Srb, Pavel; Hexnerova, Rozalie; Fabry, Milan; Madlikova, Marcela; Horejsi, Magdalena (2021-11-26). "وحدة تفاعل بروتيني مضطربة في كل مكان تنظم استطالة النسخ". Science . 374 (6571): 1113–1121. Bibcode :2021Sci...374.1113C. doi :10.1126/science.abe2913. PMC 8943916. PMID 34822292.  S2CID 244660781  . 
  9. ^ Armache, Karim-Jean; Mitterweger, Simone; Meinhart, Anton; Cramer, Patrick (2019). "هياكل بوليميراز الحمض النووي الريبي الكامل II ومجمعه الفرعي، Rpb4/7" (PDF) . مجلة الكيمياء الحيوية . 280 (8): 7131–1734. doi :10.2210/pdb1wcm/pdb. PMID  15591044.
  10. ^ Sawadogo M, Sentenac A (1990). "RNA polymerase B (II) and general transcription factors". Annual Review of Biochemistry . 59 : 711–54. doi :10.1146/annurev.bi.59.070190.003431. PMID  2197989.
  11. ^ ab Myer VE, Young RA (أكتوبر 1998). "هولو إنزيمات ومركبات فرعية لبوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني". مجلة الكيمياء الحيوية . 273 (43): 27757–60. doi : 10.1074/jbc.273.43.27757 . PMID  9774381.
  12. ^ abcdefghijklm Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (يوليو 1997). "التفاعلات بين وحدات بوليميراز الحمض النووي الريبي البشري II". مجلة الكيمياء الحيوية . 272 ​​(27): 16815-21. doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . PMID  9201987.
  13. ^ ab Brickey WJ, Greenleaf AL (يونيو 1995). "دراسات وظيفية لنطاق التكرار الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني في ذبابة الفاكهة في الجسم الحي". علم الوراثة . 140 (2): 599-613. doi :10.1093/genetics/140.2.599. PMC 1206638. PMID  7498740 . 
  14. ^ "جين إنتريز: بولي ببتيد بوليميراز POLR2A (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) A، 220 كيلو دالتون".
  15. ^ "جين إنتريز: بولي ببتيد بوليميراز POLR2B (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) B، 140 كيلو دالتون".
  16. ^ Khazak V, Estojak J, Cho H, Majors J, Sonoda G, Testa JR, Golemis EA (أبريل 1998). "تحليل تفاعل وحدة بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني الجديدة (pol II) hsRPB4 مع شريكتها hsRPB7 ومع pol II". علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 18 (4): 1935-1945. doi :10.1128/mcb.18.4.1935. PMC 121423. PMID  9528765 . 
  17. ^ "جين إنتريز: بولي ببتيد بوليميراز POLR2E (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) E، 25 كيلو دالتون".
  18. ^ "جين إنتريز: بولي ببتيد بوليميراز POLR2F (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) F".
  19. ^ "جين إنتريز: بولي ببتيد بوليميراز POLR2G (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) G".
  20. ^ "بولي ببتيد بوليميراز POLR2J3 (RNA) II (الموجه بالحمض النووي) J3".
  21. ^ abc Kolodziej PA, Young RA (سبتمبر 1991). "الطفرات في أكبر ثلاث وحدات فرعية من بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني في الخميرة والتي تؤثر على تجميع الإنزيم". علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 11 (9): 4669–78. doi :10.1128/mcb.11.9.4669. PMC 361357. PMID  1715023 . 
  22. ^ كابلان سي دي، جين هـ، تشانغ آي إل، بيليانين أ (12 أبريل 2012). "تشريح وظيفة حلقة الزناد لـ بول 2 والتحكم المعتمد على نشاط بول 2 في اختيار موقع البدء في الجسم الحي". PLOS Genetics . 8 (4): e1002627. doi : 10.1371/journal.pgen.1002627 . PMC 3325174. PMID  22511879 . 
  23. ^ abbondanzieri EA, Greenleaf WJ, Shaevitz JW, Landick R, Block SM (نوفمبر 2005). "الملاحظة المباشرة لخطوات أزواج القواعد بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي". مجلة الطبيعة . 438 (7067): 460–5. رمز Bibcode :2005Natur.438..460A. doi :10.1038/nature04268. PMC 1356566. PMID  16284617 . 
  24. ^ ab Hodges, Courtney; Bintu, Lacramioara; Lubkowska, Lucyna; Kashlev, Mikhail; Bustamante, Carlos (2009-07-31). "تقلبات النواة تحكم ديناميكيات النسخ لبوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني". Science . 325 (5940): 626–628. Bibcode :2009Sci...325..626H. doi :10.1126/science.1172926. ISSN  1095-9203. PMC 2775800. PMID 19644123  . 
  25. ^ Churchman, L. Stirling; Weissman, Jonathan S. (2011-01-20). "تسلسل النسخ الوليدة يصور النسخ بدقة النوكليوتيدات". Nature . 469 (7330): 368–373. Bibcode :2011Natur.469..368C. doi :10.1038/nature09652. ISSN  1476-4687. PMC 3880149. PMID 21248844  . 
  26. ^ Galburt, Eric A.; Grill, Stephan W.; Wiedmann, Anna; Lubkowska, Lucyna; Choy, Jason; Nogales, Eva; Kashlev, Mikhail; Bustamante, Carlos (2007-04-12). "التتبع العكسي يحدد حساسية القوة لـ RNAP II بطريقة تعتمد على العوامل". Nature . 446 (7137): 820–823. Bibcode :2007Natur.446..820G. doi :10.1038/nature05701. ISSN  1476-4687. PMID  17361130. S2CID  4310108.
  27. ^ Bintu, Lacramioara; Kopaczynska, Marta; Hodges, Courtney; Lubkowska, Lucyna; Kashlev, Mikhail; Bustamante, Carlos (2011-11-13). "معدل استطالة بوليميراز الحمض النووي الريبي يحدد مصير النيوكليوزومات المنقولة". Nature Structural & Molecular Biology . 18 (12): 1394–1399. doi :10.1038/nsmb.2164. ISSN  1545-9985. PMC 3279329. PMID 22081017  . 
  28. ^ كابلان سي دي، لارسون كيه إم، كورنبرج آر دي (يونيو 2008). "تعمل حلقة تحفيز بوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني في اختيار الركيزة وتستهدفها ألفا أمانيتين بشكل مباشر". الخلية الجزيئية . 30 (5): 547–56. doi :10.1016/j.molcel.2008.04.023. PMC 2475549. PMID  18538653 . 
  29. ^ Gong, Xue Q.; Nedialkov, Yuri A.; Burton, Zachary F. (2004-06-25). "α-Amanitin Blocks Translocation by Human RNA Polymerase II". مجلة الكيمياء الحيوية . 279 (26): 27422–27427. doi : 10.1074/jbc.M402163200 . ISSN  0021-9258. PMID  15096519.
  30. ^ Briggs, Scott D.; Bryk, Mary; Strahl, Brian D.; Cheung, Wang L.; Davie, Judith K.; Dent, Sharon YR; Winston, Fred; Allis, C. David (2001-12-15). "يتم وساطة مثيلة الليسين 4 في هيستون H3 بواسطة Set1 وهي مطلوبة لنمو الخلايا وإسكات الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين في خميرة Saccharomyces cerevisiae". Genes & Development . 15 (24): 3286–3295. doi :10.1101/gad.940201. ISSN  0890-9369. PMC 312847. PMID 11751634  . 
  31. ^ لي، بينج؛ هاو، لين؛ أندرسون، سكوت؛ ييتس، جون ر؛ ووركمان، جيري ل. (2003-03-14). "تعمل ميثيل ترانسفيراز هيستون سيت2 من خلال المجال الطرفي الكربوكسيلي الفوسفوري لبوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني". مجلة الكيمياء الحيوية . 278 (11): 8897-8903. doi : 10.1074/jbc.M212134200 . ISSN  0021-9258. PMID  12511561.
  32. ^ Meinhart A, Cramer P (يوليو 2004). "التعرف على المجال الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي الثاني بواسطة عوامل معالجة الحمض النووي الريبي 3'". مجلة الطبيعة . 430 (6996): 223–6. رمز Bibcode :2004Natur.430..223M. doi :10.1038/nature02679. hdl : 11858/00-001M-0000-0015-8512-8 . PMID  15241417. S2CID  4418258.
  33. ^ abc Egloff, Sylvain; Murphy, Shona (2008). "كسر شفرة RNA polymerase II CTD". Trends in Genetics . 24 (6): 280–288. doi :10.1016/j.tig.2008.03.008. PMID  18457900.
  34. ^ Wei L, Levine AS, Lan L (2016). "Transcription-coupled homologous recombination after oxidative damage". DNA Repair (Amst.) . 44 : 76–80. doi :10.1016/j.dnarep.2016.05.009. PMID  27233112.
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RNA_polymerase_II&oldid=1220069565"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate