إنزيم ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل

إنزيم ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز (أو ثنائي هيدروليبواميد أسيتيل ترانسفيراز ) هو أحد مكونات مركب بيروفات ديهيدروجينيز متعدد الإنزيمات . يُعد مركب بيروفات ديهيدروجينيز مسؤولاً عن خطوة إزالة الكربوكسيل من البيروفات ، والتي تربط عملية تحلل الجلوكوز بدورة حمض الستريك . تتضمن هذه العملية تحويل البيروفات الناتج عن تحلل الجلوكوز إلى أسيتيل مرافق الإنزيم-أ، والذي يُستخدم بدوره في دورة حمض الستريك لإجراء التنفس الخلوي .

يحتوي مُركّب نازعة هيدروجين البيروفات على ثلاثة مُكوّنات إنزيمية مُختلفة. نازعة هيدروجين البيروفات (EC 1.2.4.1) مسؤولة عن أكسدة البيروفات، بينما ينقل إنزيم ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز (هذا الإنزيم؛ EC 2.3.1.12) مجموعة الأسيتيل إلى مرافق الإنزيم أ (CoA)، ويُعيد إنزيم ثنائي هيدروليبويل نازعة هيدروجين البيروفات (EC 1.8.1.4) تكوين الليبوأميد. ولأن إنزيم ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز هو المُكوّن الإنزيمي الثاني من بين المُكوّنات الثلاثة المُشاركة في آلية تفاعل تحويل البيروفات إلى أسيتيل مرافق الإنزيم أ، يُشار إليه أحيانًا بالرمز E2.

في البشر، يكمن النشاط الإنزيمي لـ dihydrolipoyl transacetylase في المكون E2 من مركب نازعة هيدروجين البيروفات (PDCE2) الذي يتم ترميزه بواسطة جين DLAT ( dihydro lipoamide S- acetyl t transferase ) . [ 5 ]

التسمية

الاسم النظامي لهذه الفئة من الإنزيمات هو أسيتيل-CoA: إنزيم N6-(ديهيدروليبويل)ليسين S-أسيتيل ترانسفيراز.

ومن الأسماء الأخرى الشائعة الاستخدام ما يلي:

  • أسيتيل-CoA: ثنائي هيدروليبواميد S-أسيتيل ترانسفيراز،
  • أسيتيل-CoA: إنزيم 6-N-(ثنائي هيدروليبويل) ليسين S-أسيتيل ترانسفيراز.
  • إنزيم أسيتيل ترانسفيراز ثنائي هيدروليبواميد إس،
  • أسيتيل ترانسفيراز ثنائي هيدروليبوات،
  • إنزيم ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويك،
  • إنزيم أسيتيل ترانسفيراز ثنائي هيدروليبويل،
  • إنزيم ثنائي هيدروليبويل ليسين: أسيتيل-CoA إس-أسيتيل ترانسفيراز،
  • أسيتيل ترانسفيراز الليبوات،
  • إنزيم ناقل الأسيتيل ليبوات،
  • أسيتيل ترانسفيراز حمض الليبويك،
  • أسيتيل ترانسفيراز حمض الليبويك،
  • ناقلة أسيتيل حمض الليبويك،
  • ليبويل أسيتيل ترانسفيراز،
  • ثيول ترانس أسيتيلاز أ، و
  • ترانس أسيتيلاز X.

بناء

يتكون الهيكل الأساسي التحفيزي المكعب من 24 وحدة فرعية من ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز. [ 6 ]
البنية الأساسية التحفيزية ذات الشكل الاثني عشري، والمكونة من 60 وحدة فرعية من إنزيم ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل من بكتيريا جيوباسيلوس ستيروثيرموفيلوس : خريطة مجهرية إلكترونية ثلاثية الأبعاد (يسار) وبنية حيود الأشعة السينية (يمين). [ 7 ]

تتميز جميع إنزيمات نقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل ببنية متعددة المجالات فريدة تتكون من (من الطرف الأميني إلى الطرف الكربوكسيلي): 3 مجالات ليبويل، ومجال تفاعل، ومجال تحفيزي (انظر بنية المجالات في Pfam ). وترتبط جميع المجالات بمناطق رابطة غير منتظمة ذات تعقيد منخفض.

بحسب النوع، يمكن أن تتجمع وحدات فرعية متعددة من إنزيمات ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز معًا في شكل مكعب أو اثني عشري الأوجه. تشكل هذه البنية النواة التحفيزية لمركب بيروفات ديهيدروجينيز، الذي لا يحفز فقط التفاعل الذي ينقل مجموعة أسيتيل إلى مرافق الإنزيم أ، بل يؤدي أيضًا دورًا بنيويًا حاسمًا في تكوين بنية المركب ككل. [ 7 ]

مكعب

يتكون الهيكل الأساسي المكعب، الموجود في أنواع مثل أزوتوباكتر فيني لاندي ، من 24 وحدة فرعية. [ 8 ] [ 9 ] تتجمع المجالات التحفيزية في ثلاثيات، ويقع الموقع النشط عند سطح التماس بين الوحدات الفرعية. تتطابق بنية هذا الموقع النشط الثلاثي مع بنية إنزيم أسيتيل ترانسفيراز الكلورامفينيكول . ثم تُرتّب ثماني من هذه الثلاثيات في مكعب مجوف ناقص. يوجد الركيزتان الرئيسيتان، مرافق الإنزيم أ (CoA) والليبواميد (Lip(SH)2)، عند مدخلين متقابلين لقناة طولها 30 أنغستروم تمتد بين الوحدات الفرعية وتشكل المركز التحفيزي. يدخل مرافق الإنزيم أ من داخل المكعب، بينما يدخل الليبواميد من خارجه. [ 10 ]

مجسم ذو اثني عشر وجهًا

في العديد من الأنواع، بما في ذلك البكتيريا مثل Geobacillus stearothermophilus و Enterococcus faecalis [ 7 ] ، وكذلك الثدييات مثل البشر [ 11 ] والأبقار [ 12 ] ، يتكون الهيكل الأساسي ذو الاثني عشر وجهًا من 60 وحدة فرعية. تُرتّب هذه الوحدات الفرعية في مجموعات ثلاثية، على غرار الوحدات الثلاثية في الشكل الأساسي المكعب، حيث تُشكّل كل مجموعة رأسًا واحدًا من رؤوس الاثني عشر وجهًا العشرين.

وظيفة

يشارك إنزيم ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل في تفاعل نزع الكربوكسيل من البيروفات، الذي يربط عملية تحلل الجلوكوز بدورة حمض الستريك. تُعدّ هذه العمليات الأيضية مهمة للتنفس الخلوي، أي تحويل الطاقة الكيميائية الحيوية من المغذيات إلى أدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP)، الذي يُستخدم بدوره لإجراء العديد من التفاعلات البيولوجية داخل الخلية. تحدث مراحل التنفس الخلوي المختلفة في أجزاء مختلفة من الخلية. ففي حقيقيات النوى، يحدث تحلل الجلوكوز في السيتوبلازم، ونزع الكربوكسيل من البيروفات في الميتوكوندريا، ودورة حمض الستريك داخل مصفوفة الميتوكوندريا، والفسفرة التأكسدية عبر سلسلة نقل الإلكترون على أعراف الميتوكوندريا . وبالتالي، توجد معقدات نازعة هيدروجين البيروفات (التي تحتوي على إنزيمات ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل) في ميتوكوندريا حقيقيات النوى (وفي السيتوسول في بدائيات النوى).

الآلية

آلية عمل ناقل الأسيتيل ثنائي هيدروليبويل

تتطلب عملية نزع الكربوكسيل من البيروفات بعض العوامل المساعدة بالإضافة إلى الإنزيمات المكونة للمركب. أولها ثيامين بيروفوسفات (TPP)، الذي يستخدمه إنزيم نازع هيدروجين البيروفات لأكسدة البيروفات وتكوين وسيط هيدروكسي إيثيل-TPP. يمتص إنزيم ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز هذا الوسيط ويتفاعل مع عامل مساعد ليبواميد ثانٍ لتكوين وسيط أسيتيل-ثنائي هيدروليبويل، مع إطلاق TPP في هذه العملية. يمكن بعد ذلك مهاجمة هذا الوسيط الثاني بواسطة الكبريت النيوكليوفيلي المرتبط بالإنزيم المساعد A، مما يؤدي إلى إطلاق ثنائي هيدروليبواميد. ينتج عن ذلك إنتاج أسيتيل CoA، وهو الهدف النهائي من نزع الكربوكسيل من البيروفات. يمتص إنزيم ثنائي هيدروليبويل ديهيدروجينيز ثنائي هيدروليبويل ثنائي هيدروليبواميد، وبمساعدة العوامل المساعدة الإضافية FAD وNAD+، يعيد تكوين الليبواميد الأصلي (مع NADH كمنتج جانبي مفيد).

خريطة المسارات التفاعلية

انقر على الجينات والبروتينات والمستقلبات أدناه للانتقال إلى المقالات ذات الصلة. [ § 1 ]

[[ملف:
تحلل الجلوكوز وتكوين الجلوكوز_WP534go to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to WikiPathwaysgo to articlego to Entrezgo to article
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
تحلل الجلوكوز وتكوين الجلوكوز_WP534go to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to articlego to WikiPathwaysgo to articlego to Entrezgo to article
]]
تحرير عملية تحلل الجلوكوز وتكوين الجلوكوز
  1. يمكن تعديل خريطة المسار التفاعلية على WikiPathways: "GlycolysisGluconeogenesis_WP534" .

الأهمية السريرية

تليف الكبد الصفراوي الأولي

يُعدّ تليف الكبد الصفراوي الأولي (PBC) مرضًا مناعيًا ذاتيًا يتميز بوجود أجسام مضادة ذاتية ضد مستضدات الميتوكوندريا والنواة. تُعرف هذه الأجسام المضادة بالأجسام المضادة للميتوكوندريا (AMA) والأجسام المضادة للنواة (ANA) على التوالي. يمكن الكشف عن هذه الأجسام المضادة في مصل مرضى تليف الكبد الصفراوي الأولي، وتختلف اختلافًا كبيرًا من مريض لآخر فيما يتعلق بنوعية المستضد . من بين مستضدات الميتوكوندريا التي يمكن أن تُولّد تفاعلًا مناعيًا ذاتيًا لدى مرضى تليف الكبد الصفراوي الأولي، تُعدّ الوحدة الفرعية E2 من مُركّب نازعة هيدروجين البيروفات، ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز، أكثر المستضدات شيوعًا (تشمل المستضدات الأخرى إنزيمات مُركّبات نازعة هيدروجين 2-أوكسوأسيد، بالإضافة إلى الإنزيمات الأخرى لمُركّبات نازعة هيدروجين البيروفات). [ 13 ] وقد أشارت أدلة حديثة إلى أن الببتيدات الموجودة داخل الموقع التحفيزي قد تُمثّل المستضدات المناعية السائدة التي تتعرف عليها الأجسام المضادة لـ PDC-E2 لدى مرضى تليف الكبد الصفراوي الأولي. [ 14 ] كما توجد أدلة على وجود أجسام مضادة لـ PDC-E2 لدى مرضى التهاب الكبد المناعي الذاتي (AIH). [ 15 ]

نقص إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات

نقص إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات (PDH) هو مرض وراثي يؤدي إلى الحماض اللبني واضطرابات عصبية في مرحلتي الرضاعة والطفولة المبكرة. عادةً ما ينتج نقص إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات عن طفرة في الجين المرتبط بالكروموسوم X للوحدة الفرعية E1 من مركب إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات. مع ذلك، سُجلت حالات نادرة قليلة مصابة بنقص إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات، حيث كانت الطفرة في الجين الجسدي للوحدة الفرعية E2. وقد أُبلغ عن أن هؤلاء المرضى يعانون من أعراض أقل حدة، وكان أبرز مظاهر المرض هو خلل التوتر العضلي الدوري، على الرغم من وجود كل من نقص التوتر العضلي والترنح أيضًا. [ 16 ]

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000150768 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000000168 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. ليونغ، بي إس، واتانابي، واي، مونوز، إس، توبر، إس إس، باتيل، إم إس، كورينبيرغ، جيه آر، هارا، بي، كوبيل، آر، غيرشوين، إم إي (1993). "تحديد موقع الكروموسوم وتحليل تعدد أطوال قطع التقييد (RFLP) لـ PDC-E2: المستضد الذاتي الرئيسي لتليف الكبد الصفراوي الأولي". المناعة الذاتية . 14 (4): 335-340 . doi : 10.3109/08916939309079237 . PMID 8102256 . 
  6. ماتيفي أ، أوبمولوفا ج، كالك ك.هـ، تيبلياكوف أ، هول و.ج (أبريل 1993). "التحليل البلوري لارتباط الركيزة والتحفيز في إنزيم ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز (E2p)". الكيمياء الحيوية . 32 (15): 3887-901 . doi : 10.1021/bi00066a007 . PMID 8471601 . 
  7. 1 2 3 PDB : 1B5S ​;إيزارد تي، إيفارسون إيه، ألين إم دي، ويستفال إيه إتش، بيرام آر إن، دي كوك إيه، هول دبليو جي (فبراير 1999). "مبادئ شبه التكافؤ والهندسة الإقليدية تحكم تجميع النوى المكعبة والاثني عشرية لمعقدات نازعة هيدروجين البيروفات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 ( 4): 1240-5 . Bibcode : 1999PNAS...96.1240I . doi : 10.1073/pnas.96.4.1240 . PMC 15447. PMID 9990008 .  
  8. دي كوك أ، هينجفيلد أ ف، مارتن أ، ويستفال أ هـ (يونيو 1998). "مركب إنزيم نازع هيدروجين البيروفات متعدد الإنزيمات من البكتيريا سالبة الغرام". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - بنية البروتين وعلم الإنزيمات الجزيئي . 1385 (2): 353-366 . doi : 10.1016/S0167-4838(98)00079-X . PMID 9655933 . 
  9. هانيمايير ر، ويستفال أه، فان دير هايدن ت، دي كوك أ، فيجر س (فبراير 1989). "البنية الرباعية لمكون ثنائي هيدروليبويل ترانس أسيتيلاز في مركب بيروفات ديهيدروجينيز من أزوتوباكتر فيني لاندي. إعادة نظر". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 179 (2): 287-292 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14553.x . PMID 2917567 . 
  10. ماتيفي أ، أوبمولوفا ج، شولز إي، كالك كيه إتش، ويستفال إيه إتش، دي كوك أ، هول دبليو جي (مارس 1992). "البنية الذرية للنواة المكعبة لمركب إنزيم نازع هيدروجين البيروفات المتعدد". مجلة ساينس . 255 (5051): 1544-1550 . رمز Bibcode : 1992Sci...255.1544M . doi : 10.1126/science.1549782 . PMID 1549782 . 
  11. براوتيغام، سي. أ.، وين، ر. م.، تشوانغ، ج. ل.، تشوانغ، د. ت. (مايو 2009). " نسب الوحدات الفرعية والمكونات التحفيزية لمركب نازعة هيدروجين البيروفات البشري المُعاد تكوينه في المختبر" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 284 (19): 13086-98 . doi : 10.1074/jbc.M806563200 . PMC 2676041. PMID 19240034 .  
  12. تشو، زد إتش، مكارثي، دي بي، أوكونور، سي إم، ريد، إل جيه، ستوبس، جيه كيه (ديسمبر 2001). "التنظيم البنيوي والوظيفي المذهل لمجمعات نازعة هيدروجين البيروفات في حقيقيات النوى" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 98 (26): 14802-14807 . Bibcode : 2001PNAS...9814802Z . doi : 10.1073/pnas.011597698 . PMC 64939. PMID 11752427 .  
  13. ماكاي آي آر، ويتينغهام إس، فيدا إس، مايرز إم، إيكونو إن، غيرشوين إم إي، رولي إم جيه (أبريل 2000). " المناعة الذاتية المميزة لتشمع الكبد الصفراوي الأولي" . مراجعات المناعة . 174 : 226-237 . doi : 10.1034/j.1600-0528.2002.017410.x . PMID 10807519. S2CID 596338 .  {{cite journal}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  14. براون إس، بيرغ سي، باك إس، غريغور إم، كلاين آر (فبراير 2010). "يحتوي النطاق التحفيزي لـ PDC-E2 على محددات مستضدية تتعرف عليها الأجسام المضادة للميتوكوندريا في تليف الكبد الصفراوي الأولي" . المجلة العالمية لأمراض الجهاز الهضمي . 16 (8): 973-981 . doi : 10.3748/wjg.v16.i8.973 . PMC 2828602. PMID 20180236 .  
  15. أوبراين سي، جوشي إس، فيلد جيه جيه، غويندي إم، دينيس إتش بي، هيثكوت إي جيه (أغسطس 2008). "المتابعة طويلة الأمد لالتهاب الكبد المناعي الذاتي الإيجابي للأجسام المضادة للميتوكوندريا" . علم الكبد . 48 (2): 550-556 . doi : 10.1002/hep.22380 . PMID 18666262. S2CID 5400712 .  
  16. هيد آر إيه، براون آر إم، زولكيبلي زد، شهدادبوري آر، كينغ إم دي، كلايتون بي تي، براون جي كي (أغسطس 2005). "الطيف السريري والجيني لنقص إنزيم نازعة هيدروجين البيروفات: نقص إنزيم أسيتيل ترانسفيراز ثنائي هيدروليبواميد (E2)". حوليات علم الأعصاب . 58 (2): 234-241 . doi : 10.1002/ana.20550 . PMID 16049940. S2CID 38264402 .  

للمزيد من القراءة