عنصر نووي قصير متناثر

📅 آخر تحديث: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة
التركيب الجيني لعناصر LINE1 و SINEs البشرية والفأرية .

العناصر النووية المتناثرة القصيرة ( SINEs ) هي عناصر متنقلة غير ذاتية التحكم وغير مشفرة ، يتراوح طولها بين 100 و700 زوج قاعدي . [ 1 ] وهي فئة من العناصر المتنقلة الرجعية ، وهي عناصر DNA تتكاثر ذاتيًا في جميع أنحاء الجينومات حقيقية النواة ، غالبًا عبر وسائط RNA . تشكل العناصر النووية المتناثرة القصيرة حوالي 13% من جينوم الثدييات . [ 2 ]

تنشأ المناطق الداخلية لعناصر SINE من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) وتظل محفوظة بدرجة عالية، مما يشير إلى وجود ضغط إيجابي للحفاظ على بنية ووظيفة هذه العناصر. [ 3 ] على الرغم من وجود عناصر SINE في العديد من أنواع الفقاريات واللافقاريات، إلا أنها غالبًا ما تكون خاصة بسلالات معينة، مما يجعلها مؤشرات مفيدة للتطور المتباين بين الأنواع. يسمح تباين عدد النسخ والطفرات في تسلسل SINE ببناء أشجار تطورية استنادًا إلى الاختلافات في عناصر SINE بين الأنواع. كما أن لعناصر SINE دورًا في أنواع معينة من الأمراض الوراثية لدى البشر والكائنات حقيقية النوى الأخرى .

باختصار، تُعدّ العناصر النووية المتناثرة القصيرة طفيليات جينية تطورت في مراحل مبكرة من تاريخ حقيقيات النوى، لتستغل الآليات البروتينية داخل الكائن الحي، بالإضافة إلى استعارة هذه الآليات من عناصر جينومية طفيلية مماثلة. بساطة هذه العناصر تجعلها ناجحة بشكل ملحوظ في البقاء والتكاثر (عبر النسخ العكسي) داخل جينومات حقيقيات النوى. هذه "الطفيليات"، التي أصبحت منتشرة في الجينومات، قد تكون ضارة جدًا بالكائنات الحية، كما سيتم توضيحه لاحقًا. مع ذلك، استطاعت حقيقيات النوى دمج العناصر النووية المتناثرة القصيرة في مسارات إشارات واستقلاب وتنظيم مختلفة، وأصبحت هذه العناصر مصدرًا هامًا للتنوع الجيني. ويبدو أنها تلعب دورًا بالغ الأهمية في تنظيم التعبير الجيني وتكوين جينات الحمض النووي الريبوزي (RNA) . ويمتد هذا التنظيم ليشمل إعادة تنظيم الكروماتين وتنظيم البنية الجينومية. إن السلالات والطفرات والأنشطة المختلفة بين حقيقيات النوى تجعل العناصر النووية المتناثرة القصيرة أداة مفيدة في التحليل الوراثي.

التصنيف والبنية

تُصنف عناصر SINE ضمن عناصر النسخ العكسي غير المرتبطة بتكرارات طرفية طويلة (LTRs) لعدم احتوائها على هذه التكرارات . [ 4 ] توجد ثلاثة أنواع من عناصر SINE شائعة في الفقاريات واللافقاريات: CORE-SINEs وV-SINEs وAmnSINEs. [ 3 ] تحتوي عناصر SINEs على مناطق داخلية يتراوح طولها بين 50 و500 زوج قاعدي، تتضمن قطعة مشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) مع صندوقي A وB اللذين يعملان كمحفز داخلي لإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III . [ 5 ] [ 3 ]

الهيكل الداخلي

تتميز عناصر SINE بوحداتها المختلفة، والتي تُمثل في جوهرها تقسيمًا لتسلسلها. قد تحتوي عناصر SINE على رأس وجسم وذيل، ولكن ليس بالضرورة. يقع الرأس في الطرف 5' من العناصر النووية المتناثرة القصيرة، وهو مشتق تطوريًا من الحمض النووي الريبوزي (RNA) المُصنّع بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III، مثل الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). يشير الطرف 5' للرأس إلى العنصر الداخلي الذي اشتُق منه عنصر SINE، والذي تمكن من استخدام آليته النسخية بشكل طفيلي. [ 1 ] على سبيل المثال، يُشتق الطرف 5' لعنصر Alu SINE من الحمض النووي الريبوزي 7SL ، وهو تسلسل يُنسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III، مما يُنتج عنصر الحمض النووي الريبوزي الخاص بـ SRP، وهو بروتين نووي ريبوزي وفير. [ 6 ] لا يُعرف أصل جسم عناصر SINE، لكنها غالبًا ما تتشارك في تشابه كبير مع عنصر LINE المقابل ، مما يسمح لعناصر SINE بالتطفل على الإنزيمات النووية الداخلية المشفرة بواسطة عناصر LINE (التي تتعرف على أنماط تسلسلية معينة). أخيرًا، يتكون الذيل 3′ لعناصر SINE من تكرارات بسيطة قصيرة بأطوال متفاوتة؛ هذه التكرارات البسيطة هي مواقع يمكن أن تتحد فيها عنصران نوويان قصيران متناثران (أو أكثر) لتشكيل عنصر SINE ثنائي. [ 7 ] تُسمى العناصر النووية القصيرة المتناثرة التي تمتلك رأسًا وذيلًا فقط بعناصر SINE بسيطة، بينما تُسمى العناصر النووية القصيرة المتناثرة التي تمتلك أيضًا جسمًا أو هي مزيج من عنصرين SINE أو أكثر بعناصر SINE معقدة. [ 1 ]

النسخ

تُنسخ العناصر النووية المتناثرة القصيرة (SINEs) بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III ، المعروف بقدرته على نسخ الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي ( rRNA) والحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) ، وهما نوعان من الحمض النووي الريبوزي ضروريان لتجميع الريبوسومات وترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) . [ 8 ] تمتلك عناصر SINEs، مثل الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) والعديد من أنواع الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير، مُحفزًا داخليًا، وبالتالي تُنسخ بطريقة مختلفة عن معظم الجينات المُشفِّرة للبروتينات. [ 1 ] بعبارة أخرى، تحتوي العناصر النووية المتناثرة القصيرة على عناصر المُحفز الرئيسية داخل المنطقة المنسوخة نفسها. على الرغم من نسخها بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III، فإن عناصر SINEs والجينات الأخرى التي تمتلك مُحفزات داخلية، تستقطب آليات وعوامل نسخ مختلفة عن تلك التي تستقطبها الجينات التي تمتلك مُحفزات خارجية. [ 9 ]

التأثيرات على التعبير الجيني

تؤثر التغيرات في بنية الكروموسوم على التعبير الجيني بشكل أساسي من خلال التأثير على إمكانية وصول آليات النسخ إلى الجينات. يتميز الكروموسوم بنظام معقد وهرمي لتنظيم الجينوم. يسمح هذا النظام التنظيمي، الذي يشمل الهستونات ومجموعات الميثيل ومجموعات الأسيتيل ومجموعة متنوعة من البروتينات والحمض النووي الريبوزي (RNA)، بوصول البوليميرازات وعوامل النسخ والبروتينات الأخرى المرتبطة بها إلى نطاقات مختلفة داخل الكروموسوم بدرجات متفاوتة. [ 10 ] علاوة على ذلك، يمكن أن يؤثر شكل وكثافة مناطق معينة من الكروموسوم على شكل وكثافة المناطق المجاورة (أو حتى البعيدة) عليه من خلال التفاعل الذي تُسهّله بروتينات وعناصر مختلفة. وبالتالي، يمكن أن تلعب جزيئات الحمض النووي الريبوزي غير المشفرة، مثل العناصر النووية المتناثرة القصيرة (STN-1)، المعروفة بارتباطها ببنية الكروماتين ومساهمتها فيها، دورًا كبيرًا في تنظيم التعبير الجيني. [ 11 ] وبالمثل، يمكن أن تُشارك العناصر النووية المتناثرة القصيرة في تنظيم الجينات من خلال تعديل البنية الجينومية.

في الواقع، اقترحت عثمانوفا وآخرون (2008) أن العناصر النووية المتناثرة القصيرة يمكن أن تعمل كإشارات مباشرة في إعادة ترتيب الكروماتين وبنيته. فحصت الدراسة التوزيع العالمي لعناصر SINE في كروموسومات الفئران والبشر، وخلصت إلى أن هذا التوزيع مشابه جدًا للتوزيعات الجينومية للجينات ومواقع CpG . [ 12 ] كان توزيع عناصر SINE على الجينات أكثر تشابهًا بشكل ملحوظ من توزيع العناصر الجينية غير المشفرة الأخرى، بل واختلف اختلافًا كبيرًا عن توزيع العناصر النووية المتناثرة الطويلة. [ 12 ] يشير هذا إلى أن توزيع عناصر SINE لم يكن مجرد صدفة ناتجة عن عملية النسخ العكسي بوساطة عناصر LINE، بل إن لعناصر SINE دورًا في تنظيم الجينات. علاوة على ذلك، تحتوي عناصر SINE غالبًا على مواقع لبروتينات YY1 متعددة الكومب. [ 12 ] YY1 هو بروتين ذو أصابع زنك يعمل كمثبط نسخ لمجموعة واسعة من الجينات الأساسية للنمو والإشارات الخلوية. [ 13 ] يُعتقد أن بروتين Polycomb YY1 يُساهم في تنظيم نشاط إنزيمات نزع أستيل الهيستون وإنزيمات أستيل ترانسفيراز الهيستون لتسهيل إعادة تنظيم الكروماتين؛ وغالبًا ما يكون ذلك لتسهيل تكوين الكروماتين المغاير (حالة إسكات الجينات). [ 14 ] وبالتالي، يُشير التحليل إلى أن العناصر النووية المتناثرة القصيرة يُمكن أن تعمل كمعزز للإشارة في إسكات مجموعات الجينات المعتمد على بروتين Polycomb من خلال إعادة تنظيم الكروماتين. [ 12 ] في جوهر الأمر، فإن التأثير التراكمي لأنواع عديدة من التفاعلات هو ما يُؤدي إلى الاختلاف بين الكروماتين الحقيقي ، وهو غير مُتراص بإحكام وأكثر سهولة في الوصول إليه عمومًا لآليات النسخ، والكروماتين المغاير ، وهو مُتراص بإحكام وغير سهل الوصول إليه عمومًا لآليات النسخ؛ ويبدو أن عناصر SINEs تلعب دورًا تطوريًا في هذه العملية.

إضافةً إلى تأثيرها المباشر على بنية الكروماتين، توجد عدة طرق يُمكن من خلالها لعناصر SINE تنظيم التعبير الجيني. على سبيل المثال، يُمكن للحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر أن يتفاعل مباشرةً مع مثبطات ومنشطات النسخ، مُضعفًا أو مُعدِّلًا وظيفتها. [ 15 ] يُمكن أن يحدث هذا النوع من التنظيم بطرقٍ مُختلفة: يُمكن لنسخة الحمض النووي الريبوزي أن ترتبط مُباشرةً بعامل النسخ كمُنظم مُساعد؛ كما يُمكن للحمض النووي الريبوزي أن يُنظم ويُعدِّل قدرة المُنظمات المُساعدة على الارتباط بعامل النسخ. [ 15 ] على سبيل المثال، من المعروف أن Evf-2، وهو نوع مُعين من الحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر، يعمل كمُنشط مُساعد لبعض عوامل النسخ من نوع homeobox، والتي تُعد ضرورية لتطور الجهاز العصبي وتنظيمه. [ 16 ] علاوةً على ذلك، يُمكن لنسخ الحمض النووي الريبوزي أن تُعيق وظائف مُركب النسخ من خلال التفاعل أو الارتباط مع بوليميرازات الحمض النووي الريبوزي أثناء عمليات النسخ أو التحميل. [ 15 ] علاوة على ذلك، يمكن للحمض النووي الريبي غير المشفر مثل SINEs أن يرتبط أو يتفاعل مباشرة مع الحمض النووي المزدوج الذي يشفر الجين، وبالتالي يمنع نسخه. [ 15 ]

كذلك، تتوزع العديد من الحموض النووية الريبية غير المشفرة بالقرب من الجينات المشفرة للبروتينات، وغالبًا في الاتجاه المعاكس. وينطبق هذا بشكل خاص على العناصر النووية المتناثرة القصيرة، كما هو موضح في دراسة عثمانوفا وآخرون. توفر هذه الحموض النووية الريبية غير المشفرة، التي تقع بجوار مجموعات الجينات أو تتداخل معها، آليةً يمكن من خلالها استقطاب عوامل النسخ والآليات لزيادة أو تثبيط نسخ الجينات المحلية. وقد نوقش المثال المحدد لعناصر SINE التي يُحتمل أن تستقطب مثبط النسخ YY1 polycomb أعلاه. [ 12 ] وبدلاً من ذلك، توفر هذه الحموض النووية الريبية غير المشفرة أيضًا آليةً يمكن من خلالها تقليص التعبير الجيني المحلي وتنظيمه، لأن مركبات النسخ قد تعيق أو تمنع نسخ الجينات المجاورة. وتشير الأبحاث إلى أن هذه الظاهرة تُلاحظ بشكل خاص في تنظيم الجينات في الخلايا متعددة القدرات. [ 17 ]

في الختام، تتمتع الحموض النووية غير المشفرة، مثل عناصر SINE، بالقدرة على التأثير في التعبير الجيني على مستويات متعددة وبطرق مختلفة. ويُعتقد أن العناصر النووية القصيرة المتناثرة مُدمجة بعمق في شبكة تنظيمية معقدة قادرة على ضبط التعبير الجيني بدقة عبر الجينوم حقيقي النواة.

الانتشار والتنظيم

لا يُشفّر الحمض النووي الريبوزي (RNA) المُستنسخ من العنصر النووي المتناثر القصير أي منتج بروتيني، ولكنه مع ذلك يُستنسخ عكسيًا ويُعاد إدخاله في منطقة بديلة في الجينوم. لهذا السبب، يُعتقد أن العناصر النووية المتناثرة القصيرة قد تطورت بالتزامن مع العناصر النووية المتناثرة الطويلة (LINEs)، حيث أن عناصر LINEs تُشفّر بالفعل منتجات بروتينية تُمكّنها من النسخ العكسي والاندماج مرة أخرى في الجينوم. [ 4 ] يُعتقد أن عناصر SINEs قد استغلت البروتينات التي تُشفّرها عناصر LINEs والموجودة في إطاري قراءة. يُشفّر إطار القراءة المفتوح 1 (ORF 1) بروتينًا يرتبط بالحمض النووي الريبوزي (RNA) ويعمل كبروتين مرافق لتسهيل والحفاظ على بنية مُركّب بروتين-RNA الخاص بعنصر LINE. [ 18 ] يُشفّر إطار القراءة المفتوح 2 (ORF 2) بروتينًا يمتلك نشاط كلٍ من الإندونوكلياز والناسخ العكسي. [ 19 ] وهذا يمكّن من نسخ mRNA الخاص بـ LINE عكسيًا إلى DNA ودمجه في الجينوم بناءً على أنماط التسلسل التي يتعرف عليها مجال الإندونوكلياز الخاص بالبروتين.

يُنسخ عنصر LINE-1 (L1) ويُعاد نسخه بشكل متكرر في الخلايا الجنسية وأثناء مراحل النمو المبكرة؛ ونتيجة لذلك، تتحرك عناصر SINE في الجينوم بكثرة خلال هذه الفترات. يتم تثبيط نسخ عناصر SINE بواسطة عوامل النسخ في الخلايا الجسدية بعد مراحل النمو المبكرة، على الرغم من أن الإجهاد قد يؤدي إلى زيادة نشاط عناصر SINE الصامتة عادةً. [ 20 ] يمكن نقل عناصر SINE بين الأفراد أو الأنواع عبر النقل الأفقي بواسطة ناقل فيروسي . [ 21 ]

من المعروف أن عناصر SINE تتشارك في تسلسل متماثل مع عناصر LINE، مما يوفر أساسًا لآلية LINE لنسخ ودمج نسخ SINE. [ 22 ] وبدلاً من ذلك، يُعتقد أن بعض عناصر SINE تستخدم نظامًا أكثر تعقيدًا للدمج مرة أخرى في الجينوم؛ يتضمن هذا النظام استخدام فواصل عشوائية في الحمض النووي المزدوج (بدلاً من الإندونوكلياز المشفر بواسطة عناصر نووية متناثرة طويلة ذات صلة تُنشئ موقع إدخال). [ 22 ] تُستخدم فواصل الحمض النووي هذه لتحفيز النسخ العكسي، مما يؤدي في النهاية إلى دمج نسخة SINE مرة أخرى في الجينوم. [ 22 ] ومع ذلك، تعتمد عناصر SINE على إنزيمات مشفرة بواسطة عناصر DNA أخرى، ولذلك تُعرف باسم العناصر المتنقلة الرجعية غير المستقلة، لأنها تعتمد على آلية LINE، المعروفة باسم العناصر المتنقلة الرجعية المستقلة. [ 23 ]

تدعم الدراسات التي تبحث في وجود وتوزيع عناصر LINE وSINE في مجموعات تصنيفية من أنواع مختلفة، النظرية القائلة بأن العناصر النووية المتناثرة القصيرة قد تطورت للاستفادة من آلية النسخ العكسي للعناصر النووية المتناثرة الطويلة. [ 24 ] فعلى سبيل المثال، تُظهر عناصر LINE وSINE في القوارض والرئيسيات تشابهًا قويًا جدًا في نمط موقع الإدخال. [ 24 ] تُشكل هذه الأدلة أساسًا للآلية المقترحة التي يمكن من خلالها دمج نسخة SINE مع منتجات البروتين المشفرة بواسطة LINE. ويتضح ذلك تحديدًا من خلال تحليل مفصل لأكثر من 20 نوعًا من القوارض، حيث تم تحديد عناصر LINE وSINE فيها، وخاصةً L1 وB1 على التوالي؛ وهما عائلتان من عناصر LINE وSINE موجودة بترددات عالية في القوارض إلى جانب الثدييات الأخرى. [ 24 ] سعت الدراسة إلى توفير وضوح في العلاقات التطورية ضمن سياق نشاط عناصر LINE وSINE.

توصلت الدراسة إلى تصنيف مرشح يُعتقد أنه أول حالة انقراض لعناصر L1 LINE؛ وكما هو متوقع، اكتشفت عدم وجود دليل يشير إلى حدوث نشاط لعناصر B1 SINE في أنواع لا تمتلك نشاطًا لعناصر L1 LINE. [ 24 ] كما أشارت الدراسة إلى أن إسكات عناصر B1 النووية المتناثرة القصيرة قد حدث بالفعل قبل انقراض عناصر L1 النووية المتناثرة الطويلة؛ ويعود ذلك إلى إسكات عناصر B1 SINE في الجنس الأقرب صلةً بالجنس الذي لا يحتوي على عناصر L1 LINE نشطة (مع أن الجنس الذي يعاني من إسكات عناصر B1 SINE لا يزال يحتوي على عناصر L1 LINE نشطة). [ 24 ] كما تم العثور على جنس آخر يحتوي على عناصر L1 نووية متناثرة طويلة نشطة ولكنه لا يحتوي على عناصر B1 نووية متناثرة قصيرة؛ ولم يتم العثور على السيناريو المعاكس، حيث توجد عناصر B1 SINE نشطة في جنس لا يمتلك عناصر L1 LINE نشطة. [ 24 ] كانت هذه النتيجة متوقعة، وهي تدعم بقوة النظرية القائلة بأن عناصر SINE قد تطورت لتستغل البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي، والإنزيمات الداخلية، وإنزيمات النسخ العكسي المشفرة بواسطة عناصر LINE. في الكائنات الحية التي لا تقوم بنسخ وترجمة منتجات البروتينات للعناصر النووية المتناثرة الطويلة بنشاط، لا تمتلك عناصر SINE الأساس النظري اللازم للانتقال العكسي داخل الجينوم. وبالتالي، فإن النتائج التي توصل إليها راينهارت وآخرون تدعم بقوة النموذج الحالي للانتقال العكسي لعناصر SINE.

تأثيرات نقل SINE

قد يؤدي إدخال عنصر SINE في المنطقة المجاورة لمنطقة الترميز إلى إعادة ترتيب الإكسونات أو تغييرات في المنطقة التنظيمية للجين. كما أن إدخال عنصر SINE في تسلسل الترميز للجين قد يكون له آثار ضارة، وقد يتسبب الانتقال غير المنظم في أمراض وراثية . ويُعتقد أن انتقال وإعادة تركيب عناصر SINE وغيرها من العناصر النووية النشطة يُعدّ من أهم العوامل المساهمة في التنوع الجيني بين السلالات أثناء عملية التطور النوعي. [ 21 ]

SINEs الشائعة

يُعتقد أن العناصر النووية المتناثرة القصيرة ( SINEs) ذات أصول طفيلية في جينومات حقيقيات النوى. وقد طرأت على هذه العناصر طفرات وتضاعفت مرات عديدة على مدى زمني تطوري، مما أدى إلى تكوين العديد من السلالات المختلفة. وقد تسبب أصلها التطوري المبكر في انتشارها الواسع في العديد من سلالات حقيقيات النوى.

تُعدّ عناصر Alu ، وهي عناصر نووية قصيرة متناثرة يبلغ طولها حوالي 300 نيوكليوتيد، أكثر عناصر SINE شيوعًا لدى البشر، إذ يوجد منها أكثر من مليون نسخة في جميع أنحاء الجينوم، أي ما يزيد عن 10% من إجمالي الجينوم؛ وهذا ليس نادرًا بين الأنواع الأخرى. [ 25 ] يمكن استخدام اختلافات عدد نسخ عناصر Alu للتمييز بين أنواع الرئيسيات وبناء أشجار تطورها. [ 21 ] تختلف الكلاب بشكل أساسي في وفرة تكرارات SINEC_Cf في جميع أنحاء الجينوم، وليس في الطفرات الأخرى على مستوى الجينات أو الأليلات. قد تُشفّر عناصر SINE الخاصة بالكلاب هذه موقعًا مُستقبِلًا للوصل، مما يُغيّر التسلسلات التي تظهر كإكسونات أو إنترونات في كل نوع. [ 26 ]

إلى جانب الثدييات، يمكن أن تصل عناصر SINE إلى أعداد نسخ عالية في مجموعة واسعة من الأنواع، بما في ذلك الفقاريات غير العظمية ( مثل قرش الفيل ) وبعض أنواع الأسماك العظمية ( مثل سمكة السيلاكانث ). [ 27 ] في النباتات، غالبًا ما تقتصر عناصر SINE على الأنواع وثيقة الصلة، وقد ظهرت واختفت وتراجعت بشكل متكرر خلال التطور. [ 28 ] ومع ذلك، فإن بعض عائلات SINE، مثل Au-SINEs [ 29 ] وAngio-SINEs [ 30 ] ، منتشرة على نطاق واسع بشكل غير عادي عبر العديد من أنواع النباتات التي غالبًا ما تكون غير مرتبطة.

الأمراض

هناك أكثر من 50 مرضًا بشريًا مرتبطًا بعناصر SINE. [ 20 ] عند إدخالها بالقرب من الإكسون أو داخله، يمكن أن تُسبب عناصر SINE خللًا في عملية التضفير، أو تُصبح مناطق ترميزية، أو تُغير إطار القراءة ، مما يؤدي غالبًا إلى ظهور أعراض مرضية لدى البشر والحيوانات الأخرى. [ 26 ] يرتبط إدخال عناصر Alu في الجينوم البشري بسرطان الثدي ، وسرطان القولون ، وسرطان الدم ، والهيموفيليا ، وداء دنت ، والتليف الكيسي ، والورم الليفي العصبي ، وغيرها الكثير. [ 4 ]

الميكرو الحمض النووي الريبوزي

أكدت دراسات عديدة دور العناصر النووية المتناثرة القصيرة في تنظيم الجينات داخل الخلايا. إحدى هذه الدراسات فحصت العلاقة بين عائلة معينة من هذه العناصر (SINEs) وجزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي ( microRNAs ) في سمك الزيبرا . [ 31 ] كانت عائلة العناصر النووية المتناثرة القصيرة التي دُرست هي Anamnia V-SINEs؛ وتوجد هذه العائلة من العناصر النووية المتناثرة القصيرة غالبًا في المنطقة غير المترجمة من الطرف 3' للعديد من الجينات، وهي موجودة في جينومات الفقاريات. [ 31 ] تضمنت الدراسة تحليلًا حاسوبيًا تم فيه فحص التوزيع الجينومي ونشاط Anamnia V-SINEs في سمك الزيبرا Danio rerio ؛ علاوة على ذلك، تم تحليل قدرة هذه العناصر على توليد مواقع جديدة لجزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي. [ 31 ] ووجد أن الجينات التي تم التنبؤ باحتوائها على عناصر V-SINEs كانت مستهدفة بواسطة جزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي ذات قيم تهجين E أعلى بكثير (مقارنة بمناطق أخرى في الجينوم). [ 31 ] كانت الجينات ذات قيم التهجين العالية (E-values) جيناتٍ تشارك بشكلٍ خاص في مسارات الأيض والإشارات الخلوية. [ 31 ] وقد تم تحديد جميع جزيئات miRNA تقريبًا التي تتمتع بقدرة عالية على التهجين مع تسلسلات V-SINE المفترضة في الجينات (في الثدييات) على أنها ذات أدوار تنظيمية. [ 31 ] تشير هذه النتائج، التي تُثبت وجود علاقة بين العناصر النووية المتناثرة القصيرة وجزيئات miRNA التنظيمية المختلفة، بقوة إلى أن V-SINEs لها دورٌ هام في تخفيف الاستجابات للإشارات والمحفزات المختلفة المتعلقة بالأيض والتكاثر والتمايز. ولا يزال يتعين إجراء العديد من الدراسات الأخرى لتحديد مدى صحة ونطاق دور العناصر النووية المتناثرة القصيرة المتنقلة في شبكات تنظيم التعبير الجيني. في الختام، على الرغم من أنه لا يُعرف الكثير عن دور وآلية توليد مواقع جينات miRNA بواسطة SINEs، إلا أنه من المفهوم بشكل عام أن SINEs قد لعبت دورًا تطوريًا مهمًا في إنشاء "جينات RNA"، وقد تم التطرق إلى هذا الأمر أعلاه في SINEs والجينات الكاذبة.

مع وجود أدلة تشير إلى أن العناصر النووية المتناثرة القصيرة كانت مصادر تطورية لتوليد مواقع microRNA، فمن المهم مناقشة العلاقات المحتملة بينهما، بالإضافة إلى الآلية التي ينظم بها microRNA تحلل الحمض النووي الريبوزي (RNA)، وبشكل أوسع، التعبير الجيني. microRNA هو حمض نووي ريبوزي غير مشفر، يبلغ طوله عادةً 22 نيوكليوتيدًا. [ 32 ] يُنسخ هذا الأوليغونوكليوتيد غير المشفر للبروتين عادةً من تسلسل DNA نووي أطول بواسطة بوليميراز RNA II، المسؤول أيضًا عن نسخ معظم mRNAs و snRNAs في حقيقيات النوى. [ 33 ] ومع ذلك، تشير بعض الأبحاث إلى أن بعض microRNAs التي تحتوي على عناصر نووية متناثرة قصيرة في الجزء العلوي تُنسخ بواسطة بوليميراز RNA III، الذي له دور واسع في نسخ الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)، وهما نسختان حيويتان لترجمة mRNA. [ 34 ] يوفر هذا آلية بديلة يمكن من خلالها أن تتفاعل العناصر النووية المتناثرة القصيرة مع شبكات تنظيم الجينات التي تشمل microRNAs أو تتوسط فيها.

يمكن أن تكون المناطق الجينومية المنتجة للـ miRNA جينات RNA مستقلة، وغالبًا ما تكون مضادة لجينات ترميز البروتين المجاورة، أو قد توجد داخل الإنترونات الخاصة بجينات ترميز البروتين. [ 35 ] يوفر التموضع المشترك للـ microRNA وجينات ترميز البروتين أساسًا آليًا لتنظيم الـ microRNA للتعبير الجيني. علاوة على ذلك، يكشف سكارباتو وآخرون (كما ذُكر سابقًا) أن الجينات التي يُتوقع أن تحتوي على عناصر نووية متناثرة قصيرة (SINEs) من خلال تحليل التسلسل، استُهدفت وهُجّنت بواسطة الـ microRNAs بنسبة أكبر بكثير من الجينات الأخرى. [ 31 ] يوفر هذا مسارًا تطوريًا تم من خلاله استغلال عناصر SINEs الطفيلية واستخدامها لتكوين جينات RNA (مثل الـ microRNAs) التي تطورت لتلعب دورًا في شبكات تنظيم الجينات المعقدة.

تُنسخ جزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي (microRNA) كجزء من سلاسل أطول من الحمض النووي الريبوزي (RNA) يبلغ طولها عادةً حوالي 80 نيوكليوتيدًا، والتي تستطيع، من خلال اقتران القواعد المتكاملة، تكوين بنى حلقية تشبه دبوس الشعر [ 36 ]. يتم التعرف على هذه البنى ومعالجتها في النواة بواسطة البروتين النووي DiGeorge Syndrome Critical Region 8 (DGCR8)، الذي يستقطب بروتين Drosha ويرتبط به [ 37 ] . هذا المركب مسؤول عن فصل بعض البنى الحلقية من الحمض النووي الريبوزي الميكروي الأولي (pre-microRNA)، الذي يُنقل إلى السيتوبلازم. يُعالج الحمض النووي الريبوزي الميكروي الأولي بواسطة بروتين DICER إلى جزيء مزدوج السلسلة مكون من 22 نيوكليوتيدًا [ 38 ] . بعد ذلك، تُدمج إحدى السلسلتين في مركب إسكات الحمض النووي الريبوزي المُحفز بواسطة الحمض النووي الريبوزي (RISC) متعدد البروتينات [ 39 ] . من بين هذه البروتينات، بروتينات من عائلة Argonaute، والتي تُعد ضرورية لقدرة المركب على التفاعل مع الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) المستهدف وكبح ترجمته [ 40 ] .

يُعد فهم الطرق المختلفة التي تنظم بها microRNA التعبير الجيني، بما في ذلك ترجمة mRNA وتحلله، أمرًا أساسيًا لفهم الدور التطوري المحتمل لعناصر SINE في تنظيم الجينات وفي توليد مواقع microRNA. هذا، بالإضافة إلى دور SINE المباشر في الشبكات التنظيمية (كما نوقش في "SINEs كـRNAs طويلة غير مشفرة")، أمر بالغ الأهمية لبدء فهم العلاقة بين SINEs وبعض الأمراض. وقد أشارت دراسات متعددة إلى أن زيادة نشاط SINEs يرتبط بملامح معينة للتعبير الجيني وتنظيم ما بعد النسخ لبعض الجينات. [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] في الواقع، أظهر بيترسون وآخرون (2013) أن ارتفاع مستوى تعبير SINE RNA يرتبط بانخفاض تنظيم BRCA1 بعد النسخ ، وهو جين كابت للورم متورط في أنواع متعددة من السرطان، ولا سيما سرطان الثدي. [ 43 ] علاوة على ذلك، أثبتت الدراسات وجود ارتباط قوي بين التعبئة النسخية لعناصر SINEs وبعض أنواع السرطان وحالات مثل نقص الأكسجين. قد يعود ذلك إلى عدم استقرار الجينوم الناتج عن نشاط عناصر SINE، بالإضافة إلى تأثيرات أخرى مباشرة. [ 42 ] كما ثبت تورط عناصر SINE في العديد من الأمراض الأخرى. في جوهرها، أصبحت العناصر النووية المتناثرة القصيرة جزءًا لا يتجزأ من مسارات تنظيمية واستقلابية وإشاراتية لا حصر لها، وبالتالي تلعب دورًا لا مفر منه في التسبب بالأمراض. لا يزال هناك الكثير مما يجب معرفته عن هذه الطفيليات الجينية، لكن من الواضح أنها تلعب دورًا هامًا في الكائنات حقيقية النواة.

عناصر SINE والجينات الكاذبة

مع ذلك، فإن نشاط عناصر SINE يحمل آثارًا جينية لا يبدو أنها تؤدي دورًا مهمًا، سواءً إيجابيًا أو سلبيًا، وتظهر في الجينوم على شكل جينات كاذبة . مع ذلك، يجب عدم الخلط بين عناصر SINE وجينات RNA الكاذبة. [ 1 ] بشكل عام، تتولد الجينات الكاذبة عندما تُنسخ جزيئات mRNA المعالجة لجينات ترميز البروتين عكسيًا وتُدمج مرة أخرى في الجينوم (جينات RNA الكاذبة هي جينات RNA منسوخة عكسيًا). [ 44 ] تكون الجينات الكاذبة عديمة الوظيفة عمومًا لأنها تنحدر من جزيئات RNA معالجة بغض النظر عن سياقها التطوري الذي يشمل الإنترونات وعناصر تنظيمية مختلفة تُمكّن النسخ والمعالجة. قد تحتوي هذه الجينات الكاذبة، على الرغم من كونها غير وظيفية، في بعض الحالات على محفزات وجزر CpG وخصائص أخرى تُمكّن النسخ؛ وبالتالي، لا يزال من الممكن نسخها وقد يكون لها دور في تنظيم التعبير الجيني (مثل عناصر SINE وغيرها من العناصر غير المشفرة). [ 44 ] تختلف الجينات الكاذبة عن عناصر SINE في كونها مشتقة من الحمض النووي الريبوزي الوظيفي المنسوخ، بينما عناصر SINE هي عناصر DNA تنتقل عكسيًا عن طريق استغلال آلية نسخ جينات الحمض النووي الريبوزي. مع ذلك، تشير بعض الدراسات إلى أن العناصر القابلة للانتقال العكسي، مثل عناصر SINE النووية القصيرة المتناثرة، لا تقتصر قدرتها على نسخ نفسها في مناطق بديلة من الجينوم فحسب، بل يمكنها أيضًا نسخ جينات عشوائية. [ 45 ] [ 46 ] لذا، قد تلعب عناصر SINE دورًا حيويًا في توليد الجينات الكاذبة، المعروفة بدورها في الشبكات التنظيمية. ولعل هذه وسيلة أخرى استطاعت من خلالها عناصر SINE التأثير على تنظيم الجينات والمساهمة فيه.

مراجع

  1. 1 2 3 4 5 فاسيتسكي، ن. س.، وكراميروف، د. أ. (يناير 2013). "SINEBase: قاعدة بيانات وأداة لتحليل SINE" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (عدد قواعد البيانات): D83-9. doi : 10.1093/nar/gks1263 . PMC 3531059. PMID 23203982 .  
  2. ↑ إسحاق، تشارلز أ.؛ دي كارفاليو، دانيال د. (2020). "إعادة تنشيط العناصر الوراثية الداخلية في تطور السرطان وعلاجه" . المراجعة السنوية لبيولوجيا السرطان . 4 : 159-176 . doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033525 .
  3. 1 2 3 صن إف جيه، فلورديبين إس، بوسكيت أنتونيلي سي، كايتانو أنوليس جي، ديراجون جيه إم (يناير 2007). “الاتجاهات التطورية الشائعة لهياكل SINE RNA”. الاتجاهات في علم الوراثة . 23 (1): 26-33 . دوى : 10.1016/j.tig.2006.11.005 . بميد 17126948 . 
  4. هانكس دي سي، كازازيان إتش إتش (يونيو 2012). " العناصر المتنقلة الرجعية النشطة لدى الإنسان: التباين والمرض" . الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 22 (3): 191-203 . doi : 10.1016/j.gde.2012.02.006 . PMC 3376660. PMID 22406018 .  
  5. ↑ ويكر تي، سابوت إف، هوا-فان إيه، بينيتزن جيه إل، كابي بي، شلهوب بي، وآخرون . (ديسمبر 2007). "نظام تصنيف موحد للعناصر القابلة للنقل في حقيقيات النوى". مجلة نيتشر ريفيوز. علم الوراثة . 8 (12): 973-982 . doi : 10.1038/nrg2165 . PMID 17984973. S2CID 32132898 .   
  6. ↑ كريغز، جي أو، تشوراكوف، جي، جوركا، جي، بروسيوس، جي، شميتز، جي (أبريل 2007). "التاريخ التطوري لعناصر SINE المشتقة من الحمض النووي الريبوزي 7SL في الرئيسيات العليا". اتجاهات في علم الوراثة . 23 (4): 158-161 . doi : 10.1016/j.tig.2007.02.002 . PMID 17307271 . 
  7. ↑ أوكادا ن، حمادة م، أوجيوارا إ، أوشيما ك (ديسمبر 1997). "تتشارك عناصر SINE وLINE في تسلسلات 3' مشتركة: مراجعة". جين . 205 ( 1-2 ): 229-43 . doi : 10.1016/s0378-1119(97)00409-5 . PMID 9461397 . 
  8. ↑ دينينجر، ب. ل.، وباتزر، م. أ. (أكتوبر 2002). "العناصر الرجعية في الثدييات" . أبحاث الجينوم . 12 (10): 1455-1465 . doi : 10.1101/gr.282402 . PMID 12368238 . 
  9. ↑ وايت ، آر. جيه. (مايو 2011). "النسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي III: أكثر تعقيدًا مما كنا نعتقد". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 12 (7): 459-463 . doi : 10.1038/nrg3001 . PMID 21540878. S2CID 21123216 .  
  10. ↑ كيفر جيه سي (أبريل 2007). "علم التخلق في النمو". ديناميات النمو . 236 (4): 1144-1156 . doi : 10.1002/dvdy.21094 . PMID 17304537 . 
  11. ↑ رودريغيز-كامبوس أ، أزورين ف (نوفمبر 2007). "الحمض النووي الريبوزي (RNA) عنصر أساسي في الكروماتين، ويساهم في تنظيمه البنيوي" . PLOS ONE . 2 (11) e1182. Bibcode : 2007PLoSO...2.1182R . doi : 10.1371/journal.pone.0001182 . PMC 2063516. PMID 18000552 .  
  12. 1 2 3 4 5 عثمانوفا ن.م، كازاكوف ف.إ، توميلين ن.ف (2008). "[يمكن أن تعمل عناصر SINE في جينومات الثدييات كإشارات إضافية في تكوين الكروماتين المغاير الاختياري]". علم الخلايا (باللغة الروسية). 50 (3): 256-260 . PMID 18664128 . 
  13. ↑ شي واي، سيتو إي، تشانغ إل إس، شينك تي (أكتوبر 1991). "التثبيط النسخي بواسطة YY1، وهو بروتين بشري مرتبط بـ GLI-Krüppel، وتخفيف التثبيط بواسطة بروتين E1A للفيروس الغدي". الخلية . 67 ( 2): 377-388 . doi : 10.1016/0092-8674(91)90189-6 . PMID 1655281. S2CID 19399858 .  
  14. ↑ ياو واي إل، يانغ دبليو إم، سيتو إي (سبتمبر 2001). " تنظيم عامل النسخ YY1 عن طريق الأسيتلة وإزالة الأسيتلة" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 21 (17): 5979-91 . doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . PMC 87316. PMID 11486036 .  
  15. 1 2 3 4 غودريتش، جيه إيه، وكوجل، جيه إف (أغسطس 2006). "منظمات الحمض النووي الريبي غير المشفر لنسخ بوليميراز الحمض النووي الريبي II". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 7 (8): 612-616 . doi : 10.1038/nrm1946 . PMID 16723972. S2CID 22274894 .  
  16. ↑ فينغ جيه، بي سي، كلارك بي إس، مادي آر، شاه بي، كوهتز جيه دي (يونيو 2006). "يتم نسخ الحمض النووي الريبوزي غير المشفر Evf-2 من المنطقة المحفوظة للغاية Dlx-5/6 ويعمل كمنشط نسخ مشترك لـ Dlx-2" . الجينات والتطور . 20 (11): 1470-1484 . doi : 10.1101/gad.1416106 . PMC 1475760. PMID 16705037 .  
  17. ↑ لو إس، لو جيه واي، ليو إل، ين واي، تشين سي، هان إكس، وآخرون . (مايو 2016). "تنظيم التعبير الجيني وتمايز السلالة في الخلايا متعددة القدرات بواسطة الحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر المتباين" . مجلة Cell Stem Cell . 18 (5): 637-52 . doi : 10.1016/j.stem.2016.01.024 . PMID 26996597 .  
  18. ↑ إيوينغ إيه دي، بالينجر تي جيه، إيرل دي، هاريس سي سي، دينغ إل، ويلسون آر كيه، هاوسلر دي (مارس 2013). " يؤدي النسخ العكسي للجينات إلى تنوع بنيوي في جينومات الثدييات" . علم الأحياء الجينومي . 14 (3) R22. doi : 10.1186/gb-2013-14-3-r22 . PMC 3663115. PMID 23497673 .  
  19. ↑ ماتليك ك، ريديك ك، سبيك م (2006). "محفز L1 المضاد للجينات يحفز النسخ النسيجي المحدد للجينات البشرية" . مجلة الطب الحيوي والتكنولوجيا الحيوية . 2006 (1) 71753. doi : 10.1155/JBB/2006/71753 . PMC 1559930. PMID 16877819 .  
  20. 1 2 بوريجارد أ، كورسيو إم جيه، بيلفورت إم (2008). "التفاعل بين العناصر القابلة للنقل الرجعي ومضيفيها" . المراجعة السنوية لعلم الوراثة . 42 : 587-617 . doi : 10.1146/annurev.genet.42.110807.091549 . PMC 2665727. PMID 18680436 .  
  21. 1 2 3 بون أ، برونيه ف، غاليانا-أرنو د، شولتيس س، فولف ج ن (2008). " العناصر القابلة للنقل كمحركات للتنوع الجينومي والبيولوجي في الفقاريات". أبحاث الكروموسومات . 16 (1): 203-215 . doi : 10.1007/s10577-007-1202-6 . PMID 18293113. S2CID 10510149 .  
  22. 1 2 3 سينغر إم إف (مارس 1982). "SINEs وLINEs: تسلسلات متناثرة قصيرة وطويلة متكررة بكثرة في جينومات الثدييات". الخلية . 28 ( 3): 433-434 . doi : 10.1016/0092-8674(82)90194-5 . PMID 6280868. S2CID 22129236 .  
  23. ↑ غوغفادزه إي، بوزدين أ (ديسمبر 2009). " العناصر الرجعية وتأثيرها على تطور الجينوم ووظائفه" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 66 (23): 3727-42 . doi : 10.1007/ s00018-009-0107-2 . PMC 11115525. PMID 19649766. S2CID 23872541 .   
  24. 1 2 3 4 5 6 راينهارت، تي. أ.، غراهن، ر. أ.، ويشمان، هـ. أ. (2005). "انقراض عناصر SINE سبق انقراض عناصر LINE في القوارض السيغمودونتية: دلالات على ديناميكيات وآليات النقل العكسي". أبحاث علم الوراثة الخلوية والجينوم . 110 ( 1-4 ): 416-25 . doi : 10.1159/000084974 . PMID 16093694. S2CID 36518754 .  
  25. ↑ كوردو آر، باتزر إم إيه (أكتوبر 2009). "تأثير العناصر المتنقلة الرجعية على تطور الجينوم البشري" . مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 10 (10): 691-703 . doi : 10.1038/nrg2640 . PMC 2884099. PMID 19763152 .  
  26. 1 2 وانغ و، كيركنس إي إف (ديسمبر 2005). "العناصر المتناثرة القصيرة (SINEs) مصدر رئيسي للتنوع الجينومي لدى الكلاب" . أبحاث الجينوم . 15 (12): 1798-1808 . doi : 10.1101/gr.3765505 . PMC 1356118. PMID 16339378 .  
  27. ↑ تشالوبين د، نافيل م، بلارد ف، غاليانا د، فولف ج ن (يناير 2015). "تحليل مقارن للعناصر القابلة للنقل يُبرز تنوع وتطور الموبيلوم في الفقاريات" . علم الأحياء التطوري وعلم الجينوم . 7 (2): 567-80 . doi : 10.1093 / gbe/evv005 . PMC 4350176. PMID 25577199 .  
  28. ↑ كراميروف د.أ، فاسيتزكي ن.س (ديسمبر 2011). " أصل وتطور عناصر SINE في الجينومات حقيقية النواة" . الوراثة . 107 (6): 487-95 . Bibcode : 2011Hered.107..487K . doi : 10.1038/hdy.2011.43 . PMC 3242629. PMID 21673742 .  
  29. ↑ فاوست، جيه. إيه.، وكاواهارا، تي.، وواتانابي، إتش.، وياسوي، واي. (يونيو 2006) . "عائلة SINE واسعة الانتشار في المملكة النباتية وتاريخها التطوري". بيولوجيا النبات الجزيئية . 61 (3): 505-514 . Bibcode : 2006PMolB..61..505F . doi : 10.1007/s11103-006-0026-7 . PMID 16830182. S2CID 7840648 .  
  30. ↑ سيبت كيه إم، شميدت تي، هيتكام تي (فبراير 2020). "يُعرّف نطاق أنجيو المحفوظ في الطرف 3' عائلة فائقة من العناصر النووية المتناثرة القصيرة (SINEs) في النباتات العليا" . مجلة النبات . 101 (3): 681-699 . Bibcode : 2020PlJ...101..681S . doi : 10.1111/tpj.14567 . PMID 31610059 . 
  31. 1 2 3 4 5 6 7 سكارباتو م، أنجيليني س، كوكا إي، بالوتا م م، موريسكالكي م أ، كابريليوني ت (سبتمبر 2015). "عناصر الحمض النووي المتناثرة القصيرة وmiRNAs: طبقة تنظيم جيني خفية جديدة في سمك الزيبرا؟". أبحاث الكروموسومات . 23 (3): 533-44 . doi : 10.1007/s10577-015-9484-6 . PMID 26363800. S2CID 16759020 .  
  32. ↑ أمبروز ، ف. (سبتمبر 2004). "وظائف الحمض النووي الريبوزي الميكروي في الحيوانات". مجلة نيتشر . 431 (7006): 350-355 . رمز Bibcode : 2004Natur.431..350A . doi : 10.1038/nature02871 . PMID 15372042. S2CID 205210153 .  
  33. ↑ لي واي، كيم إم، هان جيه، يوم كيه إتش، لي إس، بايك إس إتش، كيم في إن (أكتوبر 2004). "تُنسخ جينات الميكرو آر إن إيه بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي II" . مجلة EMBO . 23 (20): 4051-60 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600385 . PMC 524334. PMID 15372072 .  
  34. ↑ فالر م، غو ف (نوفمبر 2008). "تكوين الحمض النووي الريبوزي الميكروي: هناك أكثر من طريقة لتحقيق الهدف" . بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - آليات تنظيم الجينات . 1779 (11): 663-667 . doi : 10.1016/j.bbagrm.2008.08.005 . PMC 2633599. PMID 18778799 .  
  35. ↑ لاو، ن. س.، ليم، ل. ب.، وينشتاين، إ. ج.، بارتل، د. ب. (أكتوبر 2001). "فئة وفيرة من الحمض النووي الريبوزي الصغير ذي أدوار تنظيمية محتملة في دودة Caenorhabditis elegans". مجلة ساينس . 294 (5543): 858-862 . Bibcode : 2001Sci ...294..858L . doi : 10.1126/science.1065062 . PMID: 11679671. S2CID : 43262684 .  
  36. ↑ كاي إكس، هاغيدورن سي إتش، كولين بي آر (ديسمبر 2004). "تُعالَج الميكرو آر إن إيه البشري من نسخ مُغطّاة ومُذيّلة بذيل متعدد الأدينين، والتي يمكن أن تعمل أيضًا كـ mRNA" . آر إن إيه . 10 (12): 1957-66 . doi : 10.1261/rna.7135204 . PMC 1370684. PMID 15525708 .  
  37. ^ لي واي، آهن سي، هان جي، تشوي إتش، كيم جي، يم جي، وآخرون . (سبتمبر 2003). “يبدأ RNase III Drosha النووي معالجة microRNA”. طبيعة . 425 (6956): 415– 9. بيب كود : 2003Natur.425..415L . دوى : 10.1038 / طبيعة 01957 . بميد 14508493 . S2CID 4421030 .   
  38. ↑ بارتل، د.ب. (يناير 2004). "الميكرو آر إن إيه: علم الجينوم، والتكوين الحيوي، والآلية، والوظيفة" . مجلة الخلية . 116 (2): 281-297 . doi : 10.1016/s0092-8674(04)00045-5 . PMID 14744438 . 
  39. ↑ شوارتز دي إس، زامور بي دي (مايو 2002). "لماذا تعيش جزيئات miRNA داخل مركب miRNP؟" . الجينات والتطور . 16 (9): 1025-31 . doi : 10.1101/gad.992502 . PMID 12000786 . 
  40. ↑ برات إيه جيه، ماكراي آي جيه (يوليو 2009). "مركب إسكات الجينات المُحفَّز بالحمض النووي الريبي: آلة متعددة الاستخدامات لإسكات الجينات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 284 (27): 17897-17901 . doi : 10.1074/jbc.R900012200 . PMC 2709356. PMID 19342379 .  
  41. ↑ نات د، يوهانسون إ، فاريسجو ت، لودفيجسون ج، ثورسيل أ (2015). "ارتفاع مستوى الكورتيزول لدى الأطفال في سن الخامسة يُسبب فقدان مثيلة الحمض النووي في عناصر النسخ العكسي SINE: دور محتمل لـ ZNF263 في الأمراض المرتبطة بالإجهاد" . علم التخلق السريري . 7 (1) 91. doi : 10.1186/s13148-015-0123-z . PMC 4559301. PMID 26339299 .  
  42. ١ ٢ بال أ، سريفاستافا ت، شارما م ك، مهنديراتا م، داس ب، سينها س، تشاتوبادياي ب (نوفمبر ٢٠١٠). "يساهم المثيلة الشاذة وما يرتبط بها من تحريك نسخي لعناصر Alu في عدم استقرار الجينوم في نقص الأكسجين" . مجلة الطب الخلوي والجزيئي . ١٤ (١١): ٢٦٤٦-٥٤ . doi : 10.1111/j.1582-4934.2009.00792.x . PMC 4373486. PMID 19508390 .  
  43. 1 2 بيترسون م، تشاندلر ف ل، بوسكو ج (أبريل 2013). "يرتبط ارتفاع مستوى التعبير عن الحمض النووي الريبوزي SINE بانخفاض تنظيم BRCA1 بعد النسخ" . الجينات . 4 ( 2): 226-43 . doi : 10.3390/genes4020226 . PMC 3899967. PMID 24705161 .  
  44. 1 2 فانين إي إف (1985). "الجينات الكاذبة المُعالَجة: خصائصها وتطورها". المراجعة السنوية لعلم الوراثة . 19 : 253-272 . doi : 10.1146/annurev.ge.19.120185.001345 . PMID 3909943 . 
  45. ↑ ديوانيو إم، إسناولت سي، هايدمان تي (سبتمبر 2003). "النسخ العكسي لتسلسلات Alu الموسومة بواسطة LINE". علم الوراثة الطبيعية . 35 (1): 41-48 . doi : 10.1038/ng1223 . PMID 12897783. S2CID 32151696 .  
  46. ↑ جوركا، ج. (ديسمبر 2004). "الأثر التطوري للعناصر المتكررة من نوع Alu في الإنسان". الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 14 (6): 603-608 . doi : 10.1016/j.gde.2004.08.008 . PMID 15531153 .