قابلية التطور

تُعرَّف قابلية التطور بأنها قدرة النظام على التطور التكيفي . وهي قدرة مجموعة من الكائنات الحية ليس فقط على توليد تنوع جيني ، بل على توليد تنوع جيني تكيفي ، وبالتالي التطور من خلال الانتقاء الطبيعي . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
لكي يتطور الكائن الحي عن طريق الانتقاء الطبيعي، يجب أن يكون هناك حد أدنى من احتمالية أن تكون المتغيرات الوراثية الجديدة مفيدة. من المتوقع أن تكون الطفرات العشوائية ضارة في الغالب ، ما لم تحدث في تسلسلات الحمض النووي عديمة الوظيفة . الطفرات المفيدة نادرة دائمًا، ولكن إذا كانت نادرة جدًا، فلن يحدث التكيف . أظهرت المحاولات المبكرة الفاشلة لتطوير برامج الحاسوب عن طريق الطفرات العشوائية والانتقاء [ 4 ] أن قابلية التطور ليست أمرًا مفروغًا منه، بل تعتمد على تمثيل البرنامج كبنية بيانات، لأن هذا يحدد كيفية ارتباط التغييرات في البرنامج بالتغييرات في سلوكه. [ 5 ] وبالمثل، تعتمد قابلية الكائنات الحية للتطور على خريطة النمط الجيني-النمط الظاهري . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] هذا يعني أن الجينومات مُهيكلة بطرق تجعل التغييرات المفيدة أكثر احتمالًا. وقد اعتُبر هذا دليلًا على أن التطور قد خلق مجموعات من الكائنات الحية أكثر ملاءمة وأكثر قدرة على التطور.
تعريفات بديلة
يصف أندرياس فاغنر [ 9 ] تعريفين لقابلية التطور. وفقًا للتعريف الأول، يكون النظام البيولوجي قابلاً للتطور:
- إذا أظهرت خصائصها تنوعًا وراثيًا قابلًا للتوريث، و
- إذا كان الانتقاء الطبيعي قادراً على تغيير هذه الخصائص.
وفقاً للتعريف الثاني، فإن النظام البيولوجي قابل للتطور:
- إذا كان بإمكانها اكتساب وظائف جديدة من خلال التغيير الجيني، وهي وظائف تساعد الكائن الحي على البقاء والتكاثر.
على سبيل المثال، لنفترض وجود إنزيم له عدة أليلات في المجموعة السكانية. يحفز كل أليل التفاعل نفسه، ولكن بمستويات نشاط مختلفة. مع ذلك، حتى بعد ملايين السنين من التطور، واستكشاف العديد من التسلسلات ذات الوظائف المتشابهة، قد لا توجد طفرة تُكسب هذا الإنزيم القدرة على تحفيز تفاعل مختلف. لذا، فرغم أن نشاط الإنزيم قابل للتطور بالمعنى الأول، إلا أن ذلك لا يعني بالضرورة أن وظيفته قابلة للتطور بالمعنى الثاني. مع ذلك، فإن كل نظام قابل للتطور بالمعنى الثاني يجب أن يكون قابلاً للتطور بالمعنى الأول أيضاً.
يُصنّف ماسيمو بيجليوتشي [ 10 ] التعريفات إلى ثلاثة أنواع، بحسب النطاق الزمني. يتوافق النوع الأول مع تعريف فاغنر الأول، ويمثل النطاقات الزمنية القصيرة جدًا التي يصفها علم الوراثة الكمي . [ 11 ] [ 12 ] ويقسم بيجليوتشي تعريف فاغنر الثاني إلى فئتين، إحداهما تمثل النطاقات الزمنية المتوسطة التي يمكن دراستها باستخدام علم الوراثة السكانية ، والأخرى تمثل الابتكارات الشكلية النادرة للغاية طويلة الأمد.
يتضمن تعريف بيجليوتشي الثاني للتطور مفهوم ألتنبرغ الكمي [ 3 ] للتطور، حيث لا يُمثل رقمًا واحدًا، بل الطرف العلوي الكامل لتوزيع لياقة النسل الناتج عن المجموعة السكانية. واعتُبرت هذه الكمية خاصية "محلية" للحالة الآنية للمجموعة السكانية، وكان من الضروري تكاملها على مسار تطور المجموعة السكانية، وعلى العديد من المجموعات السكانية المحتملة، لإعطاء مقياس أكثر شمولية للتطور.
توليد المزيد من التنوع
زيادة التباين الظاهري القابل للتوريث تعني زيادة قابلية التطور. ورغم أن الطفرة هي المصدر الأساسي للتباين الوراثي، إلا أن تباديلها وتراكيبها تُحدث فرقًا كبيرًا أيضًا. يُولّد التكاثر الجنسي تباينًا أكبر (وبالتالي قابلية تطور أكبر) مقارنةً بالتكاثر اللاجنسي (انظر تطور التكاثر الجنسي ). وتزداد قابلية التطور أكثر بتوليد تباين أكبر عندما يكون الكائن الحي مُجهدًا، [ 13 ] وبالتالي من المرجح أن يكون أقل تكيفًا، ولكن بتباين أقل عندما يكون الكائن الحي في حالة جيدة. يمكن تعديل مقدار التباين المُولّد بطرق عديدة، على سبيل المثال من خلال معدل الطفرة ، واحتمالية التكاثر الجنسي مقابل اللاجنسي ، واحتمالية التزاوج الخارجي مقابل التزاوج الداخلي ، والانتشار ، والوصول إلى متغيرات خفية سابقًا من خلال تفعيل مُكثّف تطوري . يزيد حجم الجماعة الكبير من تدفق الطفرات الجديدة في كل جيل. [ 14 ]
المتانة وقابلية التطور
تعتمد العلاقة بين المتانة وقابلية التطور على إمكانية تجاهل إعادة التركيب الجيني. [ 15 ] يمكن عمومًا تجاهل إعادة التركيب الجيني في التجمعات اللاجنسية وللصفات المتأثرة بجينات مفردة.
بدون إعادة التركيب
لا تزيد المتانة في مواجهة الطفرات من قابلية التطور بالمعنى الأول. ففي الكائنات الحية ذات المتانة العالية، يكون تأثير الطفرات على النمط الظاهري أقل منه في الكائنات الحية ذات المتانة المنخفضة. وبالتالي، تقلل المتانة من مقدار التباين الجيني الموروث الذي يمكن أن يؤثر عليه الانتخاب الطبيعي. مع ذلك، قد تسمح المتانة باستكشاف مناطق واسعة من فضاء النمط الجيني ، مما يزيد من قابلية التطور وفقًا للمعنى الثاني. [ 9 ] [ 15 ] حتى في غياب التنوع الجيني، تتمتع بعض الأنماط الجينية بقابلية تطور أعلى من غيرها، ويمكن أن يزيد الانتخاب الطبيعي للمتانة من "ثراء الجوار" للأنماط الظاهرية التي يمكن الوصول إليها من نفس النمط الجيني الأولي عن طريق الطفرة. على سبيل المثال، أحد أسباب كون العديد من البروتينات أقل متانة في مواجهة الطفرات هو استقرارها الديناميكي الحراري الهامشي ، ومعظم الطفرات تقلل من هذا الاستقرار أكثر. أما البروتينات الأكثر استقرارًا حراريًا فتتحمل نطاقًا أوسع من الطفرات وتكون أكثر قابلية للتطور. [ 16 ] بالنسبة للصفات متعددة الجينات، يُسهم ثراء الجوار في قابلية التطور أكثر من التنوع الجيني أو "الانتشار" عبر فضاء النمط الجيني. [ 17 ]
مع إعادة التركيب
قد تؤدي المتانة المؤقتة، أو التوجيه الجيني ، إلى تراكم كميات كبيرة من التباين الجيني الخفي. في بيئة جديدة أو خلفية جينية جديدة، قد يظهر هذا التباين وقد يكون تكيفيًا في بعض الأحيان. [ 15 ] [ 18 ]
العوامل المؤثرة على قابلية التطور من خلال المتانة
تتمتع الشفرات الوراثية المختلفة بالقدرة على تغيير المتانة وقابلية التطور من خلال تغيير تأثير التغيرات الطفرية أحادية القاعدة. [ 19 ] [ 20 ]
الاستكشاف المسبق
عندما توجد مقاومة للطفرات ، تستمر العديد من الطفرات في حالة خفية. تميل الطفرات إلى الانقسام إلى فئتين: إما ذات تأثير سيئ للغاية أو تأثير ضئيل للغاية، وقليل منها يقع بينهما. [ 21 ] [ 22 ] أحيانًا، لا تكون هذه الطفرات غير مرئية تمامًا، ولكنها مع ذلك ذات تأثيرات نادرة، بنسبة نفاذية منخفضة جدًا . عندما يحدث هذا، يقوم الانتخاب الطبيعي باستبعاد الطفرات السيئة للغاية، بينما يترك الطفرات الأخرى دون تأثير يُذكر. [ 23 ] [ 24 ] في حين أن التطور لا يملك "بصيرة" لمعرفة البيئة التي سيواجهها في المستقبل، فإن بعض الطفرات تُسبب اضطرابًا كبيرًا في عملية بيولوجية أساسية، ولن تكون قابلة للتكيف في أي بيئة. يؤدي فحص هذه الطفرات مسبقًا إلى مخزونات مُهيأة مسبقًا من التباين الجيني الخفي.
ثمة طريقة أخرى لاستكشاف الأنماط الظاهرية، قبل الالتزام الجيني الراسخ، وهي التعلم. فالكائن الحي الذي يتعلم يختبر أنماطًا ظاهرية مختلفة خلال مراحل نموه المبكرة، ثم يلتزم بما أثبت فعاليته. وفي مراحل لاحقة من التطور، يمكن استيعاب النمط الظاهري الأمثل جينيًا ليصبح السلوك السائد بدلًا من كونه سلوكًا نادرًا. يُعرف هذا بتأثير بالدوين ، وهو ما قد يزيد من قابلية التطور. [ 25 ] [ 26 ]
يُؤدي التعلم إلى توجيه الأنماط الظاهرية نحو اتجاه مفيد. لكن التسطيح الاستكشافي لمشهد اللياقة قد يزيد من قابلية التطور حتى عندما لا يكون له اتجاه محدد، على سبيل المثال عندما يكون التسطيح ناتجًا عن أخطاء عشوائية في العمليات الجزيئية و/أو التطورية. يمكن أن تحدث هذه الزيادة في قابلية التطور عندما يواجه التطور عبور "وادي" في مشهد تكيفي . هذا يعني وجود طفرتين ضارتين كلٌ على حدة، لكنهما مفيدتان مجتمعتين. يمكن لهذه التركيبات أن تتطور بسهولة أكبر عندما يتم تسطيح المشهد أولًا، ثم يتم تثبيت النمط الظاهري المكتشف عن طريق الاستيعاب الجيني . [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]
نمطية التصميم
إذا أثرت كل طفرة على جميع الصفات، فإن الطفرة التي تُحسّن صفة ما ستكون ضارة بالصفات الأخرى. وهذا يعني أن الطفرات لن تكون مفيدة بشكل عام. ولكن إذا اقتصر تعدد التأثيرات الجينية على الوحدات الوظيفية ، فإن الطفرات تؤثر على صفة واحدة فقط في كل مرة، ويصبح التكيف أقل تقييدًا. ففي شبكة جينية نمطية، على سبيل المثال، قد يتطور جين يحفز مجموعة محدودة من الجينات الأخرى التي تتحكم في صفة معينة خاضعة للانتقاء بسهولة أكبر من جين يحفز أيضًا مسارات جينية أخرى تتحكم في صفات غير خاضعة للانتقاء. [ 30 ] كما تُظهر الجينات الفردية نمطية. فقد تسمح طفرة في أحد العناصر التنظيمية المجاورة لمنطقة محفز الجين بتغيير تعبير الجين في أنسجة أو مراحل نمو أو ظروف بيئية محددة فقط، بدلًا من تغيير نشاط الجين في الكائن الحي بأكمله في وقت واحد. [ 30 ]
تطور قابلية التطور
بينما قد يكون التباين الذي يُفضي إلى قابلية عالية للتطور مفيدًا على المدى البعيد، إلا أن معظم هذا التباين يُرجّح أن يكون عيبًا على المدى القريب. فعلى سبيل المثال، قد يبدو للوهلة الأولى أن زيادة معدل الطفرات عبر أليل مُطفر من شأنه أن يزيد من قابلية التطور. ولكن في حالة متطرفة، إذا كان معدل الطفرات مرتفعًا جدًا، فإن جميع الأفراد سيموتون أو على الأقل سيحملون عبئًا طفريًا ثقيلًا . ومن المرجح أن يكون الانتقاء قصير المدى للتباين المنخفض في معظم الأحيان أقوى من الانتقاء طويل المدى لقابلية التطور، مما يُصعّب على الانتقاء الطبيعي إحداث تطور قابلية التطور. كما تؤثر قوى انتقاء أخرى على توليد التباين؛ فعلى سبيل المثال، قد تكون الطفرة وإعادة التركيب جزئيًا نتاجًا ثانويًا لآليات التعامل مع تلف الحمض النووي. [ 31 ]
عندما يكون معدل إعادة التركيب منخفضًا، قد تنتقل الأليلات الطافرة أحيانًا مع نجاح الطفرات التكيفية التي تُسببها. في هذه الحالة، يمكن أن يحدث الانتقاء على مستوى السلالة. [ 32 ] قد يُفسر هذا سبب شيوع رؤية الأليلات الطافرة خلال التطور التجريبي للميكروبات. كما يمكن للأليلات الطافرة أن تتطور بسهولة أكبر عندما تزيد معدلات الطفرات في تسلسلات الحمض النووي المجاورة فقط، وليس عبر الجينوم بأكمله: يُعرف هذا باسم الموضع الطارئ.
يُعدّ تطور قابلية التطور أقل إثارةً للجدل إذا حدث عبر تطور التكاثر الجنسي ، أو عبر ميل آليات توليد التباين إلى أن تصبح أكثر نشاطًا عندما يتعرض الكائن الحي للإجهاد. وقد يكون بريون الخميرة [PSI+] مثالًا آخر على تطور قابلية التطور من خلال السعة التطورية . [ 33 ] [ 34 ] المكثف التطوري هو مفتاح يُشغّل التباين الجيني ويُطفئه. وهذا يُشبه إلى حد كبير التحوّط من مخاطر أن تكون البيئة المستقبلية مُشابهة أو مُختلفة. [ 35 ] كما تتنبأ النماذج النظرية بتطور قابلية التطور عبر النمطية. [ 36 ] عندما تكون تكاليف قابلية التطور قصيرة الأجل بما فيه الكفاية، قد تكون السلالات الأكثر قابلية للتطور هي الأكثر نجاحًا على المدى الطويل. [ 37 ] ومع ذلك، غالبًا ما تُرفض فرضية أن قابلية التطور هي تكيف لصالح فرضيات بديلة، مثل تقليل التكاليف. [ 10 ]
التطبيقات
لدراسة قابلية التطور تطبيقات عملية. ففي هندسة البروتينات ، تُعدّ قابلية التطور العالية مرغوبة، بينما تُشكّل قابلية التطور العالية في مسببات الأمراض والآفات الزراعية خطراً على المصالح البشرية. تُعرَّف قابلية تطور البروتين بأنها قدرة البروتين على اكتساب تنوّع في التسلسل ومرونة في البنية، مما يُمكّنه من التطور نحو وظيفة جديدة. [ 38 ]
في هندسة البروتينات ، يهدف كل من التصميم العقلاني والتطور الموجه إلى إحداث تغييرات سريعة من خلال طفرات ذات تأثيرات كبيرة. [ 39 ] [ 40 ] ومع ذلك، فإن هذه الطفرات عادةً ما تُدمر وظيفة الإنزيم أو على الأقل تُقلل من قدرته على تحمل المزيد من الطفرات . [ 41 ] [ 42 ] أصبح تحديد البروتينات القابلة للتطور والتحكم في قابليتها للتطور ضروريًا بشكل متزايد لتحقيق تعديلات وظيفية أكبر للإنزيمات. [ 43 ] كما تُدرس البروتينات غالبًا كجزء من العلوم الأساسية للتطور، لأن الخصائص الفيزيائية الحيوية والوظائف الكيميائية يُمكن تغييرها بسهولة من خلال بضع طفرات. [ 44 ] [ 45 ] تستطيع البروتينات الأكثر قابلية للتطور تحمل نطاق أوسع من تغييرات الأحماض الأمينية، مما يسمح لها بالتطور نحو وظائف جديدة. تُعد دراسة قابلية التطور ذات أهمية جوهرية لفهم التطور طويل الأمد لعائلات البروتينات الفائقة . [ 46 ] [ 47 ] [ 48 ] [ 49 ] [ 50 ]
تتمتع العديد من مسببات الأمراض البشرية بالقدرة على التطور. فالفيروسات والبكتيريا والفطريات والسرطانات تتطور لتصبح مقاومة لدفاعات الجهاز المناعي للمضيف ، وكذلك للأدوية . [ 51 ] [ 52 ] [ 53 ] وتظهر هذه المشاكل نفسها في الزراعة مع مقاومة المبيدات الحشرية [ 54 ] ومبيدات الأعشاب [ 55 ] . ومن المحتمل أننا نواجه نهاية العمر الافتراضي لمعظم المضادات الحيوية المتاحة . [ 56 ] ويتطلب التنبؤ بتطور مسببات الأمراض وقابليتها للتطور [ 57 ] ، ووضع استراتيجيات لإبطاء أو تجنب تطور المقاومة، معرفة أعمق بالقوى المعقدة التي تحرك التطور على المستوى الجزيئي. [ 58 ]
يُقترح أن يكون فهم قابلية التطور بشكل أفضل جزءًا من توليف تطوري موسع . [ 59 ] [ 60 ] [ 61 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ كولجريف ن، كولينز س (مايو 2008). "التطور التجريبي: التطور التجريبي وقابلية التطور" . الوراثة . 100 (5): 464-470 . doi : 10.1038/sj.hdy.6801095 . PMID 18212804 .
- ↑ كيرشنر م، جيرهارت ج (يوليو 1998). "قابلية التطور" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (15): 8420-7 . Bibcode : 1998PNAS...95.8420K . doi : 10.1073 / pnas.95.15.8420 . PMC 33871. PMID 9671692 .
- 1 2 ألتنبرغ، ل. (1995). "نمو الجينوم وتطور خريطة النمط الجيني-النمط الظاهري". التطور والحوسبة الحيوية . سلسلة محاضرات في علوم الحاسوب. المجلد 899. الصفحات 205-259 . CiteSeerX 10.1.1.493.6534 . doi : 10.1007/3-540-59046-3_11 . ISBN 978-3-540-59046-0.
- ↑ فريدبيرغ آر إم (1958). "آلة التعلم: الجزء الأول | ". مجلة آي بي إم للبحوث والتطوير . 2 (1): 2-13 . doi : 10.1147/rd.21.0002 .
- ↑ ألتنبرغ ل (1994). كينير، كينيث (محرر). "تطور قابلية التطور في البرمجة الجينية" . التقدم في البرمجة الجينية : 47-74 .
- ↑ فاغنر ، جي بي، وألتنبرغ، إل (يونيو 1996). "منظور: التكيفات المعقدة وتطور قابلية التطور" . التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 50 (3): 967-976 . doi : 10.1111 / j.1558-5646.1996.tb02339.x . JSTOR 2410639. PMID 28565291. S2CID 21040413 .
- ↑ بيانكو، سيمون (1 أبريل 2022). "الذكاء الاصطناعي: الصديق الأمثل لمهندسي الأحياء". مجلة GEN للتكنولوجيا الحيوية . 1 (2). ماري آن ليبرت : 140-141 . doi : 10.1089/genbio.2022.29027.sbi . ISSN 2768-1572 . S2CID 248313305 .
- ^ Vaishnav ED، de Boer CG، Molinet J، Yassour M، Fan L، Adiconis X، Thompson DA، Levine JZ، Cubillos FA، Regev A (مارس 2022). "تطور وقابلية التطور وهندسة الحمض النووي التنظيمي للجينات" . طبيعة . 603 (7901): 455– 463. بيب كود : 2022Natur.603..455V . دوى : 10.1038/s41586-022-04506-6 . بمك 8934302 . بميد 35264797 .
- 1 2 فاغنر أ (2005). المتانة وقابلية التطور في الأنظمة الحية . دراسات برينستون في التعقيد. مطبعة جامعة برينستون. ISBN 978-0-691-12240-3.
- 1 2 بيجليوتشي م (يناير 2008). "هل التطور قابل للتطور؟" (ملف PDF) . مجلة Nature Reviews Genetics . 9 (1): 75-82 . doi : 10.1038/nrg2278 . PMID 18059367. S2CID 3164124 .
- ↑ هول، د. (يناير 1992). "مقارنة قابلية التطور وتغير الصفات الكمية" . علم الوراثة . 130 (1): 195-204 . doi : 10.1093/genetics/130.1.195 . PMC 1204793. PMID 1732160 .
- ↑ هانسن، تي إف، بيلابون، سي، هول، دي (سبتمبر 2011). "الوراثة ليست قابلية التطور". علم الأحياء التطوري . 38 (3): 258-277 . Bibcode : 2011EvBio..38..258H . doi : 10.1007/s11692-011-9127-6 . S2CID 11359207 .
- ↑ رام ي، هاداني ل (يوليو 2012). "تطور الطفرات المفرطة الناتجة عن الإجهاد في التجمعات اللاجنسية" . التطور ؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 66 (7): 2315-2328 . doi : 10.1111/j.1558-5646.2012.01576.x . PMID 22759304. S2CID 35770307 .
- ↑ كاراسوف تي، ميسر بي دبليو، بيتروف دي إيه (يونيو 2010). "دليل على أن التكيف في ذبابة الفاكهة لا يقتصر على الطفرات في مواقع مفردة" . مجلة PLOS Genetics . 6 (6) e1000924. doi : 10.1371/journal.pgen.1000924 . PMC 2887467. PMID 20585551 .
- 1 2 3 ماسيل ج ، تروتر إم في (سبتمبر 2010). "المتانة وقابلية التطور" . اتجاهات في علم الوراثة . 26 (9): 406-14 . doi : 10.1016 / j.tig.2010.06.002 . PMC 3198833. PMID 20598394 .
- ↑ بلوم، جيه دي، ولابثافيكول، إس تي، وأوتي، سي آر، وأرنولد، إف إتش (أبريل 2006). " استقرار البروتين يعزز قابلية التطور" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (15): 5869-74 . Bibcode : 2006PNAS..103.5869B . doi : 10.1073/pnas.0510098103 . PMC 1458665. PMID 16581913 .
- ↑ راجون إي، ماسيل جيه (أبريل 2013). " التطور التعويضي وأصول الابتكارات" . علم الوراثة . 193 (4): 1209-220 . doi : 10.1534/genetics.112.148627 . PMC 3606098. PMID 23335336 .
- ↑ ويتاكر ج، بيندر أ (مارس 2010). "الانحلال: مبدأ تصميم لتحقيق المتانة وقابلية التطور". مجلة البيولوجيا النظرية . 263 (1): 143-153 . arXiv : 0907.0510 . Bibcode : 2010JThBi.263..143W . doi : 10.1016/ j.jtbi.2009.11.008 . PMID 19925810. S2CID 11511132 .
- ↑ فيرنبرغ إي، أوسترماير إم (أغسطس 2013). "الشفرة الوراثية تقيد التطور الدارويني وتسهله في الوقت نفسه" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (15): 7420-7428 . doi : 10.1093/nar/ gkt536 . PMC 3753648. PMID 23754851 .
- ↑ باينز جي، وينكلر جي دي ، باينز إيه، جيل آر تي (نوفمبر 2017). "إعادة هيكلة الشفرة الوراثية لزيادة قابلية التطور" . mBio . 8 (6). doi : 10.1128/mBio.01654-17 . PMC 5686537. PMID 29138304 .
- ↑ إير-ووكر أ، كايتلي ب د (أغسطس 2007). "توزيع تأثيرات اللياقة للطفرات الجديدة". مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 8 (8): 610-618 . doi : 10.1038/nrg2146 . PMID 17637733. S2CID 10868777 .
- ↑ فودالا أ، كورونا ر (أغسطس 2009). "انخفاض وتيرة الطفرات ذات التأثيرات الضارة بشدة ولكنها غير مميتة على اللياقة". التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 63 (8): 2164-2171 . doi : 10.1111 / j.1558-5646.2009.00713.x . PMID 19473394. S2CID 12103318 .
- ↑ ماسيل ج (مارس 2006). " التنوع الجيني الخفي غني بالتكيفات المحتملة" . علم الوراثة . 172 (3): 1985-1991 . doi : 10.1534/genetics.105.051649 . PMC 1456269. PMID 16387877 .
- ↑ راجون إي، ماسيل جيه (يناير 2011). "تطور معدلات الخطأ الجزيئي وعواقبه على قابلية التطور" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 108 ( 3): 1082-1087 . Bibcode : 2011PNAS..108.1082R . doi : 10.1073/pnas.1012918108 . PMC 3024668. PMID 21199946 .
- ↑ هينتون جي إي، نولان إس جيه (1987). "كيف يمكن للتعلم أن يوجه التطور". الأنظمة المعقدة . 1 : 495-502 .
- ↑ بورنشتاين إي، ميليجسون آي، روبين إي (سبتمبر 2006). "تأثير المرونة الظاهرية على التطور في بيئات اللياقة متعددة القمم" . مجلة علم الأحياء التطوري . 19 (5): 1555-1570 . doi : 10.1111/j.1420-9101.2006.01125.x . PMID 16910985. S2CID 6964065 .
- ↑ كيم ي (أغسطس 2007). "معدل تحولات الذروة التكيفية مع المتانة الجينية الجزئية". التطور ؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 61 (8): 1847-1856 . doi : 10.1111/j.1558-5646.2007.00166.x . PMID 17683428. S2CID 13150906 .
- ↑ وايت هيد دي جيه، ويلك سي أو، فيرنازوبريس دي، بورنبرغ-باور إي (مايو 2008). "تأثير التنبؤ بالطفرات الظاهرية" . بيولوجي دايركت . 3 (1): 18. doi : 10.1186/1745-6150-3-18 . PMC 2423361. PMID 18479505 .
- ↑ غريسولد سي كيه، ماسيل جيه (يونيو 2009). "يمكن للتكيفات المعقدة أن تدفع تطور المكثف [ PSI ] ، حتى مع معدلات واقعية للتكاثر الجنسي في الخميرة" . PLOS Genetics . 5 (6) e1000517. doi : 10.1371/journal.pgen.1000517 . PMC 2686163. PMID 19521499 .
- 1 2 أولسون-مانينغ سي إف، فاغنر إم آر، ميتشل-أولدز تي (ديسمبر 2012). "التطور التكيفي: تقييم الدعم التجريبي للتنبؤات النظرية" . مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 13 (12): 867-77 . doi : 10.1038/nrg3322 . PMC 3748133. PMID 23154809 .
- ↑ ميشود ، ر. إي. (1986). "حول اللياقة والتكيف ودورهما في التفسير التطوري". مجلة تاريخ علم الأحياء . 19 (2): 289-302 . doi : 10.1007/bf00138880 . PMID 11611993. S2CID 42288730 .
- ↑ إيشيل ، آي (1973). "اختيار الاستنساخ ومعدلات الطفرة المثلى". مجلة الاحتمالات التطبيقية . 10 (4): 728-738 . doi : 10.2307/3212376 . JSTOR 3212376. S2CID 123907349 .
- ↑ ماسيل ج ، بيرغمان أ (يوليو 2003). "تطور خصائص قابلية تطور بريون الخميرة [PSI+]". التطور ؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 57 (7): 1498-1512 . doi : 10.1111/j.0014-3820.2003.tb00358.x . PMID 12940355. S2CID 30954684 .
- ↑ لانكستر إيه كيه، بارديل جيه بي، ترو إتش إل، ماسيل جيه (فبراير 2010). "معدل الظهور التلقائي لبريون الخميرة [ PSI+ ] وآثاره على تطور خصائص قابلية تطور نظام [ PSI + ] " . علم الوراثة . 184 (2): 393-400 . doi : 10.1534/genetics.109.110213 . PMC 2828720. PMID 19917766 .
- ↑ كينغ، أو. دي.، وماسيل، ج. (ديسمبر 2007). "تطور التكيفات التحوطية لمواجهة السيناريوهات النادرة" . علم الأحياء السكاني النظري . 72 (4): 560-575 . Bibcode : 2007TPBio..72..560K . doi : 10.1016/ j.tpb.2007.08.006 . PMC 2118055. PMID 17915273 .
- ↑ دراغي ج، فاغنر جي بي (فبراير 2008). "تطور قابلية التطور في نموذج نمائي". التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 62 (2): 301-315 . doi : 10.1111/j.1558-5646.2007.00303.x . PMID 18031304. S2CID 11560256 .
- ↑ وودز آر جيه، باريك جيه إي، كوبر تي إف، شريستا يو، كاوث إم آر، لينسكي آر إي (مارس 2011). " الانتقاء من الدرجة الثانية لقابلية التطور في مجموعة كبيرة من بكتيريا الإشريكية القولونية" . مجلة ساينس . 331 (6023): 1433-1436 . Bibcode : 2011Sci...331.1433W . doi : 10.1126/science.1198914 . PMC 3176658. PMID 21415350 .
- ↑ سوسكين م، توفيق د.س. (أغسطس 2010). "التأثيرات الطفرية وتطور وظائف البروتين الجديدة". مجلة Nature Reviews Genetics . 11 (8): 572-582 . doi : 10.1038/nrg2808 . PMID 20634811. S2CID 8951755 .
- ↑ كارتر، بي جيه (مايو 2011). "مقدمة في العلاجات البروتينية الحالية والمستقبلية: منظور هندسة البروتين". بحوث الخلية التجريبية . 317 (9): 1261-1269 . doi : 10.1016/j.yexcr.2011.02.013 . PMID 21371474 .
- ↑ بوماريوس إيه إس، بلوم جيه كيه، أبراهامسون إم جيه (أبريل 2011). "وضع هندسة البروتين للمحفزات الحيوية: كيفية تصميم محفز حيوي ذي فائدة صناعية". الرأي الحالي في البيولوجيا الكيميائية . 15 (2): 194-200 . doi : 10.1016/j.cbpa.2010.11.011 . PMID 21115265 .
- ↑ توكوريكي ن، توفيق د.س. (أكتوبر 2009). "تأثيرات الطفرات على استقرار البروتين وقابليته للتطور". الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية . 19 (5): 596-604 . doi : 10.1016/j.sbi.2009.08.003 . PMID 19765975 .
- ↑ وانغ إكس، ميناسوف جي، شويتشيت بي كيه (يونيو 2002). "تطور إنزيم مقاومة المضادات الحيوية المقيد بمقايضات الاستقرار والنشاط". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 320 (1): 85-95 . doi : 10.1016/s0022-2836(02)00400-x . PMID 12079336 .
- ↑ أولوفلين، تي إل، وباتريك، دبليو إم، وماتسومورا، آي (أكتوبر 2006). "التاريخ الطبيعي كمؤشر على قابلية البروتين للتطور" . هندسة البروتين، والتصميم، والاختيار . 19 (10): 439-442 . doi : 10.1093/protein/gzl029 . PMID 16868005 .
- ^ سالفيردا إم إل، ديلوس إي، جورتر إف إيه، ديبيتس إيه جيه، فان دير أوست جيه، هوكسترا آر إف، توفيق دي إس، دي فيسر جا (مارس 2011). "الطفرات الأولية توجه مسارات بديلة لتطور البروتين" . علم الوراثة بلوس . 7 (3) هـ1001321. دوى : 10.1371/journal.pgen.1001321 . بمك 3048372 . بميد 21408208 .
- ↑ بلوم، جيه دي، ولابثافيكول، إس تي، وأوتي، سي آر، وأرنولد، إف إتش (أبريل 2006). " استقرار البروتين يعزز قابلية التطور" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (15): 5869-74 . Bibcode : 2006PNAS..103.5869B . doi : 10.1073/pnas.0510098103 . PMC 1458665. PMID 16581913 .
- ↑ رانيا، جيه. إيه.، سيليرو، إيه.، ثورنتون، جيه. إم.، أورينغو، سي. إيه. (أكتوبر 2006). "تطور عائلات البروتينات الفائقة والسلف المشترك العالمي الأخير (LUCA)". مجلة التطور الجزيئي . 63 (4): 513-525 . Bibcode : 2006JMolE..63..513R . doi : 10.1007/s00239-005-0289-7 . PMID: 17021929. S2CID : 25258028 .
- ↑ ديلوس-غور إي، توث-بيتروتشي أ، إلياس م، توفيق دي إس (يوليو 2013). "ما الذي يجعل طي البروتين قابلاً للابتكار الوظيفي؟ مفاضلات قطبية الطي والاستقرار". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 425 (14): 2609-2621 . doi : 10.1016/j.jmb.2013.03.033 . PMID 23542341 .
- ↑ فاغنر أ (14 يوليو 2011). أصول الابتكارات التطورية: نظرية التغيير التحويلي في الأنظمة الحية . مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-969259-0.
- ↑ مينيللي أ، بوكسهال ج، فوسكو ج (23 أبريل 2013). بيولوجيا وتطور المفصليات: الجزيئات، النمو، المورفولوجيا . سبرينغر. ISBN 978-3-642-36159-3.
- ↑ بيجليوتشي م (يناير 2008). "هل التطور قابل للتطور؟" (ملف PDF) . مجلة Nature Reviews Genetics . 9 (1): 75-82 . doi : 10.1038/nrg2278 . PMID 18059367. S2CID 3164124 .
- ↑ ميرلو إل إم، بيبر جيه دبليو، ريد بي جيه، مالي سي سي (ديسمبر 2006). "السرطان كعملية تطورية وبيئية". مراجعات الطبيعة. السرطان . 6 (12): 924-35 . doi : 10.1038/nrc2013 . PMID 17109012. S2CID 8040576 .
- ^ بان د، شيويه دبليو، تشانغ دبليو، ليو إتش، ياو إكس (أكتوبر 2012). “فهم آلية مقاومة الأدوية لفيروس التهاب الكبد C NS3/4A إلى ITMN-191 بسبب طفرات R155K، A156V، D168A/E: دراسة حسابية”. الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية اكتا (BBA) - مواضيع عامة . 1820 (10): 1526–34 . دوى : 10.1016/j.bbagen.2012.06.001 . بميد 22698669 .
- ↑ وودفورد ن، إلينغتون إم جيه (يناير 2007). "ظهور مقاومة المضادات الحيوية عن طريق الطفرة" . علم الأحياء الدقيقة السريرية والعدوى . 13 (1): 5-18 . doi : 10.1111/j.1469-0691.2006.01492.x . PMID 17184282 .
- ↑ لابيه، ب.، بيرتيكات، س.، بيرثوميو، أ.، أونال، س.، برنارد، س.، ويل، م.، لينورماند، ت. (نوفمبر 2007). "أربعون عامًا من التطور غير المنتظم لمقاومة المبيدات الحشرية في بعوضة كيولكس بيبينز" . مجلة PLOS Genetics . 3 (11) e205. doi : 10.1371/journal.pgen.0030205 . PMC 2077897. PMID 18020711 .
- ↑ نيف، ب. (أكتوبر 2007). "تحديات تطور مقاومة مبيدات الأعشاب وإدارتها: 50 عامًا بعد هاربر". بحوث الأعشاب . 47 (5): 365-369 . Bibcode : 2007WeedR..47..365N . doi : 10.1111/j.1365-3180.2007.00581.x .
- ↑ رودريغيز-روخاس أ، رودريغيز-بيلتران ج، كوس أ، بلازكيز ج (أغسطس 2013). "المضادات الحيوية ومقاومة المضادات الحيوية: صراع مرير ضد التطور". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة الطبية . 303 ( 6-7 ): 293-297 . doi : 10.1016/j.ijmm.2013.02.004 . PMID 23517688 .
- ↑ Schenk MF, Szendro IG, Krug J, de Visser JA (يونيو 2012). "تحديد القدرة التكيفية لإنزيم مقاومة المضادات الحيوية" . PLOS Genetics . 8 (6) e1002783. doi : 10.1371/journal.pgen.1002783 . PMC 3386231. PMID 22761587 .
- ↑ ريد إيه إف، لينش بي إيه، توماس إم بي (أبريل 2009). "كيفية صنع مبيدات حشرية مقاومة للتطور لمكافحة الملاريا" . مجلة PLOS Biology . 7 (4) e1000058. doi : 10.1371/journal.pbio.1000058 . PMC 3279047. PMID 19355786 .
- ↑ بيجليوتشي م (ديسمبر 2007). "هل نحن بحاجة إلى توليف تطوري موسع؟" (ملف PDF) . التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 61 (12): 2743-2749 . doi : 10.1111/j.1558-5646.2007.00246.x . PMID 17924956. S2CID 2703146 .
- ↑ بيجليوتشي م (يونيو 2009). "توليف موسع لعلم الأحياء التطوري" (ملف PDF) . حوليات أكاديمية نيويورك للعلوم . 1168 (1): 218-228 . Bibcode : 2009NYASA1168..218P . doi : 10.1111/ j.1749-6632.2009.04578.x . PMID 19566710. S2CID 5710484 .
- ↑ دانشان إي، شارمانتييه أ، شامبان إف إيه، مسعودي أ، بوجول ب، بلانشيه إس (يونيو 2011). "ما وراء الحمض النووي: دمج الوراثة الشاملة في نظرية موسعة للتطور". مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 12 (7): 475-486 . doi : 10.1038/nrg3028 . PMID 21681209. S2CID 8837202 .
- علم الأحياء التطوري
- توليف تطوري موسع
