بروكولاجين-برولين ديوكسيجيناز

إنزيم بروكولاجين-برولين ديوكسيجيناز ، المعروف باسم بروليل هيدروكسيلاز ، هو أحد أفراد فئة الإنزيمات المعروفة باسم هيدروكسيلازات ألفا-كيتوغلوتارات المعتمدة . تحفز هذه الإنزيمات دمج الأكسجين في الركائز العضوية من خلال آلية تتطلب حمض ألفا-كيتوغلوتاريك ، وأيونات الحديد الثنائي (Fe²⁺ )، وحمض الأسكوربيك . [ 1 ] [ 2 ] يحفز هذا الإنزيم تحديدًا تكوين ( 2S ، 4R ) -4-هيدروكسي برولين ، وهو مركب يمثل التعديل ما بعد الترجمة الأكثر شيوعًا في البروتينوم البشري . [ 3 ]

آلية الإنزيم

يحفز إنزيم بروكولاجين-برولين ديوكسيجيناز التفاعل التالي:

آلية التفاعل مشابهة لآلية تفاعلات إنزيمات ثنائي الأكسجين الأخرى، وتحدث على مرحلتين متميزتين: [ 3 ] في المرحلة الأولى، يتكون نوع Fe(IV)=O شديد التفاعل . يرتبط الأكسجين الجزيئي من طرفه في وضع محوري، مُنتجًا وحدة ثنائي الأكسجين. يؤدي الهجوم النيوكليوفيلي على ذرة الكربون C2 إلى تكوين وسيط رباعي الأوجه، مع فقدان الرابطة المزدوجة في وحدة ثنائي الأكسجين وروابط مع الحديد وذرة الكربون ألفا في 2-أوكسوغلوتارات. يتزامن التخلص اللاحق من ثاني أكسيد الكربون مع تكوين نوع Fe(IV)=O. تتضمن المرحلة الثانية انتزاع ذرة الهيدروجين pro - R من ذرة الكربون C-4 في ركيزة البرولين، متبوعًا بتفاعل جذري ، مما ينتج عنه هيدروكسي برولين. [ 4 ]

نتيجةً لآلية التفاعل، تُنزع مجموعة الكربوكسيل من جزيء واحد من 2-أوكسوغلوتارات ، مُكَوِّنةً السكسينات. تُحلَّل هذه السكسينات مائيًا وتُستبدل بجزيء آخر من 2-أوكسوغلوتارات بعد كل تفاعل، وقد استُنتج أنه في وجود 2-أوكسوغلوتارات، يتحول الحديد الثنائي المرتبط بالإنزيم بسرعة إلى حديد ثلاثي ، مما يؤدي إلى تعطيل الإنزيم. [ 5 ] يُستخدم الأسكوربات كعامل مساعد لاختزال الحديد الثلاثي مرة أخرى إلى حديد ثنائي . [ 6 ] [ 7 ]

 
[O]
ثاني أكسيد الكربون
سهم التفاعل المتجه لليمين، مع وجود الركيزة (الركائز) الثانوية من أعلى اليسار والناتج (النواتج) الثانوية في أعلى اليمين.
 
 
 

بنية الإنزيم

صورة مقربة لنطاق ارتباط الركيزة لإنزيم بروليل هيدروكسيلاز. تظهر بقايا التيروسين، التي تشكل أخدود الارتباط، باللون الأصفر.

إنزيم بروليل هيدروكسيلاز هو رباعي الوحدات يتكون من وحدتين فرعيتين فريدتين. [ 8 ] تبلغ كتلة الوحدة الفرعية α 59 كيلو دالتون، وهي المسؤولة عن كلٍ من ارتباط الببتيد والنشاط التحفيزي. [ 9 ] يمتد نطاق ارتباط الببتيد من الحمض الأميني 140 إلى 215 من الوحدة الفرعية α، [ 10 ] ويتكون من سطح مقعر مبطن ببقايا متعددة من التيروسين التي تتفاعل بشكل إيجابي مع الركيزة الغنية بالبرولين. يتكون الموقع النشط من أيون الحديد الثنائي (Fe2 +) المرتبط ببقايا الهيستيدين وبقايا الأسبارتات ، وهي سمة مشتركة بين معظم ثنائي أوكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات. أما الوحدة الفرعية β التي تبلغ كتلتها 55 كيلو دالتون، فهي المسؤولة عن توطين الإنزيم واحتجازه في الشبكة الإندوبلازمية . [ 11 ] هذه الوحدة الفرعية مطابقة للإنزيم المعروف باسم بروتين ثنائي كبريتيد إيزوميراز . [ 12 ]

الوظيفة البيولوجية

يحفز إنزيم بروليل هيدروكسيلاز تكوين الهيدروكسي برولين. يؤثر هذا التعديل بشكل كبير على استقرار الكولاجين ، وهو النسيج الضام الرئيسي في جسم الإنسان. [ 13 ] على وجه التحديد، تزيد عملية الهيدروكسيل درجة انصهار الكولاجين الحلزوني (Tm )  بمقدار 16 درجة مئوية، مقارنةً بالكولاجين غير المهدرج، [ 14 ] وهو فرق يسمح للبروتين بالبقاء مستقرًا عند درجة حرارة الجسم. نظرًا لوفرة الكولاجين (حوالي ثلث إجمالي البروتين) في جسم الإنسان، وارتفاع معدل حدوث هذا التعديل فيه، يُعد الهيدروكسي برولين أكثر التعديلات اللاحقة للترجمة وفرةً من الناحية الكمية في جسم الإنسان. [ 15 ]

يعمل الإنزيم تحديدًا على البرولين الموجود ضمن النمط X-Pro-Gly، حيث Pro هو البرولين. وبسبب هذا السلوك المحدد للنمط، يعمل الإنزيم أيضًا على بروتينات أخرى تحتوي على نفس التسلسل. تشمل هذه البروتينات C1q ، [ 16 ] والإيلاستينات ، [ 17 ] و PrP ، [ 18 ] والأرجونوت 2 ، [ 19 ] والكونوتوكسينات ، [ 20 ] وغيرها.

أهمية المرض

بما أن إنزيم بروليل هيدروكسيلاز يتطلب وجود الأسكوربات كعامل مساعد ليعمل، [ 5 ] فإن غيابه يُضعف نشاط الإنزيم. ويؤدي انخفاض الهيدروكسيل الناتج إلى الإصابة بمرض الإسقربوط . ونظرًا لتأثر استقرار الكولاجين لدى مرضى الإسقربوط، تشمل الأعراض ضعف الأوعية الدموية مما يُسبب ظهور الفرفرية ، والنمشات ، ونزيف اللثة.

يُعد عامل تحفيز نقص الأكسجين (HIF) عامل نسخ محفوظًا تطوريًا [ 21 ] يسمح للخلية بالاستجابة الفسيولوجية لانخفاض مستويات الأكسجين. [ 22 ] وقد تم تحديد فئة من إنزيمات بروليل هيدروكسيلاز التي تعمل تحديدًا على HIF؛ [ 23 ] حيث يسمح هيدروكسلة HIF باستهداف البروتين للتحلل. [ 23 ] وقد استُهدف إنزيم بروليل هيدروكسيلاز HIF بمجموعة متنوعة من المثبطات التي تهدف إلى علاج السكتة الدماغية ، [ 24 ] وأمراض الكلى، [ 25 ] ونقص التروية ، [ 26 ] وفقر الدم ، [ 27 ] وغيرها من الأمراض الهامة.

أسماء بديلة

  • هيدروكسيلاز البروتوكولاجين
  • بروليل هيدروكسيلاز
  • بروليل 4-هيدروكسيلاز
  • بروتوكولاجين بروليل هيدروكسيلاز

مراجع

  1. سميث تي جي، تالبوت إن بي (أبريل 2010). "هيدروكسيلازات البروليل والعلاجات" . مضادات الأكسدة وإشارات الأكسدة والاختزال . 12 (4): 431-433 . doi : 10.1089/ars.2009.2901 . PMID 19761407 . 
  2. هاتون جيه جيه، ترابل إيه إل، أودينفريند إس (يوليو 1966). "متطلبات ألفا-كيتوغلوتارات، وأيون الحديدوز، وأسكوربات بواسطة هيدروكسيلاز برولين الكولاجين". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 24 (2): 179-184 . Bibcode : 1966BBRC...24..179H . doi : 10.1016/0006-291x(66)90716-9 . PMID 5965224 . 
  3. 1 2 جوريس كيه إل، راينز آر تي (أبريل 2010). "بروليل 4-هيدروكسيلاز" . مراجعات نقدية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 45 (2): 106-24 . doi : 10.3109/10409231003627991 . PMC 2841224. PMID 20199358 .  
  4. فوجيتا، واي.، غوتليب، أ.، بيتركوفسكي، ب.، أودينفريند، س.، ويتكوب، ب. (1964). "تحضير سيس- وترانس-4-H3-L-برولين واستخدامهما في دراسة آلية الهيدروكسيل الأنزيمي في أجنة الدجاج". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 86 (21): 4709-4716 . Bibcode : 1964JAChS..86.4709F . doi : 10.1021/ja01075a036 .
  5. 1 2 دي يونغ إل، ألبرشت إس بي، كيمب إيه (يونيو 1982). "نشاط بروليل 4-هيدروكسيلاز وعلاقته بحالة أكسدة الحديد المرتبط بالإنزيم. دور الأسكوربات في هيدروكسيل ببتيديل برولين". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا . 704 (2): 326-332 . doi : 10.1016/0167-4838(82)90162-5 . PMID 6285984 . 
  6. دي يونغ إل، كيمب أ (مايو 1984). "القياس الكمي وحركية التفاعل الجزئي لبروليل 4-هيدروكسيلاز". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - بنية البروتين وعلم الإنزيمات الجزيئية . 787 (1): 105-111 . doi : 10.1016/0167-4838(84)90113-4 . PMID 6326839 . 
  7. ^ مبينزا إن إم، فاداككيداث بي جي، ماكجيليفراي دي جي، ليونج آي كيه (ديسمبر 2017). "دراسات الرنين المغناطيسي النووي للحديد غير الهيم (II) والأكسجيناز المعتمد على 2 أوكسوجلوتارات". جيه إنرج. الكيمياء الحيوية . 177 : 384– 394. دوى : 10.1016/j.jinorgbio.2017.08.032 . بميد 28893416 . 
  8. بيرغ، ر. أ.، وبروكوب، د. ج. (فبراير 1973). "تنقية هيدروكسيلاز البرولين من بروتوكولاجين من أجنة الدجاج باستخدام عمود التقارب، ومزيد من توصيف الإنزيم" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 248 (4): 1175-1182 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)44278-6 . PMID 4346946 . 
  9. هيلاكوسكي تي، فوري ك، ميليلا ر، كيفيريكو كي آي، بيلاجانييمي تي (يونيو 1989). "الاستنساخ الجزيئي للوحدة الفرعية ألفا من بروليل 4-هيدروكسيلاز البشري: التسلسل الكامل للأحماض الأمينية المشتق من الحمض النووي المكمل ودليل على التضفير البديل لنسخ الحمض النووي الريبوزي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 86 (12): 4392-4396 . Bibcode : 1989PNAS...86.4392H . doi : 10.1073/pnas.86.12.4392 . PMC 287275. PMID 2543975 .  
  10. بيكالا م، هيتا ر، بيرغمان يو، كيفيريكو كي آي، ويرينغا آر كي، ميليهارجو ج (ديسمبر 2004). "نطاق ارتباط الببتيد بالركيزة في إنزيمات بروليل 4-هيدروكسيلاز الكولاجين هو نطاق تكرار رباعي الببتيد مع بقايا عطرية وظيفية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (50): 52255-61 . doi : 10.1074/jbc.M410007200 . PMID 15456751 . 
  11. فوري ك، بيلاجانييمي ت، ميليلا ر، كيفيريكو ك.إ. (نوفمبر 1992). "الطفرات الموجهة للموقع في إنزيم إيزوميراز ثنائي كبريتيد البروتين البشري: تأثيرها على تجميع ونشاط واحتجاز بروليل 4-هيدروكسيلاز البشري في الشبكة الإندوبلازمية في خلايا حشرة سبودوبترا فروجيبردا" . مجلة EMBO . 11 (11): 4213-4217 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05515.x . PMC 556932. PMID 1327760 .  
  12. ^ Pihlajaniemi T، Helaakoski T، Tasanen K، Myllylä R، Huhtala ML، Koivu J، Kivirikko KI (مارس 1987). "الاستنساخ الجزيئي للوحدة الفرعية بيتا للبروليل 4-هيدروكسيلاز البشري. هذه الوحدة الفرعية وإيزوميراز ثاني كبريتيد البروتين هما منتجان لنفس الجين " . مجلة إمبو . 6 (3): 643– 9. دوى : 10.1002/j.1460-2075.1987.tb04803.x . بمك 553446 . بميد 3034602 .  
  13. شولدرز، إم دي، وراينز، آر تي (2009). " بنية الكولاجين واستقراره" . المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 78 : 929-958 . doi : 10.1146/annurev.biochem.77.032207.120833 . PMC 2846778. PMID 19344236 .  
  14. بيرغ، ر. أ.، وبروكوب، د. ج. (مايو 1973). "التحول الحراري لشكل غير مهدرج من الكولاجين. دليل على دور الهيدروكسي برولين في تثبيت الحلزون الثلاثي للكولاجين". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 52 (1): 115-120 . رمز Bibcode : 1973BBRC...52..115B . doi : 10.1016/0006-291x(73)90961-3 . PMID 4712181 . 
  15. غوريس، كيلي ل.؛ راينز ، رونالد ت. (أبريل 2010). "بروليل 4-هيدروكسيلاز" . مراجعات نقدية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 45 (2): 106-124 . doi : 10.3109/10409231003627991 . PMC 2841224. PMID 20199358 .  
  16. مولر دبليو، هاناوسكي-أبيل إتش، لوس إم (أكتوبر 1978). "التخليق الحيوي للمكون الأول من المتممة بواسطة البلاعم الصفاقية البشرية والخنزير الغيني: دليل على إنتاج مستقل للوحدات الفرعية C1" . مجلة علم المناعة . 121 (4): 1578-1584 . doi : 10.4049/jimmunol.121.4.1578 . PMID 701808. S2CID 36397927 .  
  17. روزنبلوم ج، سيونسكي أ (يونيو 1976). "تثبيط هيدروكسيل البرولين لا يثبط إفراز التروبوإيلاستين من خلايا الأبهر في الدجاج". رسائل FEBS . 65 (2): 246-250 . Bibcode : 1976FEBSL..65..246R . doi : 10.1016/0014-5793(76)80490-5 . PMID 6335. S2CID 34210226 .  
  18. جيل إيه سي، ريتشي إم إيه، هانت إل جي، ستين إس إي، ديفيز كيه جي، بوكينج إس بي، راي إيه جي، بينيت إيه دي، هوب جيه (أكتوبر 2000). "الهيدروكسيل بعد الترجمة في الطرف الأميني لبروتين البريون يكشف عن وجود بنية PPII في الجسم الحي" . مجلة EMBO . 19 (20): 5324-31 . doi : 10.1093/emboj/19.20.5324 . PMC 314005. PMID 11032800 .  
  19. ^ تشى سمو، أونجوساها PP، ميليهارجو جي، تشنغ د، باكانين أو، شي واي، لي إس دبليو، بنغ جيه، شي واي (سبتمبر 2008). "Prolyl 4-hydroxylation ينظم استقرار Argonaute 2" . طبيعة . 455 (7211): 421– 4. بيب كود : 2008Natur.455..421Q . دوى : 10.1038 / طبيعة07186 . بمك 2661850 . بميد 18690212 .  
  20. دالي، ن. ل.، وكريك، د. ج. (فبراير 2009). "دراسات بنيوية للسموم المخروطية" . مجلة IUBMB Life . 61 (2): 144-150 . doi : 10.1002/iub.158 . PMID 19165896. S2CID 8678009 .  
  21. بيكون، ن. س.، وابنر، ب.، وأورورك، ج. ف.، وبارتليت، س. م.، وشيلو، ب.، وبو، س. و.، وراتكليف، ب. ج. (أغسطس 1998). "تنظيم بروتين سيما (Sima) من عائلة bHLH-PAS في ذبابة الفاكهة بواسطة نقص الأكسجين: دليل وظيفي على التشابه مع HIF-1 ألفا في الثدييات". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 249 (3): 811-816 . Bibcode : 1998BBRC..249..811B . doi : 10.1006/bbrc.1998.9234 . PMID: 9731218 . 
  22. سميث تي جي، روبنز بي إيه، راتكليف بي جيه (مايو 2008). " الجانب الإنساني لعامل نقص الأكسجين القابل للحث" . المجلة البريطانية لأمراض الدم . 141 (3): 325-334 . doi : 10.1111/j.1365-2141.2008.07029.x . PMC 2408651. PMID 18410568 .  
  23. 1 2 Bruick RK, McKnight SL (نوفمبر 2001). "عائلة محفوظة من بروليل-4-هيدروكسيلاز تُعدّل HIF". مجلة ساينس . 294 (5545): 1337-1340 . Bibcode : 2001Sci...294.1337B . doi : 10.1126/science.1066373 . PMID 11598268. S2CID 9695199 .  
  24. كاروباجوندر إس إس، راتان آر آر (يوليو 2012). "تثبيط بروليل هيدروكسيلاز العامل المحفز بنقص الأكسجين: هدف جديد قوي أم فشل كبير آخر في علاجات السكتة الدماغية؟" . مجلة تدفق الدم الدماغي والأيض . 32 (7): 1347-1361 . doi : 10.1038/jcbfm.2012.28 . PMC 3390817. PMID 22415525 .  
  25. وارنيك سي، غريث دبليو، وايدمان إيه، يورغنسن جيه إس، ويليام سي، باخمان إس، إيفاشينكو واي، فاغنر آي، فراي يو، فيزنر إم، إيكاردت كيه يو (يونيو 2003). "تفعيل مسار عامل نقص الأكسجين وتحفيز تكوين الأوعية الدموية باستخدام مثبطات بروليل هيدروكسيلاز" . مجلة FASEB . 17 (9): 1186-1188 . doi : 10.1096/fj.02-1062fje . PMID 12709400. S2CID 45194703 .  
  26. سيلفاراجو، في.، باريناندي، ن. ل.، أدلوري، ر. س.، غولدمان، ج. و.، حسين، ن.، سانشيز، ج. أ.، موليك، ن. (يونيو 2014). "الآليات الجزيئية لعمل واستخدامات مثبطات إنزيمات بروليل 4-هيدروكسيلاز HIF الدوائية لعلاج الأمراض الإقفارية" . مضادات الأكسدة وإشارات الأكسدة والاختزال . 20 (16): 2631-2665 . doi : 10.1089/ars.2013.5186 . PMC 4026215. PMID 23992027 .  
  27. موشنيك إي، كابلان جيه (مايو 2011). " مثبطات بروليل هيدروكسيلاز HIF لعلاج فقر الدم". رأي الخبراء في الأدوية التجريبية . 20 (5): 645-56 . doi : 10.1517/13543784.2011.566861 . PMID 21406036. S2CID 21973130 .