السالمونيلا المعوية سلالة معوية

السالمونيلا المعوية الفرعية المعوية هي نوع فرعي من السالمونيلا المعوية ، وهي بكتيريا عصوية الشكل، سوطية ، هوائية، سالبة الغرام . العديد من الأنماط المصلية الممرضة من أنواع السالمونيلا المعوية تنتمي إلى هذا النوع الفرعي، بما في ذلك النمط المسؤول عن التيفوئيد . ^{[ 1 ]}

تُصنَّف الأنماط المصلية لبكتيريا السالمونيلا المعوية الفرعية المعوية بناءً على مستضداتها الجسدية (O) والسوطية (H)، ويبلغ عددها الإجمالي أكثر من 2600 نمط مصلي؛ منها حوالي 50 نمطًا فقط تُعدّ من الأسباب الشائعة للعدوى لدى البشر. ^{[ 2 ]} توجد معظم هذه الأنماط المصلية في البيئة وتعيش في النباتات والماء والتربة؛ وللعديد منها نطاق عوائل واسع يسمح لها باستعمار أنواع مختلفة من الثدييات والطيور والزواحف والبرمائيات والحشرات. تنتشر الأمراض الحيوانية المنشأ ، مثل السالمونيلا ، بين البيئة والبشر. ^{[ 3 ]} يُعدّ النمط المصلي الأكثر شهرة من السالمونيلا المعوية المعوية هو السالمونيلا التيفية، التي تُسبّب حمى التيفوئيد . أما الأنماط المصلية نظيرة التيفية A وB وC فتُسبّب حمى نظيرة التيفوئيد ، وهو مرض مشابه للتيفوئيد ولكنه أقل حدة. ^{[ 4 ]}

تُستخدم حاليًا عدة تقنيات للتمييز بين الأنماط المصلية . تشمل هذه التقنيات البحث عن وجود أو غياب المستضدات ، والتنميط العاثي ، والبصمة الجزيئية، والتنميط الحيوي، حيث يتم التمييز بين الأنماط المصلية بناءً على العناصر الغذائية التي تستطيع تخميرها. من العوامل المحتملة في تحديد نطاق العائل لأنماط مصلية معينة هو اكتساب عدد قليل من العناصر الوراثية، بوساطة العاثيات، التي تُمكّن من إصابة عائل معين. ^{[ 5 ]} يُفترض أيضًا أن الأنماط المصلية التي تُصيب نطاقًا ضيقًا من الأنواع قد تباعدت عن أسلاف ذات نطاق عائل واسع، ثم تخصصت وفقدت القدرة على إصابة بعض العوائل. ^{[ 6 ]}

خلصت الدراسات إلى أن معظم سلالات السالمونيلا المعوية الفرعية المعوية تمتلك بلازميدات ضراوة خاصة بكل نمط مصلي . وتتميز هذه البلازميدات، المرتبطة بالضراوة، بانخفاض عدد نسخها، ويتراوح حجمها بين 50 و100 كيلوبايت، وذلك تبعًا للنمط المصلي. ^{[ 7 ]} في عام 2012، رصدت شبكة PulseNet التابعة لمراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها (CDC) ظهور مجموعة من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) المقاومة للأدوية المتعددة في النمط المصلي Infantis ، والتي سُميت REPJFX01. تحتوي هذه المجموعة على بلازميد ضخم (pESI) يحوي جينات مقاومة متعددة للأدوية. ^{[ 8 ]} وذكرت إدارة نظام الإبلاغ الوطني عن مقاومة المضادات الحيوية التابعة لوزارة الزراعة الأمريكية (USDA NARMS) أن النمط المصلي Infantis هو النمط السائد في الدواجن بسبب هذا البلازميد pESI. ^{[ 9 ]} ويضم المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) أكثر من 12500 عزلة ضمن مجموعة REPJFX01، منها أكثر من 3700 عزلة سريرية. ^{[ 10 ]} كما وُجد أن النمط المصلي Enteritidis، وهو النمط المصلي الأكثر شيوعًا المعزول في الحالات السريرية البشرية، ينتج سمومًا داخلية ، مشفرة بواسطة جينات stn و sly A، والتي تُسهم في إمراضية Enteritidis. ^{[ 11 ]}

في نوفمبر/تشرين الثاني 2016، ظهرت سلالة جديدة من بكتيريا السالمونيلا المعوية المقاومة للأدوية المتعددة (XDR) من النمط المصلي التيفي في باكستان، وتحديدًا في مدينتي حيدر آباد وكراتشي . ^{[ 12 ]} وتتواجد السلالات المقاومة للأدوية المتعددة منذ أواخر سبعينيات القرن الماضي في أفريقيا وآسيا. ^{[ 13 ]} وتقاوم هذه السلالات العديد من خيارات العلاج بالمضادات الحيوية من الخط الأول، مثل: الكلورامفينيكول ، والأمبيسيلين ، والتريميثوبريم-سلفاميثوكسازول ، والفلوروكينولونات ، والسيفالوسبورينات من الجيل الثالث . وتوصي منظمة الصحة العالمية باستخدام الأزيثروميسين كعلاج من الخط الأول. ^{[ 14 ]} ولا يزال تفشي المرض مستمرًا منذ عام 2016. ^{[ 15 ]}

في الولايات المتحدة، كانت أنواع السالمونيلا العشرة التي تسببت في معظم الإصابات البشرية في عام 2016 هي: ^{[ 16 ]}

لطالما كان تصنيف بكتيريا السالمونيلا المعوية موضوع نقاش في أوساط علماء الأحياء الدقيقة. ^{[ 17 ]} في الأصل، في ثمانينيات القرن التاسع عشر، سُميت أنواع السالمونيلا نسبةً إلى المرض أو العائل أو الموقع الجيولوجي المرتبط بها؛ إلا أن هذا التصنيف كان محل جدل بسبب تصنيف أفراد الجنس بشكل لا يتوافق مع أوجه التشابه الجيني بينهم. في ثمانينيات القرن العشرين، أدى ظهور تقنيات تسلسل النيوكليوتيدات وتهجين الحمض النووي إلى دفع العديد من علماء البكتيريا البارزين، مثل لو مينور وبوبوف (1987)، ويوزيبي (1999)، وإيزاكي ويابوتشي (2000)، إلى تقديم مقترحاتهم لتغييرات في التصنيف. ^{[ 18 ]} لم يُعتمد اسم " السالمونيلا المعوية " كاسم رسمي للنوع إلا في عام 2005، وذلك بعد أن أعاد لو مينور وبوبوف اقتراحه واعتماده كاسم رسمي للنوع - باستثناء السالمونيلا البونجورية - وأن السالمونيلا المعوية تضم ستة أنواع فرعية، من بينها النوع الفرعي المعوي الذي يحتوي على أكبر عدد من الأنماط المصلية. ^{[ 19 ]} تسمح التطورات التقنية للباحثين باستخدام بيانات تسلسل الجينوم الكامل لتحديد الأنماط المصلية وتصنيفها باستخدام طريقتين: تحديد النمط التسلسلي والتعرف على المستضدات. ^{[ 20 ]}

تُكتب أسماء الأنماط المصلية بحروف كبيرة، ولكن لا تُكتب بخط مائل أو يُسطّر تحتها. يمكن تسمية الأنماط المصلية بشكل كامل أو مختصر (يشمل اسم الجنس والنمط المصلي فقط). على سبيل المثال، يُكتب اسم Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi بشكل كامل، بينما يُكتب بشكل مختصر Salmonella Typhi. ^{[ 21 ]} يمكن أن يحتوي كل نمط مصلي على العديد من السلالات، مما يسمح بزيادة سريعة في العدد الإجمالي للبكتيريا المتغيرة مستضديًا . ^{[ 22 ]}

تُعرّف منظمة الصحة العالمية داء السالمونيلا (غير التيفوئيدي) بأنه مرض ينتقل عن طريق الغذاء، وتشمل أعراضه الإسهال والحمى والغثيان والقيء، وقد يؤدي في الحالات الشديدة إلى الوفاة. ^{[ 23 ]} وقد تبين أن داء السالمونيلا يصيب الإنسان بشكل أساسي نتيجة استعمار البكتيريا للأمعاء بعد تناول طعام أو ماء ملوث، ولكنه ينتقل أيضًا من شخص لآخر عبر الطريق البرازي الفموي. ^{[ 24 ]} وللحد من خطر الإصابة بهذا المرض، ينبغي تطبيق إجراءات سلامة الغذاء المناسبة على المنتجات الغذائية عالية الخطورة، بما في ذلك الدواجن ولحم البقر ولحم الخنزير ولحم الضأن والبيض والخضراوات والفواكه الطازجة. ^{[ 25 ]} كما ينبغي على مصنعي الأغذية وموردي المكونات والمطاعم والطهاة المنزليين اتباع إجراءات معالجة صحية، وتخزين الأطعمة في درجة حرارة أقل من 5  درجات مئوية، وطهي جميع الأطعمة جيدًا حتى تصل إلى درجة الحرارة الآمنة للأكل. ^{[ 25 ]} بات من الصعب بشكل متزايد الحد من انتشار عدوى السالمونيلا بين البشر نظرًا لطبيعة السلالات المقاومة للأدوية المتعددة، وذلك نتيجةً للآثار العكسية لاستخدام المضادات الحيوية كعلاج واسع النطاق. ^{[ 26 ]} وقد ساهمت أوجه القصور المناعي الرئيسية لدى المضيف، المرتبطة بفيروس نقص المناعة البشرية والملاريا وسوء التغذية، في انتشار هذا المرض على نطاق واسع، وفي الحاجة إلى استخدام أدوية مضادة للميكروبات باهظة الثمن في أفقر الخدمات الصحية في العالم. ^{[ 27 ]}

توجد عوامل قد تزيد من خطر الإصابة بالعدوى، منها ارتفاع درجة حموضة المعدة، واستئصال جزء منها، والعلاج بمضادات الحموضة. ^{[ 38 ]} أما انخفاض درجة حموضة المعدة فيُعدّ آلية وقائية تُسهم في تجنب العدوى. ^{[ 39 ]}

هذه السلالة محبة للحرارة المعتدلة ، وبعضها قادر على البقاء في درجات حرارة منخفضة أو مرتفعة للغاية تتراوح بين 2 و54 درجة مئوية. ^{[ 40 ]} تتحكم عوامل سيجما داخل الخلية في التعبير الجيني ، وتستشعر التغيرات البيئية من خلال الغشاء الخارجي بتنشيط الجينات التي تستجيب للإجهاد الحراري وتتكيف تبعًا لذلك. ^{[ 41 ]} كما تستطيع بكتيريا السالمونيلا المعوية الاستجابة بسرعة لدرجات الحرارة المنخفضة عن طريق بروتينات الصدمة الباردة (CSP) التي تُصنّعها بنفسها، مما يسمح للخلية باستئناف نموها لاحقًا. ^{[ 42 ]} يُعد الكلور عاملًا كيميائيًا مُجهدًا للسالمونيلا المعوية ، فبمجرد وجوده، تُنتج هذه البكتيريا غشاءً حيويًا يُزوّد ​​نفسه بمصفوفة من عديد السكاريد الخارجي، والتي تتمتع بقدرة على مهاجمة الكلور كيميائيًا. ^{[ 43 ]} من هذا المنطلق، يُوفر الكلور إجراءات وقائية ضد تكوّن الأغشية الحيوية في أنظمة شرب الدواجن، مما يُقلل من خطر الإصابة بالسالمونيلا المعوية . ^{[ 44 ]} يسمح التكيف الناجح لبكتيريا السالمونيلا المعوية بتحمل ظروف أكثر حمضية، مما يعاكس التأثيرات المضادة للبكتيريا في المعدة. ^{[ 45 ]}