منطقة إصبع البنصر
في علم الأحياء الجزيئي ، يُعد نطاق إصبع RING (اختصارًا لـ Real Interesting New Gene ) نطاقًا بنيويًا بروتينيًا من نوع إصبع الزنك ، يحتوي على وحدة من الأحماض الأمينية C3HC4 ترتبط بأيونين من الزنك (سبعة سيستين وواحد هيستيدين مرتبة بشكل غير متسلسل). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] يتكون هذا النطاق البروتيني من 40 إلى 60 حمضًا أمينيًا. تلعب العديد من البروتينات التي تحتوي على نطاق إصبع RING دورًا رئيسيًا في مسار اليوبيكويتين . في المقابل، تُعد البروتينات التي تحتوي على نطاقات إصبع RING أكبر أنواع إنزيمات ربط اليوبيكويتين في الجينوم البشري. [ 6 ]
أصابع من الزنك
تُعدّ نطاقات أصابع الزنك (Znf) وحدات بروتينية صغيرة نسبيًا ترتبط بذرة زنك واحدة أو أكثر، وتحتوي عادةً على نتوءات متعددة تشبه الأصابع تُشكّل روابط متتالية مع جزيئها المستهدف. ترتبط هذه النطاقات بركائز من الحمض النووي DNA ، والحمض النووي RNA ، والبروتينات، و/أو الدهون . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] وتعتمد خصائص ارتباطها على تسلسل الأحماض الأمينية في نطاقات الأصابع والرابط بينها، بالإضافة إلى البنى ذات الترتيب الأعلى وعدد الأصابع. غالبًا ما توجد نطاقات Znf في تجمعات، حيث يمكن أن تمتلك الأصابع خصائص ارتباط مختلفة. توجد العديد من العائلات الفائقة لوحدات Znf، والتي تختلف في كل من التسلسل والبنية. تُظهر هذه الوحدات تنوعًا كبيرًا في أنماط الارتباط، حتى بين أفراد الفئة نفسها (على سبيل المثال، يرتبط بعضها بالحمض النووي DNA، والبعض الآخر بالبروتينات)، مما يشير إلى أن وحدات Znf عبارة عن هياكل مستقرة تطورت لوظائف متخصصة. على سبيل المثال، تؤدي البروتينات الحاوية على Znf وظائف في نسخ الجينات ، والترجمة، ونقل mRNA، وتنظيم الهيكل الخلوي ، وتطور الخلايا الظهارية، والتصاق الخلايا ، وطَيّ البروتينات ، وإعادة تشكيل الكروماتين، واستشعار الزنك. [ 12 ] تُعدّ وحدات ربط الزنك هياكل مستقرة، ونادرًا ما تخضع لتغيرات بنيوية عند ارتباطها بهدفها.
لقد تباعدت بعض نطاقات أصابع الزنك بحيث أنها لا تزال تحتفظ ببنيتها الأساسية، لكنها فقدت قدرتها على ربط الزنك، باستخدام وسائل أخرى مثل الجسور الملحية أو الارتباط بمعادن أخرى لتثبيت الطيات الشبيهة بالأصابع.
وظيفة
ترتبط العديد من نطاقات RING finger في آنٍ واحد بإنزيمات اليوبيكويتين وركائزها، وبالتالي تعمل كإنزيمات ربط . ويؤدي اليوبيكويتين بدوره إلى استهداف بروتين الركيزة للتحلل. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]
إعادة التركيب الميوزي
أثناء الانقسام الاختزالي ، يُعزز التبادل الكروموسومي بين الكروموسومات المتماثلة (المتماثلة) الانفصال الدقيق للكروموسومات . [ 16 ] في الثدييات، تُسهّل بروتينات المجال الحلقي RNF212 و HEI10 وRNF212B التبادل الكروموسومي بين كل زوج من الكروموسومات المتماثلة أثناء الانقسام الاختزالي. [ 16 ] أظهرت الدراسات التي أُجريت على الفئران أن لهذه البروتينات ذات المجال الحلقي المُحفزة للتبادل الكروموسومي وظائف متميزة، ولكنها مترابطة، في تسهيل عمليات إعادة التركيب المتماثل وإصلاح الحمض النووي التي تُنتج التبادل الكروموسومي. [ 16 ]
بناء
يحتوي نطاق إصبع RING على التسلسل المتفق عليه C -X 2 - C -X [9-39] - C -X [1-3] - H -X [2-3] - C -X 2 - C -X [4-48] - C -X 2 - C . [ 2 ] حيث:
- C هو بقايا سيستين محفوظة تشارك في تنسيق الزنك،
- H هو هيستيدين محفوظ يشارك في تنسيق الزنك،
- Zn هو ذرة الزنك، و
- يمثل X أي بقايا من الأحماض الأمينية.
فيما يلي تمثيل تخطيطي لبنية نطاق إصبع RING: [ 2 ]
xxxxxx xxxx xxxx xxxx CCCC x \ / xx \ / x x Zn xx Zn x ج / \ هـ ج / \ ج xxxx xxxxxxxxxxxxx
أمثلة
من أمثلة الجينات البشرية التي تشفر البروتينات التي تحتوي على نطاق إصبع زنك:
AMFR ، BARD1 ، BBAP ، BFAR ، BIRC2 ، BIRC3 ، BIRC7 ، BIRC8 ، BMI1 ، BRAP ، BRCA1 ، CBL ، CBLB ، CBLC ، CBLL1 ، CHFR ، CNOT4 ، COMMD3 ، DTX1 ، DTX2 ، DTX3 ، DTX3L ، DTX4 ، DZIP3 ، HCGV ، HLTF ، HOIL-1 ، IRF2BP2 ، LNX1 ، LNX2 ، LONRF1 ، LONRF2 ، LONRF3 ، MARCH1 ، MARCH2 ، MARCH3 ، MARCH4 ، MARCH5 ، MARCH6 ، MARCH7 ، MARCH8 ، MARCH9 , مارس 10 , MDM2 MEX3A ، MEX3B ، MEX3C ، MEX3D ، MGRN1 ، MIB1 ، MID1 ، MID2 ، MKRN1 ، MKRN2 ، MKRN3 ، MKRN4 ، MNAT1 ، MYLIP ، NFX1 ، NFX2 ، PCGF1 ، PCGF2 ، PCGF3 ، PCGF4 ، PCGF5 ، PCGF6 ، PDZRN3 ، PDZRN4 ، PEX10 ، PHRF1 ، PJA1 ، PJA2 ، PML ، PML - RAR ، PXMP3 ، RAD18 ، RAG1 ، RAPSN ، RBCK1 ، RBX1 ، RC3H1 ، RC3H2 ، RCHY1 ، RFP2 ، RFPL1 ، RFPL2 ، RFPL3 ، RFPL4B ، RFWD2 ، RFWD3 ، RING1 ،RNF2 ، RNF4 ، RNF5 ، RNF6 ، RNF7 ، RNF8 ، RNF10 ، RNF11 ، RNF12 ، RNF13 ، RNF14 ، RNF19A ، RNF20 ، RNF24 ، RNF25 ، RNF26 ، RNF32 ، RNF38 ، RNF39 ، RNF40 ، RNF41 ، RNF43 ، RNF44 ، RNF55 ، RNF71 ، RNF103 ، RNF111 ، RNF113A ، RNF113B ، RNF121 ، RNF122 ، RNF123 ، RNF125 ، RNF126 ، RNF128 ، RNF130 ، RNF133 ، RNF135 ، RNF138 RNF139 ، RNF141 ، RNF144A ، RNF145 ، RNF146 ، RNF148 ، RNF149 ، RNF150 ، RNF151 ، RNF152 ، RNF157 ، RNF165 ، RNF166 ، RNF167 ، RNF168 ، RNF169 ، RNF170 ، RNF175 ، RNF180 ، RNF181 ، RNF182 ، RNF185 ، RNF207 ، RNF213 ، RNF215 ، RNFT1 ، SH3MD4 ، SH3RF1 ، SH3RF2 ، SYVN1 ، TIF1 ، TMEM118 ، TOPORS ، TRAF2 ، TRAF3 ، TRAF4 ، TRAF5 TRAF6 ، TRAF7 ، TRAIP ، TRIM2 ، TRIM3 ، TRIM4 ، TRIM5 ، TRIM6 ، TRIM7 ، TRIM8 ، TRIM9 ، TRIM10 ، TRIM11 ، TRIM13، TRIM15 ، TRIM17 ، TRIM21 ، TRIM22 ، TRIM23 ، TRIM24 ، TRIM25 ، TRIM26 ، TRIM27 ، TRIM28 ، TRIM31 ، TRIM32 ، TRIM33 ، TRIM34 ، TRIM35 ، TRIM36 ، TRIM38 ، TRIM39 ، TRIM40 ، TRIM41 ، TRIM42 ، TRIM43 ، TRIM45 ، TRIM46 ، TRIM47 ، TRIM48 ، TRIM49 ، TRIM50 ، TRIM52 ، TRIM54 ، TRIM55 ، TRIM56 ، TRIM58 ، TRIM59 ، TRIM60 ، TRIM61 ، TRIM62 ، TRIM63 ، TRIM65 ، TRIM67 ، TRIM68 ، TRIM69 ، TRIM71 ، TRIM72 ، TRIM73 ، TRIM74 ، TRIML1 ، TTC3 ، UHRF1 ، UHRF2 ، VPS11 ، VPS8 ، ZNF179 ، ZNF294 ، ZNF313 ، ZNF364 ، ZNF451 ، ZNF650 ، ZNFB7 ، ZNRF1 ، ZNRF2 ، ZNRF3 ، ZNRF4 ، و ZSWIM2 .
مراجع
- ↑ بارلو، بي. إن.، لويزي، بي.، ميلنر، أ.، إليوت، إم.، إيفريت، آر. (مارس 1994). "بنية نطاق C3HC4 باستخدام مطيافية الرنين المغناطيسي النووي للبروتون. فئة بنيوية جديدة من أصابع الزنك". مجلة البيولوجيا الجزيئية 237 (2): 201-211 . doi : 10.1006/jmbi.1994.1222 . PMID 8126734 .
- 1 2 3 بوردن كيه إل، فريمونت بي إس (1996). "نطاق إصبع الحلقة: مثال حديث لعائلة تسلسل-بنية". الرأي الحالي في البيولوجيا البنيوية . 6 (3): 395-401 . doi : 10.1016/S0959-440X(96)80060-1 . PMID 8804826 .
- ↑ هانسون آي إم، بوستكا إيه، تروسديل جيه (1991). "جينات جديدة في المنطقة من الفئة الثانية من معقد التوافق النسيجي الرئيسي البشري". علم الجينوم . 10 (2): 417-24 . doi : 10.1016/0888-7543(91)90327-B . PMID 1906426 .
- ↑ فريمونت، بي إس، وهانسون، آي إم، وتروسديل، جيه (1991). "نمط تسلسل جديد غني بالسيستين" . الخلية . 64 (3): 483-484 . doi : 10.1016/0092-8674(91)90229-R . PMID 1991318 .
- ↑ لوفيرينغ ر، هانسون إم، بوردن كيه إل، مارتن إس، أورايلي إن جيه، إيفان جي آي، رحمن دي، بابين دي جيه، تروسديل جيه، فريمونت بي إس (1993). "تحديد وتوصيف أولي لنمط بروتيني مرتبط بإصبع الزنك" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 90 (6): 2112-2116 . Bibcode : 1993PNAS...90.2112L . doi : 10.1073/pnas.90.6.2112 . PMC 46035. PMID 7681583 .
- ↑ سكاليا، بييرلويجي؛ ويليامز، ستيفن جيه؛ سوما، أنطونيو؛ كارنيفالي، فينتشنزو (21-06-2023). "عائلة بروتين DTX: مجموعة ناشئة من إنزيمات E3 يوبيكويتين ليغاز في السرطان" . الخلايا . 12 ( 13): 1680. doi : 10.3390/cells12131680 . ISSN 2073-4409 . PMC 10340142. PMID 37443713 .
- ↑ كلوج أ (1999). "ببتيدات أصابع الزنك لتنظيم التعبير الجيني". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 293 (2): 215-218 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3007 . PMID 10529348 .
- ↑ هول، تي إم (2005). "أنماط متعددة للتعرف على الحمض النووي الريبي بواسطة بروتينات أصابع الزنك" . الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية . 15 (3): 367-373 . doi : 10.1016/j.sbi.2005.04.004 . PMID 15963892 .
- ↑ براون، آر إس (2005). "بروتينات أصابع الزنك: فهم الحمض النووي الريبوزي". الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية . 15 (1): 94-98 . doi : 10.1016/j.sbi.2005.01.006 . PMID 15718139 .
- ↑ غامسياغر ر، ليو سي كيه، لوغلين إف إي، كروسلي إم، ماكاي جيه بي (2007). "الأصابع اللاصقة: أصابع الزنك كعناصر تعريفية للبروتين". تريندز بيوكيم. ساينس . 32 (2): 63-70 . doi : 10.1016/j.tibs.2006.12.007 . PMID 17210253 .
- ↑ ماثيوز جيه إم، وسوند إم (2002). "أصابع الزنك - طيات لمناسبات عديدة" . مجلة IUBMB Life . 54 (6): 351-355 . doi : 10.1080/15216540216035 . PMID 12665246. S2CID 22109146 .
- ↑ لايتي جيه إتش، لي بي إم، رايت بي إي (2001). "بروتينات أصابع الزنك: رؤى جديدة حول التنوع البنيوي والوظيفي". الرأي الحالي في البيولوجيا البنيوية . 11 (1): 39-46 . doi : 10.1016/S0959-440X(00)00167-6 . PMID 11179890 .
- ↑ لوريك كيه إل، جنسن جيه بي، فانغ إس، أونغ إيه إم، هاتاكياما إس، وايس مان إيه إم (1999). " تتوسط حلقات الأصابع عملية إضافة اليوبيكويتين المعتمدة على إنزيم ربط اليوبيكويتين (E2)" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 (20): 11364-11369 . Bibcode : 1999PNAS...9611364L . doi : 10.1073/pnas.96.20.11364 . PMC 18039. PMID 10500182 .
- ↑ جوازيرو، سي. أ.، ويسمان، أ. م. (2000). "بروتينات حلقة الإصبع: وسائط نشاط إنزيم يوبيكويتين ليغاز" . الخلية . 102 (5): 549-552 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00077-5 . PMID 11007473 .
- ↑ فريمونت، ب. س. (2000). "حلقة للتدمير؟" . علم الأحياء الحالي . 10 (2): R84–7. doi : 10.1016/S0960-9822(00)00287-6 . PMID 10662664 .
- 1 2 3 Ito M، Yun Y، Kulkarni DS، Lee S، Sandhu S، Nuñez B، Hu L، Lee K، Lim N، Hirota RM، Prendergast R، Huang C، Huang I، Hunter N (يناير 2025). "الوظائف المتميزة والمترابطة لثلاثة بروتينات RING تنظم إعادة التركيب أثناء الانقسام الاختزالي للثدييات" . Proc Natl Acad Sci الولايات المتحدة الأمريكية . 122 (2) هـ2412961121. دوى : 10.1073/pnas.2412961121 . بمك 11745341 . بميد 39761402 .
روابط خارجية
- مجالات الخاتم والإصبع في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- الأنماط البنيوية للبروتين
- بروتينات إصبع الخاتم
- عائلات البروتينات الفائقة
