تضخيم الجينات
يشير تضخيم الجينات إلى عدد من العمليات الطبيعية والاصطناعية التي يتم من خلالها زيادة عدد نسخ الجين " دون زيادة متناسبة في الجينات الأخرى". [ 1 ]
يُطلق على قطعة الحمض النووي DNA أو RNA التي تمثل مصدرًا و/أو ناتجًا لأحداث التضخيم أو التضاعف الطبيعية أو الاصطناعية اسم الأمبليكون . [ 2 ]
تضخيم الجينات الطبيعي
التضخيم المنظم نمائيًا
في عام ١٩٦٨، درس دونالد د. براون وإيغور ب. داويد الحمض النووي الريبوزي المُضخّم ، وهو الحمض النووي الذي يُشفّر الحمض النووي الريبوزي 28S و18S ، ووصفا "تضخيمًا جينيًا مُحددًا" في البويضات . [ ٣ ] في هذه الدراسة على بويضات البرمائيات، وُجدت نسخ إضافية من الحمض النووي الريبوزي في الحويصلة الجرثومية؛ وترتبط هذه النسخ بنويات خارج الكروموسومات . [ ٣ ] كما وُجد أن الحمض النووي الريبوزي المُضخّم أكثر وفرةً مقارنةً بالحمض النووي النووي الكلي، ومقارنةً بالحمض النووي المُتماثل مع الحمض النووي الريبوزي 4S و5S. [ ٣ ] وجد الباحثان أدلةً على وجود نسخ إضافية من الحمض النووي الريبوزي في بويضات العديد من البرمائيات ، وكذلك في دودة إكيوريدية ومحار الشاطئ . [ ٣ ] قدمت هذه الورقة البحثية بعضًا من أوائل الأدلة على حدوث تغيير جيني عكسي خاص بنوع الخلية أثناء النمو. [ ٣ ]
التضخيم التكيفي تحت الانتقاء
في ظل الانتقاء الطبيعي أو الانتقاء الاصطناعي ، هناك حالات موثقة حيث يؤدي زيادة عدد نسخ الجينات عن طريق تضخيم الجينات إلى زيادة التعبير عن جين مستهدف أو جين مقاومة؛ وتشمل الحالات المعروفة جيدًا مقاومة مبيدات الأعشاب في النباتات، أو مقاومة الأدوية أو مضادات الميكروبات في البكتيريا أو الخميرة.
على سبيل المثال، في خميرة Saccharomyces cerevisiae ، ترتبط مقاومة النحاس بزيادة عدد نسخ جين CUP1 ، الذي يُشفّر بروتين الميثالوثيونين. [ 4 ] يتناسب مستوى مقاومة النحاس طرديًا مع عدد نسخ جين CUP1 ، ويمكن أن يتكرر هذا الموضع الجيني بشكل متسلسل. [ 4 ]
توجد أيضًا أمثلة عديدة على زيادة البكتيريا لمقاومتها عن طريق تضخيم الجينات التي تشفر أهداف الأدوية، أو وظائف الإخراج، أو الإنزيمات المعدلة للمضادات الحيوية. وفي هذا السياق، توجد حالات موثقة لمقاومة الأمبيسيلين، وهو أحد مضادات البيتا لاكتام، حيث تكيفت سلالات بكتيرية مع مستويات عالية من المضاد الحيوي عبر تضخيم الجين الذي يشفر إنزيم بيتا لاكتاماز AmpC . [ 5 ]
توجد في النباتات أمثلة عديدة على تضخيم الجينات المسؤولة عن تحمل مبيدات الأعشاب، استجابةً للتأثيرات الانتقائية لمبيدات مثل الغليفوسات . في الظروف الحقلية، وبعد معالجات زراعية متكررة وعلى مدى سنوات عديدة، لوحظ تضخيم جيني لإنزيم EPSP synthase في الأعشاب المقاومة للغليفوسات، مثل نبات القطيفة ، والكوشيا ، والقنب المائي ، وعشب الإوز ، والراي الإيطالي ، وعشب المروج السنوي . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] يُثبط الغليفوسات النشاط الإنزيمي لإنزيم EPSP synthase بالتساوي في كل من النباتات المقاومة والحساسة، ولكن يزداد العدد النسبي لنسخ الجين المشفر في النباتات المقاومة للغليفوسات من 5 أضعاف إلى أكثر من 160 ضعفًا، مما يؤدي إلى زيادة كبيرة في الإنزيم المستهدف بالغليفوسات، وبالتالي تمكين الأعشاب من البقاء. [ 7 ] يُعد تضخيم جين إنزيم EPSP synthase أحد الآليات الرئيسية لمقاومة الغليفوسات في الأعشاب الضارة نتيجة لزيادة عدد نسخ إنزيم EPSP synthase وتعبيره. [ 8 ]
العمليات الجينومية ذات الصلة
على مستوى الجينوم، يمكن أن تزداد كمية الحمض النووي أو عدد الجينات داخل الكائن الحي من خلال تضاعف الجينات ، وهي آلية رئيسية لتوليد مادة وراثية جديدة خلال التطور الجزيئي . تشمل المصادر الشائعة لتضاعف الجينات، الذي يؤدي إلى تضخيمها ، إعادة التركيب غير المتجانس ، وأحداث النسخ العكسي ، وانزلاق التضاعف . [ 9 ] قد تشمل الأحداث التطورية أو الكروموسومية الأوسع نطاقًا اختلال الصيغة الصبغية أو تعدد الصيغ الصبغية ، ولا تُعتبر عادةً تضخيمًا للجينات يؤدي إلى زيادة عدد نسخ جين معين أو منطقة جينومية.
تضخيم الأحماض النووية في المختبر
في مجال البحث أو التشخيص، يمكن إجراء تضخيم الحمض النووي من خلال طرق مثل:
- تفاعل البوليميراز المتسلسل ، وهو طريقة سهلة ورخيصة وموثوقة لتكرار جزء محدد من الحمض النووي بشكل متكرر عن طريق بلمرة النيوكليوتيدات، وهو مفهوم قابل للتطبيق في العديد من المجالات في علم الأحياء الحديث والعلوم ذات الصلة. [ 10 ]
- تفاعل سلسلة الليغاز ، وهو طريقة لتضخيم الحمض النووي المستخدم كمسبار. لكل من سلسلتي الحمض النووي، يتم ربط مسبارين جزئيين لتكوين المسبار الفعلي؛ وبالتالي، يستخدم تفاعل سلسلة الليغاز إنزيمين: بوليميراز الحمض النووي (يستخدم لتضخيم القالب الأولي ثم يتم تعطيله) وليغاز الحمض النووي المقاوم للحرارة . [ 11 ]
- التضخيم بوساطة النسخ ، وهو نظام تضخيم متساوي الحرارة أحادي الأنبوب للأحماض النووية يستخدم إنزيمين، بوليميراز الحمض النووي الريبي والناسخ العكسي ، لتضخيم الحمض النووي الريبي/الحمض النووي المستهدف بسرعة، مما يتيح الكشف المتزامن عن العديد من الكائنات المسببة للأمراض في أنبوب واحد.
- تضخيم الدائرة المتدحرجة (RCA) هو طريقة تضخيم متساوية الحرارة مُقتبسة من تضاعف الدائرة المتدحرجة . تُنتج هذه الطريقة حمضًا نوويًا أحادي السلسلة متصلًا عن طريق تضخيم حمض نووي دائري.
مراجع
- ↑ " تضخيم الجينات - أحدث الأبحاث والأخبار - مجلة نيتشر" . www.nature.com
- ↑ غراهام ديلاير، جيسون ن بيرمان، روبرت ج. أرسيسي، محرران، علم جينوم السرطان: من المختبر إلى الطب الشخصي (2014)، ص 205.
- براون ، دونالد د .؛ داويد ، إيغور ب . (1968). "تضخيم جيني محدد في البويضات. تحتوي نوى البويضات على نسخ خارج الكروموسومات من جينات الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي". مجلة ساينس . 160 (3825): 272-280 . doi : 10.1126/science.160.3825.272 . PMID 4867987 .
- 1 2 فوغل، س.؛ ويلش، ج. و.؛ كاثالا، ج.؛ كارين، م. (1983). "تضخيم الجينات في الخميرة: عدد نسخ CUP1 ينظم مقاومة النحاس". علم الوراثة الحالي . 7 (5): 347-355 . doi : 10.1007/BF00445874 . PMID 24173415 .
- ↑ غروس، روتيم؛ يلين، إيدان؛ لازار، فيكتوريا؛ سين داتا، مانوشي؛ كيشوني، روي (2024). " مسارات تطورية تعتمد على بيتا لاكتاماز وأخرى مستقلة عنه لمقاومة الأمبيسيلين عالية المستوى" . نيتشر كوميونيكيشنز . 15 (1) 5383. Bibcode : 2024NatCo..15.5383G . doi : 10.1038/s41467-024-49621-2 . PMC 11199616. PMID 38918379 .
- ↑ باولس، ستيفن ب. (2010). "تضخيم الجينات يُؤدي إلى تطور الأعشاب المقاومة للجليفوسات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 107 (3 ) : 955-956 . doi : 10.1073/pnas.0913433107 . PMC 2824278. PMID 20080659 .
- 1 2 غينز، تود أ.؛ تشانغ، وينلي؛ وانغ، دافو؛ بوكون، بكير؛ تشيشولم، ستيفن ت.؛ شانر، ديل ل.؛ نيسن، سكوت ج.؛ باتزولد، ويليام ل.؛ ترانيل، باتريك ج.؛ كولبيبر، أ. ستانلي؛ غراي، تيموثي ل.؛ ويبستر، ثيودور م.؛ فينسيل، ويليام ك.؛ سامونز، ر. دوغلاس؛ جيانغ، جيمينغ؛ بريستون، كريستوفر؛ ليتش، جان إي.؛ ويسترا، فيليب (2010). "تضخيم الجينات يمنح مقاومة للجليفوسات في نبات القطيفة بالميري " . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 107 (3): 1029-1034 . doi : 10.1073/pnas.0906649107 . PMC 2824275. PMID 20018685 .
- 1 2 سودهاكار، س.؛ نورثوورثي، ج.ك.؛ أفينت، ت.؛ غونزاليس-تورالفا، ف.؛ ماكلروي، س.؛ بوتس، ت.ر. (2025). "تأكيد مقاومة الغليفوسات في عشب المروج السنوي ( Poa annua ) عبر تضاعف EPSPS في دورة زراعية لفول الصويا والأرز" . علم الأعشاب الضارة . 73 e9. doi : 10.1017/wsc.2024.86 .
- ↑ تشانغ جيه (2003). "التطور عن طريق تضاعف الجينات: تحديث". اتجاهات في علم البيئة والتطور . 18 (6): 292-298 . doi : 10.1016/S0169-5347(03)00033-8 .
- ↑ "PCR" . مركز تعليم العلوم الوراثية، جامعة يوتا .
- ↑ ويدمان، م (فبراير 1994). "تفاعل سلسلة الليغاز (LCR) - نظرة عامة وتطبيقات" . طرق وتطبيقات تفاعل البوليميراز المتسلسل . 3 (4): S51–64. doi : 10.1101/gr.3.4.s51 . PMID 8173509 .
- علم الوراثة الجزيئية
