تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز
في علم الإنزيمات ، يعتبر تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز ( EC 1.13.11.11 ) إنزيمًا هيميًا يحفز أكسدة L- تريبتوفان ( L - Trp ) إلى N- فورميل- L- كينورينين ، كخطوة أولى ومحددة لمعدل مسار الكينورينين .
يلعب إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز دورًا محوريًا في التنظيم الفيزيولوجي لتدفق التربتوفان في جسم الإنسان، كجزء من العملية البيولوجية الشاملة لاستقلاب التربتوفان. يحفز هذا الإنزيم الخطوة الأولى والمحددة لمعدل تحلل التربتوفان عبر مسار الكينورينين، وبالتالي ينظم مستويات التربتوفان في الجسم. [ 5 ] في البشر، يُشفّر إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز بواسطة جين TDO2 . [ 6 ]
وظيفة
ينتمي هذا الإنزيم إلى عائلة الأكسيدوريدوكتازات ، وتحديدًا تلك التي تعمل على مانح واحد باستخدام الأكسجين (O₂ ) كمؤكسد، وتُدمج ذرتي أكسجين في الركيزة (الأكسيجينازات). تشمل هذه العائلة إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز (TDO، ويُشار إليه أحيانًا باسم تريبتوفان أوكسيجيناز L- تريبتوفان بيرولاز) وإنزيم إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز (IDO) ذي الصلة الوثيقة . [ 7 ] [ 8 ] يحتوي كل من TDO وIDO على هيم واحد مرتبط برابطة غير تساهمية لكل مونومر؛ عادةً ما يكون TDO رباعي الوحدات، بينما يكون IDO أحادي الوحدة.
اكتُشف إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز لأول مرة في ثلاثينيات القرن العشرين [ 9 ] ، وهو موجود في كل من حقيقيات النوى وبدائيات النوى . يقتصر التعبير عن هذا الإنزيم في الثدييات عادةً على الكبد، ولكنه وُجد أيضًا في الدماغ والبربخ لدى بعض الأنواع، وفي بعض الأنسجة، يمكن تحفيز إنتاجه استجابةً للمؤثرات الخارجية. [ 8 ] وكان إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز من الفئران أول إنزيم يُعبَّر عنه بتقنية إعادة التركيب الجيني (في بكتيريا الإشريكية القولونية ). [ 10 ] كما تم التعبير عن إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز البشري أيضًا. [ 11 ] [ 12 ]
تضم نفس عائلة الإنزيمات أيضًا إندول 2،3-ديوكسيجيناز من بكتيريا شيوانيلا أونيدنسيس [ 13 ]، وPrnB، وهو الإنزيم الثاني في مسار التخليق الحيوي للبيرولنيترين من بكتيريا الزائفة المتألقة [ 14 ]، على الرغم من عدم إثبات نشاط الديوكسيجيناز لأي منهما حتى الآن. في عام 2007، تم تحديد إنزيم جديد قادر على تحفيز أكسدة التربتوفان- L ، وهو IDO2 [ 15 ] .
بناء
إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز هو إنزيم سيتوبلازمي يحتوي على الهيم ، ويُشفّر بواسطة الجين TDO2. [ 5 ] كشفت الدراسات البلورية لإنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز من بكتيريا Xanthomonas campestris [ 13 ] وإنزيم تريبتوفان 2،3 -ديوكسيجيناز من بكتيريا Ralstonia metallidurans [ 16 ] أن بنيتهما متطابقة بشكل أساسي، وهما إنزيمان متماثلان رباعيا الوحدات مرتبطان ارتباطًا وثيقًا . [ 17 ] يُوصفان على أفضل وجه بأنهما ثنائي من ثنائيات، لأن بقايا الطرف الأميني لكل وحدة فرعية تُشكّل جزءًا من موقع ارتباط الركيزة في وحدة فرعية مجاورة. البروتينات حلزونية تمامًا، وتُلاحظ حلقة مرنة، تُشارك في ارتباط L- تريبتوفان، خارج جيب الموقع النشط مباشرةً. يبدو أن هذه الحلقة تُستحث بارتباط الركيزة، إذ تُلاحظ فقط في البلورات التي نُمت في وجود L- تريبتوفان. [ 17 ]
يوجد نوعان من هياكل TDO المرتبطة بالركيزة (التريبتوفان). [ 17 ] [ 18 ]
الآلية

قدّم سونو ودوسون مقترحات مبكرة لآلية أكسدة التربتوفان. [ 19 ] أشارت هذه المقترحات إلى آلية انتزاع محفزة قاعديًا، تتضمن فقط الهيم الحديدي (Fe II ). يُفترض أن إنزيمي TDO وIDO يتفاعلان بنفس الآلية، على الرغم من عدم وجود دليل قاطع على ذلك. في إنزيم IDO، تم تحديد هيم فيريل (Fe IV ) أثناء عملية التحول. [ 20 ] [ 21 ] لذلك، تم تعديل المقترحات الآلية لتشمل تكوين هيم فيريل أثناء الآلية. [ 22 ] يُفترض أن إنزيم TDO يتفاعل بنفس الطريقة، ولكن لم يُلاحظ وجود هيم فيريل فيه. انظر أيضًا مناقشة آلية إنزيم إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز .
الأهمية السريرية
لقد ثبت أن إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز يُعبَّر عنه في نسبة كبيرة من الأورام البشرية . [ 5 ] وفي الدراسة نفسها، منع التعبير عن هذا الإنزيم في الأورام رفضها من قِبَل الفئران المُحصَّنة. وقد استعاد مُثبِّطٌ لهذا الإنزيم، طوَّره الفريق البحثي، قدرة هذه الفئران على رفض الأورام التي تُعبِّر عن هذا الإنزيم، مما يُشير إلى أن مُثبِّطات هذا الإنزيم تُظهر إمكانات واعدة في علاج السرطان.
أظهرت دراسة أخرى أن إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز قد يكون له دور في المسار الأيضي المسؤول عن السلوك المرتبط بالقلق . [ 23 ] وقد قام فريق البحث بتوليد فئران تفتقر إلى إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز ومقارنتها بالفئران البرية ، ووجدوا أن الفئران التي تفتقر إلى هذا الإنزيم أظهرت ارتفاعًا في مستويات البلازما ليس فقط في التربتوفان، بل أيضًا في السيروتونين و5 -هيدروكسي إندول أسيتيك أسيد (5-HIAA) في الحصين والدماغ المتوسط . وأظهرت مجموعة متنوعة من الاختبارات، مثل اختبار المتاهة المرتفعة واختبار الحقل المفتوح، تعديلًا مضادًا للقلق في هذه الفئران المعدلة وراثيًا ، مما يدل على وجود صلة مباشرة بين إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز واستقلاب التربتوفان والسلوك المرتبط بالقلق في الظروف الفسيولوجية الطبيعية.
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 ENSG00000151790 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000262635، ENSG00000151790 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000028011 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- 1 2 3 Pilotte L، Larrieu P، Stroobant V، Colau D، Dolusic E، Frédérick R، De Plaen E، Uyttenhove C، Wouters J، Masereel B، Van den Eynde BJ (فبراير 2012). "عكس المقاومة المناعية للورم عن طريق تثبيط التربتوفان 2،3-ديوكسيجيناز" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 109 (7): 2497– 2502. بيب كود : 2012PNAS..109.2497P . دوى : 10.1073/pnas.1113873109 . بمك 3289319 . بميد 22308364 .
- ↑ "Entrez Gene: TDO2 تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز" .
- ↑ إيفيموف، إي.، باسران، ج.، ثاكراي، إس. ج.، هاندا، إس.، موات، سي. ج.، رافين، إي. إل. (أبريل 2011). " بنية وآلية تفاعل ثنائي أوكسيجيناز الهيم" . الكيمياء الحيوية . 50 (14): 2717-2724 . doi : 10.1021/bi101732n . PMC 3092302. PMID 21361337 .
- 1 2 ثاكراي إس جيه، بروكمان سي، موات سي جي، فوروهار إف، تشابمان إس كيه، تونغ إل (2008). "إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز وتربتوفان 2،3-ديوكسيجيناز". كتيب البروتينات المعدنية . doi : 10.1002/0470028637.met223 .
- ^ كوتاكي واي. ماساياما إيز (1936). "Über den Mechanismus der Kynureninbildung aus Tryptophan". Z. فيزيول. الكيمياء . 243 : 237– 244. دوى : 10.1515/bchm2.1936.243.6.237 .
- ↑ رين إس، ليو إتش، ليكاد إي، كوريا إم إيه (سبتمبر 1996). "تعبير إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز من كبد الفئران في بكتيريا الإشريكية القولونية: توصيف بنيوي ووظيفي للإنزيم المنقى". مجلة أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 333 (1): 96-102 . doi : 10.1006/abbi.1996.0368 . PMID 8806758 .
- ↑ باتابيال د، يه إس آر (ديسمبر 2007). "ديوكسيجيناز التربتوفان البشري: مقارنة مع ديوكسيجيناز الإندولامين 2،3". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 129 (50): 15690-15701 . Bibcode : 2007JAChS.12915690B . doi : 10.1021/ja076186k . PMID 18027945 .
- ↑ باسران ج، رافيس س أ، تشوهان ن، إيفيموف إ، تشيزمان م ر، غامساري ل، رافين إي إل (أبريل 2008). "دراسة حركية وطيفية وتفاعلات أكسدة واختزال لإنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز البشري". الكيمياء الحيوية . 47 (16): 4752-4760 . doi : 10.1021/bi702393b . PMID 18370401 .
- 1 2 فوروهار ف، أندرسون جيه إل، موات سي جي، فوروبييف إس إم، حسين أ، أباشيدزه م، بروكمان سي، ثاكراي إس جيه، سيثارامان جيه، تاكر تي، شياو آر، ما إل سي، تشاو إل، أكتون تي بي، مونتيليون جي تي، تشابمان إس كيه، تونغ إل (يناير 2007). "رؤى جزيئية حول التعرف على الركيزة والتحفيز بواسطة تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 104 (2): 473-478 . Bibcode : 2007PNAS..104..473F . doi : 10.1073/pnas.0610007104 . PMC 1766409. PMID 17197414 .
- ↑ دي لورينتيس دبليو، خيم إل، أندرسون جيه إل، آدم إيه، جونسون كيه إيه، فيليبس آر إس، تشابمان إس كيه، فان بي كيه إتش، نايسميث جيه إتش (أكتوبر 2007). "الإنزيم الثاني في مسار التخليق الحيوي للبيرولنيترين يرتبط بعائلة الديوكسيجيناز المعتمدة على الهيم" . الكيمياء الحيوية . 46 (43): 12393-12404 . doi : 10.1021/bi7012189 . PMC 3326534. PMID 17924666 .
- ↑ Ball HJ, Sanchez-Perez A, Weiser S, Austin CJ, Astelbauer F, Miu J, McQuillan JA, Stocker R, Jermiin LS, Hunt NH (يوليو 2007). "توصيف بروتين شبيه بإنزيم إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز موجود في الإنسان والفأر". جين . 396 (1): 203-213 . doi : 10.1016/j.gene.2007.04.010 . PMID 17499941 .
- ↑ تشانغ واي، كانغ إس إيه، موخرجي تي، بيل إس، كرين بي آر، بيغلي تي بي، إيليك إس إي (يناير 2007). "البنية البلورية وآلية عمل إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز، وهو إنزيم هيمي يشارك في هدم التريبتوفان وفي التخليق الحيوي للكينولينات". الكيمياء الحيوية . 46 (1): 145-155 . doi : 10.1021/bi0620095 . PMID 17198384 .
- 1 2 3 ثاكراي إس جيه، موات سي جي، تشابمان إس كيه (ديسمبر 2008). "استكشاف آلية عمل إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز" . معاملات الجمعية الكيميائية الحيوية . 36 (الجزء 6): 1120-1123 . doi : 10.1042/bst0361120 . PMC 2652831. PMID 19021508 .
- ↑ لويس-باليستر أ، فوروهار ف، كيم إس إم، ليو إس، وانغ واي، كاركاشون إس، سيثارامان جيه، باتابيال دي، تشيانغ بي واي، حسين إم، كوريا إم إيه، ييه إس آر، تونغ إل (أكتوبر 2016). "الأساس الجزيئي للحفز والتثبيت الخلوي لإنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز البشري بوساطة الركيزة" . التقارير العلمية . 6 35169. Bibcode : 2016NatSR...635169L . doi : 10.1038/srep35169 . PMC 5071832. PMID 27762317 .
- ↑ سونو م، روش م ب، كولتر إي د، داوسون ج هـ (نوفمبر 1996). "الأكسيجينازات المحتوية على الهيم". المراجعات الكيميائية . 96 (7): 2841-2888 . doi : 10.1021/cr9500500 . PMID 11848843 .
- ↑ لويس-باليستر أ، باتابيال د، إيغاوا ت، لو س، لين ي، مارتي م أ، كابيس ل، إسترين د أ، ييه س ر (أكتوبر 2009). "دليل على وجود وسيط فيريل في ديوكسيجيناز قائم على الهيم" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (41): 17371-17376 . Bibcode : 2009PNAS..10617371L . doi : 10.1073/pnas.0906655106 . PMC 2765089. PMID 19805032 .
- ^ ياناجيساوا إس، يوتسويا ك، هاشيواكي واي، هوريتاني إم، سوجيموتو إتش، شيرو واي، أبلمان إيه، أوجورا تي (2010). "تحديد أنواع Fe-O 2 وFe=O الهيم للإندولامين 2،3-ديوكسيجيناز أثناء الدوران التحفيزي" . كيم ليت . 39 : 36– 37. دوى : 10.1246/cl.2010.36 .
- ↑ باسران ج، إيفيموف إ، تشوهان ن، ثاكراي إس جيه، كروبا جيه إل، إيتون ج، غريفيث جي إيه، موات سي جي، هاندا إس، رافين إي إل (أكتوبر 2011). "آلية تكوين N- فورميل كينورينين بواسطة ثنائي أوكسيجيناز الهيم" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 133 (40): 16251-16257 . Bibcode : 2011JAChS.13316251B . doi : 10.1021 / ja207066z . PMC 3210546. PMID 21892828 .
- ↑ كاناي م، فوناكوشي هـ، تاكاهاشي هـ، هاياكاوا ت، ميزونو س، ماتسوموتو ك، ناكامورا ت (مارس 2009). " إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز هو مُعدِّل رئيسي للتكوين العصبي الفيزيولوجي والسلوك المرتبط بالقلق في الفئران" . الدماغ الجزيئي . 2 (8) 8. doi : 10.1186/1756-6606-2-8 . PMC 2673217. PMID 19323847 .
للمزيد من القراءة
- كومينغز دي إي، موهلمان دي، ديتز جي دبليو، دونلون تي (فبراير 1991). "تحديد موقع أوكسيجيناز التربتوفان البشري في 4q31: دلالات محتملة على إدمان الكحول واضطرابات سلوكية أخرى". علم الجينوم . 9 (2): 301-308 . doi : 10.1016/0888-7543(91)90257-F . PMID 2004780 .
- كومينغز دي إي، موهلمان دي، ديتز جي، شيرمان إم، فورست جي إل (سبتمبر 1995). "تسلسل إنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز البشري (TDO2): وجود عنصر شبيه باستجابة الجلوكوكورتيكويد يتكون من تكرار GTT وتكرار CCCCT داخل الإنترون". علم الجينوم . 29 (2): 390-396 . doi : 10.1006/geno.1995.9990 . PMID 8666386 .
- ديك ر، موراي ب ب، ريد م ج، كوريا م أ (أغسطس 2001). "علاقات البنية والوظيفة لإنزيم تريبتوفان 2،3-ديوكسيجيناز الكبدي في الفئران: تحديد بقايا الهيستيدين المفترضة المرتبطة بالهيم". أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 392 (1): 71-78 . doi : 10.1006/abbi.2001.2420 . PMID 11469796 .
- كودو واي، بويد سي إيه، سارجنت آي إل، ريدمان سي دبليو (مارس 2003). "انخفاض استقلاب التربتوفان بواسطة إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز المشيمي في تسمم الحمل". المجلة الأمريكية لأمراض النساء والتوليد . 188 (3): 719-726 . doi : 10.1067/mob.2003.156 . PMID 12634647 .
- نابي ر، سراجي ف ج، تشوغاني د س، تشونغ هـ، حق أ هـ (فبراير 2004). "ارتباط تعدد أشكال جين ثنائي أوكسيجيناز التربتوفان 2،3 بالتوحد". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية. الجزء ب، علم الوراثة العصبية والنفسية . 125ب (1): 63-68 . doi : 10.1002/ajmg.b.20147 . PMID 14755447. S2CID 26302464 .
- غيليمين، جي جي، سميث، جي، تاكيكاوا، أو، برو، بي جي (يناير 2005). "تعبير إنزيم إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز وإنتاج حمض الكينولينيك بواسطة الخلايا الدبقية الصغيرة والخلايا النجمية والخلايا العصبية البشرية". مجلة جليا . 49 (1): 15-23 . doi : 10.1002/glia.20090 . PMID 15390107. S2CID 31823904 .
- بهاروند، هـ.، هاشمي، س.م.، كاظمي أشتياني، س.، فاروخي، أ. (2006). "تمايز الخلايا الجذعية الجنينية البشرية إلى خلايا كبدية في أنظمة زراعة ثنائية وثلاثية الأبعاد في المختبر" . المجلة الدولية لعلم الأحياء التنموي . 50 (7): 645-652 . doi : 10.1387/ijdb.052072hb . PMID 16892178 .
- باتابيال د، يه إس آر (ديسمبر 2007). "ديوكسيجيناز التربتوفان البشري: مقارنة مع ديوكسيجيناز الإندولامين 2،3". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 129 (50): 15690-15701 . Bibcode : 2007JAChS.12915690B . doi : 10.1021/ja076186k . PMID 18027945 .
- غوبتا ر، فو ر، ليو أ، هندريش م ب (2007). "يُظهر التحليل الطيفي بالرنين المغناطيسي الإلكتروني وموسباور وجود هيمات غير متكافئة في إنزيم ديوكسيجيناز التربتوفان" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 132 (3): 1098-1109 . doi : 10.1021/ja908851e . PMC 4251817. PMID 20047315 .
- أليغري جي، راغازي إي، بيرتازّو أ، كوستا سي في، روكي آر (2003). "استقلاب التربتوفان على طول مسار الكينورينين في الجرذان". التطورات في استقلاب التربتوفان والسيروتونين . التقدم في الطب التجريبي وعلم الأحياء. المجلد 527. الصفحات 481-496 . doi : 10.1007/978-1-4615-0135-0_56 . ISBN 978-1-4613-4939-6PMID 15206766
- تشونغ إل دبليو، لي إكس، سوغيموتو إتش، شيرو واي، موروكوما كيه (سبتمبر 2008). "دراسة نظرية الكثافة الوظيفية حول حلقة مفقودة في فهم كيمياء الهيم: آلية تفاعل إندولامين 2،3-ديوكسيجيناز وتربتوفان 2،3-ديوكسيجيناز". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 130 (37): 12299-12309 . Bibcode : 2008JAChS.13012299C . doi : 10.1021/ja803107w . PMID 18712870 .
- أليجري جي، راجازي إي، بيرتازو أ، بياسيولو إم، كوستا السيرة الذاتية (2003). "استقلاب التربتوفان في الأرانب". التطورات في استقلاب التربتوفان والسيروتونين . التقدم في الطب التجريبي والبيولوجيا. المجلد. 527. ص 473 – 479. دوى : 10.1007 / 978-1-4615-0135-0_55 . رقم ISBN 978-1-4613-4939-6PMID 15206765
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 4
- EC 1.13.11
- إنزيمات الهيم
- إنزيمات ذات بنية معروفة
