زينوبوس

الضفدع زينوبوس ( يُلفظ / ˈzɛnəpəs / [ 1 ] [ 2 ] ) (من اليونانية ξενος، زينوس بمعنى " غريب" + πους، بوس بمعنى "قدم"، ويُعرف باسم الضفدع ذي المخالب ) هو جنس من الضفادع المائية موطنها الأصلي أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى . يضم هذا الجنس حاليًا عشرين نوعًا موصوفًا. أشهر نوعين منه هما زينوبوس ليفيس وزينوبوس تروبيكاليس ، واللذان يُستخدمان على نطاق واسع ككائنات نموذجية في علم الأحياء النمائي، وعلم الأحياء الخلوي، وعلم السموم، وعلم الأعصاب، بالإضافة إلى نمذجة الأمراض البشرية والعيوب الخلقية. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]

يُعرف هذا الجنس أيضًا بتعدد الصيغ الصبغية الخلطية ، حيث تمتلك بعض الأنواع ما يصل إلى 12 مجموعة من الكروموسومات (جميعها خضعت لعملية التضاعف الصبغي ؛ وأعلى عدد هو 2 ن = 12 س = 108 ). [ 6 ]

صفات

يُعدّ الضفدع الأفريقي (Xenopus laevis) كائنًا خاملًا نسبيًا. يتميّز بقدرة تحمل عالية جدًا، إذ يمكن أن يعيش حتى 15 عامًا. في بعض الأحيان ، تجفّ البرك التي يعيش فيها، مما يضطره، خلال موسم الجفاف، إلى الحفر في الطين، تاركًا نفقًا للتنفس. وقد يبقى في حالة سبات لمدة تصل إلى عام. إذا جفّت البركة في موسم الأمطار، فقد يهاجر الضفدع الأفريقي لمسافات طويلة إلى بركة أخرى، معتمدًا على مياه الأمطار لترطيب جسمه. وهو سبّاح ماهر، يسبح في جميع الاتجاهات بسهولة. بالكاد يستطيع القفز، لكنه قادر على الزحف. يقضي معظم وقته تحت الماء، ويصعد إلى السطح للتنفس. يتم التنفس بشكل أساسي من خلال رئتيه المتطورتين؛ أما التنفس الجلدي فهو نادر.

وصف

تتميز جميع أنواع الضفادع من جنس زينوبوس بأجسام مسطحة، بيضاوية الشكل نوعًا ما، وانسيابية، وجلد شديد النعومة (بسبب طبقة مخاطية واقية). [ 7 ] جلد الضفدع أملس، ولكنه يحتوي على عضو حسي جانبي يشبه الغرز. جميع الضفادع سباحون ماهرون، ولها أصابع قوية متصلة بأغشية كاملة، بينما أصابع اليدين غير متصلة. ثلاثة من أصابع كل قدم لها مخالب سوداء بارزة .

تقع عينا الضفدع أعلى رأسه، وتتجهان للأعلى. بؤبؤا العينين دائريان. ليس لديه جفون متحركة ، ولا لسان (بل هو متصل تمامًا بأرضية الفم [ 7 ] )، ولا طبلة أذن (على غرار ضفدع سورينام الشائع، Pipa pipa [ 8 ] ). [ 9 ]

على عكس معظم البرمائيات، لا يوجد لديهم هابتوغلوبين في دمائهم . [ 9 ]

سلوك

تُعدّ أنواع الضفدع الأفريقي (Xenopus) مائية بالكامل ، على الرغم من رصد هجرتها على اليابسة إلى المسطحات المائية القريبة خلال فترات الجفاف أو الأمطار الغزيرة. وتوجد عادةً في البحيرات والأنهار والمستنقعات والحفر في الجداول والخزانات الاصطناعية. [ 9 ]

تُعدّ الضفادع البالغة عادةً مفترسة وقادرة على التغذّي على الجيف ، ولأنّ ألسنتها غير قابلة للاستخدام، تستخدم أطرافها الأمامية الصغيرة للمساعدة في عملية التغذية. ولأنّها تفتقر أيضًا إلى الأكياس الصوتية ، فإنّها تُصدر نقرات (نبضات صوتية قصيرة) تحت الماء (على غرار ضفدع بيبا بيبا ). [ 8 ] يُرسي الذكور تسلسلًا هرميًا للهيمنة الاجتماعية، حيث يكون لذكر واحد الحق في إصدار نداء التزاوج. [ 10 ] تُصدر إناث العديد من الأنواع نداءً للتزاوج، وتُصدر إناث ضفدع زينوبوس ليفيس نداءً إضافيًا عندما تكون جاهزة للتزاوج وعلى وشك وضع البيض. [ 11 ] تنشط أنواع زينوبوس أيضًا خلال ساعات الشفق (أو ساعات الغسق ). [ 9 ]

خلال موسم التزاوج، تنمو لدى الذكور وسائد تزاوج سوداء اللون تشبه التلال على أصابعها لتسهيل الإمساك بالأنثى. ويكون عناق التزاوج لدى الضفادع أربيًا، أي أن الذكر يمسك الأنثى من خصرها. [ 9 ]

صِنف

أنثى ضفدع زينوبوس ليفيس مع مجموعة من البيض حديث الوضع وذكر ضفدع زينوبوس تروبيكاليس

الأنواع الموجودة

الأنواع الأحفورية

تم وصف الأنواع الأحفورية التالية: [ 12 ]

كما توجد العديد من أنواع "الأحافير الجزيئية" المعروفة اليوم فقط بأنها آباء منقرضون لأنواع متعددة الصبغيات حية. [ 6 ]

كائن نموذجي للبحوث البيولوجية

كغيرها من الضفادع ، تُستخدم ضفادع الزينوبوس بكثرة في المختبرات كحيوانات بحثية. [ 7 ] تُعدّ أجنة وبيض الزينوبوس نموذجًا شائعًا للعديد من الدراسات البيولوجية. [ 4 ] [ 5 ] يُستخدم هذا الحيوان نظرًا لسهولة التعامل معه تجريبيًا وقرابته التطورية الوثيقة بالإنسان، على الأقل مقارنةً بالعديد من الكائنات النموذجية. [ 4 ] [ 5 ]

لطالما شكّل الضفدع الأفريقي (Xenopus) أداةً بالغة الأهمية في الدراسات الحيوية داخل الكائنات الحية في مجالات البيولوجيا الجزيئية والخلوية والتطورية للفقاريات. [ 5 ] ومع ذلك، فإنّ النطاق الواسع لأبحاث الضفدع الأفريقي ينبع من حقيقة إضافية، وهي أنّ المستخلصات الخالية من الخلايا المُستخلصة منه تُعدّ نظامًا مخبريًا رائدًا لدراسة الجوانب الأساسية للبيولوجيا الخلوية والجزيئية. وبالتالي، يُعدّ الضفدع الأفريقي نموذجًا حيويًا للفقاريات يسمح بإجراء تحليلات حيوية عالية الإنتاجية لوظائف الجينات والكيمياء الحيوية. علاوة على ذلك، تُعدّ بويضات الضفدع الأفريقي نظامًا رائدًا لدراسة نقل الأيونات ووظائف القنوات الأيونية. [ 4 ] كما يُعدّ الضفدع الأفريقي نظامًا فريدًا لتحليل تطور الجينوم (وخاصةً التضاعف الصبغي والتضاعف الصبغي ) في الفقاريات، [ 13 ] حيث تُشكّل أنواع الضفدع الأفريقي المختلفة سلسلةً من التضاعف الصبغي (2x، 4x، 8x، 12x) ناتجةً عن التهجين بين الأنواع . [ 14 ] (للحصول على نظرة عامة على تطور Xenopus مع الأخذ في الاعتبار أحداث التهجين السابقة، انظر الشكل 3 من Evans et al. ، 2015.) [ 6 ]

في عام ١٩٣١، لاحظ لانسلوت هوغبن أن إناث ضفدع زينوبوس ليفيس تُبَيِّض عند حقنها ببول النساء الحوامل. [ ١٥ ] أدى هذا إلى تطوير اختبار حمل، قام الباحثان الجنوب أفريقيان هليل آبي شابيرو وهاري زوارنشتاين بتطويره لاحقًا. [ ١٦ ] كانت أنثى ضفدع زينوبوس تُحقن ببول امرأة، ثم توضع في وعاء به قليل من الماء. إذا وُجدت بيوض في الماء بعد يوم، فهذا يعني أن المرأة حامل. بعد أربع سنوات من أول اختبار على ضفدع زينوبوس ، أفاد زميل زوارنشتاين، الدكتور لويس بوسمان، أن الاختبار كان دقيقًا في أكثر من ٩٩٪ من الحالات. [ ١٧ ] من ثلاثينيات القرن العشرين إلى خمسينياته، صُدِّرت آلاف الضفادع إلى جميع أنحاء العالم لاستخدامها في اختبارات الحمل هذه. [ ١٨ ]

اليُعدّ المورد الوطني لضفدع زينوبوس التابع للمختبر البيولوجي البحري مستودعًا حيويًا للسلالات المعدلة وراثيًا والطافرة ومركزًا للتدريب. [ 19 ]

قاعدة بيانات الكائنات النموذجية على الإنترنت

Xenbase [ 20 ] هي قاعدة بيانات الكائنات النموذجية (MOD) لكل من Xenopus laevis و Xenopus tropicalis . [ 21 ]

دراسة جينات الأمراض البشرية

تُستخدم جميع أساليب البحث في الضفدع الأفريقي (الأجنة، والمستخلصات الخالية من الخلايا، والبويضات) بشكل شائع في الدراسات المباشرة لجينات الأمراض البشرية، وفي دراسة الأسس العلمية الكامنة وراء بدء السرطان وتطوره. [ 22 ] أجنة الضفدع الأفريقي للدراسات الحية لوظيفة جينات الأمراض البشرية: تتميز أجنة الضفدع الأفريقي بكبر حجمها وسهولة التعامل معها، كما يمكن الحصول على آلاف الأجنة في يوم واحد. في الواقع، كان الضفدع الأفريقي أول حيوان فقاري طُوّرت له طرق تسمح بالتحليل السريع لوظيفة الجينات باستخدام التعبير الجيني غير الطبيعي (عن طريق حقن الحمض النووي الريبوزي الرسول [ 23 ] ). وقد أدى حقن الحمض النووي الريبوزي الرسول في الضفدع الأفريقي إلى استنساخ الإنترفيرون. [ 24 ] علاوة على ذلك، فإن استخدام مورفولينو-مضادات التعبير الجيني لإسكات الجينات في أجنة الفقاريات، والذي يُستخدم على نطاق واسع الآن، طُوّر لأول مرة بواسطة جانيت هيسمان باستخدام الضفدع الأفريقي . [ 25 ]

في السنوات الأخيرة، لعبت هذه المناهج دورًا هامًا في دراسات جينات الأمراض البشرية. وقد دُرست آلية عمل العديد من الجينات المتحولة في اضطرابات الكلى الكيسية البشرية (مثل داء الكلى الكيسي النخاعي ) على نطاق واسع في أجنة الضفدع الأفريقي (Xenopus ) ، مما ألقى ضوءًا جديدًا على العلاقة بين هذه الاضطرابات وتكوين الأهداب وإشارات Wnt . [ 26 ] كما وفرت أجنة الضفدع الأفريقي بيئة اختبار سريعة للتحقق من صحة جينات الأمراض المكتشفة حديثًا. على سبيل المثال، أكدت الدراسات التي أُجريت على الضفدع الأفريقي دور PYCR1 في ارتخاء الجلد المصحوب بخصائص الشيخوخة المبكرة، ووضحته. [ 27 ]

الضفدع المعدل وراثيًا لدراسة تنظيم نسخ جينات الأمراض البشرية: تنمو أجنة الضفدع بسرعة، لذا يُعد التعديل الوراثي فيها طريقة سريعة وفعالة لتحليل التسلسلات التنظيمية الجينومية. في دراسة حديثة، تبين أن الطفرات في موضع SMAD7 مرتبطة بسرطان القولون والمستقيم لدى الإنسان . تقع هذه الطفرات في تسلسلات محفوظة، ولكنها غير مشفرة، مما يشير إلى أن هذه الطفرات تؤثر على أنماط نسخ SMAD7 . لاختبار هذه الفرضية، استخدم الباحثون التعديل الوراثي في ​​الضفدع ، وكشفوا أن هذه المنطقة الجينومية تحفز التعبير عن بروتين GFP في الأمعاء الخلفية. علاوة على ذلك، أظهرت الكائنات المعدلة وراثيًا التي أُنتجت باستخدام النسخة الطافرة من هذه المنطقة تعبيرًا أقل بكثير في الأمعاء الخلفية. [ 28 ]

مستخلصات خلايا الضفدع الأفريقي (Xenopus) الخالية من الخلايا لدراسات الكيمياء الحيوية للبروتينات المشفرة بواسطة جينات الأمراض البشرية: تتمثل إحدى المزايا الفريدة لنظام الضفدع الأفريقي في احتواء المستخلصات السيتوبلازمية على كلٍ من البروتينات السيتوبلازمية والنووية الذائبة (بما في ذلك بروتينات الكروماتين). وهذا يختلف عن المستخلصات الخلوية المُحضّرة من الخلايا الجسدية ذات الحجيرات الخلوية المتميزة. وقد قدمت مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي رؤىً عديدة حول البيولوجيا الأساسية للخلايا، مع تأثير خاص على انقسام الخلايا وعمليات الحمض النووي المرتبطة به (انظر أدناه).

أسفرت الدراسات التي أُجريت على مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي (Xenopus) عن رؤى بالغة الأهمية حول آلية عمل جينات الأمراض البشرية المرتبطة بعدم الاستقرار الجيني وارتفاع خطر الإصابة بالسرطان، مثل ترنح توسع الشعيرات، وسرطان الثدي والمبيض الوراثي المرتبط بجين BRCA1 ، ومتلازمة نيميغن المرتبطة بجين Nbs1 ، ومتلازمة روثمون-تومسون المرتبطة بجين RecQL4 ، وجين c-Myc الورمي، وبروتينات FANC ( فقر الدم فانكوني ). [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ]

بويضات الضفدع الأفريقي (Xenopus) لدراسة التعبير الجيني ونشاط القنوات المرتبطة بالأمراض البشرية: من نقاط قوة الضفدع الأفريقي (Xenopus) الأخرى القدرة على قياس نشاط بروتينات القنوات والناقلات بسرعة وسهولة باستخدام التعبير الجيني في البويضات. وقد أدى هذا التطبيق أيضًا إلى رؤى مهمة حول الأمراض البشرية، بما في ذلك الدراسات المتعلقة بانتقال التريبانوسوما [ 34 ] ، والصرع المصحوب بترنح وصمم حسي عصبي [ 35 واضطراب النظم القلبي الكارثي ( متلازمة كيو تي الطويلة ) [ 36 ] ، واعتلال بيضاء الدماغ الضخم [ 37 ] .

تم مؤخراً إثبات إمكانية تعديل الجينات باستخدام نظام CRISPR/CAS في الضفدع الاستوائي Xenopus tropicalis [ 38 ] [ 39 ] والضفدع الأفريقي Xenopus laevis [ 40 ] . تُستخدم هذه التقنية لفحص تأثيرات جينات الأمراض البشرية في الضفدع الأفريقي ، ويتميز النظام بكفاءة عالية لدراسة هذه التأثيرات داخل الأجنة نفسها التي خضعت للتعديل [ 41 ] .

دراسة العمليات البيولوجية الأساسية

نقل الإشارات : تُستخدم أجنة الضفدع الأفريقي (Xenopus) ومستخلصاتها الخالية من الخلايا على نطاق واسع في البحوث الأساسية المتعلقة بنقل الإشارات. ففي السنوات القليلة الماضية، قدمت أجنة الضفدع الأفريقي رؤى بالغة الأهمية حول آليات نقل إشارات TGF-beta وWnt. على سبيل المثال، استُخدمت أجنة الضفدع الأفريقي لتحديد الإنزيمات التي تتحكم في إضافة اليوبيكويتين إلى Smad4، [ 42 ] ولإثبات وجود روابط مباشرة بين مسارات إشارات عائلة TGF-beta الفائقة وشبكات مهمة أخرى، مثل مسار كيناز البروتين المنشط بالمايتوجين (MAPK) [ 43 ] ومسار Wnt. [ 44 ] علاوة على ذلك، كشفت طرق جديدة باستخدام مستخلصات البيض عن أهداف جديدة وهامة لمركب تدمير Wnt/GSK3. [ 45 ]

انقسام الخلايا : سمحت مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي (Xenopus) بدراسة العديد من العمليات الخلوية المعقدة في المختبر . ولأن سيتوبلازم البيضة يدعم دورات متتالية بين الانقسام المتساوي والطور البيني في المختبر ، فقد كان له دور حاسم في دراسات متنوعة لانقسام الخلايا. على سبيل المثال، وُجد أن البروتين GTPase الصغير Ran ينظم النقل النووي في الطور البيني، لكن مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي كشفت عن الدور الحاسم لبروتين Ran GTPase في الانقسام المتساوي بشكل مستقل عن دوره في النقل النووي في الطور البيني. [ 46 ] وبالمثل، استُخدمت المستخلصات الخالية من الخلايا لنمذجة تجميع الغلاف النووي من الكروماتين، مما كشف عن وظيفة RanGTPase في تنظيم إعادة تجميع الغلاف النووي بعد الانقسام المتساوي. [ 47 ] ومؤخرًا، باستخدام مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي ، أمكن إثبات الوظيفة الخاصة بالانقسام المتساوي للبروتين النووي لامين B في تنظيم تكوين المغزل [ 48 ] وتحديد بروتينات جديدة تتوسط ارتباط الحيز الحركي بالأنيبيبات الدقيقة. [ 49 ] أصبحت الأنظمة الخالية من الخلايا مؤخرًا أدوات بحثية عملية، وغالبًا ما تكون بويضات الضفدع الأفريقي مصدرًا للمستخلصات المستخدمة. وقد أسفر ذلك عن نتائج مهمة في فهم التذبذب الانقسامي والأنيبيبات الدقيقة . [ 50 ]

التطور الجنيني : تُستخدم أجنة الضفدع الأفريقي (Xenopus) على نطاق واسع في علم الأحياء النمائي. وتشمل أبرز التطورات الحديثة التي حققتها أبحاث الضفدع الأفريقي في السنوات الأخيرة ما يلي:

  1. علم التخلق لتحديد مصير الخلية [ 51 ] وخرائط مرجعية للجينوم [ 52 ]
  2. microRNA في تشكيل الطبقات الجرثومية وتطور العين [ 53 ] [ 54 ]
  3. العلاقة بين إشارات Wnt والتيلوميراز [ 55 ]
  4. تطور الأوعية الدموية [ 56 ]
  5. تكوين الأمعاء [ 57 ]
  6. تثبيط الاتصال وهجرة خلايا العرف العصبي [ 58 ] وتكوين العرف العصبي من خلايا البلاستولا متعددة القدرات [ 59 ]
  7. المصير التنموي - دور Notch : أوضح دورسكي وآخرون عام 1995 نمطًا من التعبير يتبعه انخفاض التنظيم [ 60 ].

تضاعف الحمض النووي : تدعم المستخلصات الخلوية الخالية من الخلايا من الضفدع الأفريقي (Xenopus) التجميع المتزامن وتفعيل مواقع بدء تضاعف الحمض النووي. وقد كان لها دورٌ أساسي في تحديد الوظيفة البيوكيميائية للمركب ما قبل التضاعف، بما في ذلك بروتينات MCM. [ 61 ] [ 62 ]

استجابة تلف الحمض النووي : لعبت المستخلصات الخلوية دورًا محوريًا في كشف مسارات الإشارات التي يتم تنشيطها استجابةً لكسور الحمض النووي المزدوجة (ATM)، أو توقف شوكة التضاعف (ATR)، أو الروابط المتقاطعة بين خيوط الحمض النووي (بروتينات FA وATR). والجدير بالذكر أن العديد من آليات ومكونات مسارات نقل الإشارة هذه قد تم تحديدها لأول مرة في الضفدع الأفريقي (Xenopus ). [ 31 ] [ 63 ] [ 64 ]

الاستماتة : توفر بويضات الضفدع الأفريقي (Xenopus) نموذجًا مناسبًا للدراسات البيوكيميائية للاستماتة. وقد استُخدمت هذه البويضات مؤخرًا لدراسة الآليات البيوكيميائية لتفعيل كاسبيز-2؛ ومن المهم أن هذه الآلية محفوظة في الثدييات. [ 65 ]

الطب التجديدي : في السنوات الأخيرة، ازداد الاهتمام بعلم الأحياء النمائي بشكل كبير بفضل ما يبشر به الطب التجديدي. وقد لعب الضفدع الأفريقي (Xenopus) دورًا هامًا في هذا المجال. فعلى سبيل المثال، أدى التعبير عن سبعة عوامل نسخ في خلايا الضفدع الأفريقي متعددة القدرات إلى تمكين هذه الخلايا من التطور إلى عيون وظيفية عند زرعها في أجنة الضفدع ، مما يوفر رؤى قيّمة حول إصلاح تنكس أو تلف الشبكية. [ 66 ] وفي دراسة مختلفة تمامًا، استُخدمت أجنة الضفدع الأفريقي لدراسة تأثير شد الأنسجة على التكوين الشكلي، [ 67 ] وهي مسألة بالغة الأهمية لهندسة الأنسجة في المختبر . تُعد أنواع الضفدع الأفريقي كائنات نموذجية مهمة لدراسة تجديد الحبل الشوكي، لأنه على الرغم من قدرتها على التجديد في مراحلها اليرقية، إلا أنها تفقد هذه القدرة في المراحل المبكرة من التحول. [ 68 ]

علم وظائف الأعضاء : يُعدّ النبض الموجه للخلايا متعددة الأهداب ضروريًا لنمو الجهاز العصبي المركزي، والمجرى التنفسي، وقناة البيض، والحفاظ على توازنها. وقد طُوّرت مؤخرًا الخلايا متعددة الأهداب في بشرة الضفدع الأفريقي (Xenopus) لتكون أول بيئة اختبار حية لدراسة هذه الأنسجة الهدبية، وقد قدمت هذه الدراسات رؤى مهمة حول التحكم البيوميكانيكي والجزيئي في النبض الموجه. [ 69 ] [ 70 ]

الأكتين : من النتائج الأخرى لمستخلصات بويضات الضفدع الأفريقي الخالية من الخلايا تحسين فهم الأكتين. [ 50 ]

فحص الجزيئات الصغيرة لتطوير علاجات جديدة

نظراً لسهولة الحصول على كميات هائلة من المواد، يتم الآن استخدام جميع أساليب البحث في الضفدع الأفريقي (Xenopus) لإجراء عمليات فحص تعتمد على الجزيئات الصغيرة.

علم الوراثة الكيميائية لنمو الأوعية الدموية في يرقات ضفادع الزينوبوس : نظرًا للدور المهم لتكوين الأوعية الدموية الجديدة في تطور السرطان، استُخدمت أجنة الزينوبوس مؤخرًا لتحديد جزيئات صغيرة جديدة مثبطة لنمو الأوعية الدموية. والجدير بالذكر أن المركبات التي تم تحديدها في الزينوبوس كانت فعالة في الفئران. [ 71 ] [ 72 ] كما برزت أجنة الضفادع بشكل لافت في دراسة استخدمت مبادئ التطور لتحديد عامل جديد مُعطِّل للأوعية الدموية قد يكون له إمكانات علاجية كيميائية. [ 73 ] وقد نُشر هذا العمل في قسم العلوم بصحيفة نيويورك تايمز. [ 74 ]

اختبار المواد المحتملة المسببة لاضطرابات الغدد الصماء في أجنة الضفدع المعدلة وراثيًا (Xenopus) في الجسم الحي ؛ تم مؤخرًا تطوير اختبار عالي الإنتاجية لاضطراب الغدة الدرقية باستخدام أجنة الضفدع المعدلة وراثيًا (Xenopus) . [ 75 ]

فحص الجزيئات الصغيرة في مستخلصات بيض الضفدع الأفريقي : توفر مستخلصات البيض تحليلاً سهلاً للعمليات البيولوجية الجزيئية، ويمكن فحصها بسرعة. وقد استُخدم هذا النهج لتحديد مثبطات جديدة لإنزيمات تحلل البروتين وإصلاح الحمض النووي بوساطة البروتيازوم. [ 76 ] [ 77 ]

الدراسات الجينية

على الرغم من أن الضفدع الأفريقي المخلبي (Xenopus laevis) هو النوع الأكثر استخدامًا في دراسات بيولوجيا النمو ، إلا أن الدراسات الجينية، وخاصة الدراسات الجينية المباشرة، قد تكون معقدة بسبب جينومه شبه الرباعي الصبغي . يوفر الضفدع الأفريقي الاستوائي (Xenopus tropicalis) نموذجًا أبسط للدراسات الجينية، نظرًا لامتلاكه جينومًا ثنائي الصبغي .

تقنيات تثبيط التعبير الجيني

يمكن تقليل التعبير الجيني بوسائل متعددة، منها استخدام قليل النوكليوتيدات المضادة التي تستهدف جزيئات mRNA محددة. غالبًا ما تُعدّل قليل النوكليوتيدات DNA المكملة لجزيئات mRNA محددة كيميائيًا لتحسين استقرارها داخل الكائن الحي . تشمل التعديلات الكيميائية المستخدمة لهذا الغرض: الفوسفوروثيوات، و2'-O-ميثيل، والمورفولينو، وفوسفوراميدات MEA، وفوسفوراميدات DEED. [ 78 ]

مورفولينو أوليغونوكليوتيدات

تُستخدم قليل النوكليوتيدات المورفولينية في كل من الضفدع الأفريقي ذي المخالب (Xenopus laevis) والضفدع الأفريقي الاستوائي (Xenopus tropicalis) لدراسة وظيفة البروتين من خلال مراقبة نتائج تعطيل نشاطه. [ 78 ] [ 79 ] على سبيل المثال، تم فحص مجموعة من جينات الضفدع الأفريقي الاستوائي (Xenopus tropicalis) بهذه الطريقة. [ 80 ]

مورفولينو أوليغومرات (MOs) هي أوليغومرات قصيرة مضادة للمعنى، مصنوعة من نيوكليوتيدات معدلة. تستطيع هذه المورفولينات تثبيط التعبير الجيني عن طريق منع ترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، أو منع عملية ربط الحمض النووي الريبوزي (RNA)، أو تثبيط نشاط ونضج الحمض النووي الريبوزي الميكروي (miRNA). وقد أثبتت المورفولينات فعاليتها كأدوات لتثبيط التعبير الجيني في تجارب بيولوجيا النمو، وككواشف لحجب الحمض النووي الريبوزي في الخلايا المزروعة. لا تُحلل المورفولينات أهدافها من الحمض النووي الريبوزي، بل تعمل عبر آلية حجب فراغي مستقلة عن إنزيم RNAseH. وهي تبقى مستقرة في الخلايا ولا تُحفز استجابات مناعية. ويمكن لحقن المورفولينات مجهريًا في أجنة الضفدع الأفريقي (Xenopus) في مراحلها المبكرة أن يُثبط التعبير الجيني بطريقة مُستهدفة.

كما هو الحال مع جميع أساليب مضادات التعبير الجيني، قد تختلف فعالية جزيئات الحمض النووي الريبوزي المتعددة (MOs) المختلفة، وقد تُسبب آثارًا جانبية غير محددة. غالبًا ما يتطلب الأمر اختبار عدة جزيئات MOs للعثور على تسلسل مستهدف فعال. تُستخدم ضوابط صارمة لإثبات الخصوصية، [ 79 ] بما في ذلك:

  • نظير ظاهري للطفرة الجينية
  • التحقق من البروتين المختزل بواسطة تقنية ويسترن بلوت أو التلوين المناعي
  • إنقاذ الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عن طريق إضافة حمض نووي ريبوزي رسول (mRNA) مقاوم للجزيء العضوي (MO).
  • استخدام نوعين مختلفين من الكائنات المعدلة وراثيًا (حجب الترجمة وحجب الربط)
  • حقن الخلايا الليمفاوية الضابطة

توفر قاعدة بيانات Xenbase فهرسًا قابلًا للبحث يضم أكثر من 2000 مورفولينو (MOs) استُخدمت خصيصًا في أبحاث الضفدع الأفريقي (Xenopus). يمكن البحث في البيانات باستخدام التسلسل، ورمز الجين، ومرادفات مختلفة (كما وردت في منشورات متعددة). [ 81 ] تربط Xenbase المورفولينات بأحدث جينومات الضفدع الأفريقي في GBrowse، وتتنبأ بالنتائج غير المستهدفة، وتُدرج جميع الدراسات المنشورة حول الضفدع الأفريقي التي نُشر فيها المورفولين.

مراجع

  1. "زينوبوس" . قاموس ليكسيكو الإنجليزي البريطاني . مطبعة جامعة أكسفورد . مؤرشف من الأصل بتاريخ 22-03-2020.
  2. "زينوبوس" . قاموس Merriam-Webster.com . Merriam-Webster. OCLC 1032680871. تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 يناير 2016 . 
  3. نيني إم جيه، فيشر إم إي، جيمس-زورن سي، بيلز تي جيه، بونفيرادا في، تشو إس، وآخرون (2019). "Xenbase: تسهيل استخدام الضفدع الأفريقي (Xenopus ) لنمذجة الأمراض البشرية" . مجلة Frontiers in Physiology . 10 : 154. doi : 10.3389/fphys.2019.00154 . PMC 6399412. PMID 30863320 .   
  4. 1 2 3 4 والينغفورد جيه بي، ليو كيه جيه، تشنغ واي (مارس 2010). "زينوبوس" . علم الأحياء الحالي . 20 (6): R263– R264. رمز Bibcode : 2010CBio...20.R263W . doi : 10.1016/j.cub.2010.01.012 . PMID 20334828 . 
  5. 1 2 3 4 هارلاند آر إم، غرينجر آر إم (ديسمبر 2011). " أبحاث الضفدع الأفريقي: تحولات بفعل علم الوراثة وعلم الجينوم" . اتجاهات في علم الوراثة . 27 (12): 507-515 . doi : 10.1016/j.tig.2011.08.003 . PMC 3601910. PMID 21963197 .  
  6. إيفانز ، بي جيه ؛ كارتر، تي إف؛ غرينباوم، إي؛ غفوزديك، في؛ كيلي، دي بي؛ ماكلولين، بي جيه؛ باولز، أو إس؛ بورتيك، دي إم؛ ستانلي، إي إل؛ تينسلي، آر سي؛ توبياس، إم إل؛ بلاكبيرن، دي سي (2015). "علم الوراثة، والتشكل، ونداءات التزاوج، والسجلات التاريخية تميز ستة أنواع جديدة متعددة الصيغ الصبغية من ضفادع المخالب الأفريقية (زينوبوس، بيبيداي) من غرب ووسط أفريقيا". مجلة PLoS ONE . 10 (12) e0142823. doi : 10.1371/journal.pone.0142823 . PMID 26672747 . {{cite journal}}: CS1 maint: unflagged free DOI ( link )
  7. 1 2 3 "وحدة تعليمية للجنة رعاية الحيوانات واستخدامها - الضفدع الأفريقي المخلبي " جامعة أريزونا. مؤرشفة من الأصل بتاريخ 26-06-2010 . تم الاطلاع عليها بتاريخ 11-10-2009 .
  8. 1 2 روتس سي (2006). الحيوانات الليلية . دار غرينوود للنشر. ص 19. ISBN  978-0-313-33546-4.
  9. 1 2 3 4 5 باسْمور، ن. إ.، وكاروثرز، ف. س. (1979). ضفادع جنوب أفريقيا . جوهانسبرغ: مطبعة جامعة ويتواترسراند. ص 42-43 . ISBN  0-85494-525-3.
  10. توبياس إم إل، كورك إيه، كورش جيه، ين دي، كيلي دي بي (نوفمبر 2010). "التنافس الصوتي لدى ذكور ضفادع زينوبوس ليفيس" . علم البيئة السلوكي وعلم الأحياء الاجتماعي . 64 (11): 1791-1803 . doi : 10.1007/s00265-010-0991-3 . PMC 3064475. PMID 21442049 .  
  11. توبياس إم إل، فيسواناثان إس إس، كيلي دي بي (فبراير 1998). "النقر، وهو نداء استقبالي أنثوي، يبدأ ثنائيات بين الذكور والإناث في ضفدع جنوب أفريقيا المخالب" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (4): 1870-1875 . Bibcode : 1998PNAS...95.1870T . doi : 10.1073/pnas.95.4.1870 . PMC 19205. PMID 9465109 .  
  12. [ زينوبوس ] علىموقع Fossilworks.org
  13. سيشن إيه إم، أونو واي، كوون تي، تشابمان جيه إيه، تويودا إيه، تاكاهاشي إس، وآخرون . (أكتوبر 2016). " تطور الجينوم في الضفدع رباعي الصبغيات Xenopus laevis" . مجلة نيتشر . 538 (7625): 336-343 . Bibcode : 2016Natur.538..336S . doi : 10.1038/nature19840 . PMC 5313049. PMID 27762356 .   
  14. شميد م، إيفانز ب ج، بوغارت ج ب (2015). "تعدد الصيغ الصبغية في البرمائيات" . أبحاث علم الوراثة الخلوية والجينوم . 145 ( 3-4 ): 315-330 . doi : 10.1159/000431388 . PMID 26112701 . 
  15. هوغبن إل، تشارلز إي، سلوم دي (1931). "دراسات حول الغدة النخامية. 8. علاقة الغدة النخامية باستقلاب الكالسيوم ووظيفة المبيض في الضفدع الأفريقي (Xenopus)" . مجلة علم الأحياء التجريبي . 8 : 345-354 . doi : 10.1242/jeb.8.4.345 . مؤرشف من الأصل في 13 أغسطس 2018. تم الاسترجاع في 12 أغسطس 2018 .
  16. إلكان إي آر (ديسمبر 1938). "اختبار الحمل باستخدام الضفدع الأفريقي" . المجلة الطبية البريطانية . 2 (4067): 1253-1274.2. doi : 10.1136/bmj.2.4067.1253 . PMC 2211252. PMID 20781969 .  
  17. تشخيص الحمل ، لويس ب. بوسمان، المجلة الطبية البريطانية 1937؛2:939، 6 نوفمبر 1937
  18. نوير ر (16 مايو 2013). "كان الأطباء يستخدمون الضفادع الأفريقية الحية كاختبارات حمل" . Smithsonian.com . مؤرشف من الأصل في 16 نوفمبر 2018. تم الاطلاع عليه في 30 أكتوبر 2018 .
  19. "المورد الوطني لضفدع زينوبوس" . مختبر الأحياء البحرية . مؤرشف من الأصل بتاريخ 4 أبريل 2022. تم الاطلاع عليه بتاريخ 5 أبريل 2022 .
  20. كريمي ك، فورتريد جيه دي، لوتيه في إس، بيرنز كيه إيه، وانغ دي زد، فيشر إم إي، وآخرون . (يناير 2018). "Xenbase: قاعدة بيانات للكائنات النموذجية الجينومية والإبيجينومية والترانسكريبتومية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 46 (D1): D861– D868 . doi : 10.1093/nar/gkx936 . PMC 5753396. PMID 29059324 .   
  21. "قاعدة بيانات الكائنات النموذجية من نوع زينوبوس" . Xenbase.org . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 4 سبتمبر 2009. تم الاطلاع عليها بتاريخ 24 يناير 2005 .
  22. هاردويك إل جيه، فيلبوت إيه (ديسمبر 2015). "صديق طبيب الأورام: كيف يُسهم الضفدع الأفريقي (Xenopus) في أبحاث السرطان" . علم الأحياء النمائي . نمذجة التطور البشري والأمراض في الضفدع الأفريقي (Xenopus). 408 ( 2): 180-187 . doi : 10.1016/j.ydbio.2015.02.003 . PMC 4684227. PMID 25704511 .  
  23. جوردون جيه بي، لين سي دي، وودلاند إتش آر، مارباي جي (سبتمبر 1971). "استخدام بيض الضفادع والبويضات لدراسة الحمض النووي الريبوزي الرسول وترجمته في الخلايا الحية". مجلة نيتشر . 233 (5316): 177-182 . Bibcode : 1971Natur.233..177G . doi : 10.1038/233177a0 . PMID 4939175. S2CID 4160808 .  
  24. رينولدز، ف. هـ.، بريمكومار، إ.، بيثا، ب. م. (ديسمبر 1975). "نشاط الإنترفيرون الناتج عن ترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول للإنترفيرون البشري في أنظمة ريبوسومية خالية من الخلايا وفي بويضات الضفدع الأفريقي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 72 (12): 4881-4885 . Bibcode : 1975PNAS...72.4881R . doi : 10.1073 / pnas.72.12.4881 . PMC 388836. PMID 1061077 .  
  25. هيسمان ج، كوفرون م، وايلي س (يونيو 2000). "تحليل نشاط إشارات بيتا-كاتينين في جنين الضفدع زينوبوس المبكر: نهج مضاد جديد" . علم الأحياء النمائي . 222 (1): 124-134 . doi : 10.1006/dbio.2000.9720 . PMID 10885751 . 
  26. شيفر تي، بوتز إم، لينكامب إس، جانر إيه، بيرغبرايتر إيه، راماتشاندران إتش، وآخرون . (ديسمبر 2008). "التفاعل الجيني والفيزيائي بين نواتج جيني NPHP5 وNPHP6" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 17 (23): 3655-3662 . doi : 10.1093/hmg/ ddn260 . PMC 2802281. PMID 18723859 .   
  27. عكس ب، إسكاند-بيلارد ن، ديموبولو أ، فيشر ب، تشنغ إس سي، لي واي، وآخرون . (سبتمبر 2009). "الطفرات في PYCR1 تسبب تراخي الجلد مع ميزات progeroid". علم الوراثة الطبيعة . 41 (9): 1016-1021 . دوى : 10.1038 / ng.413 . اتش دي ال : 11858/00-001M-0000-0010-7D1E-8 . بميد 19648921 . S2CID 10221927 .   
  28. بيتمان إيه إم، نارانجو إس، ويب إي، برودريك بي، ليبس إي إتش، فان ويزل تي، وآخرون (يونيو 2009). "يُعزى خطر الإصابة بسرطان القولون والمستقيم في الموضع 18q21 إلى متغير جديد يُغير من تعبير جين SMAD7" . أبحاث الجينوم . 19 (6): 987-993 . doi : 10.1101/gr.092668.109 . PMC 2694486. PMID 19395656 .   
  29. جوكوف ف، غروين أ.س، بروخوروفا ت، غيرسون ر، وايت إ، رودريغيز أ، وآخرون . (نوفمبر 2006). " يُعدِّل ثنائي BRCA1/BARD1 غير المتجانس تجميع المغزل الانقسامي المعتمد على ran" . الخلية . 127 (3): 539-552 . doi : 10.1016/j.cell.2006.08.053 . PMID 17081976. S2CID 17769149 .   
  30. يو زد، بايليس جيه إم، جونسون إس إيه، ديلورث إس إم، هنتر تي (نوفمبر 2007). "التنشيط السريع لبروتين ATM على الحمض النووي المحيط بكسور الحمض النووي المزدوجة". مجلة نيتشر لبيولوجيا الخلية . 9 (11): 1311-1318 . doi : 10.1038/ncb1651 . PMID 17952060. S2CID 17389213 .  
  31. 1 2 بن-يهويادا م، وانغ إل سي، كوزيكوف آي دي، ريزو سي جيه، غوتسمان إم إي، غوتييه جيه (سبتمبر 2009). "إشارات نقطة التفتيش من رابطة متقاطعة واحدة بين سلسلتي الحمض النووي" . الخلية الجزيئية . 35 (5): 704-715 . doi : 10.1016/j.molcel.2009.08.014 . PMC 2756577. PMID 19748363 .  
  32. سوبيك أ، ستون س، لانديس إ، دي غراف ب، هواتلين م.إ (سبتمبر 2009). "يتم التحكم في بروتين فقر الدم فانكوني FANCM بواسطة FANCD2 ومسارات ATR/ATM" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 284 (38): 25560-25568 . doi : 10.1074/jbc.M109.007690 . PMC 2757957. PMID 19633289 .  
  33. دومينغيز-سولا د، يينغ سي واي، غراندوري سي، روجيرو إل، تشين بي، لي إم، وآخرون . (يوليو 2007). "التحكم غير النسخي في تضاعف الحمض النووي بواسطة c-Myc". نيتشر . 448 ( 7152): 445-451 . Bibcode : 2007Natur.448..445D . doi : 10.1038/nature05953 . PMID 17597761. S2CID 4422771 .   
  34. دين إس، ماركيتي آر، كيرك كيه، ماثيوز كيه آر (مايو 2009). "عائلة من النواقل السطحية تنقل إشارة تمايز التريبانوسوما" . نيتشر . 459 ( 7244): 213-217 . Bibcode : 2009Natur.459..213D . doi : 10.1038/nature07997 . PMC 2685892. PMID 19444208 .  
  35. بوكنهاور د، فيذر س، ستانيسكو هـ س، باندوليك س، زديبك أ أ، رايشولد م، وآخرون . (مايو 2009). "الصرع، والرنح، والصمم الحسي العصبي، واعتلال الأنابيب الكلوية، وطفرات جين KCNJ10" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 360 (19): 1960-1970 . doi : 10.1056/NEJMoa0810276 . PMC 3398803. PMID 19420365 .   
  36. غوستينا إيه إس، ترودو إم سي (أغسطس 2009). "نطاق طرفي N مُعاد التركيب يُعيد تمامًا وظيفة تعطيل قنوات البوتاسيوم hERG المُختزلة من الطرف N والمُصابة بطفرة متلازمة QT الطويلة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (31): 13082-13087 . Bibcode : 2009PNAS..10613082G . doi : 10.1073/pnas.0900180106 . PMC 2722319. PMID 19651618 .  
  37. ^ دواري أ، تيجيدو أو، لوبيز هيرنانديز تي، شيبر جي سي، باريير إتش، بور الأول، وآخرون . (ديسمبر 2008). "التسبب الجزيئي لاعتلال بيضاء الدماغ الضخم مع الخراجات تحت القشرية: الطفرات في MLC1 تسبب عيوب قابلة للطي" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 17 (23): 3728-3739 . دوى : 10.1093/hmg/ddn269 . بمك 2581428 . بميد 18757878 .   
  38. بليتز آي إل، بيسينجر جيه، شي إكس، تشو كيه دبليو (ديسمبر 2013). "تعديل الجينوم ثنائي الأليل في أجنة الضفدع الاستوائي F(0) باستخدام نظام CRISPR/Cas" . مجلة Genesis . 51 (12): 827-834 . doi : 10.1002/dvg.22719 . PMC 4039559. PMID 24123579 .  
  39. ناكاياما تي، فيش إم بي، فيشر إم، أومن-هاجاجوس جيه، تومسن جي إتش، غرينجر آر إم (ديسمبر 2013). "الطفرات الموجهة البسيطة والفعالة باستخدام تقنية كريسبر/كاس9 في الضفدع الاستوائي Xenopus tropicalis" . مجلة جينيسيس . 51 (12): 835-843 . doi : 10.1002/dvg.22720 . PMC 3947545. PMID 24123613 .  
  40. وانغ ف، شي ز، تسوي ي، غو إكس، شي واي بي، تشين واي (14 أبريل 2015). "تعطيل الجينات المستهدفة في الضفدع الأفريقي ذي المخالب باستخدام تقنية كريسبر/كاس9" . مجلة الخلية والعلوم الحيوية . 5 (1): 15. doi : 10.1186/s13578-015-0006-1 . PMC 4403895. PMID 25897376 .  
  41. بهاتاشاريا د، مارفو سي إيه، لي د، لين إم، خوكا إم كيه (ديسمبر 2015). "تقنية كريسبر/كاس9: أداة فعالة وغير مكلفة لفقدان الوظيفة لفحص جينات الأمراض البشرية في الضفدع الأفريقي" . علم الأحياء النمائي . نمذجة التطور البشري والأمراض في الضفدع الأفريقي. 408 (2): 196-204 . doi : 10.1016/j.ydbio.2015.11.003 . PMC 4684459. PMID 26546975 .  
  42. دوبونت إس، ماميدي أ، كوردينونسي إم، مونتاجنر إم، زاكيجنا إل، أدورنو إم، وآخرون . (يناير 2009). "FAM/USP9x، وهو إنزيم deubiquitinating ضروري لإشارات TGFbeta، يتحكم في Smad4 monoubiquitination" . خلية . 136 (1): 123-135 . دوى : 10.1016/j.cell.2008.10.051 . بميد 19135894 . S2CID 16458957 .   
  43. كوردينونسي م، مونتانييه م، أدورنو م، زاكينيا ل، مارتيلو ج، ماميدي أ، وآخرون . (فبراير 2007). " تكامل إشارات TGF-beta وRas/MAPK من خلال فسفرة p53" . مجلة ساينس . 315 (5813): 840-843 . Bibcode : 2007Sci...315..840C . doi : 10.1126/science.1135961 . PMID 17234915. S2CID 83962686 .   
  44. فوينتيالبا إل سي، إيفرز إي، إيكيدا إيه، هورتادو سي، كورودا إتش، بيرا إي إم، دي روبرتيس إي إم (نوفمبر 2007). " دمج إشارات التنميط: ينظم Wnt/GSK3 مدة إشارة BMP/Smad1" . مجلة Cell . 131 (5): 980-993 . doi : 10.1016/j.cell.2007.09.027 . PMC 2200633. PMID 18045539 .  
  45. كيم، ن. ج.، شو، س.، غومبينر، ب. م. (مارس 2009). "تحديد أهداف مُركّب تدمير مسار Wnt بالإضافة إلى بيتا-كاتينين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (13): 5165-5170 . Bibcode : 2009PNAS..106.5165K . doi : 10.1073/pnas.0810185106 . PMC 2663984. PMID 19289839 .  
  46. كالاب ب، برال أ، إيزاكوف إي واي، هيلد ر، وايس ك (مارس 2006). "تحليل تدرج منظم بواسطة RanGTP في الخلايا الجسدية الانقسامية". نيتشر . 440 ( 7084): 697-701 . Bibcode : 2006Natur.440..697K . doi : 10.1038/nature04589 . PMID 16572176. S2CID 4398374 .  
  47. تساي إم واي، وانغ إس، هايدنجر جي إم، شوماكر دي كيه، آدم إس إيه، غولدمان آر دي، تشنغ واي (مارس 2006). "مصفوفة لامين ب الانقسامية المحفزة بواسطة RanGTP ضرورية لتكوين المغزل". مجلة ساينس . 311 (5769): 1887-1893 . Bibcode : 2006Sci...311.1887T . doi : 10.1126/science.1122771 . PMID 16543417. S2CID 12219529 .  
  48. ما إل، تساي إم واي، وانغ إس، لو بي، تشين آر، ييتس جيه آر، وآخرون (مارس 2009). " متطلبات نودل والداينين ​​لتجميع مصفوفة مغزل لامين ب" . بيولوجيا الخلية الطبيعية . 11 (3): 247-256 . doi : 10.1038/ncb1832 . PMC 2699591. PMID 19198602 .   
  49. إيمانويل إم جيه، ستوكينبيرغ بي تي (سبتمبر 2007). "بروتين Cep57 في الضفدع الأفريقي هو مكون حركي جديد يشارك في ارتباط الأنابيب الدقيقة" . مجلة Cell . 130 (5): 893-905 . doi : 10.1016/j.cell.2007.07.023 . PMID 17803911. S2CID 17520550 .  
  50. 1 2 نويرو، ف.، وليو، أ.ب. (يونيو 2020). "العصر الجديد لعلم الأحياء الخالي من الخلايا" . المراجعة السنوية للهندسة الطبية الحيوية . 22 (1). المراجعات السنوية : 51-77 . doi : 10.1146/annurev - bioeng-092019-111110 . PMID 32151150. S2CID 212652742 .  
  51. أكيرز آر سي، فان هيرينجن إس جيه، جاكوبي يو جي، يانسن ميجنز إي إم، فرانسويجس كيه جيه، ستونينبرج إتش جي، فينسترا جي جي (سبتمبر 2009). "التسلسل الهرمي لاكتساب H3K4me3 وH3K27me3 في تنظيم الجينات المكانية في أجنة Xenopus" . الخلية التنموية . 17 (3): 425-434 . دوى : 10.1016/j.devcel.2009.08.005 . بمك 2746918 . بميد 19758566 .  
  52. ^ Hontelez S، van Kruijsbergen I، Georgiou G، van Heeringen SJ، Bogdanovic O، Lister R، Veenstra GJ (ديسمبر 2015). "يتم التحكم في النسخ الجنيني من خلال حالة الكروماتين المحددة من قبل الأم" . اتصالات الطبيعة . 6 10148. بيب كود : 2015NatCo...610148H . دوى : 10.1038/ncomms10148 . بمك 4703837 . بميد 26679111 .  
  53. ووكر جيه سي، هارلاند آر إم (مايو 2009). "يُعدّ microRNA-24a ضروريًا لكبح موت الخلايا المبرمج في شبكية العين العصبية النامية" . الجينات والتطور . 23 (9): 1046-1051 . doi : 10.1101/gad.1777709 . PMC 2682950. PMID 19372388 .  
  54. روزا أ، سبانيولي إف إم، بريفانلو إيه إتش (أبريل 2009). "تتحكم عائلة miR-430/427/302 في تحديد مصير الأديم المتوسط ​​والأديم الباطن عبر اختيار الهدف الخاص بالنوع" . خلية النمو . 16 (4): 517-527 . doi : 10.1016/j.devcel.2009.02.007 . PMID 19386261 . 
  55. بارك جي آي، فينتيشر إيه إس، هونغ جي واي، تشوي جي، جون إس، شكريلي إم، وآخرون (يوليو 2009). "يُعدِّل التيلوميراز إشارات Wnt من خلال الارتباط بكروماتين الجين المستهدف" . نيتشر . 460 (7251): 66-72 . Bibcode : 2009Natur.460...66P . doi : 10.1038/ nature08137 . PMC 4349391. PMID 19571879 .   
  56. دي فال إس، تشي إن سي، ميدوز إس إم، مينوفيتسكي إس، أندرسون جيه بي، هاريس آي إس، وآخرون . (ديسمبر 2008). " التنظيم التوافقي للتعبير الجيني للخلايا البطانية بواسطة عوامل النسخ ets وforkhead" . مجلة Cell . 135 (6): 1053-1064 . doi : 10.1016/j.cell.2008.10.049 . PMC 2782666. PMID 19070576 .   
  57. لي واي، رانكين إس إيه، سينر دي، كيني إيه بي، كريج بي إيه، زورن إيه إم (نوفمبر 2008). " ينسق Sfrp5 تحديد وتكوين الأمعاء الأمامية من خلال تثبيط كل من إشارات Wnt11 الكلاسيكية وغير الكلاسيكية" . الجينات والتطور . 22 (21): 3050-3063 . doi : 10.1101/gad.1687308 . PMC 2577796. PMID 18981481 .  
  58. كارمونا-فونتين سي، ماثيوز إتش كيه، كورياما إس، مورينو إم، دان جي إيه، بارسونز إم، وآخرون . (ديسمبر 2008). "تثبيط الحركة بالتلامس في الجسم الحي يتحكم في الهجرة الاتجاهية للخلايا العصبية" . نيتشر . 456 ( 7224): 957-961 . Bibcode : 2008Natur.456..957C . doi : 10.1038/nature07441 . PMC 2635562. PMID 19078960 .   
  59. بويتراغو-ديلغادو إي، نوردين ك، راو أ، جيري ل، لابون سي (يونيو 2015). "التطور العصبي. تشير البرامج التنظيمية المشتركة إلى احتفاظ خلايا العرف العصبي بإمكانية مرحلة البلاستولة" . مجلة ساينس . 348 (6241): 1332-1335 . doi : 10.1126/science.aaa3655 . PMC 4652794. PMID 25931449 .  
  60. غايانو ن، فيشيل ج (2002). "دور نوتش في تعزيز مصير الخلايا الجذعية الدبقية والعصبية". المراجعة السنوية لعلم الأعصاب . 25 (1). المراجعات السنوية : 471-490 . doi : 10.1146 / annurev.neuro.25.030702.130823 . PMID 12052917. S2CID 15691580 .  
  61. تسوجي تي، لاو إي، تشيانغ جي جي، جيانغ دبليو (ديسمبر 2008). "دور كيناز Cdc7 المعتمد على Dbf4/Drf1 في التحكم بنقاط التفتيش الخاصة بتلف الحمض النووي" . الخلية الجزيئية . 32 (6): 862-869 . doi : 10.1016/j.molcel.2008.12.005 . PMC 4556649. PMID 19111665 .  
  62. ^ Xu X، Rochette PJ، Feyissa EA، Su TV، Liu Y (أكتوبر 2009). "يتوسط MCM10 ارتباط RECQ4 مع مركب هيليكاز MCM2-7 أثناء تكرار الحمض النووي" . مجلة إمبو . 28 (19): 3005–3014 . دوى : 10.1038/emboj.2009.235 . بمك 2760112 . بميد 19696745 .  
  63. راشلي م، كنيبشير ب، كنيبشير ب، إينويو م، أنجيلوف ت، صن ج، وآخرون . (سبتمبر 2008). "آلية إصلاح الروابط المتقاطعة بين خيوط الحمض النووي المرتبطة بالتضاعف" . الخلية . 134 ( 6): 969-980 . doi : 10.1016/j.cell.2008.08.030 . PMC 2748255. PMID 18805090 .   
  64. ماكدوغال، سي. أ.، بيون، تي. إس.، فان، سي.، يي، إم. سي.، سيمبريتش، ك. أ. (أبريل 2007). " المحددات البنيوية لتفعيل نقاط التفتيش" . الجينات والتطور . 21 (8): 898-903 . doi : 10.1101/gad.1522607 . PMC 1847708. PMID 17437996 .  
  65. نوت إل كيه، بوتشاكجيان إم آر، غان إي، دارباندي آر، يون إس واي، وو جيه كيو، وآخرون . (يونيو 2009). "التحكم الأيضي في موت الخلايا المبرمج للبويضة بوساطة إزالة الفسفرة المنظمة بواسطة 14-3-3 زيتا للكاسبيز-2" . خلية النمو . 16 (6): 856-866 . doi : 10.1016/j.devcel.2009.04.005 . PMC 2698816. PMID 19531356 .   
  66. فيكزيان إيه إس، سوليسيو إي سي، ليو واي، زوبر إم إي (أغسطس 2009). "توليد عيون وظيفية من خلايا متعددة القدرات" . مجلة PLOS Biology . 7 (8) e1000174. doi : 10.1371/journal.pbio.1000174 . PMC 2716519. PMID 19688031 .  
  67. دزامبا بي جيه، جاكاب كيه آر، مارسدن إم، شوارتز إم إيه، دي سيمون دي دبليو (مارس 2009). "التصاق الكادهيرين، وتوتر الأنسجة، وإشارات Wnt غير التقليدية تنظم تنظيم مصفوفة الفيبرونيكتين" . خلية النمو . 16 (3): 421-432 . doi : 10.1016/j.devcel.2009.01.008 . PMC 2682918. PMID 19289087 .  
  68. بيتي إم إس، بريسناهان جيه سي، لوبات جي (أكتوبر 1990). "يُغير التحول استجابة ضفادع زينوبوس ليفيس لقطع الحبل الشوكي". مجلة علم الأحياء العصبي . 21 (7): 1108-1122 . doi : 10.1002/neu.480210714 . PMID 2258724 . 
  69. بارك تي جيه، ميتشل بي جيه، أبيتو بي بي، كينتنر سي، والينغفورد جيه بي (يوليو 2008). "يتحكم بروتين Dishevelled في الالتحام القمي والاستقطاب المستوي للأجسام القاعدية في الخلايا الظهارية الهدبية" . مجلة Nature Genetics . 40 (7): 871-879 . doi : 10.1038/ng.104 . PMC 2771675. PMID 18552847 .  
  70. ميتشل ب، جاكوبس ر، لي ج، تشين س، كينتنر س (مايو 2007). "آلية تغذية راجعة إيجابية تتحكم في قطبية وحركة الأهداب المتحركة". نيتشر . 447 ( 7140): 97-101 . Bibcode : 2007Natur.447...97M . doi : 10.1038/nature05771 . PMID 17450123. S2CID 4415593 .  
  71. كالين، ر. إي.، بانزيغر-توبلر، ن. إي.، ديتمار، م.، براندلي، أ. و. (يوليو 2009). "فحص مكتبة كيميائية في الجسم الحي في يرقات ضفادع زينوبوس يكشف عن مسارات جديدة متورطة في تكوين الأوعية الدموية والليمفاوية" . مجلة الدم . 114 (5): 1110-1122 . doi : 10.1182 / blood-2009-03-211771 . PMC 2721788. PMID 19478043 .  
  72. ني أ، كوخ م، فانديفيلد و، شنايدر م، فيشر س، دييز-خوان أ، وآخرون . (سبتمبر 2008). "دور VEGF-D وVEGFR-3 في تكوين الأوعية اللمفاوية أثناء النمو، دراسة كيميائية وراثية في يرقات الضفدع Xenopus" . مجلة الدم . 112 (5): 1740-1749 . doi : 10.1182/blood-2007-08-106302 . PMID 18474726. S2CID 14663578 .   
  73. تشا إتش جيه، بايروم إم، ميد بي إي، إلينغتون إيه دي، والينغفورد جيه بي، ماركوت إي إم (2012-01-01). " الشبكات المعاد توظيفها تطوريًا تكشف أن دواء ثيابندازول المضاد للفطريات المعروف هو عامل جديد مُعطِّل للأوعية الدموية" . مجلة PLOS Biology . 10 (8) e1001379. doi : 10.1371/journal.pbio.1001379 . PMC 3423972. PMID 22927795 .  
  74. زيمر سي (21 أغسطس 2012). "اختبارات الجينات في الخميرة تساعد في علاج السرطان" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل في 8 يونيو 2017. تم الاطلاع عليه في 28 فبراير 2017 .
  75. فيني جيه بي، لو ميفيل إس، تورك إن، بالمييه كيه، زالكو دي، كرافيدي جيه بي، ديمينيكس بي إيه (أغسطس 2007). "فحص فلوري متعدد الآبار في الجسم الحي لرصد اضطراب هرمون الغدة الدرقية لدى الفقاريات". العلوم والتكنولوجيا البيئية . 41 (16): 5908-5914 . Bibcode : 2007EnST...41.5908F . doi : 10.1021/es0704129 . PMID 17874805 . 
  76. دوبري أ، بوييه-شاتينيه ل، ساتلر ر.م، مودي أ.ب، لي ج.ه، نيكوليت م.ل، كوبيلوفيتش ل، جاسين م، باير ر، بول ت.ت، غوتييه ج (فبراير 2008). "فحص جيني كيميائي مباشر يكشف عن مثبط لمركب Mre11-Rad50-Nbs1" . مجلة Nature Chemical Biology . 4 (2): 119-125 . doi : 10.1038/nchembio.63 . PMC 3065498. PMID 18176557 .  
  77. لانديس آي، سوبيك إيه، ستون إس، لاشابيل إيه، هواتلين إم إي (فبراير 2009). "فحص جديد خالٍ من الخلايا يُحدد مُثبِّطًا قويًا لمسار فقر الدم فانكوني" . المجلة الدولية للسرطان . 124 (4): 783-92 . doi : 10.1002/ijc.24039 . PMID 19048618. S2CID 33589304 .  
  78. 1 2 داغل جيه إم، ويكس دي إل (ديسمبر 2001). "استراتيجيات قائمة على قليل النوكليوتيدات لتقليل التعبير الجيني". التمايز؛ بحث في التنوع البيولوجي . 69 ( 2-3 ): 75-82 . doi : 10.1046/j.1432-0436.2001.690201.x . PMID 11798068 . 
  79. 1 2 بلوم م، دي روبرتيس إي إم، والينغفورد جيه بي، نيهرز سي (أكتوبر 2015). "مورفولينو: مضاد المعنى والحساسية" . خلية النمو . 35 (2): 145-149 . doi : 10.1016/j.devcel.2015.09.017 . PMID 26506304 . 
  80. رانا، أ.أ.، كولارت، س.، جيلكريست، م.ج.، سميث، ج.س. (نوفمبر 2006). "تحديد مجموعات النمط الظاهري المتزامن في الضفدع الاستوائي Xenopus tropicalis باستخدام قليل النوكليوتيدات المورفولينية المضادة للحساسية" . مجلة PLOS Genetics . 2 (11) e193. doi : 10.1371/journal.pgen.0020193 . PMC 1636699. PMID 17112317 .  " فحص مورفولينو مضاد للحساسية في الضفدع الاستوائي Xenopus tropicalis " . معهد غوردون. 4 مارس 2014. مؤرشف من الأصل في 12 يونيو 2018. تم الاطلاع عليه في 17 يناير 2007 .
  81. تم أرشفة Xenbase بتاريخ 12 يونيو 2018 على موقع Wayback Machine
  • تمت أرشفة قاعدة بيانات Xenbase في 4 سبتمبر 2009 على موقع Wayback Machine ~ مورد ويب خاص بضفدع Xenopus laevis و Xenopus tropicalis