سودويوريدين
Pseudouridine ( 5-ribosyluracil ، مختصرة بالحرف اليوناني psi- Ψ ) [ 1 ] هو متماثل من النوكليوزيد uridine حيث يرتبط اليوراسيل عبر رابطة كربون-كربون بدلاً من رابطة جليكوسيدية نيتروجين-كربون .
يُعدّ السودويوريدين أكثر تعديلات الحمض النووي الريبوزي (RNA) وفرةً في الحمض النووي الريبوزي الخلوي [ 2 ] ، وهو واحد من أكثر من 100 تعديل كيميائي متميز قد تؤثر على الترجمة أو وظائف أخرى للحمض النووي الريبوزي. السودويوريدين هو متصاوغ غليكوزيد C5 لليوريدين، ويحتوي على رابطة كربون- كربون بين ذرة الكربون C1 في سكر الريبوز وذرة الكربون C5 في اليوراسيل ، بدلاً من رابطة C1-N1 المعتادة الموجودة في اليوريدين. يتحول اليوريدين إلى سودويوريدين بتدوير جزيء اليوريدين 180 درجة حول محوره N3-C6. [ 3 ] تمنح رابطة الكربون-كربون السودويوريدين مزيدًا من حرية الدوران والمرونة التركيبية. [ 4 ] بالإضافة إلى ذلك، يحتوي السودويوريدين على مانح رابطة هيدروجينية إضافي في الموضع N1.
يُعدّ البسودويوريدين مكونًا شائعًا في الحمض النووي الريبوزي البنيوي ( الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)، والحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA)، والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير ( snRNA)، والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير ( snoRNA))، كما يوجد في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، عبر النطاقات التطورية الثلاثة للحياة، وكان أول ما تم اكتشافه. يُمثل 4% من النيوكليوتيدات في الحمض النووي الريبوزي الناقل للخميرة . [ 5 ] يُساهم هذا التعديل القاعدي في استقرار الحمض النووي الريبوزي وتحسين تكديس القواعد عن طريق تكوين روابط هيدروجينية إضافية مع الماء من خلال مجموعة الأمين الإضافية. [ 6 ] يوجد 11 بسودويوريدين في الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي لبكتيريا الإشريكية القولونية ، و30 في الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي السيتوبلازمي للخميرة ، وتعديل واحد في الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي 21S للميتوكوندريا، وحوالي 100 بسودويوريدين في الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي البشري، مما يُشير إلى أن مدى البسودويوريدين يزداد مع تعقيد الكائن الحي. [ 7 ] تم الكشف عن وجود اليوريدين الكاذب أيضًا في جينوم الليشمانيا الدونوفانية . وتم رصد 18 موقعًا لتعديل اليوريدين الكاذب في موقع دخول إنزيم ناقل الببتيديل وفي نفق دخول الحمض النووي الريبوزي الرسول أثناء ترجمة البروتين. تؤدي هذه التعديلات في الطفيلي إلى زيادة تخليق البروتين ومعدل النمو. [ 8 ]
ثبت أن البسودويوريدين في الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) يُحسّن ويُثبّت البنية الإقليمية، ويُساعد في الحفاظ على وظائفهما في فك شفرة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، وتجميع الريبوسومات ، والمعالجة، والترجمة. [ 4 ] [ 9 ] [ 10 ] كما ثبت أن البسودويوريدين في الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) يُعزز تفاعل الحمض النووي الريبوزي الخاص بالجسيم الرابط مع الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي ( pre-mRNA) لتسهيل تنظيم عملية الربط. [ 11 ]
التأثيرات والتعديلات على أنواع مختلفة من الحمض النووي الريبي
الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)
يُعدّ Ψ عنصرًا شائعًا في هذه الفئة من الحمض النووي الريبوزي (RNA)، ويُسهّل تكوين الأنماط البنيوية الشائعة في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). أحد هذه الأنماط البنيوية هو حلقة ساق TΨC التي تتضمن Ψ55. يوجد Ψ عادةً في ساق D وساق وحلقة مضاد الكودون في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) من كل نطاق. في كل نمط بنيوي، تُساهم الخصائص الفيزيائية والكيميائية الفريدة لـ Ψ في تثبيت هياكل لا يُمكن تكوينها باستخدام U القياسي. [ 4 ]
أثناء عملية الترجمة، يُعدِّل Ψ تفاعلات جزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) مع الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). يؤثر Ψ والنيوكليوتيدات المُعدَّلة الأخرى على البنية الموضعية لمجالات tRNA التي توجد فيها، دون التأثير على الطي العام للحمض النووي الريبوزي. في حلقة ساق مضاد الكودون (ASL)، يبدو أن Ψ ضروري للارتباط الصحيح لجزيئات tRNA بالريبوسوم. يُثبِّت Ψ البنية الديناميكية لحلقة ساق مضاد الكودون ويعزز الارتباط الأقوى بالريبوسوم 30S . يساعد التكوين المُستقر لحلقة ساق مضاد الكودون في الحفاظ على اقتران الكودون - مضاد الكودون الصحيح أثناء الترجمة. قد يزيد هذا الاستقرار من دقة الترجمة عن طريق تقليل معدل تكوين الرابطة الببتيدية وإتاحة المزيد من الوقت لرفض أزواج الكودون-مضاد الكودون غير الصحيحة. على الرغم من دور Ψ في تثبيت البنية الموضعية، فإن إضافة اليوريدين الكاذب إلى tRNA ليست ضرورية لبقاء الخلية على قيد الحياة، وعادةً لا تكون مطلوبة لعملية إضافة الأحماض الأمينية . [ 4 ]
mRNA
يوجد Ψ أيضًا في جزيئات mRNA التي تُعدّ قالبًا لتخليق البروتين. يمكن أن تؤثر بقايا Ψ في mRNA على خصوصية ترميز كودونات التوقف UAA وUGA وUAG. في هذه الكودونات، يُعزز كلٌ من تعديل U→Ψ وطفرة U→C كبتَ الطفرة غير المنطقية. [ 12 ] في لقاح SARS-CoV-2 من BioNTech/Pfizer، المعروف أيضًا باسم BNT162b2 أو tozinameran أو Comirnaty، تم استبدال جميع اليوريدينات بـ N1-methylpseudouridine ، [ 13 ] وهو نيوكليوزيد ذو صلة بـ Ψ يحتوي على مجموعة ميثيل مضافة إلى ذرة النيتروجين N1.
الحمض النووي الريبوزي
يوجد بروتين Ψ في الوحدات الفرعية الكبيرة والصغيرة للريبوسوم في جميع نطاقات الحياة وعضياتها . في الريبوسوم، تتجمع بقايا Ψ في النطاقات II وIV وV، وتُثبّت تفاعلات RNA-RNA و/أو RNA-بروتين. قد يُساعد الاستقرار الذي يوفره Ψ في طي rRNA وتجميع الريبوسوم. كما قد يؤثر Ψ على استقرار البنى المحلية التي تؤثر بدورها على سرعة ودقة فك الشفرة والتدقيق أثناء الترجمة. [ 4 ]
snRNA
يوجد Ψ في جزيئات snRNA الرئيسية الخاصة بالجسيمات الرابطة في حقيقيات النوى. غالبًا ما تكون بقايا Ψ في snRNA محفوظة تطوريًا ، ولكنها تختلف بين التصنيفات والكائنات الحية. تقع بقايا Ψ في snRNA عادةً في مناطق تشارك في تفاعلات RNA-RNA و/أو RNA-بروتين، وهي تفاعلات ضرورية لتجميع ووظيفة الجسيم الرابط. تساهم بقايا Ψ في snRNA في الطي والتجميع الصحيحين للجسيم الرابط، وهو أمر أساسي لمعالجة ما قبل mRNA . [ 4 ]
سينثاز
البسودويوريدين هو تعديلٌ في الحمض النووي الريبوزي (RNA) يحدث بعد عملية الترجمة، أي بعد نسخ الحمض النووي الريبوزي. تُسمى البروتينات التي تُسهّل هذه العملية بإنزيمات البسودويوريدين سينثاز (PUS)، وتوجد في جميع ممالك الحياة. ركّزت معظم الأبحاث على كيفية تعديل إنزيمات البسودويوريدين سينثاز للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)، لذا فإن الآليات التي تشمل الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) غير محددة بوضوح. تختلف إنزيمات البسودويوريدين سينثاز في تخصصها للحمض النووي الريبوزي، وبنيتها، وآليات تحويلها . تُقسّم هذه الإنزيمات إلى خمس عائلات تشترك في تسلسل نشط ووحدات بنائية مهمة. [ 1 ]
TruA
يُعدِّل نطاق TruA مواقع مختلفة في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) والحمض النووي الريبوزي النووي الصغير (snRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). ولا تزال آلية تحويل اليوريدين إلى متصاوغات أخرى قيد البحث في هذه العائلة. [ 10 ] [ 14 ]
يتواجد بروتين PUS 1 في النواة ، ويُعدّل الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في مواقع مختلفة، منها U44 من الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير U2 ، وU28 من الحمض النووي الريبوزي النووي الصغير U6 . وقد أظهرت الدراسات أن تعبير PUS 1 يزداد أثناء الإجهاد البيئي، وأنه مهم لتنظيم عملية تضفير الحمض النووي الريبوزي. كما أن PUS 1 ضروري لنقل الحمض النووي الريبوزي الناقل المُصنّع في النواة إلى السيتوبلازم. [ 10 ]
يُشبه البروتين PUS 2 البروتين PUS 1 إلى حد كبير، ولكنه يتواجد في الميتوكوندريا ويُعدّل فقط اليوريدين 27 واليوريدين 28 من الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا (mito-tRNA). يُعدّل هذا البروتين الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا، الذي يحتوي على كمية أقل من تعديلات اليوريدين الكاذب مقارنةً بأنواع الحمض النووي الريبوزي الناقل الأخرى. على عكس معظم البروتينات الموجودة في الميتوكوندريا، لم يُعثر على إشارة استهداف ميتوكوندرية (MTS) في البروتين PUS 2. [ 10 ]
يُعدّ PUS 3 نظيرًا لـ PUS 1، ولكنه يُعدّل مواقع مختلفة من الحمض النووي الريبوزي الناقل (U38/39) في السيتوبلازم والميتوكوندريا. هذا البروتين هو الأكثر حفظًا في عائلة TruA. لوحظ انخفاض في التعديلات التي يُجريها PUS 3 عند وجود خلل في طي بنية الحمض النووي الريبوزي الناقل. إلى جانب الحمض النووي الريبوزي الناقل، يستهدف البروتين الحمض النووي الريبوزي غير المشفر (ncRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)؛ ولا تزال هناك حاجة إلى مزيد من البحث لتحديد أهمية هذا التعديل. يُعدّل PUS 3، إلى جانب PUS 1، مستقبلات مُنشّط الستيرويد في البشر. [ 10 ]
TruB
تحتوي عائلة TruB فقط على PUS 4 الموجود في الميتوكوندريا والنواة. تعديل PUS 4 محفوظ بشكل كبير ويقع في U55 في منطقة الكوع من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). يفتقر الشكل البشري من PUS 4 إلى نطاق ارتباط يُسمى PUA أو سينثاز اليوريدين الكاذب، بالإضافة إلى نطاق ارتباط أركيوسين ترانس-جليكوزيلاز. يتميز PUS 4 بتخصص تسلسلي لجزء الحلقة T من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). تشير البيانات الأولية إلى أن PUS 4 يُعدّل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، ولكن هناك حاجة إلى مزيد من البحث للتأكيد. كما يرتبط أيضًا بفيروس موزاييك البروم ، وهو فيروس RNA يصيب النباتات. [ 10 ] [ 15 ]
TruD
يستطيع إنزيم TruD تعديل أنواع مختلفة من الحمض النووي الريبوزي (RNA)، ولا يزال من غير الواضح كيف يتم التعرف على هذه الركائز المختلفة. يُعدِّل إنزيم PUS 7 الحمض النووي الريبوزي الصغير U2 snRNA عند الموضع 35، ويزداد هذا التعديل عند تعرض الخلايا للصدمة الحرارية . كما يُعدِّل أيضًا الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) السيتوبلازمي عند الموضع 13، والحمض النووي الريبوزي الناقل الأولي (pre-tRNA ) عند الموضع 35. لا تعتمد خصوصية تعديل PUS 7 على نوع الحمض النووي الريبوزي، حيث يُظهر الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) تعديلًا باليوريدين الكاذب بواسطة PUS 7. يتم التعرف على هذا التعديل من خلال تسلسل الحمض النووي الريبوزي UGUAR، حيث يُمثل U الثاني النيوكليوتيد المراد تعديله. يزداد تعديل اليوريدين الكاذب للحمض النووي الريبوزي الرسول بواسطة PUS 7 أثناء الصدمة الحرارية، لأن البروتين ينتقل من النواة إلى السيتوبلازم. يُعتقد أن هذا التعديل يزيد من استقرار الحمض النووي الريبوزي الرسول أثناء الصدمة الحرارية قبل انتقاله إلى النواة أو الميتوكوندريا، ولكن هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات. [ 10 ] [ 14 ]
R LuA
يمكن لنطاق RluA في هذه البروتينات تحديد الركيزة من خلال ارتباط بروتين مختلف بالركيزة، ثم تكوين روابط محددة مع نطاق RluA. [ 1 ] [ 14 ]
لم يُدرس بروتين PUS 5 بشكل كافٍ، وهو إنزيم سينثاز سودويوريدين، ومثل بروتين PUS 2، لا يحتوي على تسلسل إشارة استهداف الميتوكوندريا. يُعدّل هذا البروتين اليوريدين 2819 في الحمض النووي الريبوزي 21S للميتوكوندريا. يُشتبه أيضًا في أن بروتين PUS 5 يُعدّل بعض اليوريدينات في الحمض النووي الريبوزي الرسول، ولكن يلزم المزيد من البيانات لتأكيد ذلك.
يحتوي PUS 6 على واحد يقوم فقط بتعديل U31 من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) السيتوبلازمي والميتوكوندري. ومن المعروف أيضًا أن PUS 6 يقوم بتعديل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). [ 10 ]
يُعدِّل البروتين PUS 8، المعروف أيضًا باسم Rib2/Pus8p، الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) السيتوبلازمي عند الموضع U32. ويحتوي الطرف الكربوكسيلي على نطاق DRAP-deaminase المرتبط بتخليق الريبوفلافين . يؤدي كلٌّ من نطاق RluA ونطاق DRAP أو deaminase المرتبط بإنزيم ريبوفلافين سينثاز وظائف منفصلة تمامًا في البروتين، ولا يُعرف ما إذا كانا يتفاعلان مع بعضهما البعض. يُعدّ البروتين PUS 8 ضروريًا في الخميرة، ولكن يُشتبه في أن دوره مرتبط بتخليق الريبوفلافين وليس بتعديل البسودويوريدين. [ 10 ]
يحفز كل من PUS 9 وPUS 8 نفس الموضع في الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا بدلاً من السيتوبلازم. وهو بروتين PUS الوحيد الذي يحتوي على نطاق إشارة استهداف للميتوكوندريا في الطرف الأميني . تشير الدراسات إلى أن PUS 9 قادر على تعديل الحمض النووي الريبوزي الرسول، مما يعني انخفاضًا في خصوصية الركيزة. [ 10 ]
تقنيات تسلسل الجينوم لليوريدين الكاذب
يمكن تحديد البسودويوريدين باستخدام تقنيات متعددة. إحدى التقنيات الشائعة لتحديد التعديلات في الحمض النووي الريبي (RNA) والحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) هي الاستشراب السائل مع مطياف الكتلة ( LC-MS) . يفصل مطياف الكتلة الجزيئات بناءً على كتلتها وشحنتها. على الرغم من أن اليوريدين والبسودويوريدين لهما نفس الكتلة، إلا أنهما يختلفان في الشحنة. يعتمد الاستشراب السائل على زمن الاحتفاظ، أي وقت خروج الجزيء من العمود. [ 16 ] تعتمد إحدى الطرق الكيميائية لتحديد البسودويوريدين على استخدام مركب يُسمى CMC أو N-سيكلوهكسيل-N′-β-(4-ميثيل مورفولينيوم) إيثيل كاربودي إيميد لوسم اليوريدين وتمييزه عن البسودويوريدين. [ 17 ] يرتبط CMC بكل من البسودويوريدين واليوريدين، ولكنه يرتبط بالأول بقوة أكبر، نظرًا لقدرة ذرة النيتروجين الثالثة على تكوين روابط هيدروجينية . يمكن بعد ذلك تصوير CMC المرتبط بالبسودويوريدين عن طريق وسم جزيء إشارة. لا تزال هذه الطريقة قيد التطوير لتصبح ذات إنتاجية عالية. [ 18 ]
تتيح تقنية محسّنة، وهي تسلسل التدوير بمساعدة 2-برومو أكريلاميد، انتقالات Ψ إلى C، من أجل التوصيف الكمي لـ Ψ بدقة قاعدة واحدة. [ 19 ]
الأهمية الطبية
يُؤثر البسودويوريدين تأثيرًا دقيقًا ولكنه هام على هيكل السكر-فوسفات المجاور، كما يُعزز تكدس القواعد. قد تُفسر هذه التأثيرات الدور البيولوجي لمعظم بقايا البسودويوريدين في الحمض النووي الريبوزي (RNA)، ولكن ربما ليس جميعها. تُظهر بعض الطفرات الجينية التي تفتقر إلى بقايا بسودويوريدين مُحددة في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) أو الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) صعوبات في الترجمة، وبطءًا في معدلات النمو، وعدم القدرة على المنافسة بفعالية مع السلالات البرية في المزارع المختلطة. كما تُشير الدراسات إلى أن تعديلات البسودويوريدين لها دور في أمراض بشرية مثل اعتلال العضلات الميتوكوندري وفقر الدم الأروماتي الحديدي (MLASA) وخلل التقرن الخلقي. [ 10 ] يُعد خلل التقرن الخلقي ومتلازمة هويرال-هريدارسون متلازمتين وراثيتين نادرتين ناتجتين عن طفرات في جين DKC1 ، وهو الجين المسؤول عن ترميز إنزيم البسودويوريدين سينثاز ديسكيرين. تُعرف البسودويوريدينات بأنها منظمات لعمليات الكمون الفيروسي في عدوى فيروس نقص المناعة البشرية (HIV). [ 20 ] كما رُبطت عملية البسودويوريديلية بآلية حدوث داء السكري والصمم الموروثين من الأم (MIDD). وعلى وجه الخصوص، يبدو أن طفرة نقطية في الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا تمنع عملية البسودويوريديلية لنوكليوتيد واحد، مما يُغير البنية الثلاثية للحمض النووي الريبوزي الناقل. وقد يؤدي ذلك إلى زيادة عدم استقرار الحمض النووي الريبوزي الناقل، مما يُسبب قصورًا في الترجمة والتنفس الميتوكوندري . [ 20 ]
اللقاحات
عند استخدام السودويوريدين بدلاً من اليوريدين في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الاصطناعي، يُثير جزيء mRNA المُعدَّل استجابةً أقل من مستقبلات تول-لايك ، وهي جزء من الجهاز المناعي البشري الذي كان سيتعرف على mRNA على أنه غير مرغوب فيه. وهذا ما يجعل السودويوريدين مفيدًا في لقاحات mRNA ، بما في ذلك لقاحات mRNA لفيروس كوفيد-19 . وقد اكتشف هذه الخاصية للسودويوريدين كاتالين كاريكو ودرو وايزمان عام 2005، وحصلا بفضل هذا الاكتشاف على جائزة نوبل في الطب أو علم وظائف الأعضاء لعام 2023. [ 21 ] [ 22 ]
يُحفّز N1-ميثيلبسودويوريدين استجابة مناعية فطرية أقل من Ψ، كما يُحسّن من قدرة الترجمة . [ 23 ] ولذلك، يستخدم كلٌّ من لقاحي فايزر-بيونتك وموديرنا mRNA ، N1-ميثيلبسودويوريدين بدلاً من Ψ. [ 23 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 هاما، توموكو؛ فيري-داماري، أدريان ر. (نوفمبر 2006). "سينثاس السودوريدين" . الكيمياء والبيولوجيا . 13 (11): 1125–1135 . دوى : 10.1016/j.chembiol.2006.09.009 . ردمك 1074-5521 . بميد 17113994 .
- ^ بينزو، ماريانا؛ جيرييري، أنيا؛ زاكيني، فيديريكو؛ ترير، دافيد؛ مونتانارو ، لورنزو (2017/11/01). "التحلل الكاذب للحمض النووي الريبوزي (RNA) في علم وظائف الأعضاء والطب: للأفضل وللأسوأ" . الجينات . 8 (11): 301. دوى : 10.3390 / الجينات 8110301 . ردمك 2073-4425 . بمك 5704214 . بميد 29104216 .
- ↑ غاروس أ، أوتكسييه س (2021). "ديسكيرين: إنزيم أساسي لتخليق اليوريدين الكاذب ذو أدوار متعددة في تكوين الريبوسومات، والتضفير، والحفاظ على التيلوميرات" . RNA . 27 ( 12): 1441-1458 . doi : 10.1261/rna.078953.121 . PMC 8594475. PMID 34556550 .
- 1 2 3 4 5 6 غراي، مايكل شاريت، مايكل و. (2000-05-01). "اليوريدين الكاذب في الحمض النووي الريبي: ما هو، وأين، وكيف، ولماذا". مجلة IUBMB Life . 49 (5): 341-351 . doi : 10.1080/152165400410182 . ISSN 1521-6543 . PMID 10902565. S2CID 20561376 .
{{cite journal}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين ( رابط ) - ↑ ديفيس، ف. ف.؛ ألين، ف. و. (أكتوبر 1957). "الأحماض الريبية النووية من الخميرة التي تحتوي على نيوكليوتيد خامس" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 227 (2): 907-915 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)70770-9 . ISSN 0021-9258 . PMID 13463012 .
- ↑ ديفيس، داريل ر. (1995). " تثبيت تكديس الحمض النووي الريبي بواسطة اليوريدين الكاذب" . أبحاث الأحماض النووية . 23 (24): 5020-5026 . doi : 10.1093/nar/23.24.5020 . ISSN 0305-1048 . PMC 307508. PMID 8559660 .
- ↑ أوفينغاند، ج؛ باكين، أ (21 فبراير 1997). "تحديد مواقع بقايا اليوريدين الكاذب بدقة النيوكليوتيدات في الحمض النووي الريبوزي للوحدة الفرعية الكبيرة من حقيقيات النوى، وبدائيات النوى، والبكتيريا القديمة، والميتوكوندريا، والبلاستيدات الخضراء" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 266 (2): 246-268 . doi : 10.1006/jmbi.1996.0737 . PMID 9047361 .
- ↑ بوسوتي، جيوفاني؛ بيل، لورا؛ بيشر، باسكال؛ دوماغالسكا، مالغورزاتا أ.؛ راجان، ك. شانموغا؛ كوهين-شالاميش، سمادار؛ دونيغر، تيرزا؛ هيريجانج، ديشا-غاجانان؛ مايلر، بيتر ج.؛ أونغر، رون؛ ميخائيلي، شولاميت؛ سباث، جيرالد ف. (21 ديسمبر 2021). "عدم استقرار الجينوم يحفز التكيف التفاعلي في طفيل الليشمانيا الممرض للإنسان" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 118 (51) e2113744118. Bibcode : 2021PNAS..11813744B . doi : 10.1073/pnas.2113744118 . ISSN 0027-8424 . PMC 8713814. PMID 34903666 .
- ↑ جي، جون هوي؛ يو، يي تاو (أبريل 2013). "تعديل الحمض النووي الريبوزي الكاذب: رؤى جديدة حول تعديل قديم" . اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 38 (4): 210-218 . doi : 10.1016/j.tibs.2013.01.002 . ISSN 0968-0004 . PMC 3608706. PMID 23391857 .
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 رينتالا-ديمبسي، آن سي؛ كوث، أوتي (2017-01-03). "إنزيمات سينثاز اليوريدين الكاذب المستقلة في حقيقيات النوى - إنزيمات تعديل الحمض النووي الريبي ومنظمات ناشئة للتعبير الجيني؟" . بيولوجيا الحمض النووي الريبي . 14 (9): 1185-1196 . doi : 10.1080/15476286.2016.1276150 . ISSN 1547-6286 . PMC 5699540. PMID 28045575 .
- ^ وو ، جووي. رضوان، محمد ك.؛ شياو، مو؛ أداتشي، هيرونوري؛ فان، جيسون؛ يو ، يي تاو (2016/06/07). "ينظم مسار الإشارة TOR عملية التحلل الكاذب الناجم عن الجوع في الخميرة U2 snRNA" . الحمض النووي الريبي . 22 (8): 1146-1152 . دوى : 10.1261 / rna.056796.116 . ردمك 1355-8382 . بمك 4931107 . بميد 27268497 .
- ^ أداتشي، هيرونوري. دي زويسا، ميمناج د.؛ يو ، يي تاو (مارس 2019). "التحلل الكاذب بعد النسخ في الرنا المرسال وكذلك في بعض الأنواع الرئيسية من الرناوات غير المشفرة" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - آليات تنظيم الجينات . 1862 (3): 230-239 . دوى : 10.1016/j.bbagrm.2018.11.002 . ردمك 1874-9399 . بمك 6401265 . بميد 30414851 .
- ↑ "تقرير تقييم وكالة الأدوية الأوروبية بشأن لقاح Comirnaty (الاسم الشائع: لقاح mRNA لكوفيد-19) (المعدل بالنيوكليوزيد) رقم الإجراء EMEA/H/C/005735/0000" (PDF) . 19-02-2021.
- بينزو ، م.؛ غيريري، أ.ن.؛ زاكيني، ف.؛ تريري، د.؛ مونتانارو، ل. (2017-11-01). " تعديل الحمض النووي الريبوزي الكاذب في علم وظائف الأعضاء والطب: بين الإيجابيات والسلبيات" . الجينات . 8 ( 11): 301. doi : 10.3390/genes8110301 . ISSN 2073-4425 . PMC 5704214. PMID 29104216 .
- ↑ كيفر-ويلكس، لورا كارول؛ فيراريديغاري، جوفاردان ريدي؛ كوثي، أوتي (14 نوفمبر 2016). "إنزيم تعديل الحمض النووي الريبوزي TruB هو بروتين مرافق للحمض النووي الريبوزي الناقل" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 113 (50): 14306-14311 . Bibcode : 2016PNAS..11314306K . doi : 10.1073/pnas.1607512113 . ISSN 0027-8424 . PMC 5167154. PMID 27849601 .
- ↑ Xu, J.; Gu, AY; Thumati, NR; Wong JMY (2017-09-05). "قياس مستويات البسودويوريدين في تجمعات الحمض النووي الريبوزي الخلوي باستخدام طريقة HPLC-UV معدلة" . الجينات . 8 ( 9): 219. doi : 10.3390/genes8090219 . ISSN 2073-4425 . PMC 5615352. PMID 28872587 .
- ↑ باكين، أ. (21-09-1993). "أربعة بقايا سودويوريديلات تم تحديد موقعها حديثًا في الحمض النووي الريبوزي 23S لبكتيريا الإشريكية القولونية، جميعها تقع في مركز الببتيديل ترانسفيراز: تحليل باستخدام تقنية تسلسل جديدة" . الكيمياء الحيوية . 32 (37): 9754-9762 . doi : 10.1021/bi00088a030 . PMID 8373778 .
- ↑ كالسوترا، أويناش (2016-11-02). "تقييم مجموعة الألف لرسم خرائط النسخ الجيني يكشف عن انتشار واسع النطاق لعملية إضافة اليوريدين الكاذب المنظمة ديناميكيًا إلى الحمض النووي الريبوزي غير المشفر والحمض النووي الريبوزي الرسول" . doi : 10.3410/f.718875945.793524920 .
{{cite journal}}يتطلب الاستشهاد بالمجلة ( مساعدة )|journal= - ↑ شو، هاي تشي؛ كونغ، لين تشن؛ تشنغ، جينغ فاي؛ الموسوي، خاتون؛ تشن، شيو فاي؛ إقبال، عليمة؛ وينغ، بيتر إيه سي؛ هاريس، جيمس إم؛ تسوكودا، سينكو؛ إمبارك-بوه، أزمان؛ وي، غويفنغ؛ كاستيلو، ألفريدو؛ كرياوتشيونيس، سكيرمانتاس؛ ماكيكاتينغ، جين إيه؛ لو، شين (نوفمبر 2024). "التسلسل الكمي المطلق وتسلسل القواعد يكشف عن مشهد شامل لليوريدين الكاذب عبر النسخ الجيني البشري" . Nature Methods . 21 (11): 2024–2033 . doi : 10.1038/s41592-024-02439-8 . ISSN 1548-7105 . PMC 11541003 . PMID 39349603 .
- 1 2 تشاو، يانغ؛ كاريجوليتش، جون؛ غلاونسينجر، بريت؛ تشو، تشيانغ (أكتوبر 2016). "يعزز تعديل الحمض النووي الريبوزي الصغير 7 SK sn RNA تكوين مركب 7 SK sn RNP لكبح نسخ فيروس نقص المناعة البشرية من النوع الأول والهروب من الكمون" . تقارير EMBO . 17 (10): 1441-1451 . doi : 10.15252/embr.201642682 . ISSN 1469-221X . PMC 5048380. PMID 27558685 .
- ↑ دولجين، إيلي (14 سبتمبر 2021). "التاريخ المتشابك للقاحات mRNA" . مجلة نيتشر .
- ↑ "جائزة نوبل في الطب أو علم وظائف الأعضاء لعام 2023" . NobelPrize.org . تاريخ الاسترجاع: 2023-10-02 .
- 1 2 مورايس ب، أداتشي هـ، يو ي (2021). " المساهمة الحاسمة لليوريدين الكاذب في لقاحات mRNA لفيروس كوفيد-19" . مجلة فرونتيرز في بيولوجيا الخلية والتطور . 9 789427. doi : 10.3389/fcell.2021.789427 . PMC 8600071. PMID 34805188 .
- النيوكليوسيدات
- مشتقات اليوراسيل