إنزيم نازع الماء من السيرين

إنزيم سيرين ديهيدراتاز ، أو لياز أمونيا- سيرين (SDH)، ينتمي إلى عائلة بيتا من الإنزيمات المعتمدة على فوسفات البيريدوكسال (PLP) . يوجد إنزيم SDH على نطاق واسع في الطبيعة، لكن بنيته وخصائصه تختلف بين الأنواع. يوجد إنزيم SDH في الخميرة والبكتيريا وسيتوبلازم خلايا الكبد لدى الثدييات . يحفز إنزيم SDH نزع الأمين من- سيرين لإنتاج البيروفات ، مع إطلاق الأمونيا . [ 1 ]

يحتوي هذا الإنزيم على ركيزة واحدة ، وهي L- سيرين ، وناتجين ، وهما البيروفات والأمونيا ، ويستخدم عاملًا مساعدًا واحدًا ، وهو فوسفات البيريدوكسال (PLP). يتمثل الدور الرئيسي لهذا الإنزيم في استحداث الجلوكوز في سيتوبلازم الكبد .

التسمية

يُعرف إنزيم سيرين ديهيدراتاز أيضًا باسم: [ 2 ]

  • إنزيم الأمونيا-لياز ل-سيرين
  • سيرين دياميناز
  • إنزيم نازع الماء من الأحماض الأمينية L-هيدروكسي
  • نازعة أمين السيرين L
  • إنزيم نازع الماء من إل-سيرين
  • هيدروليز إل-سيرين

بناء

يحتوي إنزيم SDH الكامل على 319 حمضًا أمينيًا ، وجزيء واحد من العامل المساعد PLP . [ 1 ] يتشابه الطي العام للوحدة الأحادية إلى حد كبير مع طي إنزيمات أخرى تعتمد على PLP من عائلة بيتا. يحتوي الإنزيم على نطاق تحفيزي كبير يرتبط بـ PLP ونطاق صغير. يرتبط النطاقان بواسطة حمضين أمينيين 32-35 و138-146، والفجوة الداخلية الناتجة هي مساحة الموقع النشط. [ 1 ]

ارتباط العامل المساعد

يقع العامل المساعد PLP بين سلسلتي بيتا 7 و10 من النطاق الكبير، ويستقر في الفجوة الداخلية الكبيرة بين النطاقين الصغير والكبير. ويرتبط هذا العامل المساعد تساهميًا برابطة قاعدة شيف مع الليسين 41. كما يقع بين السلسلة الجانبية للفينيل ألانين 40 والسلسلة الرئيسية للألانين 222. وترتبط كل مجموعة من المجموعات القطبية البديلة في PLP بمجموعات وظيفية: يرتبط نيتروجين البيريدينيوم في PLP برابطة هيدروجينية مع السلسلة الجانبية للسيستين 303، وترتبط مجموعة الهيدروكسيل في الموضع C3 من PLP برابطة هيدروجينية مع السلسلة الجانبية للأسباراجين 67، وترتبط مجموعة الفوسفات في PLP بروابط أميد من السلسلة الرئيسية لحلقة التتراجليسين. [ 1 ] [ 3 ] (الشكل 3 والشكل 4).

الآلية

يتبع التفاعل المحفز بواسطة إنزيم سيرين ديهيدراتاز النمط الملاحظ في التفاعلات الأخرى المعتمدة على PLP. يتم تكوين رابطة قاعدة شيف ، وتُحرر مجموعة أمينو أكريلات التي تخضع لتحلل مائي غير إنزيمي لتكوين البيروفات . [ 4 ]

المثبطات

وفقًا لسلسلة التجارب التي أجراها كليلاند (1967)، أظهر المعدل الخطي لتكوين البيروفات عند تراكيز مختلفة من المثبطات أن السيستين- L والسيرين-D يثبطان إنزيم نازعة هيدروجين السكسينات (SDH) تنافسيًا . [ 5 ] ويعود سبب تثبيط نشاط SDH بواسطة السيستين-L إلى تكوّن كبريت غير عضوي منه عبر إنزيم نازع كبريت السيستين، ومن المعروف أن المجموعات المحتوية على الكبريت تعزز التثبيط. [ 6 ] كما يثبط الثريونين-L إنزيم نازع هيدروجين السيرين تنافسيًا أيضًا.

علاوة على ذلك، من المعروف أن الأنسولين يُسرّع عملية تحلل الجلوكوز ويُثبّط تحفيز إنزيم سيرين ديهيدراتاز في كبد الفئران البالغة المصابة بداء السكري . [ 7 ] وقد أظهرت الدراسات أن الأنسولين يُسبب تثبيطًا بنسبة 40-50% لتحفيز إنزيم سيرين ديهيدراتاز بواسطة الجلوكاجون في خلايا كبد الفئران. [ 8 ] كما أظهرت الدراسات أن الأنسولين والإبينفرين يُثبّطان نشاط إنزيم سيرين ديهيدراتاز عن طريق تثبيط نسخ جين SDH في خلايا الكبد. [ 9 ] وبالمثل، فإن زيادة مستويات الجلوكاجون تزيد من نشاط إنزيم SDH لأن هذا الهرمون يُحفّز إنتاج هذا الإنزيم. وهذا منطقي في سياق استحداث الجلوكوز . يتمثل الدور الرئيسي لإنزيم SDH في إنتاج البيروفات الذي يُمكن تحويله إلى جلوكوز حر. يُعطي الجلوكاجون إشارة لتثبيط استحداث الجلوكوز وزيادة كمية الجلوكوز الحر في الدم عن طريق إطلاق مخزون الجليكوجين من الكبد.

يُعد الهوموسيستين ، وهو مركب يتحد مع السيرين بواسطة إنزيم نازع هيدروجين السكسينات (SDH) لتكوين السيستاثيونين ، مثبطًا غير تنافسي لعمل هذا الإنزيم. وقد أظهرت الدراسات أن الهوموسيستين يتفاعل مع مرافق الإنزيم PLP الخاص بإنزيم SDH لتكوين مُركب. هذا المُركب خالٍ من نشاط مرافق الإنزيم، وبالتالي لا يستطيع إنزيم SDH العمل (انظر قسم آلية عمل الإنزيم ). [ 10 ] بشكل عام، يُعد الهوموسيستين حمضًا أمينيًا ومستقلبًا للميثيونين ؛ ويمكن أن تؤدي المستويات المرتفعة من الهوموسيستين إلى الإصابة ببيلة الهوموسيستين (انظر قسم أهمية المرض ). [ 11 ]

الوظيفة البيولوجية

بشكل عام، تنخفض مستويات SDH مع ازدياد حجم الثدييات. [ 12 ]

يلعب إنزيم SDH دورًا هامًا في عملية استحداث الجلوكوز. ويزداد نشاطه عند اتباع نظام غذائي غني بالبروتين أو عند الصيام. خلال فترات انخفاض الكربوهيدرات ، يتحول السيرين إلى بيروفات عبر إنزيم SDH. يدخل هذا البيروفات إلى الميتوكوندريا حيث يمكن تحويله إلى أوكسالوأسيتات ، ومن ثم إلى جلوكوز. [ 13 ]

لا يُعرف الكثير عن خصائص ووظيفة إنزيم نازعة هيدروجين السكسينات (SDH) البشري نظرًا لانخفاض نشاطه في الكبد البشري. في دراسة أجراها يوشيدا وكيكوتشي، تم قياس مسارات تحلل الجلايسين. يمكن تحويل الجلايسين إلى سيرين، والذي بدوره يتحول إما إلى بيروفات عبر إنزيم نازعة هيدروجين السيرين، أو يخضع لانشطار تأكسدي ينتج عنه ميثيلين-THF ، وأمونيا ، وثاني أكسيد الكربون. أظهرت النتائج الأهمية الثانوية لمسار SDH. [ 13 ] [ 14 ]

أهمية المرض

قد يكون لـ SDH دور مهم في تطور ارتفاع نسبة السكر في الدم والأورام.

يُعد نقص إنزيم ثريونين ديهيدراتاز ، وهو بروتين آخر من عائلة بيتا PLP، [ 15 ] سببًا محتملاً لارتفاع سكر الدم غير الكيتوني . [ 16 ] كما وُجد أن إنزيم سيرين ديهيدراتاز غائب في سرطان القولون البشري وساركوما الفئران . يُشير اختلال التوازن الإنزيمي الملحوظ في هذه الأورام إلى أن زيادة القدرة على تخليق السيرين مرتبطة باستخدامه في تخليق النيوكليوتيدات كجزء من التزام الخلايا السرطانية بالتكاثر . ويُلاحظ هذا النمط في الساركوما والسرطانات ، وفي أورام من أصل بشري وقوارض. [ 17 ]

تطور

تتطابق نسخ الحمض النووي التكميلي (cDNA) لإنزيم سيرين ديهيدراتاز البشري والفأري باستثناء تسلسل مكون من 36 حمضًا أمينيًا. كما لوحظت أوجه تشابه بين إنزيم ثريونين ديهيدراتاز في الخميرة والإشريكية القولونية وإنزيم سيرين ديهيدراتاز البشري. يُظهر إنزيم سيرين ديهيدراتاز البشري تشابهًا في التسلسل بنسبة 27% مع إنزيم الخميرة و27% مع إنزيم الإشريكية القولونية . [ 18 ] وبشكل عام، تُظهر إنزيمات PLP درجة عالية من الحفاظ على بقايا الموقع النشط. [ 18 ]

مراجع

  1. 1 2 3 4 صن إل، بارتلام إم، ليو واي، بانغ إتش، راو زد (مارس 2005). "البنية البلورية لإنزيم سيرين ديهيدراتاز المعتمد على بيريدوكسال-5'-فوسفات من كبد الإنسان" . علم البروتين . 14 (3): 791-8 . doi : 10.1110/ps.041179105 . PMC 2279282. PMID 15689518 .  
  2. "مدخل قاعدة بيانات إنزيمات KEGG" . موسوعة كيوتو للجينات والمجينات . مختبرات كانيهيسا . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 مايو 2011 .
  3. تويوتا سي جي، بيرتهولد سي إل، غروز إيه، جونسون إس، ليندكفيست واي، كامبيلو سي، ريتشاردز إن جي (أبريل 2008). " التخصص التفاضلي للركيزة والسلوك الحركي لإنزيم ناقل مرافق الإنزيم أ فورميل YfdW في الإشريكية القولونية وأوكسالوباكتر فورميجينز" . مجلة علم البكتيريا . 190 (7): 2556-2564 . doi : 10.1128/JB.01823-07 . PMC 2293189. PMID 18245280 .  
  4. يامادا تي، كوموتو جيه، تاكاتا واي، أوغاوا إتش، بيتو إتش سي، تاكوساغاوا إف (نوفمبر 2003). "البنية البلورية لإنزيم سيرين ديهيدراتاز من كبد الفئران". الكيمياء الحيوية . 42 (44): 12854-65 . doi : 10.1021/bi035324p . PMID 14596599 . 
  5. غانون ف، بريدجلاند إي إس، جونز كيه إم (فبراير 1977). "إنزيم نازع الماء من إل-سيرين من بكتيريا أرثروباكتر غلوبيفورميس" . المجلة البيوكيميائية . 161 (2): 345-355 . doi : 10.1042/bj1610345 . PMC 1164512. PMID 322657 .  
  6. ناكاغاوا هـ، كيمورا هـ (نوفمبر 1969). "خصائص نازعة هيدروجين السيرين البلورية في كبد الفئران" . مجلة الكيمياء الحيوية . 66 (5): 669-83 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a129180 . PMID 5358627 . 
  7. فريدلاند، ر. أ.، وتايلور، أ. ر. (ديسمبر 1964). "دراسات حول إنزيم جلوكوز-6-فوسفاتاز وإنزيم جلوتاميناز في كبد وكلى الفئران". مجلة بيوكيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - القسم المتخصص في علم الإنزيمات . 92 (3): 567-571 . doi : 10.1016/0926-6569(64)90016-1 . PMID 14264889 . 
  8. ميورا إس، ناكاغاوا إتش (أكتوبر 1970). "دراسات حول الأساس الجزيئي لتطور إنزيم سيرين ديهيدراتاز في كبد الفئران" . مجلة الكيمياء الحيوية . 68 (4): 543-548 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a129384 . PMID 5488777 . 
  9. كاناموتو ر، سو ي، بيتو هـ.س (أغسطس 1991). "تأثيرات الجلوكوز والأنسولين و cAMP على نسخ جين سيرين ديهيدراتاز في كبد الفئران". أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 288 (2): 562-566 . doi : 10.1016/0003-9861(91)90236-C . PMID 1654838 . 
  10. بيستانا أ، ساندوفال الرابع، سولس أ (أكتوبر 1971). "تثبيط إنزيم سيرين ديهيدراتاز وإنزيمات بيريدوكسال 5'-فوسفات الأخرى في الفئران بواسطة الهوموسيستين من خلال حجب العامل المساعد". أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 146 (2): 373-379 . doi : 10.1016/0003-9861(71)90139-1 . PMID 4398884 . 
  11. هيرد، ر. و.، هاموند، إ. ج.، وايلدر، ب. ج. (مارس 1981) . "التشنجات الناجمة عن الهوموسيستين: تعزيزها بفيتامين ب6 وتثبيطها بالهيدرازين". أبحاث الدماغ . 209 (1): 250-254 . doi : 10.1016/0006-8993(81)91190-2 . PMID 6260308. S2CID 29790535 .  
  12. Rowsell EV, Carnie JA, Wahbi SD, Al-Tai AH, Rowsell KV (1979). "نشاط إنزيم L-سيرين ديهيدراتاز وإنزيم L-سيرين-بيروفات أمينوترانسفيراز في أنواع حيوانية مختلفة". الكيمياء الحيوية المقارنة وعلم وظائف الأعضاء. ب، الكيمياء الحيوية المقارنة . 63 (4): 543-55 . doi : 10.1016/0305-0491(79)90061-0 . PMID 318433 . 
  13. 1 2 سنيل ك (1984). "إنزيمات استقلاب السيرين في أنسجة الفئران الطبيعية والنامية والورمية" . التقدم في تنظيم الإنزيم . 22 : 325-400 . doi : 10.1016/0065-2571(84)90021-9 . PMID 6089514 . 
  14. كوياتا هـ، هيراغا ك (فبراير 1991). "نظام انقسام الجليسين: بنية الحمض النووي المكمل (cDNA) الذي يشفر بروتين H البشري، والوصف الجزئي لجينه لدى مرضى فرط جليسين الدم" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 48 (2): 351-361 . PMC 1683031. PMID 1671321 .  
  15. ^ سكارسيلي إم، بادولا إم جي، بيرنيني أ، سبيجا أو، سيوتي أ، ليونسيني آر، فانوني د، مارينيلو إي، نيكولاي إن (2003). "العلاقات الهيكلية والوظيفية بين ثريونين دياميناز كبد الفئران وناقلات الأمين". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - البروتينات والبروتيوميات . 1645 (1): 40– 48. دوى : 10.1016/S1570-9639(02)00502-2 . بميد 12535609 . 
  16. كريجر، آي.، وبوث، إف. (1984). "نقص إنزيم ثريونين ديهيدراتاز: سبب محتمل لفرط غليسين الدم غير الكيتوني". مجلة الأمراض الأيضية الوراثية . 7 (2): 53-56 . doi : 10.1007/BF01805800 . hdl : 2027.42/147124 . PMID 6434824 . 
  17. سنيل ك، ناتسوميدا ي، إيبل جيه إن، غلوفر جيه إل، ويبر جي (يناير 1988). "اختلال التوازن الإنزيمي في استقلاب السيرين في سرطان القولون البشري وساركوما الفئران" . المجلة البريطانية للسرطان . 57 (1): 87-90 . doi : 10.1038/bjc.1988.15 . PMC 2246686. PMID 3126791 .  
  18. 1 2 أوغاوا هـ، غومي ت، كونيشي ك، ديت ت، ناكاشيما هـ، نوز ك، ماتسودا ي، بيرينو س، بيتو هـ س، فوجيوكا م (سبتمبر 1989). "إنزيم نازع الماء من السيرين في كبد الإنسان. استنساخ الحمض النووي المكمل (cDNA) وتماثل التسلسل مع إنزيمات نازعة الماء من الأحماض الأمينية الهيدروكسيلية من مصادر أخرى" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 264 (27): 15818-23 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)71550-0 . PMID 2674117 .