الحمض النووي الريبوزي الناقل

الموسوعة الحرة

الحمض النووي الريبوزي الناقل ( tRNA )، الذي كان يُعرف سابقًا بالحمض النووي الريبوزي الذائب ( sRNA )، [ 1 ] هو جزيء مُحَوِّل يتكون من الحمض النووي الريبوزي (RNA )، ويتراوح طوله عادةً بين 76 و90 نيوكليوتيدًا (في حقيقيات النوى). [ 2 ] في الخلية ، يُوفِّر tRNA الرابط المادي بين الشفرة الوراثية في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) وتسلسل الأحماض الأمينية في البروتينات، حاملًا التسلسل الصحيح للأحماض الأمينية التي يجب دمجها بواسطة جهاز تخليق البروتين، الريبوسوم . يُكمِّل كل كودون ثلاثي النيوكليوتيدات في mRNA كودون مضاد ثلاثي النيوكليوتيدات في tRNA. وبذلك، يُعد tRNA عنصرًا أساسيًا في عملية الترجمة ، وهي عملية التخليق الحيوي للبروتينات الجديدة وفقًا للشفرة الوراثية.

ملخص

تبدأ عملية الترجمة بالمعلومات المخزنة في تسلسل النيوكليوتيدات في الحمض النووي ( DNA) . تُحوّل هذه المعلومات أولًا إلى الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، ثم يُحدد الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) أي كودون ثلاثي النيوكليوتيدات من الشفرة الوراثية يُقابل أي حمض أميني. [ 3 ] يتعرف نوع معين من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) على كل كودون في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، ويرتبط به عبر مضاد الكودون ثلاثي النيوكليوتيدات ، ليشكلا معًا ثلاثة أزواج قواعد متكاملة .

في الطرف الآخر من جزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) يوجد ارتباط تساهمي بالحمض الأميني المقابل لتسلسل الكودون المضاد، حيث يرتبط كل نوع من أنواع tRNA بحمض أميني محدد. ولأن الشفرة الوراثية تحتوي على عدة كودونات تحدد نفس الحمض الأميني، فهناك العديد من جزيئات tRNA التي تحمل كودونات مضادة مختلفة، ولكنها تحمل نفس الحمض الأميني.

يُحفز ارتباط الأحماض الأمينية بالنهاية 3' لجزيء tRNA بواسطة إنزيمات تُسمى سينثيتازات أمينو أسيل tRNA . أثناء تخليق البروتين، تُنقل جزيئات tRNA المرتبطة بالأحماض الأمينية إلى الريبوسوم بواسطة بروتينات تُسمى عوامل الاستطالة ، والتي تُساعد في ارتباط tRNA بالريبوسوم، وتخليق عديد الببتيد الجديد، وانتقال الريبوسوم على طول mRNA. إذا تطابق الكودون المضاد لـ tRNA مع mRNA، فإن tRNA آخر مرتبط بالفعل بالريبوسوم ينقل سلسلة عديد الببتيد المتنامية من نهايته 3' إلى الحمض الأميني المرتبط بالنهاية 3' لـ tRNA المُنقل حديثًا، وهو تفاعل يُحفزه الريبوسوم. قد يخضع عدد كبير من النيوكليوتيدات الفردية في جزيء tRNA لتعديلات كيميائية ، غالبًا عن طريق المثيلة أو نزع الأميد . تؤثر هذه القواعد غير العادية أحيانًا على تفاعل tRNA مع الريبوسومات ، وقد تظهر أحيانًا في الكودون المضاد لتغيير خصائص اقتران القواعد. [ 4 ]

تُعدّ إضافة نيوكليوتيد الغوانين في الموضع -1 (G-1) إلى الطرف 5′ من tRNA-His، والتي يحفزها إنزيم غوانيل ترانسفيراز tRNA-His (Thg1) والبروتينات الشبيهة بـ Thg1 (TLPs)، عمليةً جديرةً بالملاحظة، إذ تتم في اتجاه 3′ إلى 5′، وهو عكس اتجاه إضافة النيوكليوتيدات المتعارف عليه من 5′ إلى 3′ الذي تستخدمه جميع بوليميرازات الأحماض النووية الأخرى المعروفة. [ 5 ] تُعتبر آلية البلمرة العكسية هذه فريدةً من نوعها من الناحية البيوكيميائية ومحفوظةً تطوريًا، مما يُبرز أهميتها الأساسية في نضج tRNA. [ 6 ] توجد نظائر Thg1 في جميع نطاقات الحياة، حيث يمكنها أيضًا المشاركة في إصلاح tRNA ومراقبة جودته. [ 7 ] يُعدّ وجود G-1 عنصرًا أساسيًا في هوية tRNA-His، ويؤدي غيابه إلى إضعاف كفاءة الهيستيديلة ووظيفة tRNA بشكلٍ كبير.

بناء

بنية ورقة البرسيم الثانوية لـ tRNA الذي يرمز للفينيل ألانين. 76 نيوكليوتيد.
بنية الحمض النووي الريبوزي الناقل Sec من بكتيريا الإشريكية القولونية، موضحة أيضًا القواعد المعدلة باللون الأزرق والمضاد الكودوني باللون الأحمر. 95 نيوكليوتيد.
البنية الثلاثية لـ tRNA. ذيل CCA باللون الأصفر، ساق المستقبل باللون الأرجواني، الحلقة المتغيرة باللون البرتقالي، الذراع D باللون الأحمر، ذراع مضاد الكودون باللون الأزرق مع مضاد الكودون باللون الأسود، الذراع T باللون الأخضر.
صورة متحركة ثلاثية الأبعاد توضح بنية فينيل ألانين-tRNA من الخميرة (معرف بنك بيانات البروتين 1ehz). تشير الخطوط البيضاء إلى اقتران القواعد بواسطة الروابط الهيدروجينية. في الوضع الموضح، يكون ساق المستقبل في الأعلى والمضاد للكودون في الأسفل. [ 8 ]

يمكن تقسيم بنية الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) إلى بنيته الأولية ، وبنيته الثانوية (التي تُصوَّر عادةً على شكل ورقة البرسيم )، وبنيته الثالثية [ 9 ] (تمتلك جميع جزيئات tRNA بنية ثلاثية الأبعاد متشابهة على شكل حرف L، مما يسمح لها بالارتباط بموقعي P و A في الريبوسوم ). تتحول بنية ورقة البرسيم إلى بنية ثلاثية الأبعاد على شكل حرف L من خلال التراص المحوري للحلزونات، وهو نمط شائع في البنية الثالثية للحمض النووي الريبوزي . يختلف طول كل ذراع، بالإضافة إلى قطر الحلقة، في جزيء tRNA من نوع إلى آخر. [ 9 ] [ 10 ] تتكون بنية tRNA مما يلي:

  • يتكون ساق المستقبل من 7 إلى 9 أزواج قاعدية، وذلك من خلال اقتران النيوكليوتيد الطرفي 5′ مع النيوكليوتيد الطرفي 3′ (الذي يحتوي على ذيل CCA المستخدم لربط الحمض الأميني). قد يحتوي ساق المستقبل على أزواج قاعدية غير واتسون-كريك. [ 9 ] [ 11 ]
  • ذيل CCA هو تسلسل سيتوزين -سيتوزين- أدينين في الطرف 3′ لجزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). يرتبط الحمض الأميني المُحمّل على tRNA بواسطة إنزيمات أمينو أسيل tRNA سينثيتاز ، لتكوين أمينو أسيل-tRNA ، برابطة تساهمية مع مجموعة الهيدروكسيل 3′ في ذيل CCA. [ 12 ] يُعد هذا التسلسل مهمًا لتعرف الإنزيمات على tRNA، وهو بالغ الأهمية في عملية الترجمة. [ 13 ] [ 14 ] في بدائيات النوى، يُنسخ تسلسل CCA في بعض تسلسلات tRNA. أما في معظم جزيئات tRNA بدائية النوى وحقيقية النوى، فيُضاف تسلسل CCA أثناء المعالجة، وبالتالي لا يظهر في جين tRNA. [ 15 ]
  • الحلقة D عبارة عن ساق يتراوح طولها من 4 إلى 6 أزواج قاعدية تنتهي بحلقة تحتوي غالبًا على ثنائي هيدرويوريدين . [ 9 ]
  • حلقة مضاد الكودون هي ساق مكونة من 5 أزواج قاعدية تحتوي حلقتها على مضاد الكودون . [ 9 ]
  • سُميت حلقة TΨC بهذا الاسم نسبةً إلى وجود القاعدة غير العادية Ψ المميزة فيها، حيث Ψ هي سورويدوريدين ، وهو يوريدين مُعدَّل . غالبًا ما توجد هذه القاعدة المُعدَّلة ضمن التسلسل 5'-TΨCGA-3'، حيث يُشكِّل كلٌّ من T ( ريبوثيميدين ، m5U) وA زوجًا قاعديًا. [ 16 ]
  • تقع الحلقة المتغيرة ، أو حلقة V، بين حلقة مضاد الكودون وحلقة ΨU، وكما يوحي اسمها، يتراوح طولها بين 3 و21 قاعدة. في بعض جزيئات tRNA، تكون هذه الحلقة طويلة بما يكفي لتشكيل ساق صلبة، تُسمى الذراع المتغيرة . [ 17 ] يُصنف tRNA الذي يزيد طول حلقة V فيه عن 10 قواعد ضمن "الفئة الثانية"، بينما يُصنف الباقي ضمن "الفئة الأولى". [ 18 ]

مضاد الكودون

الكودون المضاد [ 19 ] هو وحدة من ثلاثة نيوكليوتيدات تُقابل القواعد الثلاث لكودون mRNA . لكل جزيء tRNA تسلسل ثلاثي مميز للكودون المضاد، قادر على تكوين ثلاثة أزواج قاعدية متكاملة مع كودون واحد أو أكثر لحمض أميني. بعض الكودونات المضادة ترتبط بأكثر من كودون واحد بسبب اقتران القواعد المتذبذب . غالبًا ما يكون النيوكليوتيد الأول في الكودون المضاد غير موجود في mRNA: الإينوزين ، الذي يمكنه تكوين روابط هيدروجينية مع أكثر من قاعدة في موضع الكودون المقابل. [ 4 ] : ​​29.3.9 في الشفرة الوراثية ، من الشائع أن يُحدد حمض أميني واحد بجميع الاحتمالات الأربعة للموضع الثالث، أو على الأقل بكل من البيريميدينات والبيورينات ؛ على سبيل المثال، يُشفر الحمض الأميني جليسين بواسطة تسلسلات الكودونات GGU وGGC وGGA وGGG. قد تظهر نيوكليوتيدات معدلة أخرى في أول موقع مضاد للكودون - يُعرف أحيانًا باسم "موقع التذبذب" - مما يؤدي إلى تغييرات طفيفة في الشفرة الوراثية، كما هو الحال في الميتوكوندريا . [ 20 ] يقلل احتمال وجود قواعد التذبذب من عدد أنواع الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) المطلوبة: فبدلاً من 61 نوعًا (نوع واحد لكل كودون ذي معنى في الشفرة الوراثية القياسية)، يلزم 31 نوعًا فقط من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) لترجمة جميع الكودونات الـ 61 ذات المعنى بدقة. [ 3 ] [ 21 ]

التسمية

يُسمى الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) عادةً باسم الحمض الأميني المُستهدف (مثل tRNA-Asn )، أو بتسلسل الكودون المضاد (مثل tRNA(GUU) )، أو بكليهما (مثل tRNA-Asn(GUU) أو tRNA Asn GUU ). [ 22 ] تُحدد هاتان السمتان الوظيفة الرئيسية للحمض النووي الريبوزي الناقل، لكنهما لا تُغطيان في الواقع التنوع الكامل لأنواع الحمض النووي الريبوزي الناقل؛ ونتيجةً لذلك، تُضاف لواحق رقمية للتمييز بينها. [ 23 ] تُسمى أنواع الحمض النووي الريبوزي الناقل المُخصصة لنفس الحمض الأميني "الأنماط المتماثلة"؛ وعندما تشترك الأنماط المتماثلة أيضًا في نفس الكودون المضاد، تُسمى "المتقبلات المتماثلة"؛ وعندما يكون للأنماط المتماثلة تسلسل ناضج متطابق، تُسمى "المفككات المتماثلة". [ 24 ]

الأمينوأسيلة

الأمينوأسيلة هي عملية إضافة مجموعة أمينوأسيل إلى مركب. تربط هذه العملية حمضًا أمينيًا تساهميًا بالنهاية 3′ (CCA) لجزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). يُشحن كل جزيء tRNA بحمض أميني محدد بواسطة إنزيم أمينوأسيل tRNA سينثيتاز . يوجد عادةً إنزيم أمينوأسيل tRNA سينثيتاز واحد لكل حمض أميني، على الرغم من إمكانية وجود أكثر من جزيء tRNA واحد، وأكثر من مضاد كودون واحد للحمض الأميني الواحد. لا يعتمد تعرف الإنزيمات على جزيء tRNA المناسب على مضاد الكودون فقط، بل غالبًا ما يلعب ساق المستقبل دورًا بارزًا. [ 25 ] التفاعل:

  1. حمض أميني + ATP → أمينو أسيل-AMP + بيروفوسفات
  2. أمينو أسيل-AMP + tRNA → أمينو أسيل-tRNA + AMP

قد تفتقر بعض الكائنات الحية إلى واحد أو أكثر من إنزيمات سينثيتاز أمينوفوسفات-tRNA. يؤدي هذا إلى شحن tRNA بحمض أميني ذي صلة كيميائية، وباستخدام إنزيم أو أكثر، يتم تعديل tRNA ليصبح مشحونًا بشكل صحيح. على سبيل المثال، تفتقر بكتيريا الملوية البوابية (Helicobacter pylori) إلى إنزيم سينثيتاز غلوتامينيل tRNA. وبالتالي، يقوم إنزيم سينثيتاز غلوتامات tRNA بشحن tRNA-غلوتامين (tRNA-Gln) بالغلوتامات . ثم يقوم إنزيم أميدوترانسفيراز بتحويل السلسلة الجانبية الحمضية للغلوتامات إلى أميد، مكونًا gln-tRNA-Gln المشحون بشكل صحيح.

الارتباط بالريبوسوم

نطاق التكوينات التي يتخذها الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) أثناء مروره عبر موقعي الأدينين/الثايمين (A/T) والفوسفور/الإيثيلين (P/E) على الريبوسوم. تُعرض رموز بنك بيانات البروتين (PDB) للنماذج الهيكلية المستخدمة كنقاط نهاية للرسوم المتحركة. تم نمذجة كلا الحمضين النوويين الريبوزي الناقلين (tRNA) كحمض نووي ريبوزي ناقل خاص بالفينيل ألانين من الإشريكية القولونية ، مع اعتبار الحمض النووي الريبوزي الناقل الخاص بالأدينين/الثايمين (A/T) نموذجًا متماثلًا للإحداثيات المُودعة. يُستخدم الترميز اللوني كما هو موضح للبنية الثلاثية للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) . مقتبس من [ 26 ] .

يحتوي الريبوسوم على ثلاثة مواقع ارتباط لجزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA ) تمتد بين وحدتي الريبوسوم الفرعيتين : الموقع A (الحمض الأميني) ، [ 27 ] والموقع P (الببتيديل) ، والموقع E (الخروج) . بالإضافة إلى ذلك، يحتوي الريبوسوم على موقعين آخرين لارتباط الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) يُستخدمان أثناء فك شفرة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA ) أو أثناء بدء تخليق البروتين . هذان الموقعان هما الموقع T (المسمى عامل الاستطالة Tu ) والموقع I (البدء). [ 28 ] [ 29 ] اصطلاحًا، يُشار إلى مواقع ارتباط الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) بذكر الموقع الموجود على وحدة الريبوسوم الفرعية الصغيرة أولًا، ثم الموقع الموجود على وحدة الريبوسوم الفرعية الكبيرة ثانيًا. على سبيل المثال، غالبًا ما يُكتب الموقع A على النحو التالي: A/A، والموقع P على النحو التالي: P/P، والموقع E على النحو التالي: E/E. [ 28 ] تم تحديد البروتينات الرابطة مثل L27 و L2 و L14 و L15 و L16 في المواقع A و P عن طريق وضع علامات التقارب بواسطة AP Czernilofsky et al. ( Proc. Natl. Acad. Sci, USA , pp.  230–234, 1974).

بمجرد اكتمال بدء عملية الترجمة، يستقر أول جزيء tRNA حامل للأحماض الأمينية في موقع P/P، جاهزًا لدورة الاستطالة الموضحة أدناه. خلال استطالة الترجمة، يرتبط tRNA أولًا بالريبوسوم كجزء من مُركّب مع عامل الاستطالة Tu ( EF-Tu ) أو نظيره في حقيقيات النوى ( eEF-1 ) أو في العتائق. يُسمى موقع ارتباط tRNA الأولي هذا بموقع A/T. في موقع A/T، يقع نصف الموقع A في الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة حيث يوجد موقع فك شفرة mRNA. موقع فك شفرة mRNA هو المكان الذي تُقرأ فيه شفرة mRNA أثناء الترجمة. يقع نصف الموقع T بشكل رئيسي على الوحدة الفرعية الريبوسومية الكبيرة حيث يتفاعل EF-Tu أو eEF-1 مع الريبوسوم. بمجرد اكتمال فك شفرة mRNA، يرتبط tRNA الحامل للأحماض الأمينية في موقع A/A ويكون جاهزًا لتكوين الرابطة الببتيدية التالية [ 30 ] مع الحمض الأميني المرتبط به. يرتبط جزيء الببتيديل-tRNA، الذي ينقل سلسلة الببتيد المتنامية إلى جزيء الأمينوأسيل-tRNA المرتبط بموقع A/A، بموقع P/P. بمجرد تكوين الرابطة الببتيدية، يصبح جزيء tRNA في موقع P/P مُؤَسْتَلًا، أي أن طرفه 3' حر ، بينما يقوم جزيء tRNA في موقع A/A بفصل سلسلة الببتيد المتنامية. وللسماح بدورة الاستطالة التالية، ينتقل جزيء tRNA عبر مواقع الارتباط الهجينة A/P وP/E، قبل إكمال الدورة والاستقرار في موقعي P/P وE/E. بمجرد انتقال جزيئي tRNA من موقعي A/A وP/P إلى موقعي P/P وE/E، يكون جزيء mRNA قد انتقل أيضًا بمقدار كودون واحد ، ويصبح موقع A/T شاغرًا، جاهزًا للجولة التالية من فك شفرة mRNA. ثم يغادر جزيء tRNA المرتبط بموقع E/E الريبوسوم.

يُعد موقع P/I أول موقع يرتبط بـ tRNA الأمينو أسيل، الذي يُنقل بواسطة عامل بدء يُسمى IF2 في البكتيريا. [ 29 ] مع ذلك، لم يتم تأكيد وجود موقع P/I في الريبوسومات حقيقية النواة أو العتائق بعد. وقد تم تحديد بروتين الموقع P، L27، بواسطة تقنية الوسم بالتقارب من قِبل إي. كولاتز وإيه. بي. تشيرنيلوفسكي ( FEBS Lett. ، المجلد 63، الصفحات  283-286، 1976).

جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)

تختلف الكائنات الحية في عدد جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في جينومها . فعلى سبيل المثال، تحتوي دودة النيماتودا C. elegans ، وهي كائن نموذجي شائع الاستخدام في الدراسات الوراثية ، على 29647 جينًا في جينومها النووي ، [ 31 ] منها 620 جينًا تُشفّر الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). [ 32 ] [ 33 ] أما خميرة التبرعم Saccharomyces cerevisiae فتحتوي على 275 جينًا للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في جينومها. ويمكن أن يتباين عدد جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) لكل جينوم تباينًا كبيرًا، إذ تحتوي أنواع البكتيريا من مجموعات مثل Fusobacteria وTenericutes على حوالي 30 جينًا لكل جينوم، بينما قد تحتوي الجينومات حقيقية النواة المعقدة، مثل جينوم سمكة الزيبرا ( Danio rerio )، على أكثر من 10 آلاف جين للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). [ 34 ]

يحتوي الجينوم البشري، الذي يُقدّر عدد جيناته المُشفّرة للبروتينات بنحو 20,848 جينًا [ 35 ] ، على 497 جينًا نوويًا تُشفّر جزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) السيتوبلازمية، و324 جينًا كاذبًا مُشتقًا من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA ) - وهي جينات tRNA يُعتقد أنها لم تعد وظيفية [ 36 ] (على الرغم من ثبوت تورط جزيئات tRNA الكاذبة في مقاومة المضادات الحيوية لدى البكتيريا). [ 37 ] وقد أظهرت إحدى الدراسات أن عدد نسخ جينات tRNA يختلف بين الأفراد. [ 38 ] وكما هو الحال في جميع حقيقيات النوى، يوجد 22 جينًا للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في الميتوكوندريا لدى البشر [ 39 ] . وقد ارتبطت الطفرات في بعض هذه الجينات بأمراض خطيرة مثل متلازمة ميلاس . كما تم تحديد مناطق في الكروموسومات النووية ، تُشابه في تسلسلها جينات tRNA الميتوكوندرية (شبيهات tRNA). [ 40 ] تُعتبر هذه الجزيئات الشبيهة بالحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) جزءًا من الحمض النووي للميتوكوندريا النووي (الجينات المنقولة من الميتوكوندريا إلى النواة). [ 40 ] [ 41 ] وقد لوحظت ظاهرة وجود نسخ نووية متعددة من الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا (الجزيئات الشبيهة بالحمض النووي الريبوزي الناقل) في العديد من الكائنات الحية العليا، بدءًا من الإنسان وصولًا إلى الأبوسوم [ 42 ]، مما يشير إلى احتمال أن تكون هذه الجزيئات الشبيهة وظيفية.

في البشر، يمكن تصنيف جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) السيتوبلازمية إلى 49 عائلة وفقًا لخصائصها المضادة للكودون. توجد هذه الجينات على جميع الكروموسومات، باستثناء الكروموسوم 22 والكروموسوم Y. لوحظ تجمع كثيف على الكروموسوم 6p (140 جينًا من جينات tRNA)، وكذلك على الكروموسوم 1. [ 36 ]

وقد وافقت اللجنة الوطنية للجينوم البشري (HGNC ) ، بالتعاون مع قاعدة بيانات الحمض النووي الريبوزي الناقل الجينومي ( GtRNAdb ) والخبراء في هذا المجال، على أسماء فريدة للجينات البشرية التي تشفر الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA).

عادةً، تكون جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في البكتيريا أقصر (المتوسط ​​= 77.6 زوجًا قاعديًا) من تلك الموجودة في العتائق (المتوسط ​​= 83.1 زوجًا قاعديًا) وحقيقيات النوى (المتوسط ​​= 84.7 زوجًا قاعديًا). [ 34 ] أما الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضج فيتبع نمطًا معاكسًا، حيث يكون الحمض النووي الريبوزي الناقل في البكتيريا أطول عادةً (الوسيط = 77.6 نيوكليوتيدًا) من الحمض النووي الريبوزي الناقل في العتائق (الوسيط = 76.8 نيوكليوتيدًا)، بينما تُظهر حقيقيات النوى أقصر الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضج (الوسيط = 74.5 نيوكليوتيدًا). ​​[ 34 ]

تطور

يُعدّ محتوى الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) في الجينوم سمةً مميزةً للجينومات بين مختلف نطاقات الحياة البيولوجية: تُظهر العتائق أبسط حالة من حيث محتوى الحمض النووي الريبوزي الناقل في الجينوم، حيث يكون عدد نسخ الجينات موحدًا، بينما تتميز البكتيريا بحالة متوسطة، أما حقيقيات النوى فتُظهر الحالة الأكثر تعقيدًا. [ 43 ] لا تتميز حقيقيات النوى فقط بمحتوى جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) أكثر من المملكتين الأخريين، بل تُظهر أيضًا تباينًا كبيرًا في عدد نسخ الجينات بين مختلف المستقبلات المتماثلة، ويبدو أن هذا التعقيد ناتج عن تضاعف جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) وتغيرات في خصوصية الكودون المضاد .

يرتبط تطور عدد نسخ جين الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) عبر الأنواع المختلفة بظهور إنزيمات تعديل محددة (ميثيل ترانسفيراز اليوريدين في البكتيريا، وأدينوزين دياميناز في حقيقيات النوى)، مما يزيد من قدرة فك شفرة الحمض النووي الريبوزي الناقل. [ 43 ] على سبيل المثال، يشفر الحمض النووي الريبوزي الناقل ألانين (tRNA Ala ) أربعة أنواع مختلفة من الحمض النووي الريبوزي الناقل المتماثل (AGC، UGC، GGC، وCGC). في حقيقيات النوى، يكون عدد نسخ جين الحمض النووي الريبوزي الناقل المتماثل AGC مرتفعًا للغاية مقارنةً ببقية الأنواع، وقد ارتبط ذلك بتعديل قاعدته المتذبذبة من الأدينوزين إلى الإينوزين. وقد لوحظ هذا الاتجاه نفسه لمعظم الأحماض الأمينية في حقيقيات النوى. في الواقع، يظهر تأثير هذين التعديلين على الحمض النووي الريبوزي الناقل أيضًا في انحياز استخدام الكودونات . يبدو أن الجينات ذات التعبير العالي غنية بالكودونات التي تستخدم حصريًا الكودونات التي سيتم فك شفرتها بواسطة هذه الحمض النووي الريبوزي الناقل المعدل، مما يشير إلى دور محتمل لهذه الكودونات - وبالتالي لهذه التعديلات على الحمض النووي الريبوزي الناقل - في كفاءة الترجمة. [ 43 ]

فقدت العديد من الأنواع أنواعًا محددة من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) خلال التطور. على سبيل المثال، تفتقر كل من الثدييات والطيور إلى نفس الجينات الـ 14 من أصل 64 جينًا ممكنًا للحمض النووي الريبوزي الناقل، بينما تحتوي أشكال الحياة الأخرى على هذه الجينات. [ 44 ] لترجمة الكودونات التي تفتقر إلى جزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل المطابق لها تمامًا، تلجأ الكائنات الحية إلى استراتيجية تُسمى " التذبذب "، حيث تُنتج أزواج الحمض النووي الريبوزي الناقل/الحمض النووي الريبوزي الرسول غير المتطابقة تمامًا عملية الترجمة، على الرغم من أن هذه الاستراتيجية تزيد أيضًا من احتمالية حدوث أخطاء في الترجمة. [ 45 ] لا تزال أسباب فقدان جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل خلال التطور محل نقاش، ولكنها قد ترتبط بتحسين مقاومة العدوى الفيروسية. [ 46 ] نظرًا لأن ثلاثيات النيوكليوتيدات يمكن أن تُقدم عددًا من التركيبات يفوق عدد الأحماض الأمينية وجزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل المرتبطة بها، فهناك فائض في الشفرة الوراثية، ويمكن لعدة كودونات مختلفة مكونة من 3 نيوكليوتيدات أن تُعبر عن نفس الحمض الأميني. هذا التحيز في الكودونات هو ما يستلزم تحسين الكودونات.

أصل افتراضي

يُشكّل النصف العلوي من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) (المكوّن من الذراع T وساق المستقبل مع مجموعة فوسفات طرفية 5′ ومجموعة CCA طرفية 3′) والنصف السفلي (المكوّن من الذراع D وذراع مضاد الكودون) وحدتين مستقلتين في التركيب والوظيفة. يُحتمل أن يكون النصف العلوي قد تطوّر أولًا، بما في ذلك العلامة الجينومية الطرفية 3′، والتي ربما كانت تُستخدم في الأصل لتمييز جزيئات شبيهة بالحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) للتضاعف في عالم الحمض النووي الريبوزي المبكر . أما النصف السفلي، فيُحتمل أنه تطوّر لاحقًا كتوسع، على سبيل المثال، مع بدء تخليق البروتين في عالم الحمض النووي الريبوزي وتحوّله إلى عالم البروتينات النووية الريبوزية ( RNP ). يُطلق على هذا السيناريو المقترح فرضية العلامة الجينومية . في الواقع، لا يزال للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) والتجمعات الشبيهة به تأثير تحفيزي هام (أي، كإنزيمات ريبوزية ) على التضاعف حتى اليوم. يُمكن اعتبار هذه الأدوار بمثابة " أحافير جزيئية (أو كيميائية) " لعالم الحمض النووي الريبوزي. [ 47 ] في مارس 2021، أفاد باحثون بوجود أدلة تشير إلى أن شكلاً مبكراً من الحمض النووي الريبوزي الناقل ربما كان جزيئاً ريبوزيمياً ناسخاً في المراحل المبكرة جداً من تطور الحياة، أو ما يُعرف بتكوين الحياة التلقائي . [ 48 ] [ 49 ]

يُفسَّر تطور الحمض النووي الريبوزي الناقل من النوع الأول والنوع الثاني حتى آخر نيوكليوتيد بنظرية تطور الحمض النووي الريبوزي الناقل ثلاثي الحلزونات المصغرة المكونة من 31 نيوكليوتيدًا، والتي تصف أيضًا الانتقال من مرحلة ما قبل الحياة إلى مرحلة الحياة على الأرض. [ 50 ] [ 51 ] [ 52 ] [ 53 ] [ 54 ] في مرحلة ما قبل الحياة، تم ربط ثلاثة حلزونات مصغرة مكونة من 31 نيوكليوتيدًا ذات تسلسل معروف لتكوين طليعة الحمض النووي الريبوزي الناقل المكونة من 93 نيوكليوتيدًا. في مرحلة ما قبل الحياة، تم ربط حلزون مصغر لحلقة D مكون من 31 نيوكليوتيدًا (GCGGCGGUAGCCUAGCCUAGCCUACCGCCGC) بحلزونين مصغرين لحلقة مضاد الكودون مكونين من 31 نيوكليوتيدًا (GCGGCGGCCGGGCU/???AACCCGGCCGCCGC؛ حيث يشير / إلى شكل U-turn في العمود الفقري للحمض النووي الريبوزي؛ وتشير علامة الاستفهام إلى هوية قاعدة غير معروفة) لتكوين طليعة الحمض النووي الريبوزي الناقل المكونة من 93 نيوكليوتيدًا. لإنتاج الحمض النووي الريبوزي الناقل من النوع الثاني، يحدث حذف داخلي واحد لتسعة نيوكليوتيدات ضمن سيقان المستقبل المربوطة (يتحول التسلسل CCGCCGCGCGGCGG إلى GGCGG). ولإنتاج الحمض النووي الريبوزي الناقل من النوع الأول، يحدث حذف إضافي لتسعة نيوكليوتيدات ضمن سيقان المستقبل المربوطة في منطقة الحلقة المتغيرة (يتحول التسلسل CCGCCGCGCGGCGG إلى CCGCC). هذان الحذفان متطابقان على سلسلتي الحمض النووي الريبوزي المتكاملتين. يتم إنتاج جميع أنواع الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNAomes) للكائن الحي عن طريق التضاعف والطفرة. 

من الواضح تمامًا أن الحياة تطورت من عالم البوليمرات الذي تضمن تكرارات الحمض النووي الريبوزي (RNA) وتكرارات الحمض النووي الريبوزي المعكوسة (سيقان حلقية). وكانت حلقات الالتفاف على شكل حرف U المكونة من 7 نيوكليوتيدات (CU/???AA) ذات أهمية خاصة. بعد السلف المشترك الأخير (LUCA)، تطورت حلقة T لتتفاعل مع حلقة D عند "انحناء" الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) (حلقة T: UU/CAAAU، بعد LUCA). تطور عالم البوليمرات إلى عالم الحلزونات المصغرة، ثم إلى عالم الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)، الذي استمر لحوالي 4 مليارات سنة. ويكشف تحليل تسلسلات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) عن مسار رئيسي ناجح في تطور الحياة على الأرض.

شظايا مشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل

شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRFs) هي جزيئات قصيرة تنشأ بعد انقسام الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضج أو النسخة الأولية. [ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] يمكن لكل من الحمض النووي الريبوزي الناقل السيتوبلازمي والميتوكوندري أن ينتج شظايا. [ 59 ] هناك أربعة أنواع هيكلية على الأقل من شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل يُعتقد أنها تنشأ من الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضج، بما في ذلك أنصاف الحمض النووي الريبوزي الناقل الطويلة نسبيًا وشظايا 5'-tRFs القصيرة، وشظايا 3'-tRFs، وشظايا i-tRFs. [ 55 ] [ 59 ] [ 60 ] يمكن انقسام الحمض النووي الريبوزي الناقل الأولي لإنتاج جزيئات من التسلسل الرائد 5' أو التسلسل الخلفي 3'. تشمل إنزيمات التحلل أنجيوجينين، ودايسر، وRNase Z، وRNase P. [ 55 ] [ 56 ] وخاصةً في حالة أنجيوجينين، تتميز جزيئات tRFs بوجود فوسفات حلقي غير عادي في طرفها 3' ومجموعة هيدروكسيل في طرفها 5'. [ 61 ] يبدو أن جزيئات tRFs تلعب دورًا في تداخل الحمض النووي الريبوزي ، وتحديدًا في كبح الفيروسات القهقرية والعناصر المتنقلة القهقرية التي تستخدم الحمض النووي الريبوزي الناقل كبادئ للتضاعف. تُعرف أنصاف الحمض النووي الريبوزي الناقل التي يتحللها أنجيوجينين أيضًا باسم tiRNAs. أما التكوين الحيوي للشظايا الأصغر، بما في ذلك تلك التي تعمل كـ piRNAs ، فهو أقل فهمًا. [ 62 ]

تتمتع جزيئات tRFs بوظائف وعلاقات متعددة، إذ تُظهر تغيرات ملحوظة بين الجنسين، وبين الأعراق، وفي حالات مرضية مختلفة. [ 59 ] [ 63 ] [ 64 ] وظيفيًا، يمكن تحميلها على بروتين Ago والعمل عبر مسارات RNAi، [ 57 ] [ 60 ] [ 65 ] والمشاركة في تكوين حبيبات الإجهاد، [ 66 ] وإزاحة mRNAs من البروتينات الرابطة للـRNA، [ 67 ] أو تثبيط الترجمة. [ 68 ] على مستوى النظام أو الكائن الحي، تتمتع الأنواع الأربعة من tRFs بنطاق واسع من الأنشطة. وظيفيًا، ترتبط tRFs بالعدوى الفيروسية، [ 69 ] والسرطان، [ 60 ] وتكاثر الخلايا ، [ 61 ] وكذلك بالتنظيم اللاجيني العابر للأجيال لعمليات الأيض. [ 70 ]

لا تقتصر جزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRFs) على البشر، وقد ثبت وجودها في العديد من الكائنات الحية. [ 60 ] [ 71 ] [ 72 ] [ 73 ]

تتوفر أداتان عبر الإنترنت لمن يرغب في معرفة المزيد عن شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRFs): إطار عمل للاستكشاف التفاعلي لشظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا والنووية ( MINTbase ) [ 74 ] [ 75 ] ، وقاعدة بيانات علائقية لشظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل ( tRFdb ، مؤرشفة في 15 مارس 2024 على Wayback Machine ) [ 76 ] . كما توفر MINTbase نظام تسمية لشظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل يُسمى لوحات ترخيص شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل (أو رموز MINT)، وهو نظام مستقل عن الجينوم؛ حيث يضغط هذا النظام تسلسل الحمض النووي الريبوزي إلى سلسلة أقصر.

الحمض النووي الريبوزي الناقل المُهندس

يمكن استخدام الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) ذي مضادات الكودونات المعدلة و/أو سيقان المستقبلات لتعديل الشفرة الوراثية. وقد نجح العلماء في إعادة توظيف الكودونات (المعنى والتوقف) لاستقبال الأحماض الأمينية (الطبيعية والجديدة)، وذلك لبدء عملية الترجمة (انظر: كودون البدء ) واستطالتها.

في عام 1990، أُدخل جزيء tRNA fMet2 CUA (المُعدَّل من جين tRNA fMet2 CAU، metY ) إلى بكتيريا الإشريكية القولونية ، مما حثّها على بدء تخليق البروتين عند كودون التوقف UAG، شريطة أن يسبقه تسلسل شاين-دالغارنو قوي. عند بدء التخليق، لا يُدخل هذا الجزيء الفورميل ميثيونين التقليدي فحسب ، بل يُدخل أيضًا الفورميل غلوتامين، حيث يتعرف إنزيم غلوتاميل-tRNA سينثاز على جزيء tRNA الجديد. [ 77 ] أُعيدت التجربة في عام 1993، باستخدام جزيء tRNA مُعدَّل ليُتعرف عليه إنزيم ميثيونيل-tRNA فورميل ترانسفيراز . [ 78 ] وقد حُصل على نتيجة مماثلة في بكتيريا المتفطرة . [ 79 ] أظهرت التجارب اللاحقة أن الحمض النووي الريبوزي الناقل الجديد كان متعامدًا مع كودون البدء AUG العادي، ولم يُظهر أي أحداث بدء ترجمة خارج الهدف قابلة للكشف في سلالة E. coli المعاد ترميزها جينوميًا . [ 80 ]

تكوين الحمض النووي الريبوزي الناقل

في الخلايا حقيقية النواة ، تُنسخ جزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III على شكل جزيئات أولية (pre-tRNA) في النواة. [ 81 ] يتعرف بوليميراز الحمض النووي الريبوزي III على تسلسلين محفزين محفوظين للغاية في اتجاه المصب: منطقة التحكم داخل الجين 5′ (5′-ICR، أو منطقة التحكم D، أو صندوق A)، ومنطقة التحكم داخل الجين 3′ (منطقة التحكم T، أو صندوق B) داخل جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل. [ 2 ] [ 82 ] [ 83 ] يبدأ المحفز الأول عند الموضع +8 من الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضج، ويقع المحفز الثاني على بُعد 30-60 نيوكليوتيدًا في اتجاه المصب من المحفز الأول. وينتهي النسخ بعد سلسلة من أربعة ثايميدينات أو أكثر . [ 2 ] [ 83 ]

نمط انتفاخ-حلزون-انتفاخ في إنترون الحمض النووي الريبوزي الناقل

تخضع جزيئات ما قبل الحمض النووي الريبوزي الناقل (pre-tRNA) لتعديلات واسعة النطاق داخل النواة. تحتوي بعض جزيئات ما قبل الحمض النووي الريبوزي الناقل على إنترونات تُقطع لتكوين جزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل الوظيفي؛ [ 84 ] في البكتيريا، تُقطع هذه الإنترونات ذاتيًا ، بينما في حقيقيات النوى والعتائق، تُزال بواسطة إنزيمات نوكلياز داخلية خاصة بقطع الحمض النووي الريبوزي الناقل . [ 85 ] يحتوي ما قبل الحمض النووي الريبوزي الناقل في حقيقيات النوى على وحدة بنائية منتفخة-حلزونية-منتفخة (BHB) مهمة للتعرف على إنترون الحمض النووي الريبوزي الناقل وقطعه بدقة بواسطة إنزيمات النوكلياز الداخلية. [ 86 ] يُعد موضع هذه الوحدة البنائية وبنيتها محفوظين تطوريًا. مع ذلك، تمتلك بعض الكائنات الحية، مثل الطحالب وحيدة الخلية، موضعًا غير نمطي لوحدة BHB البنائية، بالإضافة إلى نهايتي 5′ و3′ لتسلسل الإنترون المقطوع. [ 86 ] تُزال متتالية 5′ بواسطة إنزيم RNase P ، [ 87 ] بينما تُزال متتالية 3′ بواسطة إنزيم tRNase Z. [ 88 ] ويُستثنى من ذلك بكتيريا Nanoarchaeum equitans ، التي لا تمتلك إنزيم RNase P، ولديها مُحفِّزٌ موضوعٌ بحيث يبدأ النسخ من الطرف 5′ لجزيء tRNA الناضج. [ 89 ] ويُضاف ذيل CCA غير المُنسوخ 3′ بواسطة إنزيم ناقل النيوكليوتيدات . [ 90 ] وقبل تصدير جزيئات tRNA إلى السيتوبلازم بواسطة Los1/ Xpo-t ، [ 91 ] [ 92 ] تُضاف الأحماض الأمينية إلى جزيئات tRNA . [ 93 ] ولا يُحفظ ترتيب عمليات المعالجة. فعلى سبيل المثال، في الخميرة ، لا تتم عملية الربط في النواة، بل على الجانب السيتوبلازمي لأغشية الميتوكوندريا . [ 94 ]

تاريخ

افترض فرانسيس كريك وجود الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) لأول مرة تحت مسمى " فرضية المحول "، استنادًا إلى افتراض وجود جزيء محول قادر على نقل تسلسل الحمض النووي الريبوزي إلى تسلسل البروتين. اكتشف بول سي زاميكنيك ، وماهلون هوغلاند ، وماري لويز ستيفنسون الحمض النووي الريبوزي الناقل عام 1958. [ 95 ] [ 96 ] [ 97 ] أُجريت أبحاثٌ هامة حول بنيته في أوائل الستينيات من القرن الماضي على يد أليكس ريتش ودونالد كاسبار ، وهما باحثان في بوسطن، ومجموعة جاك فريسكو في جامعة برينستون ، ومجموعة من المملكة المتحدة في كلية كينغز كوليدج لندن . [ 98 ] في عام 1965، نشر روبرت دبليو هولي من جامعة كورنيل البنية الأولية واقترح ثلاث بنيات ثانوية. [ 99 ] تم بلورة الحمض النووي الريبوزي الناقل لأول مرة في ماديسون، ويسكونسن، على يد روبرت إم بوك. [ 100 ] تم تأكيد بنية البرسيم من خلال عدة دراسات أخرى في السنوات اللاحقة [ 101 ] ، وتم تأكيدها نهائيًا باستخدام دراسات علم البلورات بالأشعة السينية في عام 1974. ونشرت مجموعتان مستقلتان، إحداهما بقيادة كيم سونغ-هو تحت إشراف ألكسندر ريتش، والأخرى مجموعة بريطانية برئاسة آرون كلوغ ، نفس نتائج علم البلورات في غضون عام واحد. [ 102 ] [ 103 ]

الأهمية السريرية

قد يكون التدخل في عملية إضافة الأحماض الأمينية مفيدًا كنهج لعلاج بعض الأمراض: إذ قد تكون الخلايا السرطانية أكثر عرضةً لاضطراب هذه العملية مقارنةً بالخلايا السليمة. غالبًا ما يعتمد تخليق البروتين المرتبط بالسرطان والبيولوجيا الفيروسية اعتمادًا كبيرًا على جزيئات tRNA محددة. على سبيل المثال، في سرطان الكبد، تُسهم إضافة الليسين إلى tRNA-Lys-CUU في دعم نمو خلايا سرطان الكبد وانتشارها، بينما تعتمد الخلايا السليمة بشكل أقل بكثير على هذا الـ tRNA لدعم وظائفها الخلوية. [ 104 ] وبالمثل، يتطلب فيروس التهاب الكبد E مجموعةً من جزيئات tRNA تختلف اختلافًا كبيرًا عن تلك الموجودة في الخلايا غير المصابة. [ 105 ] لذا، يُعتبر تثبيط إضافة الأحماض الأمينية لأنواع محددة من tRNA نهجًا جديدًا واعدًا للعلاج العقلاني للعديد من الأمراض.

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ بليسيا، أو. جيه.، بالتشوك، إن. سي.، كورا-فيغيروا، إي.، موخرجي، إيه.، براون، دبليو. (أكتوبر 1965). "إنتاج الأجسام المضادة للحمض النووي الريبي الذائب (sRNA)" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 54 (4): 1281-1285 . Bibcode : 1965PNAS...54.1281P . doi : 10.1073 / pnas.54.4.1281 . PMC 219862. PMID 5219832 .  
  2. 1 2 3 شارب إس جيه، شاك جيه، كولي إل، بيرك دي جيه، سول دي (1985). "بنية ونسخ جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل في حقيقيات النوى". مراجعات سي آر سي النقدية في الكيمياء الحيوية . 19 (2): 107-144 . doi : 10.3109/10409238509082541 . PMID 3905254 . 
  3. 1 2 كريك ، ف. هـ. (ديسمبر 1968). "أصل الشفرة الوراثية". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 38 (3): 367-379 . doi : 10.1016/0022-2836(68)90392-6 . PMID 4887876. S2CID 4144681 .  
  4. 1 2 سترير إل، بيرج جي إم، تيموشكو جيه إل (2002). الكيمياء الحيوية ( الطبعة الخامسة). سان فرانسيسكو: دبليو إتش فريمان. رقم ISBN  978-0-7167-4955-4تمت أرشفة هذا النص من المصدر الأصلي في 10 ديسمبر 2010.
  5. ↑ جاكمان، جين إي.؛ جوت، جوناثا إم.؛ جراي، مايكل دبليو. (مايو 2012). "العملية العكسية: بلمرة من 3' إلى 5' بواسطة عائلة Thg1 الفائقة" . RNA . 18 ( 5): 886-899 . doi : 10.1261/rna.032300.112 . ISSN 1469-9001 . PMC 3334698. PMID 22456265 .   
  6. ↑ راو، بهالشاندرا س.؛ ماريس، إميلي ل.؛ جاكمان، جين إي. (2011-03-01). "أنشطة إصلاح الطرف 5′ لـ tRNA بواسطة بروتينات شبيهة بـ tRNA His guanylyltransferase (Thg1) من البكتيريا والعتائق" . أبحاث الأحماض النووية . 39 (5): 1833-1842 . doi : 10.1093/nar/gkq976 . ISSN 0305-1048 . PMC 3061083. PMID 21051361 .   
  7. ↑ تشين، آلان دبليو؛ جاياسينغ، ماليثي آي؛ تشونغ، كريستينا زد؛ راو، بهالشاندرا إس؛ كينانا، روزان؛ هاينمان، إيلكا يو؛ جاكمان، جين إي. (26 مارس 2019). "دور بلمرة الحمض النووي الريبوزي العكسية من 3′ إلى 5′ في دقة الحمض النووي الريبوزي الناقل وإصلاحه" . جينات . 10 ( 3): 250. doi : 10.3390/genes10030250 . ISSN 2073-4425 . PMC 6471195. PMID 30917604 .   
  8. ↑ "الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)" . Proteopedia.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 نوفمبر 2018 .
  9. 1 2 3 4 5 إيتوه واي، سيكين إس، سويتسوغو إس، يوكوياما إس (يوليو 2013). "البنية الثلاثية لـ tRNA السيرينوسيستين البكتيري" . أبحاث الأحماض النووية . 41 (13): 6729-6738 . doi : 10.1093/nar/gkt321 . PMC 3711452. PMID 23649835 .  
  10. ↑ غودنبور، جيه إم، وبان، تي (29 أكتوبر 2006). "تنوع جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل في حقيقيات النوى" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (21): 6137-6146 . doi : 10.1093/nar/gkl725 . PMC 1693877. PMID 17088292 .  
  11. ↑ جان م، روجرز م ج، سول د (يوليو 1991). "تُعدّ نيوكليوتيدات مضاد الكودون وجذع المستقبل في الحمض النووي الريبوزي الناقل (الجلوتامين) عناصرَ تعريف رئيسية لإنزيم سينثيتاز غلوتامينيل-حمض نووي ريبوزي ناقل في الإشريكية القولونية". مجلة نيتشر . 352 (6332): 258-260 . Bibcode : 1991Natur.352..258J . doi : 10.1038/352258a0 . PMID 1857423. S2CID 4263705 .  
  12. ↑ إيبا م، سول د (يونيو 2000). "تخليق أمينوأسيل-tRNA". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 69 (1): 617-650 . doi : 10.1146/annurev.biochem.69.1.617 . PMID 10966471 . 
  13. ↑ سبرينزل م، كرامر ف (1979). "نهاية -CCA لـ tRNA ودورها في تخليق البروتين". التقدم في أبحاث الأحماض النووية والبيولوجيا الجزيئية . 22 : 1-69 . doi : 10.1016/s0079-6603(08)60798-9 . ISBN 978-0-12-540022-0PMID 392600​​ 
  14. ↑ غرين ر، نولر إتش إف (1997). "الريبوسومات والترجمة". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 66 : 679-716 . doi : 10.1146/annurev.biochem.66.1.679 . PMID 9242921 . 
  15. ↑ أيبي م، كيرشنر ج، تشين جيه واي، فيجايراغافان يو، جاكوبسون أ، مارتن إن سي، أبيلسون جيه، وآخرون . (سبتمبر 1990). "عزل طفرة حساسة للحرارة ذات إنزيم ناقل نيوكليوتيديل tRNA مُعدَّل، واستنساخ الجين المُشفِّر لهذا الإنزيم في خميرة Saccharomyces cerevisiae" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 265 (27): 16216-16220 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)46210-7 . PMID 2204621 .  
  16. ↑ تشان، سي دبليو؛ شيتناني، بي؛ موندراغون، إيه (سبتمبر 2013). "بنية ووظيفة النمط البنيوي T-loop في الحمض النووي الريبي غير المشفر" . مراجعات وايلي متعددة التخصصات. الحمض النووي الريبي . 4 (5): 507-22 . doi : 10.1002/wrna.1175 . PMC 3748142. PMID 23754657 .  
  17. ↑ برابهاكار أ، كران إن، تشانغ جيه، فارغاس رودريغيز أو، كروبكين إم، فو زد، أكوستا رييس إف جيه، جي إكس، تشوي جيه، كرنكوفيتش أ، إهرنبيرج إم، بوجليسي إي في، سول د، بوجليسي جي (يوليو 2022). "الكشف عن حواجز الترجمة أثناء تطوير الحمض الريبي النووي النقال الاصطناعي" . الدقة الأحماض النووية . 50 (18): 10201–10211 . دوى : 10.1093/nar/gkac576 . بمك 9561287 . بميد 35882385 .  
  18. ↑ برينان، ت.؛ سوندارالينغام، م. (1 نوفمبر 1976). "بنية جزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل التي تحتوي على الحلقة المتغيرة الطويلة" . أبحاث الأحماض النووية . 3 (11): 3235-3252 . doi : 10.1093/nar/3.11.3235 . PMC 343166. PMID 794835 .  
  19. ↑ فيلسنفيلد، جي، وكانتوني، جي إل (مايو 1964). "استخدام دراسات التمسخ الحراري للتحقق من تسلسل قواعد الحمض النووي الريبوزي الصغير (sRNA) للسيرين في الخميرة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 51 (5): 818-826 . Bibcode : 1964PNAS...51..818F . doi : 10.1073/pnas.51.5.818 . PMC 300168. PMID 14172997 .  
  20. ↑ سوزوكي تي، سوزوكي تي (يونيو 2014). "نظرة شاملة على التعديلات اللاحقة للنسخ في الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا لدى الثدييات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 42 (11): 7346-7357 . doi : 10.1093/nar/gku390 . PMC 4066797. PMID 24831542 .  
  21. ↑ لوديش هـ، بيرك أ، ماتسودايرا ب، كايزر سي أ، كريجر م، سكوت إم بي، زيبورسكي إس إل، دارنيل ج. (2004). بيولوجيا الخلية الجزيئية . دبليو إتش فريمان: نيويورك. الطبعة الخامسة. ISBN 978-0716743668
  22. ↑ باريسيان، مارك؛ وانغ، شياويون؛ بان، تاو (ديسمبر 2013). "تنوع جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل البشري من مشروع الألف جينوم" . بيولوجيا الحمض النووي الريبوزي . 10 (12): 1853-1867 . doi : 10.4161/rna.27361 . PMC 3917988. PMID 24448271 .  
  23. ↑ تشان، ب.ب.؛ لوي، ت.م. (4 يناير 2016). "GtRNAdb 2.0: قاعدة بيانات موسعة لجينات الحمض النووي الريبوزي الناقل المُحددة في الجينومات الكاملة والمسودات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 44 (D1): D184-9. doi : 10.1093/nar/gkv1309 . PMC 4702915. PMID 26673694 .  
  24. ↑ هيوز، ليتيسيا أ.؛ رودلر، دانييل ل.؛ سييرا، ستيفان ج.؛ مكوبين، تيم؛ رافين، صموئيل أ.؛ براون، ياسمين م.؛ إرمر، جوديث أ.؛ رينتجيس، جانيت؛ رودجر، جينيفر؛ مارسيلين، إستيبان؛ راكهام، أوليفر؛ فيليبوفسكا، ألكسندرا (18 أبريل 2023). "يؤدي تباين عدد النسخ في جينات فك شفرة الحمض النووي الريبوزي الناقل إلى إعاقة نمو الثدييات والترجمة المتوازنة" . مجلة نيتشر كوميونيكيشنز . 14 (1): 2210. Bibcode : 2023NatCo..14.2210H . doi : 10.1038/s41467-023-37843-9 . PMC 10113395. PMID 37072429 .  
  25. ↑ شيميل، ب.، جيجي، ر.، موراس، د.، يوكوياما، س. (أكتوبر 1993). " شفرة RNA تشغيلية للأحماض الأمينية وعلاقتها المحتملة بالشفرة الوراثية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 90 (19): 8763-8768 . Bibcode : 1993PNAS...90.8763S . doi : 10.1073/pnas.90.19.8763 . PMC 47440. PMID 7692438 .  
  26. ↑ دانكل، جيه. إيه.، وانغ، إل.، فيلدمان، إم. بي.، بولك، إيه.، تشين، في. بي.، كابرال، جي. جيه.، نوسكي، جيه.، ريتشاردسون، جيه. إس.، بلانشارد، إس. سي.، كيت، جيه. إتش. (مايو 2011). " بنية الريبوسوم البكتيري في حالتي الارتباط الكلاسيكية والهجينة لجزيء الحمض النووي الريبوزي الناقل" . مجلة ساينس . 332 (6032): 981-984 . Bibcode : 2011Sci...332..981D . doi : 10.1126/science.1202692 . PMC 3176341. PMID 21596992 .  
  27. ↑ كونيفيكا إيه إل، سوبوليفا إن جي، ماخنو في آي، سيمينكوف واي بي، وينترماير دبليو، رودنينا إم في، كاتونين في آي (يناير 2004). "قواعد البيورين في الموضع 37 من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) تُثبّت تفاعل الكودون-مضاد الكودون في الموقع A للريبوسوم عن طريق التراص والتفاعلات المعتمدة على أيونات المغنيسيوم (Mg2+)" . مجلة الحمض النووي الريبوزي (RNA) . 10 (1): 90-101 . doi : 10.1261/rna.5142404 . PMC 1370521. PMID 14681588 .  
  28. 1 2 أغيريزابالا إكس، فرانك جيه (أغسطس 2009). "استطالة الترجمة كتفاعل ديناميكي بين الريبوسوم، وtRNA، وعوامل الاستطالة EF-G وEF-Tu" . المراجعات الفصلية للفيزياء الحيوية . 42 (3): 159-200 . doi : 10.1017/S0033583509990060 . PMC 2832932. PMID 20025795 .  
  29. 1 2 ألين جي إس، زافيالوف أ، جورسكي ر، إهرنبرغ م، فرانك ج (يونيو 2005). "بنية معقد بدء الترجمة من الإشريكية القولونية باستخدام المجهر الإلكتروني فائق البرودة" . الخلية . 121 ( 5): 703-712 . doi : 10.1016/j.cell.2005.03.023 . PMID 15935757. S2CID 16146867 .  
  30. ↑ تيرومالاي إم آر، ريفاس إم، تران كيو، فوكس جي إي (نوفمبر 2021). "مركز نقل الببتيديل: نافذة على الماضي" . مجلة علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 85 (4) e00104-21: e0010421. رمز Bibcode : 2021MMBR...85...21T . doi : 10.1128/MMBR.00104-21 . PMC 8579967. PMID 34756086 .  
  31. ↑ موقع WormBase الإلكتروني، http://www.wormbase.org مؤرشف في 2017-04-20 في Wayback Machine ، الإصدار WS187، تاريخ 25-يناير-2008.
  32. ↑ سبيث ج، لوسون د (يناير 2006). "نظرة عامة على بنية الجينات" . WormBook : 1-10 . doi : 10.1895/wormbook.1.65.1 . PMC 4781370. PMID 18023127 .  
  33. ↑ هارتويل إل إتش، هود إل، غولدبيرغ إم إل، رينولدز إيه إي، سيلفر إل إم، فيريس آر سي. (2004). علم الوراثة: من الجينات إلى الجينومات، الطبعة الثانية. ماكجرو هيل: نيويورك. ص 264.
  34. 1 2 3 سانتوس، فينيسيا بريتو؛ ديل بيم ، لويز إدواردو (يناير 2023). "تطور عدد نسخ tRNA والمرجع في الحياة الخلوية" . الجينات . 14 (1): 27. دوى : 10.3390 / الجينات 14010027 . ردمك 2073-4425 . بمك 9858662 . بميد 36672768 .   
  35. ↑ إصدار Ensembl 70 - يناير 2013 http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/StatsTable?db=core مؤرشف بتاريخ 15 ديسمبر 2013 على Wayback Machine
  36. 1 2 لاندر إي إس، لينتون إل إم، بيرين بي، نوسباوم سي، زودي إم سي، بالدوين جيه، وآخرون (الاتحاد الدولي لتسلسل الجينوم البشري) (فبراير 2001). "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري" (ملف PDF) . مجلة نيتشر . 409 (6822): 860-921 . Bibcode : 2001Natur.409..860L . doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011 .  
  37. ↑ روغرز تي إي، أتايد إس إف، دار كيه، كاتز إيه، سيفو إس، روي إتش، إيبا إم (2012). " يُعدِّل جزيء tRNA زائف مقاومة المضادات الحيوية في بكتيريا Bacillus cereus" . PLOS ONE . 7 (7) e41248. Bibcode : 2012PLoSO...741248R . doi : 10.1371/journal.pone.0041248 . PMC 3399842. PMID 22815980 .  
  38. ↑ إيبن، جيمس ر.؛ مارايا، ريتشارد ج. (2014). "تغير عدد نسخ جين الحمض النووي الريبوزي الناقل في البشر" . جين . 536 (2): 376-384 . doi : 10.1016/j.gene.2013.11.049 . PMC 3941035. PMID 24342656 .  
  39. ↑ هارتويل إل إتش، هود إل، غولدبيرغ إم إل، رينولدز إيه إي، سيلفر إل إم، فيريس آر سي. (2004). علم الوراثة: من الجينات إلى الجينومات، الطبعة الثانية. ماكجرو هيل: نيويورك. ص 529.
  40. 1 2 تيلونيس إيه جي، لوهر بي، كيرينو واي، ريغوتسوس آي (2014). " شبيهات الحمض النووي الريبوزي الناقل النووي والميتوكوندري في الجينوم البشري" . فرونتيرز إن جينيتكس . 5 : 344. doi : 10.3389/fgene.2014.00344 . PMC 4189335. PMID 25339973 .  
  41. ↑ راموس أ، باربينا إي، ماتيو إل، ديل مار غونزاليس إم، ميرال كيو، ليما إم، مونتيل آر، ألوجا إم بي، سانتوس سي، وآخرون . (نوفمبر 2011). “الإدراج النووي من أصل الميتوكوندريا: تحديث قاعدة البيانات وفائدتها في دراسات السرطان”. الميتوكوندريا . 11 (6): 946-953 . دوى : 10.1016/j.mito.2011.08.009 . بميد 21907832 .  
  42. ↑ تيلونيس إيه جي، كيرينو واي، ريغوتسوس آي (2015). "شبيهات الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا في الكروموسومات النووية: هل يمكن أن تكون وظيفية؟" . بيولوجيا الحمض النووي الريبوزي . 12 (4): 375-380 . doi : 10.1080/15476286.2015.1017239 . PMC 4615777. PMID 25849196 .  
  43. 1 2 3 نوفوا إي إم، بافون-إتيرنود إم، بان تي، ريباس دي بوبلانا إل (مارس 2012). "دور تعديلات الحمض النووي الريبوزي الناقل في بنية الجينوم واستخدام الكودونات" . الخلية . 149 ( 1): 202-213 . doi : 10.1016/j.cell.2012.01.050 . PMID 22464330. S2CID 16487609 .  
  44. ↑ أو إكس، بينغ دبليو، يانغ زد، كاو جيه، وانغ إم، بيبيلنبوش إم بي، بان كيو، تشنغ إيه (نوفمبر 2020). "جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل المفقودة والمحفوظة تطوريًا في الإنسان والطيور" . علم الوراثة والتطور المعدي . 85 104460. Bibcode : 2020InfGE..8504460O . doi : 10.1016/j.meegid.2020.104460 . hdl : 1765/129010 . PMID 32679345 . 
  45. ↑ أو إكس، كاو جيه، تشينغ إيه، بيبيلنبوش إم بي، بان كيو (مارس 2019). "أخطاء في فك شفرة الترجمة: تذبذب الحمض النووي الريبوزي الناقل أم إدخال خاطئ؟" . مجلة PLOS Genetics . 15 (3): 2979-2986 . doi : 10.1371/journal.pgen.1008017 . PMC 3158919. PMID 21930591 .  
  46. ↑ أو إكس، وانغ إم، ماو إس، كاو جيه، تشنغ إيه، تشو دي، تشن إس، جيا آر، ليو إم، يانغ كيو، وو واي، تشاو إكس، تشانغ إس، ليو واي، يو واي، تشانغ إل، تشن إكس، بيبيلنبوش إم بي، بان كيو (يوليو 2018). "الترجمة غير المتوافقة تقود إلى تطور متقارب وتوهين فيروسي أثناء تطوير لقاح حي موهن" . فرونت . سيل. إنفكت. ميكروبيول . 8 249. doi : 10.3389/fcimb.2018.00249 . PMC 6058041. PMID 30073153 .  
  47. ↑ مايزلز، نانسي؛ وينر، آلان م. (1999). "فرضية الوسم الجينومي - ما تخبرنا به الأحافير الجزيئية عن تطور الحمض النووي الريبوزي الناقل" . عالم الحمض النووي الريبوزي ( الطبعة الثانية). مطبعة مختبر كولد سبرينغ هاربور. CiteSeerX 10.1.1.708.7795 . ISBN   978-0-87969-561-3تم الاطلاع عليه بتاريخ 16 فبراير 2024 .
  48. ↑ كوهنلين، ألكسندرا؛ لانزميتش، سيمون أ.؛ برون، ديتر (2 مارس 2021). "يمكن لتسلسلات الحمض النووي الريبوزي الناقل أن تتجمع لتكوين مُضاعِف" . eLife . 10 e63431. doi : 10.7554/eLife.63431 . PMC 7924937. PMID 33648631 .  
  49. ↑ ماكسيميليان، لودفيج (3 أبريل 2021). "حل معضلة البيضة والدجاجة - خطوة أقرب إلى إعادة بناء أصل الحياة"" . SciTechDaily . تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 أبريل 2021 .
  50. ↑ لي، لي؛ بيرتون، زاكاري فروم (2023). "نظرية تطور الحمض النووي الريبوزي الناقل المصغر ذي 31 نيوكليوتيدًا وأصل الحياة" . مجلة لايف . 13 (11): 2224. Bibcode : 2023Life...13.2224L . doi : 10.3390/life13112224 . PMC 10672568. PMID 38004364 .  
  51. ↑ لي، لي؛ بيرتون، زاكاري (2021). "تطور الشفرة الوراثية" . النسخ . 12 (1 ) : 28-53 . doi : 10.1080/21541264.2021.1927652 . PMC 8172153. PMID 34000965 .  
  52. ↑ لي، لي؛ بيرتون، زاكاري (2021). "تطور الحياة على الأرض: الحمض النووي الريبوزي الناقل، وإنزيمات أمينو أسيل-حمض نووي ريبوزي ناقل ، والشفرة الوراثية" . مجلة لايف . 10 (3): 21. doi : 10.3390/life10030021 . PMC 7151597. PMID 32131473 .  
  53. ↑ بيرتون، زاكاري (2020). "نظرية تطور الحمض النووي الريبوزي الناقل ثلاثي الحلزونات". مجلة التطور الجزيئي . 88 (3): 234-242 . Bibcode : 2020JMolE..88..234B . doi : 10.1007/s00239-020-09928-2 . PMID 32020280 . 
  54. ↑ كيم، يونسو؛ أوبرون، كريستوفر؛ بيرتون، زاكاري (2019). "نظرةٌ تركز على الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) والمضاد للكودون لتطور إنزيمات أمينو أسيل-tRNA سينثيتاز، ومجموعات الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNAomes)، والشفرة الوراثية" . مجلة لايف . 9 (2): 37. Bibcode : 2019Life....9...37K . doi : 10.3390/life9020037 . PMC 6616430. PMID 31060233 .  
  55. 1 2 3 جيبيتسبرجر جيه، بولاسيك إن (ديسمبر 2013). "تشريح الحمض الريبي النووي النقال لتعزيز التنوع الوظيفي للـ ncRNA" . بيولوجيا الحمض النووي الريبي . 10 (12): 1798–1806 . دوى : 10.4161/rna.27177 . بمك 3917982 . بميد 24351723 .  
  56. 1 2 شيغيماتسو م، هوندا س، كيرينو ي (2014). "الحمض النووي الريبوزي الناقل كمصدر للحمض النووي الريبوزي الوظيفي الصغير" . مجلة البيولوجيا الجزيئية والتصوير الجزيئي . 1 (2): 8. PMC 4572697. PMID 26389128 .  
  57. 1 2 سوبالا أ، هوتفاجنر ج (2011). "شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل: أصولها، ومعالجتها، ووظائفها" (ملف PDF) . مراجعات وايلي متعددة التخصصات: الحمض النووي الريبوزي . 2 (6): 853-862 . doi : 10.1002/wrna.96 . hdl : 10453/18187 . PMID 21976287. S2CID 206554146 .  
  58. ↑ كيم إس بي، هوتفاجنر جي (نوفمبر 2015). "شظايا مشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRFs): أدوار جديدة ناشئة لحمض نووي ريبوزي قديم في تنظيم التعبير الجيني" . مجلة لايف . 5 (4): 1638-1651 . Bibcode : 2015Life....5.1638K . doi : 10.3390/life5041638 . PMC 4695841. PMID 26703738 .  
  59. 1 2 3 تيلونيس إيه جي، لوهر بي، هوندا إس، جينغ واي، بالازو جيه، كيرينو واي، ريغوتسوس آي (يوليو 2015). " تحليل تعقيدات شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل باستخدام النسخ الجينية الشخصية يكشف عن فئات شظايا جديدة وعلاقات تبعية غير متوقعة" . أونكوتارجت . 6 (28): 24797-822 . doi : 10.18632/oncotarget.4695 . PMC 4694795. PMID 26325506 .  
  60. 1 2 3 4 كومار ب، أنايا ج، مودونوري س ب، دوتا أ (أكتوبر 2014). "تحليل تلوي لشظايا الحمض النووي الريبوزي المشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل يكشف أنها محفوظة تطوريًا وترتبط ببروتينات AGO للتعرف على أهداف محددة من الحمض النووي الريبوزي" . بي إم سي بيولوجي . 12 78. doi : 10.1186/s12915-014-0078-0 . PMC 4203973. PMID 25270025 .  
  61. هوندا إس ، لوهر بي، شيغيماتسو إم، بالازو جيه بي، سوزوكي آر، إيموتو آي، ريغوتسوس آي، كيرينو واي (يوليو 2015). "تعزز أنصاف الحمض النووي الريبوزي الناقل المعتمدة على الهرمونات الجنسية تكاثر الخلايا في سرطانات الثدي والبروستاتا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 112 (29): E3816– E3825. Bibcode : 2015PNAS..112E3816H . doi : 10.1073/pnas.1510077112 . PMC 4517238. PMID 26124144 .  
  62. ↑ شورن، أ. ج.؛ مارتينسن، ر. (أكتوبر 2018). "كسر التعادل: المضيف والعناصر المتنقلة الرجعية تلعب دور الحمض النووي الريبوزي الناقل" . اتجاهات في بيولوجيا الخلية . 28 (10): 793-806 . doi : 10.1016/j.tcb.2018.05.006 . PMC 6520983. PMID 29934075 .  
  63. ↑ تيلونيس إيه جي، ريغوتسوس آي (مارس 2018). "التفاوتات العرقية في مساهمة أشكال miRNA المتغايرة وشظايا tRNA المشتقة في سرطان الثدي ثلاثي السلبية" . أبحاث السرطان . 78 (5): 1140-1154 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-17-1947 . PMC 5935570. PMID 29229607 .  
  64. ↑ تيلونيس إيه جي، لوهر بي، ماجي آر، بلياتسيكا في، لوندين إي، كيرينو واي، ريغوتسوس آي (يونيو 2019). "تُظهر شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل تشابكًا مع الحمض النووي الريبوزي الرسول ذي المحتوى التكراري المحدد، وترتبط بالاختلافات" . أبحاث السرطان . 79 (12): 3034-49 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-19-0789 . PMC 6571059. PMID 30996049 .  
  65. ↑ شيغيماتسو م، كيرينو ي (2015). "الحمض النووي الريبوزي القصير غير المشفر المشتق من الحمض النووي الريبوزي الناقل كشركاء متفاعلين مع بروتينات أرجونوت" . تنظيم الجينات وبيولوجيا الأنظمة . 9 GRSB.S29411: 27-33 . doi : 10.4137/GRSB.S29411 . PMC 4567038. PMID 26401098 .  
  66. ↑ عمارة م.م، إيفانوف ب، هيكمان ت، داورا ن، تيسديل س، كيديرشا ن، هو ج.ف، أندرسون ب (أبريل 2010). "تعزز الحموض النووية الريبية المشتقة من الحمض النووي الريبي الناقل والمحفزة بالإجهاد، والمولدة بواسطة الأنجيوجينين، تجميع حبيبات الإجهاد المحفزة بالإجهاد" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 285 (14): 10959-10968 . doi : 10.1074/jbc.M109.077560 . PMC 2856301. PMID 20129916 .  
  67. ↑ غودارزي هـ، ليو إكس، نغوين إتش سي، تشانغ إس، فيش إل، تافازوي إس إف (مايو 2015). "تُثبّط شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل الداخلي تطور سرطان الثدي عبر إزاحة YBX1" . مجلة Cell . 161 (4): 790-802 . doi : 10.1016/j.cell.2015.02.053 . PMC 4457382. PMID 25957686 .  
  68. ↑ إيفانوف ب، إمارة م م، فيلين ج، جيجي س ب، أندرسون ب (أغسطس 2011). "شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل المحفزة بالأنجيوجينين تثبط بدء الترجمة" . الخلية الجزيئية . 43 (4): 613-623 . doi : 10.1016/j.molcel.2011.06.022 . PMC 3160621. PMID 21855800 .  
  69. ↑ سيليتسكي إس آر، باران-غيل جيه، هوندا إم، ياماني دي، ماساكي تي، فانين إي إي، غيرا بي، شيراساكي تي، شيماكامي تي، كانيكو إس، لانفورد آر إي، ليمون إس إم، سيثوباثي بي (يناير 2015). "تزداد جزيئات الحمض النووي الريبوزي الصغيرة المشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) وتكون أكثر وفرة من جزيئات الحمض النووي الريبوزي الميكروي (microRNA) في التهاب الكبد المزمن من النوعين B وC" . التقارير العلمية . 5 7675. Bibcode : 2015NatSR...5.7675S . doi : 10.1038/srep07675 . PMC 4286764. PMID 25567797 .  
  70. ^ Sharma U، Conine CC، Shea JM، Boskovic A، Derr AG، Bing XY، Belleannee C، Kucukural A، Serra RW، Sun F، Song L، Carone BR، Ricci EP، Li XZ، Fauquier L، Moore MJ، Sullivan R، Mello CC، Garber M، Rando OJ (يناير 2016). "التكوين الحيوي ووظيفة شظايا الحمض الريبي النووي النقال أثناء نضوج الحيوانات المنوية والتخصيب في الثدييات" . علوم . 351 (6271): 391–396 . بيب كود : 2016Sci...351..391S . دوى : 10.1126/science.aad6780 . بمك 4888079 . بميد 26721685 .  
  71. ↑ كاساس إي، كاي جي، نيل جي دي (2015). "توصيف شظايا الحمض النووي الريبوزي المشتقة من الحمض النووي الريبوزي الناقل المتداول في الماشية" . فرونتيرز إن جينيتكس . 6 : 271. doi : 10.3389/fgene.2015.00271 . PMC 4547532. PMID 26379699 .  
  72. ↑ هيروسي واي، إيكيدا كيه تي، نورو إي، هيراوكا كيه، توميتا إم، كاناي إيه (يوليو 2015). " التحديد الدقيق وديناميكيات أجزاء الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRFs) في نمو تريوبس كانكريفورميس (روبيان الشرغوف)" . بي إم سي جينيتكس . 16 83. doi : 10.1186/s12863-015-0245-5 . PMC 4501094. PMID 26168920 .  
  73. ↑ كارايسكوس إس، نقفي إيه إس، سوانسون كيه إي، غريغورييف إيه (سبتمبر 2015). "تعديل شظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA ) المرتبطة بالعمر في ذبابة الفاكهة وأهدافها المحتملة" . بيولوجي دايركت . 10 51. doi : 10.1186/s13062-015-0081-6 . PMC 4572633. PMID 26374501 .  
  74. ↑ بلياتسيكا ف، لوهر ب، تيلونيس أ.ج، ريغوتسوس إ (أغسطس 2016). "MINTbase: إطار عمل للاستكشاف التفاعلي لشظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا والنواة" . المعلوماتية الحيوية . 32 (16): 2481-2489 . doi : 10.1093/bioinformatics/btw194 . PMC 4978933. PMID 27153631 .  
  75. ↑ بلياتسيكا ف، لوهر ب، ماجي ر، تيلونيس أ.ج، لوندين إ، شيغيماتسو م، كيرينو ي، ريغوتسوس إ (يناير 2018). "MINTbase v2.0: قاعدة بيانات شاملة لشظايا الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) تتضمن شظايا نووية وميتوكوندرية من جميع مشاريع أطلس جينوم السرطان" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 46(D1) (D1): D152– D159. doi : 10.1093/nar/gkx1075 . PMC 5753276. PMID 29186503 .  
  76. ↑ كومار ب، مودونوري إس بي، أنايا ج، دوتا أ (يناير 2015). "tRFdb: قاعدة بيانات لقطع الحمض النووي الريبوزي الناقل" . أبحاث الأحماض النووية . 43 (عدد قواعد البيانات): D141-5. doi : 10.1093/nar/gku1138 . PMC 4383946. PMID 25392422 .  
  77. ↑ فارشني، يو؛ راجبانداري، يو إل (فبراير 1990). "بدء تخليق البروتين من كودون إنهاء" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 87 (4): 1586-1590 . Bibcode : 1990PNAS...87.1586V . doi : 10.1073 / pnas.87.4.1586 . PMC 53520. PMID 2406724 .  
  78. ↑ فارشني، يو؛ لي، سي بي؛ راجبانداري، يو إل (15 مارس 1993). "من الحمض النووي الريبوزي الناقل المُطيل إلى الحمض النووي الريبوزي الناقل المُبادر" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 90 (6): 2305-2309 . رمز Bibcode : 1993PNAS...90.2305V . doi : 10.1073/pnas.90.6.2305 . PMC 46075. PMID 8460138 .  
  79. ↑ جوفيندان أ، ميريالا س، موندال س، فارشني يو (نوفمبر 2018). "تطوير أنظمة فحص لفك شفرة كودون العنبر في مراحل البدء والاستطالة في المتفطرات" . مجلة علم البكتيريا . 200 (22). doi : 10.1128/jb.00372-18 . PMC 6199473. PMID 30181124 .  
  80. ↑ فينسنت آر إم، رايت بي دبليو، ياشكي بي آر (أبريل 2019). "قياس تعامد الحمض النووي الريبوزي الناقل البادئ Amber في كائن حي مُعاد ترميزه جينوميًا". مجلة ACS للبيولوجيا التركيبية . 8 (4): 675-685 . doi : 10.1021/acssynbio.9b00021 . PMID 30856316. S2CID 75136654 .  
  81. ↑ وايت، آر. جيه. (مارس 1997). "تنظيم بوليميراز الحمض النووي الريبي الأول والثالث بواسطة بروتين الورم الأرومي الشبكي: آلية للتحكم في النمو؟". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 22 (3): 77-80 . doi : 10.1016/S0968-0004(96)10067-0 . PMID 9066256 . 
  82. ↑ شارب إس، دينجرمان تي، سول دي (سبتمبر 1982). "الحد الأدنى من التسلسلات الجينية اللازمة لتحفيز نسخ جين الحمض النووي الريبوزي الناقل في حقيقيات النوى" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 10 (18): 5393-5406 . doi : 10.1093/nar/10.18.5393 . PMC 320884. PMID 6924209 .  
  83. 1 2 ديسي جي، فيورينو جي، كاستلنوفو إم، تيشمان إم، باجانو إيه (ديسمبر 2007). “نسخة بوليميريز RNA المتوسعة III”. الاتجاهات في علم الوراثة . 23 (12): 614-622 . دوى : 10.1016/j.tig.2007.09.001 . اتش دي ال : 11381/1706964 . بميد 17977614 . 
  84. ↑ توكيني-فالنتيني جي دي، فروسكولوني بي، توكيني-فالنتيني جي بي (ديسمبر 2009). "معالجة الحمض النووي الريبوزي الناقل الأولي المحتوي على إنترونات متعددة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (48): 20246-20251 . Bibcode : 2009PNAS..10620246T . doi : 10.1073/pnas.0911658106 . PMC 2787110. PMID 19910528 .  
  85. ↑ أبيلسون ج، تروتا سي آر، لي إتش (مايو 1998). "تضفير الحمض النووي الريبوزي الناقل" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 273 (21): 12685-12688 . doi : 10.1074/jbc.273.21.12685 . PMID 9582290 . 
  86. 1 2 سوما أ (2014). " جينات الحمض النووي الريبوزي الناقل ذات الترتيب الدائري: تعبيرها وآثارها على أهميتها الفسيولوجية وتطورها" . مجلة فرونتيرز إن جينيتكس . 5 : 63. doi : 10.3389/fgene.2014.00063 . PMC 3978253. PMID 24744771 .  
  87. ↑ فرانك دي إن، بيس إن آر (1998). "ريبونيوكلياز P: الوحدة والتنوع في ريبوزيم معالجة الحمض النووي الريبوزي الناقل" . المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 67 (1): 153-180 . doi : 10.1146/annurev.biochem.67.1.153 . PMID 9759486 . 
  88. ↑ سيبايوس م، فيوك أ (2007). "tRNase Z". رسائل البروتين والببتيد . 14 (2): 137-145 . doi : 10.2174/092986607779816050 . PMID 17305600 . 
  89. ↑ راندو إل، شرودر آي، سول دي (مايو 2008). "الحياة بدون إنزيم RNase P". مجلة نيتشر . 453 (7191): 120-123 . Bibcode : 2008Natur.453..120R . doi : 10.1038/nature06833 . PMID 18451863. S2CID 3103527 .  
  90. ↑ واينر، أ.م. (أكتوبر 2004). "نضج الحمض النووي الريبوزي الناقل: بلمرة الحمض النووي الريبوزي بدون قالب من الحمض النووي" . علم الأحياء الحالي . 14 (20): R883-5. رمز Bibcode : 2004CBio...14.R883W . doi : 10.1016/j.cub.2004.09.069 . PMID 15498478 . 
  91. ↑ كوتاي يو، ليبوفسكي جي، إيزورالدي إي، بيشوف إف آر، شوارزماير بي، هارتمان إي، غورليش دي (فبراير 1998). "تحديد مستقبل تصدير نووي خاص بـ tRNA" . الخلية الجزيئية . 1 (3): 359-369 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80036-2 . PMID 9660920 . 
  92. ↑ آرتس جي جي، فورنيرود إم، ماتاج آي دبليو (مارس 1998). "تحديد مستقبل تصدير نووي لـ tRNA" . علم الأحياء الحالي . 8 (6): 305-314 . Bibcode : 1998CBio....8..305A . doi : 10.1016/ S0960-9822 (98)70130-7 . PMID 9512417. S2CID 17803674 .  
  93. ↑ آرتس جي جي، كويرستن إس، رومبي بي، إهريسمان بي، ماتاج آي دبليو (ديسمبر 1998). "دور بروتين إكسبورتين-تي في التصدير النووي الانتقائي لجزيئات الحمض النووي الريبوزي الناقل الناضجة" . مجلة EMBO . 17 (24): 7430-7441 . doi : 10.1093/ emboj /17.24.7430 . PMC 1171087. PMID 9857198 .  
  94. ↑ يوشيهيسا تي، يونوكي-إساكي ك، أوشيما سي، تاناكا إن، إندو تي (أغسطس 2003). "إمكانية ربط الحمض النووي الريبوزي الناقل الأولي في السيتوبلازم: يتمركز إنزيم ربط الحمض النووي الريبوزي الناقل في الخميرة بشكل رئيسي في الميتوكوندريا" . علم الأحياء الجزيئي للخلية . 14 (8): 3266-3279 . doi : 10.1091/mbc.E02-11-0757 . PMC 181566. PMID 12925762 .  
  95. ↑ زاميكنيك، بول تشارلز. "تأثير زيادة تركيزات الأدينوسين ثلاثي الفوسفات على دمج C14-ATP في الحمض النووي الريبي لجزء الأس الهيدروجيني 5" . collections.countway.harvard.edu . تاريخ الاسترجاع: 28 فبراير 2024 .
  96. ↑ كريسج، نيكول؛ سيموني، روبرت د.؛ هيل، روبرت ل. (7 أكتوبر 2005). "اكتشاف الحمض النووي الريبوزي الناقل بواسطة بول سي. زاميكنيك" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 280 (40): e37– e39. doi : 10.1016/S0021-9258(20)79029-0 .
  97. ↑ هوغلاند، ماهلون ب. (1959). "الأحماض النووية والبروتينات". مجلة ساينتفك أمريكان . 201 (6): 55-61 . Bibcode : 1959SciAm.201f..55H . doi : 10.1038/scientificamerican1259-55 . ISSN 0036-8733 . JSTOR 24941182. PMID 14402122 .   
  98. ↑ كلارك ، ب. ف. (أكتوبر 2006). "البنية البلورية للحمض النووي الريبوزي الناقل" (ملف PDF) . مجلة العلوم البيولوجية . 31 (4): 453-457 . doi : 10.1007/BF02705184 . PMID 17206065. S2CID 19558731 .  
  99. ↑ هولي، ر. و.، أبغار ، ج.، إيفريت، ج. أ.، ماديسون، ج. ت.، ماركيزي، م.، ميريل، ش. هـ.، بينسويك، ج. ر.، زامير، أ. (مارس 1965). "بنية الحمض النووي الريبي". مجلة ساينس . 147 (3664): 1462-1465 . رمز Bibcode : 1965Sci...147.1462H . doi : 10.1126/science.147.3664.1462 . PMID 14263761. S2CID 40989800 .  
  100. ↑ "نعي" . صحيفة نيويورك تايمز . 4 يوليو 1991.
  101. ↑ «جائزة نوبل في الطب أو علم وظائف الأعضاء لعام 1968: روبرت دبليو هولي - حقائق» . مؤسسة نوبل للتوعية. 2022. تم الاطلاع عليه بتاريخ 18 مارس 2022 .
  102. ↑ لادنر، جيه إي، جاك، أ، روبرتس، جيه دي، براون، آر إس، رودس، دي، كلارك، بي إف، كلوج، أ (نوفمبر 1975). "بنية الحمض النووي الريبوزي الناقل للفينيل ألانين في الخميرة بدقة 2.5 أنغستروم" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 72 (11): 4414-4418 . Bibcode : 1975PNAS...72.4414L . doi : 10.1073/pnas.72.11.4414 . PMC 388732. PMID 1105583 .  
  103. ↑ كيم إس إتش، كويجلي جي جي، سوداث إف إل، ماكفرسون إيه، سنيدن دي، كيم جي جي، واينزيرل جي، ريتش إيه (يناير 1973). "البنية ثلاثية الأبعاد لحمض فينيل ألانين الناقل في الخميرة: طي سلسلة عديد النوكليوتيدات". مجلة ساينس . 179 (4070): 285-288 . Bibcode : 1973Sci...179..285K . doi : 10.1126/science.179.4070.285 . PMID 4566654. S2CID 28916938 .  
  104. ↑ Zhang R، Noordam L، Ou X، Ma B، Li Y، Das P، Shi S، Liu J، Wang L، Li P، Verstegen MM، Reddy DS، van der Laan LJ، Peppelenbosch MP، Kwekkeboom J، Smits R، Pan Q (يناير 2021). "العملية البيولوجية لشحن اللايسين-الحمض الريبي النووي النقال قابلة للاستهداف علاجيًا في سرطان الكبد" . كثافة العمليات في الكبد . 41 (1): 206-219 . دوى : 10.1111/liv.14692 . بمك 7820958 . بميد 33084231 .  
  105. ↑ أو إكس، ما بي، تشانغ آر، مياو زد، تشنغ إيه، بيبيلنبوش إم بي، بان كيو (يونيو 2020). "طريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي المبسطة للكشف عن إعادة تشكيل الحمض النووي الريبوزي الناقل عند الإصابة بفيروس التهاب الكبد الوبائي إي من النمط الجيني 3" . رسائل FEBS . 594 (12): 2005-2015 . doi : 10.1002/1873-3468.13764 . hdl : 1765/126038 . PMID 32133647 .