انتقال العدوى بين الأنواع

📅 آخر تحديث: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

انتقال العدوى بين الأنواع ( CST )، ويُسمى أيضًا انتقال العدوى بين الأنواع ، أو انتقال العدوى بين العوائل ، أو الانتشار ، هو انتقال مسبب مرض مُعدٍ ، مثل الفيروس ، بين عوائل تنتمي إلى أنواع مختلفة . بمجرد دخوله إلى فرد من نوع عائل جديد، قد يُسبب مسبب المرض المرض لهذا العائل الجديد و/أو يكتسب القدرة على إصابة أفراد آخرين من نفس النوع، مما يسمح له بالانتشار في مجتمع العائل الجديد. [ 1 ] تُدرس هذه الظاهرة بشكل شائع في علم الفيروسات ، ولكن قد يحدث انتقال العدوى بين الأنواع أيضًا مع مسببات الأمراض البكتيرية أو أنواع أخرى من الكائنات الحية الدقيقة. [ 2 ]

تشمل خطوات انتقال مسببات الأمراض إلى عوائل جديدة ما يلي : التلامس بين العامل الممرض والعائل؛ إصابة فردٍ ما بنجاح، مما قد يؤدي إلى تكاثر المرض وانتشاره ؛ وتكيف العامل الممرض، سواء داخل العائل الأصلي أو الجديد، مما قد يجعله قادرًا على الانتشار بكفاءة بين أفراد مجتمعات العائل الجديد. [ 3 ] يُعد هذا المفهوم مهمًا لفهم الأمراض المعدية الناشئة لدى البشر والسيطرة عليها، لا سيما تلك التي تسببها الفيروسات. معظم الأمراض الفيروسية التي تصيب البشر حيوانية المنشأ، إذ انتقلت تاريخيًا إلى البشر من أنواع حيوانية مختلفة؛ ومن الأمثلة على ذلك: السارس ، والإيبولا ، وإنفلونزا الخنازير ، وداء الكلب ، وإنفلونزا الطيور . [ 4 ]

تختلف الآليات الدقيقة التي تُسهّل انتقال العدوى بين الأنواع باختلاف المُمْرِض، وحتى بالنسبة للأمراض الشائعة، غالبًا ما تكون غير مفهومة جيدًا. يُعتقد أن الفيروسات ذات معدلات الطفرات العالية قادرة على التكيف بسرعة مع عوائل جديدة، وبالتالي التغلب على الدفاعات المناعية الخاصة بكل عائل ، مما يسمح باستمرار انتقالها. يحدث انتقال العائل عندما تبدأ سلالة كانت سابقًا حيوانية المنشأ في الانتشار حصريًا بين أنواع العوائل الجديدة. [ 5 ]

يُرجّح انتقال مسببات الأمراض بين الأنواع التي تتلامس بشكل متكرر. كما يمكن أن يحدث بشكل غير مباشر بين الأنواع التي تتلامس بشكل أقل تكرارًا إذا ما تم تسهيل ذلك بواسطة نوع وسيط؛ على سبيل المثال، قد ينقل نوعٌ خازن الفيروس إلى نوع ناقل ، والذي بدوره ينقل الفيروس إلى البشر. [ 6 ] [ 7 ]

تؤثر درجة القرابة التطورية بين أنواع العوائل أيضًا على احتمالية انتقال العامل الممرض بينها، ويرجع ذلك على الأرجح إلى تشابه دفاعات المناعة لدى العوائل. فعلى سبيل المثال، تأتي معظم حالات انتقال الأمراض الحيوانية المنشأ بين البشر من أنواع أخرى من الثدييات، التي تنتمي إلى نفس الفئة التصنيفية . ومع ذلك، لوحظ انتقال العدوى بين الأنواع من الروبيان الأبيض ، وهو ينتمي إلى شعبة مختلفة تمامًا: مفصليات الأرجل مقابل الحبليات . (قد لا تكون مسببات الأمراض من الأنواع الأبعد قرابة، مثل الفيروسات النباتية ، قادرة على إصابة البشر على الإطلاق).

تشمل العوامل الأخرى المؤثرة على معدلات انتقال العدوى، على سبيل المثال لا الحصر، التقارب الجغرافي وسلوكيات أفراد النوع الواحد. [ 3 ] ونظرًا لتغير المناخ وفقدان الموائل بسبب توسع استخدام الأراضي، [ 8 ] فمن المتوقع أن يزداد خطر انتقال العدوى الفيروسية بشكل ملحوظ. [ 9 ]

الانتشار والسيطرة

يُعدّ انتقال العدوى بين الأنواع السبب الأهم لظهور الأمراض لدى البشر والكائنات الحية الأخرى. كما تُشكّل الأمراض الحيوانية المنشأ التي تصيب الحيوانات البرية ، والناجمة عن الميكروبات، المجموعة الأكثر شيوعًا من الأمراض الناشئة لدى البشر، ويُخلّف انتقال العدوى بين الحيوانات البرية والماشية آثارًا اقتصادية ملموسة في الزراعة، إذ يُقلّل من إنتاجية الماشية ويفرض قيودًا على التصدير. [ 2 ] وهذا ما يجعل انتقال العدوى بين الأنواع مصدر قلق بالغ للصحة العامة والزراعة وإدارة الحياة البرية .

يؤكد مؤلفو دراسة حول الطاعون الدبلي في وهران أن المرض "هو في الأساس مرض بكتيري حيواني المنشأ يصيب القوارض . تسببه بكتيريا يرسينيا الطاعونية ، وينتقل من حيوان إلى آخر عن طريق البراغيث . عادةً ما يُصاب البشر بالعدوى من خلال لدغة برغوث قارض مصاب " . وكانت إجراءات المكافحة الصحية التي اتخذتها سلطة الصحة العامة كيميائية بطبيعتها: "تم رش المنازل ومحيطها بمادة البيرميثرين . كما تم رش الدلتا مثرين على مسارات القوارض وحول جحورها في دائرة نصف قطرها 10 كيلومترات حول مساكن المرضى. ومُنع قتل الفئران بشكل عشوائي". [ 10 ]

يُعتقد أن نسبة كبيرة من مسببات الأمراض الفيروسية التي ظهرت مؤخرًا لدى البشر نشأت من أنواع حيوانية مختلفة. ويتضح ذلك من خلال العديد من الأوبئة الحديثة، مثل إنفلونزا الطيور ، والإيبولا ، وجدري القرود ، وفيروس هانتا . [ 11 ] وتشير الأدلة إلى إمكانية عودة بعض الأمراض إلى البشر عبر الحيوانات بعد القضاء عليها. [ 12 ] ويُعدّ هذا الأمر واردًا مع فيروسات الحصبة، نظرًا لقدرتها على عبور الحواجز بين الأنواع بسهولة. [ 12 ] كما يمكن أن يكون لانتقال العدوى بين الأنواع تأثير كبير على الصناعات الغذائية. فالنمط الجيني السادس - فيروس باراميكسو الطيور من النمط المصلي 1 (GVI-PMV1) هو فيروس نشأ من خلال انتقال العدوى بين الأنواع من الدجاجيات إلى الحماميات ، وأصبح منتشرًا في صناعة الدواجن . [ 13 ]

يُعدّ انتقال سلالات فيروس داء الكلب بين العديد من أنواع الحيوانات المختلفة مصدر قلق بالغ في إدارة الحياة البرية . ويؤدي دخول هذه السلالات إلى الحيوانات غير الحاملة للفيروس إلى زيادة خطر تعرض الإنسان له، ويهدد التقدم المحرز حالياً في مكافحة داء الكلب. [ 14 ]

يُعتقد أن العديد من مسببات الأمراض تتخصص في عوائل محددة، مما يفسر استمرار وجود سلالات متميزة في أنواع العوائل. [ 5 ] يتعين على مسببات الأمراض التغلب على تخصصها في العائل للانتقال إلى نوع عائل جديد. وقد أشارت بعض الدراسات إلى أن التخصص في العائل قد يكون مبالغًا فيه، وأن مسببات الأمراض أكثر عرضة لإظهار التخصص في العائل مما كان يُعتقد سابقًا. [ 5 ] عادةً ما تكون معدلات الوفيات منخفضة لدى العوائل الأصلية عند إصابتها بمسبب المرض، بينما تميل معدلات الوفيات إلى أن تكون أعلى بكثير لدى العوائل الجديدة. [ 15 ]

بين الرئيسيات غير البشرية والبشر

نظراً للعلاقة الوثيقة بين الرئيسيات غير البشرية والبشر ، فإن انتقال الأمراض بينهما شائع نسبياً، وقد يُصبح مصدر قلق بالغ للصحة العامة. وقد ارتبطت أمراض مثل فيروس نقص المناعة البشرية والفيروسات الغدية البشرية بتفاعلات الرئيسيات غير البشرية. [ 16 ] [ 17 ]

في المناطق التي يكثر فيها التلامس بين البشر والقرود غير البشرية، تُتخذ الاحتياطات اللازمة لمنع انتقال الأمراض. يُعد فيروس الرغوة القردي (SFV) فيروسًا قهقريًا متوطنًا يتميز بمعدلات انتقال عالية بين الأنواع، وقد ثبتت إصابته للبشر عند تعرضهم لعضات من قرود غير بشرية مصابة. [ 18 ] وقد أثار هذا الفيروس مخاوف صحية في أماكن مثل إندونيسيا، حيث يمكن لزوار معابد القرود أن يُصابوا بفيروس الرغوة القردي من قرود المكاك ( Macaca fascicularis ) الموجودة في المعابد. [ 19 ] أما فيروس TMAdV ( فيروس غدي قرود تيتي ) فهو فيروس شديد التباين، إذ يتشارك في أقل من 57% من تطابق النيوكليوتيدات مع فيروسات غدية أخرى، وهو فيروس يصيب القرود غير البشرية، وله معدل وفيات مرتفع (83%) بين القرود، وقادر على الانتشار بين البشر. [ 15 ]

التنبؤ بانتقال العدوى بين الأنواع ومنعه

يُعدّ التنبؤ والرصد من الأمور بالغة الأهمية لدراسة انتقال الأمراض بين الأنواع وتأثيراتها. مع ذلك، لا تزال العوامل التي تحدد منشأ ومصير أحداث انتقال الأمراض بين الأنواع غير واضحة بالنسبة لمعظم مسببات الأمراض البشرية. [ 4 ] وقد أدى ذلك إلى استخدام نماذج إحصائية مختلفة لتحليل انتقال الأمراض بين الأنواع. تشمل بعض هذه النماذج نماذج تحليل المخاطر، [ 20 ] ونماذج تحديد الطرف المؤرخ بمعدل واحد، [ 17 ] ونماذج الانتشار الوراثي. [ 4 ] تُعدّ دراسة جينومات مسببات الأمراض المتورطة في أحداث انتقال الأمراض بين الأنواع مفيدة للغاية في تحديد منشأها ومصيرها. [ 4 ] وذلك لأن التنوع الجيني ومعدل الطفرات لمسببات الأمراض يُعدّان من العوامل الرئيسية في تحديد قدرتها على الانتقال عبر عوائل متعددة. وهذا ما يجعل من المهم إجراء تسلسل جزئي أو كامل لجينومات الأنواع الناقلة. [ 15 ] قد يؤدي تغيير في البنية الجينومية إلى جعل مسبب المرض ذي النطاق العائلي الضيق قادرًا على استغلال نطاق عائلي أوسع. [ 5 ] كما أن المسافة الجينية بين الأنواع المختلفة، والنطاق الجغرافي، وعوائق التفاعل الأخرى ستؤثر أيضًا على انتقال العدوى بين الأنواع. [ 4 ]

يتمثل أحد مناهج تحليل تقييم مخاطر انتقال الأمراض بين الأنواع في تطوير نماذج تحليل المخاطر التي تُقسّم "عملية" انتقال المرض إلى أجزاء. ويتم وصف العمليات والتفاعلات التي قد تؤدي إلى انتقال المرض بين الأنواع بشكل صريح كسلسلة عدوى افتراضية. وتُستخدم البيانات المستقاة من التجارب المخبرية والميدانية لتقدير احتمالية كل مكون، والتغير الطبيعي المتوقع، وهوامش الخطأ. [ 19 ]

تتطلب أنواع مختلفة من أبحاث علم الفيروسات الخلوية مسارات تحليلية مختلفة لتلبية احتياجاتها. استخدمت دراسة لتحديد الفيروسات في الخفافيش التي يمكن أن تنتقل إلى الثدييات الأخرى سير العمل التالي: تسلسل العينات الجينومية ← "تنظيف" القراءات الأولية ← إزالة قراءات المضيف والملوثات حقيقية النواة ← التجميع من الصفر للقراءات المتبقية ← شرح القطع الفيروسية ← الكشف الجزيئي عن فيروسات محددة ← التحليل التطوري ← تفسير البيانات. [ 21 ]

يُعدّ الكشف عن انتقال العدوى بين الأنواع وتقدير معدل انتشارها بناءً على بيانات الانتشار أمرًا صعبًا. [ 2 ] ونظرًا لهذه الصعوبات، تُستخدم الأساليب الحسابية لتحليل حالات انتقال العدوى بين الأنواع ومسببات الأمراض المرتبطة بها. وقد أتاح التطور الهائل للتقنيات الجزيئية إمكانيات جديدة لاستخدام التحليل الوراثي للسلالات المرضية لاستنتاج المعايير الوبائية . [ 2 ] وهذا يُقدّم بعض الفهم لأصول هذه الحالات وكيفية معالجتها. وتعتمد طرق الوقاية من انتقال العدوى بين الأنواع حاليًا على البيانات البيولوجية والحسابية. ومن الأمثلة على ذلك استخدام كلٍّ من التحليلات الخلوية والمقارنات الوراثية لدعم دور TRIM5α، وهو نتاج جين TRIM5، في كبح انتقال العدوى بين الأنواع وظهور الفيروسات القهقرية في الطبيعة. [ 22 ]

تحليل

نسالة

تُعدّ مقارنة البيانات الجينومية بالغة الأهمية لدراسة انتقال العدوى بين الأنواع. يُستخدم التحليل التطوري لمقارنة التباين الجيني في كلٍّ من مسببات الأمراض المرتبطة بانتقال العدوى بين الأنواع، والأنواع المضيفة التي تُصيبها. ومن خلال الجمع بين هذه المعلومات، يُمكن استنتاج العوامل التي سمحت لمسبب المرض بالانتقال إلى مضيف جديد (مثل الطفرة في مسبب المرض، أو تغير قابلية المضيف للإصابة)، وكيفية منع ذلك في المستقبل. إذا كانت الآليات التي يستخدمها مسبب المرض للدخول إلى نوع جديد مفهومة جيدًا، يُمكن تحقيق مستوى معين من السيطرة على المخاطر والوقاية. في المقابل، يُصعّب ضعف فهم مسببات الأمراض والأمراض المرتبطة بها اتخاذ التدابير الوقائية [ 20 ].

قد تلعب العوائل البديلة دورًا حاسمًا في تطور وانتشار العامل الممرض. [ 23 ] فعندما ينتقل العامل الممرض بين الأنواع، غالبًا ما يكتسب خصائص جديدة تمكنه من اختراق حواجز العائل. [ 20 ] وقد يكون لأنواع مختلفة من العامل الممرض تأثيرات متباينة للغاية على أنواع العائل. [ 23 ] لذا، قد يكون من المفيد لتحليل CST مقارنة نفس العوامل الممرضة الموجودة في أنواع مختلفة من العوائل. ويمكن استخدام التحليل التطوري لتتبع تاريخ العامل الممرض عبر تجمعات الأنواع المختلفة. حتى لو كان العامل الممرض جديدًا ومتباينًا للغاية، فإن المقارنة التطورية قد تكون مفيدة جدًا. [ 15 ] وتجمع إحدى الاستراتيجيات المفيدة لدراسة تاريخ الأوبئة الناجمة عن انتقال العامل الممرض بين تحليل الساعة الجزيئية ، لتقدير النطاق الزمني للوباء، ونظرية الاندماج ، لاستنتاج التاريخ الديموغرافي للعامل الممرض. [ 17 ] وغالبًا ما تُستخدم قواعد البيانات والأدوات الحاسوبية عند بناء الأشجار التطورية. تُستخدم برامج مثل BLAST لشرح تسلسلات مسببات الأمراض، بينما توفر قواعد البيانات مثل GenBank معلومات حول الوظائف بناءً على البنية الجينومية لهذه المسببات. تُبنى الأشجار باستخدام أساليب حسابية مثل MPR أو الاستدلال البايزي، وتُصمم النماذج وفقًا لاحتياجات الدراسة. [ 24 ] على سبيل المثال، تسمح نماذج الطرف المؤرخ بمعدل واحد (SRDT) بتقدير النطاق الزمني ضمن شجرة التطور. [ 17 ] تختلف نماذج التنبؤ بـ CST تبعًا للمعايير التي يجب مراعاتها عند بناء النموذج.

إعادة البناء الأكثر اقتصادًا (MPR)

مبدأ الاقتصاد هو اختيار أبسط تفسير علمي يتوافق مع الأدلة. عند بناء الأشجار التطورية، تُعتبر الفرضية الأفضل هي تلك التي تتطلب أقل عدد من التغيرات التطورية. يُعد استخدام مبدأ الاقتصاد لإعادة بناء خصائص الأسلاف على الشجرة التطورية طريقةً لاختبار الفرضيات البيئية والتطورية . [ 25 ] يمكن استخدام هذه الطريقة في دراسات الأمراض المنقولة بالخلايا لتقدير عدد التغيرات في الخصائص بين مسببات الأمراض وعلاقتها بمضيفيها. [ 2 ] وهذا ما يجعل تحليل الانحدار متعدد المتغيرات مفيدًا لتتبع مسببات الأمراض المنقولة بالخلايا إلى أصولها. كما يمكن استخدام تحليل الانحدار متعدد المتغيرات لمقارنة سمات تجمعات الأنواع المضيفة. قد تجعل السمات والسلوكيات داخل التجمع السكاني هذه الأنواع أكثر عرضةً للأمراض المنقولة بالخلايا. على سبيل المثال، تُعد الأنواع التي تهاجر إقليميًا مهمةً لنشر الفيروسات عبر الشبكات السكانية. [ 26 ]

على الرغم من نجاح عمليات إعادة البناء القائمة على مبدأ الاقتصاد، تشير الأبحاث إلى أنها غالبًا ما تكون حساسة وقد تكون عرضة للتحيز في النماذج المعقدة. [ 25 ] وهذا قد يُسبب مشاكل لنماذج نظرية الأنظمة المعقدة التي يتعين عليها مراعاة العديد من المتغيرات. وقد طُوّرت طرق بديلة، مثل طريقة الاحتمال الأقصى، كبديل لإعادة البناء القائمة على مبدأ الاقتصاد. [ 25 ]

استخدام المؤشرات الجينية

لقد كان لطريقتين لقياس التباين الجيني، وهما التكرارات المترادفة ذات العدد المتغير (VNTRs) وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs)، فائدة كبيرة في دراسة انتقال البكتيريا. [ 2 ] تُعدّ التكرارات المترادفة ذات العدد المتغير من النوكليوتيدات المفردة (VNTRs)، نظرًا لانخفاض تكلفتها وارتفاع معدلات طفراتها، مفيدة بشكل خاص في الكشف عن الاختلافات الجينية في حالات التفشي الحديثة . وبينما تتميز تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بمعدل طفرة أقل لكل موقع جيني مقارنةً بالتكرارات المترادفة ذات العدد المتغير من النوكليوتيدات المفردة (VNTRs)، فإنها توفر علاقات جينية أكثر استقرارًا وموثوقية بين العزلات. تُستخدم كلتا الطريقتين لبناء الأشجار التطورية للتحليل الجيني، إلا أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) أكثر ملاءمة لدراسات انكماش الأشجار التطورية. [ 2 ] ومع ذلك، قد يكون من الصعب على هاتين الطريقتين محاكاة انقلابات أنماط التكاثر الخلوي (CSTs) بدقة. إذ يمكن أن تكون تقديرات أنماط التكاثر الخلوي (CSTs) المستندة إلى الأشجار التطورية التي تم إنشاؤها باستخدام علامة التكرارات المترادفة ذات العدد المتغير من النوكليوتيدات المفردة (VNTRs) متحيزة نحو الكشف عن أحداث أنماط التكاثر الخلوي (CSTs) عبر نطاق واسع من المعايير. تميل المتغيرات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) إلى أن تكون أقل تحيزًا وتغيرًا في تقديرات معدل التغير الحرج (CST) عندما تكون تقديرات معدلات التغير الحرج منخفضة ويتم استخدام عدد قليل من المتغيرات النوكليوتيدية المفردة. بشكل عام، تكون تقديرات معدل التغير الحرج باستخدام هذه الطرق أكثر موثوقية في الأنظمة التي تحتوي على المزيد من الطفرات، والمزيد من المؤشرات، واختلافات جينية عالية بين السلالات المُدخلة. [ 2 ] يُعد التغير الحرج معقدًا للغاية، وتحتاج النماذج إلى مراعاة العديد من المعلمات لتمثيل الظاهرة بدقة. يمكن أن تؤدي النماذج التي تُبسط الواقع بشكل مفرط إلى بيانات متحيزة. يمكن أن تجعل معلمات متعددة، مثل عدد الطفرات المتراكمة منذ الإدخال، والعشوائية ، والاختلاف الجيني للسلالات المُدخلة، وجهد أخذ العينات، من الصعب الحصول على تقديرات غير متحيزة للتغير الحرج حتى مع تسلسلات الجينوم الكامل، خاصةً إذا كان أخذ العينات محدودًا، أو كانت معدلات الطفرات منخفضة، أو إذا تم إدخال مسببات الأمراض مؤخرًا. [ 2 ]

يجب أن تراعي عملية استخدام المؤشرات الجينية لتقدير معدلات الطفرات الكيميائية والبيولوجية عدة عوامل مهمة للحد من التحيز. أولها أن الشجرة التطورية المُنشأة في التحليل يجب أن تُجسد العملية الوبائية الكامنة وراء تكوينها. [ 2 ] يجب أن تُراعي النماذج كيفية تأثير التباين الجيني لمسبب المرض على المرض في النوع، وليس فقط الاختلافات العامة في البنية الجينومية. ثانيًا، ستعتمد قوة التحليل على مقدار الطفرات المتراكمة منذ دخول مسبب المرض إلى النظام. [ 2 ] ويرجع ذلك إلى أن العديد من النماذج تستخدم عدد الطفرات كمؤشر على تواتر الطفرات الكيميائية والبيولوجية. لذلك، تُركز الجهود على تقدير إما الوقت منذ دخول المؤشر أو معدل استبداله (من التجارب المخبرية أو التحليل المقارن الجينومي). وهذا مهم ليس فقط عند استخدام طريقة MPR، ولكن أيضًا لأساليب الاحتمالية التي تتطلب تقدير معدل الطفرات. [ 2 ] ثالثًا، سيؤثر CST أيضًا على انتشار المرض في المضيف المحتمل، لذا فإن الجمع بين بيانات السلاسل الزمنية الوبائية والبيانات الجينية قد يكون نهجًا ممتازًا لدراسة CST [ 2 ].

التحليل البايزي

تُعدّ الأطر البايزية شكلاً من أشكال التحليلات القائمة على أقصى احتمال، ويمكن أن تكون فعّالة للغاية في دراسات انتقال الصفات بين الأنواع. يُمكن للاستدلال البايزي لأساليب تطور الصفات أن يأخذ في الحسبان عدم اليقين في شجرة التطور الوراثي، والسيناريوهات الأكثر تعقيدًا، مع نماذج مثل نموذج انتشار الصفات قيد التطوير حاليًا لدراسة انتقال الصفات بين الأنواع في فيروسات الحمض النووي الريبي . [ 2 ] يُقدّم النهج الإحصائي البايزي مزايا على التحليلات الأخرى لتتبّع أصول انتقال الصفات بين الأنواع. تسمح التقنيات الحسابية بالتكامل عبر شجرة تطور وراثي غير معروفة، والتي لا يُمكن ملاحظتها مباشرةً، وعملية هجرة غير معروفة، والتي عادةً ما تكون غير مفهومة جيدًا. [ 27 ]

تُعدّ الأطر البايزية مناسبةً أيضًا لدمج أنواع مختلفة من المعلومات. ويُجسّد برنامج BEAST، الذي يُركّز بشدة على علم الوراثة العرقي وعلم الأنساب المُعاير، هذا الأمر من خلال توفير عدد كبير من النماذج التطورية التكميلية، بما في ذلك نماذج الاستبدال، والنماذج الديموغرافية، ونماذج الساعة المرنة، والتي يُمكن دمجها في نموذج احتمالي كامل. وبإضافة إعادة البناء المكاني، تُنشئ هذه النماذج احتمالية إعادة بناء التاريخ الجغرافي الحيوي من البيانات الجينية. [ 27 ] قد يكون هذا مفيدًا لتحديد أصول انتقال العدوى بين الأنواع. وقد جعلت الفعالية العالية للأساليب الإحصائية البايزية منها أداةً أساسيةً في الدراسات التطورية. [ 28 ] يُمكن استخدام إعادة بناء المضيف السلفي البايزي في ظل نماذج الانتشار المنفصل لاستنتاج أصل وتأثيرات مسببات الأمراض المرتبطة بمتلازمة انتقال العدوى بين الأنواع. وقد دعمت إحدى الدراسات التي أُجريت على الفيروسات الغدية البشرية باستخدام الأساليب البايزية أصلًا للأنواع الفيروسية من الغوريلا والشمبانزي ، مما يُساعد في جهود الوقاية. [ 16 ] على الرغم من ندرة الاتصال المباشر المفترض بين مجموعات النوعين المتواجدة في نفس المنطقة، إلا أن أحداث انتقال العدوى عبر الجلد (CST) قد تحدث بينهما. وقد حددت الدراسة أيضًا حدوث حالتي انتقال مستقلتين لفيروس HAdV-B إلى البشر، وأن فيروسات HAdV-B المنتشرة بين البشر ذات أصل حيواني المنشأ، وربما أثرت على الصحة العالمية طوال معظم تاريخ جنسنا البشري. [ 16 ]

تُستخدم نماذج الانتشار التطوري بكثرة في التحليلات الجغرافية التطورية، مع تزايد الاهتمام باستنتاج انتقال الفيروس بين العوائل. [ 4 ] يُمكّن أسلوب الاستدلال البايزي من حساب متوسط ​​النماذج لعدة مُتنبئات محتملة للانتشار، ويُقدّر دعم ومساهمة كل مُتنبئ مع إهمال التاريخ التطوري. [ 4 ] لدراسة انتقال الفيروس بين العوائل، تسمح مرونة الإطار الإحصائي البايزي بإعادة بناء انتقال الفيروس بين أنواع العوائل المختلفة، مع اختبار وتحديد مساهمة التأثيرات البيئية والتطورية المتعددة لكل من انتقال الفيروس بين العوائل وانتقال الفيروس بين العوائل. [ 4 ] أظهرت إحدى الدراسات على داء الكلب في الخفافيش أن تداخل النطاق الجغرافي يُعد مُتنبئًا متواضعًا لانتقال الفيروس بين العوائل، ولكنه ليس كذلك لانتقال الفيروس بين العوائل. [ 4 ] يُبرز هذا كيف يُمكن استخدام الاستدلالات البايزية في النماذج لتحليل انتقال الفيروس بين العوائل.

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ تشايلدز، جيه إي، ماكنزي، جيه إي، ريشت، جيه إي (2007)، الحياة البرية والأمراض الحيوانية المنشأ الناشئة: بيولوجيا وظروف وعواقب انتقال العدوى بين الأنواع ، المواضيع الحالية في علم الأحياء الدقيقة وعلم المناعة، المجلد  315، سبرينغر-فيرلاغ برلين هايدلبرغ: سبرينغر ساينس + بيزنس ميديا، الصفحات 129-134 ، doi : 10.1007/978-3-540-70962-6 ، ISBN  978-3-540-70961-9
  2. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 بينافيدس، جيه إيه، كروس، بي سي، لويكارت، جي، كريل، إس (2014)، "محدودية تقدير انتقال البكتيريا بين الأنواع باستخدام المؤشرات الجينية والجينومية: استنتاجات من نمذجة المحاكاة"، التطبيقات التطورية ، 7 (7): 774-787 ، Bibcode : 2014EvApp...7..774B ، doi : 10.1111/eva.12173 ، PMC 4227858 ، PMID 25469159  
  3. 1 2 باريش سي آر، هولمز إي سي، مورينز دي إم، بارك إي سي، وآخرون (2008)، "انتقال الفيروسات بين الأنواع وظهور أمراض وبائية جديدة"، مجلة علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية ، 72 (3): 457-470 ، doi : 10.1128/MMBR.00004-08 ، PMC 2546865 ، PMID 18772285   
  4. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 فاريا إن آر، سوشارد إم إيه، رامبوت إيه، ستريكر دي جي، وآخرون (2013)، "إعادة بناء تاريخ انتقال الفيروسات بين الأنواع وتحديد القيود الأساسية في آن واحد"، Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci ، 368 (1614) 20120196، doi : 10.1098/rstb.2012.0196 ، PMC 3678322 ، PMID 23382420   
  5. 1 2 3 4 هافن جيه، بارك إيه دبليو (2013)، "العدوى الفائقة توفق بين ارتباط المضيف بالطفيلي وانتقال العدوى بين الأنواع"، علم الأحياء السكاني النظري ، 90 : 129-134 ، Bibcode : 2013TPBio..90..129H ، doi : 10.1016/j.tpb.2013.09.015 ، PMC 7126234 ، PMID 24161558  
  6. ↑ وانغ إل إف، أندرسون دي إي (2019). " الفيروسات في الخفافيش واحتمالية انتقالها إلى الحيوانات والبشر" . الرأي الحالي في علم الفيروسات . 34 : 79-89 . doi : 10.1016/j.coviro.2018.12.007 . PMC 7102861. PMID 30665189 .  
  7. ↑ فاجري إيه سي، كادينج آر سي (2019). "هل يمكن للخفافيش أن تكون بمثابة مستودعات للفيروسات المنقولة بالمفصليات؟" . الفيروسات . 11 (3): 215. doi : 10.3390/v11030215 . PMC 6466281. PMID 30832426 .  
  8. ↑ فون تشيفالفاي سي (2023)، "أنظمة المضيف والناقل وأنظمة المضيف المتعدد" ، النمذجة الحاسوبية للأمراض المعدية ، إلسيفير، ص 121-149 ، doi : 10.1016/b978-0-32-395389-4.00013-x ، ISBN  978-0-323-95389-4تم الاطلاع عليه بتاريخ 2023-03-02
  9. ↑ كارلسون سي جيه، ألبري جي إف، ميرو سي، تريسوس سي إتش، زيبفيل سي إم، إسكيو إي إيه، أوليفال كيه جيه، روس إن، بانسال إس (28 أبريل 2022). "تغير المناخ يزيد من خطر انتقال الفيروسات بين الأنواع" . مجلة نيتشر . 607 (7919): 555-562 . Bibcode : 2022Natur.607..555C . doi : 10.1038/s41586-022-04788- w . ISSN 1476-4687 . PMID 35483403. S2CID 248430532 .   
  10. ↑ بيرثيرات إي، بخوشة إس، شوغراني إس، رازق إف، دوتشيمين جي بي، هوتي إل، دهريب إل، فايول سي، ماكرروجراس بي، دالي يحيى آر، بلال آر، بلحبري إل، شايب أ، تيخوميروف إي، كارنييل إي (2007). "عودة الطاعون للظهور في الجزائر بعد 50 عاما، 2003" . الأمراض المعدية الناشئة . 13 (10): 1459-1462 . دوى : 10.3201/eid1310.070284 . بمك 2851531 . بميد 18257987 .  
  11. ↑ جيسين أ، روا ر، بيتسم إ، توربان ج (2013)، "فيروسات HTLV-3/4 والفيروسات الرغوية القردية في البشر: الاكتشاف، وعلم الأوبئة، والانتقال بين الأنواع، وعلم الفيروسات الجزيئي"، علم الفيروسات ، 435 (1): 187-199 ، doi : 10.1016/j.virol.2012.09.035 ، PMC 7111966 ، PMID 23217627  
  12. 1 2 كروسبي إل (2013)، "عدوى فيروس الحصبة بين الأنواع: هل هناك خطر على البشر؟"، علم الفيروسات المستقبلي ، 7 (1): 1103-1113 ، doi : 10.2217/fvl.12.103 ، ProQuest 1179633590 
  13. ↑ تشونغ واي إل، لام تي تي، كيم أو، لو إتش، وآخرون (2013)، "نجاح التأسيس والانتشار العالمي للنمط الجيني السادس من فيروس باراميكسو الطيور من النمط المصلي 1 بعد انتقاله بين الأنواع"، العدوى، علم الوراثة والتطور ، 17 : 260-268 ، Bibcode : 2013InfGE..17..260C ، doi : 10.1016/j.meegid.2013.04.025 ، PMC 7106292 ، PMID 23628639   
  14. ↑ والاس آر إم، جيلبرت إيه، سلات دي، تشيبمان آر (2014)، "المكان المناسب، النوع الخطأ: مراجعة لمدة 20 عامًا لانتقال فيروس داء الكلب بين الأنواع المختلفة من الثدييات البرية في الولايات المتحدة"، PLOS ONE ، 9 (10) e107539، Bibcode : 2014PLoSO...9j7539W ، doi : 10.1371/journal.pone.0107539 ، PMC 4189788 ، PMID 25295750  
  15. 1 2 3 4 تشين إي سي، ياغي إس، كيلي كيه آر، ميندوزا إس بي، وآخرون (2011)، "انتقال فيروس غدي جديد بين الأنواع مرتبط بتفشي التهاب رئوي حاد في مستعمرة قرود العالم الجديد"، PLOS Pathogens ، 7 (7) e1002155، doi : 10.1371/journal.ppat.1002155 ، PMC 3136464 ، PMID 21779173   
  16. 1 2 3 هوب إي، باولي إم، جيليسبي تي آر، أكوا-كوفي سي، وآخرون (2015)، "أحداث انتقال متعددة بين الأنواع لفيروسات الأدينو البشرية (HAdV) خلال تطور أشباه البشر"، علم الأحياء الجزيئي والتطور ، 32 (8): 2072-2084 ، doi : 10.1093/molbev/msv090 ، PMC 4833075 ، PMID 25862141   
  17. 1 2 3 4 ليمي ب، بايبوس أو جي، وانغ ب، ساكسينا إن كيه، وآخرون (2003)، "تتبع أصل وتاريخ وباء فيروس نقص المناعة البشرية من النوع الثاني"، وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم ، 100 (11): 6588-6592 ، Bibcode : 2003PNAS..100.6588L ، doi : 10.1073/pnas.0936469100 ، PMC 164491 ، PMID 12743376   
  18. ↑ موينغا-أونديمي أ، كارون م، نكوغي د، تيلفر ل ب، وآخرون (2012)، "انتقال فيروس الرغوة القردي بين الأنواع إلى البشر في المناطق الريفية في الغابون، وسط أفريقيا"، مجلة علم الفيروسات ، 86 (2): 1255-1260 ، doi : 10.1128/jvi.06016-11 ، PMC 3255803 ، PMID 22072747   
  19. 1 2 إنجل جي، هانغرفورد إل إل، جونز-إنجل إل، ترافيس دي، وآخرون (2006)، "تقييم المخاطر: نموذج للتنبؤ بانتقال فيروس الرغوة القردي من قرود المكاك ( M. fascicularis ) إلى البشر في معبد للقرود في بالي، إندونيسيا"، المجلة الأمريكية لعلم الرئيسيات ، 68 (9): 934-948 ، doi : 10.1002/ajp.20299 ، PMID 16900504 ، S2CID 11821014   
  20. 1 2 3 باريش سي آر، هولمز إي سي، مورينز دي إم، بارك إي سي، وآخرون (2008)، "انتقال الفيروسات بين الأنواع وظهور أمراض وبائية جديدة"، مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية ، 72 (3): 457-470 ، doi : 10.1128/MMBR.00004-08 ، PMC 2546865 ، PMID 18772285   
  21. ↑ داشو إل، سيرفانتس-غونزاليس إم، غيغون جي، ثيبرج جي إم، وآخرون (2014)، "دراسة أولية للميتاجينوميات الفيروسية لأنواع الخفافيش الفرنسية المتصلة بالبشر: تحديد فيروسات ثديية جديدة"، PLOS ONE ، 9 (1): 845-53 ، Bibcode : 2014PLoSO...987194D ، doi : 10.1371/journal.pone.0087194 ، PMC 3906132 ، PMID 24489870   
  22. ↑ كيرماير أ، وو ف، نيومان ر.م، هول ل.ر، وآخرون (2013)، "بروتين TRIM5 يثبط انتقال فيروس نقص المناعة لدى الرئيسيات بين الأنواع ويؤدي إلى ظهور سلالات مقاومة في الأنواع الجديدة"، مجلة PLOS Biology ، 8 (8) e1000462، doi : 10.1371/journal.pbio.1000462 ، PMC 2927514 ، PMID 20808775   
  23. 1 2 أليسون إيه بي، هاربيسون سي إي، باغان آي، ستوكر كيه إم، وآخرون (2012)، "دور العوائل المتعددة في انتقال فيروس بارفو وبائي بين الأنواع وظهوره"، مجلة علم الفيروسات ، 86 (2): 865-872 ، doi : 10.1128/jvi.06187-11 ، PMC 3255849 ، PMID 22072763   
  24. ↑ أليسون إيه بي، كولر دي جيه، فوكس كيه إيه، براون جيه دي (2015)، "تحليل شبكي لمجتمعات المضيف والفيروس في الخفافيش والقوارض يكشف عن محددات انتقال العدوى بين الأنواع"، رسائل علم البيئة ، 18 (11): 1153-1162 ، Bibcode : 2015EcolL..18.1153L ، doi : 10.1111/ele.12491 ، PMC 5014217 ، PMID 26299267  
  25. 1 2 3 كانينغهام، سي دبليو، أوملاند، كي إي، أوكلي، تي إتش (1998)، "إعادة بناء حالات الصفات السلفية: إعادة تقييم نقدية"، اتجاهات في علم البيئة والتطور ، 13 (9): 361-366 ، Bibcode : 1998TEcoE..13..361C ، doi : 10.1016/s0169-5347(98)01382-2 ، PMID 21238344 ، S2CID 6779286  
  26. ↑ لويس إيه دي، أوشيا تي جيه، هايمان دي، وود جيه (2015)، "تحليل شبكي لمجتمعات المضيف والفيروس في الخفافيش والقوارض يكشف عن محددات انتقال العدوى بين الأنواع" (ملف PDF) ، رسائل علم البيئة ، 18 (11): 1153-1162 ، Bibcode : 2015EcolL..18.1153L ، doi : 10.1111/ele.12491 ، PMC 5014217 ، PMID 26299267  
  27. 1 2 ليمي ب، رامبوت أ، دروموند أ ج، سوشارد م أ، وآخرون (2009)، "علم الجغرافيا الوراثية البايزي يجد جذوره"، PLOS Comput Biol ، 5 (9) e1000520، Bibcode : 2009PLSCB...5E0520L ، doi : 10.1371/journal.pcbi.1000520 ، PMC 2740835 ، PMID 19779555   
  28. ↑ رونكويست ف (2004)، "الاستدلال البايزي لتطور الصفات" (ملف PDF) ، اتجاهات في علم البيئة والتطور ، 19 (9): 475-481 ، doi : 10.1016/j.tree.2004.07.002 ، PMID 16701310