إنزيم متماثل

في الكيمياء الحيوية ، تُعرف الإنزيمات المتماثلة (أو الإنزيمات المتشابهة أو بشكل أعم باسم الأشكال المتعددة للإنزيمات أو الأشكال المتماثلة) بأنها إنزيمات تختلف في تسلسل الأحماض الأمينية ولكنها تحفز نفس التفاعل الكيميائي. عادةً ما تمتلك الإنزيمات المتماثلة معايير حركية مختلفة (مثل قيم K<sub> M </sub> مختلفة )، أو تخضع لتنظيم مختلف. وهي تسمح بضبط دقيق لعملية الأيض لتلبية الاحتياجات الخاصة لنسيج معين أو مرحلة نمو معينة.

في كثير من الحالات، تُشفَّر الإنزيمات المتماثلة بواسطة جينات متماثلة تباعدت عبر الزمن. وبدقة، تُسمى الإنزيمات ذات التسلسلات المختلفة من الأحماض الأمينية التي تحفز التفاعل نفسه إنزيمات متماثلة إذا كانت مشفرة بواسطة جينات مختلفة، أو إنزيمات متغايرة إذا كانت مشفرة بواسطة أليلات مختلفة من الجين نفسه ؛ وغالبًا ما يُستخدم المصطلحان بشكل متبادل.

مقدمة

وُصفت الإنزيمات المتماثلة لأول مرة من قِبل آر. إل. هنتر وكليمنت ماركرت (1957)، حيث عرّفاها بأنها أشكال مختلفة من الإنزيم نفسه، لها وظائف متطابقة وتوجد في الفرد نفسه . [ 1 ] يشمل هذا التعريف (1) أشكال الإنزيم الناتجة عن جينات مختلفة، وبالتالي تمثل مواقع جينية مختلفة (تُسمى الإنزيمات المتماثلة )، و(2) الإنزيمات الناتجة عن أليلات مختلفة من الجين نفسه (تُسمى الإنزيمات المتغايرة ). [ 2 ]

تنتج الإنزيمات المتماثلة عادةً عن تضاعف الجينات ، ولكنها قد تنشأ أيضًا من تعدد الصيغ الصبغية أو تهجين الأحماض النووية . مع مرور الزمن التطوري، إذا بقيت وظيفة المتغير الجديد مطابقةً للأصل، فمن المرجح أن يفقد أحدهما أو الآخر مع تراكم الطفرات ، مما يؤدي إلى ظهور جين كاذب . مع ذلك، إذا لم تمنع الطفرات الإنزيم من العمل فورًا، بل عدّلت وظيفته أو نمط تعبيره ، فقد يُفضّل الانتقاء الطبيعي كلا المتغيرين ويتخصصان في وظائف مختلفة. [ 3 ] على سبيل المثال، قد يُعبَّر عنهما في مراحل نمو مختلفة أو في أنسجة مختلفة. [ 4 ]

قد تنشأ الأنزيمات المتغايرة من طفرات نقطية أو من أحداث إدخال/حذف ( indel ) تؤثر على التسلسل المشفر للجين. وكما هو الحال مع أي طفرات جديدة أخرى، هناك ثلاثة أمور قد تحدث للإنزيم المتغاير الجديد:

أمثلة

من الأمثلة على الإنزيمات المتماثلة إنزيم جلوكوكيناز ، وهو نوع من إنزيم هيكسوكيناز لا يُثبَّط بواسطة جلوكوز 6-فوسفات . تسمح له خصائصه التنظيمية المختلفة وانخفاض ألفته للجلوكوز (مقارنةً بأنواع هيكسوكيناز الأخرى) بأداء وظائف مختلفة في خلايا أعضاء محددة، مثل تنظيم إفراز الأنسولين من خلايا بيتا في البنكرياس ، أو بدء تخليق الجليكوجين في خلايا الكبد . ولا تحدث هاتان العمليتان إلا في وجود الجلوكوز بوفرة.

الإنزيمات الخمسة المتماثلة لإنزيم نازعة هيدروجين اللاكتات
التمييز بين خمسة إنزيمات متماثلة باستخدام الرحلان الكهربائي

1) إنزيم نازعة هيدروجين اللاكتات هو رباعي يتكون من وحدتين فرعيتين مختلفتين، هما الشكل H والشكل M. وتتحد هاتان الوحدتان بتراكيب مختلفة تبعًا لنوع النسيج: [ 7 ]

يكتبتعبيرموقعالحركة الكهربائيةسواء تم تدميرها بواسطة

التسخين (عند 60  درجة مئوية)

نسبة طبيعية

مصل الدم عند البشر

LDH 1هههههالقلب وكريات الدم الحمراءالأسرعلا25%
LDH 2HHHMالقلب وكريات الدم الحمراءأسرعلا35%
LDH 3همممالدماغ والكلىسريعجزئيا27%
LDH 4أممالعضلات الهيكلية والكبدبطيءنعم8%
LDH 5ممممالعضلات الهيكلية والكبدالأبطأنعم5%

2) الإنزيمات المتماثلة لـ كرياتين فوسفوكيناز: [ 7 ] يقوم كرياتين كيناز (CK) أو كرياتين فوسفوكيناز (CPK) بتحفيز التحويل المتبادل للفوسفوكرياتين إلى كرياتين.

يوجد إنزيم CPK في 3 أشكال متماثلة. كل شكل متماثل عبارة عن ثنائي من وحدتين فرعيتين M (العضلات)، B (الدماغ) أو كليهما [ 7 ]

الإنزيم المتماثلالوحدة الفرعيةنسيج المنشأ
سي بي كي 1بي بيمخ
سي بي كي 2MBقلب
سي بي كي 3ممالعضلات الهيكلية

3.) Isoenzymes of alkaline phosphatase:[7] Six isoenzymes have been identified. The enzyme is a monomer, the isoenzymes are due to the differences in the carbohydrate content (sialic acid residues). The most important ALP isoenzymes are α1-ALP, α2-heat labile ALP, α2-heat stable ALP, pre-β ALP and γ-ALP. Increase in α2-heat labile ALP suggests hepatitis whereas pre-β ALP indicates bone diseases.

Distinguishing isozymes

Isozymes (and allozymes) are variants of the same enzyme. Unless they are identical in their biochemical properties, for example their substrates and enzyme kinetics, they may be distinguished by a biochemical assay. However, such differences are usually subtle, particularly between allozymes which are often neutral variants. This subtlety is to be expected, because two enzymes that differ significantly in their function are unlikely to have been identified as isozymes.

While isozymes may be almost identical in function, they may differ in other ways. In particular, amino acid substitutions that change the electric charge of the enzyme are simple to identify by gel electrophoresis, and this forms the basis for the use of isozymes as molecular markers. To identify isozymes, a crude protein extract is made by grinding animal or plant tissue with an extraction buffer, and the components of extract are separated according to their charge by gel electrophoresis. Historically, this has usually been done using gels made from potato starch, but acrylamide gels provide better resolution.

All the proteins from the tissue are present in the gel, so that individual enzymes must be identified using an assay that links their function to a staining reaction. For example, detection can be based on the localised precipitation of soluble indicator dyes such as tetrazolium salts which become insoluble when they are reduced by cofactors such as NAD or NADP, which generated in zones of enzyme activity. This assay method requires that the enzymes are still functional after separation (native gel electrophoresis), and provides the greatest challenge to using isozymes as a laboratory technique.

Isoenzymes differ in kinetics (they have different KM and Vmax values).

Isozymes and allozymes as molecular markers

علم الوراثة السكانية هو في جوهره دراسة أسباب وتأثيرات التباين الجيني داخل وبين المجموعات السكانية، وفي الماضي، كانت الإنزيمات المتماثلة من بين أكثر المؤشرات الجزيئية استخدامًا لهذا الغرض. على الرغم من أنها قد استُبدلت إلى حد كبير الآن بأساليب أكثر دقة تعتمد على الحمض النووي (مثل التسلسل المباشر للحمض النووي ، وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة، والميكروساتلايت )، إلا أنها لا تزال من بين أسرع أنظمة المؤشرات وأقلها تكلفة في التطوير، وما زالت كذلك ( حتى عام 2005) .) خيار ممتاز للمشاريع التي تحتاج فقط إلى تحديد مستويات منخفضة من التباين الجيني، على سبيل المثال تحديد كمية أنظمة التزاوج .

أمثلة رئيسية أخرى

  • تلعب إنزيمات السيتوكروم P450 أدوارًا مهمة في عملية التمثيل الغذائي وتكوين الستيرويدات .
  • تؤدي الأشكال المتعددة لإنزيم فوسفودايستراز أدوارًا رئيسية في العديد من العمليات البيولوجية. ورغم وجود أكثر من شكل من هذه الإنزيمات في الخلايا الفردية، إلا أن هذه الأشكال المتماثلة من الإنزيم تتوزع بشكل غير متساوٍ بين خلايا الكائن الحي. ومن الناحية السريرية، وُجد أنها تُنشط وتُثبط بشكل انتقائي، وهي ملاحظة أدت إلى استخدامها في العلاج.

مراجع

  • هنتر، آر إل؛ ميركيرت، سي إل (1957). "التوضيح النسيجي الكيميائي للإنزيمات المفصولة بالرحلان الكهربائي النطاقي في هلامات النشا". مجلة ساينس . 125 (3261): 1294-1295 . doi : 10.1126/science.125.3261.1294-a . PMID 13432800 . 
  • فايس، ب.؛ هايت، و.ن. (1977). "مثبطات فوسفودايستراز النيوكليوتيدات الحلقية الانتقائية كعوامل علاجية محتملة". المجلة السنوية لعلم الأدوية وعلم السموم ، 17 : 441-477 . doi : 10.1146/annurev.pa.17.040177.002301 . PMID 17360 . 
  • ويندل، جيه إف، وويدن، إن إف. 1990. "تصوير وتفسير الإنزيمات المتماثلة النباتية". الصفحات  5-45 في دي إي سولتيس وبي إس سولتيس ، محرران. الإنزيمات المتماثلة في بيولوجيا النبات. تشابمان وهول، لندن.
  • ويدن، إن إف، وويندل، جيه إف. 1990. "علم وراثة الإنزيمات المتماثلة النباتية". الصفحات  46-72 في : سولتيس، دي إي ، وسولتيس ، بي إس (محرران). الإنزيمات المتماثلة في بيولوجيا النبات. تشابمان وهول، لندن.
  • كروفورد، دي جيه. 1989. "الرحلان الكهربائي للإنزيمات وتصنيف النباتات". الصفحات  146-164 في كتاب دي إي سولتيس وبي إس سولتيس (محرران). الإنزيمات المتماثلة في بيولوجيا النبات. ديوسكوريدس، بورتلاند، أوريغون.
  • هامريك، جيه إل، وجودت، إم جيه دبليو. 1990. "تنوع الأنزيمات المتغايرة في أنواع النباتات". الصفحات  43-63 في: براون، إيه إتش دي، وكليج، إم تي، وكاهلر، إيه إل، ووير، بي إس (محررون). علم الوراثة السكانية النباتية، والتربية، والموارد الوراثية. سيناور، سندرلاند
  • الكيمياء الحيوية من تأليف جيريمي إم. بيرج، وجون إل. تيموتشكو، ولوبيرت ستراير (مقدمة مأخوذة من هذا الكتاب المدرسي)
محدد
  1. ماركرت، كليمنت ل.؛ مولر، فريدي (1959). "أشكال متعددة من الإنزيمات: أنماط خاصة بالأنسجة، والتطور، والأنواع" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 45 (5): 753-763 . Bibcode : 1959PNAS...45..753M . doi : 10.1073/pnas.45.5.753 . PMC 222630. PMID 16590440 .  
  2. كيرني (2014). علم الوراثة الأساسي ( الطبعة الثالثة). دار نشر ماكناوتون. الصفحات 413-414 .  
  3. جيرالد، جيرالد (2015). كتاب الأحياء: من أصل الحياة إلى علم التخلق، 250 معلماً بارزاً في تاريخ علم الأحياء . ستيرلينغ. ص 79. 
  4. هوانغ، لي (2009). الجينوم . جرادي-ماكفيرسون. ص 299. 
  5. ألبرتس (2017). البيولوجيا الجزيئية للخلية ( الطبعة السادسة). جارلاند ساينس. ص 649.  
  6. 1 2 والستروم، فورد؛ وآخرون (2014). "نماذج علم الوراثة والانتقاء الطبيعي: فهم بيولوجي جزيئي حالي". علم البيئة الجزيئية الحيوية . 70 (2): 1021-1034 . 
  7. 1 2 3 4 ساتيانارايانا، يو. (2002). الكيمياء الحيوية ( الطبعة الثانية). كولكاتا، الهند: الكتب والحلفاء. رقم ISBN  8187134801. OCLC 71209231 .