الانجراف الجيني

الانجراف الجيني ، المعروف أيضًا باسم الانجراف الجيني العشوائي ، أو الانجراف الأليلي أو تأثير رايت ، [1] هو التغيير في تواتر متغير جيني موجود ( أليل ) في مجموعة سكانية بسبب الصدفة العشوائية. [2]

قد يؤدي الانجراف الجيني إلى اختفاء المتغيرات الجينية تمامًا وبالتالي تقليل التنوع الجيني . [3] يمكن أن يتسبب أيضًا في أن تصبح الأليلات النادرة في البداية أكثر تكرارًا وحتى ثابتة.

عندما توجد نسخ قليلة من الأليل، يكون تأثير الانجراف الجيني أكثر وضوحًا، وعندما توجد نسخ عديدة، يكون التأثير أقل وضوحًا (بسبب قانون الأعداد الكبيرة ). في منتصف القرن العشرين، دارت مناقشات قوية حول الأهمية النسبية للانتقاء الطبيعي مقابل العمليات المحايدة، بما في ذلك الانجراف الجيني. كان رونالد فيشر ، الذي شرح الانتقاء الطبيعي باستخدام علم الوراثة المندلية ، [4] يرى أن الانجراف الجيني يلعب دورًا ثانويًا على الأكثر في التطور ، وظل هذا الرأي سائدًا لعدة عقود. في عام 1968، أعاد عالم الوراثة السكانية موتو كيمورا إشعال النقاش بنظريته المحايدة للتطور الجزيئي ، والتي تدعي أن معظم الحالات التي ينتشر فيها التغيير الجيني عبر مجموعة سكانية (على الرغم من عدم وجود تغييرات بالضرورة في النمط الظاهري ) تنجم عن الانجراف الجيني الذي يعمل على الطفرات المحايدة . [5] [6] في التسعينيات، تم اقتراح التطور المحايد البنّاء الذي يسعى إلى شرح كيفية ظهور الأنظمة المعقدة من خلال التحولات المحايدة. [7] [8]

تشبيه بالكرات الزجاجية في الجرة

يمكن توضيح عملية الانجراف الجيني باستخدام 20 كرة زجاجية في جرة لتمثيل 20 كائنًا حيًا في مجموعة سكانية. [9] ضع في اعتبارك أن هذه الجرة من الكرات الزجاجية هي المجموعة السكانية الأولية. نصف الكرات الزجاجية في الجرة حمراء والنصف الآخر أزرق، حيث يتوافق كل لون مع أليل مختلف لجين واحد في المجموعة السكانية. في كل جيل جديد، تتكاثر الكائنات الحية بشكل عشوائي. لتمثيل هذا التكاثر، حدد بشكل عشوائي كرة زجاجية من الجرة الأصلية وأودع كرة زجاجية جديدة بنفس اللون في جرة جديدة. هذا هو "ذرية" الكرة الزجاجية الأصلية، مما يعني أن الكرة الزجاجية الأصلية تظل في جرتها. كرر هذه العملية حتى يصبح هناك 20 كرة زجاجية جديدة في الجرة الثانية. ستحتوي الجرة الثانية الآن على 20 "ذرية"، أو كرات زجاجية بألوان مختلفة. ما لم تحتوي الجرة الثانية على 10 كرات زجاجية حمراء و10 كرات زجاجية زرقاء بالضبط، فقد حدث تحول عشوائي في ترددات الأليل.

إذا تكررت هذه العملية عدة مرات، فإن أعداد الكرات الحمراء والزرقاء التي يتم التقاطها في كل جيل تتقلب. في بعض الأحيان، تحتوي الجرة على كرات حمراء أكثر من الجرة "الأم" وأحيانًا أكثر من الكرات الزرقاء. هذا التقلب يشبه الانجراف الوراثي - وهو تغير في تواتر الأليلات في السكان نتيجة لاختلاف عشوائي في توزيع الأليلات من جيل إلى جيل.

في أي جيل، لا يمكن اختيار أي كرات من لون معين، مما يعني أنه لا يوجد لها ذرية. في هذا المثال، إذا لم يتم اختيار أي كرات حمراء، فإن الجرة التي تمثل الجيل الجديد تحتوي فقط على ذرية زرقاء. إذا حدث هذا، فإن الأليل الأحمر قد ضاع بشكل دائم في المجموعة، بينما أصبح الأليل الأزرق المتبقي ثابتًا: كل الأجيال المستقبلية زرقاء بالكامل. في المجموعات السكانية الصغيرة، يمكن أن يحدث التثبيت في غضون بضعة أجيال فقط.

في هذه المحاكاة، تشير كل نقطة سوداء على الرخام إلى أنه تم اختيارها للنسخ (التكاثر) مرة واحدة. يحدث التثبيت في "الأليل" الأزرق خلال خمسة أجيال.

الاحتمالية وتردد الأليل

يمكن توضيح آليات الانجراف الجيني بمثال بسيط للغاية. لنفترض وجود مستعمرة كبيرة جدًا من البكتيريا المعزولة في قطرة من المحلول. البكتيريا متطابقة وراثيًا باستثناء جين واحد له أليلان مُسمَّيان A و B ، وهما أليلان محايدان، مما يعني أنهما لا يؤثران على قدرة البكتيريا على البقاء والتكاثر؛ جميع البكتيريا في هذه المستعمرة لديها نفس احتمالية البقاء والتكاثر. افترض أن نصف البكتيريا لديها الأليل A والنصف الآخر لديها الأليل B. وبالتالي، فإن كلًا من A و B لديه تردد أليل 1/2.

ثم تتقلص قطرة المحلول حتى تحتوي على ما يكفي من الغذاء لأربعة بكتيريا فقط. جميع البكتيريا الأخرى تموت دون أن تتكاثر. من بين الأربعة التي بقيت على قيد الحياة، توجد 16 مجموعة محتملة للأليلات A و B :
(AAAA)، (BAAA)، (ABAA)، (BBAA)
، (AABA)، (BABA)، (ABBA)، (BBBA)،
( AAAB)، (BAAB)، (ABAB)، (BBAB)،
(AABB)، (BABB)، (ABBB)، (BBBB).

نظرًا لأن جميع البكتيريا الموجودة في المحلول الأصلي من المرجح أن تبقى على قيد الحياة عند انكماش المحلول، فإن الناجين الأربعة هم عينة عشوائية من المستعمرة الأصلية. احتمال أن يكون لكل من الناجين الأربعة أليل معين هو 1/2، وبالتالي فإن احتمال حدوث أي تركيبة أليلية معينة عند انكماش المحلول هو

(حجم السكان الأصلي كبير جدًا لدرجة أن أخذ العينات يحدث فعليًا مع الاستبدال). بعبارة أخرى، من المرجح أن تحدث كل من تركيبات الأليلات الـ 16 المحتملة بنفس القدر، باحتمالية 1/16.

إن حساب التركيبات التي تحتوي على نفس العدد من A و B يعطي الجدول التالي:

أ ب التركيبات احتمال
4 0 1 1/16
3 1 4 16/4
2 2 6 16/6
1 3 4 16/4
0 4 1 1/16

كما هو موضح في الجدول، فإن العدد الإجمالي للتركيبات التي لها نفس عدد أليلات A مثل أليلات B هو ستة، واحتمال هذا التركيب هو 6/16. العدد الإجمالي للتركيبات الأخرى هو عشرة، وبالتالي فإن احتمال وجود عدد غير متساوٍ من أليلات A و B هو 10/16. وبالتالي، على الرغم من أن المستعمرة الأصلية بدأت بعدد متساوٍ من أليلات A و B ، فمن المحتمل جدًا ألا يكون عدد الأليلات في السكان المتبقين المكونين من أربعة أعضاء متساويًا. إن حالة الأعداد المتساوية أقل احتمالية في الواقع من الأعداد غير المتساوية. في الحالة الأخيرة، حدث الانجراف الجيني لأن ترددات أليلات السكان قد تغيرت بسبب أخذ العينات العشوائية. في هذا المثال، انكمش السكان إلى أربعة ناجين عشوائيين فقط، وهي ظاهرة تُعرف باسم عنق الزجاجة السكاني .

يمكن حساب احتمالات عدد نسخ الأليل A (أو B ) التي تبقى على قيد الحياة (الموضحة في العمود الأخير من الجدول أعلاه) مباشرة من التوزيع الثنائي ، حيث يكون احتمال "النجاح" (احتمال وجود أليل معين) هو 1/2 (أي احتمال وجود k نسخة من أليل A (أو B ) في التركيبة) يعطى بواسطة:

حيث n=4 هو عدد البكتيريا الباقية.

النماذج الرياضية

يمكن تصميم النماذج الرياضية للانجراف الجيني باستخدام عمليات التفرع أو معادلة الانتشار التي تصف التغيرات في تردد الأليل في مجموعة سكانية مثالية . [10]

نموذج رايت-فيشر

لنفترض وجود جين به أليلين، A أو B. في حالة الازدواج الصبغي ، تحتوي التجمعات السكانية التي تتكون من N فرد على 2 N نسخة من كل جين. يمكن أن يكون لدى الفرد نسختان من نفس الأليل أو أليلين مختلفين. يتم تعيين تردد أحد الأليلين p والآخر q . يفترض نموذج رايت-فيشر (المسمى على اسم سيوال رايت ورونالد فيشر ) أن الأجيال لا تتداخل (على سبيل المثال، تحتوي النباتات السنوية على جيل واحد بالضبط في السنة) وأن كل نسخة من الجين الموجود في الجيل الجديد يتم سحبها بشكل مستقل عشوائيًا من جميع نسخ الجين في الجيل القديم. تكون الصيغة لحساب احتمالية الحصول على k نسخة من الأليل الذي كان تردده p في الجيل الأخير هي [11] [12]

حيث يشير الرمز " ! " إلى الدالة العاملية . يمكن أيضًا صياغة هذا التعبير باستخدام المعامل ذي الحدين ،


نموذج موران

يفترض نموذج موران تداخل الأجيال. في كل خطوة زمنية، يتم اختيار فرد واحد للتكاثر ويتم اختيار فرد واحد للموت. لذلك في كل خطوة زمنية، يمكن أن يزيد عدد نسخ الأليل المعطى بمقدار واحد، أو ينخفض ​​بمقدار واحد، أو يمكن أن يظل كما هو. وهذا يعني أن مصفوفة الانتقال ثلاثية الأقطار ، مما يعني أن الحلول الرياضية أسهل بالنسبة لنموذج موران مقارنة بنموذج رايت-فيشر. من ناحية أخرى، عادةً ما يكون إجراء المحاكاة الحاسوبية أسهل باستخدام نموذج رايت-فيشر، لأنه يلزم حساب خطوات زمنية أقل. في نموذج موران، يستغرق الأمر N خطوة زمنية للوصول إلى جيل واحد، حيث N هو حجم السكان الفعال . في نموذج رايت-فيشر، يستغرق الأمر خطوة واحدة فقط. [13]

في الممارسة العملية، يعطي نموذجا موران ورايت-فيشر نتائج متشابهة نوعياً، لكن الانجراف الجيني يجري بسرعة مضاعفة في نموذج موران.

نماذج أخرى من الانجراف

إذا كان التباين في عدد النسل أكبر بكثير من ذلك المعطى بواسطة التوزيع الثنائي الذي افترضه نموذج رايت-فيشر، فبالنظر إلى نفس السرعة الإجمالية للانجراف الوراثي (حجم السكان الفعال للتباين)، فإن الانجراف الوراثي يكون قوة أقل قوة مقارنة بالاختيار. [14] حتى بالنسبة لنفس التباين، إذا تجاوزت اللحظات الأعلى لتوزيع عدد النسل تلك الخاصة بالتوزيع الثنائي، فإن قوة الانجراف الوراثي تضعف بشكل كبير مرة أخرى. [15]

التأثيرات العشوائية بخلاف خطأ العينة

يمكن أيضًا أن تحدث تغييرات عشوائية في ترددات الأليلات بسبب تأثيرات أخرى غير خطأ العينة ، على سبيل المثال التغييرات العشوائية في ضغط الانتقاء. [16]

أحد المصادر البديلة المهمة للعشوائية ، ربما أكثر أهمية من الانجراف الوراثي، هو السحب الوراثي . [17] السحب الوراثي هو التأثير على موضع عن طريق الانتقاء على المواضع المرتبطة . الخصائص الرياضية للسحب الوراثي مختلفة عن خصائص الانجراف الوراثي. [18] يرتبط اتجاه التغيير العشوائي في تردد الأليل تلقائيًا عبر الأجيال. [2]

الانجراف والتثبيت

تنص مبدأ هاردي-واينبرج على أنه ضمن مجموعات سكانية كبيرة بما فيه الكفاية، تظل ترددات الأليلات ثابتة من جيل إلى جيل ما لم يتم إزعاج التوازن بالهجرة أو الطفرات الجينية أو الانتقاء . [ 19]

ومع ذلك، في المجتمعات المحدودة، لا يتم اكتساب أليلات جديدة من أخذ العينات العشوائية للأليلات التي تنتقل إلى الجيل التالي، ولكن أخذ العينات يمكن أن يتسبب في اختفاء أليل موجود. ولأن أخذ العينات العشوائي يمكن أن يزيل، ولكن لا يحل محل، ولأن الانخفاضات أو الزيادات العشوائية في تردد الأليل تؤثر على توزيعات الأليل المتوقعة للجيل التالي، فإن الانجراف الجيني يدفع المجتمع نحو التوحيد الجيني بمرور الوقت. عندما يصل الأليل إلى تردد 1 (100٪) يقال إنه "ثابت" في المجتمع وعندما يصل الأليل إلى تردد 0 (0٪) فإنه يفقد. تحقق المجتمعات الأصغر التثبيت بشكل أسرع، بينما في حدود المجتمع اللانهائي، لا يتحقق التثبيت. بمجرد أن يصبح الأليل ثابتًا، يتوقف الانجراف الجيني، ولا يمكن لتردد الأليل أن يتغير إلا إذا تم تقديم أليل جديد في المجتمع عن طريق الطفرة أو تدفق الجينات . وبالتالي، حتى في حين أن الانجراف الجيني هو عملية عشوائية بلا اتجاه، فإنه يعمل على القضاء على التباين الجيني بمرور الوقت. [20]

معدل تغير تردد الأليل بسبب الانجراف

عشر عمليات محاكاة للانحراف الجيني العشوائي لأليل واحد معين بتوزيع ترددي أولي 0.5 تم قياسه على مدار 50 جيلًا، وتكرر في ثلاث مجموعات سكانية متزامنة تكاثريًا بأحجام مختلفة. في هذه المحاكاة، تنحرف الأليلات إلى الفقدان أو التثبيت (بتردد 0.0 أو 1.0) فقط في أصغر مجموعة سكانية.

بافتراض أن الانجراف الجيني هو القوة التطورية الوحيدة المؤثرة على الأليل، بعد أجيال t في العديد من السكان المتماثلين، بدءًا من ترددات الأليل p و q ، فإن التباين في تردد الأليل عبر تلك السكان هو

[21]

حان وقت التثبيت أو الخسارة

بافتراض أن الانجراف الجيني هو القوة التطورية الوحيدة المؤثرة على الأليل، ففي أي وقت معين، فإن احتمال أن يصبح الأليل ثابتًا في النهاية في السكان هو ببساطة تردده في السكان في ذلك الوقت. [22] على سبيل المثال، إذا كان التردد p للأليل A هو 75٪ والتردد q للأليل B هو 25٪، فعندئذٍ مع مرور الوقت غير المحدود، فإن احتمال أن يصبح A ثابتًا في النهاية في السكان هو 75٪ واحتمال أن يصبح B ثابتًا هو 25٪.

العدد المتوقع للأجيال لحدوث التثبيت يتناسب مع حجم السكان، بحيث يُتوقع حدوث التثبيت بسرعة أكبر بكثير في السكان الأصغر. [23] عادةً ما يتم استخدام حجم السكان الفعال، وهو أصغر من إجمالي السكان، لتحديد هذه الاحتمالات. يأخذ السكان الفعال ( N e ) في الاعتبار عوامل مثل مستوى التزاوج الداخلي ، ومرحلة دورة الحياة التي يكون فيها السكان أصغر، وحقيقة أن بعض الجينات المحايدة مرتبطة وراثيًا بجينات أخرى تخضع للاختيار. [14] قد لا يكون حجم السكان الفعال هو نفسه لكل جين في نفس السكان. [24]

إحدى الصيغ التطلعية المستخدمة لتقريب الوقت المتوقع قبل أن يصبح الأليل المحايد ثابتًا من خلال الانجراف الجيني، وفقًا لنموذج رايت-فيشر، هي

حيث T هو عدد الأجيال، و N e هو حجم السكان الفعلي، و p هو التردد الأولي للأليل المعطى. والنتيجة هي عدد الأجيال المتوقع مرورها قبل حدوث التثبيت لأليل معين في مجموعة سكانية ذات حجم معين ( N e ) وتردد أليل ( p ). [25]

يمكن حساب الوقت المتوقع لفقدان الأليل المحايد من خلال الانجراف الجيني على النحو التالي [11]

عندما تظهر الطفرة مرة واحدة فقط في مجموعة سكانية كبيرة بما يكفي ليكون التردد الأولي مهملاً، يمكن تبسيط الصيغ إلى [26]

بالنسبة لعدد الأجيال المتوسط ​​المتوقع قبل تثبيت الطفرة المحايدة، و

بالنسبة لعدد الأجيال المتوسط ​​المتوقع قبل فقدان الطفرة المحايدة في مجموعة سكانية ذات حجم فعلي N. [27]

حان وقت الخسارة مع الانجراف والطفرة

تنطبق الصيغ أعلاه على الأليل الموجود بالفعل في مجموعة سكانية، والذي لا يخضع للطفرة أو الانتقاء الطبيعي. إذا فقد الأليل عن طريق الطفرة أكثر من اكتسابه عن طريق الطفرة، فإن الطفرة، وكذلك الانجراف، قد تؤثر على وقت الفقدان. إذا بدأ الأليل المعرض للفقد الطفري ثابتًا في المجموعة السكانية، وفُقد عن طريق الطفرة بمعدل م لكل تكرار، فإن الوقت المتوقع بالأجيال حتى فقده في مجموعة أحادية الصيغة الصبغية يُعطى بواسطة

حيث هو ثابت أويلر . [28] يمثل التقريب الأول وقت الانتظار حتى يصبح الطفر الأول مقدرًا للخسارة، مع حدوث الخسارة بسرعة نسبية عن طريق الانجراف الجيني، ويستغرق وقتًا1/مN e . يمثل التقريب الثاني الوقت اللازم للخسارة الحتمية عن طريق تراكم الطفرة. في كلتا الحالتين، يهيمن الطفرة على وقت التثبيت من خلال المصطلح 1/م، ويتأثر بشكل أقل بحجم السكان الفعلي .

مقابل الانتقاء الطبيعي

في المجتمعات الطبيعية، لا يعمل الانجراف الوراثي والانتقاء الطبيعي بمعزل عن بعضهما البعض؛ فكلا الظاهرتين تلعبان دوراً دائماً، جنباً إلى جنب مع الطفرة والهجرة. والتطور المحايد هو نتاج كل من الطفرة والانجراف، وليس الانجراف وحده. وعلى نحو مماثل، حتى عندما يتغلب الانتقاء على الانجراف الوراثي، فإنه لا يستطيع أن يعمل إلا على التنوع الذي توفره الطفرة.

في حين أن الانتقاء الطبيعي له اتجاه، يوجه التطور نحو التكيفات الوراثية للبيئة الحالية، فإن الانجراف الجيني ليس له اتجاه ويوجهه فقط رياضيات الصدفة . [29] ونتيجة لذلك، فإن الانجراف يؤثر على الترددات الجينية داخل السكان دون مراعاة تأثيراتها الظاهرية. في المقابل، يفضل الانتقاء انتشار الأليلات التي تزيد تأثيراتها الظاهرية من بقاء و/أو تكاثر حامليها، ويخفض ترددات الأليلات التي تسبب سمات غير مواتية، ويتجاهل تلك المحايدة. [30]

يتنبأ قانون الأعداد الكبيرة بأنه عندما يكون العدد المطلق لنسخ الأليل صغيرًا (على سبيل المثال، في مجموعات سكانية صغيرة )، فإن حجم الانجراف في ترددات الأليل لكل جيل يكون أكبر. يكون حجم الانجراف كبيرًا بما يكفي لإرباك الاختيار عند أي تردد أليل عندما يكون معامل الاختيار أقل من 1 مقسومًا على حجم السكان الفعال. لذلك يُعتبر التطور غير التكيفي الناتج عن حاصل الطفرة والانحراف الجيني آلية لاحقة للتغيير التطوري في المقام الأول داخل مجموعات سكانية صغيرة ومعزولة. [31] تعتمد رياضيات الانحراف الجيني على حجم السكان الفعال، ولكن ليس من الواضح كيف يرتبط هذا بالعدد الفعلي للأفراد في السكان. [17] يمكن أن يؤدي الارتباط الجيني بالجينات الأخرى التي تخضع للاختيار إلى تقليل حجم السكان الفعال الذي يعاني منه الأليل المحايد. مع معدل إعادة التركيب الأعلى ، ينخفض ​​الارتباط ومعه هذا التأثير المحلي على حجم السكان الفعال. [32] [33] يظهر هذا التأثير في البيانات الجزيئية كارتباط بين معدل إعادة التركيب المحلي والتنوع الجيني ، [34] والارتباط السلبي بين كثافة الجينات والتنوع في مناطق الحمض النووي غير المشفرة . [35] لا تتطابق العشوائية المرتبطة بالارتباط بالجينات الأخرى التي تخضع للاختيار مع خطأ أخذ العينات، وتُعرف أحيانًا باسم المسودة الجينية من أجل تمييزها عن الانجراف الجيني. [17]

إن انخفاض تواتر الأليلات يجعل الأليلات أكثر عرضة للزوال عن طريق الصدفة العشوائية، حتى مع التغلب على تأثير الانتقاء الطبيعي. على سبيل المثال، في حين يتم عادةً التخلص من الطفرات غير المواتية بسرعة داخل السكان، فإن الطفرات الجديدة المفيدة تكون معرضة للخسارة من خلال الانجراف الجيني تقريبًا مثل الطفرات المحايدة. لن يكون للانحراف الجيني أي تأثير إلا عندما يصل تواتر الأليل للطفرة المفيدة إلى حد معين. [30]

عنق الزجاجة السكاني

التغيرات في تردد الأليلات في السكان بعد حدوث عنق زجاجة سكاني : أدى الانخفاض السريع والجذري في حجم السكان إلى تقليل التنوع الجيني للسكان .

يحدث الاختناق السكاني عندما ينكمش عدد السكان إلى حجم أصغر بشكل ملحوظ خلال فترة زمنية قصيرة بسبب بعض الأحداث البيئية العشوائية. في الاختناق السكاني الحقيقي، تكون احتمالات بقاء أي عضو في السكان عشوائية تمامًا، ولا تتحسن بأي ميزة وراثية متأصلة معينة. يمكن أن يؤدي الاختناق السكاني إلى تغييرات جذرية في ترددات الأليلات، بشكل مستقل تمامًا عن الاختيار. [36]

يمكن أن يستمر تأثير عنق الزجاجة السكاني، حتى عندما يكون سبب عنق الزجاجة حدثًا لمرة واحدة مثل كارثة طبيعية. ومن الأمثلة المثيرة للاهتمام لعنق الزجاجة الذي يسبب توزيعًا وراثيًا غير عادي النسبة العالية نسبيًا من الأفراد المصابين بعمى الألوان الكلي في الخلايا القضيبية ( عمى الألوان ) في جزيرة بينجيلاب المرجانية في ميكرونيزيا . [37] بعد عنق الزجاجة، يزداد التزاوج الداخلي. وهذا يزيد من الضرر الناجم عن الطفرات الضارة المتنحية، في عملية تُعرف باسم اكتئاب التزاوج الداخلي . يتم اختيار أسوأ هذه الطفرات، مما يؤدي إلى فقدان الأليلات الأخرى المرتبطة بها وراثيًا ، في عملية اختيار الخلفية . [2] بالنسبة للطفرات الضارة المتنحية، يمكن تعزيز هذا الاختيار نتيجة لعنق الزجاجة، بسبب التطهير الجيني . وهذا يؤدي إلى المزيد من فقدان التنوع الجيني. بالإضافة إلى ذلك، فإن الانخفاض المستمر في حجم السكان يزيد من احتمالية حدوث المزيد من التقلبات في الأليلات بسبب الانجراف في الأجيال القادمة.

يمكن أن ينخفض ​​التنوع الجيني للسكان بشكل كبير بسبب الاختناق، وحتى التكيفات المفيدة قد يتم القضاء عليها بشكل دائم. [38] إن فقدان التنوع يجعل السكان الباقين عرضة لأي ضغوط انتقائية جديدة مثل المرض أو التغير المناخي أو التحول في مصدر الغذاء المتاح، لأن التكيف استجابة للتغيرات البيئية يتطلب تنوعًا جينيًا كافيًا في السكان لحدوث الانتقاء الطبيعي. [39] [40]

كانت هناك العديد من الحالات المعروفة لاختناق السكان في الماضي القريب. قبل وصول الأوروبيين ، كانت سهول أمريكا الشمالية موطنًا لملايين دجاج البراري الأكبر . في إلينوي وحدها، انخفضت أعدادهم من حوالي 100 مليون طائر في عام 1900 إلى حوالي 50 طائرًا في التسعينيات. نتج الانخفاض في عدد السكان عن الصيد وتدمير الموائل ، ولكن النتيجة كانت فقدان معظم التنوع الجيني للأنواع. يوثق تحليل الحمض النووي الذي يقارن الطيور من منتصف القرن بالطيور في التسعينيات انخفاضًا حادًا في التنوع الجيني في العقود القليلة الأخيرة فقط. حاليًا، يعاني دجاج البراري الأكبر من نجاح تكاثري منخفض . [41]

ومع ذلك، فإن الخسارة الجينية الناجمة عن الاختناق والانحراف الجيني يمكن أن تزيد من اللياقة البدنية، كما هو الحال في إيرليخيا . [42]

كما تسبب الإفراط في الصيد في حدوث اختناق سكاني شديد في الفقمة الفيلية الشمالية في القرن التاسع عشر. ويمكن استنتاج الانحدار الناتج في التنوع الجيني من خلال مقارنتها بالفقمة الفيلية الجنوبية ، والتي لم تتعرض للصيد العنيف. [43]

تأثير المؤسس

عندما يهاجر عدد قليل جدًا من أفراد مجموعة سكانية لتكوين مجموعة سكانية جديدة منفصلة، ​​يحدث تأثير المؤسس. لفترة ما بعد التأسيس، تتعرض المجموعة السكانية الصغيرة لانجراف مكثف. في الشكل، يؤدي هذا إلى تثبيت الأليل الأحمر.

إن تأثير المؤسس هو حالة خاصة من حالات الاختناق السكاني، والتي تحدث عندما تنفصل مجموعة صغيرة في مجموعة سكانية عن المجموعة السكانية الأصلية وتشكل مجموعة جديدة. ومن المتوقع أن تؤدي العينة العشوائية من الأليلات في المستعمرة الجديدة التي تم تشكيلها للتو إلى تشويه صورة المجموعة السكانية الأصلية بشكل كبير في بعض النواحي على الأقل. [44] ومن الممكن أيضًا أن يكون عدد الأليلات لبعض الجينات في المجموعة السكانية الأصلية أكبر من عدد نسخ الجينات في المؤسسين، مما يجعل التمثيل الكامل مستحيلًا. عندما تكون المستعمرة التي تم تشكيلها حديثًا صغيرة، يمكن لمؤسسيها التأثير بقوة على التركيبة الجينية للمجموعة السكانية في المستقبل البعيد.

تم العثور على مثال موثق جيدًا في هجرة الأميش إلى بنسلفانيا في عام 1744. شارك اثنان من أعضاء المستعمرة الجديدة في الأليل المتنحي لمتلازمة إليس فان كريفيلد . يميل أعضاء المستعمرة وذريتهم إلى العزلة الدينية ويبقون منعزلين نسبيًا. نتيجة لأجيال عديدة من التزاوج الداخلي، أصبحت متلازمة إليس فان كريفيلد الآن أكثر انتشارًا بين الأميش مقارنة بالسكان بشكل عام. [30] [45]

قد يؤدي الاختلاف في ترددات الجينات بين السكان الأصليين والمستعمرة أيضًا إلى تحفيز المجموعتين على التباعد بشكل كبير على مدار العديد من الأجيال. ومع زيادة الاختلاف أو المسافة الجينية ، قد يصبح السكان المنفصلان متميزين، وراثيًا وظاهريًا ، على الرغم من أن الانجراف الجيني ليس فقط ولكن أيضًا الانتقاء الطبيعي وتدفق الجينات والطفرة تساهم في هذا التباعد. دفعت هذه الإمكانية للتغيرات السريعة نسبيًا في تردد جينات المستعمرة معظم العلماء إلى اعتبار تأثير المؤسس (وبالتالي الانجراف الجيني) قوة دافعة مهمة في تطور الأنواع الجديدة . كان سيوال رايت أول من ربط هذه الأهمية بالانجراف العشوائي والسكان الصغار المعزولين حديثًا بنظريته المتوازنة المتغيرة للتطور. [46] بعد رايت، ابتكر إرنست ماير العديد من النماذج المقنعة لإظهار أن الانخفاض في التباين الجيني وحجم السكان الصغير بعد تأثير المؤسس كانا مهمين للغاية لتطور الأنواع الجديدة. [47] ومع ذلك، هناك دعم أقل بكثير لهذا الرأي اليوم حيث تم اختبار الفرضية مرارًا وتكرارًا من خلال البحث التجريبي وكانت النتائج غامضة في أفضل الأحوال. [48]

تاريخ

تم تحديد دور الصدفة العشوائية في التطور لأول مرة من قبل أريند إل هاجيدورن وآنا كورنيليا هاجيدورن فورستوفيل لا براند في عام 1921. [49] وأكدوا أن البقاء العشوائي يلعب دورًا رئيسيًا في فقدان التباين من السكان. استجاب فيشر (1922) لهذا الأمر بأول معالجة رياضية، وإن كانت غير صحيحة إلى حد ما، لـ "تأثير هاجيدورن". [50] ومن الجدير بالذكر أنه توقع أن العديد من السكان الطبيعيين كانوا أكبر من اللازم (N ~10000) بحيث تكون تأثيرات الانجراف كبيرة وكان يعتقد أن الانجراف سيكون له تأثير ضئيل على العملية التطورية. تمت صياغة المعالجة الرياضية المصححة ومصطلح "الانجراف الجيني" لاحقًا من قبل مؤسس علم الوراثة السكانية ، سيوال رايت . كان أول استخدام له لمصطلح "الانجراف" في عام 1929، [51] على الرغم من أنه كان يستخدمه في ذلك الوقت بمعنى عملية التغيير الموجهة، أو الانتقاء الطبيعي. وقد أصبح الانجراف العشوائي عن طريق الخطأ في أخذ العينات معروفًا باسم "تأثير سيوال-رايت"، على الرغم من أنه لم يكن مرتاحًا تمامًا لرؤية اسمه يُطلق عليه. أشار رايت إلى جميع التغييرات في تردد الأليل إما باعتبارها "انجرافًا ثابتًا" (على سبيل المثال، الانتقاء) أو "انجرافًا عشوائيًا" (على سبيل المثال، خطأ في أخذ العينات). [52] تم تبني "الانجراف" كمصطلح فني بالمعنى العشوائي حصريًا. [53] اليوم يتم تعريفه عادةً بشكل أضيق، من حيث خطأ أخذ العينات، [54] على الرغم من أن هذا التعريف الضيق ليس عالميًا. [55] [56] كتب رايت أن "تقييد" الانجراف العشوائي "أو حتى" الانجراف "بمكون واحد فقط، تأثيرات حوادث أخذ العينات، يميل إلى التسبب في الارتباك". [52] اعتبر سيوال-رايت عملية الانجراف الجيني العشوائي عن طريق خطأ أخذ العينات معادلة لتلك التي تحدث عن طريق التزاوج الداخلي، لكن أظهرت الأعمال اللاحقة أنهما متميزان. [57]

في الأيام الأولى للتطور التوليفي الحديث ، بدأ العلماء في دمج علم الوراثة السكانية الجديد مع نظرية تشارلز داروين في الانتقاء الطبيعي. وفي هذا الإطار، ركز رايت على تأثيرات التزاوج الداخلي على السكان المعزولين نسبيًا. وقد قدم مفهوم المناظر الطبيعية التكيفية حيث يمكن لظواهر مثل التهجين والانحراف الجيني في السكان الصغار أن تدفعهم بعيدًا عن قمم التكيف، مما يسمح بدوره للانتقاء الطبيعي بدفعهم نحو قمم تكيفية جديدة. [58] اعتقد رايت أن السكان الأصغر حجمًا أكثر ملاءمة للانتقاء الطبيعي لأن "التزاوج الداخلي كان مكثفًا بدرجة كافية لإنشاء أنظمة تفاعل جديدة من خلال الانجراف العشوائي ولكن ليس مكثفًا بدرجة كافية للتسبب في تثبيت عشوائي غير تكيفي للجينات". [59]

كانت آراء رايت حول دور الانجراف الوراثي في ​​المخطط التطوري مثيرة للجدل منذ البداية تقريبًا. وكان أحد أكثر المنتقدين صخبًا وتأثيرًا زميله رونالد فيشر. اعترف فيشر بأن الانجراف الوراثي لعب دورًا ما في التطور، ولكنه دور غير مهم. واتهم فيشر بسوء فهم آراء رايت لأنه بدا في انتقاداته وكأنه يزعم أن رايت رفض الانتقاء بالكامل تقريبًا. بالنسبة لفيشر، كان النظر إلى عملية التطور باعتبارها تقدمًا طويلًا وثابتًا وتكيفيًا هو السبيل الوحيد لتفسير التعقيد المتزايد باستمرار من الأشكال الأبسط. لكن المناقشات استمرت بين "التدريجيين" وأولئك الذين يميلون أكثر نحو نموذج رايت للتطور حيث يلعب الانتقاء والانجراف معًا دورًا مهمًا. [60]

في عام 1968، أعاد موتو كيمورا إشعال النقاش بنظريته المحايدة للتطور الجزيئي ، والتي تدعي أن معظم التغيرات الجينية ناجمة عن الانجراف الجيني الذي يعمل على الطفرات المحايدة. [5] [6]

وقد تعرض دور الانجراف الجيني عن طريق خطأ أخذ العينات في التطور لانتقادات جون إتش جيليسبي [61] وويليام ب. بروفين ، اللذان يزعمان أن الاختيار على المواقع المرتبطة يشكل قوة عشوائية أكثر أهمية.

انظر أيضا

الملاحظات والمراجع

  1. ^ جولد إس جيه (2002). "الفصل 7، القسم "التوليف كتصلب"". بنية نظرية التطور .
  2. ^ abc Masel J (أكتوبر 2011). "الانجراف الجيني". علم الأحياء الحالي . 21 (20). Cell Press : R837-8. Bibcode :2011CBio...21.R837M. doi : 10.1016/j.cub.2011.08.007 . PMID  22032182.
  3. ^ Star B, Spencer HG (مايو 2013). "تأثيرات الانجراف الجيني وتدفق الجينات على الصيانة الانتقائية للتنوع الجيني". علم الوراثة . 194 (1): 235–44. doi :10.1534/genetics.113.149781. PMC 3632471. PMID  23457235 . 
  4. ^ ميلر 2000، ص 54
  5. ^ ab Kimura M (فبراير 1968). "معدل التطور على المستوى الجزيئي". مجلة نيتشر . 217 (5129). مجموعة نيتشر للنشر: 624–6. رمز Bibcode :1968Natur.217..624K. doi :10.1038/217624a0. PMID  5637732. S2CID  4161261.
  6. ^ ab Futuyma 1998، ص 320
  7. ^ Stoltzfus A (1999). "حول إمكانية التطور المحايد البنّاء". مجلة التطور الجزيئي . 49 (2): 169–181. Bibcode :1999JMolE..49..169S. doi :10.1007/PL00006540. ISSN  0022-2844. PMID  10441669. S2CID  1743092. مؤرشف من الأصل في 30 يوليو 2022. تم الاسترجاع في 20 يناير 2022 .
  8. ^ Muñoz-Gómez SA، Bilolikar G، Wideman JG، Geiler-Samerotte K (أبريل 2021). "التطور المحايد البنّاء بعد 20 عامًا". مجلة التطور الجزيئي . 89 (3): 172-182. رمز Bibcode : 2021JMolE..89..172M. doi : 10.1007/s00239-021-09996-y. PMC 7982386. PMID  33604782. 
  9. ^ "خطأ أخذ العينات والتطور". فهم التطور . جامعة كاليفورنيا، بيركلي . مؤرشف من الأصل في 8 ديسمبر 2015. تم الاسترجاع في 1 ديسمبر 2015 .
  10. ^ Wahl LM (أغسطس 2011). "التثبيت عندما يختلف N وs: الأساليب الكلاسيكية تعطي نتائج جديدة أنيقة". علم الوراثة . 188 (4). جمعية علم الوراثة الأمريكية : 783-5. doi :10.1534/genetics.111.131748. PMC 3176088. PMID 21828279  . 
  11. ^ أب هارتل وكلارك 2007، ص. 112
  12. ^ تيان 2008، ص 11
  13. ^ موران با (1958). "العمليات العشوائية في علم الوراثة". الإجراءات الرياضية لجمعية كامبريدج الفلسفية . 54 (1): 60-71. رمز Bibcode :1958PCPS...54...60M. doi :10.1017/S0305004100033193. S2CID  85823386.
  14. ^ ab Charlesworth B (مارس 2009). "المفاهيم الأساسية في علم الوراثة: حجم السكان الفعال وأنماط التطور والتباين الجزيئي". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 10 (3). مجموعة النشر الطبيعية : 195-205. doi :10.1038/nrg2526. PMID  19204717. S2CID  205484393.
  15. ^ Der R, Epstein CL , Plotkin JB (سبتمبر 2011). "Generalized population models and the nature of genetic drift". Theoretical Population Biology . 80 (2). Elsevier : 80–99. Bibcode :2011TPBio..80...80D. doi :10.1016/j.tpb.2011.06.004. PMID  21718713.
  16. ^ لي و جراور 1991، ص 28
  17. ^ abc Gillespie JH (نوفمبر 2001). "هل حجم تعداد الأنواع له علاقة بتطورها؟". التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 55 (11). جون وايلي وأولاده لصالح جمعية دراسة التطور : 2161-9. doi : 10.1111/j.0014-3820.2001.tb00732.x . PMID  11794777. S2CID  221735887.
  18. ^ Neher RA, Shraiman BI (أغسطس 2011). "Genetic draft and quasi-neutrality in large facultatively sexual populations". Genetics . 188 (4). Genetics Society of America: 975–96. arXiv : 1108.1635 . doi :10.1534/genetics.111.128876. PMC 3176096. PMID 21625002  . 
  19. ^ إيوينز 2004
  20. ^ لي و جراور 1991، ص 29
  21. ^ بارتون وآخرون. 2007، ص 417
  22. ^ فوتويما 1998، ص 300
  23. ^ Otto SP , Whitlock MC (June 1997). "احتمالية التثبيت في مجموعات ذات حجم متغير" (PDF) . علم الوراثة . 146 (2). جمعية علم الوراثة الأمريكية: 723–33. doi :10.1093/genetics/146.2.723. PMC 1208011. PMID  9178020. مؤرشف من الأصل (PDF) في 19 مارس 2015. 
  24. ^ Cutter AD, Choi JY (أغسطس 2010). "الانتقاء الطبيعي يشكل تعدد أشكال النوكليوتيدات عبر جينوم الدودة الخيطية Caenorhabditis briggsae". Genome Research . 20 (8). Cold Spring Harbor Laboratory Press : 1103–11. doi :10.1101/gr.104331.109. PMC 2909573. PMID  20508143 . 
  25. ^ هيدريك 2005، ص 315
  26. ^ لي و جراور 1991، ص 33
  27. ^ كيمورا وأوتا 1971
  28. ^ Masel J ، King OD، Maughan H (يناير 2007). "فقدان المرونة التكيفية أثناء فترات طويلة من الركود البيئي". عالم الطبيعة الأمريكي . 169 (1). مطبعة جامعة شيكاغو نيابة عن الجمعية الأمريكية لعلماء الطبيعة : 38-46. doi :10.1086/510212. PMC 1766558. PMID  17206583 . 
  29. ^ "الانتقاء الطبيعي: كيف يعمل التطور". Actionbioscience . واشنطن العاصمة: المعهد الأمريكي للعلوم البيولوجية . مؤرشف من الأصل في 6 يناير 2010. تم الاسترجاع في 24 نوفمبر 2009 .مقابلة مع دوغلاس ج. فوتويما . انظر إجابة السؤال: هل الانتقاء الطبيعي هو الآلية الوحيدة للتطور؟
  30. ^ اي بي سي كافالي سفورزا، مينوزي وبياتزا 1996
  31. ^ زيمر 2001
  32. ^ جولدينج 1994، ص 46
  33. ^ Charlesworth B, Morgan MT, Charlesworth D (August 1993). "The effect of ruineriousmutations on neutral molecular variation" (PDF) . علم الوراثة . 134 (4). جمعية علم الوراثة الأمريكية: 1289–303. doi : 10.1093/genetics/134.4.1289. PMC 1205596. PMID  8375663. مؤرشف من الأصل (PDF) في 12 مارس 2020. تم الاسترجاع في 9 ديسمبر 2015 . 
  34. ^ Presgraves DC (سبتمبر 2005). "إعادة التركيب تعزز تكيف البروتين في ذبابة الفاكهة". علم الأحياء الحالي . 15 (18). Cell Press: 1651–6. Bibcode :2005CBio...15.1651P. doi : 10.1016/j.cub.2005.07.065 . PMID  16169487. S2CID  15120927.
  35. ^ Nordborg M، Hu TT، Ishino Y، Jhaveri J، Toomajian C، Zheng H، Bakker E، Calabrese P، Gladstone J، Goyal R، Jakobsson M، Kim S، Morozov Y، Padhukasahasram B، Plagnol V، Rosenberg NA، Shah سي، وول جي دي، وانغ جيه، تشاو كيه، كالبفليش تي، شولز في، كريتمان م، بيرجلسون جي (يوليو 2005). “نمط تعدد الأشكال في الأرابيدوبسيس ثاليانا”. بلوس علم الأحياء . 3 (7). المكتبة العامة للعلوم : e196. دوى : 10.1371/journal.pbio.0030196 . بمك 1135296 . بميد  15907155.  أيقونة الوصول المفتوح
  36. ^ روبنسون ر، محرر (2003). "عنق الزجاجة السكاني" . علم الوراثة . المجلد 3. نيويورك: ماكميلان ريفرنس الولايات المتحدة الأمريكية . رقم ISBN 0-02-865609-1. LCCN  2002003560. OCLC  614996575. تم الاسترجاع في 14 ديسمبر 2015 .
  37. ^ Hussels IE, Morton NE (مايو 1972). "جزر بينجيلاب وموكيل المرجانية: عدم وضوح الرؤية". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 24 (3): 304–309. PMC 1762260. PMID  4555088 . 
  38. ^ فوتويما 1998، ص 303-304
  39. ^ O'Corry-Crowe G (مارس 2008). "تغير المناخ والبيئة الجزيئية للثدييات البحرية في القطب الشمالي". التطبيقات البيئية . 18 (ملحق 2). الجمعية البيئية الأمريكية : S56-76. رمز Bibcode : 2008EcoAp..18S..56O. doi : 10.1890/06-0795.1 . PMID  18494363.
  40. ^ Cornuet JM, Luikart G (ديسمبر 1996). "وصف وتحليل قوة اختبارين للكشف عن الاختناقات السكانية الحديثة من بيانات تردد الأليل". علم الوراثة . 144 (4). جمعية علم الوراثة الأمريكية: 2001-14. doi :10.1093/genetics/144.4.2001. PMC 1207747. PMID  8978083 . 
  41. ^ Sadava et al. 2008، الفصول 1، 21-33، 52-57
  42. ^ ديل سي، موران إن إيه (أغسطس 2006). "التفاعلات الجزيئية بين الكائنات الحية المتعايشة مع بعضها ومضيفيها". الخلية . 126 (3): 453–65. doi : 10.1016/j.cell.2006.07.014 . PMID  16901780. S2CID  15985536.
  43. ^ "الاختناقات وتأثيرات المؤسس". فهم التطور . جامعة كاليفورنيا، بيركلي. مؤرشف من الأصل في 4 ديسمبر 2015. تم الاسترجاع في 14 ديسمبر 2015 .
  44. ^ كامبل 1996، ص 423
  45. ^ "الانجراف الجيني وتأثير المؤسس". مكتبة التطور (مصدر على شبكة الإنترنت). التطور. بوسطن، ماساتشوستس: مؤسسة دبليو جي بي إتش التعليمية ؛ شركة كلير بلو سكاي للإنتاج، 2001. OCLC  48165595. مؤرشف من الأصل في 14 مارس 2009. تم الاسترجاع في 7 أبريل 2009 .
  46. ^ وولف، برودي وويد 2000
  47. ^ مرحباً، فيتش وأيالا 2005
  48. ^ هوارد وبيرلوشر 1998
  49. ^ Hagedoorn AL, Hagedoorn-Vorstheuvel La Brand AC (1921). القيمة النسبية للعمليات المسببة للتطور. لاهاي: مارتينوس نيجهوف. مؤرشف من الأصل في 28 مارس 2019. تم الاسترجاع في 28 مارس 2019 .
  50. ^ Fisher RA (1922). "حول نسبة الهيمنة". وقائع الجمعية الملكية في إدنبرة . 42 : 321-341. doi :10.1017/s0370164600023993.
  51. ^ رايت س (نوفمبر-ديسمبر 1929). "تطور الهيمنة". عالم الطبيعة الأمريكي . 63 (689). شيكاغو، إلينوي: مطبعة جامعة شيكاغو نيابة عن الجمعية الأمريكية لعلماء الطبيعة: 556-561. doi :10.1086/280290. ISSN  0003-0147. JSTOR  2456825. S2CID  85301374.
  52. ^ ab Wright S (1955). "تصنيف عوامل التطور". ندوات كولد سبرينج هاربور حول علم الأحياء الكمي . 20. Cold Spring Harbor Laboratory Press: 16–24D. doi :10.1101/SQB.1955.020.01.004. PMID  13433551.ندوة: "علم الوراثة السكانية: طبيعة وأسباب التباين الوراثي في ​​السكان".
  53. ^ ستيفنسون 1991
  54. ^ فريمان وهيرون 2007
  55. ^ Masel J (أغسطس 2012). "إعادة التفكير في نظرية هاردي-واينبرج والانحراف الجيني في علم الأحياء الجامعي". BioEssays . 34 (8). John Wiley & Sons: 701–710. doi :10.1002/bies.201100178. PMID  22576789. S2CID  28513167.
  56. ^ لينش 2007
  57. ^ Crow JF (مارس 2010). "Wright and Fisher on inbreeding and random drift". Genetics . 184 (3). Genetics Society of America: 609–611. doi :10.1534/genetics.109.110023. PMC 2845331. PMID 20332416  . 
  58. ^ لارسون 2004، ص 221-243
  59. ^ ستيفنسون 1991: اقتباس منسوب إلى ويليام ب. بروفين في أصول علم الوراثة السكانية النظري (1971)، ص 162؛ شيكاغو: مطبعة جامعة شيكاغو.
  60. ^ أفيرز 1989
  61. ^ Gillespie JH (يونيو 2000). "الانجراف الجيني في عدد سكاني لا نهائي. نموذج التهجين الزائف". علم الوراثة . 155 (2). جمعية علم الوراثة الأمريكية: 909-919. doi :10.1093/genetics/155.2.909. PMC 1461093. PMID 10835409  . 

فهرس

  • Sheehy, Bob. "Population genetics simulator program". Radford, VA: Radford University . تم الاسترجاع في 21 ديسمبر 2015 .
  • جرايمز، بيل. "محاكاة الانجراف الجيني". توسان، أريزونا: جامعة أريزونا . تم الاسترجاع في 25 أغسطس 2016 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Genetic_drift&oldid=1251744699"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate