جداول كودونات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA

جدول كودونات الحمض النووي الريبي القياسي مُنظم على شكل عجلة

يمكن استخدام جدول الكودونات لترجمة الشفرة الوراثية إلى تسلسل من الأحماض الأمينية . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} تُمثَّل الشفرة الوراثية القياسية تقليديًا بجدول كودونات الحمض النووي الريبوزي (RNA )، لأنه عند تصنيع البروتينات في الخلية بواسطة الريبوسومات ، يكون الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) هو الذي يُوجِّه عملية تخليق البروتين . ^[²^]^[³^] يُحدَّد تسلسل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بواسطة تسلسل الحمض النووي الجينومي (DNA ). ^[⁴^] في هذا السياق، يُشار إلى الشفرة الوراثية القياسية باسم "جدول الترجمة 1" من بين جداول أخرى . ^[³^] يمكن أيضًا تمثيلها في جدول كودونات الحمض النووي (DNA). تقع كودونات الحمض النووي (DNA) في هذه الجداول على شريط الحمض النووي (DNA) ذي الاتجاه الموجب، وتُرتَّب في اتجاه 5 ′ إلى 3 ′ . تُستخدم جداول مختلفة تحتوي على كودونات بديلة اعتمادًا على مصدر الشفرة الوراثية، مثل نواة الخلية ، أو الميتوكوندريا ، أو البلاستيدات ، أو الهيدروجينوسوم . ^[⁵^]

يحتوي الكودون الوراثي، الموضح في الجداول أدناه، على 64 كودونًا مختلفًا؛ يُحدد معظمها حمضًا أمينيًا. ^{[ 6 ]} أما التسلسلات الثلاثة UAG وUGA وUAA، والمعروفة بكودونات التوقف ، ^{[ ملاحظة 1 ]} فلا تُشفّر حمضًا أمينيًا، بل تُشير إلى تحرر عديد الببتيد الوليد من الريبوسوم. ^{[ 7 ]} في الكود القياسي، يُمكن أن يعمل التسلسل AUG - الذي يُقرأ ميثيونين - ككودون بدء ، ويُحفز عملية الترجمة، إلى جانب تسلسلات أخرى مثل عامل البدء . ^{[ 3 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} في حالات نادرة، قد تتضمن كودونات البدء في الكود القياسي أيضًا GUG أو UUG؛ تُمثل هذه الكودونات عادةً الفالين والليوسين على التوالي، ولكن عند استخدامها ككودونات بدء ، تُترجم إلى ميثيونين أو فورميل ميثيونين . ^{[ 3 ]}^{[ 10 ]}

يُرتَّب الجدول/العجلة الكلاسيكي للشيفرة الوراثية القياسية بشكلٍ اعتباطي بناءً على موقع الكودون الأول. وقد أظهر ساير ^{[ 12 ]} ، استنادًا إلى ملاحظات موتو ^{[ 13 ]} ، أن إعادة تنظيم العجلة بناءً على موقع الكودون الثاني (وإعادة ترتيب الكودونات من UCAG إلى UCGA) يُحسِّن ترتيب الكودونات وفقًا لكراهية الماء للأحماض الأمينية المُشفَّرة. وهذا يُشير إلى أن الريبوسومات المبكرة تقرأ موقع الكودون الثاني بعناية فائقة، للتحكم في أنماط كراهية الماء في تسلسلات البروتين.

يمكن استخدام الجدول الأول - الجدول القياسي - لترجمة ثلاثيات النيوكليوتيدات إلى الحمض الأميني المقابل أو الإشارة المناسبة إذا كان كودون بدء أو توقف. أما الجدول الثاني، والذي يُسمى الجدول العكسي، فيقوم بالعكس: إذ يمكن استخدامه لاستنتاج رمز ثلاثي محتمل إذا كان الحمض الأميني معروفًا. ولأن عدة كودونات قد تُشفّر نفس الحمض الأميني، يُستخدم في بعض الحالات ترميز الأحماض النووية الخاص بالاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) .

جدول الترجمة 1

جدول كودونات الحمض النووي الريبي القياسي

الخصائص البيوكيميائية للأحماض الأمينية	غير قطبي (np)	قطبي (ص)	أساسي (ب)	حمضي (أ)		إنهاء العملية: كودون التوقف *		بدء الترجمة: كودون البدء المحتمل ⇒

الشفرة الوراثية القياسية ^{[ 1 ]}^{[ 14 ]}
القاعدة الأولى	القاعدة الثانية								القاعدة الثالثة
القاعدة الأولى	يو		ج		أ		جي		القاعدة الثالثة
يو	UUU	(Phe/F) فينيل ألانين (np)	UCU	(Ser/S) سيرين (p)	UAU	(Tyr/Y) تيروسين (p)	يو جي يو	(Cys/C) سيستين (p)	يو
	UUC	(Phe/F) فينيل ألانين (np)	جامعة كورك		UAC	(Tyr/Y) تيروسين (p)	المحتوى الذي ينشئه المستخدمون	(Cys/C) سيستين (p)	ج
	UUA	(Leu/L) الليوسين (np)	جامعة آسيا الوسطى		جامعة ألاسكا أنكوريج	توقف ( أوكر ) * ^{[ الملاحظة 2 ]}	جامعة جورجيا	توقف ( أوبال ) * ^{[ ملاحظة 2 ]}	أ
	UUG ⇒		التبول الليلي		UAG	توقف ( كهرماني ) * ^{[ ملاحظة 2 ]}	يو جي جي	(Trp/W) تريبتوفان (np)	جي
ج	CUU		وحدة العناية المركزة	(Pro/P) برولين (np)	جامعة كاج	(His/H) الهيستيدين (ب)	جامعة كليفلاند جورنال	(Arg/R) أرجينين (ب)	يو
	CUC		CCC		CAC	(His/H) الهيستيدين (ب)	CGC		ج
	CUA		CCA		هيئة الطيران المدني	(Gln/Q) غلوتامين (p)	محاسب قانوني معتمد		أ
	CUG		مجموعة التكليف السريري		مراقب الحسابات المركزي	(Gln/Q) غلوتامين (p)	CGG		جي
أ	جامعة أوبافيمي أوروبية	(Ile/I) إيزولوسين (np)	وحدة مكافحة الإرهاب	(Thr/T) ثريونين (p)	الاتحاد الرياضي الجامعي	(Asn/N) أسباراجين (p)	الاتحاد الجيوفيزيائي الأمريكي	(Ser/S) سيرين (p)	يو
	AUC		ACC		التواصل المعزز والبديل	(Asn/N) أسباراجين (p)	AGC	(Ser/S) سيرين (p)	ج
	جامعة أركنساس		قانون الرعاية الصحية الميسرة		AAA	(Lys/K) ليسين (ب)	أجا	(Arg/R) أرجينين (ب)	أ
	أغسطس ⇒	(Met/M) ميثيونين (np)	ACG		مساعد المدعي العام	(Lys/K) ليسين (ب)	AGG	(Arg/R) أرجينين (ب)	جي
جي	غوو	(Val/V) فالين (np)	جامعة غلاسكو	(Ala/A) ألانين (np)	GAU	(Asp/D) حمض الأسبارتيك (أ)	GGU	(Gly/G) جليسين (np)	يو
	GUC		مجلس التعاون الخليجي		GAC	(Asp/D) حمض الأسبارتيك (أ)	جي جي سي		ج
	غوا		GCA		رابطة الألعاب الرياضية الغيلية	(Glu/E) حمض الجلوتاميك (أ)	جي جي إيه		أ
	GUG ⇒		جي سي جي		أسكت	(Glu/E) حمض الجلوتاميك (أ)	GGG		جي

كما هو موضح في الجدول أعلاه، يتضمن الجدول 1 في NCBI كودونات البدء الأقل شيوعًا GUG و UUG. ^{[ 3 ]}

جدول الكودونات العكسي للحمض النووي الريبي

جدول عكسي للرمز الجيني القياسي (مضغوط باستخدام ترميز IUPAC ) ^{[ 17 ]}

حمض أميني	كودونات الحمض النووي الريبي	مضغوط		حمض أميني	كودونات الحمض النووي الريبي	مضغوط
ألا، أ	جامعة غلاسكو، مجلس التعاون الخليجي، كلية غلاسكو للفنون، كلية غلاسكو للهندسة	GCN		إيلي، أنا	AUU، AUC، AUA	أبو
أرج، ر	CGU، CGC، CGA، CGG؛ AGA، AGG	CGN، AGR؛ أو CGY، MGR		ليو، ل	CUU، CUC، CUA، CUG؛ UUA، UUG	CUN, UUR; أو CUY, YUR
آسن، ن	AAU، AAC	AAY		ليس، ك	AAA، AAG	تقرير ما بعد الحدث
أسب، د	GAU، GAC	مثلي الجنس		ميت، م	أغسطس
Asn أو Asp، B	AAU، AAC؛ GAU، GAC	راي		في، ف	UUU, UUC	UUY
سيستئين، ج	UGU، UGC	UGY		برو، ب	وحدة العناية المركزة، وحدة العناية المركزة، وحدة العناية المركزة للأطفال، مجموعة العناية المركزة	شبكة سي إن إن
جلين، كيو	هيئة الطيران المدني، مراقب الحركة الجوية	سيارة		سير، إس	UCU، UCC، UCA، UCG؛ AGU، AGC	UCN، AGY
جلو، E	GAA، GAG	غار		ثر، تي	ACU، ACC، ACA، ACG	ACN
غلوتامين أو غلوتامات، Z	CAA، CAG؛ GAA، GAG	سار		تريب، غرب	يو جي جي
جلي، جي	GGU، GGC، GGA، GGG	GGN		تير، واي	UAU، UAC	UAY
له، ح	جامعة الصين الزراعية، جامعة الصين الزراعية	كاي		فال، في	غوو، غوك، غوا، غوغ	بندقية
يبدأ	أغسطس، جامعة كاليفورنيا، جامعة كاليفورنيا	حضن	قف	UAA، UGA، UAG	URA، UAG؛ أو UGA، UAR

جدول كودونات الحمض النووي القياسي

الخصائص البيوكيميائية للأحماض الأمينية	غير قطبي (np)	قطبي (ص)	أساسي (ب)	حمضي (أ)		إنهاء العملية: كودون التوقف *		بدء الترجمة: كودون البدء المحتمل ⇒

الشفرة الوراثية القياسية ^{[ 18 ]}^{[ ملاحظة 3 ]}
القاعدة الأولى	القاعدة الثانية								القاعدة الثالثة
القاعدة الأولى	تي		ج		أ		جي		القاعدة الثالثة
تي	TTT	(Phe/F) فينيل ألانين (np)	TCT	(Ser/S) سيرين (p)	TAT	(Tyr/Y) تيروسين (p)	TGT	(Cys/C) سيستين (p)	تي
	TTC	(Phe/F) فينيل ألانين (np)	TCC		تاك	(Tyr/Y) تيروسين (p)	تي جي سي	(Cys/C) سيستين (p)	ج
	TTA	(Leu/L) الليوسين (np)	TCA		تي إيه إيه	توقف ( أوكر ) * ^{[ الملاحظة 2 ]}	TGA	توقف ( أوبال ) * ^{[ ملاحظة 2 ]}	أ
	تي تي جي ⇒		لعبة بطاقات التداول		الوسم	توقف ( كهرماني ) * ^{[ ملاحظة 2 ]}	TGG	(Trp/W) تريبتوفان (np)	جي
ج	CTT		CCT	(Pro/P) برولين (np)	قطة	(His/H) الهيستيدين (ب)	ضريبة أرباح رأس المال	(Arg/R) أرجينين (ب)	تي
	سي تي سي		CCC		CAC	(His/H) الهيستيدين (ب)	CGC		ج
	دعوة للعمل		CCA		هيئة الطيران المدني	(Gln/Q) غلوتامين (p)	محاسب قانوني معتمد		أ
	CTG		مجموعة التكليف السريري		مراقب الحسابات المركزي	(Gln/Q) غلوتامين (p)	CGG		جي
أ	AT&T	(Ile/I) إيزولوسين (np)	يمثل	(Thr/T) ثريونين (p)	AAT	(Asn/N) أسباراجين (p)	AGT	(Ser/S) سيرين (p)	تي
	مراقبة الحركة الجوية		ACC		التواصل المعزز والبديل	(Asn/N) أسباراجين (p)	AGC	(Ser/S) سيرين (p)	ج
	ATA		قانون الرعاية الصحية الميسرة		AAA	(Lys/K) ليسين (ب)	أجا	(Arg/R) أرجينين (ب)	أ
	ATG ⇒	(Met/M) ميثيونين (np)	ACG		مساعد المدعي العام	(Lys/K) ليسين (ب)	AGG	(Arg/R) أرجينين (ب)	جي
جي	جي تي تي	(Val/V) فالين (np)	GCT	(Ala/A) ألانين (np)	بوابة	(Asp/D) حمض الأسبارتيك (أ)	جي جي تي	(Gly/G) جليسين (np)	تي
	GTC		مجلس التعاون الخليجي		GAC	(Asp/D) حمض الأسبارتيك (أ)	جي جي سي		ج
	لعبة GTA		GCA		رابطة الألعاب الرياضية الغيلية	(Glu/E) حمض الجلوتاميك (أ)	جي جي إيه		أ
	GTG ⇒		جي سي جي		أسكت	(Glu/E) حمض الجلوتاميك (أ)	GGG		جي

جدول الكودونات العكسي للحمض النووي

جدول عكسي للرمز الجيني القياسي (مضغوط باستخدام ترميز IUPAC ) ^{[ 17 ]}

حمض أميني	كودونات الحمض النووي	مضغوط		حمض أميني	كودونات الحمض النووي	مضغوط
ألا، أ	GCT، GCC، GCA، GCG	GCN		إيلي، أنا	ATT، ATC، ATA	رياضي
أرج، ر	CGT، CGC، CGA، CGG؛ AGA، AGG	CGN، AGR؛ أو CGY، MGR		ليو، ل	CTT، CTC، CTA، CTG؛ TTA، TTG	CTN، TTR؛ أو CTY، YTR
آسن، ن	AAT، AAC	AAY		ليس، ك	AAA، AAG	تقرير ما بعد الحدث
أسب، د	GAT، GAC	مثلي الجنس		ميت، م	ATG
Asn أو Asp، B	AAT، AAC؛ GAT، GAC	راي		في، ف	TTT، TTC	TTY
سيستئين، ج	TGT، TGC	تي جي واي		برو، ب	CCT، CCC، CCA، CCG	شبكة سي إن إن
جلين، كيو	هيئة الطيران المدني، مراقب الحركة الجوية	سيارة		سير، إس	TCT، TCC، TCA، TCG؛ AGT، AGC	TCN، AGY
جلو، E	GAA، GAG	غار		ثر، تي	ACT، ACC، ACA، ACG	ACN
غلوتامين أو غلوتامات، Z	CAA، CAG؛ GAA، GAG	سار		تريب، غرب	TGG
جلي، جي	GGT، GGC، GGA، GGG	GGN		تير، واي	TAT، TAC	تاي
له، ح	CAT، CAC	كاي		فال، في	جي تي تي، جي تي سي، جي تي إيه، جي تي جي	GTN
يبدأ	ATG، TTG، GTG، CTG ^{[ 20 ]}	إن تي جي	قف	TAA، TGA، TAG	ترا، تار

الكودونات البديلة في جداول الترجمة الأخرى

كان يُعتقد سابقًا أن الشفرة الوراثية عالمية: ^{[ 21 ]} حيث يُشفّر الكودون الواحد نفس الحمض الأميني بغض النظر عن الكائن الحي أو مصدره. ومع ذلك، يُتفق الآن على أن الشفرة الوراثية تتطور، ^{[ 22 ]} مما يؤدي إلى اختلافات في كيفية ترجمة الكودون اعتمادًا على المصدر الوراثي. ^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} على سبيل المثال، في عام 1981، اكتُشف أن استخدام الكودونات AUA وUGA وAGA وAGG بواسطة نظام الترميز في ميتوكوندريا الثدييات يختلف عن الشفرة العالمية. ^{[ 21 ]} يمكن أن تتأثر كودونات التوقف أيضًا: في الأوليات الهدبية ، تُشفّر كودونات التوقف العالمية UAA وUAG الجلوتامين. ^{[ 22 ]}^{[ ملاحظة 4 ]} اكتشف شولجينا وإيدي أربعة أكواد وراثية بديلة جديدة (مرقمة هنا من 34 إلى 37) في الجينومات البكتيرية، كاشفين بذلك عن أول تغييرات في كودونات المعنى في البكتيريا. ^{[ 23 ]} يعرض الجدول التالي هذه الكودونات البديلة.

الخصائص البيوكيميائية للأحماض الأمينية	غير قطبي (np)	قطبي (ص)	أساسي (ب)	حمضي (أ)		إنهاء العملية: كودون التوقف *

مقارنة بين ترجمات الكودونات باستخدام الشفرات الوراثية البديلة والقياسية ^{[ 3 ]}^{[ 23 ]}
شفرة	جدول الترجمة	الكودون المتضمن في الحمض النووي	الكودون RNA المتضمن	الترجمة باستخدام هذا الرمز			الترجمة القياسية	ملحوظات
معيار	1							يتضمن جدول الترجمة 8 ( بلاستيدات النبات ).
الميتوكوندريا الفقارية	2	أجا	أجا	قف *			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	قف *			Arg (R) (b)
		ATA	جامعة أركنساس	ميت (م) (نب)			Ile (I) (np)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
ميتوكوندريا الخميرة	3	ATA	جامعة أركنساس	ميت (م) (نب)			Ile (I) (np)
		CTT	CUU	ثر (ت) (ص)			ليو (L) (np)
		سي تي سي	CUC	ثر (ت) (ص)			ليو (L) (np)
		دعوة للعمل	CUA	ثر (ت) (ص)			ليو (L) (np)
		CTG	CUG	ثر (ت) (ص)			ليو (L) (np)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
		محاسب قانوني معتمد	محاسب قانوني معتمد	غائب			Arg (R) (b)
		CGC	CGC	غائب			Arg (R) (b)
العفن، والأوالي، والميتوكوندريا المعوية + الميكوبلازما / السبيروبلازما	4	TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *	يتضمن جدول الترجمة 7 ( الكينيتوبلاستات ).
الميتوكوندريا اللافقارية	5	أجا	أجا	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		ATA	جامعة أركنساس	ميت (م) (نب)			Ile (I) (np)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
الهدبيات، والداسيكلاداسيا، والهيكساميتا النووية	6	تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	Gln (Q) (p)			قف *
الهدبيات، والداسيكلاداسيا، والهيكساميتا النووية	6	الوسم	UAG	Gln (Q) (p)			قف *
الميتوكوندريا في شوكيات الجلد والديدان المسطحة	9	AAA	AAA	Asn (N) (p)			Lys (K) (b)
		أجا	أجا	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
النواة اليوبلوتيدية	10	TGA	جامعة جورجيا	Cys (C) (p)			قف *
البلاستيدات البكتيرية والأثرية والنباتية	11							انظر جدول الترجمة 1 .
الخميرة البديلة النووية	12	CTG	CUG	سير (S) (p)			ليو (L) (np)
الميتوكوندريا الأسيدية	13	أجا	أجا	غلي (G) (np)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	غلي (G) (np)			Arg (R) (b)
		ATA	جامعة أركنساس	ميت (م) (نب)			Ile (I) (np)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
الميتوكوندريا البديلة للديدان المسطحة	14	AAA	AAA	Asn (N) (p)			Lys (K) (b)
		أجا	أجا	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	تير (Y) (p)			قف *
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
جفن نووي	15	الوسم	UAG	Gln (Q) (p)			قف *	اعتبارًا من 18 نوفمبر 2016: غير موجود في تحديث المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). مشابه لجدول الترجمة رقم 6 .
الميتوكوندريا في الطحالب الخضراء	16	الوسم	UAG	ليو (L) (np)			قف *
الميتوكوندريا المثقوبة	21	TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
		ATA	جامعة أركنساس	ميت (م) (نب)			Ile (I) (np)
		أجا	أجا	سير (S)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		AAA	AAA	Asn (N) (p)			Lys (K) (b)
Scenedesmus المائل الميتوكوندريا	22	TCA	جامعة آسيا الوسطى	قف *			سير (S) (p)
Scenedesmus المائل الميتوكوندريا	22	الوسم	UAG	ليو (L) (np)			قف *
ثراستوشيتريوم ميتوكوندريا	23	TTA	UUA	قف *			ليو (L) (np)	على غرار جدول الترجمة رقم 11 .
الميتوكوندريا بتيروبرانشيا	24	أجا	أجا	سير (S) (p)			Arg (R) (b)
		AGG	AGG	Lys (K) (b)			Arg (R) (b)
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
القسم المرشح SR1 والبكتيريا الرشيقة	25	TGA	جامعة جورجيا	غلي (G) (np)			قف *
Pachysolen tannophilus nuclear	26	CTG	CUG	ألا (أ) (ن.ب)			ليو (L) (np)
النواة المتبقية	27	تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	Gln (Q) (p)			قف *
		الوسم	UAG	Gln (Q) (p)			قف *
		TGA	جامعة جورجيا	قف *	أو	Trp (W) (np)	قف *
كونديلوستوما نووية	28	تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	قف *	أو	Gln (Q) (p)	قف *
		الوسم	UAG	قف *	أو	Gln (Q) (p)	قف *
		TGA	جامعة جورجيا	قف *	أو	Trp (W) (np)	قف *
ميزودينيوم نووي	29	تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	تير (Y) (p)			قف *
ميزودينيوم نووي	29	الوسم	UAG	تير (Y) (p)			قف *
نووي بيريتريك	30	مساعد تدريس	جامعة ألاسكا أنكوريج	Glu (E) (a)			قف *
نووي بيريتريك	30	الوسم	UAG	Glu (E) (a)			قف *
نووية البلاستوكريتيديا	31	تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	قف *	أو	Glu (E) (a)	قف *
		الوسم	UAG	قف *	أو	Glu (E) (a)	قف *
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
الشفرة الميتوكوندرية لعائلة سيفالوديسيداي	33	أجا	أجا	سير (S) (p)			Arg (R) (b)	على غرار جدول الترجمة رقم 24 .
		AGG	AGG	Lys (K) (b)			Arg (R) (b)
		تي إيه إيه	جامعة ألاسكا أنكوريج	تير (Y) (p)			قف *
		TGA	جامعة جورجيا	Trp (W) (np)			قف *
الأمعاء	34	AGG	AGG	ميت (م) (نب)			Arg (R) (b)
بيبتاسيتوباكتر	35	CGG	CGG	Gln (Q) (p)			Arg (R) (b)
اللاهوائية والأونثوفيفينس	36	CGG	CGG	Trp (W) (np)			Arg (R) (b)
أبسكونديتابكتيراليس	37	محاسب قانوني معتمد	محاسب قانوني معتمد	Trp (W) (np)			Arg (R) (b)
		CGG	CGG	Trp (W) (np)			Arg (R) (b)
		TGA	جامعة جورجيا	غلي (G) (np)			قف *

انظر أيضاً

ملحوظات

↑ لكل كودون توقف اسم محدد: UAG هو كهرماني ، وUGA هو أوبال ، وUAA هو مغرة ،^{[ 7 ]} (أحيانًايُستخدم اسم أوبر بدلًا من أوبال لـ UGA ).^{[ 8 ]} في الحمض النووي، تكون كودونات التوقف هذه هي TAG وTGA وTAA، على التوالي.
1 2 3 4 5 6 تم وصف الأساس التاريخي لتسمية كودونات التوقف بالعنبر والأوكر والأوبال في السيرة الذاتية لسيدني برينر ^{[ 15 ]} وفي مقال تاريخي لبوب إدغار.^{[ 16 ]}
↑ الفرق الرئيسي بين الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA هو أن الثايمين (T) موجود فقط في الأول، بينما يُستبدل باليوراسيل (U) في الحمض النووي الريبوزي RNA.^{[ 19 ]} هذا هو الفرق الوحيد بين جدول الشفرات القياسي للحمض النووي الريبوزي RNA وجدول الشفرات القياسي للحمض النووي DNA.
↑ يُعدّ Euplotes octacarinatus استثناءً.^{[ 22 ]}

مراجع

1 2 "جدول ترجمة الأحماض الأمينية" . جامعة ولاية أوريغون. مؤرشف من الأصل في 29 مايو 2020. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2020 .
١ ٢ بارتي، ليزا؛ بروك، جاك. بيولوجيا ١١٢ في كلية ماونت هود المجتمعية: البيولوجيا للمهن الصحية . أوبن أوريغون. ص ٤٢. مؤرشف من الأصل في ٦ ديسمبر ٢٠٢٠. تم الاسترجاع في ٦ ديسمبر ٢٠٢٠ .
1 2 3 4 5 6 إلزانوفسكي أ، أوستيل ج (7 يناير 2019). "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية. مؤرشف من الأصل في 5 أكتوبر 2020. تم الاطلاع عليه في 21 فبراير 2019 .
↑ "وظائف الحمض النووي الريبوزي" . سايتيبل . نيتشر إديوكيشن. مؤرشف من الأصل في 18 أكتوبر 2008. تم الاطلاع عليه في 5 يناير 2021 .
↑ "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية. مؤرشف من الأصل في 13 مايو 2011. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2020 .
↑ "الكودون" . المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . مؤرشف من الأصل في 22 أكتوبر 2020. تم الاطلاع عليه في 10 أكتوبر 2020 .
1 2 مالوي، س. (29 نوفمبر 2003). "كيف سُميت الطفرات غير المنطقية" . دورة علم الوراثة الميكروبية . جامعة ولاية سان دييغو. مؤرشف من الأصل في 23 سبتمبر 2020. تم الاسترجاع في 10 أكتوبر 2020 .
↑ ستانلي مالوي: كودون أومبر
↑ هينيبوش إيه جي (2011). " الآلية الجزيئية للمسح واختيار كودون البدء في حقيقيات النوى" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 75 (3): 434-467 . doi : 10.1128/MMBR.00008-11 . PMC 3165540. PMID 21885680 .
1 2 توريول سي، بورنيس إس، بونال إس، أوديجييه إس، براتس إتش، براتس إيه سي، فاغنر إس (2003). "توليد تنوع أشكال البروتين عن طريق بدء الترجمة البديل عند كودونات غير كودون AUG" . بيولوجيا الخلية . 95 ( 3-4 ): 169-178 . doi : 10.1016/S0248-4900(03)00033-9 . PMID 12867081 .
↑ بانديوبادياي، ديباشري؛ ميهلر، إرنست ل. (أغسطس 2008). "التعبير الكمي عن عدم تجانس البروتين: استجابة السلاسل الجانبية للأحماض الأمينية لبيئتها المحلية". البروتينات . 72 (2): 646-59 . doi : 10.1002/prot.21958 . PMID 18247345 .
↑ ساير، ميلتون هـ. الابن (10 يوليو 2019). "فهم الشفرة الوراثية" . مجلة علم البكتيريا . 201 (15): e00091-19. doi : 10.1128/JB.00091-19 . PMC 6620406. PMID 31010904 .
↑ موتو، أ.؛ أوساوا، س. (يناير 1987). "محتوى الجوانين والسيتوزين في الحمض النووي الجينومي وتطور البكتيريا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 84 ( 1): 166-169 . Bibcode : 1987PNAS...84..166M . doi : 10.1073/pnas.84.1.166 . PMC 304163. PMID 3467347 .
↑ "المعلومات الموجودة في الحمض النووي تحدد وظيفة الخلية عبر الترجمة" . Scitable . Nature Education. مؤرشف من الأصل في 23 سبتمبر 2017. تم الاطلاع عليه في 5 ديسمبر 2020 .
↑ برينر، سيدني؛ وولبرت، لويس (2001). حياة في العلم . بيوميد سنترال المحدودة. الصفحات 101-104 . ISBN 9780954027803.
↑ إدغار ب (2004). "جينوم العاثية T4: حفر أثري" . علم الوراثة . 168 (2): 575-82 . doi : 10.1093/genetics/168.2.575 . PMC 1448817. PMID 15514035 . انظر الصفحات 580-581
١ ٢ لجنة التسمية الكيميائية الحيوية التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) والاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUB). "الاختصارات والرموز للأحماض النووية، والبولينوكليوتيدات، ومكوناتها" (ملف PDF) . الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية. مؤرشف (ملف PDF) من الأصل في ٩ يوليو ٢٠٢١. تم الاطلاع عليه في ٥ ديسمبر ٢٠٢٠ .
↑ "ماذا يفعل الحمض النووي؟" . جينومك . مرحباً بك في حرم الجينوم. مؤرشف من الأصل في 29 نوفمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 12 يناير 2021 .
↑ "الجينات" . الحمض النووي، وعلم الوراثة، والتطور . جامعة بوسطن. مؤرشف من الأصل في 28 أبريل 2020. تم الاطلاع عليه في 10 ديسمبر 2020 .
↑ "اختر كودون البدء" . depts.washington.edu . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2024 .
1 2 3 أوساوا، أ. (نوفمبر 1993). "التغيرات التطورية في الشفرة الوراثية". الكيمياء الحيوية المقارنة وعلم وظائف الأعضاء . 106 (2): 489-94 . doi : 10.1016/0305-0491(93)90122-l . PMID 8281749 .
1 2 3 4 أوساوا إس، جوكس تي إتش، واتانابي كيه، موتو إيه (مارس 1992). "أدلة حديثة على تطور الشفرة الوراثية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 56 (1): 229-264 . Bibcode : 1992MbRev..56..229O . doi : 10.1128/MR.56.1.229-264.1992 . PMC 372862. PMID 1579111 .
شولغينا ، يكاترينا؛ إيدي، شون ر . (9 نوفمبر 2021). "فحص حاسوبي للرموز الجينية البديلة في أكثر من 250,000 جينوم" . eLife . 10 e71402 . doi : 10.7554/eLife.71402 . PMC 8629427. PMID 34751130 .

للمزيد من القراءة

شيفانس، إف. في.، وهيوز، ك. ت. (2 مايو 2017). "حجة تدعم فكرة أن الشفرة الوراثية ثلاثية من ثلاثيات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 114 (18): 4745-4750 . Bibcode : 2017PNAS..114.4745C . doi : 10.1073/pnas.1614896114 . JSTOR 26481868. PMC 5422812. PMID 28416671 .
ديفر ، تي إي (29 يونيو 2012). "بداية جديدة لتخليق البروتين" . مجلة ساينس . 336 (6089). الجمعية الأمريكية لتقدم العلوم: 1645-1646 . رمز Bibcode : 2012Sci...336.1645D . doi : 10.1126/science.1224439 . JSTOR 41585146. PMID 22745408. S2CID 44326947. مؤرشف من الأصل في 8 يونيو 2022. تم الاطلاع عليه في 17 أكتوبر 2020 .
غاردنر، آر إس، وهبة، إيه جيه، باسيلو، سي، ميلر، آر إس، لينجيل، بي، سباير، جيه إف (ديسمبر 1962). "البولينوكليوتيدات الاصطناعية وشفرة الأحماض الأمينية. الجزء السابع" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 48 (12): 2087-2094 . Bibcode : 1962PNAS...48.2087G . doi : 10.1073 / pnas.48.12.2087 . PMC 221128. PMID 13946552 .
ناكاموتو تي (مارس 2009). "التطور وعالمية آلية بدء تخليق البروتين". جين . 432 ( 1-2 ): 1-6 . doi : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . PMID 19056476 .
وهبة، أ. ج.، غاردنر، ر. س.، باسيلو، س.، ميلر، ر. س.، سباير، ج. ف.، لينجيل، ب. (يناير 1963). "البولينوكليوتيدات الاصطناعية وشفرة الأحماض الأمينية. الجزء الثامن" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 49 (1): 116-122 . Bibcode : 1963PNAS...49..116W . doi : 10.1073/pnas.49.1.116 . PMC 300638. PMID 13998282 .
يانوفسكي ، سي (9 مارس 2007). "إثبات الطبيعة الثلاثية للشفرة الوراثية" . مجلة الخلية . 128 (5): 815-818 . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.029 . PMID 17350564. S2CID 14249277 .
زانفيلد ج، حمادي م، سويوكا ن، نايت ر (28 فبراير 2009). "مستكشف الكودون: قاعدة بيانات تفاعلية على الإنترنت لتحليل استخدام الكودونات وتكوين التسلسل". المعلوماتية الحيوية لتحليل تسلسل الحمض النووي . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 537. الصفحات 207-232 . doi : 10.1007/978-1-59745-251-9_10 . ISBN 978-1-58829-910-9. PMC 2953947 . PMID 19378146 .

روابط خارجية

مخطط كودونات الحمض النووي منظم على شكل عجلة

[9] لكل كودون توقف اسم محدد: UAG هو كهرماني ، وUGA هو أوبال ، وUAA هو مغرة ،^{[ 7 ]} (أحيانًايُستخدم اسم أوبر بدلًا من أوبال لـ UGA ).^{[ 8 ]} في الحمض النووي، تكون كودونات التوقف هذه هي TAG وTGA وTAA، على التوالي.

[historical-18] 1 2 3 4 5 6 تم وصف الأساس التاريخي لتسمية كودونات التوقف بالعنبر والأوكر والأوبال في السيرة الذاتية لسيدني برينر ^{[ 15 ]} وفي مقال تاريخي لبوب إدغار.^{[ 16 ]}

[22] الفرق الرئيسي بين الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA هو أن الثايمين (T) موجود فقط في الأول، بينما يُستبدل باليوراسيل (U) في الحمض النووي الريبوزي RNA.^{[ 19 ]} هذا هو الفرق الوحيد بين جدول الشفرات القياسي للحمض النووي الريبوزي RNA وجدول الشفرات القياسي للحمض النووي DNA.

[26] يُعدّ Euplotes octacarinatus استثناءً.^{[ 22 ]}

[RNA_codon_table-1] 1 2 "جدول ترجمة الأحماض الأمينية" . جامعة ولاية أوريغون. مؤرشف من الأصل في 29 مايو 2020. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2020 .

[oregon-2] ١ ٢ بارتي، ليزا؛ بروك، جاك. بيولوجيا ١١٢ في كلية ماونت هود المجتمعية: البيولوجيا للمهن الصحية . أوبن أوريغون. ص ٤٢. مؤرشف من الأصل في ٦ ديسمبر ٢٠٢٠. تم الاسترجاع في ٦ ديسمبر ٢٠٢٠ .

[geneticcodes-3] 1 2 3 4 5 6 إلزانوفسكي أ، أوستيل ج (7 يناير 2019). "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية. مؤرشف من الأصل في 5 أكتوبر 2020. تم الاطلاع عليه في 21 فبراير 2019 .

[4] "وظائف الحمض النووي الريبوزي" . سايتيبل . نيتشر إديوكيشن. مؤرشف من الأصل في 18 أكتوبر 2008. تم الاطلاع عليه في 5 يناير 2021 .

[5] "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية. مؤرشف من الأصل في 13 مايو 2011. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2020 .

[6] "الكودون" . المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . مؤرشف من الأصل في 22 أكتوبر 2020. تم الاطلاع عليه في 10 أكتوبر 2020 .

[stop-7] 1 2 مالوي، س. (29 نوفمبر 2003). "كيف سُميت الطفرات غير المنطقية" . دورة علم الوراثة الميكروبية . جامعة ولاية سان دييغو. مؤرشف من الأصل في 23 سبتمبر 2020. تم الاسترجاع في 10 أكتوبر 2020 .

[8] ستانلي مالوي: كودون أومبر

[10] هينيبوش إيه جي (2011). " الآلية الجزيئية للمسح واختيار كودون البدء في حقيقيات النوى" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 75 (3): 434-467 . doi : 10.1128/MMBR.00008-11 . PMC 3165540. PMID 21885680 .

[pmid12867081-11] 1 2 توريول سي، بورنيس إس، بونال إس، أوديجييه إس، براتس إتش، براتس إيه سي، فاغنر إس (2003). "توليد تنوع أشكال البروتين عن طريق بدء الترجمة البديل عند كودونات غير كودون AUG" . بيولوجيا الخلية . 95 ( 3-4 ): 169-178 . doi : 10.1016/S0248-4900(03)00033-9 . PMID 12867081 .

[12] بانديوبادياي، ديباشري؛ ميهلر، إرنست ل. (أغسطس 2008). "التعبير الكمي عن عدم تجانس البروتين: استجابة السلاسل الجانبية للأحماض الأمينية لبيئتها المحلية". البروتينات . 72 (2): 646-59 . doi : 10.1002/prot.21958 . PMID 18247345 .

[13] ساير، ميلتون هـ. الابن (10 يوليو 2019). "فهم الشفرة الوراثية" . مجلة علم البكتيريا . 201 (15): e00091-19. doi : 10.1128/JB.00091-19 . PMC 6620406. PMID 31010904 .

[14] موتو، أ.؛ أوساوا، س. (يناير 1987). "محتوى الجوانين والسيتوزين في الحمض النووي الجينومي وتطور البكتيريا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 84 ( 1): 166-169 . Bibcode : 1987PNAS...84..166M . doi : 10.1073/pnas.84.1.166 . PMC 304163. PMID 3467347 .

[15] "المعلومات الموجودة في الحمض النووي تحدد وظيفة الخلية عبر الترجمة" . Scitable . Nature Education. مؤرشف من الأصل في 23 سبتمبر 2017. تم الاطلاع عليه في 5 ديسمبر 2020 .

[16] برينر، سيدني؛ وولبرت، لويس (2001). حياة في العلم . بيوميد سنترال المحدودة. الصفحات 101-104 . ISBN 9780954027803.

[pmid15514035-17] إدغار ب (2004). "جينوم العاثية T4: حفر أثري" . علم الوراثة . 168 (2): 575-82 . doi : 10.1093/genetics/168.2.575 . PMC 1448817. PMID 15514035 . انظر الصفحات 580-581

[iupac-19] ١ ٢ لجنة التسمية الكيميائية الحيوية التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) والاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUB). "الاختصارات والرموز للأحماض النووية، والبولينوكليوتيدات، ومكوناتها" (ملف PDF) . الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية. مؤرشف (ملف PDF) من الأصل في ٩ يوليو ٢٠٢١. تم الاطلاع عليه في ٥ ديسمبر ٢٠٢٠ .

[20] "ماذا يفعل الحمض النووي؟" . جينومك . مرحباً بك في حرم الجينوم. مؤرشف من الأصل في 29 نوفمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 12 يناير 2021 .

[21] "الجينات" . الحمض النووي، وعلم الوراثة، والتطور . جامعة بوسطن. مؤرشف من الأصل في 28 أبريل 2020. تم الاطلاع عليه في 10 ديسمبر 2020 .

[23] "اختر كودون البدء" . depts.washington.edu . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2024 .

[evolve1-24] 1 2 3 أوساوا، أ. (نوفمبر 1993). "التغيرات التطورية في الشفرة الوراثية". الكيمياء الحيوية المقارنة وعلم وظائف الأعضاء . 106 (2): 489-94 . doi : 10.1016/0305-0491(93)90122-l . PMID 8281749 .

[evolve2-25] 1 2 3 4 أوساوا إس، جوكس تي إتش، واتانابي كيه، موتو إيه (مارس 1992). "أدلة حديثة على تطور الشفرة الوراثية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 56 (1): 229-264 . Bibcode : 1992MbRev..56..229O . doi : 10.1128/MR.56.1.229-264.1992 . PMC 372862. PMID 1579111 .

[Shulgina-27] شولغينا ، يكاترينا؛ إيدي، شون ر . (9 نوفمبر 2021). "فحص حاسوبي للرموز الجينية البديلة في أكثر من 250,000 جينوم" . eLife . 10 e71402 . doi : 10.7554/eLife.71402 . PMC 8629427. PMID 34751130 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[

[

[

[ 6 ]

[ ملاحظة 1 ]

[ 7 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ الملاحظة 2 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ ملاحظة 3 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ ملاحظة 4 ]

[ 23 ]

[ 8 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 19 ]

اللغة	العربية (RTL)
روابط موسوعية	30 رابطاً
المصدر الأصلي	ويكيبيديا ↗