المجموعة النمطية E (mtDNA)
| المجموعة النمطية E | |
|---|---|
| الوقت المحتمل للأصل | 35000 [1] إلى 8000 [2] YBP |
| مكان المنشأ المحتمل | شرق ساندالاند [1] أو ساحل فوجيان [2] |
| سلف | م9 |
| الأحفاد | ه1، ه2 |
| تعريف الطفرات | 3027، 3705، 7598، 13626، 16390 [3] |
في علم الوراثة البشرية للميتوكوندريا ، تعتبر المجموعة الفرعية E مجموعة فرعية من الحمض النووي للميتوكوندريا البشرية (mtDNA) النموذجية لأرخبيل الملايو . وهي مجموعة فرعية من المجموعة الفرعية M9 .
أصل
تم تقديم اقتراحين متناقضين لموقع ووقت أصل المجموعة الفرعية E. أحد الآراء هو أن المجموعة الفرعية تشكلت منذ أكثر من 30000 عام، في وقت الذروة الجليدية الأخيرة ، على الساحل الشمالي الشرقي لسوندالاند (بالقرب من بورنيو الحديثة ). في هذا النموذج، تشتت المجموعة الفرعية بسبب ارتفاع مستويات سطح البحر خلال العصر الجليدي المتأخر . [1] [4]
في عام 2014، وجد أن الحمض النووي للميتوكوندريا لهيكل عظمي عمره 8000 عام عُثر عليه في جزيرة ليانغ ، إحدى جزر ماتسو قبالة ساحل جنوب شرق الصين، ينتمي إلى المجموعة الفرعية E، مع اثنتين من الطفرات الأربع المميزة للمجموعة الفرعية E1. ومن هذا، يزعم كو وزملاؤه أن المجموعة الفرعية E نشأت منذ 8000 إلى 11000 عام بالقرب من ساحل فوجيان الشمالي ، وسافرت إلى تايوان مع مستوطنين من العصر الحجري الحديث منذ 6000 عام، ومن هناك انتشرت إلى جنوب شرق آسيا البحري مع انتشار اللغة الأسترونيزية . [2] يحذر سواريس وآخرون من المبالغة في التأكيد على عينة واحدة، ويؤكدون أن الساعة الجزيئية الثابتة تعني أن التاريخ الأقدم (والأصل الأكثر جنوبًا) يظل أكثر احتمالية. [5]
توزيع
توجد المجموعة النمطية E في جميع أنحاء جنوب شرق آسيا البحرية . [4] وهي غائبة تقريبًا عن شرق آسيا القارية، حيث تنتشر مجموعتها الشقيقة M9a (الموجودة أيضًا في اليابان). [4] [6] على وجه الخصوص ، توجد بين متحدثي اللغات الأسترونيزية ، وهي نادرة حتى في جنوب شرق آسيا بين متحدثي عائلات لغوية أخرى. تم اكتشافها في سكان تايوان والفلبين وإندونيسيا وماليزيا (بما في ذلك صباح في بورنيو ، ولكن ليس أورانغ أصلي في شبه جزيرة ماليزيا)، وبابوا غينيا الجديدة الساحلية ، وخاصة في شعب تشامورو في جزر ماريانا . [4] [ 7] [8] [9] [10] [11]
من بين الفروع الفرعية الرئيسية الأربعة، تم العثور على E1b وE2a بشكل أساسي في جنوب شرق آسيا البحري، بينما تم العثور على E1a وE2b فقط في تايوان أيضًا. [12] تتمتع E2b بتنوع منخفض داخل تايوان، مما يشير إلى أنها وصلت إلى هناك منذ حوالي 5000 عام. [12] تتمتع الفرع الفرعي E الأكثر شيوعًا، E1a1a، بأعلى تنوع في تايوان، تليها الفلبين وسولاويزي. علاوة على ذلك، تقتصر الفروع الأخرى من E1a1 إلى حد كبير على تايوان. [13]
| سكان | تكرار | عدد | مصدر | الأنواع الفرعية |
|---|---|---|---|---|
| الشامورو (85 غوام ، 14 سايبان ، و6 روتا ) | 0.924 | 105 | فيلار وآخرون 2013 | E2a=68، E1a2=29 |
| شرق إندونيسيا ( سولاويزي ، بما في ذلك 89 مانادو ، 64 توراجا ، 46 أوجونج بادانج ، و38 بالو ) | 0.266 | 237 | هيل وآخرون 2007 | E1a=42، E1b=9، E2=7، E1(xE1a، E1b)=5 |
| الفلبينية ( مينداناو ) | 0.214 | 70 | طبادا وآخرون 2010، ص 24 | E1a1a=10، E2(xE2b)=4، E1b=1 |
| الفلبينية ( فيساياس ) | 0.214 | 112 | طبادا وآخرون 2010، ص 24 | E1a1a=18، E2(xE2b)=5، E1(xE1a1a، E1a2، E1b)=1 |
| شرق إندونيسيا ( أمبون ) | 0.163 | 43 | هيل وآخرون 2007 | E1(xE1a, E1b)=3, E1a=2, E2=2 |
| شرق إندونيسيا ( وينجابو ، سومبا ) | 0.160 | 50 | هيل وآخرون 2007 | E1b=6، E1a=1، E2=1 |
| الإندونيسية ( بانجكا ) | 0.147 | 34 | هيل وآخرون 2006 | ع=5 |
| بورنيو (89 بانجارماسين ، 68 كوتا كينابالو ) | 0.146 | 157 | هيل وآخرون 2007 | E1a=14، E2=5، E1b=3، E1(xE1a، E1b)=1 |
| فلبيني | 0.125 | 64 | طبادا وآخرون 2010، ص 24 | E1a1a=5، E2(xE2b)=2، E1a2=1 |
| الفلبينية ( لوزون ) | 0.124 | 177 | طبادا وآخرون 2010، ص 24 | E1a1a=14، E1b=5، E2(xE2b)=2، E2b=1 |
| تايوان (السكان الأصليين) | 0.120 | 640 | بنغ وآخرون 2011 | ع=77 |
| شرق إندونيسيا ( ألور ) | 0.111 | 45 | هيل وآخرون 2007 | E1a=3، E1b=2 |
| شرق إندونيسيا ( ماتارام ، لومبوك ) | 0.091 | 44 | هيل وآخرون 2007 | E1b=3، E1a=1 |
| الإندونيسية ( بادانج ، سومطرة ) | 0.083 | 24 | هيل وآخرون 2006 | ع=2 |
| الإندونيسية ( ميدان ، سومطرة ) | 0.071 | 42 | هيل وآخرون 2006 | ع=3 |
| الإندونيسية ( بيكانبارو ، ميدان ، بانجكا ، باليمبانج ، وبادانج ) | 0.067 | 180 | هيل وآخرون 2007 | E1a=6، E1b=4، E1(xE1a، E1b)=1، E2=1 |
| الإندونيسية ( بالي ) | 0.061 | 82 | هيل وآخرون 2007 | E1a=3، E1b=1، E1(xE1a، E1b)=1 |
| الفلبينية ( بالاوان ) | 0.050 | 20 | شولز وآخرون 2011 | ه1أ=1 |
| الإندونيسية ( باليمبانج ، سومطرة ) | 0.036 | 28 | هيل وآخرون 2006 | ع=1 |
| توجيا ( مقاطعة يانهي ، قويتشو ) | 0.034 | 29 | لي وآخرون 2007 | ع=1 |
| جيلاو (مقاطعة داوزين، قويتشو) | 0.032 | 31 | لي وآخرون 2007 | ع=1 |
| الإندونيسية ( جافا ، بما في ذلك 36 من تنغر ) | 0.022 | 46 | هيل وآخرون 2007 | ه1ب=1 |
| الإندونيسية ( بيكانبارو ، سومطرة ) | 0.019 | 52 | هيل وآخرون 2006 | ع=1 |
| تشام ( بينه ثوين ، فيتنام ) | 0.012 | 168 | بنغ وآخرون 2010 | E1a1a=1، E2a=1 |
| كارولينيان ( سايبان ) | 0.000 | 17 | فيلار وآخرون 2013 | - |
| يي ( مقاطعة هيزهانج ، قويتشو ) | 0.000 | 20 | لي وآخرون 2007 | - |
| دونغ ( مقاطعة تيانتشو، قويتشو ) | 0.000 | 28 | لي وآخرون 2007 | - |
| باتيك ( ماليزيا ) | 0.000 | 29 | هيل وآخرون 2006 | - |
| كون ( هاينان ) | 0.000 | 30 | بنغ وآخرون 2011 | - |
| باتاك ( بالاوان ) | 0.000 | 31 | شولز وآخرون 2011 | - |
| لينجاو ( هاينان ) | 0.000 | 31 | بنغ وآخرون 2011 | - |
| مندريك ( ماليزيا ) | 0.000 | 32 | هيل وآخرون 2006 | - |
| تيموان ( ماليزيا ) | 0.000 | 33 | هيل وآخرون 2006 | - |
| دنجا ( هاينان ) | 0.000 | 40 | بنغ وآخرون 2011 | - |
| جهاي ( ماليزيا ) | 0.000 | 51 | هيل وآخرون 2006 | - |
| سينوي ( ماليزيا ) | 0.000 | 52 | هيل وآخرون 2006 | - |
| سيملاي ( ماليزيا ) | 0.000 | 61 | هيل وآخرون 2006 | - |
| جيلاو (مقاطعة داوزين، قويتشو) | 0.000 | 102 | ليو وآخرون 2011 | - |
| لي ( هاينان ) | 0.000 | 346 | بنغ وآخرون 2011 | - |
الفروع الفرعية
تعتمد هذه الشجرة التطورية للمجموعات الفرعية من النمط E على الورقة البحثية التي كتبها مانيس فان أوفن ومانفريد كايزر بعنوان " الشجرة التطورية الشاملة المحدثة للتنوع العالمي في الحمض النووي للميتوكوندريا البشرية" [3] والأبحاث المنشورة اللاحقة.
- هـ
- ه1
- ه1أ
- ه1أ1
- إي1أ1أ
- إي1أ1أ1
- إي1أ1أ
- ه1أ2
- ه1أ1
- ه1ب
- ه1ب1
- ه1أ
- هـ2
- إي 2 أ
- إي 2 ب
- إي2ب1
- إي2بي2
- ه1
انظر أيضا
- اختبار الحمض النووي للأنساب
- علم الأنساب الوراثي
- علم الوراثة للميتوكوندريا البشرية
- علم الوراثة السكانية
- مجموعات هابلوغروب الحمض النووي للميتوكوندريا البشرية
|
شجرة التطور للمجموعات النمطية للحمض النووي للميتوكوندريا البشرية (mtDNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| حواء الميتوكوندريا ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ل0 | ل1-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ل1 | ل2 | ل3 | ل4 | ل5 | ل6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| م | ن | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| تشيكوسلوفاكيا | د | هـ | ج | س | ا | أ | س | ر | أنا | و | إكس | ي | |||||||||||||||||||||||||||
| ج | ز | ب | ف | ر0 | قبل JT | ص | و | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| قيمة عالية | جيه تي | ك | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ح | الخامس | ج | ت | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
مراجع
- ^ اي بي سي سواريس وآخرون 2008، ص. 1215.
- ^ abc Ko وآخرون 2014.
- ^ ab van Oven & Kayser 2008.
- ^ abcd هيل وآخرون 2007.
- ^ سواريس وآخرون 2016.
- ^ تريجوت وآخرون 2005.
- ^ تبادا وآخرون 2010، ص 24 ، 28.
- ^ بنغ وآخرون 2010.
- ^ هيل وآخرون 2006.
- ^ فيلار وآخرون 2013.
- ^ بنغ وآخرون 2011.
- ^ أ ب سواريس وآخرون 2008، ص. 1213.
- ^ طبادا وآخرون 2010، ص 29.
- هيل، كاثرين. سواريس، بيدرو؛ مورمينا، مارو؛ ماكولاي، فنسنت؛ ميهان، وليام. بلاكبيرن، جيمس؛ كلارك، دوغلاس. رجا، جوزيف ماريبا؛ إسماعيل، فاطمة؛ بولبيك، ديفيد؛ أوبنهايمر، ستيفن. ريتشاردز، مارتن (2006). “جغرافيا الجغرافيا والتكوين العرقي للسكان الأصليين في جنوب شرق آسيا”. البيولوجيا الجزيئية والتطور . 23 (12): 2480-2491. دوى : 10.1093/مولبيف/msl124 . اتش دي ال : 1885/23220 . بميد 16982817.
- هيل، كاثرين؛ سواريس، بيدرو؛ مورمينا، مارو؛ ماكولاي، فينسينت؛ كلارك، دوجي؛ بلومباك، بيتيا بي؛ فيزويت فورستر، ماثيو؛ فورستر، بيتر؛ بولبيك، ديفيد؛ أوبنهايمر، ستيفن؛ ريتشاردز، مارتن (2007). "الطبقات الميتوكوندريا لجزر جنوب شرق آسيا". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 80 (1): 29-43. doi :10.1086/510412. PMC 1876738. PMID 17160892 .
- كو، ألبرت مين شان؛ تشين، تشونغ يو؛ فو، كياومي؛ دلفين، فريدريك؛ لي، مينغكون؛ تشيو، هونغ لين؛ ستونكينج، مارك؛ كو، ينغ تشين (2014). "الأسترونيزيون الأوائل: داخل وخارج تايوان". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 94 (3): 426-436. doi :10.1016/j.ajhg.2014.02.003. PMC 3951936. PMID 24607387 .
- لي بينبين. تشونغ، فوجوانغ؛ يي، هونغ شنغ؛ وانغ، شيانران؛ لي، ليانغفانغ؛ وانغ، ليلان؛ تشي، شياولان؛ وو، ليفو (2007). “تعدد الأشكال الجيني للحمض النووي للميتوكوندريا في السكان العرقيين دونغ وجيلاو وتوجيا ويي من قويتشو، الصين”. مجلة علم الوراثة وعلم الجينوم . 34 (9): 800-811. دوى :10.1016/S1673-8527(07)60091-5. بميد 17884690.
- ليو، تشانغ؛ وانغ، شا يان؛ تشاو، ميان؛ شو، تشي يونغ؛ هو، يو هوا؛ تشن فنغ. تشانغ، روان تشانغ؛ جاو، قوه فنغ؛ يو، يو شنغ؛ كونغ، تشينغ بينغ (2011). “تعدد أشكال الحمض النووي للميتوكوندريا في مجموعة جيلاو العرقية المقيمة في جنوب غرب الصين”. علوم الطب الشرعي الدولية: علم الوراثة . 5 (1): PE4 – E10. دوى :10.1016/j.fsigen.2010.04.007. بميد 20494640.
- بنغ، مين شينغ؛ كوانغ، هوي هو؛ دانج، خوا فام؛ تريو، آن فو؛ وانغ، هوا وي؛ ياو، يونج جانج؛ كونغ، تشينج بينج؛ تشانغ، يا بينج (2010). "تتبع البصمة الأسترونيزية في جنوب شرق آسيا: منظور من الحمض النووي للميتوكوندريا". علم الأحياء الجزيئي والتطور . 27 (10): 2417-2430. doi : 10.1093/molbev/msq131 . PMID 20513740.
- بنغ، مين شينغ؛ هي، جون دونغ؛ ليو، هاي شين؛ تشانغ، يا بينج (2011). "تتبع إرث سكان جزيرة هاينان الأوائل - منظور من الحمض النووي للميتوكوندريا". علم الأحياء التطوري BMC . 11 (46): 46. رمز Bibcode : 2011BMCEE..11...46P. doi : 10.1186/1471-2148-11-46 . PMC 3048540. PMID 21324107 .
- سكولز، كلاريسا؛ سيدل، كاثرين؛ دوكورنو، أكسل؛ كريفيلارو، فيديريكا؛ يارفي، ماري؛ روتسي، سيري؛ بيلاتي، ماجي. تبادا، كريستينا؛ مورمينا، مارو؛ ريدلا، ميري؛ فيلمز، ريتشارد؛ كيفيسيلد، توماس؛ لار، مارتا ميرازون؛ ميجليانو وأندريا بامبرج (2011). “التنوع الوراثي والأدلة على الاختلاط السكاني في باتاك نيجريتوس من بالاوان”. المجلة الأمريكية للأنثروبولوجيا الفيزيائية . 146 (1): 62-72. دوى :10.1002/ajpa.21544. بميد 21796613.
- سواريس، بيدرو؛ تريجوت، جان آلان؛ لو، جون-هون؛ هيل، كاثرين. مورمينا، مارو؛ لي، شين ليانغ؛ تشن ياو مينغ. هودجاشوف، جورجي؛ فورستر، بيتر. ماكولاي، فنسنت؛ بولبيك، ديفيد؛ أوبنهايمر، ستيفن. لين ماري. ريتشاردز، مارتن ب. (2008). “تغير المناخ والتشتت البشري بعد العصر الجليدي في جنوب شرق آسيا”. البيولوجيا الجزيئية والتطور . 25 (6): 1209-1218. دوى : 10.1093/molbev/msn068 . بميد 18359946.
- سواريس، بيدرو أ؛ تريجوت، جان أ؛ ريتو، تيريزا. كافاداس، برونو؛ هيل، كاثرين. المهندس كين خونج. مورمينا، مارو؛ برانداو، أندريا؛ فريزر، روس م. وانغ، تسي يي؛ لو، جون-هون؛ سنيل، كريستوفر. كو، تسانغ مينغ؛ أموريم، أنطونيو؛ بالا، ماريا؛ ماكولاي، فنسنت؛ بولبيك، ديفيد؛ ويلسون، جيمس ف. جوسماو، ليونور؛ بيريرا، لويزا؛ أوبنهايمر، ستيفن. لين ماري. ريتشاردز، مارتن ب. (2016). “حل أصل السكان الناطقين باللغة الأسترونيزية”. الوراثة البشرية . 135 (3): 309-326. دوى :10.1007/s00439-015-1620-z. PMC 4757630 . PMID 26781090.
- تبادا، كريستينا أ؛ تريجوت، جان؛ لو، جون-هون؛ تشن ياو مينغ. لين ماري. ميرازون لار، مارتا؛ كيفيسيلد، توماس؛ دي أنجريا، ماريا كورازون أ. (2010). “تنوع الحمض النووي للميتوكوندريا الفلبينية: جسر مأهول بالسكان بين تايوان وإندونيسيا؟”. البيولوجيا الجزيئية والتطور . 27 (1): 21-31. دوى : 10.1093/مولبيف/msp215 . بميد 19755666.
- Trejaut، Jean A.؛ Kivisild، Toomas؛ Loo، Jun Hun؛ Lee، Chien Liang؛ He، Chun Lin؛ Hsu، Chia Jung؛ Lee، Zheng Yuan؛ Lin، Marie (2005). "آثار الأنساب الميتوكوندريا القديمة لا تزال قائمة في السكان الفورموسيين الناطقين باللغة الأسترونيزية". PLOS Biology . 3 (8). e247. doi : 10.1371/journal.pbio.0030247 . PMC 1166350. PMID 15984912 .
- فان أوفن، مانيس؛ كايزر، مانفريد (2008). "الشجرة التطورية الشاملة المحدثة للتنوع العالمي في الحمض النووي للميتوكوندريا البشرية". الطفرة البشرية . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
- فيلار، ميغيل جي. تشان، شيم دبليو. سانتوس، دانا ر.؛ لينش، دانيال. سباتيس، ريتا؛ جاروتو، رالف م. لوم، ج. كوجي (2013). “الأصول والتميز الجيني لشامورو جزر ماريانا: منظور mtDNA”. المجلة الأمريكية لعلم الأحياء البشري . 25 (1): 116-122. دوى :10.1002/ajhb.22349. بمك 4335639 . بميد 23180676.
روابط خارجية
- عام
- شجرة فيلوتية من تصميم مانيس فان أوفن
- المجموعة النمطية E
- مجموعة هابلوغروب E لإيان لوجان
- المجموعة الوراثية E1 لإيان لوجان
- المجموعة الوراثية E1a1b لإيان لوجان
- المجموعة الوراثية E1a2 لإيان لوجان
- مجموعة هابلوغروب E2 لإيان لوجان
- مجموعة هابلوغروب E من YFull MTree
- مجموعة هابلوغروب E من MITOMAP
- شجرة هابلو تري للميتوكوندريا من FamilyTreeDNA: المجموعة النمطية E
- Ballinger, SW; Schurr, TG; Torroni, A.; Gan, YY; Hodge, JA; Hassan, K.; Chen, KH; Wallace, DC (1992). "تحليل الحمض النووي للميتوكوندريا في جنوب شرق آسيا يكشف عن الاستمرارية الجينية للهجرات المنغولية القديمة". علم الوراثة . 130 (1): 139–152. doi :10.1093/genetics/130.1.139. PMC 1204787. PMID 1346259 .
- Herrnstadt, C.; Elson, JL; Fahy, E.; et al. (2002). "Reduced-Median-Network Analysis of Complete Mitochondrial DNA Coding-Region Sequences for the Major African, Asian, and European Haplogroups". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 70 (5): 1152–1171. doi :10.1086/339933. PMC 447592. PMID 11938495 .
- إنجمان، م.؛ كايسمان، هـ.؛ بابو، س.؛ جيلينستين، يو. (2000). "تباين جينوم الميتوكوندريا وأصل البشر المعاصرين". نيتشر . 408 (6813): 708-713. رمز Bibcode :2000Natur.408..708I. doi :10.1038/35047064. PMID 11130070. S2CID 52850476.
- Stoneking, M.; Jorde, LB; Bhatia, K.; Wilson, AC (1990). "التباين الجغرافي في الحمض النووي للميتوكوندريا البشرية من بابوا غينيا الجديدة". علم الوراثة . 124 (3): 717–733. doi :10.1093/genetics/124.3.717. PMC 1203963. PMID 1968873 .
