بكتيريا لامدا

الموسوعة الحرة
فيروس الإشريكية لامدا
صورة مجهرية إلكترونية لجسيم فيروس من نوع Escherichia virus Lambda
تصنيف الفيروسات تعديل هذا التصنيف
(غير مصنف): فايروس
العالَم : دوبلودنافيريا
المملكة: هيونغجونغفيراي
الشعبة: أوروفيركوتا
فصل: الدودة الشريطية
طلب: فيروسات كادوفيروس
عائلة: فيروسات السيفوفيروس
جنس: فيروس لامدا
صِنف:
فيروس الإشريكية لامدا
نموذج هيكلي لبكتيريا لامدا بدقة ذرية [1]

إن البكتيريا المعوية فاج λ ( لامدا فاج ، كوليفاج λ ، رسميًا إشيريشيا فيروس لامدا ) هو فيروس بكتيري، أو بكتيريا ، يصيب النوع البكتيري إشيريشيا كولاي ( إي كولاي ). تم اكتشافه من قبل إستر ليدربيرج في عام 1950. [2] يتمتع النوع البري من هذا الفيروس بدورة حياة معتدلة تسمح له إما بالبقاء داخل جينوم مضيفه من خلال التحلل أو الدخول في مرحلة تحلل ، حيث يقتل الخلية ويحللها لإنتاج ذرية. سلالات لامدا، التي تحورت في مواقع محددة، غير قادرة على تحلل الخلايا؛ بدلاً من ذلك، تنمو وتدخل الدورة التحللية بعد إصابة خلية تحللت بالفعل. [3]

يتكون جسيم العاثية من رأس (يُعرف أيضًا باسم الغلاف )، [4] وذيل وألياف ذيل (انظر صورة الفيروس أدناه). يحتوي الرأس على جينوم الحمض النووي الخطي مزدوج السلسلة للعاثية . أثناء العدوى، يتعرف جسيم العاثية على مضيفه، الإشريكية القولونية ، ويرتبط به ، مما يتسبب في إخراج الحمض النووي في رأس العاثية من خلال الذيل إلى سيتوبلازم الخلية البكتيرية. عادةً ما تحدث " دورة تحللية "، حيث يتم تكرار الحمض النووي لامدا وإنتاج جزيئات عاثية جديدة داخل الخلية. يتبع ذلك تحلل الخلايا ، مما يؤدي إلى إطلاق محتويات الخلية، بما في ذلك الفيروسات التي تم تجميعها، في البيئة. ومع ذلك، في ظل ظروف معينة، قد يدمج الحمض النووي للعاثية نفسه في كروموسوم الخلية المضيفة في مسار التحلل . في هذه الحالة، يُطلق على الحمض النووي λ اسم طليعة العاثية ويبقى مقيمًا داخل جينوم المضيف دون ضرر واضح للمضيف. يُطلق على المضيف اسم lysogen عندما يكون هناك طليعة عاثية. وقد تدخل هذه الطليعة في الدورة التحللية عندما يدخل طليعة العاثية في حالة مجهدة.

تشريح

فيروس بكتيريا لامدا
فيروس بكتيريوفاج لامدا (مخطط). تظهر أسماء البروتينات وأرقام نسخها في جسيم الفيريون. لا يزال وجود البروتينات L وM في الفيريون غير واضح. [5]

يتكون جسيم الفيروس من رأس وذيل يمكن أن يحتوي على ألياف ذيل. يتكون الجسيم بالكامل من 12-14 بروتينًا مختلفًا مع أكثر من 1000 جزيء بروتيني إجمالي وجزيء DNA واحد يقع في رأس العاثية. ومع ذلك، لا يزال من غير الواضح تمامًا ما إذا كان البروتينان L وM جزءًا من الفيريون. [5] تمتلك جميع العاثيات اللامبدوية المميزة آلية إنهاء النسخ بوساطة البروتين N، باستثناء العاثية HK022. [6]

تخطيط خطي لجينوم فاج لامدا مع الأوبرونات الرئيسية ومناطق المحفز وجينات ترميز الغلاف. [5]

يحتوي الجينوم على 48502 [7] زوجًا قاعديًا من الحمض النووي الخطي مزدوج السلسلة، مع 12 قطعة أحادية السلسلة من القاعدة عند كلا الطرفين 5'. [8] هذان القطعان أحاديا السلسلة هما "الطرفان اللزجان" لما يسمى بموقع cos . يقوم موقع cos بتدوير الحمض النووي في سيتوبلازم المضيف. وبالتالي، يبلغ طول جينوم العاثيات في شكله الدائري 48502 زوجًا قاعديًا. [8] يمكن إدخال جينوم لامدا في كروموسوم الإشريكية القولونية ويُطلق عليه بعد ذلك اسم بروفاج. راجع القسم أدناه للحصول على التفاصيل.

يتكون ذيل البكتيريا العصوية من 6 بروتينات على الأقل (H، J، U، V، Stf، Tfa) ويتطلب 7 بروتينات أخرى للتجميع (I، K، L، M، Z، G/T). تبدأ عملية التجميع هذه بالبروتين J، الذي يقوم بعد ذلك بتجنيد البروتينات I، L، K، وG/T لإضافة البروتين H. بمجرد خروج G وG/T من المركب، يمكن للبروتين V التجمع على سقالة J/H. بعد ذلك، يضاف البروتين U إلى الطرف القريب من الرأس للذيل. يتمكن البروتين Z من ربط الذيل بالرأس. يتم انقسام البروتين H بسبب تصرفات البروتينات U وZ. [5]

دورة الحياة

عدوى

تفاعل بروتين لامدا فاج J مع بورين لامدا بي

إن البكتيريا العصوية لامدا هي بكتيريا عصوية ذيلية غير قابلة للانقباض، وهذا يعني أنه أثناء حدوث العدوى لا يمكنها "إجبار" حمضها النووي على المرور عبر غشاء الخلية البكتيرية. بل يجب عليها بدلاً من ذلك استخدام مسار موجود لغزو الخلية المضيفة، بعد أن طورت طرف ذيلها للتفاعل مع مسام محددة للسماح بدخول حمضها النووي إلى الخلية المضيفة.

  1. ترتبط البكتيريا العاثية Lambda بخلية E. coli عن طريق بروتين J الموجود في طرف الذيل. يتفاعل بروتين J مع بورين الغشاء الخارجي المالتوز (نتاج جين lamB ) لـ E. coli ، [9] وهو جزيء بورين، وهو جزء من أوبيرون المالتوز .
  2. يتم حقن جينوم العاثية الخطي من خلال الغشاء الخارجي.
  3. يمر الحمض النووي عبر معقد نفاذية المانوز في الغشاء الداخلي [10] [11] (المشفر بواسطة جينات manXYZ) ويدور على الفور باستخدام مواقع cos ، "الأطراف اللاصقة" المتماسكة الغنية بـ GC ذات 12 قاعدة. يتم ربط أطراف الحمض النووي الفيروسي أحادي السلسلة بواسطة رباط الحمض النووي المضيف . لا يُقدَّر عمومًا أن أطراف تماسك لامدا ذات 12 قاعدة كانت موضوع أول تسلسل نوكليوتيدي مباشر للحمض النووي البيولوجي. [6]
حقن الحمض النووي لبكتيريا لامدا في غشاء الخلية باستخدام نفاذية مانوز PTS (نظام نقل السكر) كآلية للدخول إلى السيتوبلازم
  1. يضع جيريز الحمض النووي المضيف لفات فائقة سلبية في الكروموسوم الدائري، مما يتسبب في فك المناطق الغنية بـ AT وتحفيز النسخ.
  2. تبدأ عملية النسخ من المحفزات التكوينية P L و P R و P R' التي تنتج النسخ "المبكرة المباشرة". في البداية، تعبر هذه المحفزات عن جينات N و cro ، مما ينتج عنه N وCro وبروتين قصير غير نشط.
أحداث التنشيط المبكرة التي تشمل البروتين N
  1. يرتبط Cro بـ OR3 ، مما يمنع الوصول إلى مُحفِّز P RM ، ويمنع التعبير عن جين cI . يرتبط N بموقعي Nut (استخدام N)، أحدهما في جين N في إطار القراءة PL ، والآخر في جين cro في إطار القراءة P R.
  2. البروتين N هو مضاد للإنهاء ، ويعمل عن طريق إشراك بوليميراز الحمض النووي الريبي النسخي في مواقع محددة من mRNA النسخي الناشئ. عندما ينسخ بوليميراز الحمض النووي الريبي هذه المناطق، فإنه يجند N ويشكل معقدًا مع العديد من بروتينات Nus المضيفة. يتخطى هذا المعقد معظم تسلسلات الإنهاء. تتضمن النسخ الممتدة (النسخ "المتأخرة المبكرة") جينات N و cro جنبًا إلى جنب مع جينات cII و cIII ، وجينات xis و int و O و P و Q التي تمت مناقشتها لاحقًا.
  3. يعمل بروتين cIII على حماية بروتين cII من التحلل البروتيني بواسطة FtsH (إنزيم بروتياز أساسي مرتبط بالغشاء في الإشريكية القولونية ) من خلال العمل كمثبط تنافسي. يمكن أن يؤدي هذا التثبيط إلى حالة مضادة للبكتيريا ، مما يعزز عملية التحلل. كما يعمل بروتين cIII بشكل مباشر على تثبيت بروتين cII. [12]

عند الإصابة الأولية، يحدد استقرار cII نمط حياة البكتيريا العصوية؛ حيث يؤدي استقرار cII إلى مسار التحلل، بينما إذا تحلل cII ، فإن البكتيريا العصوية ستدخل مسار التحلل. ومن المعروف أن درجات الحرارة المنخفضة وتجويع الخلايا وتعدد العدوى (MOI) يساعد على تفضيل التحلل (انظر المناقشة اللاحقة). [13]

N مضاد الإنهاء

يتطلب منع الإنهاء تجميع مركب كبير من الريبونوكليوبروتين لإطالة عملية منع الإنهاء بشكل فعال، وبدون المركب الكامل، يكون بوليميراز الحمض النووي الريبي قادرًا على تجاوز منتهي واحد فقط [14]

يحدث هذا دون تفاعل البروتين N مع الحمض النووي؛ بل يرتبط البروتين بدلاً من ذلك بالرنا المرسال المنقول حديثًا. تحتوي مواقع الجوز على 3 "صناديق" محفوظة، منها الصندوق B فقط هو الأساسي.

  1. تقع تسلسلات RNA في boxB بالقرب من الطرف 5' من نسخ pL وpR. عند النسخ، تشكل كل تسلسل بنية حلقية يمكن للبروتين N الارتباط بها.
  2. يرتبط البروتين N بالصندوق B في كل نسخة، ويتصل ببوليميراز الحمض النووي الريبي النسخي عبر حلقة الحمض النووي الريبي. يتم تثبيت مركب N-RNAP عن طريق الارتباط اللاحق بالعديد من بروتينات Nus المضيفة (مادة استخدام N) (والتي تتضمن عوامل إنهاء النسخ/مكافحة الإنهاء، ومن الغريب، وحدة فرعية من الريبوسوم).
  3. يستمر المجمع بأكمله (بما في ذلك موقع Nut المرتبط على mRNA) في النسخ، ويمكنه تخطي تسلسلات الإنهاء.

دورة الحياة التحللية

لويحات تحلل البكتيريا العصوية لامدا على بكتيريا الإشريكية القولونية

هذه هي دورة الحياة التي يتبعها العاثية بعد معظم الالتهابات، حيث لا يصل بروتين cII إلى تركيز مرتفع بما فيه الكفاية بسبب التحلل، وبالتالي لا يقوم بتنشيط المحفزات الخاصة به. [ بحاجة لمصدر ]

  1. تستمر كتابة النسخ "المتأخرة المبكرة"، بما في ذلك الجينات xis و int و Q لتكرار جينوم لامدا ( OP ). يهيمن Cro على موقع القمع (انظر قسم "القمع")، مما يقمع التوليف من مروج P RM (وهو مروج للدورة الليزوجينية).
  2. تعمل بروتينات O وP على بدء عملية تكرار كروموسوم العاثية (انظر "التكرار الانحلالي").
  3. Q، وهو مضاد إنهاء آخر ، يرتبط بمواقع Qut .
  4. يمكن الآن أن تمتد عملية النسخ من مُحفز P R' لإنتاج mRNA للتحلل وبروتينات الرأس والذيل.
  5. تتجمع البروتينات البنيوية وجينومات العاثيات ذاتيًا لتكوين جزيئات عاثية جديدة.
  6. تتسبب منتجات الجينات S و R و Rz و Rz1 في انحلال الخلايا. S هو هولين ، وهو بروتين غشائي صغير يصنع فجأة ثقوبًا في الغشاء في وقت يتم تحديده من خلال تسلسل البروتين. R هو إندوليسين ، وهو إنزيم يهرب من خلال ثقوب S ويشق جدار الخلية. Rz وRz1 عبارة عن بروتينات غشائية تشكل مركبًا يدمر الغشاء الخارجي بطريقة ما، بعد أن يقوم الإندوليسين بتحلل جدار الخلية. بالنسبة لللامدا من النوع البري، يحدث الانحلال بعد حوالي 50 دقيقة من بدء العدوى ويطلق حوالي 100 فيروس.

النسخ إلى اليمين

يعبر النسخ إلى اليمين عن الجينات O و P و Q. O وP مسؤولان عن بدء التضاعف، وQ هو عامل مضاد آخر يسمح بالتعبير عن جينات الرأس والذيل والانحلال من P R' . [6]

إن جين Pr هو المحفز للنسخ إلى اليمين، وجين cro هو جين منظم. سوف يقوم جين cro بتشفير بروتين Cro الذي سوف يقمع بعد ذلك محفز Prm. بمجرد بدء نسخ Pr، سيتم نسخ جين Q عند الطرف البعيد من الأوبرون للنسخ إلى اليمين. جين Q هو جين منظم موجود على هذا الأوبرون، والذي سوف يتحكم في التعبير عن الجينات اللاحقة للنسخ إلى اليمين. بمجرد أن تسمح البروتينات التنظيمية للجين بالتعبير، سيعمل بروتين Q بعد ذلك كمضاد للإنهاء. سيسمح هذا بعد ذلك بقراءة بقية الأوبرون حتى يصل إلى منتهي النسخ. وبالتالي السماح بالتعبير عن الجينات اللاحقة في الأوبرون، مما يؤدي إلى التعبير عن الدورة التحللية. [15]

لقد وجد أن مُحفِّز Pr يعمل على تنشيط الأصل عند استخدام النسخ نحو اليمين، ولكن الصورة الكاملة لهذا الأمر لا تزال غير مفهومة إلى حد ما. ونظرًا لوجود بعض التحذيرات بشأن هذا، على سبيل المثال، تختلف هذه العملية بالنسبة للبكتيريا الأخرى مثل البكتيريا N15، والتي قد تشفر بوليميراز الحمض النووي. ومن الأمثلة الأخرى على ذلك البكتيريا P22 التي قد تحل محل الجين p، الذي يشفر بروتين تكرار أساسي لشيء قادر على تشفير حلزونات DnaB. [6]

التضاعف الانحلالي

  1. بالنسبة لدورات التضاعف القليلة الأولى، يخضع جينوم لامدا لتضاعف θ (دائرة إلى دائرة).
  2. يتم البدء في هذا في موقع ori الموجود في جين O. يرتبط بروتين O بموقع ori ، ويرتبط بروتين P بوحدة DnaB من آلية تكرار المضيف بالإضافة إلى ارتباطه بـ O. هذا يسيطر بشكل فعال على بوليميراز DNA المضيف.
  3. سرعان ما يتحول العاثي إلى تكرار دائري متدحرج مشابه لذلك المستخدم بواسطة العاثي M13. يتم قطع الحمض النووي وتعمل النهاية 3' كبادئ. لاحظ أن هذا لا يحرر نسخًا مفردة من جينوم العاثي بل جزيءًا واحدًا طويلًا به العديد من نسخ الجينوم: مركب مترابط .
  4. يتم انقسام هذه الجزيئات المتتالية عند مواقعها الجيبية أثناء تعبئتها. لا يمكن أن يحدث التغليف من الحمض النووي للعاثيات الدائرية، ولكن فقط من الحمض النووي المتتالي.

Q ضد الإنهاء

يعدل بروتين Q بوليميراز الحمض النووي الريبي في منطقة المحفز ويتم تجنيده إلى بوليميراز الحمض النووي الريبي. يتحول بروتين Q إلى وحدة بوليميراز الحمض النووي الريبي بعد تجنيده إلى RNAP ويعدل الإنزيم إلى حالة معالجة. لاحظ أن NusA يمكن أن يحفز نشاط بروتين Q. [14]

Q مشابه لـ N في تأثيره: يرتبط Q ببوليميراز الحمض النووي الريبي في مواقع Qut ويمكن للمركب الناتج أن يتجاهل المنهيات، إلا أن الآلية مختلفة تمامًا؛ يرتبط بروتين Q أولاً بتسلسل الحمض النووي بدلاً من تسلسل mRNA. [16]

  1. يقع موقع Qut بالقرب من مُحفِّز P R' ، وهو قريب بدرجة كافية بحيث لا يتم إطلاق عامل σ من إنزيم الهولوإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي. يشبه جزء من موقع Qut مربع Pribnow -10 ، مما يتسبب في توقف الهولوإنزيم مؤقتًا.
  2. ثم يرتبط بروتين Q ويحل محل جزء من عامل σ وتبدأ عملية النسخ مرة أخرى.
  3. يتم نسخ جينات الرأس والذيل وتجميع البروتينات المقابلة ذاتيًا.

النسخ إلى اليسار

رسم تخطيطي يوضح عملية التنظيم الرجعي التي تنتج تركيزًا أعلى من xis مقارنة بـ int. يتم هضم نسخة mRNA بواسطة RNase البكتيري بدءًا من حلقة دبوس الشعر المشقوقة في sib.

يعبر النسخ إلى اليسار عن الجينات gam و xis و bar و int . [6] تشارك بروتينات Gam في إعادة التركيب. كما أن Gam مهم لأنه يمنع نوكلياز RecBCD المضيف من تحلل النهايات 3' في تكرار الدائرة المتدحرجة. Int وxis عبارة عن بروتينات تكامل واستئصال حيوية لعملية الليزوجين. [ بحاجة لمصدر ]

عملية النسخ إلى اليسار
  1. يقوم فاج لامدا بإدخال الكروموسوم في سيتوبلازم الخلية البكتيرية المضيفة.
  2. يتم إدخال كروموسوم العاثية إلى كروموسوم البكتيريا المضيفة من خلال رباط الحمض النووي.
  3. تستمر عملية نسخ الكروموسوم العاثي نحو اليسار عندما يرتبط بوليميراز الحمض النووي الريبي المضيف بموقع المحفز p L مما يؤدي إلى ترجمة الجين N.
    1. يعمل الجين N كجين تنظيمي يؤدي إلى عدم قدرة بوليميراز الحمض النووي الريبي على التعرف على مواقع إنهاء الترجمة. [17]
طفرات النسخ إلى اليسار

يُعتقد أن النسخ إلى اليسار يؤدي إلى طفرة حذف في جين الراب مما يؤدي إلى نقص نمو فاج لامدا. ويرجع هذا إلى ارتباط بوليميراز الحمض النووي الريبي بموقع مُحفز pL بدلاً من موقع مُحفز pR. يؤدي النسخ إلى اليسار إلى نسخ شريط I وشريط II على الأوبرون الأيسر. يكون النمط الظاهري الإيجابي للشريط موجودًا عندما يكون جين الراب غائبًا. يُعتقد أن نقص نمو فاج لامدا يحدث بسبب حساسية درجة الحرارة مما يؤدي إلى تثبيط النمو. [18]

تنظيم الإدخال والاستئصال بواسطة xis وint
  1. تم العثور على xis و int على نفس قطعة mRNA، وبالتالي يتم إنتاج تركيزات متساوية تقريبًا من بروتينات xis و int . ويؤدي هذا (في البداية) إلى استئصال أي جينومات مدرجة من جينوم المضيف.
  2. يشكل mRNA من مُحفِّز P L بنية ثانوية مستقرة مع حلقة جذعية في قسم sib من mRNA. يستهدف هذا الطرف 3' ( sib ) من mRNA لتحلل RNAaseIII، مما يؤدي إلى تركيز فعال أقل من mRNA int مقارنة بـ mRNA xis (حيث يكون cistron int أقرب إلى تسلسل sib من cistron xis إلى تسلسل sib )، لذلك يتم ملاحظة تركيزات أعلى من xis مقارنة بـ int .
  3. تؤدي التركيزات الأعلى من xis مقارنة بـ int إلى عدم إدخال أو إزالة جينومات العاثيات، وهو الإجراء المفضل من الناحية التطورية - ترك أي جينومات عاثية تم إدخالها مسبقًا (مما يقلل من المنافسة) ومنع إدخال جينوم العاثية في جينوم المضيف المحكوم عليه بالموت.

دورة حياة ليسوجينية (أو ليسينوجينية)

تبدأ دورة الحياة الليزوجينية بمجرد أن يصل بروتين cI إلى تركيز عالٍ بما يكفي لتنشيط محركاته، بعد عدد صغير من الإصابات.

  1. وتستمر كتابة النسخ "المتأخرة المبكرة"، بما في ذلك الجينات xis و int و Q لتكرار جينوم لامدا.
  2. يعمل cII المستقر على تعزيز النسخ من المحفزات P RE و P I و P antiq .
  3. ينتج مروج P antiq mRNA مضادًا للمعنى لرسالة جين Q من نسخة مروج P R ، وبالتالي إيقاف إنتاج Q. ينتج مروج P RE mRNA مضادًا للمعنى لقسم cro من نسخة مروج P R ، مما يقلل من إنتاج cro، ويحتوي على نسخة من جين cI . يتم التعبير عن هذا، مما يؤدي إلى تشغيل إنتاج مثبط cI. يعبر مروج P I عن جين int ، مما يؤدي إلى تركيزات عالية من بروتين Int. يدمج بروتين int هذا الحمض النووي للعاثيات في كروموسوم المضيف (انظر "تكامل Prophage").
  4. يؤدي عدم وجود Q إلى عدم امتداد إطار القراءة الخاص بمروج P R' ، وبالتالي لا يتم تصنيع أي بروتينات تحللية أو بنيوية. تؤدي المستويات المرتفعة من int (أعلى بكثير من مستويات xis) إلى إدراج جينوم lambda في جينوم المضيف (انظر الرسم التخطيطي). يؤدي إنتاج cI إلى ارتباط cI بمواقع OR1 و OR2 في مروج P R ، مما يؤدي إلى إيقاف التعبير الجيني المبكر عن cro وغيره. يرتبط cI أيضًا بمروج P L ، مما يؤدي إلى إيقاف النسخ هناك أيضًا.
  5. يؤدي نقص الكروم إلى ترك موقع OR3 غير مرتبط، لذا قد يحدث النسخ من مُحفز P RM ، مما يحافظ على مستويات cI.
  6. يؤدي نقص النسخ من المحفزات P L و P R إلى عدم إنتاج المزيد من cII و cIII.
  7. مع انخفاض تركيزات cII وcIII، يتوقف الترويج للنسخ من P antiq و P RE و P I نظرًا لعدم الحاجة إليها بعد الآن.
  8. لا يبقى سوى محفزي P RM و P R' نشطين، حيث ينتج الأول بروتين cI بينما ينتج الثاني نسخة قصيرة غير نشطة. ويظل الجينوم مدمجًا في جينوم المضيف في حالة خاملة.

يتم مضاعفة البروفاج مع كل انقسام لاحق لخلية المضيف. تقوم جينات البروف المعبر عنها في هذه الحالة الخاملة بتشفير البروتينات التي تقمع التعبير عن جينات البروف الأخرى (مثل الجينات البنيوية والانحلالية) من أجل منع الدخول في الدورة الانحلالية. يتم تكسير هذه البروتينات القمعية عندما تكون الخلية المضيفة تحت الضغط، مما يؤدي إلى التعبير عن جينات البروف المكبوتة. يمكن أن يكون الضغط من الجوع أو السموم (مثل المضادات الحيوية ) أو عوامل أخرى يمكن أن تلحق الضرر بالمضيف أو تدمره. استجابة للضغط، يتم استئصال البروفاج المنشط من الحمض النووي للخلية المضيفة بواسطة أحد منتجات الجينات المعبر عنها حديثًا ويدخل مساره الانحلالي.

تكامل البروفاج

يحدث تكامل الفاج λ في موقع ارتباط خاص في جينوم البكتيريا والفاج، يسمى att λ . يسمى تسلسل موقع att البكتيري attB ، بين الأوبيرونات gal و bio ، ويتكون من الأجزاء BOB'، في حين يسمى التسلسل التكميلي في جينوم الفاج الدائري attP ويتكون من الأجزاء POP'. التكامل نفسه هو تبادل متسلسل (انظر إعادة التركيب الجيني ) عبر تقاطع هوليداي ويتطلب كل من بروتين الفاج Int وبروتين البكتيريا IHF ( عامل تكامل المضيف ). يرتبط كل من Int وIHF بـ attP ويشكلان إنتاسوم، وهو مركب DNA-protein-complex مصمم لإعادة التركيب الخاص بالموقع للحمض النووي للفاج والمضيف. يتغير تسلسل BOB' الأصلي عن طريق التكامل إلى BOP'-phage DNA-POB'. أصبح DNA الفاج الآن جزءًا من جينوم المضيف. [19]

صيانة عملية الاستقلاب

تمثيل مبسط لنموذج التكامل/الاستئصال والجينات الرئيسية المعنية.
  • يتم الحفاظ على عملية الليزوجينية فقط بواسطة البروتين cI. حيث يقمع البروتين cI عملية النسخ من P L و P R بينما يعمل على زيادة تنظيم وضبط تعبيره الخاص من P RM . وبالتالي فهو البروتين الوحيد الذي يتم التعبير عنه بواسطة البكتيريا المسببة للليزوجينية.
مثبطات الليسوجين والبوليميراز المرتبطة بـ OR1 وتجند OR2، والذي سيعمل على تنشيط PRM وإيقاف PR.
  • يتم تنسيق ذلك من خلال مشغلي P L و P R. يحتوي كلا المشغلين على ثلاثة مواقع ربط لـ cI: OL1 و OL2 و OL3 لـ P L ، و OR1 و OR2 و OR3 لـ P R.
  • يرتبط cI بشكل أفضل بـ OR1 ؛ حيث يمنع الارتباط هنا النسخ من P R. ونظرًا لأن cI يتثنى بسهولة، فإن ارتباط cI بـ OR1 يزيد بشكل كبير من تقارب ارتباط cI بـ OR2 ، ويحدث هذا على الفور تقريبًا بعد ارتباط OR1 . وينشط هذا النسخ في الاتجاه الآخر من P RM ، حيث يشدد المجال الطرفي الأميني لـ cI على OR2 ارتباط بوليميراز الحمض النووي الريبي بـ P RM وبالتالي يحفز cI نسخه الخاص. وعندما يكون موجودًا بتركيز أعلى بكثير، فإنه يرتبط أيضًا بـ OR3 ، مما يمنع النسخ من P RM ، وبالتالي ينظم مستوياته الخاصة في حلقة تغذية مرتدة سلبية .
  • إن ارتباط cI بعامل P L مشابه جدًا، إلا أنه لا يؤثر بشكل مباشر على نسخ cI. ومع ذلك، فإن ثنائيات cI المرتبطة بـ OR3 و OL3 تعمل على ثني الحمض النووي بينهما ليصبح رباعي الترابط.
  • يؤدي وجود cI إلى حدوث مناعة ضد العدوى الإضافية بواسطة عاثيات لامدا الأخرى، حيث أنه سيعمل على تثبيط محفزات P L و P R الخاصة بها .

تعريفي

الحالة النسخية لمناطق المحفز P RM وP R أثناء الحالة التحللية مقابل الحالة التحللية المبكرة المستحثة.

تتضمن عملية الحث التقليدية للليزوجين تعريض الخلايا المصابة لأشعة فوق البنفسجية. أي موقف يتعرض فيه الليزوجن لتلف الحمض النووي أو يتم تحفيز استجابة SOS للمضيف بطريقة أخرى يؤدي إلى الحث.

  1. تتعرض الخلية المضيفة، التي تحتوي على جينوم العاثية الخامل، لتلف الحمض النووي بسبب بيئة عالية الضغط، وتبدأ في الخضوع لاستجابة SOS .
  2. يكتشف بروتين RecA (البروتين الخلوي) تلف الحمض النووي ويصبح نشطًا. وهو الآن RecA*، وهو بروتيناز مساعد عالي التخصص.
  3. عادةً ما يرتبط RecA* بـ LexA ( مثبط النسخ )، مما ينشط نشاط البروتيناز الذاتي لـ LexA، والذي يدمر مثبط LexA، مما يسمح بإنتاج بروتينات إصلاح الحمض النووي . في الخلايا الليسوسينية، يتم اختطاف هذه الاستجابة، ويحفز RecA* انقسام cI. وذلك لأن cI يحاكي بنية LexA في موقع الانقسام الذاتي.
  4. لم يعد بإمكان البروتين cI المشقوق أن يتحول إلى ثنائي الترابط، ويفقد قدرته على الارتباط بالحمض النووي.
  5. لم تعد محفزات P R و P L مكبوتة ويتم تشغيلها، وتعود الخلية إلى التسلسل التحللي لأحداث التعبير (لاحظ أن cII غير مستقر في الخلايا التي تخضع لاستجابة SOS). ومع ذلك، هناك فرق ملحوظ واحد.
وظيفة LexA في استجابة SOS. يؤدي التعبير عن LexA إلى تثبيط العديد من الجينات بما في ذلك LexA.

التحكم في استئصال جينوم العاثيات أثناء التحريض

  1. لا يزال جينوم العاثيات مدرجًا في جينوم المضيف ويحتاج إلى الاستئصال حتى يحدث تكرار الحمض النووي. ومع ذلك، لم يعد الجزء الشقيق الذي يقع خارج نسخة المروج الطبيعي للبروتين PL مدرجًا في إطار القراءة هذا (انظر الرسم التخطيطي).
  2. يؤدي عدم وجود مجال sib على mRNA لمحفز PL إلى عدم وجود حلقة دبوس الشعر في الطرف 3'، ولم تعد النسخة مستهدفة لتحلل RNAaseIII.
  3. تحتوي النسخة الجديدة السليمة على نسخة واحدة من كل من xis و int ، وبالتالي يتم إنتاج تركيزات متساوية تقريبًا من بروتينات xis و int.
  4. تؤدي التركيزات المتساوية من xis و int إلى استئصال الجينوم المُدرج من جينوم المضيف للتكرار وإنتاج العاثيات لاحقًا.

إعادة تنشيط التعددية وإعادة تنشيط البروفاج

إعادة تنشيط التعددية (MR) هي العملية التي تتفاعل بها جينومات فيروسية متعددة، كل منها يحتوي على تلف جينومي معطل، داخل خلية مصابة لتشكيل جينوم فيروسي قابل للحياة. تم اكتشاف إعادة تنشيط التعددية في الأصل مع فاج T4، ولكن تم العثور عليها لاحقًا في فاج λ (وكذلك في العديد من الفيروسات البكتيرية والثديية الأخرى [20] ). يعتمد إعادة تنشيط التعددية لفاج λ المعطل بواسطة الأشعة فوق البنفسجية على وظيفة إعادة التركيب إما للمضيف أو للفاج المصاب. [21] يؤدي غياب كل من أنظمة إعادة التركيب إلى فقدان إعادة تنشيط التعددية.

تزداد معدلات بقاء البكتيريا العصوية λ المعرضة للأشعة فوق البنفسجية عندما يكون مضيف الإشريكية القولونية متحللاً للبكتيريا العصوية المتجانسة، وهي الظاهرة التي يطلق عليها إعادة تنشيط البكتيريا العصوية. [22] ويبدو أن إعادة تنشيط البكتيريا العصوية في البكتيريا العصوية λ تحدث من خلال عملية إصلاح إعادة التركيب مماثلة لتلك الخاصة بـ MR.

مُثَبِّط

تفاعلات البروتين التي تؤدي إما إلى دورات تحللية أو دورات تحللية لبكتيريا لامدا

إن الكابت الموجود في البكتيريا العاثية لامدا هو مثال بارز لمستوى التحكم الممكن في التعبير الجيني بواسطة نظام بسيط للغاية. فهو يشكل "مفتاحًا ثنائيًا" مع وجود جينين يخضعان لتعبير متبادل الحصر، كما اكتشفته باربرا جيه ماير . [23]

تمثيل مرئي لربط رباعي/ثماني القمع بمواقع عامل L وR في البكتيريا العاثية (حالة التحلل المستقرة)

يتكون نظام جين قمع لامدا من (من اليسار إلى اليمين على الكروموسوم):

  • جين cI
  • أو ر 3
  • أو ر 2
  • أو ر 1
  • جين الكروم

مثبط لامدا هو ثنائي التجميع الذاتي المعروف أيضًا باسم بروتين cI . [24] وهو يرتبط بالحمض النووي في نمط الارتباط الحلزوني. وهو ينظم نسخ بروتين cI وبروتين Cro.

يتم التحكم في دورة حياة البكتيريا العصوية لامدا بواسطة بروتينات cI وCro. ستظل البكتيريا العصوية لامدا في الحالة التحللية إذا سادت بروتينات cI، ولكنها ستتحول إلى الدورة التحللية إذا سادت بروتينات CRO.

قد يرتبط ثنائي cI بأي من المشغلات الثلاثة، O R 1 و O R 2 و O R 3، بالترتيب O R 1 > O R 2 > O R 3. يعزز ارتباط ثنائي cI بـ O R 1 ارتباط ثنائي cI ثانٍ بـ O R 2، وهو التأثير الذي يُسمى التعاون . وبالتالي، فإن O R 1 و O R 2 مشغولان دائمًا تقريبًا بواسطة cI. ومع ذلك، فإن هذا لا يزيد من التقارب بين cI و O R 3، والذي سيتم شغله فقط عندما يكون تركيز cI مرتفعًا.

عند تركيزات عالية من cI، ترتبط ثنائيات الترابط أيضًا بالمشغلين O L 1 وO L 2 (اللذين يقعان على بعد أكثر من 2 كيلو بايت من مشغلي R). عندما ترتبط ثنائيات الترابط cI بـ O L 1 وO L 2 وO R 1 وO R 2، يتم تحريض حلقة في الحمض النووي، مما يسمح لهذه الثنائيات الترابط معًا لتكوين ثماني الترابطات. هذه ظاهرة تسمى التعاون بعيد المدى . عند تكوين ثماني الترابطات، قد ترتبط ثنائيات الترابط cI بشكل تعاوني بـ O L 3 وO R 3، مما يؤدي إلى قمع نسخ cI. يضمن هذا التنظيم السلبي الذاتي تركيزًا أدنى ثابتًا لجزيء القمع، وفي حالة ظهور إشارات SOS، يسمح بتحريض بروفاج أكثر كفاءة. [25]

  • في حالة عدم وجود بروتينات cI، قد يتم نسخ جين cro .
  • في وجود بروتينات cI، قد يتم نسخ جين cI فقط.
  • عند التركيز العالي من cI، يتم قمع نسخ كلا الجينين.
  • بعض أزواج القواعد لها وظيفة مزدوجة مع المحفز والمشغل لكل من البروتينات cl وcro.
    بعض أزواج القواعد لها وظيفة مزدوجة مع المحفز والمشغل لكل من البروتينات cl وcro.
  • يتم تشغيل البروتين cl، مع زيادة ارتباط الكابت ببوليميراز OR2 وإيقاف تشغيل OR1.
    يتم تشغيل البروتين cl، مع زيادة ارتباط الكابت ببوليميراز OR2 وإيقاف تشغيل OR1.
  • إن قمع الليزوجين الذي يربط جميع المواقع الثلاثة هو حدوث منخفض بسبب ضعف قدرة الارتباط بـ OR3. إن قمع OR1 يزيد من قدرة الارتباط بـ OR2 بسبب تفاعل الكابت-الكبت. إن زيادة تركيزات الكابت تزيد من الارتباط.
    إن قمع الليزوجين الذي يربط جميع المواقع الثلاثة هو حدوث منخفض بسبب ضعف قدرة الارتباط بـ OR3. إن قمع OR1 يزيد من قدرة الارتباط بـ OR2 بسبب تفاعل الكابت-الكبت. إن زيادة تركيزات الكابت تزيد من الارتباط.

نظرة عامة على وظيفة البروتين

بروتين الوظيفة في دورة الحياة منطقة المروج وصف
ج3 البروتين التنظيمي CIII. استقلاب الخلايا، استقرار cII ب ل (Clear 3) البروتين الرابط لـ HflB (FtsH)، يحمي cII من التحلل بواسطة البروتياز.
سي آي آي الاستيلاد، منشط النسخ ب ر (Clear 2) ينشط النسخ من المحفزات P AQ وP RE وP I ، وينسخ cI و int . استقرار منخفض بسبب قابلية البروتينات الخلوية HflB (FtsH) (خاصة في الخلايا السليمة والخلايا التي تخضع لاستجابة SOS). ستدفع المستويات العالية من cII البكتيريا نحو التكامل والتحلل بينما ستؤدي المستويات المنخفضة من cII إلى التحلل.
سي اي مثبط، صيانة عملية الاستسقاء ب ر م ، ب ر ر (Clear 1) مثبط للنسخ، يرتبط بـ OR 1 و O R 2 و O R 3 (التقارب O R 1 > O R 2 = O R 3، أي يرتبط بشكل تفضيلي بـ OR R 1). عند التركيزات المنخفضة، يمنع مُحفز P R (يمنع إنتاج الكروموسومات). عند التركيزات العالية، يقلل من إنتاجه من خلال الارتباط بـ O R 3. كما يثبط المُثبط النسخ من مُحفز P L. عُرضة للانقسام بواسطة RecA * في الخلايا الخاضعة لاستجابة SOS.
كرو التحلل، التحكم في مشغل القمع ب ر مثبط النسخ، يرتبط بـ O R 3 و O R 2 و O R 1 (التقارب O R 3 > O R 2 = O R 1، أي يرتبط بشكل تفضيلي بـ O R 3). عند التركيزات المنخفضة، يمنع مُحفِّز pRM (يمنع إنتاج cI ). عند التركيزات العالية، يقلل من إنتاجه من خلال الارتباط بـ O R 2 و O R 1. لا يوجد ارتباط تعاوني (راجع أدناه لربط cI)
ا التحلل، مضاعفة الحمض النووي ب ر بروتين التضاعف O. يبدأ عملية تضاعف الحمض النووي لفاج لامدا عن طريق الارتباط بموقع أوري .
ص التحلل، مضاعفة الحمض النووي ب ر يبدأ تكرار الحمض النووي لـ Phage Lambda من خلال الارتباط بالوحدة الفرعية O و DnaB . توفر هذه الارتباطات التحكم في بوليميراز الحمض النووي المضيف.
لعبة التحلل، مضاعفة الحمض النووي ب ل يمنع نوكلياز RecBCD المضيف من تدهور النهايات 3' - مما يسمح باستمرار تكرار الدائرة المتدحرجة .
س التحلل ب ر' هولين ، وهو بروتين غشائي يخترق الغشاء أثناء التحلل.
ر التحلل ب ر' إندوليسين ، ليسوزيم، وهو إنزيم يخرج من الخلية من خلال الثقوب التي ينتجها الهولين ويقسم جدار الخلية.
Rz وRz1 التحلل ب ر' يشكل مركب بروتين غشائي يدمر غشاء الخلية الخارجي بعد تحلل جدار الخلية بواسطة الإندوليسين. سبانين، Rz1 (وحدة الغشاء الخارجي) وRz (وحدة الغشاء الداخلي).
ف التحلل ب ر' بروتينات رأس غلاف البكتيريا العاثية.
د التحلل ب ر' زينة الرأس البروتينية.
هـ التحلل ب ر' بروتين الرأس الرئيسي.
ج التحلل ب ر' بروتين القفيصة الصغرى.
ب التحلل ب ر' البروتين البوابة ب.
أ التحلل ب ر' بروتين التيرميناز الكبير.
ج التحلل ب ر' بروتين تحديد المضيف J.
مفوجلز التحلل ب ر' بروتين الذيل الصغير M.
ك التحلل ب ر' من المحتمل أن يكون إندوببتيديز.
ح التحلل ب ر' شريط قياس الذيل البروتين H.
أنا التحلل ب ر' بروتين تجميع الذيل الأول
في اي التحلل ب ر' بروتين تعبئة الحمض النووي FI.
مؤسسة التمويل الدولية التحلل ب ر' بروتين ربط الذيل.
تفا التحلل ب ر' بروتين تجميع ألياف الذيل.
دولي دمج الجينوم، الاستئصال بى اي ، ب ل Integrase ، يدير إدخال جينوم البكتيريا العاثية إلى جينوم المضيف. في ظروف تركيز int المنخفض لا يوجد تأثير. إذا كان تركيز xis منخفضًا و int مرتفعًا، فإن هذا يؤدي إلى إدخال جينوم البكتيريا العاثية. إذا كان تركيز xis و int مرتفعًا (ومتساويًا تقريبًا)، فإن هذا يؤدي إلى استئصال جينومات البكتيريا العاثية من جينوم المضيف.
إكسيس استئصال الجينوم بى اي ، ب ل منظم البروتين الاستئصالي والإنزيم الداخلي ، يدير استئصال وإدخال جينوم العاثية إلى جينوم المضيف.
ن منع الإنهاء لنسخ الجينات المبكرة المتأخرة ب ل يرتبط مضاد الإنهاء ، وهو بروتين رابط للرنا وعامل مساعد لبوليميراز الرنا، بالرنا (في مواقع الجوز) وينتقل إلى RNApol الناشئ الذي نسخ للتو موقع الجوز. يمنع تعديل RNApol هذا التعرف على مواقع الإنهاء، لذلك يتم تجاهل إشارات الإنهاء الطبيعية لبوليميراز الرنا ويستمر تخليق الرنا في جينات البكتيريا البعيدة ( cII، cIII، xis، int، O، P، Q )
س منع الإنهاء لنسخ الجينات المتأخرة الانحلال ب ر يرتبط مضاد الإنهاء ، وهو بروتين ربط الحمض النووي وعامل مساعد RNApol، بالحمض النووي (في مواقع Qut) وينتقل إلى RNApol المبدئي. يغير تعديل RNApol هذا من التعرف على تسلسلات الإنهاء، لذلك يتم تجاهل التسلسلات الطبيعية؛ تكون تسلسلات الإنهاء Q الخاصة التي تبعد حوالي 20000 زوج أساسي فعالة. تتضمن النسخ الممتدة Q البروتينات البنيوية للعاثيات (AF وZJ) وجينات الانحلال ( S وR وRz وRz1 ). يتم تقليل تنظيمها بواسطة mRNA المضاد للحس P antiq أثناء الانحلال.
ريكا استجابة SOS البروتين المضيف بروتين إصلاح الحمض النووي، يعمل كمساعد للبروتيناز أثناء استجابة SOS، ويقسم تلقائيًا LexA و cI ويسهل التحلل.

التحلل مقابل التحلل اللايزوجيني

مخطط لدورة حياة البكتيريا العاثية المعتدلة، يظهر كل من الدورة التحللية والتحللية.

إن التمييز المهم هنا هو بين القرارين؛ التحلل الخلوي والتحلل عند الإصابة، والتحلل الخلوي المستمر أو التحلل من بروفاج. يتم تحديد الأخير فقط من خلال تنشيط RecA في استجابة SOS للخلية، كما هو مفصل في القسم الخاص بالتحريض. سيتأثر الأول أيضًا بهذا؛ ستتحلل الخلية التي تخضع لاستجابة SOS دائمًا، حيث لن يُسمح لأي بروتين cI بالتراكم. ومع ذلك، فإن القرار التحللي/التحللي الأولي بشأن العدوى يعتمد أيضًا على بروتينات cII وcIII.

في الخلايا التي تحتوي على كمية كافية من المغذيات، يكون نشاط البروتياز مرتفعًا، مما يؤدي إلى تحلل cII. وهذا يؤدي إلى نمط الحياة التحللي. في الخلايا التي تحتوي على كمية محدودة من المغذيات، يكون نشاط البروتياز منخفضًا، مما يجعل cII مستقرًا. وهذا يؤدي إلى نمط الحياة التحللي. يبدو أن cIII يعمل على تثبيت cII، سواء بشكل مباشر أو من خلال العمل كمثبط تنافسي للبروتيازات ذات الصلة. وهذا يعني أن الخلية "المتعثرة"، أي التي تفتقر إلى المغذيات وفي حالة أكثر خمولًا، تكون أكثر عرضة للتحلل. سيتم اختيار هذا لأن العاثية يمكن أن تظل خاملة الآن في البكتيريا حتى تأتي أوقات أفضل، وبالتالي يمكن للعاثية إنشاء المزيد من النسخ من نفسها بالموارد الإضافية المتاحة ومع وجود احتمال أكبر لقرب المزيد من الخلايا القابلة للعدوى.

لا يزال يتعين تطوير نموذج بيوفيزيائي كامل لقرار تحلل لامدا-تحلل الخلايا. تشير النمذجة والمحاكاة الحاسوبية إلى أن العمليات العشوائية أثناء العدوى تدفع اختيار التحلل أو التحلل داخل الخلايا الفردية. [26] ومع ذلك، تشير التجارب الأخيرة إلى أن الاختلافات الفيزيائية بين الخلايا، والتي توجد قبل العدوى، تحدد مسبقًا ما إذا كانت الخلية سوف تتحلل أو تصبح تحلل الخلايا. [27]

كأداة وراثية

لقد تم استخدام فاج لامدا بكثافة ككائن نموذجي وكان أداة ممتازة أولاً في علم الوراثة الميكروبية ، ثم لاحقًا في علم الوراثة الجزيئي . [28] تشمل بعض استخداماته تطبيقه كناقل لاستنساخ الحمض النووي المؤتلف ؛ استخدام إنزيم إعادة التركيب الخاص بالموقع (int) لخلط الحمض النووي المستنسخ بطريقة البوابة ؛ [29] وتطبيق الأوبرون الأحمر الخاص به ، بما في ذلك البروتينات الحمراء ألفا (وتسمى أيضًا "إكسو") وبيتا وجاما في طريقة هندسة الحمض النووي المسماة إعادة التركيب . إن شظية الحمض النووي التي يبلغ طولها 48 كيلو بايت من فاج لامدا ليست ضرورية للعدوى الإنتاجية ويمكن استبدالها بحمض نووي غريب، [30] والذي يمكن بعد ذلك تكراره بواسطة الفاج. سيدخل فاج لامدا البكتيريا بسهولة أكبر من البلازميدات، مما يجعله ناقلًا مفيدًا يمكنه إما تدمير الحمض النووي للمضيف أو أن يصبح جزءًا منه. [31] يمكن أيضًا التلاعب ببكتيريا لامدا واستخدامها كلقاح مضاد للسرطان يستهدف أسبارتيل (أسباراجينيل) بيتا هيدروكسيلاز (ASPH، HAAH) البشري، والذي ثبت أنه مفيد في حالات سرطان الخلايا الكبدية في الفئران. [32] كانت بكتيريا لامدا أيضًا ذات أهمية كبيرة في دراسة التحويل المتخصص . [33]

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ Padilla-Sanchez V (2021-07-16). "نموذج هيكلي لبكتيريا لامدا بدقة ذرية". doi :10.5281/zenodo.5134493 . تم الاسترجاع في 2021-07-24 .
  2. ^ ليدربيرج إي (يناير 1950). "التكاثر اللاهوائي في سلالة الإشريكية القولونية K-12". نشرة علم الوراثة الميكروبية . 1 : 5-8.؛ يليه Lederberg EM، Lederberg J (يناير 1953). "دراسات وراثية عن التكاثر اللاجيني في الإشريكية القولونية". علم الوراثة . 38 (1): 51–64. doi :10.1093/genetics/38.1.51. PMC 1209586. PMID  17247421 . 
  3. ^ Griffiths A, Miller J, Suzuki D, Lewontin R, Gelbart W (2000). مقدمة في التحليل الوراثي (الطبعة السابعة). نيويورك: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-3520-5تم الاسترجاع بتاريخ 19 مايو 2017 .
  4. ^ Wang C, Zeng J, Wang J (أبريل 2022). "الأساس البنيوي لنضج غلاف لامدا للبكتيريا العاثية". Structure . 30 (4): 637–645.e3. doi : 10.1016/j.str.2021.12.009 . PMID  35026161. S2CID  245933331.
  5. ^ abcd Rajagopala SV, Casjens S, Uetz P (سبتمبر 2011). "خريطة التفاعل البروتيني لبكتيريا لامدا". BMC Microbiology . 11 : 213. doi : 10.1186/1471-2180-11-213 . PMC 3224144. PMID  21943085 . 
  6. ^ abcde Casjens SR, Hendrix RW (مايو 2015). "Bacteriophage lambda: Early pioneer and still relevant". Virology . 479–480: 310–330. doi :10.1016/j.virol.2015.02.010. PMC 4424060. PMID 25742714  . 
  7. ^ "Escherichia phage Lambda، الجينوم الكامل". 6 يناير 2020.
  8. ^ ab Campbell AM (1996). "Bacteriophages". في Neidhardt FC، Curtiss R (المحرران).Escherichia coli و Salmonella typhimurium : Cellular and Molecular Biology . واشنطن العاصمة: ASM Press. OCLC  1156862867.
  9. ^ Werts C, Michel V, Hofnung M, Charbit A (فبراير 1994). "امتصاص البكتيريا العاثية لامدا على بروتين لامب من الإشريكية القولونية K-12: الطفرات النقطية في الجين J من لامدا المسؤولة عن امتداد نطاق المضيف". مجلة علم الجراثيم . 176 (4): 941-947. doi :10.1128/jb.176.4.941-947.1994. PMC 205142. PMID  8106335 . 
  10. ^ Erni B, Zanolari B, Kocher HP (أبريل 1987). "يتكون نفاذ المانوز في الإشريكية القولونية من ثلاثة بروتينات مختلفة. تسلسل الأحماض الأمينية ووظيفتها في نقل السكر، وفسفرة السكر، واختراق الحمض النووي لفاج لامدا". مجلة الكيمياء الحيوية . 262 (11): 5238-5247. doi : 10.1016/S0021-9258(18)61180-9 . PMID  2951378.
  11. ^ Liu X, Zeng J, Huang K, Wang J (أغسطس 2019). "بنية ناقل المانوز لنظام الفوسفورترانسفيراز البكتيري". Cell Research . 29 (8): 680–682. doi :10.1038/s41422-019-0194-z. PMC 6796895. PMID  31209249 . 
  12. ^ Kobiler O, Rokney A, Oppenheim AB (أبريل 2007). "Phage lambda CIII: a protease inhibitor regulating the lysis-lysogeny decision". PLOS ONE . ​​2 (4): e363. Bibcode :2007PLoSO...2..363K. doi : 10.1371/journal.pone.0000363 . PMC 1838920 . PMID  17426811. 
  13. ^ Henkin, Tina M.; Peters, Joseph E. (2020). "Bacteriophages and Transduction". Snyder and Champness molecular genetics ofbacterial (Fifth ed.). Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. ص 293-294. ISBN 9781555819750.
  14. ^ ab Santangelo TJ, Artsimovitch I (مايو 2011). "الإنهاء والإنهاء المضاد: بوليميراز الحمض النووي الريبي يمر بعلامة توقف". مراجعات الطبيعة. علم الأحياء الدقيقة . 9 (5): 319-329. doi :10.1038/nrmicro2560. PMC 3125153. PMID  21478900 . 
  15. ^ Thomason LC, Schiltz CJ, Court C, Hosford CJ, Adams MC, Chappie JS, Court DL (أكتوبر 2021). "تساعد وظائف البكتيريا λ RexA وRexB في الانتقال من التحلل إلى النمو التحللي". علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 116 (4): 1044-1063. doi :10.1111/mmi.14792. PMC 8541928. PMID  34379857 . 
  16. ^ Deighan P, Hochschild A (فبراير 2007). "ينظم بروتين الإنهاء المضاد للبكتيريا lambdaQ التعبير الجيني المتأخر كمكون ثابت لمجمع استطالة النسخ". علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 63 (3): 911–920. doi : 10.1111/j.1365-2958.2006.05563.x . PMID  17302807.
  17. ^ Brammar WJ, Hadfield C (نوفمبر 1984). "برنامج لبناء فاج لامدا". مجلة علم الأجنة والمورفولوجيا التجريبية . 83 (ملحق): 75-88. PMID  6241940.
  18. ^ Guzmán P, Guarneros G (مارس 1989). "المواقع الجينية للعاثيات المشاركة في تثبيط نمو لامدا بواسطة الطفرة الرابية لـ Escherichia coli". علم الوراثة . 121 (3): 401-409. doi :10.1093/genetics/121.3.401. PMC 1203628. PMID 2523838  . 
  19. ^ Groth AC, Calos MP (يناير 2004). "Phage integrases: biology and applications". مجلة علم الأحياء الجزيئي . 335 (3): 667–678. doi :10.1016/j.jmb.2003.09.082. PMID  14687564.
  20. ^ Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (مايو 2008). "القيمة التكيفية للجنس في مسببات الأمراض الميكروبية". العدوى والوراثة والتطور . 8 (3): 267-285. doi :10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.
  21. ^ Huskey RJ (أبريل 1969). "Multiplicity reactivation as a test for recombination function". Science . 164 (3877): 319–320. Bibcode :1969Sci...164..319H. doi :10.1126/science.164.3877.319. PMID  4887562. S2CID  27435591.
  22. ^ Blanco M, Devoret R (مارس 1973). "آليات الإصلاح المشاركة في إعادة تنشيط الطليعة وإعادة تنشيط الأشعة فوق البنفسجية لفاج لامدا المشع بالأشعة فوق البنفسجية". أبحاث الطفرات . 17 (3): 293-305. doi :10.1016/0027-5107(73)90001-8. PMID  4688367.
  23. ^ "باربرا جيه ماير". HHMI Interactive .
  24. ^ Burz DS, Beckett D, Benson N, Ackers GK (يوليو 1994). "التجميع الذاتي لقمع البكتيريا العاثية lambda cI: تأثيرات الطفرات في الموقع الواحد على توازن المونومر-الثنائي". الكيمياء الحيوية . 33 (28): 8399-8405. doi :10.1021/bi00194a003. PMID  8031775.
  25. ^ Ptashne M (2004). A genetic switch: phage lambda revisited (الطبعة الثالثة). Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ص. 112. ISBN 978-0-87969-716-7.
  26. ^ Arkin A, Ross J, McAdams HH (أغسطس 1998). "التحليل الحركي العشوائي لتشعب مسار النمو في خلايا الإشريكية القولونية المصابة ببكتيريا لامدا". علم الوراثة . 149 (4): 1633–1648. doi :10.1093/genetics/149.4.1633. PMC 1460268. PMID  9691025 . 
  27. ^ St-Pierre F, Endy D (ديسمبر 2008). "تحديد اختيار مصير الخلية أثناء الإصابة ببكتيريا فاج لامدا". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 105 (52): 20705–20710. Bibcode :2008PNAS..10520705S. doi : 10.1073/pnas.0808831105 . PMC 2605630. PMID  19098103 . 
  28. ^ بيترا، إيمانويل؛ تي فيلثويس، آرتجان جيه دبليو (2021-01-01)، كاميرون، كريج إي؛ أرنولد، جيمي جيه؛ كاجوني، لوري إس. (المحررون)، "الفصل الرابع - فهم التكاثر الفيروسي والنسخ باستخدام تقنيات الجزيء الواحد"، الإنزيمات ، إنزيمات التكاثر الفيروسي ومثبطاتها الجزء أ، 49 ، أكاديميك بريس: 83-113، doi :10.1016/bs.enz.2021.07.005، PMID  34696840، S2CID  239573473 ، تم الاسترجاع في 2023-11-28
  29. ^ Reece-Hoyes, John S.; Walhout, Albertha JM (2018-01-01). "Gateway Recombination Cloning". Cold Spring Harbor Protocols . 2018 (1): pdb.top094912. doi :10.1101/pdb.top094912. ISSN  1940-3402. PMC 5935001. PMID 29295908  . 
  30. ^ Feiss, Michael; Catalano, Carlos Enrique (2013), "Bacteriophage Lambda Terminase and the Mechanism of Viral DNA Packaging", Madame Curie Bioscience Database [Internet] , Landes Bioscience , تم الاسترجاع في 2023-11-28
  31. ^ سميث، جورج ب. (1985). "فاج الاندماج الخيطي: متجهات تعبيرية جديدة تعرض مستضدات مستنسخة على سطح الفيروس". ساينس . 228 (4705): 1315–1317. رمز Bibcode :1985Sci...228.1315S. doi :10.1126/science.4001944. ISSN  0036-8075. JSTOR  1694587. PMID  4001944.
  32. ^ Iwagami, Yoshifumi; Casulli, Sarah; Nagaoka, Katsuya; Kim, Miran; Carlson, Rolf I.; Ogawa, Kosuke; Lebowitz, Michael S.; Fuller, Steve; Biswas, Biswajit; Stewart, Solomon; Dong, Xiaoqun; Ghanbari, Hossein; Wands, Jack R. (2017). "لقاح لامدا القائم على البكتيريا يحفز المناعة المضادة للأورام في سرطان الخلايا الكبدية". Heliyon . 3 (9): e00407. Bibcode :2017Heliy...300407I. doi : 10.1016/j.heliyon.2017.e00407 . PMC 5619992. PMID  28971150 . 
  33. ^ "7.14E: Bacteriophage Lambda as a Cloning Vector". Biology LibreTexts . 2017-05-17 . تم الاسترجاع في 2023-11-28 .

قراءة إضافية

  • واتسون جيه، بيكر تي، بيل إس، جان إيه، ليفين إم، لوسيك آر. علم الأحياء الجزيئي للجين (الطبعة الدولية) (الطبعة السادسة).
  • بتاشني إم ، هوبكنز إن (أغسطس 1968). "المشغلون الذين يتم التحكم بهم بواسطة مثبط البكتيريا العصوية لامدا". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 60 (4): 1282-7. رمز Bibcode :1968PNAS...60.1282P. doi : 10.1073/pnas.60.4.1282 . PMC  224915. PMID  5244737 .
  • ماير بي جيه، كلايد دي جي، بتاشني إم (ديسمبر 1975). "مثبط لامدا يوقف نسخ جينه الخاص". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 72 (12): 4785-89. رمز Bibcode :1975PNAS...72.4785M. doi : 10.1073/pnas.72.12.4785 . PMC  388816. PMID  1061069 .
  • Brüssow H, Hendrix RW (يناير 2002). "علم الجينوم البكتيري: الصغير جميل". Cell . 108 (1): 13–16. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00637-7 . PMID  11792317.
  • Dodd IB, Shearwin KE, Egan JB (أبريل 2005). "إعادة النظر في تنظيم الجينات في البكتيريا العاثية لامدا". الرأي الحالي في علم الوراثة والتنمية . 15 (2): 145-152. doi :10.1016/j.gde.2005.02.001. PMID  15797197.
  • فريدمان دي، كورت دي إل (أبريل 2001). "بكتيريا لامدا: حية وبصحة جيدة وما زالت تؤدي عملها". الرأي الحالي في علم الأحياء الدقيقة . 4 (2): 201-207. doi :10.1016/S1369-5274(00)00189-2. PMID  11282477.
  • Gottesman ME, Weisberg RA (ديسمبر 2004). "Little lambda, who made thee؟". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 68 (4): 796–813. doi :10.1128/MMBR.68.4.796-813.2004. PMC  539004. PMID  15590784 .
  • هندريكس آر دبليو، سميث إم سي، بيرنز آر إن، فورد إم إي، هاتفول جي إف (مارس 1999). "العلاقات التطورية بين البكتيريا العاثية والطلائعية المتنوعة: كل العالم عبارة عن عاثية". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 (5): 2192-2197. رمز Bibcode : 1999PNAS...96.2192H. doi : 10.1073 /pnas.96.5.2192 . PMC  26759. PMID  10051617.
  • كيتانو هـ (مارس 2002). "علم الأحياء النظمي: نظرة عامة موجزة". مجلة العلوم . 295 (5560): 1662–1664. رمز Bibcode :2002Sci...295.1662K. doi :10.1126/science.1069492. PMID  11872829. S2CID  2703843.
  • بتاشني، م. "التبديل الجيني: إعادة النظر في فاج لامدا"، الطبعة الثالثة 2003
  • Ptashne M (يونيو 2005). "تنظيم النسخ: من لامدا إلى حقيقيات النوى". الاتجاهات في العلوم الكيميائية الحيوية . 30 (6): 275-279. doi : 10.1016/j.tibs.2005.04.003 . PMID  15950866.
  • سنيدر ل، شامبينس دبليو (2007). علم الوراثة الجزيئي للبكتيريا (الطبعة الثالثة).(يحتوي على نظرة عامة مفيدة وموضحة جيدًا عن البكتيريا العاثية لامدا)
  • "عدوى البكتيريا العاثية لامدا". Splasho . مؤرشف من الأصل في 19 مارس 2014.(يوضح الجينات النشطة في جميع مراحل دورة الحياة)
تحتوي ويكيميديا ​​كومنز على الوسائط المتعلقة بـ فاج لامدا .
تحتوي ويكي أنواع على معلومات متعلقة بفيروسات تشبه Λ .
  • دورة الحياة، رسوم متحركة أساسية لدورة حياة لامدا (توضح مسارات العدوى والتحلل/التحلل الخلوي مع بعض التفاصيل المتعلقة بالبروتين والنسخ)
  • فيديو مجهر زمني من معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا يظهر كل من التحلل والتحلل الخلوي بواسطة البكتيريا العصوية لامدا
  • دورة حياة البكتيريا العاثية لامدا (عرض مرئي أساسي لدورة حياة البكتيريا العاثية لامدا)
  • جينوم لامدا فاج في GenBank
  • بروتيوم مرجعي لبكتيريا لامدا من UniProt
  • هياكل بروتينات البكتيريا العاثية لامدا في NCBI (عرض ثلاثي الأبعاد لهياكل البروتين للبكتيريا العاثية لامدا)
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Lambda_phage&oldid=1248378761"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate