PSMB2

الوحدة الفرعية بيتا من النوع الثاني للبروتيازوم، والمعروفة أيضًا باسم الوحدة الفرعية بيتا 4 للبروتيازوم 20S (وفقًا للتسمية المنهجية)، هي بروتين يُشفَّر في الإنسان بواسطة جين PSMB2 . [ 5 ] يُعد هذا البروتين واحدًا من 17 وحدة فرعية أساسية (الوحدات الفرعية ألفا 1-7، والوحدات الفرعية بيتا التكوينية 1-7، والوحدات الفرعية القابلة للتحفيز بما في ذلك بيتا 1i، وبيتا 2i، وبيتا 5i) التي تُساهم في التجميع الكامل لمركب البروتيازوم 20S . على وجه الخصوص، تتجمع الوحدة الفرعية بيتا من النوع الثاني للبروتيازوم، جنبًا إلى جنب مع وحدات بيتا الفرعية الأخرى، لتكوين حلقتين سباعيتين، ثم حجرة بروتينية لتحليل الركائز. يتعرف البروتيازوم حقيقي النواة على البروتينات القابلة للتحلل، بما في ذلك البروتينات التالفة لأغراض مراقبة جودة البروتين، أو مكونات البروتين التنظيمية الرئيسية للعمليات البيولوجية الديناميكية. تتمثل الوظيفة الأساسية للبروتيازوم المعدل، وهو البروتيازوم المناعي، في معالجة ببتيدات MHC من الفئة الأولى.

بناء

جين

يشفر الجين PSMB2 أحد أفراد عائلة البروتيازوم من النوع B، والمعروفة أيضًا باسم عائلة T1B، وهي الوحدة الفرعية بيتا الأساسية 20S. [ 6 ] يحتوي الجين على 7 إكسونات ويقع في النطاق الكروموسومي 1p34.2.

بروتين

يبلغ حجم الوحدة الفرعية بيتا من النوع الثاني للبروتيازوم البشري 23 كيلو دالتون، وتتكون من 201 حمض أميني. وتبلغ قيمة الرقم الهيدروجيني النظري المحسوب لهذا البروتين 6.52.

تجميع معقد

البروتيازوم هو مُركّب بروتيني متعدد الحفز ذو بنية أساسية مُنظّمة للغاية (20S ) . تتكون هذه البنية الأساسية الأسطوانية الشكل من 4 حلقات مُتراصة محوريًا، كل حلقة تضم 28 وحدة فرعية غير متطابقة: تتكون كل من الحلقتين الطرفيتين من 7 وحدات فرعية ألفا، بينما تتكون كل من الحلقتين المركزيتين من 7 وحدات فرعية بيتا. تحتوي ثلاث وحدات فرعية بيتا (بيتا 1، بيتا 2، وبيتا 5) على موقع نشط للتحلل البروتيني، ولكل منها تفضيلات ركائز مُختلفة. تتوزع البروتيازومات في جميع أنحاء الخلايا حقيقية النواة بتركيز عالٍ، وتقوم بتحليل الببتيدات في عملية تعتمد على الأدينوسين ثلاثي الفوسفات/اليوبيكويتين، وذلك عبر مسار غير ليزوزومي. [ 7 ] [ 8 ]

وظيفة

تُدعم وظائف البروتين ببنيته الثلاثية وتفاعله مع البروتينات المرتبطة به. وباعتباره أحد الوحدات الفرعية الـ 28 للبروتيازوم 20S، تُساهم الوحدة الفرعية بيتا من النوع الثاني للبروتيازوم في تكوين بيئة بروتينية لتحلل الركائز. تُظهر الأدلة المستقاة من البنية البلورية لمركب البروتيازوم 20S المعزول أن حلقتي الوحدات الفرعية بيتا تُشكلان حجرة بروتينية، وتحافظان على جميع مواقع التحلل البروتيني النشطة داخل هذه الحجرة. [ 8 ] في الوقت نفسه، تُشكل حلقات الوحدات الفرعية ألفا مدخل الركائز إلى الحجرة البروتينية. في مركب البروتيازوم 20S غير النشط، تُحرس البوابة المؤدية إلى الحجرة البروتينية الداخلية بواسطة النهايات الأمينية للوحدات الفرعية ألفا. يمنع هذا التصميم البنيوي الفريد التفاعل العشوائي بين المواقع النشطة للتحلل البروتيني والركيزة البروتينية، مما يجعل تحلل البروتين عملية مُنظمة بدقة. [ 9 ] [ 10 ] عادةً ما يكون مُركّب البروتيازوم 20S غير نشط وظيفيًا بمفرده. يُمكن تنشيط القدرة البروتينية للجسيم الأساسي 20S (CP) عند ارتباطه بجسيم تنظيمي واحد أو اثنين (RP) على أحد جانبي حلقات ألفا أو كليهما. تشمل هذه الجسيمات التنظيمية مُركّبات البروتيازوم 19S، ومُركّب البروتيازوم 11S، وغيرها. بعد ارتباط CP-RP، يتغير تركيب بعض وحدات ألفا الفرعية، مما يؤدي بالتالي إلى فتح بوابة دخول الركيزة. بالإضافة إلى الجسيمات التنظيمية، يُمكن أيضًا تنشيط البروتيازومات 20S بفعالية عن طريق مُعالجات كيميائية خفيفة أخرى، مثل التعريض لمستويات منخفضة من دوديسيل كبريتات الصوديوم (SDS) أو NP-14. [ 10 ] [ 11 ]

الأهمية السريرية

يُعدّ البروتيازوم ووحداته الفرعية ذا أهمية سريرية لسببين رئيسيين على الأقل: (1) قد يرتبط خلل في تجميع هذا المركب أو خلل وظيفي في البروتيازوم بالآليات المرضية الكامنة وراء أمراض معينة، و(2) يمكن استغلالها كأهداف دوائية للتدخلات العلاجية. وقد بُذلت جهود متزايدة مؤخرًا لدراسة البروتيازوم بهدف تطوير مؤشرات واستراتيجيات تشخيصية جديدة. ومن المتوقع أن يُفضي فهمٌ أعمق وأشمل للآليات المرضية للبروتيازوم إلى تطبيقات سريرية في المستقبل.

تُشكّل البروتيازومات عنصرًا محوريًا في نظام اليوبيكويتين-بروتيازوم (UPS) [ 12 ] ونظام مراقبة جودة البروتين الخلوي (PQC) المقابل. يُعدّ يوبيكويتين البروتين وما يتبعه من تحلل وتفكك بواسطة البروتيازوم آليات مهمة في تنظيم دورة الخلية ، ونموها وتمايزها، ونسخ الجينات ، ونقل الإشارات، والاستماتة الخلوية . [ 13 ] ونتيجةً لذلك، يؤدي ضعف تجميع ووظيفة مُركّب البروتيازوم إلى انخفاض النشاط البروتيني وتراكم أنواع البروتينات التالفة أو المطوية بشكل خاطئ. قد يُساهم هذا التراكم البروتيني في إمراضية وخصائص النمط الظاهري في الأمراض التنكسية العصبية، [ 14 ] [ 15 ] وأمراض القلب والأوعية الدموية، [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] والاستجابات الالتهابية وأمراض المناعة الذاتية، [ 19 ] واستجابات تلف الحمض النووي الجهازية التي تؤدي إلى الأورام الخبيثة . [ 20 ]

أشارت العديد من الدراسات التجريبية والسريرية إلى أن اضطرابات نظام اليوبيكويتين-بروتيازوم (UPS) واختلالاته تساهم في نشأة العديد من الأمراض التنكسية العصبية والعضلية، بما في ذلك مرض الزهايمر [ 21 ] ، ومرض باركنسون [ 22 ] ، ومرض بيك [ 23 ] ، والتصلب الجانبي الضموري (ALS) [ 23 ] ، ومرض هنتنغتون ، ومرض كروتزفيلد-جاكوب ، وأمراض الخلايا العصبية الحركية ، وأمراض عديد الغلوتامين (PolyQ)، وضمور العضلات [ 24 ] ، والعديد من الأشكال النادرة للأمراض التنكسية العصبية المرتبطة بالخرف [ 25 ] . وباعتباره جزءًا من نظام اليوبيكويتين-بروتيازوم (UPS)، يحافظ البروتيازوم على استتباب بروتينات القلب، وبالتالي يلعب دورًا هامًا في إصابة القلب الإقفارية [ 26 ] ، وتضخم البطين [ 27 ] ، وفشل القلب . [ 28 ] بالإضافة إلى ذلك، تتراكم الأدلة على أن نظام البروتياز اليوبيكويتين (UPS) يلعب دورًا أساسيًا في التحول الخبيث. إذ يلعب التحلل البروتيني بواسطة نظام البروتياز اليوبيكويتين دورًا رئيسيًا في استجابة الخلايا السرطانية للإشارات المحفزة التي تُعد حاسمة لتطور السرطان. وبناءً على ذلك، فإن التعبير الجيني عن طريق تحلل عوامل النسخ ، مثل p53 و c-jun و c-Fos و NF-κB و c-Myc وHIF-1α وMATα2 و STAT3 والبروتينات الرابطة لعنصر تنظيم الستيرول ومستقبلات الأندروجين، كلها تخضع لسيطرة نظام البروتياز اليوبيكويتين، وبالتالي فهي متورطة في تطور العديد من الأورام الخبيثة. [ 29 ] علاوة على ذلك، ينظم نظام البروتياز اليوبيكويتين تحلل منتجات جينات كابتة للأورام، مثل جين الورم الحميد القولوني ( APC ) في سرطان القولون والمستقيم، وسرطان الشبكية (Rb). وجين فون هيبل-لينداو الكابت للورم (VHL)، بالإضافة إلى عدد من الجينات الأولية المسرطنة ( Raf ، Myc ، Myb ، Rel ، Src ، Mos ، ABL).يشارك نظام البروتيازوم واليوبيكويتين (UPS) أيضًا في تنظيم الاستجابات الالتهابية. يُعزى هذا النشاط عادةً إلى دور البروتيازومات في تنشيط عامل النسخ النووي NF-κB، الذي بدوره ينظم التعبير عن السيتوكينات المحفزة للالتهاب، مثل عامل نخر الورم ألفا (TNF-α) ، والإنترلوكين بيتا ( IL-β) ، والإنترلوكين 8 ( IL-8 ) ، وجزيئات الالتصاق ( ICAM-1 ، و VCAM-1 ، و P-selectinوالبروستاجلاندينات ، وأكسيد النيتريك (NO). [ 19 ] بالإضافة إلى ذلك، يلعب نظام البروتيازوم واليوبيكويتين دورًا في الاستجابات الالتهابية كمنظم لتكاثر الكريات البيضاء، وذلك بشكل رئيسي من خلال تحلل السيكلينات وتفكيك مثبطات كينازات البروتين المعتمدة على السيكلين (CDK ) . [ 30 ] أخيرًا، يُظهر مرضى أمراض المناعة الذاتية، مثل الذئبة الحمامية الجهازية (SLE) ، ومتلازمة شوغرن، والتهاب المفاصل الروماتويدي (RA)، وجودًا ملحوظًا للبروتيازومات في الدورة الدموية، والتي يمكن استخدامها كمؤشرات حيوية سريرية. [ 31 ]

أظهرت الوحدة الفرعية بيتا من النوع الثاني للبروتيازوم، والمعروفة أيضًا باسم الوحدة الفرعية بيتا 4 للبروتيازوم 20S، وهي بروتين مُشفَّر بواسطة جين PSMB2 في البشر، استقرارًا في خلايا غسل القصبات الهوائية ( BAL ) في الرئة خلال بعض الحالات السريرية مثل أمراض الرئة الخلالية والساركويد ( بالتوازي مع RPL32). ولذلك، يُعد PSMB2 جينًا مرجعيًا مناسبًا للتطبيع في خلايا غسل القصبات الهوائية في الساركويد، وأمراض الرئة الخلالية الأخرى، خلال الدراسات السريرية التي تُطبِّق تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي العكسي ( qRT-PCR) . [ 32 ]

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000126067 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000028837 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. نوثوانغ إتش جي، تامورا تي، تاناكا كيه، إيتشيهارا إيه (أكتوبر 1994). "تحليلات التسلسل والمقارنات بين الأنواع لثلاث وحدات فرعية جديدة من البروتيازوم البشري، HsN3 وHsC7-I وHsC10-II، تحدد بقايا الموقع النشط المحتملة للتحلل البروتيني". مجلة بيوشيميكا وبيوفيزيكا أكتا (BBA) - بنية الجينات وتعبيرها . 1219 (2): 361-368 . doi : 10.1016/0167-4781(94)90060-4 . PMID 7918633 . 
  6. "Entrez Gene: PSMB2 proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 2" .
  7. كوكس أو، تاناكا ك، غولدبيرغ إيه إل (1996). "بنية ووظائف البروتيازومات 20S و26S". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 65 : 801-47 . doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 . 
  8. 1 2 تومكو آر جيه، هوخستراسر إم (2013). " البنية الجزيئية وتجميع البروتيازوم حقيقي النواة" . المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 82 : 415-445 . doi : 10.1146/annurev-biochem-060410-150257 . PMC 3827779. PMID 23495936 .  
  9. غرول م، ديتزل ل، لوي ج، ستوك د، بوختلر م، بارتونيك هـ د، هوبر ر (أبريل 1997). "بنية البروتيازوم 20S من الخميرة بدقة 2.4 أنغستروم". نيتشر . 386 ( 6624): 463-471 . Bibcode : 1997Natur.386..463G . doi : 10.1038/386463a0 . PMID 9087403. S2CID 4261663 .  
  10. 1 2 غرول م، باجوريك م، كولر أ، مورودر ل، روبين د.م، هوبر ر، غليكمان م.هـ، فينلي د (نوفمبر 2000). "قناة مُبَوَّبة إلى الجسيم الأساسي للبروتيازوم". بيولوجيا التركيب الطبيعي . 7 (11): 1062-1067 . doi : 10.1038/80992 . PMID 11062564. S2CID 27481109 .  
  11. زونغ سي، غوميز إيه في، دروز أو، لي إكس، يونغ جي دبليو، برهان بي، كياو إكس، فرينش إس دبليو، بارداغ-غورس إف، بينغ بي (أغسطس 2006). "تنظيم البروتيازومات 20S القلبية في الفئران: دور الشركاء المرتبطين" . مجلة أبحاث الدورة الدموية . 99 (4): 372-380 . doi : 10.1161/01.RES.0000237389.40000.02 . PMID 16857963 . 
  12. كليجر جي، مايور تي (يونيو 2014). " رحلة محفوفة بالمخاطر: جولة في نظام اليوبيكويتين-البروتيازوم" . اتجاهات في بيولوجيا الخلية . 24 (6): 352-359 . doi : 10.1016/j.tcb.2013.12.003 . PMC 4037451. PMID 24457024 .  
  13. غولدبيرغ، أ. ل.، شتاين، ر.، آدامز، ج. (أغسطس 1995). "رؤى جديدة حول وظيفة البروتيازوم: من البكتيريا القديمة إلى تطوير الأدوية" . الكيمياء والبيولوجيا . 2 (8): 503-508 . doi : 10.1016/1074-5521(95)90182-5 . PMID 9383453 . 
  14. سوليستيو، واي إيه، وهيس ، كيه (يناير 2015). "نظام اليوبيكويتين-البروتيازوم واضطراب المرافقات الجزيئية في مرض الزهايمر". علم الأحياء العصبية الجزيئية . 53 (2): 905-31 . doi : 10.1007/s12035-014-9063-4 . PMID 25561438. S2CID 14103185 .  
  15. أورتيغا ز، لوكاس جيه جيه (2014). " دور نظام اليوبيكويتين-البروتيازوم في مرض هنتنغتون" . فرونتيرز إن موليكولار نيوروساينس . 7 : 77. doi : 10.3389/fnmol.2014.00077 . PMC 4179678. PMID 25324717 .  
  16. ساندري م، روبنز ج (يونيو 2014). "السمية البروتينية: مرضٌ غير مُقدَّر حق قدره في أمراض القلب" . مجلة علم وظائف القلب الجزيئي والخلوي . 71 : 3-10 . doi : 10.1016/j.yjmcc.2013.12.015 . PMC 4011959. PMID 24380730 .  
  17. دروز أو، تاغتماير إتش (ديسمبر 2014). "استهداف نظام اليوبيكويتين-بروتيازوم في أمراض القلب: أساس استراتيجيات علاجية جديدة" . مضادات الأكسدة وإشارات الأكسدة والاختزال . 21 (17): 2322-43 . doi : 10.1089/ars.2013.5823 . PMC 4241867. PMID 25133688 .  
  18. وانغ زد في، هيل جيه إيه (فبراير 2015). "مراقبة جودة البروتين واستقلابه: تحكم ثنائي الاتجاه في القلب" . استقلاب الخلية . 21 (2): 215-226 . doi : 10.1016/j.cmet.2015.01.016 . PMC 4317573. PMID 25651176 .  
  19. 1 2 كارين م، ديلهاس م (فبراير 2000). "كيناز IκB (IKK) وNF-κB: عناصر أساسية في الإشارات الالتهابية". ندوات في علم المناعة . 12 (1): 85-98 . doi : 10.1006/smim.2000.0210 . PMID 10723801 . 
  20. إرمولاييفا، م. أ.، داخوفنيك، أ.، شوماخر، ب. (يناير 2015). "آليات مراقبة الجودة في استجابات تلف الحمض النووي الخلوية والجهازية" . مجلة أبحاث الشيخوخة . 23 (الجزء أ): 3-11 . doi : 10.1016/j.arr.2014.12.009 . PMC 4886828. PMID 25560147 .  
  21. ^ Checler F، da Costa CA، Ancolio K، Chevallier N، Lopez-Perez E، Marambaud P (يوليو 2000). "دور البروتيزوم في مرض الزهايمر" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - الأساس الجزيئي للمرض . 1502 (1): 133– 8. دوى : 10.1016/s0925-4439(00)00039-9 . بميد 10899438 . 
  22. تشونغ كيه كيه، داوسون في إل، داوسون تي إم (نوفمبر 2001). "دور مسار اليوبيكويتين-البروتيازوم في مرض باركنسون واضطرابات التنكس العصبي الأخرى". اتجاهات في علم الأعصاب . 24 (11 ملحق): S7–14. doi : 10.1016/s0166-2236(00)01998-6 . PMID 11881748. S2CID 2211658 .  
  23. 1 2 إيكيدا ك، أكياما هـ، أراي ت، أوينو هـ، تسوتشيا ك، كوساكا ك (يوليو 2002). "إعادة تقييم مورفومترية للجهاز العصبي الحركي في مرض بيك والتصلب الجانبي الضموري المصحوب بالخرف". مجلة أكتا نيوروباثولوجيكا . 104 (1): 21-8 . doi : 10.1007/s00401-001-0513-5 . PMID 12070660. S2CID 22396490 .  
  24. ماثيوز ك.د، مور س.أ (يناير 2003). "ضمور العضلات الحزامية الطرفية". تقارير علم الأعصاب وعلم الأعصاب الحالي . 3 (1): 78-85 . doi : 10.1007 / s11910-003-0042-9 . PMID 12507416. S2CID 5780576 .  
  25. ماير آر جيه (مارس 2003). "من التنكس العصبي إلى التوازن العصبي: دور اليوبيكويتين". أخبار ووجهات نظر الأدوية . 16 (2): 103-108 . doi : 10.1358/dnp.2003.16.2.829327 . PMID 12792671 . 
  26. كاليس جيه، باول إس آر (فبراير 2013). "نظام البروتيازوم اليوبيكويتين ونقص تروية عضلة القلب" . المجلة الأمريكية لعلم وظائف الأعضاء. القلب والدورة الدموية . 304 (3): H337–49. doi : 10.1152/ajpheart.00604.2012 . PMC 3774499. PMID 23220331 .  
  27. بريدمور جيه إم، وانغ بي، ديفيس إف، بارتولون إس، ويستفال إم في، دايك دي بي، باجاني إف، باول إس آر، داي إس إم (مارس 2010). "خلل وظيفة البروتيازوم اليوبيكويتين في اعتلالات عضلة القلب الضخامية والمتوسعة لدى الإنسان" . سيركوليشن . 121 (8): 997-1004 . doi : 10.1161/CIRCULATIONAHA.109.904557 . PMC 2857348. PMID 20159828 .  
  28. باول إس آر (يوليو 2006). "نظام اليوبيكويتين-البروتيازوم في وظائف القلب وأمراضه". المجلة الأمريكية لعلم وظائف الأعضاء. القلب والدورة الدموية . 291 (1): H1– H19 . doi : 10.1152/ajpheart.00062.2006 . PMID 16501026. S2CID 7073263 .  
  29. آدامز ج (أبريل 2003). "إمكانية تثبيط البروتيازوم في علاج السرطان". اكتشاف الأدوية اليوم . 8 (7): 307-315 . doi : 10.1016/s1359-6446(03)02647-3 . PMID 12654543 . 
  30. بن نيريا، ي. (يناير 2002). "الوظائف التنظيمية لليوبيكويتين في الجهاز المناعي". مجلة نيتشر إيمونولوجي . 3 (1): 20-26 . doi : 10.1038/ni0102-20 . PMID 11753406. S2CID 26973319 .  
  31. إيغيرر ك، كوكلكورن يو، رودولف بي إي، روكيرت جي سي، دورنر تي، بورميستر جي آر، كلوتزل بي إم، فيست إي (أكتوبر 2002). "البروتيازومات الدائرة هي مؤشرات على تلف الخلايا والنشاط المناعي في أمراض المناعة الذاتية". مجلة الروماتيزم . 29 (10): 2045-52 . PMID 12375310 . 
  32. كريغوفا إي، أراكليان أ، فيليروفا ر، زاتلوكال ج، مرازيك ف، نافراتيلوفا ز، كوليك ف، دو بوا ر.م، بيتريك م (31 يوليو 2008). "يُعدّ كلٌّ من PSMB2 وRPL32 مُقامين مناسبين لتطبيع أنماط التعبير الجيني في خلايا القصبات الهوائية" . بي إم سي بيولوجيا الجزيئات . 9 : 69. doi : 10.1186/1471-2199-9-69 . PMC 2529339. PMID 18671841 .  

للمزيد من القراءة