قائمة الجينومات حقيقية النواة التي تم تسلسلها

تحتوي هذه القائمة من الجينومات حقيقية النواة "المتسلسلة" على جميع حقيقيات النوى المعروفة التي لديها تسلسلات جينوم نووية وعضية كاملة متاحة للجمهور والتي تم تسلسلها وتجميعها وشرحها ونشرها؛ ولا يتم تضمين مسودات الجينومات، ولا تسلسلات العضيات فقط.
تم تحديد تسلسل الحمض النووي لأول مرة في عام 1977. وكان أول كائن حي حر المعيشة يتم تحديد تسلسل جينومه بالكامل هو بكتيريا Haemophilus influenzae ، في عام 1995. وفي عام 1996، كانت Saccharomyces cerevisiae (خميرة الخباز) أول تسلسل جينومي حقيقي النواة يتم إصداره، وفي عام 1998 تم إصدار أول تسلسل جينومي لكائن حقيقي النواة متعدد الخلايا، وهو Caenorhabditis elegans .
للاطلاع على جينومات الميتوكوندريا، انظر قائمة جينومات الميتوكوندريا .
فيما يلي أقدم تسعة جينومات تم تسلسلها للأوليات. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الأوليات التي تم تسلسلها .
| الكائن الحي | يكتب | الأهمية | حجم الجينوم | عدد الجينات المتوقعة | منظمة | سنة الإنجاز |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Guillardia theta | كريبتومونا | الكائن النموذجي | 0.551 ميجابايت ( جينوم النيوكليومورف فقط) | 465، [ 1 ] 513، 598 (UniProt) | المعهد الكندي للأبحاث المتقدمة، وجامعة فيليبس ماربورغ، وجامعة كولومبيا البريطانية | 2001 [ 1 ] |
| مستنسخ بلازموديوم فالسيباروم : 3D7 | الأبيكومبلكسا | مسببات الأمراض البشرية ( الملاريا ) | 22.9 ميجابايت | 5268 [ 2 ] | اتحاد مشروع جينوم الملاريا | 2002 [ 2 ] |
| بلازموديوم يويلي يويلي السلالة: 17XNL | الأبيكومبلكسا | مسببات الأمراض القوارضية (الملاريا) | 23.1 ميجابايت | 5878 [ 3 ] | معهد البحوث الطبية والبحوث البحرية الوطنية | 2002 [ 3 ] |
| سلالة الكريبتوسبوريديوم هومينيس : TU502 | الأبيكومبلكسا | مسببات الأمراض البشرية | 10.4 ميجابايت | 3994 [ 4 ] | جامعة فرجينيا كومنولث | 2004 [ 4 ] |
| عزلة كريبتوسبوريديوم بارفوم من النمط الجيني C- أو النمط الجيني 2 | الأبيكومبلكسا | مسببات الأمراض البشرية | 16.5 ميجابايت | 3807 [ 5 ] | جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو وجامعة مينيسوتا | 2004 [ 5 ] |
| سلالة Thalassiosira pseudonana : CCMP 1335 | الدياتوم | الكائن النموذجي | 34.5 ميجابايت | 11242 [ 6 ] | معهد الجينوم المشترك وجامعة واشنطن | 2004 [ 6 ] |
| سلالة التريبانوسوما كروزي : CL-Brener | الكينيتوبلاستيد | مسببات الأمراض البشرية | 67 ميجابايت | 22,570 [ 7 ] | معهد أبحاث الجينوم (TIGR) ومعهد كارولينسكا (KI) ومعهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية (SBRI) | 2005 [ 7 ] |
| تريبانوسوما بروساي، السلالة: TREU 927/4 | الكينيتوبلاستيد | مسببات الأمراض البشرية | 26 ميجابايت | 9068 [ 8 ] | معهد سانجر التابع لمؤسسة ويلكوم ترست ومعهد أبحاث الجينوم (TIGR) | 2005 [ 8 ] |
| سلالة الليشمانيا الكبرى : فريدلين | الكينيتوبلاستيد | مسببات الأمراض البشرية | 32.8 ميجابايت | 8272 [ 9 ] | معهد سانجر التابع لمؤسسة ويلكوم ترست ومعهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية (SBRI) | 2005 [ 9 ] |
النباتات
فيما يلي أقدم خمسة جينومات نباتية تم تسلسلها. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات النباتات التي تم تسلسلها .
| الكائن الحي | يكتب | الأهمية | حجم الجينوم | عدد الكروموسومات | عدد الجينات المتوقعة | منظمة | سنة الإنجاز |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| نبات الرشاد الأذيني (Arabidopsis thaliana) النمط البيئي: كولومبيا | الخردل البري (الجرجير البري) | مصنع نموذجي | 135 ميجابايت [ 10 ] | 5 | 25,498، [ 11 ] 27,400، [ 12 ] 31,670 (UniProt) | مبادرة جينوم نبات الرشاد [ 13 ] | 2000 [ 11 ] |
| سلالة Cyanidioschyzon merolae : 10D | الطحالب الحمراء | حقيقيات النوى البسيطة | 16.5 ميجابايت | 20 | 5331 [ 14 ] | جامعة طوكيو، وجامعة ريكيو، وجامعة سايتاما، وجامعة كوماموتو | 2004 [ 14 ] |
| Oryza sativa ssp indica | أرز | المحاصيل والكائنات النموذجية | 420 ميجابايت | 12 | 32-50,000 [ 15 ] | معهد بكين لعلم الجينوم، جامعة تشجيانغ والأكاديمية الصينية للعلوم | 2002 [ 15 ] |
| Ostreococcus tauri | الطحالب الخضراء | حقيقيات النوى البسيطة، جينوم صغير | 12.6 ميجابايت | 7969 (UniProt) | مختبر أراغو | 2006 [ 16 ] | |
| حور ثلاثي الثمار | الحور البلسمي أو الحور الأسود | عزل الكربون ، شجرة نموذجية، استخدام تجاري (الأخشاب)، ومقارنة مع نبات الرشاد (Arabidopsis thaliana). | 550 ميجابايت | 19 | 45,555 [ 17 ] | اتحاد جينوم الحور الدولي | 2006 [ 17 ] |
الفطريات
فيما يلي أقدم خمسة جينومات تم تسلسلها للفطريات. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الفطريات التي تم تسلسلها .
| الكائن الحي | يكتب | الأهمية | حجم الجينوم | عدد الجينات المتوقعة | منظمة | سنة الإنجاز |
|---|---|---|---|---|---|---|
| سلالة الخميرة Saccharomyces cerevisiae : S288C | السكاروميسيتات | خميرة الخباز؛ نموذج حقيقي النواة | 12.1 ميجابايت | 6294 [ 18 ] | التعاون الدولي لتسلسل جينوم الخميرة [ 19 ] | 1996 [ 18 ] |
| إنسيفاليتوزون كونيكولي | الميكروسبوريديوم | مسببات الأمراض البشرية | 2.9 ميجابايت | 1997 [ 20 ] | جينوسكوب وجامعة بليز باسكال | 2001 [ 20 ] |
| سلالة Schizosaccharomyces pombe : 972h- | شيزوساكاروميسيتس | نموذج حقيقيات النوى | 14 ميجابايت | 4824 [ 21 ] | معهد سانجر ومختبر كولد سبرينج هاربور | 2002 [ 21 ] |
| نيوروسبورا كراسا | السورداريوميسيتات | نموذج حقيقيات النوى | 40 ميجابايت | 10,082 [ 22 ] | معهد برود ، وجامعة أوريغون للصحة والعلوم ، وجامعة كنتاكي ، وجامعة كانساس | 2003 [ 22 ] |
| سلالة Phanerochaete chrysosporium : RP78 | أغاريكوميسيتس | فطر تعفن الخشب، يُستخدم في المعالجة الفطرية | 30 ميجابايت | 11,777 [ 23 ] | معهد الجينوم المشترك | 2004 [ 23 ] |
الحيوانات
فيما يلي أقدم خمسة جينومات حيوانية تم تسلسلها. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الحيوانات التي تم تسلسلها .
| الكائن الحي | يكتب | الأهمية | حجم الجينوم | عدد الجينات المتوقعة | منظمة | سنة الإنجاز |
|---|---|---|---|---|---|---|
| سلالة Caenorhabditis elegans : بريستول N2 | الديدان الأسطوانية | حيوان نموذجي | 100 ميجابايت | 19000 [ 24 ] | جامعة واشنطن ومعهد سانجر | 1998 [ 24 ] |
| ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر) | ذبابة الفاكهة | حيوان نموذجي | 165 ميجابايت | 13600 [ 25 ] | سيليرا، جامعة كاليفورنيا في بيركلي، كلية بايلور للطب، المجموعة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية | 2000 [ 25 ] |
| سلالة البعوضة الأنوفيلية الغامبية : بيست | البعوض | ناقل الملاريا | 278 ميجابايت | 13683 [ 26 ] | سيليرا جينوميكس وجينوسكوب | 2002 [ 26 ] |
| تاكيفوجو روبيبس | سمكة البخاخ | فقاري ذو جينوم صغير | 390 ميجابايت | 22–29,000 [ 27 ] | اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي [ 28 ] | 2002 [ 29 ] |
| الإنسان العاقل | بشر | 3.2 جيجابايت [ 30 ] | 18826 (اتحاد CCDS) | اتحاد مشروع الجينوم البشري وشركة سيليرا جينوميكس | مسودة 2001 [ 31 ] [ 32 ] مكتملة 2006 [ 33 ] |
انظر أيضاً
- مشروع الجينوم ، الجينوم البشري
- التنظيم الجينومي
- تاريخ علم الوراثة
- قوائم الجينومات المتسلسلة
- قائمة الجينومات البكتيرية المتسلسلة
- قائمة الجينومات الأثرية المتسلسلة
- قائمة الجينومات الميتوكوندرية المتسلسلة
- قائمة البلاستومات المتسلسلة
- قائمة الجينومات الحيوانية التي تم تسلسلها
- قائمة جينومات الميتوكوندريا الحيوانية التي تم تسلسلها
- قائمة جينومات الفطريات التي تم تسلسلها
- قائمة جينومات الميتوكوندريا للفطريات التي تم تسلسلها
- قائمة الجينومات النباتية التي تم تسلسلها
- قائمة جينومات الميتوكوندريا النباتية التي تم تسلسلها
- قائمة جينومات الطلائعيات التي تم تسلسلها
مراجع
- 1 2 دوغلاس إس، زاونر إس، فراونهولز إم، وآخرون (أبريل 2001). "الجينوم المختزل للغاية لنواة طحلب مستعبدة" . نيتشر . 410 (6832): 1091-1096 . Bibcode : 2001Natur.410.1091D . doi : 10.1038/35074092 . PMID 11323671 .
- 1 2 غاردنر إم جيه، هول إن، فونغ إي، وآخرون . (أكتوبر 2002). "تسلسل جينوم طفيل الملاريا البشري بلازموديوم فالسيباروم " . نيتشر . 419 (6906): 498-511 . Bibcode : 2002Natur.419..498G . doi : 10.1038 / nature01097 . PMC 3836256. PMID 12368864 .
- كارلتون ، جيه إم، أنجيولي، إس في، سوه، بي بي، وآخرون (أكتوبر 2002). "تسلسل الجينوم والتحليل المقارن لطفيلي الملاريا النموذجي في القوارض ، بلازموديوم يويلي يويلي " . مجلة نيتشر . 419 (6906): 512-519 . Bibcode : 2002Natur.419..512C . doi : 10.1038/nature01099 . PMID 12368865 .
- 1 2 Xu P, Widmer G, Wang Y, et al. (أكتوبر 2004). "جينوم كريبتوسبوريديوم هومينيس " . Nature . 431 (7012): 1107–1112 . Bibcode : 2004Natur.431.1107X . doi : 10.1038/nature02977 . PMID 15510150 .
- 1 2 أبراهامسن إم إس، تمبلتون تي جيه، إينوموتو إس، وآخرون . (أبريل 2004). "التسلسل الجينومي الكامل للأبيكومبلكسا، كريبتوسبوريديوم بارفوم " . مجلة ساينس . 304 (5669): 441-445 . Bibcode : 2004Sci...304..441A . doi : 10.1126/science.1094786 . PMID 15044751. S2CID 26434820 .
- 1 2 أرمبرست إيف، بيرجيس جيه إيه، بولر سي، وآخرون . (أكتوبر 2004). “جينوم الدياتوم Thalassiosira pseudonana: البيئة والتطور والتمثيل الغذائي”. علوم . 306 (5693): 79– 86. بيب كود : 2004Sci...306...79A . سيتيسيركس 10.1.1.690.4884 . دوى : 10.1126/science.1101156 . بميد 15459382 . S2CID 8593895 .
- 1 2 السيد ن.م، مايلر ب، بارثولوميو د.س، وآخرون . (يوليو 2005). "تسلسل جينوم التريبانوسوما كروزي، العامل المسبب لداء شاغاس" . مجلة ساينس . 309 (5733): 409-415 . Bibcode : 2005Sci...309..409E . doi : 10.1126/science.1112631 . hdl : 11336/80500 . PMID 16020725. S2CID 3830267 .
- 1 2 بيريمان م، غيدين إي، هيرتز-فاولر سي إتش، وآخرون . (يوليو 2005). "جينوم التريبانوسوما الأفريقية تريبانوسوما بروساي". مجلة ساينس . 309 (5733): 416-422 . Bibcode : 2005Sci...309..416B . doi : 10.1126/science.1112642 . PMID 16020726. S2CID 18649858 .
- 1 2 إيفنز إيه سي، بيكوك سي إس، وورثي إي إيه، وآخرون (يوليو 2005). "جينوم طفيل الكينيتوبلاستيد، الليشمانيا الكبرى" . مجلة ساينس . 309 (5733): 436-442 . Bibcode : 2005Sci...309..436I . doi : 10.1126/science.1112680 . PMC 1470643. PMID 16020728 .
- ↑ "TAIR - تجميع الجينوم" .
- مبادرة جينوم نبات الرشاد (ديسمبر 2000). " تحليل تسلسل جينوم نبات الرشاد المزهر (Arabidopsis thaliana )" . مجلة نيتشر . 408 (6814): 796-815 . Bibcode : 2000Natur.408..796T . doi : 10.1038/35048692 . PMID 11130711 .
- ↑ مدخل فرقة
- ↑ مبادرة جينوم نبات الرشاد (Arabidopsis Genome Initiative) مؤرشفة بتاريخ 7 فبراير 2006 على موقع Wayback Machine
- 1 2 ماتسوزاكي م، ميسومي أ، شين-آي ت، وآخرون (أبريل 2004). "تسلسل جينوم الطحلب الأحمر وحيد الخلية فائق الصغر Cyanidioschyzon merolae 10D" . مجلة نيتشر . 428 (6983): 653-7 . Bibcode : 2004Natur.428..653M . doi : 10.1038/nature02398 . PMID 15071595 .
- 1 2 غوف إس إيه، ريك دي، لان تي إتش، وآخرون (أبريل 2002). "مسودة تسلسل جينوم الأرز ( Oryza sativa L. ssp. japonica ) " . مجلة ساينس . 296 (5565): 92-100 . Bibcode : 2002Sci...296...92G . doi : 10.1126/science.1068275 . PMID 11935018. S2CID 2960202 .
- ↑ ديريل إي، فيراز سي، رومباوتس إس، وآخرون (أغسطس 2006). "تحليل جينوم أصغر حقيقيات النوى الحرة المعيشة، Ostreococcus tauri، يكشف عن العديد من السمات الفريدة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 103 (31): 11647-52 . Bibcode : 2006PNAS..10311647D . doi : 10.1073/pnas.0604795103 . PMC 1544224. PMID 16868079 .
- 1 2 توسكان جي إيه، ديفازيو إس، جانسون إس، وآخرون . (سبتمبر 2006). "جينوم خشب القطن الأسود Populus trichocarpa (Torr. & Gray)" . علوم . 313 (5793): 1596–604 . بيب كود : 2006Sci...313.1596T . دوى : 10.1126/science.1128691 . بميد 16973872 . S2CID 7717980 .
- 1 2 جوفو أ، باريل ب ج، بوساي هـ، وآخرون (أكتوبر 1996). "الحياة مع 6000 جين". مجلة ساينس . 274 (5287): 546، 563-567 . Bibcode : 1996Sci...274..546G . doi : 10.1126/science.274.5287.546 . PMID 8849441. S2CID 16763139 .
- ↑ التعاون الدولي لتسلسل جينوم الخميرة، مؤرشف بتاريخ 27-09-2007 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine)
- 1 2 كاتينكا، إم دي، دوبرات، إس، كورنيلو، إي، وآخرون . (نوفمبر 2001). "تسلسل الجينوم وتكثيف الجينات للطفيلي حقيقي النواة Encephalitozoon cuniculi " . مجلة Nature . 414 (6862): 450-453 . Bibcode : 2001Natur.414..450K . doi : 10.1038/35106579 . PMID 11719806 .
- 1 2 وود في، جويليام آر، راجاندريم إم إيه، وآخرون . (فبراير 2002). "تسلسل الجينوم ل Schizosaccharomyces pombe " . طبيعة . 415 (6874): 871-80 . دوى : 10.1038 / طبيعة 724 . بميد 11859360 .
- 1 2 جالاجان جي إي، كالفو إس إي، بوركوفيتش كا، وآخرون . (أبريل 2003). "التسلسل الجينومي للفطر الخيطي Neurospora crassa " . طبيعة . 422 (6934): 859–68 . بيب كود : 2003Natur.422..859G . دوى : 10.1038 / طبيعة 01554 . بميد 12712197 .
- 1 2 مارتينيز، دييغو؛ لاروندو ، لويس إف ؛ بوتنام، نيك؛ جيلبكي، مارتن د سوليوين؛ هوانغ، كاثرين. تشابمان، جارود. هيلفينباين ، كيفن جي ؛ رامايا، بريثي؛ وآخرون . (2004). "تسلسل الجينوم للفطر المهين اللجنوسيليلوز Phanerochaete chrysosporium سلالة RP78" . التكنولوجيا الحيوية الطبيعية . 22 (6): 695–700 . دوى : 10.1038/nbt967 . بميد 15122302 .
- 1 2 اتحاد تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans (ديسمبر 1998). "تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans : منصة لدراسة علم الأحياء". مجلة ساينس . 282 (5396): 2012-2018 . Bibcode : 1998Sci...282.2012. doi : 10.1126 /science.282.5396.2012 . PMID 9851916 .
- 1 2 Adams MD, Celniker SE, Holt RA, et al. (مارس 2000). "تسلسل جينوم ذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster )". مجلة ساينس . 287 (5461): 2185-95 . Bibcode : 2000Sci...287.2185. CiteSeerX 10.1.1.549.8639 . doi : 10.1126 /science.287.5461.2185 . PMID 10731132 .
- 1 2 هولت، ر. أ.، سوبرامانيان، ج. م.، هالبرن، أ.، وآخرون . (أكتوبر 2002) . "تسلسل جينوم بعوضة الملاريا أنوفيلس غامبيا ". مجلة ساينس . 298 (5591): 129-149 . Bibcode : 2002Sci...298..129H . CiteSeerX 10.1.1.149.9058 . doi : 10.1126/science.1076181 . PMID 12364791. S2CID 4512225 . ح
- ↑ اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي. تجميع الجينوم الرابع. مؤرشف بتاريخ 5 فبراير 2012 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
- ↑ اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي، مؤرشف بتاريخ 5 فبراير 2012 في أرشيف الإنترنت
- ↑ أباريسيو إس، تشابمان جيه، ستوبكا إي، وآخرون (أغسطس 2002). "تجميع وتحليل جينوم سمكة الفوجو روبيبس بتقنية التسلسل العشوائي " . مجلة ساينس . 297 (5585): 1301-1310 . رمز Bibcode : 2002Sci...297.1301A . doi : 10.1126/science.1072104 . PMID 12142439. S2CID 10310355 .
- ↑ اتحاد تسلسل الجينوم البشري الدولي (أكتوبر 2004). "إتمام تسلسل الكروماتين الحقيقي للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 431 (7011): 931-945 . Bibcode : 2004Natur.431..931H . doi : 10.1038/nature03001 . PMID 15496913 .
- ↑ ماكفرسون، جيه دي، مارا، إم، هيلير، إل، وآخرون (فبراير 2001). "خريطة فيزيائية للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 409 (6822): 934-941 . Bibcode : 2001Natur.409..934M . doi : 10.1038/35057157 . PMID 11237014 .
- ↑ فينتر جيه سي، آدامز إم دي، مايرز إي دبليو، وآخرون (فبراير 2001). "تسلسل الجينوم البشري". مجلة ساينس . 291 (5507): 1304-1351 . رمز Bibcode : 2001Sci...291.1304V . doi : 10.1126/science.1058040 . PMID 11181995 .
- ↑ غريغوري إس جي، بارلو كيه إف، ماكلاي كيه إي، وآخرون (مايو 2006). "تسلسل الحمض النووي والتعليق البيولوجي للكروموسوم البشري 1" . مجلة نيتشر . 441 (7091): 315-321 . Bibcode : 2006Natur.441..315G . doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414 .
روابط خارجية
- ديارك - مصدر لأبحاث الجينوم حقيقيات النوى
- جينومات حقيقيات النوى EMBL-EBL
- متصفح جينوم جامعة كاليفورنيا في سانتا كروز
- اتحاد التسلسل الدولي - قاعدة بيانات مشاريع التسلسل واسعة النطاق
- متصفح جينوم Ensembl ( يتضمن مسودات الجينومات ذات التغطية المنخفضة)
- قاعدة بيانات GOLD:Genomes OnLine الإصدار 3.0
- قاعدة بيانات علم الجينوم المقارن للعائلات الفائقة تتضمن جينومات جميع حقيقيات النوى التي تم تسلسلها بالكامل، بالإضافة إلى أدوات متطورة لاستخراج البيانات وتصورها لأغراض التحليل.
- قاعدة بيانات جينوم الفئران
- قوائم الجينومات المتسلسلة
- قوائم متعلقة بعلم الأحياء
