قائمة الجينومات حقيقية النواة التي تم تسلسلها

كانت الخميرة Saccharomyces cerevisiae أول كائن حقيقي النواة يتم تحديد تسلسل جينومه بالكامل.

تحتوي هذه القائمة من الجينومات حقيقية النواة "المتسلسلة" على جميع حقيقيات النوى المعروفة التي لديها تسلسلات جينوم نووية وعضية كاملة متاحة للجمهور والتي تم تسلسلها وتجميعها وشرحها ونشرها؛ ولا يتم تضمين مسودات الجينومات، ولا تسلسلات العضيات فقط.

تم تحديد تسلسل الحمض النووي لأول مرة في عام 1977. وكان أول كائن حي حر المعيشة يتم تحديد تسلسل جينومه بالكامل هو بكتيريا Haemophilus influenzae ، في عام 1995. وفي عام 1996، كانت Saccharomyces cerevisiae (خميرة الخباز) أول تسلسل جينومي حقيقي النواة يتم إصداره، وفي عام 1998 تم إصدار أول تسلسل جينومي لكائن حقيقي النواة متعدد الخلايا، وهو Caenorhabditis elegans .

للاطلاع على جينومات الميتوكوندريا، انظر قائمة جينومات الميتوكوندريا .

فيما يلي أقدم تسعة جينومات تم تسلسلها للأوليات. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الأوليات التي تم تسلسلها .

الكائن الحييكتبالأهميةحجم الجينومعدد الجينات المتوقعةمنظمةسنة الإنجاز
Guillardia thetaكريبتوموناالكائن النموذجي0.551 ميجابايت ( جينوم النيوكليومورف فقط)465، [ 1 ] 513، 598 (UniProt)المعهد الكندي للأبحاث المتقدمة، وجامعة فيليبس ماربورغ، وجامعة كولومبيا البريطانية2001 [ 1 ]
مستنسخ بلازموديوم فالسيباروم : 3D7الأبيكومبلكسامسببات الأمراض البشرية ( الملاريا )22.9 ميجابايت5268 [ 2 ]اتحاد مشروع جينوم الملاريا2002 [ 2 ]
بلازموديوم يويلي يويلي السلالة: 17XNLالأبيكومبلكسامسببات الأمراض القوارضية (الملاريا)23.1 ميجابايت5878 [ 3 ]معهد البحوث الطبية والبحوث البحرية الوطنية2002 [ 3 ]
سلالة الكريبتوسبوريديوم هومينيس : TU502الأبيكومبلكسامسببات الأمراض البشرية10.4 ميجابايت3994 [ 4 ]جامعة فرجينيا كومنولث2004 [ 4 ]
عزلة كريبتوسبوريديوم بارفوم من النمط الجيني C- أو النمط الجيني 2الأبيكومبلكسامسببات الأمراض البشرية16.5 ميجابايت3807 [ 5 ]جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو وجامعة مينيسوتا2004 [ 5 ]
سلالة Thalassiosira pseudonana : CCMP 1335الدياتومالكائن النموذجي34.5 ميجابايت11242 [ 6 ]معهد الجينوم المشترك وجامعة واشنطن2004 [ 6 ]
سلالة التريبانوسوما كروزي : CL-Brenerالكينيتوبلاستيدمسببات الأمراض البشرية67 ميجابايت22,570 [ 7 ]معهد أبحاث الجينوم (TIGR) ومعهد كارولينسكا (KI) ومعهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية (SBRI)2005 [ 7 ]
تريبانوسوما بروساي، السلالة: TREU 927/4الكينيتوبلاستيدمسببات الأمراض البشرية26 ميجابايت9068 [ 8 ]معهد سانجر التابع لمؤسسة ويلكوم ترست ومعهد أبحاث الجينوم (TIGR)2005 [ 8 ]
سلالة الليشمانيا الكبرى : فريدلينالكينيتوبلاستيدمسببات الأمراض البشرية32.8 ميجابايت8272 [ 9 ]معهد سانجر التابع لمؤسسة ويلكوم ترست ومعهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية (SBRI)2005 [ 9 ]

النباتات

فيما يلي أقدم خمسة جينومات نباتية تم تسلسلها. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات النباتات التي تم تسلسلها .

الكائن الحييكتبالأهميةحجم الجينومعدد الكروموسوماتعدد الجينات المتوقعةمنظمةسنة الإنجاز
نبات الرشاد الأذيني (Arabidopsis thaliana) النمط البيئي: كولومبياالخردل البري (الجرجير البري)مصنع نموذجي135 ميجابايت [ 10 ]525,498، [ 11 ] 27,400، [ 12 ] 31,670 (UniProt)مبادرة جينوم نبات الرشاد [ 13 ]2000 [ 11 ]
سلالة Cyanidioschyzon merolae : 10Dالطحالب الحمراءحقيقيات النوى البسيطة16.5 ميجابايت205331 [ 14 ]جامعة طوكيو، وجامعة ريكيو، وجامعة سايتاما، وجامعة كوماموتو2004 [ 14 ]
Oryza sativa ssp indicaأرزالمحاصيل والكائنات النموذجية420 ميجابايت1232-50,000 [ 15 ]معهد بكين لعلم الجينوم، جامعة تشجيانغ والأكاديمية الصينية للعلوم2002 [ 15 ]
Ostreococcus tauriالطحالب الخضراءحقيقيات النوى البسيطة، جينوم صغير12.6 ميجابايت7969 (UniProt)مختبر أراغو2006 [ 16 ]
حور ثلاثي الثمارالحور البلسمي أو الحور الأسودعزل الكربون ، شجرة نموذجية، استخدام تجاري (الأخشاب)، ومقارنة مع نبات الرشاد (Arabidopsis thaliana).550 ميجابايت1945,555 [ 17 ]اتحاد جينوم الحور الدولي2006 [ 17 ]

الفطريات

فيما يلي أقدم خمسة جينومات تم تسلسلها للفطريات. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الفطريات التي تم تسلسلها .

الكائن الحييكتبالأهميةحجم الجينومعدد الجينات المتوقعةمنظمةسنة الإنجاز
سلالة الخميرة Saccharomyces cerevisiae : S288Cالسكاروميسيتاتخميرة الخباز؛ نموذج حقيقي النواة12.1 ميجابايت6294 [ 18 ]التعاون الدولي لتسلسل جينوم الخميرة [ 19 ]1996 [ 18 ]
إنسيفاليتوزون كونيكوليالميكروسبوريديوممسببات الأمراض البشرية2.9 ميجابايت1997 [ 20 ]جينوسكوب وجامعة بليز باسكال2001 [ 20 ]
سلالة Schizosaccharomyces pombe : 972h-شيزوساكاروميسيتسنموذج حقيقيات النوى14 ميجابايت4824 [ 21 ]معهد سانجر ومختبر كولد سبرينج هاربور2002 [ 21 ]
نيوروسبورا كراساالسورداريوميسيتاتنموذج حقيقيات النوى40 ميجابايت10,082 [ 22 ]معهد برود ، وجامعة أوريغون للصحة والعلوم ، وجامعة كنتاكي ، وجامعة كانساس2003 [ 22 ]
سلالة Phanerochaete chrysosporium : RP78أغاريكوميسيتسفطر تعفن الخشب، يُستخدم في المعالجة الفطرية30 ميجابايت11,777 [ 23 ]معهد الجينوم المشترك2004 [ 23 ]

الحيوانات

فيما يلي أقدم خمسة جينومات حيوانية تم تسلسلها. للاطلاع على قائمة أكثر شمولاً، انظر قائمة جينومات الحيوانات التي تم تسلسلها .

الكائن الحييكتبالأهميةحجم الجينومعدد الجينات المتوقعةمنظمةسنة الإنجاز
سلالة Caenorhabditis elegans : بريستول N2الديدان الأسطوانيةحيوان نموذجي100 ميجابايت19000 [ 24 ]جامعة واشنطن ومعهد سانجر1998 [ 24 ]
ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر)ذبابة الفاكهةحيوان نموذجي165 ميجابايت13600 [ 25 ]سيليرا، جامعة كاليفورنيا في بيركلي، كلية بايلور للطب، المجموعة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية2000 [ 25 ]
سلالة البعوضة الأنوفيلية الغامبية : بيستالبعوضناقل الملاريا278 ميجابايت13683 [ 26 ]سيليرا جينوميكس وجينوسكوب2002 [ 26 ]
تاكيفوجو روبيبسسمكة البخاخفقاري ذو جينوم صغير390 ميجابايت22–29,000 [ 27 ]اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي [ 28 ]2002 [ 29 ]
الإنسان العاقلبشر3.2 جيجابايت [ 30 ]18826 (اتحاد CCDS)اتحاد مشروع الجينوم البشري وشركة سيليرا جينوميكسمسودة 2001 [ 31 ] [ 32 ] مكتملة 2006 [ 33 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 دوغلاس إس، زاونر إس، فراونهولز إم، وآخرون  (أبريل 2001). "الجينوم المختزل للغاية لنواة طحلب مستعبدة" . نيتشر . 410 (6832): 1091-1096 . Bibcode : 2001Natur.410.1091D . doi : 10.1038/35074092 . PMID 11323671 . 
  2. 1 2 غاردنر إم جيه، هول إن، فونغ إي، وآخرون . (أكتوبر 2002). "تسلسل جينوم طفيل الملاريا البشري بلازموديوم فالسيباروم " . نيتشر . 419 (6906): 498-511 . Bibcode : 2002Natur.419..498G . doi : 10.1038 / nature01097 . PMC 3836256. PMID 12368864 .   
  3. كارلتون ، جيه إم، أنجيولي، إس في، سوه، بي بي، وآخرون (أكتوبر 2002). "تسلسل الجينوم والتحليل المقارن لطفيلي الملاريا النموذجي في القوارض ، بلازموديوم يويلي يويلي " . مجلة نيتشر . 419 (6906): 512-519 . Bibcode : 2002Natur.419..512C . doi : 10.1038/nature01099 . PMID 12368865 .  
  4. 1 2 Xu P, Widmer G, Wang Y, et al. (أكتوبر 2004). "جينوم كريبتوسبوريديوم هومينيس " . Nature . 431 (7012): 1107–1112 . Bibcode : 2004Natur.431.1107X . doi : 10.1038/nature02977 . PMID 15510150 .  
  5. 1 2 أبراهامسن إم إس، تمبلتون تي جيه، إينوموتو إس، وآخرون . (أبريل 2004). "التسلسل الجينومي الكامل للأبيكومبلكسا، كريبتوسبوريديوم بارفوم " . مجلة ساينس . 304 (5669): 441-445 . Bibcode : 2004Sci...304..441A . doi : 10.1126/science.1094786 . PMID 15044751. S2CID 26434820 .   
  6. 1 2 أرمبرست إيف، بيرجيس جيه إيه، بولر سي، وآخرون . (أكتوبر 2004). “جينوم الدياتوم Thalassiosira pseudonana: البيئة والتطور والتمثيل الغذائي”. علوم . 306 (5693): 79– 86. بيب كود : 2004Sci...306...79A . سيتيسيركس 10.1.1.690.4884 . دوى : 10.1126/science.1101156 . بميد 15459382 . S2CID 8593895 .    
  7. 1 2 السيد ن.م، مايلر ب، بارثولوميو د.س، وآخرون . (يوليو 2005). "تسلسل جينوم التريبانوسوما كروزي، العامل المسبب لداء شاغاس" . مجلة ساينس . 309 (5733): 409-415 . Bibcode : 2005Sci...309..409E . doi : 10.1126/science.1112631 . hdl : 11336/80500 . PMID 16020725. S2CID 3830267 .   
  8. 1 2 بيريمان م، غيدين إي، هيرتز-فاولر سي إتش، وآخرون . (يوليو 2005). "جينوم التريبانوسوما الأفريقية تريبانوسوما بروساي". مجلة ساينس . 309 (5733): 416-422 . Bibcode : 2005Sci...309..416B . doi : 10.1126/science.1112642 . PMID 16020726. S2CID 18649858 .   
  9. 1 2 إيفنز إيه سي، بيكوك سي إس، وورثي إي إيه، وآخرون (يوليو 2005). "جينوم طفيل الكينيتوبلاستيد، الليشمانيا الكبرى" . مجلة ساينس . 309 (5733): 436-442 . Bibcode : 2005Sci...309..436I . doi : 10.1126/science.1112680 . PMC 1470643. PMID 16020728 .   
  10. "TAIR - تجميع الجينوم" .
  11. مبادرة جينوم نبات الرشاد (ديسمبر 2000). " تحليل تسلسل جينوم نبات الرشاد المزهر (Arabidopsis thaliana )" . مجلة نيتشر . 408 (6814): 796-815 . Bibcode : 2000Natur.408..796T . doi : 10.1038/35048692 . PMID 11130711 . 
  12. مدخل فرقة
  13. مبادرة جينوم نبات الرشاد (Arabidopsis Genome Initiative) مؤرشفة بتاريخ 7 فبراير 2006 على موقع Wayback Machine
  14. 1 2 ماتسوزاكي م، ميسومي أ، شين-آي ت، وآخرون (أبريل 2004). "تسلسل جينوم الطحلب الأحمر وحيد الخلية فائق الصغر Cyanidioschyzon merolae 10D" . مجلة نيتشر . 428 (6983): 653-7 . Bibcode : 2004Natur.428..653M . doi : 10.1038/nature02398 . PMID 15071595 .  
  15. 1 2 غوف إس إيه، ريك دي، لان تي إتش، وآخرون (أبريل 2002). "مسودة تسلسل جينوم الأرز ( Oryza sativa L. ssp. japonica ) " . مجلة ساينس . 296 (5565): 92-100 . Bibcode : 2002Sci...296...92G . doi : 10.1126/science.1068275 . PMID 11935018. S2CID 2960202 .   
  16. ديريل إي، فيراز سي، رومباوتس إس، وآخرون (أغسطس 2006). "تحليل جينوم أصغر حقيقيات النوى الحرة المعيشة، Ostreococcus tauri، يكشف عن العديد من السمات الفريدة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 103 (31): 11647-52 . Bibcode : 2006PNAS..10311647D . doi : 10.1073/pnas.0604795103 . PMC 1544224. PMID 16868079 .   
  17. 1 2 توسكان جي إيه، ديفازيو إس، جانسون إس، وآخرون . (سبتمبر 2006). "جينوم خشب القطن الأسود Populus trichocarpa (Torr. & Gray)" . علوم . 313 (5793): 1596–604 . بيب كود : 2006Sci...313.1596T . دوى : 10.1126/science.1128691 . بميد 16973872 . S2CID 7717980 .   
  18. 1 2 جوفو أ، باريل ب ج، بوساي هـ، وآخرون (أكتوبر 1996). "الحياة مع 6000 جين". مجلة ساينس . 274 (5287): 546، 563-567 . Bibcode : 1996Sci...274..546G . doi : 10.1126/science.274.5287.546 . PMID 8849441. S2CID 16763139 .   
  19. التعاون الدولي لتسلسل جينوم الخميرة، مؤرشف بتاريخ 27-09-2007 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine)
  20. 1 2 كاتينكا، إم دي، دوبرات، إس، كورنيلو، إي، وآخرون . (نوفمبر 2001). "تسلسل الجينوم وتكثيف الجينات للطفيلي حقيقي النواة Encephalitozoon cuniculi " . مجلة Nature . 414 (6862): 450-453 . Bibcode : 2001Natur.414..450K . doi : 10.1038/35106579 . PMID 11719806 .  
  21. 1 2 وود في، جويليام آر، راجاندريم إم إيه، وآخرون . (فبراير 2002). "تسلسل الجينوم ل Schizosaccharomyces pombe " . طبيعة . 415 (6874): 871-80 . دوى : 10.1038 / طبيعة 724 . بميد 11859360 .  
  22. 1 2 جالاجان جي إي، كالفو إس إي، بوركوفيتش كا، وآخرون . (أبريل 2003). "التسلسل الجينومي للفطر الخيطي Neurospora crassa " . طبيعة . 422 (6934): 859–68 . بيب كود : 2003Natur.422..859G . دوى : 10.1038 / طبيعة 01554 . بميد 12712197 .  
  23. 1 2 مارتينيز، دييغو؛ لاروندو ، لويس إف ؛ بوتنام، نيك؛ جيلبكي، مارتن د سوليوين؛ هوانغ، كاثرين. تشابمان، جارود. هيلفينباين ، كيفن جي ؛ رامايا، بريثي؛ وآخرون . (2004). "تسلسل الجينوم للفطر المهين اللجنوسيليلوز Phanerochaete chrysosporium سلالة RP78" . التكنولوجيا الحيوية الطبيعية . 22 (6): 695–700 . دوى : 10.1038/nbt967 . بميد 15122302 .  
  24. 1 2 اتحاد تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans (ديسمبر 1998). "تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans : منصة لدراسة علم الأحياء". مجلة ساينس . 282 (5396): 2012-2018 . Bibcode : 1998Sci...282.2012. doi : 10.1126 /science.282.5396.2012 . PMID 9851916 . 
  25. 1 2 Adams MD, Celniker SE, Holt RA, et al. (مارس 2000). "تسلسل جينوم ذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster )". مجلة ساينس . 287 (5461): 2185-95 . Bibcode : 2000Sci...287.2185. CiteSeerX 10.1.1.549.8639 . doi : 10.1126 /science.287.5461.2185 . PMID 10731132 .   
  26. 1 2 هولت، ر. أ.، سوبرامانيان، ج. م.، هالبرن، أ.، وآخرون . (أكتوبر 2002) . "تسلسل جينوم بعوضة الملاريا أنوفيلس غامبيا ". مجلة ساينس . 298 (5591): 129-149 . Bibcode : 2002Sci...298..129H . CiteSeerX 10.1.1.149.9058 . doi : 10.1126/science.1076181 . PMID 12364791. S2CID 4512225 .    ح
  27. اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي. تجميع الجينوم الرابع. مؤرشف بتاريخ 5 فبراير 2012 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
  28. اتحاد جينوم سمكة الفوغو الدولي، مؤرشف بتاريخ 5 فبراير 2012 في أرشيف الإنترنت
  29. أباريسيو إس، تشابمان جيه، ستوبكا إي، وآخرون (أغسطس 2002). "تجميع وتحليل جينوم سمكة الفوجو روبيبس بتقنية التسلسل العشوائي " . مجلة ساينس . 297 (5585): 1301-1310 . رمز Bibcode : 2002Sci...297.1301A . doi : 10.1126/science.1072104 . PMID 12142439. S2CID 10310355 .   
  30. اتحاد تسلسل الجينوم البشري الدولي (أكتوبر 2004). "إتمام تسلسل الكروماتين الحقيقي للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 431 (7011): 931-945 . Bibcode : 2004Natur.431..931H . doi : 10.1038/nature03001 . PMID 15496913 . 
  31. ماكفرسون، جيه دي، مارا، إم، هيلير، إل، وآخرون (فبراير 2001). "خريطة فيزيائية للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 409 (6822): 934-941 . Bibcode : 2001Natur.409..934M . doi : 10.1038/35057157 . PMID 11237014 .  
  32. فينتر جيه سي، آدامز إم دي، مايرز إي دبليو، وآخرون (فبراير 2001). "تسلسل الجينوم البشري". مجلة ساينس . 291 (5507): 1304-1351 . رمز Bibcode : 2001Sci...291.1304V . doi : 10.1126/science.1058040 . PMID 11181995 .  
  33. غريغوري إس جي، بارلو كيه إف، ماكلاي كيه إي، وآخرون (مايو 2006). "تسلسل الحمض النووي والتعليق البيولوجي للكروموسوم البشري 1" . مجلة نيتشر . 441 (7091): 315-321 . Bibcode : 2006Natur.441..315G . doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414 .