قائمة الجينومات الأولية المتسلسلة

الموسوعة الحرة

تحتوي هذه القائمة من الجينومات الأولية المتسلسلة على جميع الأنواع الأولية المعروفة التي لديها تسلسلات جينومية كاملة متاحة للعامة والتي تم تجميعها وشرحها ونشرها؛ ولا يتم تضمين مسودات الجينومات، ولا تسلسلات العضيات فقط.

الحويصلات الهوائية

الحويصلات الهوائية هي مجموعة من الكائنات الأولية التي تشمل الهدبيات ، ومجمعات القمة ، والطحالب . وتحظى أعضاء هذه المجموعة باهتمام خاص من جانب العلماء باعتبارها السبب وراء الأمراض الخطيرة التي تصيب البشر والثروة الحيوانية.

الكائن الحي يكتب الصلة حجم الجينوم عدد الجينات المتوقعة منظمة سنة الإنجاز حالة التجميع الروابط
بابيزيا بوفيس أبيكومبلكسان مسببات أمراض الأبقار 8.2 ميجا بايت 3,671 2007 [1]
Breviolum minutim ( Symbiodinium minutum؛ الفرع B1) الدياتومات المرجان المتكافل 1.5 جيجابايت 47,014 معهد أوكيناوا للعلوم والتكنولوجيا 2013 [2] مسودة علم الجينوم البحري OIST [3]
Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui؛ Clade C1) الدياتومات المرجان المتكافل 1.19 جيجابايت 35,913 علم الجينوم المستقبلي للشعاب المرجانية (ReFuGe) 2020/ جامعة كوينزلاند 2018 [4] مسودة ملجأ 2020 [5]
سلالة Cladocopium C92 Y103 ( Symbiodinium sp. clade C؛ النوع المفترض C92) الدياتومات المتعايش الفورامينيفراني غير معروف (حجم التجميع 0.70 جيجابايت) 65,832 معهد أوكيناوا للعلوم والتكنولوجيا 2018 [6] مسودة علم الجينوم البحري OIST [3]
سلالة الكريبتوسبوريديوم هومينيس : TU502
 أبيكومبلكسان مسببات الأمراض البشرية 10.4 ميجا بايت 3,994 [7] جامعة فيرجينيا كومنولث 2004 [7]
عزلة من بكتيريا Cryptosporidium parvum
من النمط الجيني 2 أو النمط C 		أبيكومبلكسان مسببات الأمراض البشرية 16.5 ميجا بايت 3,807 [8] جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو وجامعة مينيسوتا 2004 [8]
سلالة إيميريا تينيلا هوتون
 أبيكومبلكسان طفيليات معوية للدواجن المنزلية 55-60 ميجا بايت [9] معهد ويلكوم ترست سانجر [10] متاح للتحميل؛ [10] 2007 لـ Chr 1 [11]
فوغاسيوم كاواغوتي CS156=CCMP2468 ( سيمبيودينيوم كاواغوتي ؛ كليد F1) الدياتومات المرجان المتكافل؟ 1.07 جيجابايت 26,609 علم الجينوم المستقبلي للشعاب المرجانية (ReFuGe) 2020 / جامعة كوينزلاند 2018 [4] مسودة ملجأ 2020 [5]
فوجاسيوم كاواجوتي CCMP2468 ( سيمبيودينيوم كاواجوتي ؛ كليد F1) الدياتومات المرجان المتكافل؟ 1.18 جيجابايت 36,850 جامعة كونيتيكت / جامعة شيامن 2015 [12] مسودة مشروع جينوم S. kawagutii [13]
نيوسبورا كانينوم أبيكومبلكسان مسببات الأمراض للماشية والكلاب 62 ميجا بايت [14] معهد ويلكوم ترست سانجر [15] متاح للتحميل [15]
براميسيوم تيتراوريليا هدبية نموذج الكائن الحي 72 ميجا بايت 39,642 [16] جينوسكوب 2006 [16]
بولاريلا جلاسياليس CCMP1383 الدياتومات محب للطبيعة، القطب الجنوبي 3.02 جيجابايت (ثنائي الصبغيات)، 1.48 جيجابايت (أحادي الصبغيات) 58,232 جامعة كوينزلاند 2020 [17] مسودة جامعة كوينزلاند إي سبيس [18]
بولاريلا جلاسياليس CCMP2088 الدياتومات محب للطبيعة، القطب الشمالي 2.65 جيجابايت (ثنائي الصبغيات)، 1.30 جيجابايت (أحادي الصبغيات) 51,713 جامعة كوينزلاند 2020 [17] مسودة جامعة كوينزلاند إي سبيس [18]
بلازموديوم بيرغي أنكا أبيكومبلكسان ملاريا الأرانب 18.5 ميجا بايت [19] 4,900؛ [19] 11,654 (يونيبروت)
بلازموديوم شابودي أبيكومبلكسان ملاريا القوارض 19.8 ميجا بايت [20] 5000 [20]
المتصورة المنجلية
المستنسخة: 3D7 		أبيكومبلكسان مسببات الأمراض البشرية ( الملاريا ) 22.9 ميجا بايت 5,268 [21] اتحاد مشروع جينوم الملاريا 2002 [21]
بلازموديوم نولسي أبيكومبلكسان مسببات مرض الرئيسيات (الملاريا) 23.5 ميجا بايت 5,188 [22] 2008 [22]
المتصورة النشيطة أبيكومبلكسان مسببات الأمراض البشرية (الملاريا) 26.8 ميجا بايت 5,433 [23] 2008 [23]
بلازموديوم يولي يولي
السلالة: 17XNL 		أبيكومبلكسان مسببات الأمراض القوارض (الملاريا) 23.1 ميجا بايت 5,878 [24] TIGR و NMRC 2002 [24]
سيمبيودينيوم ميكروأدرياتيكوم (فصيلة أ) الدياتومات المرجان المتكافل 1.1 جيجابايت 49,109 جامعة الملك عبدالله للعلوم والتقنية 2016 [25] مسودة جينوميات الشعاب المرجانية [26]
سلالة Symbiodinium A3 Y106 ( Symbiodinium sp. clade A3) الدياتومات متعايش غير معروف (حجم التجميع 0.77 جيجابايت) 69,018 معهد أوكيناوا للعلوم والتكنولوجيا 2018 [6] مسودة علم الجينوم البحري OIST [3]
تتراهيمينا ثيرموفيلا هدبية نموذج الكائن الحي 104 ميجا بايت 27000 [27] 2006 [27]
ثيلريا أنولاتا
أنقرة نسخة C9 		أبيكومبلكسان مسببات أمراض الأبقار 8.3 ميجا بايت 3,792 سانجر 2005 [28]
ثيليريا بارفا
السلالة: موغوغا 		أبيكومبلكسان مسببات أمراض الأبقار (حمى الساحل الشرقي الأفريقي) 8.3 ميجا بايت 4,035 [29] TIGR والمعهد الدولي لبحوث الثروة الحيوانية 2005 [29]
سلالات التوكسوبلازما جوندي
GT1، ME49، VEG 		أبيكومبلكسان مسببات الأمراض الثديية 63 ميجا بايت (RefSeq) 8,100 (UniProt) - 9,000 (EuPathDB) معهد جي كريج فينتر، TIGR، UPenn. 2008 [30]

الأميبات

الأميبات هي مجموعة من الطلائعيات الأميبية المتحركة ، تتحرك أعضاء هذه المجموعة أو تتغذى عن طريق نتوءات مؤقتة تسمى شبه الأرجل . العضو الأكثر شهرة في هذه المجموعة هو العفن اللزج ، والذي تمت دراسته لقرون؛ وتشمل الأعضاء الأخرى الأميبا والتوبولينيا والفلابيلينيا . تسبب بعض الأميبات المرض.

الكائن الحي يكتب الصلة حجم الجينوم عدد الجينات المتوقعة منظمة سنة الإنجاز
ديكتيوستيليوم ديسكويديوم
السلالة:AX4 		العفن اللزج نموذج الكائن الحي 34 ميجا بايت 12500 [31] اتحاد من جامعة كولونيا وكلية بايلور للطب ومركز سانجر 2005 [31]
المتحولة الحالة للنسج
HM1: IMSS 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( الزحار الأميبي ) 23.8 ميجا بايت 9,938 [32] TIGR ومعهد سانجر ومدرسة لندن للصحة والطب الاستوائي 2005 [32]
سلالة Polysphondylium pallidum :PN500
 العفن اللزج نموذج الكائن الحي 12,939، [33] 12,350 (يوني بروت) معهد لايبنتز لأبحاث العمر 2009 [33]

كروميستا

الكروميستا هي مجموعة من الكائنات الأولية التي تحتوي على شعبة الطحالب غير المتجانسة ( سترامينوبيل ) والهابتوفيتا والكريبتوفيتا . تتم دراسة أعضاء هذه المجموعة في الغالب من أجل الاهتمام بالتطور .

الكائن الحي يكتب الصلة حجم الجينوم عدد الجينات المتوقعة منظمة سنة الإنجاز
البوجو لايباتشي فطريات البيض طفيلي الأرابيدوبسيس، حيوي 37 ميجا بايت [34] 13032 [34] 2011 [34]
سلالة Aureococcus anophagefferens
:CCMP1984 		نبات البلاجوفيت معهد الجينوم المشترك التابع لوزارة الطاقة 2011 [35]
بيجلوفيللا ناتانز كلورأركنيوفيت نموذج الكائن الحي nucleomorph : 0.331 ميجا
بايت نووي : 95 ميجا بايت 		nucleomorph : 373 [36]
نووي: >21000 [37] 		الشكل النووي : معهد هول أستراليا ، جامعة ملبورن، جامعة كولومبيا البريطانية،
النووي: جامعة دالهوزي، هاليفاكس، نوفا سكوشا، كندا 		2006، [36] 2012 [37]
كروموناس ميستوستيجماتيكا CCMP1168 كريبتوفيتا 2012 [38]
كريبتوموناس باراميسيوم كريبتوفيتا 2010 [39]
إميليانا هكسلي
CCMP1516 		كوكوليثوفور ( العوالق النباتية ) 141.7 ميجا بايت [40] 30,569 [40] معهد الجينوم المشترك 2013 [40]
إميليانا هكسلي
RCC1217 		كوكوليثوفور ( العوالق النباتية ) متاح للتحميل [41]
فراجيلاريوبسيس اسطوانية الدياتوم 61.1 ميجا بايت [42] 21066 [42] معهد الجينوم المشترك 2017 [42]
غويارديا ثيتا كريبتو موناد نموذج الكائن الحي 0.551 ميجا بايت ( جينوم النواة فقط)
87 ميجا بايت (جينوم النواة) 		الشكل النووي: 465 [43] 513، 598 (UniProt)
النووي: >21000 [37] 		nucleomorph: المعهد الكندي للأبحاث المتقدمة، جامعة فيليبس ماربورغ وجامعة كولومبيا البريطانية.
النووية: جامعة دالهوزي، هاليفاكس، نوفا سكوشا، كندا. 		2001، [43] 2012 [37]
هيميسلميس أندرسيني
CCMP7644 		كريبتو موناد نموذج الكائن الحي 0.572 ميجا بايت
( جينوم النواة فقط) 		472، [44] 502 (يونيبروت) المعهد الكندي للأبحاث المتقدمة 2007 [44]
هيالوبرونوسبورا أرابيدوبسيديس فطريات البيض كائن حي ملزم التغذية ، مسبب مرض نبات أرابيدوبسيس جامعة وولفسون العالمية 2010 [45]
سلالة نانوكلوروبيس غاديتانا : CCMP526
 نبات اليوستجماتوفيت تطبيقات التكنولوجيا الحيوية لإنتاج الدهون معهد فرجينيا للمعلوماتية الحيوية 2012 [46]
سلالة Phaeodactylum tricornutum
: CCAP1055/1 		الدياتوم 27.4 ميجا بايت 10,402 معهد الجينوم المشترك 2008 [47]
سلالة فيتوفثورا إنفيستانس
: T30-4 		فطريات البيض مسببات المجاعة الكبرى في أيرلندا معهد برود 2009 [48]
فيتوفثورا راموروم فطريات البيض مسبب موت البلوط المفاجئ 65 ميجا بايت (7x) 15,743 معهد الجينوم المشترك وآخرون. 2006 [49]
فيتوفثورا سوجاي فطريات البيض مسببات أمراض فول الصويا 95 ميجا بايت (9x) 19,027 معهد الجينوم المشترك وآخرون. 2006 [49]
سلسلة متعددة من قصص شبه نيتزشيا الدياتوم معهد الجينوم المشترك
بلازموديوفورا براسيكاي بلازموديوفوري مسبب مرض فطريات الجذر 25.5 ميجا بايت 9,730 جامعة سانت لويس أوبسالا وآخرون. 2015 [50]
بيثيوم ألتيموم فطريات البيض مسببات الأمراض النباتية المنتشرة في كل مكان 42.8 ميجا بايت 15,290 جامعة ولاية ميشيغان وآخرون. 2010 [51]
سلالة Thalassiosira pseudonana :CCMP 1335
 الدياتوم 34.5 ميجا بايت 11,242 [52] معهد الجينوم المشترك وجامعة واشنطن 2004 [52]

حفريات

الطفيليات الحفرية هي مجموعة من الكائنات الحية الحرة والمتكافلة ذات الصلة؛ وهي تشمل الميتامونادا واللوكوزوا واليوجلينوسوا والبركولوزوا . ويتم البحث عنها لمعرفة دورها في الأمراض البشرية.

الكائن الحي يكتب الصلة حجم الجينوم عدد الجينات المتوقعة منظمة سنة الإنجاز
الجيارديا المعوية (مجموعة جيارديا دوديناليس ب) الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( الجيارديا ) 11.7 ميجا بايت 4,470 [53] التعاون متعدد المراكز 2009 [53]
جيارديا دوديناليس
ATCC 50803
( مجموعة جيارديا دوديناليس أ)
 الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( الجيارديا ) 11.7 ميجا بايت 6,470، [54] 7,153 (يونيبروت) معهد كارولينسكا، مختبر الأحياء البحرية 2007 [54]
الليشمانيا البرازيلية
MHOM/BR/75M2904 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( داء الليشمانيات ) 33 ميجا بايت 8,314 [55] معهد سانجر ، جامعة ساو باولو، الكلية الإمبراطورية 2007 [55]
ليشمانيا الطفلية
JPCM5 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( داء الليشمانيات الحشوي ) 33 ميجا بايت 8,195 [55] معهد سانجر، إمبريال كوليدج وجامعة جلاسكو 2007 [55]
الليشمانيا الكبرى السلالة
: فريدلين 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( داء الليشمانيات الجلدي ) 32.8 ميجا بايت 8,272 [56] معهد سانجر ومعهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية 2005 [56]
نيجليريا جروبيري الأميبات السوطية انفصلت عن حقيقيات النوى الأخرى منذ أكثر من مليار سنة 41 ميجا بايت [57] 15,727 [57] 2010 [57]
المشعرات المهبلية الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( داء المشعرات ) 160 ميجا بايت 59,681 [58] تايجر 2007 [58]
Trypanosoma brucei
السلالة:TREU927/4 GUTat10.1 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( مرض النوم ) 26 ميجا بايت 9,068 [59] معهد سانجر وTIGR 2005 [59]
Trypanosoma cruzi
السلالة: CL Brener TC3 		الطفيليات الأولية مسببات الأمراض البشرية ( مرض شاغاس ) 34 ميجا بايت 22,570 [60] TIGR، معهد سياتل للأبحاث الطبية الحيوية وجامعة أوبسالا 2005 [60]

أوبيسثوكونتس، القاعدية

الطفيليات هي مجموعة من حقيقيات النوى تشمل كل من الحيوانات والفطريات وكذلك المجموعات القاعدية التي لا تصنف في هذه المجموعات. يتم تصنيف هذه الطفيليات القاعدية بشكل معقول على أنها طلائعيات وتشمل الطفيليات الطوقية ، وهي المجموعة الشقيقة أو الشقيقة القريبة من الحيوانات.

الكائن الحي يكتب الصلة حجم الجينوم عدد الجينات المتوقعة منظمة سنة الإنجاز
مونوسيجا بريفيكوليس السوطيات قريب من الحيوانات متعددة الخلايا 41.6 ميجا بايت 9200 [61] معهد الجينوم المشترك 2007 [61]

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ برايتون كا، لاو أو، هيرندون دي آر، هانيك إل، كابماير إل إس، بيرينز إس جيه، وآخرون. (أكتوبر 2007). “تسلسل الجينوم لبابيزيا بوفيس والتحليل المقارن للهيموبروتوزوا apicomplexan”. مسببات الأمراض PLOS . 3 (10): 1401–13. دوى : 10.1371/journal.ppat.0030148 . بمك  2034396 . بميد  17953480.
  2. ^ شوجوتشي إي، شينزاتو سي، كاواشيما تي، جيوجا إف، مونجباكدي إس، كوياناجي آر، وآخرون. (أغسطس 2013). “مسودة تجميع الجينوم النووي Symbiodinium minutum تكشف عن بنية الجين dinoflagellate”. علم الأحياء الحالي . 23 (15): 1399-408. بيب كود :2013CBio...23.1399S. دوى : 10.1016/j.cub.2013.05.062 . بميد  23850284.
  3. ^ abc "OIST Marine Genomics". marinegenomics.oist.jp . تم الاسترجاع في 2018-08-22 .
  4. ^ ab Liu H, Stephens TG, González-Pech RA, Beltran VH, Lapeyre B, Bongaerts P, et al. (2018). "تكشف جينومات Symbiodinium عن التطور التكيفي للوظائف المتعلقة بالتعايش بين المرجان والدينوفلاجيلات". Communications Biology . 1 : 95. doi :10.1038/s42003-018-0098-3. PMC 6123633. PMID  30271976 . 
  5. ^ "موقع بيانات ReFuGe 2020". asylum2020.reefgenomics.org . تم الاسترجاع في 2018-09-07 .
  6. ^ ab Shoguchi E، Beedessee G، Tada I، Hisata K، Kawashima T، Takeuchi T، et al. (يونيو 2018). "جينومان متباعدان من Symbiodinium يكشفان عن الحفاظ على مجموعة جينية لتخليق واقي الشمس والجينات المفقودة مؤخرًا". BMC Genomics . 19 (1): 458. doi : 10.1186/s12864-018-4857-9 . PMC 6001144. PMID  29898658 . 
  7. ^ ab Xu P, Widmer G, Wang Y, Ozaki LS, Alves JM, Serrano MG, et al. (أكتوبر 2004). "جينوم الكريبتوسبوريديوم هومينيس". مجلة الطبيعة . 431 (7012): 1107–12. رمز Bibcode :2004Natur.431.1107X. doi : 10.1038/nature02977 . PMID  15510150.
  8. ^ أب أبراهامسن إم إس، تمبلتون تي جيه، إينوموتو إس، أبراهانتي جي إي، تشو جي، لانكتو كاليفورنيا، وآخرون. (أبريل 2004). “تسلسل الجينوم الكامل للمركب أبيكومبليكسان، كريبتوسبوريديوم بارفوم”. علوم . 304 (5669): 441-5. بيب كود :2004Sci...304..441A. دوى :10.1126/science.1094786. بميد  15044751. S2CID  26434820.
  9. ^ جيندب
  10. ^ أب سانجر
  11. ^ Ling KH, Rajandream MA, Rivailler P, Ivens A, Yap SJ, Madeira AM, et al. (مارس 2007). "تسلسل وتحليل الكروموسوم 1 من Eimeria tenella يكشف عن تنظيم قطعي فريد". Genome Research . 17 (3): 311–9. doi :10.1101/gr.5823007. PMC 1800922. PMID  17284678 . 
  12. ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W, et al. (نوفمبر 2015). "جينوم Symbiodinium kawagutii يلقي الضوء على التعبير الجيني للدينوفلاجيلات والتعايش المرجاني". Science . 350 (6261): 691–4. Bibcode :2015Sci...350..691L. doi : 10.1126/science.aad0408 . PMID  26542574.
  13. ^ "موقع بيانات S. kawagutii". web.malab.cn/symka_new . تم الاسترجاع في 2018-08-22 .
  14. ^ جيندب
  15. ^ أب سانجر
  16. ^ ab Aury JM, Jaillon O, Duret L, Noel B, Jubin C, Porcel BM, et al. (نوفمبر 2006). "الاتجاهات العالمية لتكرارات الجينوم الكامل التي كشفت عنها الهدبية Paramecium tetraurelia". Nature . 444 (7116): 171–8. Bibcode :2006Natur.444..171A. doi : 10.1038/nature05230 . PMID  17086204.
  17. ^ ab Stephens TG, González-Pech RA, Cheng Y, Mohamed AR, Burt DW, Bhattacharya D, et al. (2020). "جينومات الطحالب الدوارة Polarella glacialis تشفر جينات إكسون مفردة متكررة مترادفة ذات وظائف تكيفية". BMC Biology . 18 (1): 56. doi : 10.1186/s12915-020-00782-8 . PMC 7245778. PMID  32448240 . 
  18. ^ أب ستيفنس ، تيموثي. راجان، مارك؛ بهاتاشاريا، ديباشيش؛ تشان ، تشيونغ شين (2020). " موقع بيانات بولاريلا ". دوى :10.14264/uql.2020.222. S2CID  216542238. {{cite journal}}: تتطلب المجلة الاستشهاد بها |journal=( مساعدة )
  19. ^ ab Ensembl دخول
  20. ^ ab Ensembl دخول
  21. ^ ab Gardner MJ, Hall N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman RW, et al. (أكتوبر 2002). "تسلسل جينوم طفيلي الملاريا البشري Plasmodium falciparum". Nature . 419 (6906): 498–511. Bibcode :2002Natur.419..498G. doi :10.1038/nature01097. PMC 3836256. PMID  12368864 . 
  22. ^ ab Pain A, Böhme U, Berry AE, Mungall K, Finn RD, Jackson AP, et al. (أكتوبر 2008). "جينوم طفيلي الملاريا لدى القردة والبشر Plasmodium knowlesi". Nature . 455 (7214): 799–803. Bibcode :2008Natur.455..799P. doi :10.1038/nature07306. PMC 2656934. PMID  18843368 . 
  23. ^ ab Carlton JM, Adams JH, Silva JC, Bidwell SL, Lorenzi H, Caler E, et al. (أكتوبر 2008). "الجينوميات المقارنة لطفيلي الملاريا البشري المهمل Plasmodium vivax". Nature . 455 (7214): 757–63. Bibcode :2008Natur.455..757C. doi : 10.1038/nature07327. PMC 2651158. PMID  18843361. 
  24. ^ ab Carlton JM, Angiuoli SV, Suh BB, Kooij TW, Pertea M, Silva JC, et al. (أكتوبر 2002). "تسلسل الجينوم والتحليل المقارن لطفيلي الملاريا النموذجي Plasmodium yoelii yoelii". Nature . 419 (6906): 512–9. Bibcode :2002Natur.419..512C. doi : 10.1038/nature01099 . PMID  12368865.
  25. ^ Aranda M, Li Y, Liew YJ, Baumgarten S, Simakov O, Wilson MC, et al. (ديسمبر 2016). "جينومات الدياتومات المرجانية المتكافلة تسلط الضوء على التكيفات التطورية المؤدية إلى نمط حياة تكافلي". التقارير العلمية . 6 : 39734. Bibcode :2016NatSR...639734A. doi : 10.1038/srep39734. PMC 5177918. PMID  28004835. 
  26. ^ "موقع بيانات علم الجينوم الشعابي". smic.reefgenomics.org . تم الاسترجاع في 2018-08-22 .
  27. ^ ab Eisen JA، Coyne RS، Wu M، Wu D، Thiagarajan M، Wortman JR، et al. (سبتمبر 2006). “تسلسل الجينوم النووي كبير الحجم من الهدبية Tetrahymena thermophila، نموذج حقيقي النواة”. بلوس علم الأحياء . 4 (9): هـ286. دوى : 10.1371/journal.pbio.0040286 . بمك 1557398 . بميد  16933976. 
  28. ^ Pain A, Renauld H, Berriman M, Murphy L, Yeats CA, Weir W, et al. (يوليو 2005). "جينوم الطفيلي المحول للخلايا المضيفة Theileria annulata بالمقارنة مع T. parva". Science . 309 (5731): 131–3. Bibcode :2005Sci...309..131P. doi : 10.1126/science.1110418 . PMID  15994557.
  29. ^ ab Gardner MJ, Bishop R, Shah T, de Villiers EP, Carlton JM, Hall N, et al. (يوليو 2005). "تسلسل جينوم Theileria parva، مسبب مرض البقر الذي يحول الخلايا الليمفاوية". Science . 309 (5731): 134–7. Bibcode :2005Sci...309..134G. doi : 10.1126/science.1110439 . PMID  15994558.
  30. ^ NCBI جينوم T. gondii ME49
  31. ^ ab Eichinger L, Pachebat JA, Glöckner G, Rajandream MA, Sucgang R, Berriman M, et al. (مايو 2005). "جينوم الأميبا الاجتماعية Dictyostelium discoideum". Nature . 435 (7038): 43–57. Bibcode :2005Natur.435...43E. doi :10.1038/nature03481. PMC 1352341. PMID  15875012 . 
  32. ^ ab Loftus B, Anderson I, Davies R, Alsmark UC, Samuelson J, Amedeo P, et al. (فبراير 2005). "جينوم الطفيلي الأولي Entamoeba histolytica" (PDF) . Nature . 433 (7028): 865–8. Bibcode :2005Natur.433..865L. doi : 10.1038/nature03291 . PMID  15729342. S2CID  14231289.
  33. ^ من قبل NCBI الانضمام
  34. ^ abc Kemen E، Gardiner A، Schultz-Larsen T، Kemen AC، Balmuth AL، Robert-Seilaniantz A، et al. (يوليو 2011). Ausubel FM (محرر). "اكتساب الجينات وفقدانها أثناء تطور الطفيلية الإلزامية في مسببات الصدأ الأبيض لنبات أرابيدوبسيس ثاليانا". PLOS Biology . 9 (7): e1001094. doi : 10.1371/journal.pbio.1001094 . PMC 3130010. PMID  21750662 . 
  35. ^ Gobler CJ, Berry DL, Dyhrman ST, Wilhelm SW, Salamov A, Lobanov AV, et al. (مارس 2011). "الكشف عن مكانة الطحالب الضارة Aureococcus anophagefferens من خلال علم البيئة الجينومي". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 108 (11): 4352–7. Bibcode :2011PNAS..108.4352G. doi : 10.1073/pnas.1016106108 . PMC 3060233. PMID  21368207 . 
  36. ^ ab Gilson PR, Su V, Slamovits CH, Reith ME, Keeling PJ, McFadden GI (يونيو 2006). "تسلسل نوكليوتيدي كامل لشكل نوكليوتيدي الكلوراراكنيوفيت: أصغر نواة في الطبيعة". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (25): 9566–71. Bibcode :2006PNAS..103.9566G. doi : 10.1073/pnas.0600707103 . PMC 1480447. PMID  16760254 . 
  37. ^ abcd Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, et al. (ديسمبر 2012). "جينومات الطحالب تكشف عن الفسيفساء التطورية ومصير الأشكال النووية". Nature . 492 (7427): 59–65. Bibcode :2012Natur.492...59C. doi : 10.1038/nature11681 . PMID  23201678.
  38. ^ Moore CE, Curtis B, Mills T, Tanifuji G, Archibald JM (2012). "تسلسل جينوم الشكل النووي للطحلب السري Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 يكشف عن فقدان جين خاص بالسلالة وتعقيد الجينوم". علم الأحياء الجيني والتطور . 4 (11): 1162–75. doi :10.1093/gbe/evs090. PMC 3514955. PMID  23042551 . 
  39. ^ Tanifuji G, Onodera NT, Wheeler TJ, Dlutek M, Donaher N, Archibald JM (2012). "تسلسل جينوم النواة الكامل للطحلب غير الضوئي Cryptomonas paramecium يكشف عن مجموعة جينات النواة الأساسية". علم الأحياء الجيني والتطور . 3 : 44–54. doi :10.1093/gbe/evq082. PMC 3017389. PMID  21147880 . 
  40. ^ abc Read BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F, et al. (يوليو 2013). "Pan genome of the phytoplankton Emiliania underpins its global distribution". Nature . 499 (7457): 209–13. Bibcode :2013Natur.499..209.. doi : 10.1038/nature12221 . hdl : 1854/LU-4120924 . PMID  23760476.
  41. ^ الدخول
  42. ^ abc Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J, et al. (يناير 2017). "الجينوميات التطورية للطحلب الدياتومي Fragilariopsis cylindrus المتكيف مع البرودة". Nature . 541 (7638): 536–540. Bibcode :2017Natur.541..536M. doi : 10.1038/nature20803 . hdl : 10754/622831 . PMID  28092920.
  43. ^ ab Douglas S, Zauner S, Fraunholz M, Beaton M, Penny S, Deng LT, et al. (أبريل 2001). "الجينوم المنخفض للغاية لنواة الطحالب المستعبدة". Nature . 410 (6832): 1091–6. Bibcode :2001Natur.410.1091D. doi : 10.1038/35074092 . PMID  11323671.
  44. ^ ab Lane CE, van den Heuvel K, Kozera C, Curtis BA, Parsons BJ, Bowman S, Archibald JM (ديسمبر 2007). "الجينوم النووي لـ Hemiselmis andersenii يكشف عن فقدان الإنترون الكامل والضغط كمحرك لبنية البروتين ووظيفته". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 104 (50): 19908–13. Bibcode : 2007PNAS..10419908L . doi : 10.1073/pnas.0707419104 . PMC 2148396. PMID  18077423. 
  45. ^ باكستر إل، تريباثي إس، إسحاق إن، بوت إن، كابرال أ، كيمين إي، وآخرون. (ديسمبر 2010). “توقيعات التكيف لإلزام التغذية الحيوية في جينوم Hyaloperonospora Arabidopsidis”. علوم . 330 (6010): 1549-1551. بيب كود :2010Sci...330.1549B. دوى :10.1126/science.1195203. بمك 3971456 . بميد  21148394. 
  46. ^ Radakovits R, Jinkerson RE, Fuerstenberg SI, Tae H, Settlage RE, Boore JL, Posewitz MC (فبراير 2012). "مسودة تسلسل الجينوم والتحول الجيني للطحالب الزيتية Nannochloropis gaditana". Nature Communications . 3 (2): 686. Bibcode :2012NatCo...3..686R. doi :10.1038/ncomms1688. PMC 3293424. PMID  22353717 . 
  47. ^ Bowler C, Allen AE, Badger JH, Grimwood J, Jabbari K, Kuo A, et al. (نوفمبر 2008). "يكشف جينوم Phaeodactylum عن التاريخ التطوري لجينومات الدياتوم". Nature . 456 (7219): 239–44. Bibcode :2008Natur.456..239B. doi : 10.1038/nature07410 . PMID  18923393.
  48. ^ Haas BJ, Kamoun S, Zody MC, Jiang RH, Handsaker RE, Cano LM, et al. (سبتمبر 2009). "تسلسل الجينوم وتحليل مسببات المجاعة الأيرلندية للبطاطس Phytophthora infestans" (PDF) . Nature . 461 (7262): 393–8. Bibcode :2009Natur.461..393H. doi : 10.1038/nature08358 . PMID  19741609. S2CID  4385549.
  49. ^ ab Tyler BM, Tripathy S, Zhang X, Dehal P, Jiang RH, Aerts A, et al. (سبتمبر 2006). "تسلسلات جينوم فيتوفثورا تكشف عن الأصول التطورية وآليات التسبب في المرض". مجلة العلوم . 313 (5791): 1261–6. رمز Bibcode :2006Sci...313.1261T. doi :10.1126/science.1128796. OSTI  1165482. PMID  16946064. S2CID  21287860.
  50. ^ Schwelm A, Fogelqvist J, Knaust A, Jülke S, Lilja T, Bonilla-Rosso G, et al. (يونيو 2015). "يكشف جينوم Plasmodiophora brassicae عن رؤى في دورة حياته وأصل إنزيمات الكيتين". التقارير العلمية . 5 : 11153. رمز Bibcode : 2015NatSR...511153S. doi : 10.1038/srep11153. PMC 4471660. PMID  26084520. 
  51. ^ كاربون أ، سييو أ، باتيل ر (سبتمبر 2010). "التهاب الجلد التأتبي عند الأطفال: مراجعة للإدارة الطبية". حوليات العلاج الدوائي . 44 (9): 1448-1458. doi :10.1345/aph.1P098. PMID  20628042. S2CID  44649671.
  52. ^ ab Armbrust EV, Berges JA, Bowler C, Green BR, Martinez D, Putnam NH, et al. (أكتوبر 2004). "جينوم الدياتوم Thalassiosira pseudonana: علم البيئة والتطور والتمثيل الغذائي". Science . 306 (5693): 79–86. Bibcode :2004Sci...306...79A. CiteSeerX 10.1.1.690.4884 . doi :10.1126/science.1101156. PMID  15459382. S2CID  8593895. 
  53. ^ أ ب فرانزين أو، جيرلستروم-هولتكفيست جي، كاسترو إي، شيروود إي، أنكاركليف جي، راينر دي إس، وآخرون. (أغسطس 2009). بيتري دبليو (محرر). “مشروع تسلسل الجينوم من الجيارديا المعوية تجميع B عزل GS: هل الجيارديا البشرية ناجمة عن نوعين مختلفين؟”. مسببات الأمراض PLOS . 5 (8): e1000560. دوى : 10.1371/journal.ppat.1000560 . بمك 2723961 . بميد  19696920. 
  54. ^ ab Morrison HG, McArthur AG, Gillin FD, Aley SB, Adam RD, Olsen GJ, et al. (سبتمبر 2007). "الحد الأدنى للجينوم في الطفيلي المعوي المتباعد المبكر Giardia lamblia". Science . 317 (5846): 1921–6. Bibcode :2007Sci...317.1921M. doi :10.1126/science.1143837. PMID  17901334. S2CID  29299317.
  55. ^ abcd Peacock CS, Seeger K, Harris D, Murphy L, Ruiz JC, Quail MA, et al. (يوليو 2007). "تحليل مقارن للجينوم لثلاثة أنواع من الليشمانيا تسبب أمراضًا بشرية متنوعة". Nature Genetics . 39 (7): 839–47. doi :10.1038/ng2053. PMC 2592530. PMID  17572675 . 
  56. ^ ab Ivens AC, Peacock CS, Worthey EA, Murphy L, Aggarwal G, Berriman M, et al. (يوليو 2005). "جينوم طفيليات الخلايا الحركية، الليشمانيا الكبرى". مجلة العلوم . 309 (5733): 436–42. رمز Bibcode :2005Sci...309..436I. doi :10.1126/science.1112680. PMC 1470643. PMID  16020728 . 
  57. ^ abc Fritz-Laylin LK, Prochnik SE, Ginger ML, Dacks JB, Carpenter ML, Field MC, et al. (مارس 2010). "جينوم Naegleria gruberi يسلط الضوء على تنوع الكائنات حقيقية النواة في وقت مبكر". Cell . 140 (5): 631–42. doi : 10.1016/j.cell.2010.01.032 . PMID  20211133. S2CID  13901186.
  58. ^ ab Carlton JM, Hirt RP, Silva JC, Delcher AL, Schatz M, Zhao Q, et al. (يناير 2007). "مسودة تسلسل الجينوم لمسببات الأمراض المنقولة جنسياً Trichomonas vaginalis". Science . 315 (5809): 207–12. Bibcode : 2007Sci...315..207C. doi :10.1126/science.1132894. PMC 2080659. PMID  17218520. 
  59. ^ ab Berriman M, Ghedin E, Hertz-Fowler C, Blandin G, Renauld H, Bartholomeu DC, et al. (يوليو 2005). "جينوم طفيلي المثقبيات الأفريقي Trypanosoma brucei". Science . 309 (5733): 416–22. Bibcode :2005Sci...309..416B. doi :10.1126/science.1112642. PMID  16020726. S2CID  18649858.
  60. ^ ab El-Sayed NM, Myler PJ, Bartholomeu DC, Nilsson D, Aggarwal G, Tran AN, et al. (يوليو 2005). "تسلسل جينوم Trypanosoma cruzi، العامل المسبب لمرض شاغاس". Science . 309 (5733): 409–15. Bibcode :2005Sci...309..409E. doi :10.1126/science.1112631. hdl : 11336/80500 . PMID  16020725. S2CID  3830267.
  61. ^ ab King N, Westbrook MJ, Young SL, Kuo A, Abedin M, Chapman J, et al. (فبراير 2008). "جينوم القوارض أحادية السوطيات Monosiga brevicollis وأصل الحيوانات متعددة الخلايا". Nature . 451 (7180): 783–8. Bibcode :2008Natur.451..783K. doi :10.1038/nature06617. PMC 2562698. PMID  18273011 . 
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=قائمة_الجينومات_الطلائعية_المتسلسلة&oldid=1240996174"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate