مختبر الميكوبلازما

الموسوعة الحرة

مختبر الميكوبلازما
التصنيف العلمي تعديل هذا التصنيف
اِختِصاص: البكتيريا
الشعبة: الميكوبلازمات
فصل: الرخويات
طلب: الميكوبلازماتاليس
عائلة: الميكوبلازماتية
جنس: الميكوبلازما
صِنف:
م. ميكويدس
الأنواع الفرعية:
م.م. JCVI-syn1.0
اسم ثلاثي
الميكوبلازما ميكويدس JCVI-syn1.0
جيبسون وآخرون ، 2010 [أ 1]
المرادفات [أ 2]

مختبر الميكوبلازما رايخ، 2000

يشير مصطلح Mycoplasma laboratorium أو Synthia [b 1] إلى سلالة اصطناعية من البكتيريا . وقد تطور مشروع بناء البكتيريا الجديدة منذ بدايته. في البداية كان الهدف هو تحديد مجموعة ضئيلة من الجينات المطلوبة لاستدامة الحياة من جينوم Mycoplasma genitalium ،وإعادة بناء هذه الجينات اصطناعيًا لإنشاء كائن حي "جديد". تم اختيار Mycoplasma genitalium في الأصل كأساس لهذا المشروع لأنه كان يحتوي في ذلك الوقت على أصغر عدد من الجينات من بين جميع الكائنات الحية التي تم تحليلها. لاحقًا، تحول التركيز إلى Mycoplasma mycoides واتبع نهجًا أكثر تجريبية وخطأ. [b 2]

لتحديد الجينات الدنيا المطلوبة للحياة، تم حذف كل من الجينات الـ 482 لـ M. genitalium بشكل فردي وتم اختبار قابلية الطفرات الناتجة للبقاء. أدى هذا إلى تحديد مجموعة دنيا من 382 جينًا من المفترض نظريًا أن تمثل جينومًا دنيا. [أ 3] في عام 2008، تم إنشاء المجموعة الكاملة من جينات M. genitalium في المختبر مع إضافة علامات مائية لتحديد الجينات على أنها اصطناعية. [ب 3] [أ 4] ومع ذلك، تنمو M. genitalium ببطء شديد وتم اختيار M. mycoides كمحور جديد لتسريع التجارب التي تهدف إلى تحديد مجموعة الجينات اللازمة بالفعل للنمو. [ب 4]

في عام 2010، تم تصنيع الجينوم الكامل لـ M. mycoides بنجاح من سجل كمبيوتر وزرعه في خلية موجودة من Mycoplasma capricolum تم إزالة الحمض النووي الخاص بها. [b 5] وتشير التقديرات إلى أن الجينوم الاصطناعي المستخدم في هذا المشروع كلف 40 مليون دولار أمريكي و200 عام عمل بشري لإنتاجه. [b 4] تمكنت البكتيريا الجديدة من النمو وأطلق عليها اسم JCVI-syn1.0 أو Synthia. بعد إجراء تجارب إضافية لتحديد مجموعة أصغر من الجينات التي يمكن أن تنتج كائنًا حيًا وظيفيًا، تم إنتاج JCVI-syn3.0، والتي تحتوي على 473 جينًا. [b 2] 149 من هذه الجينات لها وظيفة غير معروفة. [b 2] نظرًا لأن جينوم JCVI-syn3.0 جديد، فإنه يُعتبر أول كائن حي اصطناعي حقيقي.

مشروع الجينوم البسيط

إنتاج سينثيا هو جهد في علم الأحياء الاصطناعي في معهد جيه كريج فينتر من قبل فريق من حوالي 20 عالمًا برئاسة الحائز على جائزة نوبل هاملتون سميث بما في ذلك باحث الحمض النووي كريج فينتر وعالم الأحياء الدقيقة كلايد أ. هاتشيسون الثالث . الهدف العام هو تقليص الكائن الحي إلى أساسياته وبالتالي فهم ما هو مطلوب لبناء كائن حي جديد من الصفر. [أ 3] كان التركيز الأولي على بكتيريا M. genitalium ، وهي طفيلية داخل الخلايا إلزامية يتكون جينومها من 482 جينًا تضم ​​582970 زوجًا من القواعد ، مرتبة على كروموسوم دائري واحد (في وقت بدء المشروع ، كان هذا أصغر جينوم لأي كائن حي طبيعي معروف يمكن زراعته في ثقافة حرة). لقد استخدموا طفرة الترانسبوزون لتحديد الجينات التي لم تكن ضرورية لنمو الكائن الحي ، مما أدى إلى مجموعة ضئيلة من 382 جينًا. [أ 3] عُرف هذا الجهد باسم مشروع الجينوم الأدنى . [أ 5]

اختيار الكائن الحي

الميكوبلازما

الميكوبلازما هي جنس من البكتيريا من فئة Mollicutes في قسم Mycoplasmatota (المعروفة سابقًا باسم Tenericutes)، وتتميز بعدم وجود جدار خلوي (مما يجعلها سلبية الجرام ) بسبب نمط حياتها الطفيلي أو المتعايش . في علم الأحياء الجزيئي ، تلقى الجنس الكثير من الاهتمام، سواء لكونه ملوثًا يصعب القضاء عليه في مزارع الخلايا الثديية (إنه محصن ضد بيتا لاكتام والمضادات الحيوية الأخرى )، [أ 6] واستخداماته المحتملة ككائن نموذجي بسبب حجم جينومه الصغير. [أ 7] يعود اختيار الجنس لمشروع Synthia إلى عام 2000، عندما صاغ كارل رايش عبارة Mycoplasma laboratorium . [أ 2]

كائنات أخرى ذات جينومات صغيرة

اعتبارًا من عام 2005، تمتلك Pelagibacter ubique (وهي α-proteobacterium من رتبة Rickettsiales ) أصغر جينوم معروف (1,308,759 زوجًا قاعديًا) لأي كائن حي حر وهي واحدة من أصغر الخلايا ذاتية التكاثر المعروفة. ربما تكون البكتيريا الأكثر عددًا في العالم (ربما 10 28 خلية فردية) ويقدر أنها تشكل مع أعضاء آخرين من فرع SAR11 ما بين ربع ونصف جميع الخلايا البكتيرية أو العتيقة في المحيط. [أ 8] تم التعرف عليها في عام 2002 من خلال تسلسلات rRNA وتم تسلسلها بالكامل في عام 2005. [أ 9] من الصعب للغاية زراعة نوع لا يصل إلى كثافة نمو عالية في ثقافة المختبر. [أ 10] [أ 11] تحتوي العديد من الأنواع المكتشفة حديثًا على جينات أقل من M. genitalium ، ولكنها ليست حرة المعيشة: قد تكون العديد من الجينات الأساسية المفقودة في Hodgkinia cicadicola و Sulcia muelleri و Baumannia cicadellinicola (متعايشات السيكادا ) و Carsonella ruddi (متعايشة مع حشرة سوسة البلوط، Pachypsylla venusta [أ 12] ) مشفرة في نواة المضيف. [أ 13] الكائن الحي الذي يحتوي على أصغر مجموعة معروفة من الجينات اعتبارًا من عام 2013 هو Nasuia deltocephalinicola ، وهو متعايش إلزامي . يحتوي على 137 جينًا فقط وحجم جينوم يبلغ 112 كيلو بايت. [أ 14] [ب 6]

اسم النوع عدد الجينات الحجم (ميغا بايت)
Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem [1] 169 0.14
كانديداتوس كارسونيلا روديي PV [2] 182 0.16
Candidatus Sulcia muelleri GWSS [3] 227 0.25
Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM [4] 242 0.28
شارع بوشنيرا أفيديكولا . سينارا سيدري [5] 357 0.4261
الميكوبلازما التناسلية G37 [6] 475 0.58
كانديداتوس فيتوبلازما مالي [7] 479 0.6
شارع بوشنيرا أفيديكولا . بايزونجيا بيستاسيا [8] 504 0.6224
Nanoarchaeum إيكويتانز Kin4-M [9] 540 0.49

التقنيات

كان لا بد من تطوير العديد من التقنيات المعملية أو تكييفها للمشروع، لأنه يتطلب تركيب ومعالجة قطع كبيرة جدًا من الحمض النووي.

زرع الجينوم البكتيري

في عام 2007، أفاد فريق فينتر أنهم تمكنوا من نقل كروموسوم نوع Mycoplasma mycoides إلى Mycoplasma capricolum من خلال:

  • عزل جينوم M. mycoides : تحلل لطيف للخلايا المحاصرة في الأجار - الأجار المنصهر المخلوط بالخلايا ويترك لتشكيل هلام - يتبعه رحلان كهربائي للهلام بالحقل النبضي وعزل الشريط ذي الحجم الصحيح (دائري 1.25 ميجا بايت قاعدة) ؛
  • جعل الخلايا المستقبلة لـ M. capricolum قادرة على النمو في الوسائط الغنية بعد تجويعها في الوسائط الفقيرة حيث يؤدي تجويع النوكليوتيدات إلى تثبيط تكرار الحمض النووي وتغيير الشكل؛ و
  • تحويل الكروموسوم الدائري إلى خلايا خالية من الحمض النووي بوساطة البولي إيثيلين جليكول ، متبوعًا بالاختيار. [أ 15]

يُستخدم مصطلح التحويل للإشارة إلى إدخال ناقل في خلية بكتيرية (عن طريق الكهرومسام أو الصدمة الحرارية). هنا، تُستخدم عملية الزرع على غرار عملية الزرع النووي .

تركيب الكروموسومات البكتيرية

في عام 2008، وصفت مجموعة فينتر إنتاج جينوم اصطناعي، وهو نسخة من تسلسل M. genitalium G37 L43967، من خلال استراتيجية هرمية: [أ 16]

  • التخليق → 1 كيلو بايت: تم تخليق تسلسل الجينوم بواسطة Blue Heron في 1078 شريطًا بطول 1080 كيلو بايت مع تداخل 80 كيلو بايت ومواقع تقييد NotI (قاطع غير فعال ولكنه غير متكرر).
  • الربط → 10 كيلو بايت: تم ربط 109 مجموعات من سلسلة مكونة من 10 أشرطة متتالية واستنساخها في E. coli على بلازميد وتم التحقق من التبديل الصحيح عن طريق التسلسل.
  • تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد → 100 كيلو بايت: تم ربط 11 مجموعة من سلسلة من 10 مجموعات متتالية بطول 10 كيلو بايت (مزروعة في الخميرة) عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد، باستخدام زوج بادئ لكل مجموعة بطول 10 كيلو بايت.
  • العزل وإعادة التركيب → تم عزل التجمعات الثانوية وضمها وتحويلها إلى كرويات الخميرة بدون تسلسل ناقل (موجود في التجمعات 811-900).

تم نشر جينوم هذه النتيجة لعام 2008، M. genitalium JCVI-1.0، على GenBank باسم CP001621.1. ولا ينبغي الخلط بينه وبين الكائنات الحية الاصطناعية اللاحقة، والتي تحمل علامة JCVI-syn، استنادًا إلى M. mycoides . [أ 16]

الجينوم الاصطناعي

في عام 2010، ابتكر فينتر وزملاؤه سلالة Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0 بجينوم اصطناعي. [أ 1] في البداية لم ينجح البناء الاصطناعي، لذا لتحديد الخطأ - الذي تسبب في تأخير لمدة 3 أشهر في المشروع بأكمله [ب 4] - تم إنشاء سلسلة من البنيات شبه الاصطناعية. كان سبب الفشل طفرة إطارية واحدة في DnaA ، وهو عامل بدء التضاعف . [أ 1]

كان الغرض من إنشاء خلية بجينوم اصطناعي هو اختبار المنهجية، كخطوة نحو إنشاء جينومات معدلة في المستقبل. إن استخدام جينوم طبيعي كقالب قلل من مصادر الفشل المحتملة. هناك العديد من الاختلافات الموجودة في Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0 مقارنة بالجينوم المرجعي، ولا سيما ترانسبوزون E.coli IS1 (عدوى من مرحلة 10 كيلو بايت) وتكرار 85 زوجًا قاعديًا، بالإضافة إلى العناصر المطلوبة للتكاثر في الخميرة والبقايا من مواقع التقييد. [أ 1]

كان هناك جدل حول ما إذا كان JCVI-syn1.0 كائنًا اصطناعيًا حقيقيًا. في حين تم تصنيع الجينوم كيميائيًا في العديد من القطع، فقد تم بناؤه ليتناسب بشكل وثيق مع الجينوم الأم وزرعه في سيتوبلازم الخلية الطبيعية. لا يمكن للحمض النووي وحده إنشاء خلية قابلة للحياة: هناك حاجة إلى البروتينات والحمض النووي الريبي لقراءة الحمض النووي، وهناك حاجة إلى الأغشية الدهنية لتقسيم الحمض النووي والسيتوبلازم . في JCVI-syn1.0، فإن النوعين المستخدمين كمتبرع ومستقبل هما من نفس الجنس، مما يقلل من المشاكل المحتملة لعدم التطابق بين البروتينات في سيتوبلازم المضيف والجينوم الجديد. [أ 17] لاحظ بول كيم (عالم الوراثة الجزيئية في جامعة شمال أريزونا في فلاجستاف ) أن "هناك تحديات كبيرة تنتظر المهندسين الوراثيين قبل أن يتمكنوا من مزج ومطابقة وتصميم جينوم الكائن الحي بالكامل من الصفر". [ب 4]

العلامات المائية

علامة مائية مخفية على شريحة أشباه الموصلات من عام 1976، تعمل كتوقيع لمبتكريها. وعلى نحو مماثل، أضاف جيه سي فينتر وفريقه علامات مائية باستخدام رموز التوقف لتوقيع ابتكارهم.

من السمات التي حظيت بتغطية إعلامية واسعة النطاق لـ JCVI-syn1.0 وجود تسلسلات علامات مائية. العلامات المائية الأربع (الموضحة في الشكل S1 في المادة التكميلية للورقة البحثية [أ 1] ) عبارة عن رسائل مشفرة مكتوبة في الحمض النووي، بطول 1246 و1081 و1109 و1222 زوجًا قاعديًا على التوالي. لم تستخدم هذه الرسائل الكود الجيني القياسي ، حيث تقوم تسلسلات من 3 قواعد DNA بتشفير الأحماض الأمينية، بل كودًا جديدًا تم اختراعه لهذا الغرض، والذي تم تحدي القراء لحله. [ب 7] محتوى العلامات المائية هو كما يلي:

  1. العلامة المائية 1: مستند HTML يُقرأ في متصفح الويب كنص يهنئ مفكك التشفير، وتعليمات حول كيفية إرسال بريد إلكتروني إلى المؤلفين لإثبات فك التشفير.
  2. العلامة المائية 2: قائمة المؤلفين واقتباس من جيمس جويس : "العيش، والخطأ، والسقوط، والانتصار، وإعادة خلق الحياة من الحياة".
  3. العلامة المائية 3: المزيد من المؤلفين واقتباس من روبرت أوبنهايمر (غير مذكور): "انظر إلى الأشياء ليس كما هي، بل كما قد تكون".
  4. العلامة المائية رقم 4: المزيد من المؤلفين واقتباس من ريتشارد فاينمان : "ما لا أستطيع بنائه، لا أستطيع فهمه".

جيه سي في آي-سين 3.0

تعمل الجينات في الجينوم الأدنى للكائن الحي الاصطناعي ، Syn 3. [ أ 18]

في عام 2016، استخدم معهد فينتر جينات من JCVI-syn1.0 لتوليف جينوم أصغر أطلقوا عليه اسم JCVI-syn3.0، والذي يحتوي على 531560 زوجًا من القواعد و473 جينًا. [b 8] في عام 1996، بعد مقارنة M. genitalium ببكتيريا صغيرة أخرى Haemophilus influenzae ، اقترح أركادي موشيجيان ويوجين كونين أنه قد يكون هناك مجموعة مشتركة من 256 جينًا يمكن أن تكون مجموعة ضئيلة من الجينات اللازمة للبقاء. [b 9] [a 19] في هذا الكائن الحي الجديد، لا يمكن تقليص عدد الجينات إلا إلى 473، 149 منها لها وظائف غير معروفة تمامًا. [ب 9] اعتبارًا من عام 2022، تم تضييق المجموعة غير المعروفة إلى حوالي 100. [ب 10] في عام 2019، تم نشر نموذج حسابي كامل لجميع المسارات في خلية Syn3.0، وهو ما يمثل أول نموذج حاسوبي كامل للكائن الحي البسيط. [أ 20]

المخاوف والجدل

استقبال

في السادس من أكتوبر 2007، أعلن كريج فينتر في مقابلة مع صحيفة الغارديان البريطانية أن نفس الفريق نجح في تصنيع نسخة معدلة من الكروموسوم المفرد لبكتيريا الميكوبلازما التناسلية كيميائياً . ولم يتم زرع الجينوم المصنّع بعد في خلية عاملة. وفي اليوم التالي، أصدرت مجموعة الأخلاقيات الحيوية الكندية، مجموعة ETC، بياناً من خلال ممثلها، بات موني ، قالت فيه إن "إبداع" فينتر كان "هيكلاً يمكنك بناء أي شيء عليه تقريباً. يمكن أن يكون مساهمة للإنسانية مثل الأدوية الجديدة أو تهديداً كبيراً للإنسانية مثل الأسلحة البيولوجية". وعلق فينتر قائلاً "نحن نتعامل مع أفكار كبيرة. نحن نحاول خلق نظام قيم جديد للحياة. عندما تتعامل بهذا الحجم، لا يمكنك أن تتوقع أن يكون الجميع سعداء". [ب 11]

في الحادي والعشرين من مايو 2010، أعلنت مجلة ساينس أن مجموعة فينتر نجحت في تصنيع جينوم بكتيريا Mycoplasma mycoides من سجل حاسوبي وزرعت الجينوم المصنّع في خلية موجودة لبكتيريا Mycoplasma capricolum التي تم إزالة حمضها النووي منها. كانت البكتيريا "المصنّعة" قابلة للحياة، أي قادرة على التكاثر. [b 1] وصفها فينتر بأنها "أول نوع.... يكون أبواه حاسوبًا". [b 12]

في الخامس والعشرين من مارس 2016، أعلن في مجلة ساينس عن ابتكار بكتيريا اصطناعية جديدة، JCVI-3.0. تحتوي هذه البكتيريا على 473 جينًا فقط. ووصفها فينتر بأنها "أول كائن حي مصمم في التاريخ"، وزعم أن حقيقة أن 149 من الجينات المطلوبة لها وظائف غير معروفة تعني أن "مجال علم الأحياء بأكمله كان يفتقد ثلث ما هو ضروري للحياة". [أ 21]

التغطية الصحفية

حظي المشروع بتغطية إعلامية كبيرة بسبب استعراض فينتر، إلى الحد الذي دفع جاي كيسلينج ، عالم الأحياء الاصطناعية الرائد ومؤسس شركة أميريس، إلى التعليق قائلاً: "التنظيم الوحيد الذي نحتاجه هو من فم زميلي". [ب 13]

جدوى

وقد زعم فينتر أن البكتيريا الاصطناعية تشكل خطوة نحو خلق كائنات حية قادرة على تصنيع الهيدروجين والوقود الحيوي ، وكذلك امتصاص ثاني أكسيد الكربون وغيره من الغازات المسببة للانحباس الحراري العالمي . وقد أعرب جورج إم. تشرش ، وهو رائد آخر في مجال البيولوجيا الاصطناعية ، عن وجهة نظر متناقضة مفادها أن خلق جينوم اصطناعي بالكامل ليس ضروريًا لأن البكتيريا الإشريكية القولونية تنمو بكفاءة أكبر من البكتيريا التناسلية حتى مع كل الحمض النووي الإضافي؛ وعلق على أن الجينات الاصطناعية قد تم دمجها في البكتيريا الإشريكية القولونية لأداء بعض المهام المذكورة أعلاه. [ب 14]

الملكية الفكرية

في عام 2006 ، تقدم معهد جيه كريج فينتر بطلب للحصول على براءات اختراع لجينوم مختبر ميكوبلازما (الجينوم البكتيري الأدنى) في الولايات المتحدة وعلى الصعيد الدولي. [ب 15] [ب 16] [أ 22] احتجت مجموعة ETC، وهي مجموعة أخلاقيات حيوية كندية، على أساس أن براءة الاختراع كانت واسعة النطاق للغاية. [ب 17]

مشاريع مماثلة

من عام 2002 إلى عام 2010، أنشأ فريق في الأكاديمية المجرية للعلوم سلالة من الإشريكية القولونية تسمى MDS42، والتي تباع الآن من قبل شركة Scarab Genomics في ماديسون، ويسكونسن تحت اسم "Clean Genome. E.coli"، [b 18] حيث تمت إزالة 15٪ من جينوم السلالة الأصلية (E. coli K-12 MG1655) للمساعدة في كفاءة البيولوجيا الجزيئية، وإزالة عناصر IS والجينات الزائفة والعاثيات، مما أدى إلى صيانة أفضل للجينات السامة المشفرة بالبلازميد، والتي غالبًا ما يتم تعطيلها بواسطة العناصر المنقولة. [a 23] [a 24] [a 25] لم يتم تغيير آلية الكيمياء الحيوية والتضاعف.

مراجع

المصادر الأولية

  1. ^ abcde Gibson, DG; Glass, JI; Lartigue, C.; Noskov, VN; Chuang, R.-Y.; Algire, MA; Benders, GA; Montague, MG; Ma, L.; Moodie, MM; Merryman, C.; Vashee, S.; Krishnakumar, R.; assad-Garcia, N.; Andrews-Pfannkoch, C.; Denisova, EA; Young, L.; Qi, Z.-Q.; Segall-Shapiro, TH; Calvey, CH; Parmar, PP; Hutchison, CA; Smith, HO; Venter, JC (20 مايو 2010). "إنشاء خلية بكتيرية يتم التحكم فيها بواسطة جينوم مُصنّع كيميائيًا". العلوم . 329 (5987): 52– 56. Bibcode :2010Sci...329...52G. doi : 10.1126/science.1190719 . PMID  20488990.
  2. ^ ab Reich, KA (يونيو 2000). "البحث عن الجينات الأساسية". البحث في علم الأحياء الدقيقة . 151 (5): 319– 24. doi :10.1016/S0923-2508(00)00153-4. PMID  10919511. بالإضافة إلى ذلك، فإن الجينات الصعبة في هذه الكائنات تجعل التحقق اللاحق من الجوهرية عن طريق عمليات الحذف الموجهة أمرًا إشكاليًا ويحول عمليًا دون إمكانية إجراء تخليق جديد لـ "M. laboratorium"، وهو أصل الاهتمام في الصحافة الشعبية.
  3. ^ abc Glass, John I.; Nacyra abad-Garcia; Nina Alperovich; Shibu Yooseph; Matthew R. Lewis; Mahir Maruf; Clyde A. Hutchison; Hamilton O. Smith; J. Craig Venter (2006-01-10). "الجينات الأساسية للبكتيريا البسيطة". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 103 (2): 425– 430. Bibcode :2006PNAS..103..425G. doi : 10.1073/pnas.0510013103 . PMC 1324956. PMID  16407165 . 
  4. ^ جيبسون، دي جي؛ بيندرز، جي إيه؛ أندروز-بفانكوش، سي؛ دينيسوفا، إي إيه؛ بادن-تيلسون، إتش؛ زافيري، جيه؛ ستوكويل، تي بي؛ براونلي، إيه؛ توماس، دي دبليو (2008-02-29). "التركيب الكيميائي الكامل وتجميع واستنساخ جينوم الميكوبلازما التناسلية". ساينس . 319 (5867): 1215– 1220. رمز Bibcode :2008Sci...319.1215G. doi :10.1126/science.1151721. ISSN  0036-8075. PMID  18218864. S2CID  8190996.
  5. ^ Hutchison CA, Montague MG (2002). "Mycoplasmas and the minimal genome concept". Molecular Biology and Diseaseogenicity of Mycoplasmas (Razin S, Herrmann R, eds.) . New York: Kluwer Academic/Plenum. pp.  221– 54. ISBN 978-0-306-47287-9.
  6. ^ يونغ إل، سونغ جيه، ستايسي جيه، ماسترز جيه آر. "اكتشاف الميكوبلازما في مزارع الخلايا". بروتوكولات نات. 2010 5 (5): 929–34. نشر إلكتروني 22 أبريل 2010.
  7. ^ Fraser CM, Gocayne JD, White O, et al. (أكتوبر 1995). "المكمل الجيني الأدنى لـ Mycoplasma genitalium ". Science . 270 (5235): 397– 403. Bibcode :1995Sci...270..397F. doi :10.1126/science.270.5235.397. PMID  7569993. S2CID  29825758.
  8. ^ Morris RM, et al. (2002). "فصيلة SAR11 تهيمن على مجتمعات العوالق البكتيرية على سطح المحيط". Nature . 420 (6917): 806– 10. Bibcode :2002Natur.420..806M. doi :10.1038/nature01240. PMID  12490947. S2CID  4360530.
  9. ^ ستيفن جيه جيوفانوني، إتش جيمس تريب، وآخرون (2005). "تبسيط الجينوم في بكتيريا محيطية عالمية". ساينس . 309 (5738): 1242– 1245. رمز Bibcode :2005Sci...309.1242G. doi :10.1126/science.1114057. PMID  16109880. S2CID  16221415.
  10. ^ Rappé MS, Connon SA, Vergin KL, Giovannoni SL (2002). "Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade". Nature . 418 (6898): 630– 33. Bibcode :2002Natur.418..630R. doi :10.1038/nature00917. PMID  12167859. S2CID  4352877.
  11. ^ Tripp HJ, Kitner JB, Schwalbach MS, Dacey JW, Wilhelm LJ, Giovannoni SJ (10 أبريل 2008). "تتطلب البكتيريا البحرية SAR11 كبريتًا مخفضًا خارجيًا للنمو". Nature . 452 (7188): 741– 4. Bibcode :2008Natur.452..741T. doi :10.1038/nature06776. PMID  18337719. S2CID  205212536.
  12. ^ ناكاباتشي، أ. ياماشيتا، أ؛ توه، ه.؛ إيشيكاوا، ه.؛ دنبار، سعادة؛ موران، NA؛ هاتوري، م. (2006). “الجينوم الذي يبلغ 160 كيلو بايت من البكتيرية Endosymbiont Carsonella”. علوم . 314 (5797): 267. دوى :10.1126/science.1134196. بميد  17038615. S2CID  44570539.
  13. ^ McCutcheon, JP; McDonald, BR; Moran, NA (2009). "التطور المتقارب للأدوار الأيضية في الكائنات الحية الدقيقة المتعايشة مع الحشرات". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 106 (36): 15394– 15399. Bibcode :2009PNAS..10615394M. doi : 10.1073/pnas.0906424106 . PMC 2741262. PMID  19706397 . 
  14. ^ نانسي أ. موران؛ جوردون م. بينيت (2014). "أصغر الجينومات الصغيرة". المراجعة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 68 : 195– 215. doi : 10.1146/annurev-micro-091213-112901 . PMID  24995872.
  15. ^ Lartigue C, Glass JI, Alperovich N, Pieper R, Parmar PP, Hutchison CA 3rd, Smith HO, Venter JC (Aug 3, 2007). "Genome planting inbacterial: changing one genre to another". Science . 317 (5838): 632– 8. Bibcode :2007Sci...317..632L. CiteSeerX 10.1.1.395.4374 . doi :10.1126/science.1144622. PMID  17600181. S2CID  83956478. {{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) CS1 maint: numeric names: authors list (link)
  16. ^ ab Gibson, B; Clyde A. Hutchison; Cynthia Pfannkoch; J. Craig Venter; et al. (2008-01-24). "التوليف الكيميائي الكامل وتجميع واستنساخ جينوم الميكوبلازما التناسلية". Science . 319 (5867): 1215– 20. Bibcode :2008Sci...319.1215G. doi :10.1126/science.1151721. PMID  18218864. S2CID  8190996.
  17. ^ Povolotskaya, IS; Kondrashov, FA (يونيو 2010). "مساحة التسلسل والتوسع المستمر لكون البروتين". Nature . 465 (7300): 922– 6. Bibcode :2010Natur.465..922P. doi :10.1038/nature09105. PMID  20485343. S2CID  4431215.
  18. ^ هاتشيسون، كلايد أ.؛ تشوانغ، راي يوان؛ نوسكوف، فلاديمير ن.؛ أسعد جارسيا، ناسيرا؛ ديرينك، توماس ج.؛ إليسمان، مارك هـ.؛ جيل، جون؛ كانان، كريشنا؛ كاراس، بوغوميل ج. (2016-03-25). "تصميم وتوليف جينوم بكتيري بسيط". ساينس . 351 (6280): aad6253. رمز Bibcode :2016Sci...351.....H. doi : 10.1126/science.aad6253 . ISSN  0036-8075. PMID  27013737.
  19. ^ Arcady R. Mushegian; Eugene V. Koonin (سبتمبر 1996). "مجموعة جينية دنيا للحياة الخلوية مستمدة من مقارنة الجينومات البكتيرية الكاملة". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (19): 10268– 10273. Bibcode :1996PNAS...9310268M. doi : 10.1073 /pnas.93.19.10268 . PMC 38373. PMID  8816789. 
  20. ^ Breuer, Marian; Earnest, Tyler M.; Merryman, Chuck; Wise, Kim S.; Sun, Lijie; Lynott, Michaela R.; Hutchison, Clyde A.; Smith, Hamilton O.; Lapek, John D.; Gonzalez, David J.; De Crécy-Lagard, Valérie; Haas, Drago; Hanson, Andrew D.; Labhsetwar, Piyush; Glass, John I.; Luthey-Schulten, Zaida (2019). "التمثيل الغذائي الأساسي للخلية الدنيا". eLife . 8 . doi : 10.7554/eLife.36842 . PMC 6609329 . PMID  30657448. 
  21. ^ هيربر، ماثيو. "بعد بحث دام 20 عامًا، نجح علماء الأحياء في خلق بكتيريا اصطناعية بدون جينات إضافية". فوربس . تم الاسترجاع في 2019-07-02 .
  22. ^ طلب براءة اختراع أمريكي: 20070122826 مؤرشف في 2021-11-25 على موقع Wayback Machine
  23. ^ Umenhoffer K, Fehér T, Balikó G, Ayaydin F, Pósfai J, Blattner FR, Pósfai G (2010). "انخفاض قابلية تطور Escherichia coli MDS42، هيكل خلوي بدون IS للتطبيقات الجزيئية والبيولوجية الاصطناعية". Microbial Cell Factories . 9 : 38. doi : 10.1186/1475-2859-9-38 . PMC 2891674. PMID  20492662 . 
  24. ^ Pósfai G, Plunkett G 3rd, Fehér T, Frisch D, Keil GM, Umenhoffer K, Kolisnychenko V, Stahl B, Sharma SS, de Arruda M, Burland V, Harcum SW, Blattner FR (2006). "الخصائص الناشئة لجينوم الإشريكية القولونية المختزل". Science . 312 (5776): 1044– 6. Bibcode :2006Sci...312.1044P. doi :10.1126/science.1126439. PMID  16645050. S2CID  43287314.{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) CS1 maint: numeric names: authors list (link)
  25. ^ Kolisnychenko V، Plunkett G 3rd، Herring CD، Fehér T، Pósfai J، Blattner FR، Pósfai G (أبريل 2002). “هندسة جينوم الإشريكية القولونية المخفض”. دقة الجينوم . 12 (4): 640– 7. دوى :10.1101 / gr.217202. بمك 187512 . بميد  11932248. {{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) CS1 maint: numeric names: authors list (link)
  1. ^ من تأليف روبرتا كوك (2010). "علم الجينوم: حرفيو الحمض النووي". مجلة نيتشر . 468 (7320): 22– 5. رمز Bibcode :2010Natur.468...22K. doi : 10.1038/468022a . PMID  21048740.
  2. ^ abc Callaway, Ewen (2016). ""الخلية 'الحد الأدنى' ترفع الرهانات في السباق لتسخير الحياة الاصطناعية"". Nature . 531 (7596): 557– 558. Bibcode :2016Natur.531..557C. doi : 10.1038/531557a . ISSN  0028-0836. PMID  27029256.
  3. ^ بول، فيليب (2008-01-24). "جينوم مخيط يدويًا". نيتشر . doi :10.1038/news.2008.522. ISSN  0028-0836.
  4. ^ abcd Pennisi E (مايو 2010). "علم الجينوم. الجينوم الاصطناعي يجلب حياة جديدة للبكتيريا" (PDF) . العلوم . 328 (5981): 958– 9. doi : 10.1126/science.328.5981.958 . PMID  20488994.
  5. ^ كاتسنلسون، آلا (2010-05-20). "باحثون يبدؤون خلية بجينوم اصطناعي". نيتشر . doi : 10.1038/news.2010.253 . ISSN  0028-0836.
  6. ^ زيمر، كارل (2013-08-23). ​​"والجينومات تستمر في الانكماش..." ناشيونال جيوغرافيك . مؤرشف من الأصل في 23 أغسطس 2013.
  7. ^ كين شيريف (2010-06-10). "استخدام آرك لفك شفرة العلامة المائية السرية لفينتر على الحمض النووي". مدونة كين شيريف . تم الاسترجاع في 2010-10-29 .
  8. ^ أول خلية بكتيرية اصطناعية بسيطة. Astrobiology Web . 24 مارس 2016.
  9. ^ أب يونج، إد (24 مارس 2016). "الشيء الغامض حول الخلية الاصطناعية الجديدة الرائعة".
  10. ^ سومرز، جيمس (7 مارس 2022). "رحلة إلى مركز خلايانا". مجلة النيويوركر . نيويورك: كوندي ناست .
  11. ^ Pilkington, Ed (6 أكتوبر 2009). "أنا أصنع حياة اصطناعية، يعلن رائد الجينات الأمريكي". The Guardian . لندن . تم الاسترجاع في 23 نوفمبر 2012 .
  12. ^ "كيف صنع العلماء "حياة اصطناعية"". بي بي سي نيوز . 2010-05-20 . تم الاسترجاع في 2010-05-21 .
  13. ^ بولاك، أندرو (4 سبتمبر 2010). "استراتيجيته المؤسسية: المنهج العلمي". نيويورك تايمز .
  14. ^ أطول قطعة من الحمض النووي الاصطناعي حتى الآن، ساينتفك أميركان نيوز ، 24 يناير 2008
  15. ^ "الحياة الاصطناعية: براءة اختراع معلقة"، الإيكونوميست ، 14 يونيو 2007. تم استرجاعه في 7 أكتوبر 2007.
  16. ^ روجر هايفيلد، "ميكروب من صنع الإنسان 'لإنشاء وقود حيوي لا نهاية له'"، تلغراف ، 8 يونيو 2007. تم استرجاعه في 7 أكتوبر 2007.
  17. ^ إيانكولوفيتشي، إيلينا (15 يناير 2008). "المجال الناشئ للبيولوجيا التركيبية: "التركيبية" أم الخلاص؟". العلوم في الأخبار . تم الاسترجاع في 3 يوليو 2019 .
  18. ^ "موقع شركة Scarab Genomics LLC على الويب".


  • معهد ج. كريج فينتر: مجموعات البحث
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mycoplasma_laboratorium&oldid=1261315374"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate