الببتيدات المضادة للميكروبات

📅 آخر تحديث: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 8 صور
الموسوعة الحرة

هياكل مختلفة من الببتيدات المضادة للميكروبات

الببتيدات المضادة للميكروبات ( AMPs )، والتي تسمى أيضًا ببتيدات دفاع المضيف ( HDPs )، هي جزء من الاستجابة المناعية الفطرية الموجودة بين جميع فئات الحياة. توجد اختلافات جوهرية بين الخلايا بدائية النواة والخلايا حقيقية النواة والتي قد تمثل أهدافًا للببتيدات المضادة للميكروبات. هذه الببتيدات هي مضادات ميكروبات قوية وواسعة النطاق والتي تظهر إمكاناتها كعوامل علاجية جديدة. لقد ثبت أن الببتيدات المضادة للميكروبات تقتل البكتيريا سلبية الجرام وإيجابية الجرام ، [1] والفيروسات المغلفة والفطريات وحتى الخلايا المتحولة أو السرطانية. [2] على عكس غالبية المضادات الحيوية التقليدية، يبدو أن الببتيدات المضادة للميكروبات تعمل بشكل متكرر على زعزعة استقرار الأغشية البيولوجية ، ويمكن أن تشكل قنوات عبر الغشاء ، وقد يكون لها أيضًا القدرة على تعزيز المناعة من خلال العمل كمنظمات للمناعة .

بناء

ببتيدات مضادة للميكروبات من الحيوانات والنباتات والفطريات مرتبة حسب محتواها من البنية الثانوية. يشير حجم الدائرة إلى الوزن الجزيئي الإجمالي لكل ببتيد.

الببتيدات المضادة للميكروبات هي مجموعة فريدة ومتنوعة من الجزيئات، والتي تنقسم إلى مجموعات فرعية على أساس تركيبها وبنيتها من الأحماض الأمينية. [3] تتكون الببتيدات المضادة للميكروبات عمومًا من 12 إلى 50 حمضًا أمينيًا. تتضمن هذه الببتيدات بقايا مشحونة إيجابيا أو أكثر مقدمة من الأرجينين أو اللايسين أو في البيئات الحمضية الهيستيدين ونسبة كبيرة (عادةً >50٪) من البقايا الكارهة للماء. [4] [5] [6] تتبع الهياكل الثانوية لهذه الجزيئات 4 موضوعات، بما في ذلك i) α-helical ، ii) β-stranded بسبب وجود رابطتين أو أكثر من روابط ثاني كبريتيد ، iii) β-hairpin أو loop بسبب وجود رابطة ثاني كبريتيد واحدة و/أو حلقة لسلسلة الببتيد، و iv) ممتدة. [7] العديد من هذه الببتيدات غير مهيكلة في المحلول الحر، وتطوى في تكوينها النهائي عند الانقسام إلى أغشية بيولوجية. تحتوي الببتيدات على بقايا أحماض أمينية محبة للماء مصطفة على طول جانب واحد وبقايا أحماض أمينية كارهة للماء مصطفة على طول الجانب الآخر من الجزيء الحلزوني. [3] تسمح هذه اللامبالاة للببتيدات المضادة للميكروبات بالانقسام إلى الطبقة الدهنية الغشائية. القدرة على الارتباط بالأغشية هي سمة محددة للببتيدات المضادة للميكروبات، [8] [9] على الرغم من أن نفاذية الغشاء ليست ضرورية. تتمتع هذه الببتيدات بمجموعة متنوعة من الأنشطة المضادة للميكروبات تتراوح من نفاذية الغشاء إلى العمل على مجموعة من الأهداف السيتوبلازمية. [ بحاجة لمصدر ]

يكتب خاصية مميزة AMPs
الببتيدات الأنيونية غني بحمض الجلوتاميك والأسبارتيك ماكسيمين H5 من البرمائيات، ديرمزيدين من البشر
ببتيدات ألفا الحلزونية الكاتيونية الخطية نقص في السيستين Cecropins ، andropin، و moricin ، وceratotoxin، و melittin من الحشرات، و Magainin ، وdermaseptin ، وbombinin، وbrevinin-1، وesculentins، وbuforin II من البرمائيات، وCAP18 من الأرانب، و LL37 من البشر.
ببتيد كاتيوني غني بحمض أميني محدد غني بالبرولين والأرجينين والفينيل ألانين والجلايسين والتريبتوفان أبيسين ودروسوسين ، وأبيدايسين، وديبتيريسين ، وأتاسين من الحشرات، وبروفينين من الخنازير، وإندوليسيدين من الماشية.
ببتيدات أنيونية/كاتيونية تشكل روابط ثنائية الكبريتيد تحتوي على رابطة ثنائي كبريتيد 1~3

أنشطة

طرق عمل الببتيدات المضادة للميكروبات

تتنوع طرق العمل التي تقتل بها الببتيدات المضادة للميكروبات الميكروبات، [10] وقد تختلف باختلاف الأنواع البكتيرية. [11] تقتل بعض الببتيدات المضادة للميكروبات كل من البكتيريا والفطريات، على سبيل المثال، يقتل البسورياسين الإشريكية القولونية والعديد من الفطريات الخيطية. [12] الغشاء السيتوبلازمي هو هدف متكرر، ولكن الببتيدات قد تتداخل أيضًا مع تخليق الحمض النووي والبروتين ، وطي البروتين، وتخليق جدار الخلية. [10] يكون الاتصال الأولي بين الببتيد والكائن المستهدف كهروستاتيكي، حيث أن معظم الأسطح البكتيرية أنيونية أو كارهة للماء، كما هو الحال في الببتيد المضاد للميكروبات بيسسيدين. يسمح لها تكوين الأحماض الأمينية، وامفيباتية، وشحنة كاتيونية وحجمها بالارتباط بطبقات الغشاء الثنائية وإدخالها لتكوين مسام من خلال آليات "البرميل-الجذع" أو "السجادة" أو "المسام الحلقية". وبدلاً من ذلك، قد تخترق الخلية لربط الجزيئات داخل الخلايا والتي تعد ضرورية لحياة الخلية. [13] تتضمن نماذج الارتباط داخل الخلايا تثبيط تخليق جدار الخلية، وتغيير الغشاء السيتوبلازمي، وتنشيط الإنزيم الذاتي، وتثبيط تخليق الحمض النووي، والحمض النووي الريبي، والبروتين، وتثبيط بعض الإنزيمات. في كثير من الحالات، لا تُعرف الآلية الدقيقة للقتل. إحدى التقنيات الناشئة لدراسة مثل هذه الآليات هي قياس التداخل ثنائي الاستقطاب . [14] [15] وعلى النقيض من العديد من المضادات الحيوية التقليدية، يبدو أن هذه الببتيدات قاتلة للجراثيم [2] بدلاً من كونها مضادة للبكتيريا . بشكل عام، يتم تحديد النشاط المضاد للميكروبات لهذه الببتيدات عن طريق قياس الحد الأدنى للتركيز المثبط (MIC)، وهو أقل تركيز للدواء الذي يثبط نمو البكتيريا. [16]

يمكن أن تمتلك AMPs أنشطة متعددة بما في ذلك الأنشطة المضادة للبكتيريا إيجابية الجرام، والمضادة للبكتيريا سلبية الجرام، والمضادة للفطريات، والمضادة للفيروسات، والمضادة للطفيليات، والمضادة للسرطان. يشير تحليل وظيفي كبير لـ AMP إلى أنه من بين جميع أنشطة AMP، اللامبالاة والشحنة، هناك خاصيتان رئيسيتان لـ AMP، تميزان بشكل أفضل بين AMPs مع الأنشطة المضادة للبكتيريا سلبية الجرام وبدونها. [17] وهذا يعني أن كونها AMPs ذات أنشطة مضادة للبكتيريا سلبية الجرام قد تفضل أو حتى تتطلب لامبالاة قوية وشحنة موجبة صافية. [ بحاجة لمصدر ]

تعديل المناعة

بالإضافة إلى قتل البكتيريا بشكل مباشر، فقد ثبت أن لديهم عددًا من الوظائف المعدلة للمناعة التي قد تشارك في إزالة العدوى، بما في ذلك القدرة على تغيير التعبير الجيني للمضيف، والعمل ككيموكينات و/أو تحريض إنتاج الكيموكينات ، وتثبيط إنتاج السيتوكينات المؤيدة للالتهابات التي يسببها الليبوبوليساكاريد ، وتعزيز التئام الجروح، وتعديل استجابات الخلايا الشجيرية وخلايا الاستجابة المناعية التكيفية. تشير النماذج الحيوانية إلى أن ببتيدات دفاع المضيف ضرورية لكل من الوقاية من العدوى وإزالتها. يبدو أن العديد من الببتيدات المعزولة في البداية وتسمى "ببتيدات مضادة للميكروبات" قد ثبت أن لها وظائف بديلة أكثر أهمية في الجسم الحي (على سبيل المثال الهيبسيدين [18] ). على سبيل المثال، دوسكيتيد هو منظم للمناعة يعمل من خلال p62، وهو بروتين يشارك في إشارات مستقبلات تشبه toll للعدوى. يتم فحص الببتيد في تجربة سريرية من المرحلة الثالثة بواسطة شركة Soligenix (SGNX) للتأكد من قدرته على المساعدة في إصلاح الضرر الناجم عن الإشعاع في الغشاء المخاطي للفم والذي ينشأ أثناء العلاج الإشعاعي للسرطان في الرأس والرقبة. [19]

آليات العمل

صور مجهرية إلكترونية ماسحة (تكبير 50000 ضعف) تُظهر تأثير ببتيد مضاد للميكروبات تجريبي (NN2_0050) على الغشاء الخلوي لبكتيريا الإشريكية القولونية (K12 MG1655) [1] أعلاه: أغشية خلوية سليمة في المجموعة الضابطة. أدناه: أغشية خلوية مكسورة وتسرب كروموسوم بكتيري (أخضر) في المجموعة المعالجة.

تمتلك الببتيدات المضادة للميكروبات عمومًا شحنة موجبة صافية، مما يسمح لها بالتفاعل مع الجزيئات المشحونة سلبًا المعرضة على أسطح البكتيريا والخلايا السرطانية، مثل فوسفاتيديل سيرين الفوسفوليبيد، والميوسينات السكرية، والجانجليوزيدات السيالية، وكبريتات الهيبارين. تختلف آلية عمل هذه الببتيدات على نطاق واسع ولكن يمكن تبسيطها إلى فئتين: الببتيدات المضادة للميكروبات المحللة للأغشية وغير المحللة للأغشية. [20] يمكن وصف تعطيل الأغشية بواسطة الببتيدات المضادة للميكروبات المحللة للأغشية بأربعة نماذج: [20]

  • نموذج البرميل-العصي: يقترح نموذج البرميل-العصي أن تتفاعل AMPs مع الطبقة الدهنية المزدوجة لغشاء الخلية الميكروبية لتشكيل قنوات عبر الغشاء أو "عصي برميلية". يُعتقد أن هذه القنوات تعطل سلامة الغشاء، مما يؤدي إلى موت الميكروب.
  • نموذج السجادة: يقترح نموذج السجادة أن تمتص جزيئات AMP على الطبقة الدهنية المزدوجة لغشاء الخلية الميكروبية، لتشكل طبقة كثيفة تتسبب في نفاذية الغشاء. يقترح هذا النموذج أن جزيئات AMP تعمل كـ "سجادة" تغطي سطح الخلية، مما يمنع الميكروب من العمل بشكل صحيح.
  • النموذج الحلقي: يقترح النموذج الحلقي أن تتفاعل جزيئات AMP مع الطبقة الدهنية المزدوجة لغشاء الخلية الميكروبية لتكوين هياكل حلقية، والتي يُعتقد أنها تضغط على أجزاء من الغشاء وتؤدي إلى تكوين حويصلات. ويُعتقد أن هذه العملية تعطل سلامة الغشاء وتتسبب في موت الميكروب.
  • نموذج المسام الحلقية غير المنظمة: وفقًا لهذا النموذج، تلتف AMP غير المنظمة حول الطبقة الثنائية الدهنية وتنشئ مسامًا، مما يعطل سلامة الغشاء ويؤدي إلى موت الميكروب. وعلى عكس النموذج الحلقي، الذي يشير إلى أن AMP ينشئ بنية حلقية مستقرة، يشير نموذج المسام الحلقية غير المنظمة إلى أن AMP مرن ولا يشكل بنية حلقية مستقرة. يصبح مجمع المسام الببتيدية الدهنية غير منظم جوهريًا ، مع عدم تحديد اتجاه الببتيد جيدًا. [21]
تمثيل تخطيطي لآليات عمل AMPs عند تعطيل الأغشية. [22]

تم استخدام العديد من الطرق لتحديد آليات نشاط الببتيد المضاد للميكروبات. [11] [13] على وجه الخصوص، قدمت دراسات الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة شرحًا بدقة على المستوى الذري لتعطيل الغشاء بواسطة الببتيدات المضادة للميكروبات. [23] [24] في السنوات الأخيرة، تم استخدام علم البلورات بالأشعة السينية لتحديد التفاصيل الذرية لكيفية تمزق عائلة الديفينسينات النباتية للأغشية من خلال تحديد الفسفوليبيدات الرئيسية في أغشية خلايا العامل الممرض. [25] [26] يُعتقد أن الديفينسينات البشرية تعمل من خلال آلية مماثلة، تستهدف الدهون في غشاء الخلية كجزء من وظيفتها. في الواقع، ثبت الآن أن بيتا ديفينسين 2 البشري يقتل الفطريات المسببة للأمراض المبيضات البيضاء من خلال التفاعلات مع الفسفوليبيدات المحددة. [27] من وجهة نظر حسابية، يمكن لمحاكاة ديناميكيات الجزيئات أن توفر معلومات مفصلة حول بنية وديناميكيات تفاعلات الببتيد والغشاء، بما في ذلك التوجه والتكوين وإدخال الببتيد في الغشاء، بالإضافة إلى تفاعلات الببتيد المحددة مع الدهون والأيونات والمذيبات. [28]

طُرق التطبيقات
المجهر لتصور تأثيرات الببتيدات المضادة للميكروبات على الخلايا الميكروبية
مطيافية الانبعاث الذري للكشف عن فقدان البوتاسيوم داخل الخلايا (مؤشر على تعرض سلامة الغشاء البكتيري للخطر)
الأصباغ الفلورية لقياس قدرة الببتيدات المضادة للميكروبات على نفاذية الحويصلات الغشائية
تكوين قناة الأيونات لتقييم تكوين واستقرار المسام المستحثة بالببتيد المضاد للميكروبات
ازدواجية اللون الدائرية وازدواجية اللون الدائرية الموجهة لقياس اتجاه وبنية ثانوية لببتيد مضاد للميكروبات مرتبط بطبقة ثنائية من الدهون
قياس التداخل بالاستقطاب المزدوج لقياس الآليات المختلفة للببتيدات المضادة للميكروبات
مطيافية الرنين المغناطيسي النووي في الحالة الصلبة لقياس البنية الثانوية والتوجه واختراق الببتيدات المضادة للميكروبات إلى الطبقات الدهنية الثنائية في الحالة البلورية السائلة ذات الصلة بيولوجيًا
حيود النيوترون والأشعة السينية لقياس أنماط حيود المسام المستحثة بالببتيد داخل الأغشية في الطبقات المتعددة الموجهة أو السوائل
محاكاة الديناميكية الجزيئية لدراسة السلوك الجزيئي والبحث عن تفاعلات محددة بين الببتيد والدهون
مطيافية الكتلة لقياس الاستجابة البروتينية للكائنات الحية الدقيقة للببتيدات المضادة للميكروبات

البحث والاستخدام العلاجي

تم استخدام الببتيدات المضادة للميكروبات كعوامل علاجية؛ ويقتصر استخدامها عمومًا على الإعطاء الوريدي أو التطبيقات الموضعية نظرًا لقصر عمر النصف لها. اعتبارًا من يناير 2018، كانت الببتيدات المضادة للميكروبات التالية قيد الاستخدام السريري: [29]

نشاط يتجاوز الوظائف المضادة للبكتيريا

وقد لوحظ أن AMPs لها وظائف أخرى غير قتل البكتيريا والفطريات. وتشمل هذه الأنشطة تأثيرات مضادة للفيروسات، ولكنها تلعب أيضًا أدوارًا في دفاع المضيف مثل وظائف مضادة للسرطان وأدوار في علم الأعصاب. [30] وقد أدى هذا إلى حركة لإعادة تسمية AMPs باسم "ببتيدات دفاع المضيف" لتشمل النطاق الواسع من الأنشطة التي يمكن أن تقوم بها AMPs. [31]

خصائص مضادة للسرطان

بعض السيكروبينات (مثل السيكروبين أ، والسيكروبين ب) لها خصائص مضادة للسرطان وتسمى ببتيدات مضادة للسرطان (ACPs). [32] : 3  تمت دراسة الببتيدات المضادة للسرطان الهجينة القائمة على السيكروبين أ لخصائصها المضادة للسرطان. [32] : 7.1  يمنع ديفينسين ذبابة الفاكهة نمو الورم، ويُشتبه في ارتباطه بخلايا الورم بسبب تعديلات غشاء الخلية الشائعة في معظم خلايا السرطان، مثل التعرض للفوسفاتيديل سيرين . [33]

خصائص المضادات الحيوية

يمكن لـ Cecropin A تدمير الخلايا الإشريكية القولونية المسببة للأمراض البولية (UPEC) المكونة للأغشية الحيوية العوالقية والساكنة ، إما بمفرده أو عند دمجه مع حمض الناليديكسيك المضاد الحيوي ، مما يؤدي إلى القضاء على العدوى بشكل تآزري في الجسم الحي (في الحشرة المضيفة Galleria mellonella ) دون سمية خلوية خارج الهدف. تتضمن آلية العمل متعددة الأهداف نفاذية الغشاء الخارجي تليها عملية تعطيل الأغشية الحيوية الناتجة عن تثبيط نشاط مضخة التدفق والتفاعلات مع الأحماض النووية خارج الخلية وداخلها. [34]

أبحاث أخرى

في الآونة الأخيرة، أجريت بعض الأبحاث لتحديد الببتيدات المضادة للميكروبات المحتملة من بدائيات النوى، [35] والكائنات المائية مثل الأسماك، [36] [37] والرخويات، [38] وأحاديات المسلك مثل النضناض. [39] [40]

انتقائية

في المنافسة بين الخلايا البكتيرية والخلايا المضيفة مع الببتيدات المضادة للميكروبات، تتفاعل الببتيدات المضادة للميكروبات بشكل تفضيلي مع الخلية البكتيرية إلى الخلايا الثديية، مما يمكنها من قتل الكائنات الحية الدقيقة دون أن تكون سامة بشكل كبير للخلايا الثديية. [41]

فيما يتعلق بالخلايا السرطانية ، فإنها تفرز أيضًا ببتيدات مضادة للميكروبات البشرية بما في ذلك الديفينسين ، وفي بعض الحالات، يُقال إنها أكثر مقاومة من الخلايا الطبيعية المحيطة. لذلك، لا يمكننا أن نستنتج أن الانتقائية تكون عالية دائمًا ضد الخلايا السرطانية. [42] [43]

عوامل

هناك بعض العوامل التي ترتبط ارتباطًا وثيقًا بخاصية الانتقائية للببتيدات المضادة للميكروبات، ومن بينها الخاصية الكاتيونية التي تساهم بشكل أكبر. نظرًا لأن سطح الأغشية البكتيرية مشحون بشحنة سالبة أكثر من الخلايا الثديية، فإن الببتيدات المضادة للميكروبات ستظهر تقاربًا مختلفًا تجاه الأغشية البكتيرية وأغشية الخلايا الثديية. [44]

بالإضافة إلى ذلك، هناك أيضًا عوامل أخرى تؤثر على الانتقائية. من المعروف أن الكوليسترول منتشر بشكل واسع في أغشية الخلايا الثديية كعامل تثبيت للغشاء ولكنه غائب في أغشية الخلايا البكتيرية (باستثناء عندما يتم عزله بواسطة H. pylori )؛ [45] كما أن وجود هذه الكوليسترول سيقلل عمومًا من أنشطة الببتيدات المضادة للميكروبات، إما بسبب تثبيت الطبقة الدهنية الثنائية أو بسبب التفاعلات بين الكوليسترول والببتيد. لذا فإن الكوليسترول في الخلايا الثديية سيحمي الخلايا من هجوم الببتيدات المضادة للميكروبات. [46]

بالإضافة إلى ذلك، من المعروف جيدًا أن الجهد عبر الغشاء يؤثر على تفاعلات الببتيد والدهون. [47] هناك جهد عبر الغشاء سلبي داخلي موجود من الوريقة الخارجية إلى الوريقة الداخلية لأغشية الخلايا، وسيعمل هذا الجهد عبر الغشاء السلبي الداخلي على تسهيل نفاذية الغشاء ربما عن طريق تسهيل إدخال الببتيدات المشحونة إيجابيا في الأغشية. وبالمقارنة، فإن الجهد عبر الغشاء للخلايا البكتيرية أكثر سلبية من تلك الموجودة في الخلايا الثديية الطبيعية، لذلك سيكون الغشاء البكتيري عرضة للهجوم من قبل الببتيدات المضادة للميكروبات المشحونة إيجابيا. [ بحاجة لمصدر ]

وبالمثل، يُعتقد أيضًا أن زيادة القوة الأيونية ، [46] والتي تقلل بشكل عام من نشاط معظم الببتيدات المضادة للميكروبات، تساهم جزئيًا في انتقائية الببتيدات المضادة للميكروبات عن طريق إضعاف التفاعلات الكهروستاتيكية المطلوبة للتفاعل الأولي.

الأساس الجزيئي لانتقائية الخلايا للببتيدات المضادة للميكروبات

الآلية

الأغشية الخلوية للبكتيريا غنية بالفوسفوليبيدات الحمضية ، مثل فوسفاتيديل جلسرين وكارديوليبين . [ 41] [48]

على النقيض من ذلك، يتكون الجزء الخارجي من أغشية النباتات والثدييات بشكل أساسي من الدهون بدون أي شحنات صافية حيث يتم عزل معظم الدهون ذات المجموعات الرأسية المشحونة سلبًا بشكل أساسي في الوريقة الداخلية للأغشية البلازمية. [44] وبالتالي في حالة الخلايا الثديية، تتكون الأسطح الخارجية للأغشية عادةً من فوسفاتيديل كولين الزويترويونيك والسفينغوميلين ، على الرغم من أن جزءًا صغيرًا من الأسطح الخارجية للغشاء يحتوي على بعض الغانغليوزيدات المشحونة سلبًا. لذلك، يلعب التفاعل الكاره للماء بين الوجه الكاره للماء لببتيدات مضادة للميكروبات برمائية والفوسفوليبيدات الزويترويونيك على سطح الخلية لأغشية الخلايا الثديية دورًا رئيسيًا في تكوين ارتباط الببتيد بالخلية. [49]

تم استخدام تداخل الاستقطاب المزدوج في المختبر لدراسة وتحديد كمية الارتباط بالمجموعة الرأسية، والإدخال في الطبقة الثنائية، وتكوين المسام والتمزق النهائي للغشاء. [50] [51]

يتحكم

لقد تم بذل الكثير من الجهود في التحكم في انتقائية الخلايا. على سبيل المثال، بُذلت محاولات لتعديل وتحسين المعلمات الفيزيائية والكيميائية للببتيدات للتحكم في الانتقائية، بما في ذلك الشحنة الصافية، واللولبية ، وكراهية الماء لكل بقايا (H)، والعزم الكاره للماء (μ) والزاوية التي يحددها وجه الحلزون القطبي المشحون إيجابيا (Φ). [47] يُعتقد أن آليات أخرى مثل إدخال الأحماض الأمينية D والأحماض الأمينية المفلورة في الطور الكاره للماء تعمل على كسر البنية الثانوية وبالتالي تقليل التفاعل الكاره للماء مع الخلايا الثديية. كما وجد أن استبدال Pro→Nlys في الببتيدات المضادة للميكروبات ذات الدوران β المحتوية على Pro كانت استراتيجية واعدة لتصميم ببتيدات مضادة للميكروبات انتقائية للخلايا البكتيرية الصغيرة الجديدة مع آليات عمل داخل الخلايا. [52] وقد اقترح أن الارتباط المباشر للماجينين بسطح الركيزة يقلل من ارتباط الخلايا غير المحددة ويؤدي إلى تحسين حد الكشف للخلايا البكتيرية مثل السالمونيلا والإشريكية القولونية . [53]

مقاومة البكتيريا

تستخدم البكتيريا استراتيجيات مقاومة مختلفة لتجنب قتل الببتيد المضاد للميكروبات. [13]

  • تغير بعض الكائنات الحية الدقيقة الشحنات السطحية الصافية. تنقل المكورات العنقودية الذهبية حمض D-alanine من السيتوبلازم إلى حمض التيكويك السطحي الذي يقلل من الشحنة السالبة الصافية عن طريق إدخال مجموعات أمينية أساسية. [54] كما تعدل المكورات العنقودية الذهبية أغشيتها الأنيونية عبر MprF باستخدام L-lysine، مما يزيد من الشحنة الصافية الموجبة. [54]
  • يمكن الحد من تفاعل الببتيدات المضادة للميكروبات مع الأهداف الغشائية بواسطة كبسولة السكاريد المتعددة لـ Klebsiella pneumoniae . [55]
  • تقلل أنواع السالمونيلا من سيولة غشاءها الخارجي عن طريق زيادة التفاعلات الكارهة للماء بين عدد متزايد من ذيول أسيل الليبيد أ عن طريق إضافة ميريستات إلى الليبيد أ مع 2-هيدروكسي ميريستات وتكوين الليبيد أ المؤسل سباعي الأسيل عن طريق إضافة البالميتات. يُعتقد أن زيادة اللحظة الكارهة للماء تؤخر أو تلغي إدخال الببتيد المضاد للميكروبات وتكوين المسام. تخضع البقايا للتغيير في بروتينات الغشاء. في بعض البكتيريا سلبية الجرام، يرتبط التغيير في إنتاج بروتينات الغشاء الخارجي بمقاومة القتل بواسطة الببتيدات المضادة للميكروبات. [56]
  • تنقل البكتيريا المستدمية النزلية غير القابلة للتصنيف جزيئات AMP إلى داخل الخلية، حيث تتحلل. علاوة على ذلك، تعمل البكتيريا المستدمية النزلية على إعادة تشكيل أغشيتها لتبدو كما لو أن البكتيريا تعرضت بالفعل لهجوم ناجح من جزيئات AMP، مما يحميها من التعرض لهجوم من جزيئات AMP أخرى. [57]
  • تستورد ناقلات الكاسيت المرتبطة بـ ATP الببتيدات المضادة للميكروبات، وتصدر مضخة تدفق انقسام الخلايا المقاومة للعقد الببتيدات المضادة للميكروبات. [58] وقد ارتبط كلا الناقلين بمقاومة الببتيدات المضادة للميكروبات
  • تنتج البكتيريا إنزيمات بروتينية، والتي قد تؤدي إلى تحلل الببتيدات المضادة للميكروبات مما يؤدي إلى مقاومتها. [59]
  • ترتبط حويصلات الغشاء الخارجي التي تنتجها البكتيريا سلبية الجرام بالببتيدات المضادة للميكروبات وتعزلها بعيدًا عن الخلايا، وبالتالي تحمي الخلايا. [60] ومن المعروف أيضًا أن حويصلات الغشاء الخارجي تحتوي على العديد من البروتيازات والببتيدازات والإنزيمات التحللية الأخرى، والتي قد يكون لها دور في تحلل جزيئات الببتيد والأحماض النووية خارج الخلية، والتي إذا سُمح لها بالوصول إلى الخلايا البكتيرية فقد تكون خطيرة على الخلايا.
  • كانت إشارات Cyclic-di-GMP أيضًا متورطة في تنظيم مقاومة الببتيد المضاد للميكروبات في Pseudomonas aeruginosa [61]

في حين تُظهِر هذه الأمثلة أن المقاومة يمكن أن تتطور بشكل طبيعي، إلا أن هناك قلقًا متزايدًا من أن استخدام نسخ صيدلانية من الببتيدات المضادة للميكروبات يمكن أن يجعل المقاومة تحدث بشكل متكرر وأسرع. في بعض الحالات، يمكن أن تؤدي مقاومة هذه الببتيدات المستخدمة كدواء لعلاج المشاكل الطبية إلى مقاومة، ليس فقط للتطبيق الطبي للببتيدات، ولكن أيضًا للوظيفة الفسيولوجية لتلك الببتيدات. [62] [63]

إن نهج "حصان طروادة" لحل هذه المشكلة يستغل الحاجة الفطرية للحديد لدى مسببات الأمراض. ويتم "تهريب" المضادات الحيوية إلى داخل مسببات الأمراض عن طريق ربطها بالسيدروفورات من أجل النقل. ورغم بساطة هذا النهج، فقد استغرق الأمر عقوداً عديدة من العمل لإنجاز العقبة الصعبة المتمثلة في نقل المضادات الحيوية عبر الأغشية الخلوية لمسببات الأمراض. وقد تمت مراجعة الدروس المستفادة من نجاحات وإخفاقات الأدوية المقترنة بالسيدروفورات والتي تم تقييمها أثناء تطوير عوامل جديدة باستخدام نهج "حصان طروادة". [64]

أمثلة

ذباب الفاكهة المصاب بالبكتيريا المنتجة للبروتين الفلوري الأخضر. الذباب ذو العيون الحمراء الذي يفتقر إلى جينات الببتيد المضادة للميكروبات يكون عرضة للإصابة بالعدوى، في حين أن الذباب ذو العيون البيضاء لديه استجابة مناعية من النوع البري.

يتم إنتاج الببتيدات المضادة للميكروبات بواسطة الأنواع الموجودة في جميع أنحاء شجرة الحياة، بما في ذلك:

لقد زادت الأبحاث في السنوات الأخيرة لتطوير محاكيات هندسية اصطناعية للببتيدات المضادة للميكروبات مثل SNAPPs ، ويرجع ذلك جزئيًا إلى التكلفة الباهظة لإنتاج AMPs المشتقة من الطبيعة. [69] ومن الأمثلة على ذلك الببتيد الكاتيوني الوجهي C18G، والذي تم تصميمه من المجال الطرفي C لعامل الصفائح الدموية البشري الرابع. [70] حاليًا، الببتيد المضاد للميكروبات الأكثر استخدامًا هو نيسين ؛ كونه الببتيد المضاد للميكروبات الوحيد المعتمد من إدارة الغذاء والدواء ، فإنه يستخدم عادةً كمواد حافظة اصطناعية. [71]

المعلوماتية الحيوية

توجد العديد من قواعد البيانات المعلوماتية الحيوية لتصنيف الببتيدات المضادة للميكروبات.قاعدة بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات ( APD ) هي قاعدة البيانات الأصلية والنموذجية للببتيدات المضادة للميكروبات (https://aps.unmc.edu). بناءً على APD، تم أيضًا إنشاء قواعد بيانات أخرى، بما في ذلك ADAM (قاعدة بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات)، [72] BioPD (قاعدة بيانات الببتيدات النشطة بيولوجيًا)، CAMP (مجموعة من تسلسلات وهياكل الببتيدات المضادة للميكروبات)، [73] DBAASP (قاعدة بيانات النشاط المضاد للميكروبات وهيكل الببتيدات)، DRAMP (مستودع بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات) مرحبًا بك في قاعدة بيانات Dramp، [74] وLAMP (ربط AMP).

يمكن تقسيم قواعد بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات إلى فئتين على أساس مصدر الببتيدات التي تحتوي عليها، كقواعد بيانات محددة وقواعد بيانات عامة. تحتوي قواعد البيانات هذه على أدوات مختلفة لتحليل الببتيدات المضادة للميكروبات والتنبؤ بها. على سبيل المثال، يحتوي APD على واجهة حسابية مستخدمة على نطاق واسع. كما يوفر روابط للعديد من الأدوات الأخرى. يحتوي CAMP على توقع AMP وحاسبة الميزات والبحث BLAST وClustalW وVAST وPRATT وHelical wheel وما إلى ذلك. بالإضافة إلى ذلك، يسمح ADAM للمستخدمين بالبحث أو تصفح علاقات تسلسل AMP والبنية. غالبًا ما تشمل الببتيدات المضادة للميكروبات مجموعة واسعة من الفئات مثل الببتيدات المضادة للفطريات والبكتيريا ومضادات السل.

dbAMP: [75] يوفر منصة عبر الإنترنت لاستكشاف الببتيدات المضادة للميكروبات ذات الأنشطة الوظيفية والخصائص الفيزيائية والكيميائية على بيانات النسخ والبروتينات. dbAMP هو مورد عبر الإنترنت يتناول مواضيع مختلفة مثل التعليقات التوضيحية للببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) بما في ذلك معلومات التسلسل والأنشطة المضادة للميكروبات والتعديلات بعد الترجمة (PTMs) والتصور البنيوي والفعالية المضادة للميكروبات والأنواع المستهدفة ذات التركيز المثبط الأدنى (MIC) والخصائص الفيزيائية والكيميائية أو تفاعلات AMP والبروتين. [ بحاجة لمصدر ]

تسمح أدوات مثل PeptideRanker، [76] و PeptideLocator، [77] وAntiMPmod [78] [79] بالتنبؤ بالببتيدات المضادة للميكروبات بينما تم تطوير أدوات أخرى للتنبؤ بالأنشطة المضادة للفطريات والسل. [80] [81]

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ Ageitos JM, Sánchez-Pérez A, Calo-Mata P, Villa TG (يونيو 2017). "الببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs): المركبات القديمة التي تمثل أسلحة جديدة في مكافحة البكتيريا". علم الأدوية الكيميائية الحيوية . 133 (6): 117-138. doi :10.1016/j.bcp.2016.09.018. PMID  27663838.
  2. ^ ab Reddy KV, Yedery RD, Aranha C (ديسمبر 2004). "الببتيدات المضادة للميكروبات: المقدمات والوعود". المجلة الدولية للعوامل المضادة للميكروبات . 24 (6): 536-547. doi :10.1016/j.ijantimicag.2004.09.005. PMID  15555874.
  3. ^ ab Yeaman MR, Yount NY (مارس 2003). "آليات عمل الببتيد المضاد للميكروبات ومقاومته". المراجعات الدوائية . 55 (1): 27–55. doi :10.1124/pr.55.1.2. PMID  12615953. S2CID  6731487.
  4. ^ Papagianni M (سبتمبر 2003). "الببتيدات المصنعة عن طريق الريبوسوم ذات الخصائص المضادة للميكروبات: التخليق الحيوي والبنية والوظيفة والتطبيقات". Biotechnology Advances . 21 (6): 465–499. doi :10.1016/S0734-9750(03)00077-6. PMID  14499150.
  5. ^ سيتارام ن، ناجاراج ر (2002). "ببتيدات مضادة للميكروبات للدفاع عن المضيف: أهمية البنية للنشاط". التصميم الدوائي الحالي . 8 (9): 727-742. doi :10.2174/1381612023395358. PMID  11945168.
  6. ^ Dürr UH, Sudheendra US, Ramamoorthy A (سبتمبر 2006). "LL-37, the only human member of the cathelicidin family of antimicrobial peptides". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1758 (9): 1408–1425. doi : 10.1016/j.bbamem.2006.03.030 . PMID  16716248.
  7. ^ Dhople V, Krukemeyer A, Ramamoorthy A (سبتمبر 2006). "الببتيد المضاد للبكتيريا بيتا ديفينسين-3 البشري ذو الوظائف البيولوجية المتعددة". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1758 (9): 1499–1512. doi :10.1016/j.bbamem.2006.07.007. PMID  16978580. S2CID  36461159.
  8. ^ Hancock RE, Rozek A (يناير 2002). "دور الأغشية في أنشطة الببتيدات الكاتيونية المضادة للميكروبات". رسائل علم الأحياء الدقيقة FEMS . 206 (2): 143–149. doi : 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11000.x . PMID  11814654.
  9. ^ Varkey J, Singh S, Nagaraj R (نوفمبر 2006). "النشاط المضاد للبكتيريا للببتيدات الخطية التي تمتد عبر نطاق صفائح بيتا الطرفية الكربوكسيلية للبروتينات الدفاعية المفصلية". Peptides . 27 (11): 2614–2623. doi :10.1016/j.peptides.2006.06.010. PMID  16914230. S2CID  21104756.
  10. ^ ab Nguyen LT, Haney EF, Vogel HJ (سبتمبر 2011). "النطاق المتوسع لهياكل الببتيد المضادة للميكروبات وأساليب عملها". Trends in Biotechnology . 29 (9): 464–472. doi :10.1016/j.tibtech.2011.05.001. PMID  21680034.
  11. ^ ab O'Driscoll NH, Labovitiadi O, Cushnie TP, Matthews KH, Mercer DK, Lamb AJ (مارس 2013). "إنتاج وتقييم تركيبة رقاقة تحتوي على ببتيد مضاد للميكروبات للاستخدام الموضعي". علم الأحياء الدقيقة الحالي . 66 (3): 271-278. doi :10.1007/s00284-012-0268-3. PMID  23183933. S2CID  18671683.
  12. ^ Hein KZ، Takahashi H، Tsumori T، Yasui Y، Nanjoh Y، Toga T، et al. (أكتوبر 2015). "الصدفية المخفضة بالديسلفيد هي مبيد فطريات واسع الطيف يسبب موت الخلايا المبرمج لدى البشر". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 112 (42): 13039–13044. رمز Bibcode : 2015PNAS..11213039H. doi : 10.1073/pnas.1511197112 . PMC 4620902. PMID  26438863 . 
  13. ^ abc Brogden KA (مارس 2005). "الببتيدات المضادة للميكروبات: مُشكِّلات مسام أم مُثبطات أيضية في البكتيريا؟". مراجعات الطبيعة. علم الأحياء الدقيقة . 3 (3): 238-250. doi :10.1038/nrmicro1098. PMID  15703760. S2CID  23625167.
  14. ^ Hirst DJ, Lee TH, Swann MJ, Unabia S, Park Y, Hahm KS, Aguilar MI (أبريل 2011). "تأثير بنية سلسلة الأسيل وحالة طور الطبقة الثنائية على ارتباط واختراق الطبقة الثنائية الدهنية المدعومة بواسطة HPA3". مجلة الفيزياء الحيوية الأوروبية . 40 (4): 503-514. doi :10.1007/s00249-010-0664-1. PMID  21222117. S2CID  22514308.
  15. ^ Lee TH, Heng C, Swann MJ, Gehman JD, Separovic F, Aguilar MI (أكتوبر 2010). "التحليل الكمي في الوقت الحقيقي لاضطراب الدهون بواسطة الأورين 1.2 أثناء امتصاص الغشاء وزعزعة استقراره وانحلاله". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1798 (10): 1977–1986. doi : 10.1016/j.bbamem.2010.06.023 . PMID  20599687.
  16. ^ Turnidge JD, Bell JM (1996). "اختبار حساسية مضادات الميكروبات في الوسائط السائلة". في Lorian V (محرر). المضادات الحيوية في الطب المخبري (الطبعة الرابعة). بالتيمور، ماريلاند: ويليامز وويلكينز. ص 52-111. ISBN 978-0-683-05169-8. اللجنة الوطنية للسلامة والمعايير المعملية (NCLSS)
  17. ^ Wang CK, Shih LY, Chang KY (نوفمبر 2017). "تحليل واسع النطاق للأنشطة المضادة للميكروبات فيما يتعلق بالتفاعلية والشحنة يكشف عن توصيف جديد للببتيدات المضادة للميكروبات". Molecules . 22 (11): 2037. doi : 10.3390/molecules22112037 . PMC 6150348. PMID  29165350 . 
  18. ^ Hunter HN, Fulton DB, Ganz T, Vogel HJ (أكتوبر 2002). "البنية المحلولية للهبسيدين البشري، وهو هرمون ببتيدي ذو نشاط مضاد للميكروبات يشارك في امتصاص الحديد وداء ترسب الأصبغة الدموية الوراثي". مجلة الكيمياء الحيوية . 277 (40): 37597–37603. doi : 10.1074/jbc.M205305200 . PMID  12138110.
  19. ^ Kudrimoti M, Curtis A, Azawi S, Worden F, Katz S, Adkins D, et al. (ديسمبر 2016). "Dusquetide: منظم دفاع فطري جديد يُظهِر انخفاضًا كبيرًا ومتسقًا في مدة التهاب الغشاء المخاطي الفموي في البيانات السريرية قبل السريرية ودراسة سريرية عشوائية خاضعة للتحكم الوهمي في المرحلة 2أ". مجلة التكنولوجيا الحيوية . 239 : 115-125. doi : 10.1016/j.jbiotec.2016.10.010 . PMID  27746305.
  20. ^ ab Guilhelmelli F, Vilela N, Albuquerque P, Derengowski L, Silva-Pereira I, Kyaw CM (ديسمبر 2013). "تحديات تطوير المضادات الحيوية: الآليات المختلفة لعمل الببتيدات المضادة للميكروبات ومقاومة البكتيريا". Frontiers in Microbiology . 4 (4): 353. doi : 10.3389/fmicb.2013.00353 . PMC 3856679. PMID  24367355 . 
  21. ^ Sengupta D, Leontiadou H, Mark AE, Marrink SJ (2008-10-01). "المسام الحلقية التي تشكلها الببتيدات المضادة للميكروبات تظهر اضطرابًا كبيرًا". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1778 (10): 2308–2317. doi : 10.1016/j.bbamem.2008.06.007 . ISSN  0005-2736. PMID  18602889. S2CID  19387026.
  22. ^ Balatti GE, Martini MF, Pickholz M (2018-07-17). "نهج دقيق لدراسة تفاعلات الببتيدات المضادة للميكروبات aurein 1.2 و maculatin 1.1 مع مخاليط الدهون POPG/POPE". مجلة النمذجة الجزيئية . 24 (8): 208. doi :10.1007/s00894-018-3747-z. ISSN  0948-5023. PMID  30019106. S2CID  51678964.
  23. ^ Hallock KJ, Lee DK, Ramamoorthy A (مايو 2003). "MSI-78، وهو نظير لببتيدات ماجينين المضادة للميكروبات، يعطل بنية الطبقة الدهنية الثنائية عبر إجهاد الانحناء الإيجابي". مجلة بيوفيزيائية . 84 (5): 3052-3060. رمز Bibcode : 2003BpJ....84.3052H. doi : 10.1016 /S0006-3495(03)70031-9 . PMC 1302867. PMID  12719236. 
  24. ^ Henzler Wildman KA, Lee DK, Ramamoorthy A (يونيو 2003). "Mechanism of lipid bilayer breaking by the human antimicrobial peptide, LL-37". الكيمياء الحيوية . 42 (21): 6545–6558. doi :10.1021/bi0273563. PMID  12767238.
  25. ^ Järvå M, Lay FT, Phan TK, Humble C, Poon IK, Bleackley MR, et al. (مايو 2018). "بنية الأشعة السينية لمجمع تمزق غشاء مضاد للميكروبات يشبه السجادة". Nature Communications . 9 (1): 1962. Bibcode :2018NatCo...9.1962J. doi : 10.1038/s41467-018-04434-y . PMC 5958116. PMID  29773800 . 
  26. ^ Poon IK, Baxter AA, Lay FT, Mills GD, Adda CG, Payne JA, et al. (أبريل 2014). "التكوين الأوليغوميري للديفينسين بوساطة الفوسفوإينوزيتيد يحفز انحلال الخلايا". eLife . 3 : e01808. doi : 10.7554/elife.01808 . PMC 3968744. PMID  24692446 . 
  27. ^ Järvå M، Phan TK، Lay FT، Caria S، Kvansakul M، Hulett MD (يوليو 2018). "الإنسان β-defensin 2 يقتل المبيضات البيضاء من خلال نفاذية الغشاء الفوسفاتيديلينوسيتول 4،5-بيسفوسفات". تقدم العلوم . 4 (7): eaat0979. بيب كود :2018SciA....4..979J. دوى : 10.1126/sciadv.aat0979 . بمك 6059731 . بميد  30050988. 
  28. ^ Balatti GE, Ambroggio EE, Fidelio GD, Martini MF, Pickholz M (أكتوبر 2017). "التفاعل التفاضلي للببتيدات المضادة للميكروبات مع هياكل الدهون التي تمت دراستها بواسطة محاكاة ديناميكيات الجزيئات ذات الحبيبات الخشنة". الجزيئات . 22 (10): 1775. doi : 10.3390/molecules22101775 . PMC 6151434. PMID  29053635 . 
  29. ^ Gomes B, Augusto MT, Felício MR, Hollmann A, Franco OL, Gonçalves S, Santos NC (9 يناير 2018). "تصميم ببتيدات نشطة محسنة للنهج العلاجية ضد الأمراض المعدية". Biotechnology Advances . 36 (2): 415–429. doi :10.1016/j.biotechadv.2018.01.004. hdl : 11336/98840 . PMID  29330093. S2CID  3873934.
  30. ^ هانسون إم إيه، ليميتر بي (فبراير 2020). "رؤى جديدة حول وظيفة الببتيد المضاد للميكروبات في دفاع المضيف وما بعده". الرأي الحالي في علم المناعة . 62 : 22-30. doi : 10.1016/j.coi.2019.11.008 . hdl : 10871/133705 . PMID  31835066.
  31. ^ Mookherjee N, Anderson MA, Haagsman HP, Davidson DJ (مايو 2020). "ببتيدات الدفاع المضيفة المضادة للميكروبات: الوظائف والإمكانات السريرية" (PDF) . مراجعات الطبيعة. اكتشاف الأدوية . 19 (5): 311-332. doi :10.1038/s41573-019-0058-8. hdl : 20.500.11820/1ec38809-e8f2-4684-8bbb-e908ecb5c66e . PMID  32107480. S2CID  211526624.
  32. ^ ab Hoskin DW, Ramamoorthy A (فبراير 2008). "دراسات حول الأنشطة المضادة للسرطان للببتيدات المضادة للميكروبات". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1778 (2): 357–375. doi :10.1016/j.bbamem.2007.11.008. PMC 2238813. PMID  18078805 . 
  33. ^ Parvy JP، Yu Y، Dostalova A، Kondo S، Kurjan A، Bulet P، وآخرون. (يوليو 2019). "يتعاون الببتيد المضاد للميكروبات ديفينسين مع عامل نخر الورم لدفع موت الخلايا السرطانية في ذبابة الفاكهة". eLife . 8 . doi : 10.7554/eLife.45061 . PMC 6667213 . PMID  31358113. 
  34. ^ Kalsy M، Tonk M، Hardt M، Dobrindt U، Zdybicka-Barabas A، Cytrynska M، وآخرون. (فبراير 2020). "الببتيد المضاد للميكروبات للحشرات cecropin A يعطل الأغشية الحيوية المسببة للأمراض البولية لـ Escherichia coli". npj Biofilms and Microbiomes . 6 (1): 6. doi : 10.1038 /s41522-020-0116-3 . PMC 7016129. PMID  32051417. 
  35. ^ حسن م، خوس م، نيس آي إف، ديب دي بي، لطفيبور ف (أكتوبر 2012). "الببتيدات المضادة للميكروبات الطبيعية من البكتيريا: الخصائص والتطبيقات المحتملة لمحاربة مقاومة المضادات الحيوية". مجلة علم الأحياء الدقيقة التطبيقية . 113 (4): 723-736. doi :10.1111/j.1365-2672.2012.05338.x. PMID  22583565. S2CID  19503463.
  36. ^ Kumaresan V, Bhatt P, Ganesh MR, Harikrishnan R, Arasu M, Al-Dhabi NA, et al. (ديسمبر 2015). "ببتيد مضاد للميكروبات جديد مشتق من إنزيم الليزوزيم من نوع سمكة الأوز يعطل غشاء السالمونيلا المعوية". علم المناعة الجزيئي . 68 (2 جزء ب): 421-433. doi :10.1016/j.molimm.2015.10.001. PMID  26477736.
  37. ^ Arasu A, Kumaresan V, Ganesh MR, Pasupuleti M, Arasu MV, Al-Dhabi NA, Arockiaraj J (يونيو 2017). "النشاط القاتل للبكتيريا لببتيد ربط الغشاء المشتق من الجالاكتين 4 في الأسماك والمُوسوم بالأوليغوتريبتوفان". علم المناعة التنموي والمقارنة . 71 : 37–48. doi :10.1016/j.dci.2017.01.019. PMID  28126555. S2CID  22374102.
  38. ^ Arockiaraj J, Chaurasia MK, Kumaresan V, Palanisamy R, Harikrishnan R, Pasupuleti M, Kasi M (أبريل 2015). "الليكتين الرابط للمانوز في Macrobrachium rosenbergii: تخليق ببتيدات MrMBL-N20 ​​وMrMBL-C16 وتوصيفها المضاد للميكروبات، وتحليل المعلومات الحيوية والتعبير الجيني النسبي". Fish & Shellfish Immunology . 43 (2): 364–374. doi :10.1016/j.fsi.2014.12.036. PMID  25575476.
  39. ^ Somasekhar M (24 أبريل 2019). "يمكن أن يكون حليب آكل النمل الشوكي بديلاً للمضادات الحيوية" . BusinessLine . Chennai, India: Kasturi & Sons Ltd. تم الاسترجاع في 17 يناير 2021 .
  40. ^ "حليب الثدييات التي تبيض قد يساعد في تطوير مضادات حيوية جديدة". ديكان هيرالد . الهند: مطابع ميسور. وكالة أنباء برس تراست الهندية. 25 أبريل 2019. تم الاسترجاع في 17 يناير 2021 .
  41. ^ ab Matsuzaki K (أغسطس 2009). "التحكم في انتقائية الخلايا للببتيدات المضادة للميكروبات". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes (مقالة مراجعة). 1788 (8): 1687–1692. doi :10.1016/j.bbamem.2008.09.013. PMID  18952049.
  42. ^ Sawaki K, Mizukawa N, Yamaai T, Yoshimoto T, Nakano M, Sugahara T (2002). "تركيز عالي من بيتا ديفينسين-2 في سرطان الخلايا الحرشفية الفموي". أبحاث مكافحة السرطان . 22 (4): 2103-2107. PMID  12174890.
  43. ^ Kida-Takaoka S, Yamaai T, Mizukawa N, Murakami J, Iida S (نوفمبر 2014). "الخلايا المحيطة تؤثر على نمط التعبير الجيني للبيتا ديفينسينات البشرية في سرطان الخلايا الحرشفية في المختبر". أبحاث مكافحة السرطان . 34 (11): 6443-6449. PMID  25368244. تم الاسترجاع في 7 فبراير 2019 .
  44. ^ ab Hancock RE, Sahl HG (ديسمبر 2006). "الببتيدات المضادة للميكروبات ومضادات دفاع المضيف كإستراتيجيات علاجية جديدة مضادة للعدوى". Nature Biotechnology (مقالة مراجعة). 24 (12): 1551–1557. doi :10.1038/nbt1267. PMID  17160061. S2CID  22384207.
  45. ^ Zhang L, Xie J (سبتمبر 2023). "التخليق الحيوي والبنية والوظيفة البيولوجية لجلوكوزيد الكوليسترول في Helicobacter pylori: مراجعة". الطب (بالتيمور) . 102 (36): e34911. doi :10.1097/MD.0000000000034911. PMC 10489377. PMID  37682174 . 
  46. ^ ab Zasloff M (يناير 2002). "الببتيدات المضادة للميكروبات للكائنات متعددة الخلايا". مجلة نيتشر (مقالة مراجعة). 415 (6870): 389–395. Bibcode :2002Natur.415..389Z. doi :10.1038/415389a. PMID  11807545. S2CID  205028607.
  47. ^ ab Matsuzaki K, Sugishita K, Fujii N, Miyajima K (مارس 1995). "الأساس الجزيئي لانتقائية الغشاء للببتيد المضاد للميكروبات، ماجاينين ​​2". الكيمياء الحيوية . 34 (10): 3423-3429. doi :10.1021/bi00010a034. PMID  7533538.
  48. ^ Chou HT, Kuo TY, Chiang JC, Pei MJ, Yang WT, Yu HC, et al. (أغسطس 2008). "تصميم وتوليف الببتيدات المضادة للميكروبات الكاتيونية ذات النشاط المحسن والانتقائية ضد Vibrio spp". المجلة الدولية للعوامل المضادة للميكروبات . 32 (2): 130-138. doi :10.1016/j.ijantimicag.2008.04.003. PMID  18586467.
  49. ^ Tennessen JA (نوفمبر 2005). "التطور الجزيئي للببتيدات المضادة للميكروبات الحيوانية: الانتقاء الإيجابي المعتدل على نطاق واسع". مجلة علم الأحياء التطوري (مقالة مراجعة). 18 (6): 1387-1394. doi : 10.1111/j.1420-9101.2005.00925.x . PMID  16313451.
  50. ^ يو إل، قوه إل، دينغ جيه إل، هو بي، فنغ إس إس، بوبلويل جي، وآخرون. (فبراير 2009). "تفاعل الببتيد الاصطناعي المضاد للميكروبات مع الأغشية الدهنية". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - الأغشية الحيوية . 1788 (2): 333-344. دوى :10.1016/j.bbamem.2008.10.005. بميد  19013127.
  51. ^ Lee TH, Hall K, Mechler A, Martin L, Popplewell J, Ronan G, Aguilar MI (2009). "التصوير الجزيئي والتغيرات التوجهية للببتيدات المضادة للميكروبات في الأغشية". Peptides for Youth . Advances in Experimental Medicine and Biology. المجلد 611. ص 313-315. رمز Bibcode :2009peyo.book..313L. doi :10.1007/978-0-387-73657-0_140. ISBN 978-0-387-73656-3. PMID  19400207.
  52. ^ Zhu WL, Lan H, Park Y, Yang ST, Kim JI, Park IS, et al. (أكتوبر 2006). "تأثيرات استبدال بقايا الببتيد Pro → على انتقائية الخلايا وآلية العمل المضاد للبكتيريا لببتيد مضاد للميكروبات من نوع تريتربتيسين-أميد". الكيمياء الحيوية . 45 (43): 13007-13017. doi :10.1021/bi060487+. PMID  17059217.
  53. ^ Kulagina NV, Lassman ME, Ligler FS, Taitt CR (أكتوبر 2005). "الببتيدات المضادة للميكروبات للكشف عن البكتيريا في اختبارات المستشعرات الحيوية". الكيمياء التحليلية . 77 (19): 6504–6508. doi :10.1021/ac050639r. PMID  16194120.
  54. ^ ab Peschel A, Otto M, Jack RW, Kalbacher H, Jung G, Götz F (مارس 1999). "عدم تنشيط الأوبرون dlt في المكورات العنقودية الذهبية يمنح حساسية للديفينسينات والبروتيجرينات والببتيدات المضادة للميكروبات الأخرى". مجلة الكيمياء الحيوية . 274 (13): 8405-8410. doi : 10.1074/jbc.274.13.8405 . PMID  10085071.
  55. ^ Campos MA, Vargas MA, Regueiro V, Llompart CM, Albertí S, Bengoechea JA (December 2004). Weiser JN (ed.). "Capsule polysaccharide mediates bacterial resistant to antimicrobial peptides". Infection and Immunity . 72 (12): 7107–7114. doi :10.1128/IAI.72.12.7107-7114.2004. PMC 529140. PMID  15557634 . 
  56. ^ China B, N'Guyen BT, de Bruyere M, Cornelis GR (أبريل 1994). "دور YadA في مقاومة Yersinia enterocolitica لعملية البلعمة بواسطة كريات الدم البيضاء متعددة الأشكال البشرية". العدوى والمناعة . 62 (4): 1275-1281. doi :10.1128/IAI.62.4.1275-1281.1994. PMC 186269. PMID  8132334 . 
  57. ^ Shelton CL, Raffel FK, Beatty WL, Johnson SM, Mason KM (نوفمبر 2011). "استيراد بوساطة ناقل النسغ والتحلل اللاحق للببتيدات المضادة للميكروبات في Haemophilus". PLOS Pathogens . 7 (11): e1002360. doi : 10.1371/journal.ppat.1002360 . PMC 3207918. PMID  22072973 . 
  58. ^ Nikaido H (أكتوبر 1996). "مضخات تدفق متعددة الأدوية للبكتيريا سلبية الجرام". مجلة علم الجراثيم . 178 (20): 5853-5859. doi :10.1128/jb.178.20.5853-5859.1996. PMC 178438. PMID  8830678. 
  59. ^ Whitelock JM, Murdoch AD, Iozzo RV, Underwood PA (أبريل 1996). "تحلل البيرليكان المشتق من الخلايا البطانية البشرية وإطلاق عامل نمو الخلايا الليفية الأساسي المرتبط بواسطة ستروميليسين، وكولاجيناز، وبلازمين، وهيباراناز". مجلة الكيمياء الحيوية . 271 (17): 10079-10086. doi : 10.1074/jbc.271.17.10079 . PMID  8626565.
  60. ^ Kulkarni HM, Swamy C, Jagannadham MV (مارس 2014). "الخصائص الجزيئية والتحليل الوظيفي للحويصلات الغشائية الخارجية من البكتيريا القطبية الجنوبية Pseudomonas syringae تشير إلى استجابة محتملة للظروف البيئية". مجلة أبحاث البروتيوم . 13 (3): 1345-1358. doi :10.1021/pr4009223. PMID  24437924.
  61. ^ Chua SL, Tan SY, Rybtke MT, Chen Y, Rice SA, Kjelleberg S, et al. (مايو 2013). "Bis-(3'-5')-cyclic dimeric GMP ينظم مقاومة الببتيد المضاد للميكروبات في Pseudomonas aeruginosa". العوامل المضادة للميكروبات والعلاج الكيميائي . 57 (5): 2066–2075. doi :10.1128/AAC.02499-12. PMC 3632963. PMID 23403434  . 
  62. ^ Habets MG, Brockhurst MA (يونيو 2012). "قد تؤثر الببتيدات المضادة للميكروبات العلاجية على المناعة الطبيعية". رسائل علم الأحياء . 8 (3): 416-418. doi :10.1098/rsbl.2011.1203. PMC 3367763. PMID  22279153 . 
  63. ^ Bahar AA, Ren D (نوفمبر 2013). "الببتيدات المضادة للميكروبات". المستحضرات الصيدلانية . 6 (12): 1543–1575. doi : 10.3390/ph6121543 . PMC 3873676. PMID  24287494 . 
  64. ^ Gumienna-Kontecka E, Carver PL (2019). "الفصل 7. بناء حصان طروادة: مركبات عقارية مقترنة بالسيدروفور لعلاج الأمراض المعدية". في Sigel A, Freisinger E, Sigel RK, Carver PL (المحررون). المعادن الأساسية في الطب: الاستخدام العلاجي وسمية الأيونات المعدنية في العيادة . المجلد 19. برلين: de Gruyter GmbH. ص 181-202. doi :10.1515/9783110527872-013. ISBN 978-3-11-052691-2. PMID  30855108. S2CID  73727689. {{cite book}}: |journal=تم تجاهله ( مساعدة )
  65. ^ "الببتيدات المضادة للميكروبات الحشرية OPM". قاعدة بيانات اتجاهات البروتينات في الأغشية (OPM) .
  66. ^ شيمانوفسكي إف، بالاتي جي إي، أمبروجيو إي، هوغو آ، مارتيني إم إف، فيديليو جي دي، وآخرون. (يونيو 2019). "النشاط التفاضلي للببتيدات الحلزونية α-lytic على العصيات اللبنية والليبوسومات المشتقة من العصيات اللبنية". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - الأغشية الحيوية . 1861 (6): 1069–1077. دوى : 10.1016/j.bbamem.2019.03.004 . بميد  30878358.
  67. ^ "الببتيدات المضادة للميكروبات البرمائية". قاعدة بيانات توجهات البروتينات في الأغشية (OPM) .
  68. ^ Yang M, Zhang C, Zhang X, Zhang MZ, Rottinghaus GE, Zhang S (سبتمبر 2016). "تحليل البنية والوظيفة لـ Avian β-defensin-6 وβ-defensin-12: دور جسور الشحنة والثنائي الكبريتيد". BMC Microbiology . 16 (1): 210. doi : 10.1186/s12866-016-0828-y . PMC 5016922. PMID  27613063 . 
  69. ^ Niedermaier H (9 فبراير 2012). "المقلدات الاصطناعية للببتيدات المضادة للميكروبات: موجة جديدة من المضادات الحيوية". قسم الكيمياء . جامعة جورجيا. مؤرشف من الأصل في 28 أكتوبر 2016. تم الاسترجاع في 27 أكتوبر 2016 .
  70. ^ Kohn EM، Shirley DJ، Arotsky L، Picciano AM، Ridgway Z، Urban MW، وآخرون. (فبراير 2018). "دور السلاسل الجانبية الكاتيونية في النشاط المضاد للميكروبات لـ C18G". الجزيئات . 23 (2): 329. doi : 10.3390/molecules23020329 . PMC 6017431. PMID  29401708 . 
  71. ^ Shin JM، Gwak JW، Kamarajan P، Fenno JC، Rickard AH، Kapila YL (يونيو 2016). "التطبيقات الطبية الحيوية للنيسين". مجلة علم الأحياء الدقيقة التطبيقية . 120 (6): 1449-1465. دوى :10.1111/jam.13033. بمك 4866897 . بميد  26678028. 
  72. ^ Lee HT، Lee CC، Yang JR، Lai JZ، Chang KY (فبراير 2015). "تصنيف هيكلي واسع النطاق للببتيدات المضادة للميكروبات". BioMed Research International . 2015 : 475062. doi : 10.1155/2015/475062 . PMC 4426897. PMID  26000295 . 
  73. ^ Waghu FH, Gopi L, Barai RS, Ramteke P, Nizami B, Idicula-Thomas S (يناير 2014). "CAMP: مجموعة من تسلسلات وهياكل الببتيدات المضادة للميكروبات". Nucleic Acids Research . 42 (إصدار قاعدة البيانات): D1154–D1158. doi :10.1093/nar/gkt1157. PMC 3964954. PMID  24265220 . 
  74. ^ Shi GB, Kang XY, Dong FY, Liu YC, Zhu N (يناير 2022). "DRAMP 3.0: مستودع بيانات شامل معزز للببتيدات المضادة للميكروبات". Nucleic Acids Research . 50 (إصدار قاعدة البيانات): D488–D496. doi :10.1093/nar/gkab651. PMC 8728287. PMID  34390348 . 
  75. ^ Jhong JH, Chi YH, Li WC, Lin TH, Huang KY, Lee TY (يناير 2019). "dbAMP: مورد متكامل لاستكشاف الببتيدات المضادة للميكروبات ذات الأنشطة الوظيفية والخصائص الفيزيائية والكيميائية على بيانات النسخ والبروتينوم". Nucleic Acids Research . 47 (D1): D285–D297. doi :10.1093/nar/gky1030. PMC 6323920. PMID  30380085 . 
  76. ^ Mooney C, Haslam NJ, Pollastri G, Shields DC (8 أكتوبر 2012). "نحو الاكتشاف المحسن وتصميم الببتيدات الوظيفية: السمات المشتركة للفئات المتنوعة تسمح بالتنبؤ العام بالنشاط الحيوي". PLOS ONE . 7 (10): e45012. Bibcode :2012PLoSO...745012M. doi : 10.1371/journal.pone.0045012 . PMC 3466233. PMID  23056189 . 
  77. ^ Mooney C, Haslam NJ, Holton TA, Pollastri G, Shields DC (مايو 2013). "PeptideLocator: prediction of bioactive peptides in protein sequences". Bioinformatics . 29 (9): 1120–1126. doi : 10.1093/bioinformatics/btt103 . hdl : 10197/10121 . PMID  23505299.
  78. ^ Müller AT, Gabernet G, Hiss JA, Schneider G (سبتمبر 2017). "modlAMP: Python for antimicrobial peptides". Bioinformatics . 33 (17): 2753–2755. doi : 10.1093/bioinformatics/btx285 . hdl : 20.500.11850/206770 . PMID  28472272.
  79. ^ أجراوال ب، راجافا جي بي (26 أكتوبر 2018). "التنبؤ بإمكانية استخدام الببتيد المعدل كيميائيًا كمضاد للميكروبات من بنيته الثلاثية". فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 9 : 2551. doi : 10.3389/fmicb.2018.02551 . PMC 6212470. PMID  30416494 . 
  80. ^ أجراوال ب، بهالا س، تشودري ك، كومار ر، شارما م، راجافا جي بي (26 فبراير 2018). "نهج حاسوبي للتنبؤ بالببتيدات المضادة للفطريات". فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 9 : 323. doi : 10.3389/fmicb.2018.00323 . PMC 5834480. PMID  29535692 . 
  81. ^ Usmani SS, Bhalla S, Raghava GP (26 أغسطس 2018). " التنبؤ بالببتيدات المضادة للسل من معلومات التسلسل باستخدام مصنف المجموعة والميزات الهجينة". Frontiers in Pharmacology . 9 : 954. doi : 10.3389/fphar.2018.00954 . PMC 6121089. PMID  30210341. 
  • ADAM (قاعدة بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات) محفوظ في 2015-06-17 على موقع Wayback Machine على ntou.edu.tw
  • التنبؤ بالببتيدات المضادة للفطريات
  • AntiMPmod التنبؤ بإمكانية استخدام الببتيدات المعدلة كمضاد للميكروبات
  • مضادات الميكروبات + الكاتيونات + الببتيدات في المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ( MeSH)
  • التنبؤ بالببتيدات المضادة للسل باستخدام AntiTbPred
  • قاعدة بيانات الببتيدات المضادة للميكروبات مؤرشفة في 2011-07-20 على موقع Wayback Machine في المركز الطبي لجامعة نبراسكا
  • خادم التنبؤ AMP القائم على التعلم العميق لمسح الببتيدات المضادة للميكروبات
  • قاعدة بيانات الببتيدات المضادة للسل AntiTbPdb
  • BioPD في مركز العلوم الصحية بجامعة بكين
  • CAMP:جمع الببتيدات المضادة للميكروبات في المعهد الوطني لأبحاث الصحة الإنجابية (NIRRH)
  • DBAASP - قاعدة بيانات النشاط المضاد للميكروبات وبنية الببتيدات
  • مصباح في جامعة فودان
  • PeptideLocator التنبؤ بالببتيدات الوظيفية، بما في ذلك الببتيدات المضادة للميكروبات، في تسلسل البروتين
  • PeptideRanker الببتيد النشط بيولوجيًا، بما في ذلك الببتيد المضاد للميكروبات، والتنبؤ
  • حزمة modlAMP Python للعمل الحسابي مع الببتيدات المضادة للميكروبات، بما في ذلك التعامل مع التسلسل، والتصميم، والتنبؤ، وحساب الوصف والرسم البياني
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=الببتيدات_المضادة_للميكروبات&oldid=1248178601"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate