الارتباط الوراثي

الموسوعة الحرة

الارتباط الجيني هو ميل تسلسلات الحمض النووي القريبة من بعضها البعض على الكروموسوم إلى أن يتم توريثها معًا أثناء مرحلة الانقسام الاختزالي في التكاثر الجنسي . من غير المرجح أن يتم فصل علامتين وراثيتين قريبتين جسديًا من بعضهما البعض إلى كروماتيدات مختلفة أثناء التقاطع الكروموسومي ، وبالتالي يقال إنهما أكثر ارتباطًا من العلامات المتباعدة. بعبارة أخرى، كلما كان الجينين أقرب إلى الكروموسوم، انخفضت فرصة إعادة التركيب بينهما، وزادت احتمالية توريثهما معًا. العلامات الموجودة على الكروموسومات المختلفة غير مرتبطة تمامًا ، على الرغم من أن اختراق الأليلات الضارة المحتملة قد يتأثر بوجود أليلات أخرى، وقد توجد هذه الأليلات الأخرى على كروموسومات أخرى غير تلك التي يوجد عليها أليل ضار محتمل معين. [1]

الارتباط الوراثي هو الاستثناء الأكثر بروزًا لقانون التوزيع المستقل لغريغور مندل . أجريت أول تجربة لإثبات الارتباط في عام 1905. في ذلك الوقت، لم يكن السبب وراء ميل بعض السمات إلى التوريث معًا معروفًا. كشفت الأعمال اللاحقة أن الجينات عبارة عن هياكل مادية مرتبطة بالمسافة الفيزيائية.

الوحدة النموذجية للارتباط الجيني هي السنتيمورجان (cM). تعني المسافة التي تبلغ 1 سنتيمورجان بين علامتين أن العلامتين منفصلتان إلى كروموسومات مختلفة في المتوسط ​​مرة واحدة لكل 100 ناتج انقسامي، وبالتالي مرة واحدة لكل 50 انقسامًا انقساميًا.

اكتشاف

ينص قانون التوزيع المستقل لغريغور مندل على أن كل سمة موروثة بشكل مستقل عن كل سمة أخرى. ولكن بعد فترة وجيزة من إعادة اكتشاف عمل مندل ، تم العثور على استثناءات لهذه القاعدة. في عام 1905، قام علماء الوراثة البريطانيون ويليام باتسون وإديث ريبيكا سوندرز وريجينالد بانيت بتهجين نباتات البازلاء في تجارب مماثلة لتجارب مندل. [2] [3] كانوا مهتمين بتوريث السمات في البازلاء الحلوة وكانوا يدرسون جينين - جين لون الزهرة ( P ، أرجواني، و p ، أحمر) والجين الذي يؤثر على شكل حبوب اللقاح ( L ، طويل، و l ، مستدير). لقد عبروا عن الخطوط النقية PPLL و ppll ثم عبروا ذاتيًا عن خطوط PpLl الناتجة .

وفقًا لعلم الوراثة المندلي ، فإن النمط الظاهري المتوقع سيحدث بنسبة 9:3:3:1 من PL:Pl:pL:pl. ولدهشتهم، لاحظوا زيادة في تواتر PL وpl وانخفاضًا في تواتر Pl وpL:

تجربة بيتسون وساندرز وبونيت
النمط الظاهري والنمط الجيني لاحظ متوقع من نسبة 9:3:3:1
أرجواني، طويل ( P_L_ ) 284 216
أرجواني، مستدير ( P_ll ) 21 72
أحمر، طويل ( ppL_ ) 21 72
أحمر، مستدير ( ppll ) 55 24

كشفت تجربتهم عن وجود ارتباط بين الأليلات P و L والأليلات p و l . إن تواتر حدوث P مع L و p مع l أكبر من تواتر حدوث Pl و pL المعاد تركيبهما . إن حساب تواتر إعادة التركيب في تزاوج F2 أكثر صعوبة من حسابه في تزاوج خلفي، [4] ولكن عدم التوافق بين الأعداد الملحوظة والمتوقعة من النسل في الجدول أعلاه يشير إلى أنه أقل من 50٪. وهذا يشير إلى أن عاملين تفاعلا بطريقة ما لخلق هذا الاختلاف عن طريق إخفاء ظهور النمطين الظاهريين الآخرين. وقد أدى هذا إلى استنتاج مفاده أن بعض السمات مرتبطة ببعضها البعض بسبب قربها من بعضها البعض على الكروموسوم.

تم توسيع فهم الارتباط من خلال عمل توماس هانت مورجان . أدت ملاحظة مورجان بأن كمية التقاطع بين الجينات المرتبطة تختلف إلى فكرة أن تردد التقاطع قد يشير إلى المسافة التي تفصل الجينات على الكروموسوم . تم تسمية السنتيمورجان ، الذي يعبر عن تردد التقاطع، تكريمًا له.

خريطة الارتباط

خريطة الارتباط الجيني لدروسوفيلا ميلانوجاستر التي رسمها توماس هانت مورجان . كانت هذه أول خريطة جينية ناجحة وتقدم دليلاً مهمًا على نظرية الوراثة الكروموسومية . تُظهر الخريطة المواضع النسبية للأليلات على الكروموسوم الثاني لدروسوفيلا . المسافات بين الجينات ( سنتيمورجان ) تساوي النسب المئوية لأحداث التقاطع الكروموسومي التي تحدث بين الأليلات المختلفة. [5]

خريطة الارتباط (المعروفة أيضًا باسم الخريطة الجينية ) هي جدول لنوع أو مجموعة سكانية تجريبية تُظهر موضع الجينات أو العلامات الجينية المعروفة بالنسبة لبعضها البعض من حيث تواتر إعادة التركيب، بدلاً من المسافة الفيزيائية المحددة على طول كل كروموسوم. تم تطوير خرائط الارتباط لأول مرة بواسطة ألفريد ستورتيفانت ، أحد طلاب توماس هانت مورجان .

خريطة الارتباط هي خريطة تعتمد على ترددات إعادة التركيب بين العلامات أثناء عبور الكروموسومات المتجانسة . وكلما زاد تردد إعادة التركيب (الانفصال) بين علامتين وراثيتين، كلما افترض أنهما أبعد عن بعضهما البعض. وعلى العكس من ذلك، كلما انخفض تردد إعادة التركيب بين العلامات، كلما كانت المسافة الفيزيائية بينهما أصغر. تاريخيًا، كانت العلامات المستخدمة في الأصل عبارة عن أنماط ظاهرية يمكن اكتشافها (إنتاج الإنزيمات، لون العين) مشتقة من تسلسلات الحمض النووي المشفرة ؛ في النهاية، تم استخدام تسلسلات الحمض النووي غير المشفرة المؤكدة أو المفترضة مثل الأقمار الصناعية الدقيقة أو تلك التي تولد تعدد أشكال طول شظايا التقييد ( RFLPs ).

تساعد خرائط الارتباط الباحثين على تحديد علامات أخرى، مثل الجينات الأخرى عن طريق اختبار الارتباط الجيني للعلامات المعروفة بالفعل. في المراحل المبكرة من تطوير خريطة الارتباط، تُستخدم البيانات لتجميع مجموعات الارتباط ، وهي مجموعة من الجينات المعروفة بأنها مرتبطة. ومع تقدم المعرفة، يمكن إضافة المزيد من العلامات إلى مجموعة، حتى تغطي المجموعة كروموسومًا كاملاً. [6] بالنسبة للكائنات الحية المدروسة جيدًا، تتوافق مجموعات الارتباط واحدًا لواحد مع الكروموسومات.

خريطة الارتباط ليست خريطة فيزيائية (مثل خريطة هجينة مخفضة الإشعاع ) أو خريطة جينية .

تحليل الارتباط

تحليل الارتباط هو طريقة وراثية تبحث عن أجزاء الكروموسومات التي تتجمع مع النمط الظاهري للمرض من خلال العائلات. [ 7] يمكن استخدامه لرسم خريطة الجينات لكل من السمات الثنائية والكمية. [7] قد يكون تحليل الارتباط إما معياريًا (إذا كنا نعرف العلاقة بين التشابه الظاهري والوراثي) أو غير معياري. تحليل الارتباط المعياري هو النهج التقليدي، حيث تتم دراسة احتمالية ارتباط جين مهم لمرض ما بعلامة وراثية من خلال درجة LOD، والتي تقيم احتمالية أن يكون نسب معين، حيث يتجمع المرض والعلامة، بسبب وجود ارتباط (بقيمة ارتباط معينة) أو إلى الصدفة. يدرس تحليل الارتباط غير المعياري، بدوره، احتمالية تطابق الأليل مع نفسه من خلال النسب .

شجرة عائلة توضح تحليل الارتباط البارامتري

تحليل الارتباطات المعيارية

درجة LOD (لوغاريتم (قاعدة 10) للاحتمالات)، التي طورها نيوتن مورتون ، [8] هي اختبار إحصائي يستخدم غالبًا لتحليل الارتباط في مجموعات البشر والحيوانات والنباتات. تقارن درجة LOD احتمالية الحصول على بيانات الاختبار إذا كان الموقعان مرتبطين بالفعل، باحتمالية ملاحظة نفس البيانات بالصدفة البحتة. تفضل درجات LOD الإيجابية وجود ارتباط، بينما تشير درجات LOD السلبية إلى أن الارتباط أقل احتمالية. يعد تحليل درجة LOD المحوسب طريقة بسيطة لتحليل أنساب العائلات المعقدة من أجل تحديد الارتباط بين السمات المندلية (أو بين السمة وعلامة، أو علامتين).

تم وصف الطريقة بمزيد من التفصيل من قبل Strachan وRead.[1] باختصار، تعمل على النحو التالي:

  1. إنشاء شجرة نسب
  2. إجراء عدد من التقديرات لتردد إعادة التركيب
  3. حساب درجة مستوى التفاصيل لكل تقدير
  4. سيتم اعتبار التقدير الذي يحمل أعلى درجة LOD هو أفضل تقدير

يتم حساب درجة LOD على النحو التالي:

يشير NR إلى عدد النسل غير المؤتلف، ويشير R إلى عدد النسل المؤتلف. والسبب في استخدام 0.5 في المقام هو أن أي أليلات غير مرتبطة تمامًا (على سبيل المثال الأليلات الموجودة على كروموسومات منفصلة) لديها فرصة 50٪ لإعادة التركيب، بسبب التوزيع المستقل. θ  هو الكسر المؤتلف، أي جزء المواليد الذي حدث فيه إعادة التركيب بين العلامة الجينية المدروسة والجين المفترض المرتبط بالمرض. وبالتالي، فهو يساوي R / ( NR + R ) .

وفقًا للاتفاقية، تعتبر درجة LOD التي تزيد عن 3.0 دليلاً على الارتباط، حيث إنها تشير إلى احتمالات 1000 إلى 1 بأن الارتباط الذي يتم ملاحظته لم يحدث بالصدفة. من ناحية أخرى، تعتبر درجة LOD التي تقل عن -2.0 دليلاً على استبعاد الارتباط. على الرغم من أنه من غير المحتمل جدًا الحصول على درجة LOD 3 من شجرة نسب واحدة، فإن الخصائص الرياضية للاختبار تسمح بدمج البيانات من عدد من شجرة النسب عن طريق جمع درجات LOD الخاصة بها. تترجم درجة LOD 3 إلى قيمة p تبلغ حوالي 0.05، [9] ولا يلزم تصحيح الاختبار المتعدد (على سبيل المثال تصحيح بونفيروني ). [10]

القيود

يحتوي تحليل الارتباط على عدد من القيود المنهجية والنظرية التي يمكن أن تزيد بشكل كبير من معدل خطأ النوع الأول وتقلل من القدرة على رسم خريطة لمواقع السمات الكمية البشرية (QTL). [11] في حين تم استخدام تحليل الارتباط بنجاح لتحديد المتغيرات الجينية التي تساهم في الاضطرابات النادرة مثل مرض هنتنغتون ، إلا أنه لم يعمل بشكل جيد عند تطبيقه على الاضطرابات الأكثر شيوعًا مثل أمراض القلب أو أشكال مختلفة من السرطان . [12] أحد التفسيرات لذلك هو أن الآليات الجينية التي تؤثر على الاضطرابات الشائعة تختلف عن تلك التي تسبب بعض الاضطرابات النادرة. [13]

تردد إعادة التركيب

تردد إعادة التركيب هو مقياس للارتباط الجيني ويُستخدم في إنشاء خريطة الارتباط الجيني. تردد إعادة التركيب ( θ ) هو التردد الذي يحدث به تقاطع كروموسومي واحد بين جينين أثناء الانقسام الاختزالي . السنتيمورجان (cM) هي وحدة تصف تردد إعادة التركيب بنسبة 1%. وبهذه الطريقة يمكننا قياس المسافة الجينية بين موضعين، بناءً على تردد إعادة التركيب الخاص بهما. وهذا تقدير جيد للمسافة الحقيقية. ستتحول عمليات التقاطع المزدوجة إلى عدم حدوث إعادة تركيب. في هذه الحالة لا يمكننا معرفة ما إذا كانت عمليات التقاطع قد حدثت أم لا. إذا كانت المواضع التي نحللها قريبة جدًا (أقل من 7 cM) فإن التقاطع المزدوج غير مرجح للغاية. عندما تصبح المسافات أعلى، تزداد احتمالية حدوث التقاطع المزدوج. ومع زيادة احتمالية حدوث التقاطع المزدوج، يمكن للمرء أن يقلل بشكل منهجي من تقدير المسافة الجينية بين موضعين، ما لم يستخدم نموذجًا رياضيًا مناسبًا.

الارتباط المزدوج هو مصدر قلق تاريخي للنباتات. في الحيوانات، يحدث التقاطع المزدوج نادرًا. في البشر، على سبيل المثال، يكون لدى الكروموسوم الواحد تقاطعان في المتوسط ​​أثناء الانقسام الاختزالي. علاوة على ذلك، يمتلك علماء الوراثة المعاصرون عددًا كافيًا من الجينات بحيث لا تحتاج سوى الجينات القريبة إلى تحليل الارتباط، على عكس الأيام الأولى عندما لم يكن معروفًا سوى عدد قليل من الجينات. [14]

أثناء الانقسام المنصف، تنقسم الكروموسومات عشوائيًا إلى أمشاج ، بحيث يكون فصل أليلات أحد الجينات مستقلاً عن أليلات جين آخر. وهذا منصوص عليه في قانون مندل الثاني ويُعرف بقانون التوزيع المستقل . ينطبق قانون التوزيع المستقل دائمًا على الجينات الموجودة على كروموسومات مختلفة، ولكن بالنسبة للجينات الموجودة على نفس الكروموسوم، فإنه لا ينطبق دائمًا.

كمثال على التوزيع المستقل، ضع في اعتبارك تهجين سلالة الوالدين متماثلة الزيجوت الأصيلة ذات النمط الجيني AABB مع سلالة نقية مختلفة ذات النمط الجيني aabb . تمثل A و a و B و b أليلات الجينين A و B. سيؤدي تهجين سلالات الوالدين متماثلة الزيجوت هذه إلى ذرية من الجيل F1 وهي متغايرة الزيجوت مزدوجة النمط الجيني AaBb. ينتج ذرية F1 AaBb أمشاجًا هي AB و Ab و aB و ab بترددات متساوية (25٪) لأن أليلات الجين A تتهجين بشكل مستقل عن أليلات الجين B أثناء الانقسام الاختزالي. لاحظ أن 2 من الأمشاج الأربعة (50٪) - Ab و aB - لم تكن موجودة في الجيل الأبوي. تمثل هذه الأمشاج أمشاجًا معاد التركيب . الأمشاج المعاد تركيبها هي الأمشاج التي تختلف عن الأمشاج أحادية الصيغة الصبغية التي تكونت منها الخلية ثنائية الصيغة الصبغية الأصلية . في هذا المثال، تكون نسبة تكرار التركيب 50% حيث أن اثنتين من الأمشاج الأربعة كانتا أمشاجًا معاد تركيبها.

ستكون نسبة تكرار التركيب 50% عندما يقع جينان على كروموسومين مختلفين أو عندما يكونان منفصلين بشكل كبير على نفس الكروموسوم. وهذا نتيجة للتوزيع المستقل.

عندما يكون جينان قريبان من بعضهما البعض على نفس الكروموسوم، فإنهما لا يرتبان بشكل مستقل ويقال إنهما مرتبطان. في حين أن الجينات الموجودة على كروموسومات مختلفة ترتب بشكل مستقل ويكون معدل إعادة التركيب لها 50٪، فإن الجينات المرتبطة يكون معدل إعادة التركيب لها أقل من 50٪.

كمثال على الارتباط، ضع في اعتبارك التجربة الكلاسيكية التي أجراها ويليام باتسون وريجينالد بونيت . [15] كانا مهتمين بوراثة السمات في البازلاء الحلوة وكانا يدرسان جينين - جين لون الزهرة ( P ، أرجواني، و p ، أحمر) والجين الذي يؤثر على شكل حبوب اللقاح ( L ، طويل، و l ، مستدير). لقد عبروا عن الخطوط النقية PPLL و ppll ثم عبروا ذاتيًا عن خطوط PpLl الناتجة . وفقًا لعلم الوراثة المندلية ، فإن النمط الظاهري المتوقع سيحدث بنسبة 9:3:3:1 من PL:Pl:pL:pl. ولدهشتهم، لاحظوا زيادة في تواتر PL وpl وانخفاض في تواتر Pl وpL (انظر الجدول أدناه).

تجربة باتسون وبونيت
النمط الظاهري والنمط الجيني لاحظ متوقع من نسبة 9:3:3:1
أرجواني، طويل ( P_L_ ) 284 216
أرجواني، مستدير ( P_ll ) 21 72
أحمر، طويل ( ppL_ ) 21 72
أحمر، مستدير ( ppll ) 55 24
الجينات غير المرتبطة مقابل الجينات المرتبطة

كشفت تجربتهم عن ارتباط بين الأليلات P و L والأليلات p و l . إن معدل حدوث P مع L ومع حدوث p مع l أكبر من معدل حدوث Pl و pL المعاد تركيبهما . إن حساب معدل إعادة التركيب في تزاوج F2 أكثر صعوبة من حسابه في تزاوج خلفي، [4] ولكن عدم التوافق بين الأعداد المرصودة والمتوقعة من النسل في الجدول أعلاه يشير إلى أنه أقل من 50٪.

في هذه الحالة، تلقى النسل أليلين مهيمنين مرتبطين بكروموسوم واحد (يشار إليه باسم الاقتران أو الترتيب سيس ). ومع ذلك، بعد التهجين، قد يكون بعض النسل قد تلقى كروموسومًا أبويًا واحدًا بأليل مهيمن لصفة واحدة (مثل الأرجواني) مرتبطًا بأليل متنحي لصفة ثانية (مثل الدائري) مع كون العكس صحيحًا بالنسبة للكروموسوم الأبوي الآخر (مثل الأحمر والطويل). يُشار إلى هذا بالتنافر أو الترتيب المتحول . ستظل النمط الظاهري هنا أرجوانيًا وطويلًا، ولكن التهجين الاختباري لهذا الفرد مع الوالد المتنحي من شأنه أن ينتج ذرية بنسبة أكبر بكثير من النمطين الظاهريين المتقاطعين. في حين أن مثل هذه المشكلة قد لا تبدو محتملة من هذا المثال، إلا أن روابط التنافر غير المواتية تظهر عند التربية لمقاومة الأمراض في بعض المحاصيل.

يشار إلى الترتيبين المحتملين، سيس و ترانس، للأليلات في متغاير الزيجوت المزدوج باسم المراحل المشيجية ، والتقسيم المرحلي هو عملية تحديد أي من الاثنين موجود في فرد معين.

عندما يقع جينان على نفس الكروموسوم، فإن فرصة حدوث عملية تقاطع تؤدي إلى إعادة التركيب بين الجينين ترتبط بالمسافة بين الجينين. وبالتالي، تم استخدام ترددات إعادة التركيب لتطوير خرائط الارتباط أو الخرائط الجينية .

ومع ذلك، من المهم ملاحظة أن معدل إعادة التركيب يميل إلى التقليل من تقدير المسافة بين جينين مرتبطين. وذلك لأن الجينين يقعان بعيدًا عن بعضهما البعض، مما يزيد أيضًا من فرصة حدوث عدد مزدوج أو زوجي من عمليات التقاطع بينهما. ويؤدي العدد المزدوج أو الزوجي من عمليات التقاطع بين الجينين إلى انقسامهما إلى نفس الأمشاج، مما ينتج عنه ذرية أبوية بدلاً من النسل المعاد التركيب المتوقع. وكما ذكر أعلاه، تحاول تحويلات كوسامبي وهالدين تصحيح عمليات التقاطع المتعددة. [16]

ربط المواقع الجينية داخل الجين

في أوائل الخمسينيات من القرن العشرين، كان الرأي السائد هو أن الجينات الموجودة في الكروموسوم هي كيانات منفصلة، ​​لا يمكن تقسيمها عن طريق إعادة التركيب الجيني ومرتبة مثل الخرز على الخيط. خلال الفترة من 1955 إلى 1959، أجرى بنزر تجارب إعادة التركيب الجيني باستخدام طفرات rII من البكتيريا العاثية T4 . ووجد أنه على أساس اختبارات إعادة التركيب، يمكن رسم مواقع الطفرة بترتيب خطي. [17] [18] قدمت هذه النتيجة دليلاً على الفكرة الأساسية المتمثلة في أن الجين له بنية خطية تعادل طول الحمض النووي مع العديد من المواقع التي يمكن أن تتحور بشكل مستقل.

أجرى إدغار وآخرون [19] تجارب رسم خرائط باستخدام الطفرات r من البكتيريا العاثية T4، مما أظهر أن ترددات إعادة التركيب بين الطفرات rII ليست مضافة بشكل صارم. عادةً ما يكون تردد إعادة التركيب من تزاوج طفرتين rII (axd) أقل من مجموع ترددات إعادة التركيب للفواصل الفرعية الداخلية المجاورة (axb) + (bxc) + (cxd). على الرغم من عدم كونها مضافة بشكل صارم، فقد لوحظت علاقة منهجية [20] تعكس على الأرجح الآلية الجزيئية الأساسية لإعادة التركيب الجيني .

تباين تردد إعادة التركيب

في حين أن إعادة تركيب الكروموسومات عملية أساسية أثناء الانقسام الاختزالي، إلا أن هناك نطاقًا كبيرًا من تكرار عمليات التقاطع بين الكائنات الحية وداخل الأنواع. تُسمى معدلات إعادة التركيب ثنائية الشكل الجنسي بالتباين، وتُلاحظ أكثر من المعدل المشترك بين الذكور والإناث. في الثدييات، غالبًا ما يكون لدى الإناث معدل إعادة تركيب أعلى مقارنة بالذكور. من المفترض أن هناك اختيارات فريدة تعمل أو محركات انقسامية تؤثر على الاختلاف في المعدلات. قد يعكس الاختلاف في المعدلات أيضًا البيئات والظروف المختلفة للغاية للانقسام الاختزالي في تكوين البويضات وتكوين الحيوانات المنوية. [21]

الجينات التي تؤثر على معدل إعادة التركيب

غالبًا ما تؤثر الطفرات في الجينات التي تشفر البروتينات المشاركة في معالجة الحمض النووي على تواتر إعادة التركيب . في البكتيريا العاثية T4 ، تزيد الطفرات التي تقلل من التعبير عن بوليميراز الحمض النووي المتضاعف [منتج الجين 43 (gp43)] من إعادة التركيب (تقليل الارتباط) عدة مرات. [22] [23] قد تكون الزيادة في إعادة التركيب بسبب أخطاء التضاعف بواسطة بوليميراز الحمض النووي المعيب والتي تعد في حد ذاتها أحداث إعادة تركيب مثل تبديل القالب، أي أحداث إعادة تركيب اختيار النسخة. [24] تزداد إعادة التركيب أيضًا من خلال الطفرات التي تقلل من التعبير عن رباط الحمض النووي (gp30) [25] [23] وهيدروكسي ميثيلاز dCMP (gp42)، [22] [23] وهما إنزيمان يستخدمان في تخليق الحمض النووي .

يتم تقليل إعادة التركيب (زيادة الارتباط) عن طريق الطفرات في الجينات التي تشفر البروتينات ذات وظائف النوكلياز (gp46 و gp47) [25] [23] وبروتين ربط الحمض النووي (gp32) [23] كما تعمل الطفرة في جين البكتيريا uvsX على تقليل إعادة التركيب بشكل كبير. [26] جين uvsX مشابه لجين recA المدروس جيدًا لـ Escherichia coli والذي يلعب دورًا مركزيًا في إعادة التركيب. [27]

مؤشرات الانقسام المنصف

في حالة وجود أنساب كبيرة جدًا أو بيانات علامات جينية كثيفة جدًا، مثل تسلسل الجينوم الكامل، فمن الممكن تحديد التركيبات الجينية بدقة. باستخدام هذا النوع من التحليل الجيني، يتم تعيين مؤشر انقسام منصف لكل موضع من الجينوم لكل انقسام منصف في شجرة النسب. يشير المؤشر إلى أي نسخة من الكروموسوم الأبوي تساهم في الأمشاج المنقولة في ذلك الموضع. على سبيل المثال، إذا تم نقل الأليل من النسخة "الأولى" من الكروموسوم الأبوي، فقد يتم تعيين "0" لهذا الانقسام المنصف. إذا تم نقل الأليل من النسخة "الثانية" من الكروموسوم الأبوي، فسيتم تعيين "1" لهذا الانقسام المنصف. جاء الأليلان في الأصل، واحد لكل منهما، من جدين. تُستخدم هذه المؤشرات بعد ذلك لتحديد حالات التطابق بالنسب (IBD) أو حالات الوراثة، والتي تُستخدم بدورها لتحديد الجينات المسؤولة عن الأمراض.

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ كوبر، دي إن؛ كراوزاك، إم؛ بوليكروناكوس، سي؛ تايلر سميث، سي؛ كيهرر-ساواتسكي، إتش (أكتوبر 2013). "حيث لا يكون النمط الجيني تنبؤيًا بالنمط الظاهري: نحو فهم الأساس الجزيئي لانخفاض الاختراق في الأمراض الوراثية البشرية". علم الوراثة البشرية . 132 (10): 1077-130. doi :10.1007/s00439-013-1331-2. PMC  3778950. PMID  23820649 .
  2. ^ Lobo, Ingrid; Shaw, Kenna. "Discovery and Types of Genetic Linkage". Scitable . Nature Education . تم الاسترجاع في 21 يناير 2017 .
  3. ^ Bateson, W ; Saunders, ER ; Punnett, RC (18 May 1904). Reports to the Evolution committee of the Royal Society. London: Harrison and Sons, Printers . تم الاسترجاع في 21 يناير 2017 .
  4. ^ ab Fisher, RA ; Balmukand, B (يوليو 1928). "تقدير الارتباط من ذرية المتغايرين المتماثلين ذاتيًا". مجلة علم الوراثة . 20 (1): 79–92. doi :10.1007/BF02983317. S2CID  27688031.
  5. ^ مادير، سيلفيا (2007). علم الأحياء الطبعة التاسعة . نيويورك: ماكجرو هيل. ص 209. ISBN 978-0-07-325839-3.
  6. ^ جريفثس، أ. ج. ف. (2000). مقدمة في التحليل الجيني (الطبعة السابعة). دبليو. إتش. فريمان.
  7. ^ ab Cantor, Rita M. (2013), "Analysis of Genetic Linkage", in Rimoin, David; Pyeritz, Reed; Korf, Bruce (eds.), Emery and Rimoin's Principles and Practice of Medical Genetics (6th ed.), Academic Press, pp. 1–9, doi :10.1016/b978-0-12-383834-6.00010-0, ISBN 9780123838346
  8. ^ مورتون NE (1955). "الاختبارات المتسلسلة للكشف عن الارتباط". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 7 (3): 277-318. PMC 1716611. PMID  13258560 . 
  9. ^ Nyholt, Dale R (أغسطس 2000). "جميع مستويات تحديد الجينوم ليست متساوية". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 67 (2): 282–288. doi :10.1086/303029. PMC 1287176. PMID  10884360 . 
  10. ^ ريش، نيل (يونيو 1991). "ملاحظة حول إجراءات الاختبار المتعددة في تحليل الارتباط". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 48 (6): 1058-1064. PMC 1683115. PMID  2035526 . 
  11. ^ فيريرا، مانويل آر (2004-10-01). "تحليل الارتباط: مبادئ وطرق تحليل السمات الكمية البشرية". Twin Research and Human Genetics . 7 (5): 513–530. doi :10.1375/twin.7.5.513. ISSN  2053-6003. PMID  15527667. S2CID  199001341.
  12. ^ Gusella, James F.; Frontali, Marina; Wasmuth, John J.; Collins, Francis S.; Lehrach, Hans; Myers, Richard; Altherr, Michael; Allitto, Bernice; Taylor, Sherry (1992-05-01). "تظهر منطقة المرشح لمرض هنتنغتون العديد من الأنماط الوراثية المختلفة". Nature Genetics . 1 (2): 99–103. doi :10.1038/ng0592-99. ISSN  1546-1718. PMID  1302016. S2CID  25472459.
  13. ^ مارك جيه دالي؛ هيرشهورن، جويل ن. (2005-02-01). "دراسات الارتباط على مستوى الجينوم للأمراض الشائعة والسمات المعقدة". مراجعات الطبيعة الجينية . 6 (2): 95-108. doi :10.1038/nrg1521. ISSN  1471-0064. PMID  15716906. S2CID  2813666.
  14. ^ Meneely, Philip Mark; Dawes Hoang, Rachel; Okeke, Iruka N.; Heston, Katherine (2017). علم الوراثة: الجينات والجينومات والتطور. أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ص. 361. ISBN 978-0-19-879536-0. OCLC  951645141.
  15. ^ Punnett, RC; Bateson, W. (1908-05-15). "وراثة الجنس". مجلة العلوم . 27 (698): 785–787. Bibcode :1908Sci....27..785P. doi :10.1126/science.27.698.785. ISSN  0036-8075. PMID  17791047.
  16. ^ جريفثس، إيه جيه إف؛ ميلر، جيه إتش؛ سوزوكي، دي تي (2000). "الحساب الدقيق للمسافات الكبيرة على الخرائط، الشكل 6-4". مقدمة للتحليل الجيني (الطبعة السابعة). نيويورك: دبليو إتش فريمان . رقم ISBN 978-0-7167-3520-5.رسم بياني لدالة رسم الخرائط من مقارنة التكافؤ المثالي 1-1 لنسبة تكرار إعادة التركيب (RF%) لوحدات الخريطة.
  17. ^ Benzer S. البنية الدقيقة لمنطقة وراثية في البكتيريا العاثية. Proc Natl Acad Sci US A. 1955؛41(6):344-354. doi:10.1073/pnas.41.6.344
  18. ^ بنزر س. حول طوبولوجيا البنية الدقيقة الجينية. Proc Natl Acad Sci US A. 1959؛45(11):1607-1620. doi:10.1073/pnas.45.11.1607
  19. ^ Edgar RS, Feynman RP, Klein S, Lielausis I, Steinberg CM. Mapping experiments with r mutants of bacteriophage T4D. Genetics. 1962;47:179–186. PMC  1210321. PMID  13889186
  20. ^ Fisher KM, Bernstein H. The additivity of periods in the RIIA cistron of phage T4D. Genetics. 1965;52 (6):1127–1136. PMC  1210971. PMID  5882191
  21. ^ McKee, Bruce D. (2004-03-15). "التزاوج المتماثل وديناميكيات الكروموسومات في الانقسام المنصف والانقسام المتساوي". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - بنية الجينات والتعبير عنها . 1677 (1–3): 165–180. doi :10.1016/j.bbaexp.2003.11.017. ISSN  0006-3002. PMID  15020057.
  22. ^ ab Bernstein H. تأثير العيوب الطفرية في بوليميراز الحمض النووي وهيدروكسي ميثيلاز ديوكسيسيتيديلات في البكتيريا العصوية T4D على إعادة التركيب. علم الوراثة. 1967؛ 56 (4): 755-769
  23. ^ abcde Berger H, Warren AJ, Fry KE. Variations in genetic recombination due to amber alterns in T4D bacteriophage. J Virol. 1969;3(2):171-175. doi:10.1128/JVI.3.2.171-175.1969
  24. ^ بيرنشتاين هـ. حول آلية إعادة التركيب داخل الجينات. I. منطقة rII من البكتيريا العاثية T4. (1962) مجلة علم الأحياء النظري. 1962؛ 3، 335-353. https://doi.org/10.1016/S0022-5193(62)80030-7
  25. ^ ab Bernstein H. الإصلاح وإعادة التركيب في البكتيريا العصوية T4. I. الجينات المؤثرة في إعادة التركيب. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 1968؛ 33: 325-331. doi:10.1101/sqb.1968.033.01.037
  26. ^ Hamlett NV, Berger H. الطفرات التي تغير إعادة التركيب الجيني وإصلاح الحمض النووي في البكتيريا العاثية T4. علم الفيروسات. 1975؛ 63(2): 539-567. doi:10.1016/0042-6822(75)90326-8
  27. ^ Fujisawa H, Yonesaki T, Minagawa T. تسلسل جين إعادة التركيب T4، uvsX، ومقارنته بتسلسل جين recA في Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 1985؛13(20):7473-7481. doi:10.1093/nar/13.20.7473
مصادر المكتبة حول
رسم الخرائط الجينية
  • الموارد الموجودة في مكتبتك
  • الموارد في المكتبات الأخرى
  • جريفثس إيه جيه إف؛ ميلر جيه إتش؛ سوزوكي دي تي؛ ليوونتين آر سي؛ وآخرون (1993). "الفصل الخامس" . مقدمة في التحليل الوراثي (الطبعة الخامسة). نيويورك: دبليو إتش فريمان آند كومباني. رقم ISBN 978-0-7167-2285-4.
  • Poehlman JM; Sleper DA (1995). "الفصل 3". تربية المحاصيل الحقلية (الطبعة الرابعة). آيوا: مطبعة ولاية آيوا. ISBN 978-0-8138-2427-7.
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=الارتباط_الجيني&oldid=1246085642#تحليل_الارتباط"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate