الأبتامر

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 5 صور
الموسوعة الحرة
على اليسار: الأبتامر غير المرتبط. على اليمين: الأبتامر المرتبط بالبروتين المستهدف. البروتين باللون الأصفر. أجزاء الأبتامر التي يتغير شكلها عند ارتباطه بالبروتين المستهدف باللون الأزرق، بينما الأجزاء الثابتة باللون البرتقالي. الأجزاء التي تلامس البروتين مُظللة باللون الأحمر.
تُحضن خلايا سرطان الثدي مع الأبتاميرات التي ترتبط بشكل انتقائي بالعلامات الحيوية على الخلايا السرطانية دون الخلايا السليمة. ترتبط الأبتاميرات بجزيء أليكسا فلور 594 ، وهو جزيء يتوهج باللون الأحمر تحت الأشعة فوق البنفسجية . يُمكّن هذا النوع من الاختبارات الطبيب أو الباحث من تحديد الخلايا السرطانية في عينة نسيجية من المريض .

الأبتاميرات هي قليل الوحدات من الحمض النووي أحادي السلسلة الاصطناعي ( ssDNA ) أو الحمض النووي الريبي ( RNA ) أو الحمض النووي الريبي المختلط ( XNA ) أو الببتيدات ، ترتبط بجزيء هدف محدد أو مجموعة من جزيئات الهدف. وتُظهر نطاقًا واسعًا من الألفة ( ثابت التفكك KD يتراوح بين البيكومولار والميكرومولار) [ 1 ] [ 2 ] ، مع مستويات متفاوتة من الارتباط بأهداف غير مستهدفة [ 3 ] ، وتُصنف أحيانًا ضمن الأجسام المضادة الكيميائية . يمكن استخدام الأبتاميرات والأجسام المضادة في العديد من التطبيقات نفسها، ولكن بنية الأبتاميرات القائمة على الأحماض النووية ، والتي هي في الغالب قليلات النوكليوتيدات ، تختلف اختلافًا كبيرًا عن بنية الأجسام المضادة القائمة على الأحماض الأمينية ، والتي هي بروتينات . هذا الاختلاف قد يجعل الأبتاميرات خيارًا أفضل من الأجسام المضادة في بعض الأغراض (انظر استبدال الأجسام المضادة ).

تُستخدم الأبتاميرات في الأبحاث البيولوجية المخبرية والفحوصات الطبية . عند دمج عدة أبتاميرات في اختبار واحد ، يُمكن قياس أعداد كبيرة من البروتينات المختلفة في العينة . يُمكن استخدامها لتحديد المؤشرات الجزيئية للأمراض ، أو كأدوية ، أو أنظمة توصيل الأدوية ، أو أنظمة إطلاق الأدوية المُتحكم بها . كما تُستخدم في مهام أخرى في الهندسة الجزيئية .

معظم الأبتاميرات تنشأ من تقنية SELEX ، وهي سلسلة من التجارب المخبرية لاكتشاف الأبتاميرات المفيدة من بين مجموعة هائلة من تسلسلات الحمض النووي المختلفة. تشبه هذه العملية إلى حد كبير الانتقاء الطبيعي أو التطور الموجه أو الانتقاء الاصطناعي. في تقنية SELEX، يختار الباحث بشكل متكرر أفضل الأبتاميرات من مكتبة حمض نووي أولية تتكون من حوالي كوادريليون قطعة مختلفة من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي تم توليدها عشوائيًا . بعد انتهاء عملية SELEX، قد يُجري الباحث طفرات أو تغييرات في التركيب الكيميائي للأبتاميرات، ثم يُجري عملية اختيار أخرى، أو قد يستخدم عمليات تصميم منطقية لتحسينها. توجد أيضًا طرق أخرى لاكتشاف الأبتاميرات غير تقنية SELEX .

يعمل الباحثون على تحسين الأبتاميرات لتحقيق مجموعة متنوعة من الخصائص المفيدة. أهم هذه الخصائص هي الارتباط النوعي والحساس بالهدف المحدد. عند تعرض الأبتاميرات لسوائل الجسم، كما هو الحال في اختبارات المصل أو العلاجات القائمة على الأبتاميرات، من المهم غالبًا أن تقاوم الهضم بواسطة الإنزيمات المُحللة للحمض النووي DNA وRNA . غالبًا ما يتطلب الأمر تعديل الأبتاميرات العلاجية للتخلص منها ببطء من الجسم . تُعد الأبتاميرات التي تُغير شكلها بشكل كبير عند ارتباطها بهدفها مفيدة كمفاتيح جزيئية لتشغيل وإيقاف المستشعر. يتم تصميم بعض الأبتاميرات لتناسب المستشعرات الحيوية أو لاختبار العينات البيولوجية . قد يكون من المفيد في بعض الحالات أن يحقق الأبتامير مستوى أو سرعة ارتباط محددة مسبقًا . نظرًا لأن إنتاجية التخليق المستخدمة لإنتاج الأبتاميرات المعروفة تتناقص بسرعة مع التسلسلات الأطول، [ 4 ] غالبًا ما يقوم الباحثون بتقصير الأبتاميرات إلى الحد الأدنى من تسلسل الارتباط لتقليل تكلفة الإنتاج.

أصل الكلمة

كلمة "أبتامر" هي مصطلح جديد صاغه أندرو د. إلينغتون وجاك زوستاك في أول منشور لهما حول هذا الموضوع. لم يقدما تعريفًا دقيقًا، بل قالا: "لقد أطلقنا على هذه التسلسلات الفردية من الحمض النووي الريبي اسم "أبتامر"، من الكلمة اللاتينية " aptus " التي تعني "يناسب". [ 5 ]

ومع ذلك، فإن الكلمة نفسها مشتقة من الكلمة اليونانية ἅπτω ، بمعنى الربط أو التوافق (كما استخدمها هوميروس (حوالي القرن الثامن قبل الميلاد) [ 6 ] [ 7 ] ) و μέρος، أي مكون من شيء أكبر. [ 8 ]

تصنيف

الأبتامر النموذجي هو ربيطة مُصنّعة تستغل التنوع التركيبي للحمض النووي DNA أو RNA أو XNA أو الببتيد لتحقيق ارتباط قوي ومحدد بجزيء هدف معين أو مجموعة من جزيئات الهدف. تُصنف الأبتامرات أحيانًا على أنها "أجسام مضادة كيميائية" أو "محاكيات للأجسام المضادة" . [ 9 ] ومع ذلك، فإن معظم الأبتامرات صغيرة الحجم، بوزن جزيئي يتراوح بين 6 و30 كيلو دالتون، على عكس حجم الأجسام المضادة الذي يبلغ 150 كيلو دالتون، وتحتوي على موقع ارتباط واحد بدلاً من منطقتي ارتباط المستضد المتطابقتين الموجودتين في الجسم المضاد النموذجي.

تاريخ

جاك زوستاك، الحائز على جائزة نوبل وأحد مخترعي تقنية SELEX والأبتاميرات.

منذ تطبيقها الأول عام 1967، [ 10 ] استُخدمت منهجيات التطور الموجه لتطوير جزيئات حيوية ذات خصائص ووظائف جديدة. ومن الأمثلة المبكرة على ذلك تعديل نظام تضاعف العاثية Qbeta وإنتاج الريبوزيمات ذات نشاط التحلل المعدل . [ 11 ]

في عام 1990، قام فريقان بشكل مستقل بتطوير ونشر طرق SELEX ( التطور المنهجي للروابط عن طريق الإثراء الأسي ) وإنتاج أبتاميرات الحمض النووي الريبي (RNA): مختبر لاري غولد، الذي استخدم مصطلح SELEX لعملية اختيار روابط الحمض النووي الريبي ضد بوليميراز الحمض النووي T4 [ 12 ] ، ومختبر جاك زوستاك ، الذي اختار روابط الحمض النووي الريبي ضد أصباغ عضوية مختلفة . [ 5 ] [ 13 ] بعد ذلك بعامين، استخدم مختبر زوستاك وشركة جيليد ساينسز ، بشكل مستقل عن بعضهما البعض، مخططات اختيار في المختبر لإنتاج أبتاميرات الحمض النووي للأصباغ العضوية [ 14 ] والثرومبين البشري [ 15 ] على التوالي. في عام 2001، قام جيه. كولين كوكس بأتمتة SELEX في مختبر إلينغتون، مما قلل مدة تجربة الاختيار التي كانت تستغرق أسابيع إلى ثلاثة أيام فقط . [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]

في عام 2002، نشرت مجموعتان بحثيتان بقيادة رونالد بريكر وإيفجيني نودلر أول دليل قاطع على وجود مفتاح ريبوزي ، وهو عنصر تنظيمي جيني قائم على الأحماض النووية ، والذي كان يُشتبه بوجوده سابقًا. يمتلك المفتاح الريبوزي خصائص تعرف جزيئية مشابهة للأبتاميرات. وقد عزز هذا الاكتشاف فرضية عالم الحمض النووي الريبوزي ، وهي مرحلة زمنية مفترضة في نشأة الحياة على الأرض . [ 19 ]

ملكيات

بناء

إن البنية الثانوية والثالثية المعقدة والمتنوعة للأبتاميرات، كما هو موضح في هذا الرسم التخطيطي للبنية الثانوية للأبتامير، هي ما يسمح لها بالارتباط بهدفها بقوة ودقة. يظهر اقتران القواعد المتكاملة في الخطوط السوداء التي تربط بعض قواعد GC وAT. هذه سمة من سمات الأحماض النووية غير موجودة في الأحماض الأمينية للأجسام المضادة، وتساعد الأبتاميرات على تكوين هذه البنى الفريدة. تعمل مناطق الحلقة الدبوسية (باللون الأحمر)، التي تعتمد على اقتران القواعد هذا، على تعزيز استقرار الأبتامير عند درجات حرارة مختلفة. تُظهر هذه الصورة أيضًا أمثلة على التعديلات الكيميائية التي أُجريت على قاعدة الأبتامير. قاعدتان غير طبيعيتين، باللون الأصفر، تُعززان المتانة. يرتبط جزيء البيوتين بقوة فائقة بالستربتافيدين ، مما يسمح بتثبيت الأبتامير على جزيئات أخرى أو على سطح في أجهزة الاستشعار والاختبارات.

تعتمد معظم الأبتاميرات على تسلسل أوليغوميري محدد يتراوح طوله بين 20 و100 قاعدة ، ووزنه الجزيئي بين 3 و20 كيلو دالتون . ويخضع بعضها لتعديلات كيميائية لتحسين وظائفها أو لزيادة توافقها مع الأنظمة الجزيئية المُهندسة الأكبر حجمًا. وتتميز كيمياء الأبتاميرات القائمة على الحمض النووي DNA، والحمض النووي RNA، والحمض النووي XNA ، والببتيدات، بخصائص فريدة من حيث ثباتها أثناء التخزين، ومتانتها في المصل أو داخل الجسم الحي ، وخصوصيتها وحساسيتها، وتكلفتها، وسهولة إنتاجها وتضخيمها وتوصيفها، ومدى سهولة استخدامها. وعادةً ما تُظهر الأبتاميرات القائمة على الحمض النووي DNA والحمض النووي RNA مناعة منخفضة ، ويمكن تضخيمها باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ، ولها بنية ثانوية وثلاثية معقدة . [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] وتتميز الأبتاميرات القائمة على الحمض النووي DNA والحمض النووي XNA بثبات فائق أثناء التخزين. ويمكن للأبتاميرات القائمة على الحمض النووي XNA أن تُضيف تنوعًا كيميائيًا إضافيًا لزيادة قوة الارتباط أو متانتها في المصل أو داخل الجسم الحي .

نظراً لوجود 22 حمضاً أمينياً مشفراً جينياً وأكثر من 500 حمض أميني طبيعي ، فإنّ الأبتاميرات الببتيدية ، وكذلك الأجسام المضادة، تتمتع بتنوع تركيبي أكبر بكثير لكل وحدة طول مقارنةً بالأحماض النووية الأربعة الموجودة في الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) أو الحمض النووي الريبوزي (RNA). [ 24 ] وتؤدي التعديلات الكيميائية على قواعد أو هياكل الأحماض النووية إلى زيادة التنوع الكيميائي لقواعد الأحماض النووية القياسية. [ 25 ]

تتكون الأبتاميرات المنقسمة من سلسلتين أو أكثر من الحمض النووي، وهي أجزاء من أبتامير أصلي أكبر تم تقسيمه إلى قسمين بواسطة قطع جزيئي . [ 26 ] تعتمد قدرة كل سلسلة مكونة على الارتباط بالأهداف على موقع القطع، بالإضافة إلى البنية الثانوية للسلاسل الناتجة. [ 27 ] يدعم وجود جزيء الهدف عملية ربط أجزاء الحمض النووي. ويمكن استخدام ذلك كأساس لأجهزة الاستشعار الحيوية. [ 28 ] بمجرد تجميعها، يمكن ربط سلسلتي الحمض النووي المنفصلتين لتكوين سلسلة واحدة.

تُزال الأبتاميرات غير المعدلة بسرعة من مجرى الدم ، حيث يبلغ عمر النصف لها من ثوانٍ إلى ساعات. ويعود ذلك أساسًا إلى تحللها بواسطة النيوكلياز ، الذي يُدمرها ميكانيكيًا، بالإضافة إلى إزالتها عن طريق الكلى ، نتيجةً لانخفاض وزنها الجزيئي وحجمها. تسمح بعض التعديلات، مثل استبدال البيريميدينات بالفلور في الموضع 2' وربطها ببولي إيثيلين جلايكول (PEG)، بعمر نصف في المصل يتراوح من أيام إلى أسابيع. يمكن أن يُضيف ربط PEG كتلةً وحجمًا كافيين لمنع إزالتها عن طريق الكلى داخل الجسم الحي . يمكن للأبتاميرات غير المعدلة علاج اضطرابات التخثر . تقل مشكلة الإزالة والهضم بواسطة النيوكلياز عند استخدامها في العين ، حيث يكون تركيز النيوكلياز أقل، وبالتالي يكون معدل الإزالة أبطأ. [ 29 ] كما أن سرعة إزالتها من المصل قد تكون مفيدة في بعض التطبيقات، مثل التصوير التشخيصي داخل الجسم الحي . [ 30 ]

في دراسةٍ أُجريت على الأبتاميرات [ 31 ] المصممة للارتباط بالبروتينات المرتبطة بعدوى الإيبولا، تمت مقارنة ثلاثة أبتاميرات معزولة لقدرتها على الارتباط بالبروتين المستهدف EBOV sGP. على الرغم من اختلاف هذه الأبتاميرات في كلٍ من التسلسل والبنية، إلا أنها تُظهر تقاربًا نسبيًا متشابهًا بشكلٍ ملحوظ مع sGP من فيروسي الإيبولا والسودان، بالإضافة إلى GP1.2 من فيروس الإيبولا. والجدير بالذكر أن هذه الأبتاميرات أظهرت درجة عالية من الخصوصية لمنتجات جين GP. وقد أثبت أحد الأبتاميرات، على وجه الخصوص، فعاليته كعنصر تعريف في مستشعر كهروكيميائي، مما مكّن من الكشف عن sGP وGP1.2 في المحلول، وكذلك GP1.2 داخل غشاء الخلية. تشير نتائج هذا البحث إلى احتمالٍ مثير للاهتمام، وهو أن بعض المناطق على أسطح البروتينات قد تمتلك خصائص انجذابية. إن تحديد الخصائص الرئيسية لهذه المواقع، بالتزامن مع تحسين التنبؤات الهيكلية ثلاثية الأبعاد للأبتاميرات، يُمكن أن يُعزز دقة التنبؤ بمواقع تفاعل الأبتاميرات مع البروتينات. وهذا بدوره قد يُساعد في تحديد الأبتاميرات ذات احتمالية أعلى للارتباط بالبروتينات بألفة عالية، بالإضافة إلى تسليط الضوء على الطفرات البروتينية التي قد تؤثر بشكل كبير على ارتباط الأبتامير. يُعد هذا الفهم الشامل للتفاعلات القائمة على البنية بين الأبتاميرات والبروتينات أمرًا حيويًا لتحسين القدرة الحاسوبية على التنبؤ بارتباط الأبتامير بالبروتين. علاوة على ذلك، فإنه يُمكن أن يُغني في نهاية المطاف عن الحاجة إلى بروتوكول SELEX التجريبي.

الأهداف

قد تشمل أهداف الأبتامير جزيئات صغيرة وأيونات معادن ثقيلة ، وروابط أكبر مثل البروتينات، وحتى خلايا كاملة. [ 32 ] [ 33 ] تشمل هذه الأهداف الليزوزيم ، [ 34 ] والثرومبين ، [ 35 ] [ 36 ] وعنصر الاستجابة العابر لفيروس نقص المناعة البشرية ( HIV TAR)، [ 37 ] والهيمين ، [ 38 ] والإنترفيرون غاما ، [ 39 ] وعامل نمو بطانة الأوعية الدموية (VEGF)، [ 40 ] [ 41 ] ومستضد البروستات النوعي (PSA)، [ 42 ] [ 43 ] والدوبامين ، [ 44 ] والجين الورمي غير الكلاسيكي ، عامل الصدمة الحرارية 1 (HSF1). [ 45 ]

تم تطوير الأبتاميرات ضد الخلايا السرطانية، [ 46 ] والبريونات ، [ 47 ] والبكتيريا، [ 48 ] والفيروسات. تشمل الأهداف الفيروسية للأبتاميرات فيروسات الإنفلونزا A و B ، [ 49 ] والفيروس المخلوي التنفسي (RSV)، [ 49 ] وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الالتهاب الرئوي الحاد (SARS-CoV)، [ 49 ] وفيروس SARS-CoV-2 . [ 50 ]

قد تكون الأبتاميرات مفيدة بشكل خاص في علم البروتينات البيئية . [ 51 ] الأجسام المضادة، مثل البروتينات الأخرى، أصعب في تحديد تسلسلها من الأحماض النووية. كما أنها مكلفة في صيانتها وإنتاجها، ومعرضة باستمرار لخطر التلوث، نظرًا لإنتاجها عبر زراعة الخلايا أو استخلاصها من مصل الحيوانات. لهذا السبب، قد يجد الباحثون المهتمون بالبروتينات والأنواع قليلة الدراسة أن الشركات لا تنتج أو تصون أو تتحقق بشكل كافٍ من جودة الأجسام المضادة ضد هدفهم محل الاهتمام. [ 52 ] في المقابل، يسهل تحديد تسلسل الأبتاميرات ولا تتطلب أي تكلفة لصيانتها، حيث يمكن تخزين بنيتها الدقيقة رقميًا وتصنيعها عند الطلب. قد يجعل هذا استخدامها أكثر جدوى من الناحية الاقتصادية كأدوات بحثية للمشاريع البحثية البيولوجية التي تعاني من نقص التمويل. توجد أبتاميرات لمركبات نباتية، مثل الثيوفيلين (الموجود في الشاي ) [ 53 ] وحمض الأبسيسيك (هرمون مناعي نباتي). [ 54 ] تم تطوير أبتامر ضد ألفا-أمانيتين (السم الذي يسبب التسمم القاتل بفطر الأمانيتا )، وهو مثال على أبتامر يستهدف فطرًا معينًا . [ 55 ]

يمكن تصنيف تطبيقات الأبتاميرات تقريبًا إلى فئات الاستشعار والعلاج وإنتاج الكواشف والهندسة. تُعدّ تطبيقات الاستشعار مهمة في مجالات البيئة والطب الحيوي وعلم الأوبئة والأمن البيولوجي والبحوث الأساسية، حيث تعمل الأبتاميرات كمجسات في المقايسات وطرق التصوير والفحوصات التشخيصية وأجهزة الاستشعار الحيوية. [ 32 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] [ 59 ] [ 60 ] أما في التطبيقات العلاجية والطب الدقيق ، فيمكن للأبتاميرات أن تعمل كأدوية، [ 61 ] وكناقلات دوائية موجهة ، [ 62 ] وكآليات إطلاق مُتحكم بها، وككواشف لاكتشاف الأدوية عبر الفحص عالي الإنتاجية للجزيئات الصغيرة [ 63 ] والبروتينات. [ 64 ] [ 65 ] وللأبتاميرات تطبيقات في مراقبة إنتاج البروتين، ومراقبة الجودة، والتنقية. [ 66 ] [ 67 ] [ 68 ] يمكن استخدامها في تطبيقات الهندسة الجزيئية كوسيلة لتعديل البروتينات، مثل تعزيز بوليميراز الحمض النووي لجعل تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) أكثر موثوقية. [ 69 ] [ 70 ] [ 71 ] [ 72 ]

نظرًا لأن ألفة الأبتامر تؤثر أيضًا على نطاقه الديناميكي وحد الكشف، فقد يكون من المستحسن استخدام أبتامرات ذات ألفة أقل عند تحليل تراكيز عالية من الجزيء المستهدف. [ 73 ] كما تعتمد كروماتوغرافيا الألفة على قدرة كاشف الألفة، كالأبتامر، على الارتباط بهدفه وإطلاقه، وقد تساعد الألفة المنخفضة في إطلاق الجزيء المستهدف. [ 74 ] لذا، تحدد التطبيقات المحددة النطاق المفيد لألفة الأبتامر.

استبدال الأجسام المضادة

يمكن للأبتاميرات أن تحل محل الأجسام المضادة في العديد من تطبيقات التقنية الحيوية . [ 75 ] [ 52 ] في البحوث المخبرية والتشخيص السريري، يمكن استخدامها في نسخ من المقايسات المناعية القائمة على الأبتاميرات، بما في ذلك مقايسة الامتصاص المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) ، [ 76 ] والتلطيخ الغربي ، [ 77 ] والكيمياء النسيجية المناعية (IHC) ، [ 78 ] وقياس التدفق الخلوي . [ 79 ] كعلاجات، يمكنها أن تعمل كمحفزات أو مثبطات للرابط الخاص بها. [ 80 ] في حين أن الأجسام المضادة تقنية مألوفة ولها سوق متطورة، فإن الأبتاميرات تقنية حديثة نسبيًا بالنسبة لمعظم الباحثين، ولم يتم إنتاج الأبتاميرات إلا ضد جزء صغير من أهداف البحث المهمة. [ 81 ] على عكس الأجسام المضادة، فإن الأبتاميرات غير المعدلة أكثر عرضة للهضم بواسطة النيوكلياز في المصل والتصفية الكلوية في الجسم الحي . تتميز الأبتاميرات بصغر حجمها وكتلتها مقارنةً بالأجسام المضادة، وهو ما قد يكون عاملاً مهماً في اختيار الأنسب لتطبيق معين. فعندما تكون الأبتاميرات متاحة لتطبيق محدد، تشمل مزاياها على الأجسام المضادة انخفاض احتمالية إثارة الاستجابة المناعية، وقابلية أكبر للتكاثر ، وتكلفة أقل، ومستوى تحكم أعلى بفضل ظروف الانتقاء المختبري ، وإمكانية هندستها بكفاءة لتحقيق المتانة والنوعية والحساسية. [ 82 ]

بالإضافة إلى ذلك، تُسهم الأبتاميرات في الحد من استخدام حيوانات التجارب . [ 83 ] فبينما تعتمد الأجسام المضادة غالبًا على الحيوانات في اكتشافها الأولي، وكذلك في إنتاجها في حالة الأجسام المضادة متعددة النسائل ، فإن اختيار الأبتاميرات وإنتاجها يتمان عادةً دون استخدام الحيوانات. ومع ذلك، تسمح طرق عرض العاثيات باختيار الأجسام المضادة في المختبر ، ثم إنتاجها من سلالة خلوية أحادية النسيلة ، مما يُغني عن استخدام الحيوانات تمامًا. [ 84 ]

إطلاق متحكم به للعلاجات

أدت قدرة الأبتاميرات على الارتباط بشكل عكسي بجزيئات مثل البروتينات إلى زيادة الاهتمام باستخدامها لتسهيل الإطلاق المتحكم به للجزيئات الحيوية العلاجية، مثل عوامل النمو . ويمكن تحقيق ذلك من خلال ضبط قوة الارتباط لإطلاق عوامل النمو بشكل سلبي، [ 85 ] بالإضافة إلى الإطلاق النشط عبر آليات مثل تهجين الأبتامير مع قليل النوكليوتيدات المكملة [ 86 ] أو فك بنية الأبتامير بفعل قوى الشد الخلوية. [ 87 ] [ 88 ]

تطبيقات هندسة الأنسجة

تُستخدم الأبتاميرات، المعروفة بقدرتها على الارتباط بجزيئات محددة بشكل عكسي، في الطباعة الحيوية ثلاثية الأبعاد للأنسجة لتوصيل عوامل النمو بدقة لتعزيز تكوين الأوعية الدموية . [ 89 ] [ 90 ] يتيح هذا التوصيل المُتحكم به إطلاق عوامل النمو في المكان والزمان المناسبين، مما يُشجع على تكوين شبكات وعائية موضعية ومعقدة. بالإضافة إلى ذلك، يُمكن ضبط خصائص هذه الشبكات بدقة من خلال تعديل كيفية إطلاق عوامل النمو بمرور الوقت، مما يجعل هذا النهج أداة فعالة لإنشاء أنسجة هندسية مُزودة بالأوعية الدموية.

أبتابيد

AptaBiD (اكتشاف المؤشرات الحيوية بمساعدة الأبتامير) هي طريقة تعتمد على الأبتامير لاكتشاف المؤشرات الحيوية . [ 91 ]

الأبتاميرات الببتيدية

في حين أن معظم الأبتاميرات تعتمد على الحمض النووي DNA أو RNA أو XNA، فإن الأبتاميرات الببتيدية [ 92 ] هي بروتينات اصطناعية تم اختيارها أو هندستها لربط جزيئات هدف محددة.

بناء

تتكون الأبتاميرات الببتيدية من حلقة ببتيدية واحدة أو أكثر ذات تسلسل متغير، تُعرض على هيكل بروتيني. تسمح مشتقاتها ، المعروفة باسم "الشرغوف"، والتي ترتبط فيها "رؤوس" الأبتامير الببتيدي تساهميًا بـ"ذيول" الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) مزدوج السلسلة ذي تسلسل فريد، بتحديد كمية الجزيئات المستهدفة النادرة في المخاليط عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) (باستخدام، على سبيل المثال، تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي ) لذيول الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) الخاصة بها. [ 93 ] تُصنّع الببتيدات التي تُشكّل المناطق المتغيرة للأبتامير كجزء من سلسلة عديد الببتيد نفسها التي يتكون منها الهيكل، وتُقيّد عند طرفيها الأميني والكربوكسيلي (N و C) من خلال ارتباطها به. يُقلّل هذا التقييد البنيوي المزدوج من تنوّع البنى ثلاثية الأبعاد التي يُمكن أن تتخذها المناطق المتغيرة، [ 94 ] ويُخفّض هذا الانخفاض في التنوّع البنيوي التكلفة الإنتروبية للارتباط الجزيئي عندما يتسبب التفاعل مع الهدف في اتخاذ المناطق المتغيرة بنية موحدة.

اختيار

يُعد نظام التفاعل الثنائي في الخميرة النظام الأكثر شيوعًا لاختيار الأبتاميرات الببتيدية . كما يُمكن اختيار الأبتاميرات الببتيدية من مكتبات الببتيدات التوافقية المُنشأة باستخدام تقنية عرض العاثيات وتقنيات العرض السطحي الأخرى، مثل عرض الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) ، وعرض الريبوسومات ، والعرض البكتيري ، وعرض الخميرة . تُعرف هذه الإجراءات التجريبية أيضًا باسم الفرز الحيوي . وقد تم تخزين جميع الببتيدات التي تم فرزها من مكتبات الببتيدات التوافقية في قاعدة بيانات MimoDB . [ 95 ] [ 96 ]

التطبيقات

استُخدمت مكتبات الأبتاميرات الببتيدية كعوامل مطفرة في دراسات يقوم فيها الباحث بإدخال مكتبة تُعبّر عن أبتاميرات ببتيدية مختلفة إلى مجموعة من الخلايا، ثم يختار النمط الظاهري المطلوب ، ويحدد الأبتاميرات المسؤولة عن هذا النمط. بعد ذلك، يستخدم الباحث هذه الأبتاميرات كطُعم، على سبيل المثال في فحوص التفاعل الثنائي في الخميرة، لتحديد البروتينات الخلوية التي تستهدفها هذه الأبتاميرات. تُحدد هذه التجارب بروتينات معينة ترتبط بها الأبتاميرات، والتفاعلات البروتينية التي تُعطلها الأبتاميرات، مما يؤدي إلى ظهور النمط الظاهري. [ 97 ] [ 98 ] إضافةً إلى ذلك، يمكن للأبتاميرات الببتيدية المُشتقة بمجموعات وظيفية مناسبة أن تُحدث تعديلات ما بعد الترجمة مُحددة لبروتيناتها المستهدفة، أو تُغير موقعها داخل الخلية. [ 99 ]

يختبر هذا التحليل قدرة نوعين مختلفين من الأبتاميرات (V وI) على الكشف عن البروتينات المستهدفة الخاصة بهما (VEGF وIFN-γ). تُرتَّب العلامات Apt1 وApt2 وApt3 وApt4 تنازليًا حسب قوة الارتباط (أي أن Apt1 هو الأبتامير الأقوى). تشير الأحرف DD وAD وDA وAA إلى اختلاف تركيبات أزواج القواعد غير الطبيعية، مما يُسبب اختلاف قوة الارتباط. لا تحتوي الأعمدة "-" على بروتين، بينما تحتوي الأعمدة "+" على بروتين. يُحمَّل الأبتامير المرتبط بالبروتين (+) والأبتامير غير المرتبط به (-) في آبار الهلام، ثم يتحرك عبر مسارات الأعمدة. في حال وجود البروتين المستهدف، يرتبط الأبتامير بالبروتين ويتحرك ببطء أكبر، نظرًا لشحنة الأبتامير وكتلة البروتين. أما في حال عدم وجوده، فيتحرك الأبتامير غير المرتبط بسرعة إلى نهاية المسار. يُعرف الفرق في الموضع بين نطاقي "+" و"-" بـ"انزياح الحركة". يُمكّن هذا الباحث من الكشف عن وجود البروتين أو عدمه. يُشير الشريط الداكن في أقصى اليسار من المسارين V وI إلى أن ارتباط الأبتامر بالهدف بقوة أكبر يُسهّل الكشف عن الهدف عند وجود كمية مُحددة من بروتين الهدف في العينة. تتضمن الصورة السفلية اليوريا المُسببة لتشوه البروتين في الهلام، والتي تُعطّل ارتباط الأبتامر بالهدف في الأبتامرات I الأضعف، مما يُبيّن أن ارتباط الأبتامر بالبروتين هو بالفعل ما تسبب في تغير الحركة.

مجتمع الصناعة والبحث

تشمل المنتجات والشركات التجارية القائمة على الأبتاميرات دواء ماكوجين (بيغابتانيب) [ 100 ] وشركة التشخيص السريري سوما لوجيك [ 101 ] . وتصدر الجمعية الدولية للأبتاميرات (INSOAP)، وهي جمعية مهنية لمجتمع أبحاث الأبتاميرات، مجلة متخصصة في هذا المجال بعنوان "أبتاميرات" . أما "أبتا-إندكس" [ 102 ] فهو قاعدة بيانات حديثة تُفهرس وتُسهّل عملية طلب أكثر من 700 أبتامير.

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ رودس، أندرو؛ سميثرز، نيك؛ تشابمان، تريفور؛ بارسونز، سارة؛ ريس، ستيفن (5 أكتوبر 2001). " توليد وتوصيف الأبتاميرات الحمضية النووية الريبية المضادة لـ MCP-1" . رسائل FEBS . 506 (2): 85-90 . Bibcode : 2001FEBSL.506...85R . doi : 10.1016/S0014-5793(01)02895-2 . ISSN 0014-5793 . PMID 11591377. S2CID 36797240 .   
  2. ↑ ستولتنبرغ، ريجينا؛ نيكولاس، ناديا؛ ستريليتز، بيات (30-12-2012). "Capture-SELEX: اختيار الأبتاميرات الحمضية النووية للمضادات الحيوية الأمينوغليكوزيدية" . مجلة الأساليب التحليلية في الكيمياء . 2012 e415697. doi : 10.1155/2012/415697 . ISSN 2090-8865 . PMC 3544269. PMID 23326761 .   
  3. ↑ كريفانو-غايتا، ف.، وتومسون، م. (نوفمبر 2016). "الأبتاميرات، وأجزاء الأجسام المضادة أحادية السلسلة (scFv)، وأجزاء الأجسام المضادة (Fab'): نظرة عامة ومقارنة لثلاثة من أكثر عناصر التعرف الحيوي تنوعًا في أجهزة الاستشعار الحيوي". أجهزة الاستشعار الحيوي والإلكترونيات الحيوية . 85 : 32-45 . doi : 10.1016/j.bios.2016.04.091 . PMID 27155114 . 
  4. ↑ "تخليق قليل النوكليوتيدات من الحمض النووي" . ميلبور سيجما . تم الاطلاع عليه بتاريخ 4 يوليو 2022 .
  5. 1 2 إلينغتون ، أ.د.، وسزوستاك، ج.و. (أغسطس 1990). "الاختيار المختبري لجزيئات الحمض النووي الريبي التي ترتبط بروابط محددة". مجلة نيتشر . 346 (6287): 818-822 . Bibcode : 1990Natur.346..818E . doi : 10.1038/346818a0 . PMID 1697402. S2CID 4273647 .  
  6. ↑ "ἅπτω" ، Βικιлεξικό (باللغة اليونانية)، 12-03-2023 ، استرجاعها 21-03-2024
  7. ↑ "Οδύσσεια/φ - Βικιθήκη" . el.wikisource.org (باللغة اليونانية) . تم الاسترجاع 2024-03-21 .
  8. ↑ "μέρος" ، ويكاموس، القاموس الحر ، 31-05-2023 ، استرجاعها 21-03-2024
  9. ↑ تشو جي، ويلسون جي، هيبارد إل، دوان دبليو، ليدل سي، جورج جيه، تشياو إل (مارس 2016). " الأبتاميرات : جسم مضاد كيميائي واعد لعلاج السرطان" . أونكوتارجت . 7 (12): 13446-13463 . doi : 10.18632/oncotarget.7178 . PMC 4924653. PMID 26863567. S2CID 16618423 .   
  10. ↑ ميلز، د. ر.، بيترسون، ر. ل.، سبيجلمان، س. (يوليو 1967). "تجربة دارونية خارج الخلية باستخدام جزيء حمض نووي ذاتي التضاعف" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 58 (1): 217-224 . Bibcode : 1967PNAS...58..217M . doi : 10.1073/pnas.58.1.217 . PMC 335620. PMID 5231602 .  
  11. ↑ جويس، جي إف (أكتوبر 1989). "تضخيم، طفرة، واختيار الحمض النووي الريبوزي المحفز". جين . 82 (1): 83-87 . doi : 10.1016/0378-1119(89)90033-4 . PMID 2684778 . 
  12. ↑ تورك سي، جولد إل (أغسطس 1990). "التطور المنهجي للروابط عن طريق الإثراء الأسي: روابط الحمض النووي الريبي لبوليميراز الحمض النووي لبكتيريا العاثية T4". مجلة ساينس . 249 (4968): 505-510 . رمز Bibcode : 1990Sci...249..505T . doi : 10.1126/science.2200121 . PMID 2200121 . 
  13. ↑ ستولتنبرغ ر، راينمان س، ستريليتز ب (أكتوبر 2007). "SELEX - طريقة ثورية لتوليد روابط حمض نووي عالية الألفة". الهندسة الجزيئية الحيوية . 24 (4): 381-403 . doi : 10.1016/j.bioeng.2007.06.001 . PMID 17627883 . 
  14. ↑ إلينغتون، أ. د.، وسزوستاك، ج. و. (فبراير 1992). "اختيار جزيئات الحمض النووي أحادي السلسلة في المختبر والتي تتخذ بنى محددة لربط الليجاند". مجلة نيتشر . 355 (6363): 850-852 . Bibcode : 1992Natur.355..850E . doi : 10.1038/355850a0 . PMID: 1538766. S2CID : 4332485 .  
  15. ↑ بوك إل سي، غريفين إل سي، لاثام جيه إيه، فيرماس إي إتش، تول جيه جيه (فبراير 1992). "اختيار جزيئات الحمض النووي أحادي السلسلة التي ترتبط بالثرومبين البشري وتثبطه". نيتشر . 355 ( 6360): 564-566 . Bibcode : 1992Natur.355..564B . doi : 10.1038/355564a0 . PMID 1741036. S2CID 4349607 .  
  16. ↑ كوكس جيه سي، إلينغتون إيه دي (أكتوبر 2001). "الاختيار الآلي للأبتاميرات المضادة للبروتين". الكيمياء الحيوية العضوية والطبية . 9 (10): 2525-2531 . doi : 10.1016/s0968-0896(01)00028-1 . PMID 11557339 . 
  17. ↑ كوكس جيه سي، راجندران إم، ريدل تي، ديفيدسون إي إيه، سوتر إل جيه، باير تي إس، وآخرون . (يونيو 2002). "الاستحواذ الآلي على تسلسلات الأبتامر". الكيمياء التوافقية والفحص عالي الإنتاجية . 5 (4): 289-299 . doi : 10.2174/1386207023330291 . PMID 12052180 .  
  18. ↑ كوكس جيه سي، هايهرست إيه، هيسيلبيرث جيه، باير تي إس، جورجيو جي، إلينغتون إيه دي (أكتوبر 2002). " الاختيار الآلي للأبتاميرات ضد أهداف بروتينية مترجمة في المختبر: من الجين إلى الأبتامير" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 30 (20): 108e–108. doi : 10.1093/nar/gnf107 . PMC 137152. PMID 12384610 .  
  19. ↑ بريكر، آر آر (فبراير 2012). "المفاتيح الريبوزية وعالم الحمض النووي الريبوزي" . مجلة كولد سبرينغ هاربور لوجهات نظر في علم الأحياء . 4 (2) a003566. doi : 10.1101/cshperspect.a003566 . PMC 3281570. PMID 21106649 .  
  20. ↑ Svigelj R، Dossi N، Toniolo R، Miranda-Castro R، de-Los-Santos-Álvarez N، Lobo-Castañón MJ (سبتمبر 2018). “اختيار أبتامرات الحمض النووي المضادة للجلوتين في مذيب عميق سهل الانصهار”. أنجيواندتي كيمي . 57 (39): 12850– 12854. بيب كود : 2018AngCh.13013032S . دوى : 10.1002/ange.201804860 . اتش دي ال : 10651/49996 . بميد 30070419 . S2CID 240281828 .  
  21. ↑ نيفيس إم إيه، راينشتاين أو، سعد إم، جونسون بي إي (ديسمبر 2010). "تحديد متطلبات البنية الثانوية لجزيء رابط للكوكايين من خلال دراسة ديناميكية حرارية ودراسة طفرات". الكيمياء الفيزيائية الحيوية . 153 (1): 9-16 . doi : 10.1016/j.bpc.2010.09.009 . PMID 21035241 . 
  22. ↑ باو سي، غريت دي، ويلسون سي (أغسطس 2000). "2.8 البنية البلورية لأبتامر الأخضر المالاكيت". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 301 (1): 117-128 . doi : 10.1006/jmbi.2000.3951 . PMID 10926496 . 
  23. ↑ ديكمان تي، فوجيكاوا إي، تشاو إكس، شوستاك جيه، فيجون جيه (1995). "دراسات بنيوية لأبتاميرات الحمض النووي الريبي والحمض النووي في المحلول". مجلة الكيمياء الحيوية الخلوية . 59 : 13-81 . doi : 10.1002/jcb.240590703 . S2CID 221833821 . 
  24. ↑ ماسكيني م، بالتشيتي إ، تومبيلي س (فبراير 2012). "أبتاميرات الأحماض النووية والببتيدات: الأساسيات والجوانب التحليلية الحيوية". Angewandte Chemie . 51 (6): 1316–1332 . Bibcode : 2012ACIE...51.1316M . doi : 10.1002/anie.201006630 . PMID 22213382 . 
  25. ↑ ليبي ف، تشين س، تشاكرافارثي م، راكيش س، فيدو ر ن (ديسمبر 2016). "التطور المختبري للأبتاميرات الحمضية النووية المعدلة كيميائيًا: الإيجابيات والسلبيات، واستراتيجيات الاختيار الشاملة" . بيولوجيا الحمض النووي الريبي . 13 (12): 1232-1245 . doi : 10.1080/15476286.2016.1236173 . PMC 5207382. PMID 27715478 .  
  26. ↑ تشين أ، يان م، يانغ س (2016). "الأبتاميرات المنقسمة وتطبيقاتها في أجهزة الاستشعار الأبتاميرية الساندويتشية" . مجلة TrAC للاتجاهات في الكيمياء التحليلية . 80 : 581-593 . doi : 10.1016/j.trac.2016.04.006 .
  27. ↑ كينت إيه دي، سبيروبولوس إن جي، هيمسترا جيه إم (أكتوبر 2013). "نهج عام لهندسة الأبتاميرات المنقسمة للحمض النووي المرتبطة بالجزيئات الصغيرة". الكيمياء التحليلية . 85 (20): 9916-9923 . doi : 10.1021/ac402500n . PMID 24033257 . 
  28. ↑ ديبييس م، ليليفر أ، سميتانا م، مولر س (أبريل 2020). "تقسيم الأبتاميرات وإنزيمات الأحماض النووية لتطوير أجهزة استشعار حيوية متقدمة" . أبحاث الأحماض النووية . 48 (7): 3400-3422 . doi : 10.1093/nar/gkaa132 . PMC 7144939. PMID 32112111 .  
  29. ↑ دروليت، د. و.، غرين، ل. س.، غولد، ل.، جانجيك، ن. (يونيو 2016). "مناسب للعين: الأبتاميرات في اضطرابات العين" . العلاجات بالأحماض النووية . 26 (3): 127-146 . doi : 10.1089/nat.2015.0573 . PMC 4900223. PMID 26757406 .  
  30. ↑ وانغ إيه زد، فاروخزاد أو سي (مارس 2014). "التقدم الحالي في التصوير الجزيئي القائم على الأبتامير" . مجلة الطب النووي . 55 (3): 353-356 . doi : 10.2967/jnumed.113.126144 . PMC 4110511. PMID 24525205 .  
  31. ^ بانيرجي ، إس. همت، MA؛ شوبهام، س.؛ جوساي، أ. ديفاراكوندا، S .؛ جيانغ، ن.؛ جيكيانجي، C .؛ ديلارد، JA؛ موري، دبليو؛ شروتريا، ب. وآخرون. مختلفة من الناحية الهيكلية ولكنها متشابهة من الناحية الوظيفية: الأبتامرات الخاصة بالبروتين السكري القابل للذوبان في فيروس الإيبولا وGP1,2 وتطبيقاتها في الاستشعار الكهروكيميائي. كثافة العمليات. جيه مول. الخيال العلمي. 2023، 24، 4627. https://doi.org/10.3390/ijms24054627
  32. 1 2 كاور هـ، شوري م (يونيو 2019). "مستشعرات حيوية قائمة على المواد النانوية لتطبيقات التشخيص السريري والبيئي" . مجلة Nanoscale Advances . 1 (6): 2123-2138 . Bibcode : 2019NanoA...1.2123K . doi : 10.1039/C9NA00153K . PMC 9418768. PMID 36131986 .  
  33. ↑ ماليكاراتشي، ب. (يناير 2017). " تطور تقنية SELEX لتحديد الأبتاميرات ضد مستضدات سطح الخلية في الثدييات" . مجلة Molecules . 22 (2): 215. doi : 10.3390/molecules22020215 . PMC 5572134. PMID 28146093 .  
  34. ↑ بوتي إيه إس، كورينتزي كيه، فانغ إتش، جاكسون جي دبليو، تشانغ إكس، ليج جي بي، ويلسون آر سي (فبراير 2009). "التوصيف الفيزيائي الحيوي لتفاعلات الأبتامر الحمض النووي مع عامل نمو بطانة الأوعية الدموية". البوليمرات الحيوية . 91 (2): 145-156 . doi : 10.1002/bip.21097 . PMID 19025993. S2CID 23670 .  
  35. ↑ لونغ إس بي، لونغ إم بي، وايت آر آر، سولينجر بي إيه (ديسمبر 2008). " البنية البلورية لجزيء RNA مرتبط بالثرومبين" . RNA . 14 (12): 2504-2512 . doi : 10.1261/rna.1239308 . PMC 2590953. PMID 18971322 .  
  36. ↑ كون، إريك م.؛ كونوفالوف، كيريل؛ غوميز، كريستيان أ.؛ هوفر، جيليان ن.؛ ييك، أندرو كاي-هي؛ هوانغ، شوهوي؛ مارتيل، جيفري د. (2023-08-02). "أبتاميرات الحمض النووي المعدلة بالألكاين الطرفي ذات ألفة ارتباط معززة بالبروتين" . مجلة ACS للكيمياء الحيوية . 18 (9): 1976-1984 . doi : 10.1021/acschembio.3c00183 . ISSN 1554-8929 . PMID 37531184 .  
  37. ↑ دارفويل إف، ريغاداس إس، هانسن جيه بي، أوروم إتش، دي بريمو سي، تولمي جيه جيه (أكتوبر 2006). "الأبتاميرات الموجهة إلى حلقة شعرية من الحمض النووي الريبي تُظهر خصوصية مُحسَّنة مقارنةً بالأوليغونوكليوتيدات المُكمِّلة". الكيمياء الحيوية . 45 (39): 12076-12082 . doi : 10.1021/bi0606344 . PMID 17002307 . 
  38. ↑ ليو م، كاجاهارا ت، آبي هـ، إيتو ي (2009). "الاختيار المباشر في المختبر لأبتامر الحمض النووي المرتبط بالهيمين ذي النشاط البيروكسيدازي". نشرة الجمعية الكيميائية اليابانية . 82 : 99-104 . doi : 10.1246/bcsj.82.99 .
  39. ↑ مين ك، تشو م، هان س ي، شيم ي ب، كو ج، بان س (يوليو 2008). "كشف كهروكيميائي بسيط ومباشر عن إنترفيرون غاما باستخدام أبتاميرات الحمض النووي الريبي والحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين". أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 23 (12): 1819-1824 . doi : 10.1016/j.bios.2008.02.021 . PMID 18406597 . 
  40. ↑ نغ إي دبليو، شيما دي تي، كالياس بي، كانينغهام إي تي، غاير دي آر، أداميس إيه بي (فبراير 2006). "بيغابتانيب، أبتامر مضاد لـVEGF مُستهدف لأمراض الأوعية الدموية العينية". مجلة نيتشر ريفيوز. اكتشاف الأدوية . 5 (2): 123-132 . doi : 10.1038/nrd1955 . PMID 16518379. S2CID 8833436 .  
  41. ↑ مقدم، فاطمة مرتضوي؛ رحائي، مهدي (مايو 2019). "مستشعر نانوي حيوي يعمل بإشارة للكشف عن VEGF165 يعتمد على تجمعات نانوية من النحاس فوق الجسيمات المتكونة على أبتامر ثنائي التكافؤ" . أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 132 : 186-195 . doi : 10.1016/j.bios.2019.02.046 . PMID 30875630. S2CID 80613434 .  
  42. ↑ سافوري ن، آبي ك، سودي ك، إيكيبوكورو ك (ديسمبر 2010). "اختيار الأبتامر الحمض النووي ضد مستضد البروستات النوعي باستخدام خوارزمية جينية وتطبيقه في الاستشعار". أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 26 (4): 1386-1391 . doi : 10.1016/j.bios.2010.07.057 . PMID 20692149 . 
  43. ↑ جيونغ إس، هان إس آر، لي واي جيه، لي إس دبليو (مارس 2010). "اختيار الأبتاميرات الحمضية النووية الريبية النوعية لمستضد البروستات النوعي النشط". رسائل التكنولوجيا الحيوية . 32 (3): 379-385 . doi : 10.1007/s10529-009-0168-1 . PMID 19943183. S2CID 22201181 .  
  44. ↑ والش ر، ديروزا م.س. (أكتوبر 2009). "الاحتفاظ بالوظيفة في نظير الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) لجزيء الحمض النووي الريبوزي (RNA) الخاص بالأبتامر الدوباميني". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 388 (4): 732-735 . رمز Bibcode : 2009BBRC..388..732W . doi : 10.1016/j.bbrc.2009.08.084 . PMID 19699181 . 
  45. ↑ سالامانكا، هـ. هـ.، أنتونياك، م. أ.، سيريوني، ر. أ.، شي، هـ.، ليس، ج. ت. (2014). "تثبيط عامل الصدمة الحرارية 1 في خلايا السرطان البشري باستخدام أبتامر RNA قوي" . PLOS ONE . 9 (5) e96330. Bibcode : 2014PLoSO...996330S . doi : 10.1371/journal.pone.0096330 . PMC 4011729. PMID 24800749 .  
  46. ↑ فاروخزاد ، أو سي، كارب، جيه إم، لانجر، آر (مايو 2006). "المركبات الحيوية النانوية المرتبطة بالأبتاميرات لاستهداف السرطان". رأي الخبراء في توصيل الأدوية . 3 (3): 311-324 . doi : 10.1517/17425247.3.3.311 . PMID 16640493. S2CID 37058942 .  
  47. ↑ بروسكي د، جيلش س، ووبفنر ف، شاتزل هـ م، وينكر إي إل، فامولوك م (أغسطس 2002). "يُقلل الأبتامر المُختص ببروتين البريون من تكوين PrPSc". ChemBioChem . 3 (8): 717–725 . doi : 10.1002/1439-7633(20020802)3:8 < 717::AID - CBIC717 > 3.0.CO ; 2-C . PMID 12203970. S2CID 36801266 .  
  48. ↑ كور هـ، شوري م، شارما م، جانجولي أ.ك، سابروال ب (ديسمبر 2017). "مستشعر حيوي مُعدَّل بالجرافين المُقوّى للكشف عن بكتيريا الإشريكية القولونية الممرضة O78:K80:H11". أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 98 : 486-493 . doi : 10.1016/j.bios.2017.07.004 . PMID 28728009 . 
  49. 1 2 3 آشا ك، كومار ب، سانيكاس م، ميسيكو سي إيه، خانا م، كومار ب (ديسمبر 2018). " التطورات في العلاجات القائمة على الأحماض النووية ضد العدوى الفيروسية التنفسية" . مجلة الطب السريري . 8 (1): 6. doi : 10.3390/jcm8010006 . PMC 6351902. PMID 30577479 .  
  50. ↑ شميتز أ، ويبر أ، باين م، برويرز س، فيبرغ ف، فامولوك م، ماير ج (أبريل 2021). "أبتامر الحمض النووي المرتبط ببروتين سبايك لفيروس سارس-كوف-2 والذي يثبط عدوى الفيروسات الكاذبة بآلية مستقلة عن نطاق ربط المستقبلات*" . Angewandte Chemie . 60 (18): 10279–10285 . doi : 10.1002/anie.202100316 . PMC 8251191. PMID 33683787 .  
  51. ↑ دار ب، ساماراسينغ ر.م، شيغدار س (أبريل 2020). "الأجسام المضادة، الأجسام النانوية، أم الأبتاميرات - أيها الأفضل لفك شفرة بروتينات الأنواع غير النموذجية؟" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 21 (7): 2485. doi : 10.3390/ijms21072485 . PMC 7177290. PMID 32260091 .  
  52. 1 2 باور م، ستروم م، هاموند د.س، شيغدار س (نوفمبر 2019). "أي شيء يمكنك فعله، يمكنني فعله بشكل أفضل: هل يمكن للأبتاميرات أن تحل محل الأجسام المضادة في تطبيقات التشخيص السريري؟" . مجلة Molecules . 24 (23): 4377. doi : 10.3390/molecules24234377 . PMC 6930532. PMID 31801185 .  
  53. ↑ فينغ إس، تشين سي، وانغ دبليو، كيو إل (مايو 2018). "مستشعر دقيق مزود بمسام نانوية من نوع الأبتامر للكشف عن الثيوفيلين" . أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 105 : 36-41 . doi : 10.1016/j.bios.2018.01.016 . PMID 29351868 . 
  54. ↑ سونغ سي (2017). "الكشف عن هرمون النبات حمض الأبسيسيك (ABA) باستخدام مستشعر بصري قائم على الأبتامر مع واجهة شعرية ميكروفلويدية". المؤتمر الدولي الثلاثون لأنظمة الكهروميكانيكية الدقيقة (MEMS) لعام 2017. الصفحات 370-373 . doi : 10.1109/MEMSYS.2017.7863418 . ISBN  978-1-5090-5078-9. S2CID 20781208 . 
  55. ↑ موزينسكا ك، أوستروسكا د، بارتنيكي إف، كوالسكا إي، بوداشيفسكا-لوباش إم، هيرمانوفيتش بي، وآخرون . (2017). "اختيار وتحليل DNA aptamer المرتبط بـ α-amanitin من Amanita phalloides" . اكتا بيوتشيميكا بولونيكا . 64 (3): 401-406 . دوى : 10.18388/abp.2017_1615 . بميد 28787470 . S2CID 3638299 .   
  56. ↑ بينر ج (يوليو 2012). "تسويق اختبار تشخيصي قائم على الأبتامر" (ملف PDF) . نيوفينتشرز .
  57. ↑ وي هـ، لي ب، لي ج، وانغ إي، دونغ س (سبتمبر 2007). "استشعار لوني بسيط وحساس للبروتين باستخدام مجسات جسيمات الذهب النانوية غير المعدلة بتقنية الأبتامر". مجلة الاتصالات الكيميائية (36): 3735-3737 . doi : 10.1039/B707642H . PMID 17851611 . 
  58. ↑ تشنغ هـ، تشيو إكس، تشاو إكس، مينغ دبليو، هوو دي، وي هـ (مارس 2016). "مسبار حمض نووي وظيفي للرصد المتوازي للبوتاسيوم (K+) وبروتوبورفيرين IX في الكائنات الحية". الكيمياء التحليلية . 88 (5): 2937-2943 . doi : 10.1021/acs.analchem.5b04936 . PMID 26866998 . 
  59. ↑ شيانغ ي، لو ي (يوليو 2011). "استخدام أجهزة قياس الجلوكوز الشخصية ومستشعرات الحمض النووي الوظيفية لتحديد كمية مجموعة متنوعة من الأهداف التحليلية" . مجلة نيتشر كيمستري . 3 (9): 697-703 . Bibcode : 2011NatCh...3..697X . doi : 10.1038/nchem.1092 . PMC 3299819. PMID 21860458 .  
  60. ↑ Agnivo Gosai, Brendan Shin Hau Yeah, Marit Nilsen-Hamilton, Pranav Shrotriya, "الكشف عن الثرومبين بدون علامات في وجود تركيز عالٍ من الألبومين باستخدام غشاء نانوي مسامي وظيفي بالأبتامر"، Biosensors and Bioelectronics ، المجلد 126، 2019، الصفحات 88-95، ISSN 0956-5663 ، doi : 10.1016/j.bios.2018.10.010 . 
  61. ↑ أميرو ب، خاتوا س، رودريغيز-أغوايو س، لوبيز-بيريستين ج (أكتوبر 2020). "الأبتاميرات: علاجات جديدة ودور محتمل في علم الأورام العصبية" . مجلة السرطانات . 12 (10): 2889. doi : 10.3390/cancers12102889 . PMC 7600320. PMID 33050158 .  
  62. ↑ فتال إي، هيليرو إتش، إسماعيل إس آي (سبتمبر 2018). "الأبتاميرات في العلاجات وإيصال الأدوية". مراجعات متقدمة لإيصال الأدوية . 134 : 1-2 . doi : 10.1016/j.addr.2018.11.001 . PMID 30442313. S2CID 53562925 .  
  63. ↑ هافنر م، فيانيني إ، ألبرتوني ب، ماركيتي ل، غرون إ، غلوكنر س، فامولوك م (2008). "إزاحة الأبتاميرات المرتبطة بالبروتين بجزيئات صغيرة تم فحصها بواسطة استقطاب التألق". بروتوكولات الطبيعة . 3 (4): 579-587 . doi : 10.1038/nprot.2008.15 . PMID 18388939. S2CID 4997899 .  
  64. ↑ هوانغ ز، تشيو ل، تشانغ ت، تان و (2021-02-03). "دمج تقنية النانو الحمض النووي مع الأبتاميرات للتطبيقات البيولوجية والطبية الحيوية" . ماتير . 4 (2): 461-489 . doi : 10.1016/j.matt.2020.11.002 . ISSN 2590-2385 . S2CID 234061584 .  
  65. ↑ رينو إل، بوشيه-سبينيلي أ، رايلون سي، بوهو أ (أغسطس 2020). "الاستشعار باستخدام المسام النانوية والأبتاميرات: طريق للمستقبل" . مجلة الحساسات . 20 (16): 4495. رمز Bibcode : 2020Senso..20.4495R . doi : 10.3390/s20164495 . PMC 7472324. PMID 32796729 .  
  66. ↑ يانغ واي، ين إس، لي واي، لو دي، تشانغ جيه، صن سي (2017). "تطبيق الأبتاميرات في الكشف عن المضادات الحيوية وتنقيتها الكروماتوغرافية في مصفوفات مختلفة" . مجلة TrAC Trends in Analytical Chemistry . 95 : 1-22 . doi : 10.1016/j.trac.2017.07.023 . تاريخ الاسترجاع: 4 يوليو 2022 .
  67. ↑ مورفي إم بي، فولر إس تي، ريتشاردسون بي إم، دويل إس إيه (سبتمبر 2003). "طريقة محسّنة للتطور المختبري للأبتاميرات وتطبيقاتها في الكشف عن البروتينات وتنقيها" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 31 (18): 110e–110. doi : 10.1093/nar/gng110 . PMC 203336. PMID 12954786 .  
  68. ↑ تشين ك، تشو ج، شاو ز، ليو ج، سونغ ج، وانغ ر، وآخرون . (يوليو 2020). "الأبتاميرات كأدوات جزيئية متعددة الاستخدامات لرصد إنتاج الأجسام المضادة ومراقبة الجودة". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 142 (28): 12079-12086 . Bibcode : 2020JAChS.14212079C . doi : 10.1021/jacs.9b13370 . PMID 32516525. S2CID 219564070 .   
  69. ↑ كييجر جيه إف، ألبادا بي (مارس 2022). "تعديل البروتين الانتقائي للموقع بمساعدة الحمض النووي" . البوليمرات الحيوية . 113 (3) e23483. doi : 10.1002/bip.23483 . PMC 9285461. PMID 34878181. S2CID 244954278 .   
  70. ↑ سميث د، كولينز ب د، هيل ج، كوخ ت هـ (يناير 2003). "حساسية ونوعية مجسات الفوتوبابتامر" . علم البروتينات الجزيئي والخلوي . 2 (1): 11-18 . doi : 10.1074/mcp.m200059-mcp200 . PMID 12601078. S2CID 13406870 .  
  71. ^ فينكنبورغ جي إل، ماير جي، فامولوك إم (سبتمبر 2012). "وضع العلامات على البروتينات المبنية على الأبتمر" . أنجيواندتي كيمي . 51 (36): 9176– 9180. بيب كود : 2012ACIE...51.9176V . دوى : 10.1002/anie.201204174 . بميد 22865679 . 
  72. ↑ كييجر جيه إف، فايرت جيه، ألبادا بي (ديسمبر 2021). "أستلة الثرومبين الانتقائية للموقع والمستحثة باستخدام مقترنات الأبتامر-المحفز" . مجلة الاتصالات الكيميائية . 57 (96): 12960-12963 . doi : 10.1039/d1cc05446e . PMID 34792071. S2CID 243998479 .  
  73. ↑ ويلسون، براندون د.؛ سوه، هـ. توم (2020-08-01). "إعادة تقييم الحكمة التقليدية حول فحوصات الارتباط" . اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 45 (8): 639-649 . doi : 10.1016/j.tibs.2020.04.005 . ISSN 0968-0004 . PMC 7368832. PMID 32402748 .   
  74. ↑ جانسون، جان-كريستر (2012-01-03). تنقية البروتين: المبادئ، وطرق الدقة العالية، والتطبيقات . جون وايلي وأولاده. ISBN 978-1-118-00219-3.
  75. ↑ تشين أ، يانغ س (سبتمبر 2015). "استبدال الأجسام المضادة بالأبتاميرات في المقايسة المناعية للتدفق الجانبي". أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 71 : 230-242 . doi : 10.1016/j.bios.2015.04.041 . PMID 25912679 . 
  76. ↑ توه إس واي، سيتارتان إم، جوبيناث إس سي، تانغ تي إتش (فبراير 2015). "الأبتاميرات كبديل للأجسام المضادة في مقايسة الامتصاص المناعي المرتبط بالإنزيم". أجهزة الاستشعار الحيوية والإلكترونيات الحيوية . 64 : 392-403 . doi : 10.1016/j.bios.2014.09.026 . PMID 25278480 . 
  77. ↑ برونو جي جي، سيفيلز جي سي (2016). "التلطيخ الغربي باستخدام الأبتاميرات لبروتينات الغشاء الخارجي لبكتيريا الإشريكية القولونية وعوامل الضراوة الرئيسية في الأنماط المصلية الممرضة للإشريكية القولونية" . الأبتاميرات والأجسام المضادة الاصطناعية .
  78. ↑ باور م، ماكدونالد ج، هنري ج، دوان و، شيغدار س (يونيو 2016). "تطبيق الأبتاميرات في الكيمياء المناعية النسيجية". العلاجات بالأحماض النووية . 26 (3): 120-126 . doi : 10.1089/nat.2015.0569 . PMID 26862683 . 
  79. ↑ ماير م، شيبر ت، والتر ج.ج. (أغسطس 2013). "الأبتاميرات: مجسات متعددة الاستخدامات لقياس التدفق الخلوي". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والتكنولوجيا الحيوية . 97 (16): 7097-7109 . doi : 10.1007/s00253-013-5070-z . PMID 23838792. S2CID 13996688 .  
  80. ↑ تشو جيه، روسي جيه (مارس 2017). "الأبتاميرات كعلاجات موجهة: الإمكانات والتحديات الحالية" . مجلة نيتشر ريفيوز. اكتشاف الأدوية . 16 (3): 181-202 . doi : 10.1038/nrd.2016.199 . PMC 5700751. PMID 27807347 .  
  81. ↑ برونو جي جي (أبريل 2015). " التنبؤ بالمستقبل غير المؤكد للتشخيص والعلاج القائم على الأبتاميرات" . مجلة Molecules . 20 (4): 6866–6887 . doi : 10.3390/molecules20046866 . PMC 6272696. PMID 25913927 .  
  82. ↑ وانغ تي، تشين سي، لارشير إل إم، باريرو آر إيه، فيدو آر إن (2019). "ثلاثة عقود من تقنيات الأبتاميرات الحمضية النووية: الدروس المستفادة، والتقدم المحرز، والفرص المتاحة في تطوير الأبتاميرات" . مجلة التقدم في التكنولوجيا الحيوية . 37 (1): 28-50 . doi : 10.1016/j.biotechadv.2018.11.001 . PMID 30408510. S2CID 53242220 .  
  83. ↑ ملبورن ج، بيشوب ب، براون ج، ستودارت ج (أكتوبر 2016). "نهج متعدد الأوجه لتحقيق القبول العالمي لأساليب البحث الخالية من الحيوانات" . بدائل حيوانات المختبر . 44 (5): 495-498 . doi : 10.1177/026119291604400511 . PMID 27805832. S2CID 1002312 .  
  84. ↑ الفالح، م. أ.، الصعب، هـ. أ.، محمود، أ. ب.، الكيال، أ. أ.، جونز، م. ل.، ماهلر، س. م.، هاشم، أ. م. (2020). "الأجسام المضادة وحيدة النسيلة المشتقة من عرض العاثيات: من المختبر إلى سرير المريض" . مجلة فرونتيرز في علم المناعة . 11 1986. doi : 10.3389/fimmu.2020.01986 . PMC 7485114. PMID 32983137 .  
  85. ↑ سونتورنوراجيت ب، تشو ج، شو إم تي، فان تي إتش، وانغ واي (مارس 2010). "تفعيل الهيدروجيل باستخدام أبتاميرات الحمض النووي لإطلاق مستدام لعامل نمو الصفائح الدموية-BB". مجلة الاتصالات الكيميائية . 46 (11): 1857-1859 . doi : 10.1039/B924909E . PMID 20198232 . 
  86. ↑ باتيغ إم آر، سونتورنووراجيت بي، وانغ واي (أغسطس 2012). "إطلاق مُبرمج لأدوية بروتينية متعددة من هيدروجيلات مُعدَّلة بالأبتاميرات عبر تهجين الأحماض النووية". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 134 (30): 12410-12413 . Bibcode : 2012JAChS.13412410B . doi : 10.1021/ja305238a . PMID 22816442 . 
  87. ↑ ستيسكالوفا أ، أوليفا ن، إنجلاند إف جيه، ألمكويست بي دي (فبراير 2019). "إطلاق انتقائي للخلايا مستوحى بيولوجيًا لعوامل النمو المحصورة بالأبتاميرات بواسطة قوى الشد" . المواد المتقدمة . 31 (7) e1806380. Bibcode : 2019AdM....3106380S . doi : 10.1002/adma.201806380 . PMC 6375388. PMID 30614086 .  
  88. ^ هو، المجدلية ي.؛ أوليفا، نوريا؛ باسو، كريستوفر. رودريجيز، ماركوس ر.؛ دوران موتا، خوسيه أنطونيو؛ جولابالي، ديفيا م.؛ شواركبيرج، فيكتور ج.؛ اخفاني، مو؛ كوين، كايل ب. المكويست ، بنيامين د. (27/07/2026). "المواد الحيوية المستجيبة للقوة تدفع إصلاح الأنسجة عن طريق تسخير عوامل النمو الداخلية" . مواد الطبيعة : 1– 12. دوى : 10.1038/s41563-026-02682-8 . ردمك 1476-4660 . 
  89. ↑ رانا د، رانجيل ف ر، بادمانابان ب، تريكاليتيس ف د، كاندار أ، كيم ه و، روكيما ج (2024-11-01). "الطباعة الحيوية للأحبار الحيوية القابلة للبرمجة القائمة على الأبتاميرات لتعديل التكوين المورفولوجي للأوعية الدموية الدقيقة متعددة المقاييس في أربعة أبعاد" . مواد الرعاية الصحية المتقدمة . 14 (1) 2402302. doi : 10.1002/adhm.202402302 . PMC 11694088. PMID 39487611 .  
  90. ↑ رانا د، كاندار أ، صالحي نيك ن، إنجي إ، كوبمان ب، روكيما ج (23 أكتوبر 2021). "إطلاق عامل النمو بوساطة الأبتاميرات، والمتحكم فيه مكانيًا وزمنيًا، يُؤثر موضعيًا على تكوين الأوعية الدموية الدقيقة داخل الأنسجة المُهندسة" . المواد النشطة بيولوجيًا . 12 : 71-84 . doi : 10.1016/j.bioactmat.2021.10.024 . PMC 8777207. PMID 35087964 .  
  91. ↑ بيريزوفسكي إم في، ليخمان إم، موشيف إم يو، ماك تي دبليو، كريلوف إس إن (يوليو 2008). "اكتشاف المؤشرات الحيوية بمساعدة الأبتامير (AptaBiD)". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 130 (28): 9137-9143 . Bibcode : 2008JAChS.130.9137B . doi : 10.1021/ja801951p . PMID 18558676 . 
  92. ↑ كولاس ب، كوهين ب، جيسن ت، غريشينا إ، مكوي ج، برنت ر (أبريل 1996). "الاختيار الجيني للأبتاميرات الببتيدية التي تتعرف على كيناز 2 المعتمد على السيكلين وتثبطه". نيتشر . 380 ( 6574): 548-550 . Bibcode : 1996Natur.380..548C . doi : 10.1038/380548a0 . PMID 8606778. S2CID 4327303 .  
  93. ↑ نولان، جي بي (يناير 2005). "الضفادع الصغيرة من ذيولها". مجلة نيتشر ميثودز . 2 (1): 11-12 . doi : 10.1038/nmeth0105-11 . PMID 15782163. S2CID 1423778 .  
  94. ↑ سبولار آر إس، ريكورد إم تي (فبراير 1994). "اقتران الطي الموضعي بالارتباط الموضعي للبروتينات بالحمض النووي". مجلة ساينس . 263 (5148): 777-784 . Bibcode : 1994Sci...263..777S . doi : 10.1126/science.8303294 . PMID 8303294 . 
  95. ↑ هوانغ جيه، رو بي، تشو بي، ني إف، يانغ جيه، وانغ إكس، وآخرون . (يناير 2012). "MimoDB 2.0: قاعدة بيانات للمحاكيات وما بعدها" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 40 (عدد قواعد البيانات): D271– D277 . doi : 10.1093/nar/gkr922 . PMC 3245166. PMID 22053087 .   
  96. ↑ "MimoDB: قاعدة بيانات mimotope وما بعدها" . immunot.cn . مؤرشف من الأصل بتاريخ 16-11-2012 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 03-02-2016 .
  97. ↑ غيير سي آر، كولمان-ليرنر إيه، برنت آر (يوليو 1999). ""تحديد أعضاء الشبكة الجينية وروابط المسارات باستخدام تقنية "الطفرات المُحفزة" بواسطة الأبتاميرات الببتيدية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 (15): 8567-8572 . Bibcode : 1999PNAS...96.8567G . doi : 10.1073 / pnas.96.15.8567 . PMC 17557. PMID 10411916 .  
  98. ↑ ديبينيديتو إس، كلويه دي، ستيب بي إن، بوملي في، ليو جيه، تيرو آر، وآخرون (يوليو 2013). "الكالسينيورين أ مقابل NS5A-TP2/HD domain containing 2: دراسة حالة للطفرات العشوائية منخفضة التردد الموجهة للموقع لتحليل خصوصية الهدف للأبتاميرات الببتيدية" . علم البروتينات الجزيئي والخلوي . 12 (7): 1939-1952 . doi : 10.1074/mcp.M112.024612 . PMC 3708177. PMID 23579184 .   
  99. ↑ كولاس، ب.، كوهين، ب.، كو فيرينيو، ب.، سيلفر، ب.أ.، برنت، ر. (ديسمبر 2000). "التعديل والنقل الموجه للبروتينات الخلوية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 97 (25): 13720-13725 . Bibcode : 2000PNAS...9713720C . doi : 10.1073 /pnas.97.25.13720 . PMC 17642. PMID 11106396 .  
  100. ↑ "إدارة الغذاء والدواء الأمريكية توافق على دواء ماكوجين من شركة آي تيك/فايزر" . مراجعة طب العيون . تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 يونيو 2022 .
  101. ↑ دوت، س. "سومالوجيك وإلومينا تجمعان نقاط قوتهما لدفع الابتكار في علم البروتينات" . بيوسبيس . تم الاطلاع عليه في 30 يونيو 2022 .
  102. ↑ "Apta-Index™ (قاعدة بيانات الأبتامر) - مكتبة تضم أكثر من 500 أبتامر" . شركة أبتاجين المحدودة . تم الاطلاع عليه بتاريخ 16 ديسمبر 2022 .

للمزيد من القراءة