الحرب الشيشانية الثانية

الشيشان منطقة تقع في شمال القوقاز، وقد خاضت نضالاً مستمراً ضد الحكم الأجنبي، بما في ذلك الحكم العثماني في القرن الخامس عشر. تأسس جيش القوزاق الروسي في نهر تيريك في سهول الشيشان عام 1577 على يد قوزاق أحرار أُعيد توطينهم من نهر الفولغا إلى نهر تيريك . وفي عام 1783، وقّعت الإمبراطورية الروسية ومملكة كارتلي كاخيتي الجورجية معاهدة جورجيفسك ، التي بموجبها أصبحت كارتلي كاخيتي محمية روسية . ^{[ 38 ]} سعياً لتأمين الاتصالات مع جورجيا ومناطق أخرى من القوقاز ، بدأت الإمبراطورية الروسية بتوسيع نفوذها في منطقة القوقاز ، مما أشعل فتيل حرب القوقاز عام 1817. توغلت القوات الروسية أولاً في مرتفعات الشيشان عام 1830، واستمر الصراع في المنطقة حتى عام 1859، حين تمكن جيش قوامه 250 ألف جندي بقيادة الجنرال ألكسندر بارياتينسكي من سحق مقاومة سكان المرتفعات. وشهدت منطقة القوقاز انتفاضات متكررة خلال الحرب الروسية التركية (1877-1878) .

عقب الثورة الروسية عام 1917 ، أسس الشيشان إمامة قوقازية قصيرة الأجل شملت أجزاءً من الشيشان وداغستان وإنغوشيا ؛ كما كانت هناك جمهورية شمال القوقاز الجبلية العلمانية . ^{[ 39 ]} وقد هُزمت معظم المقاومة على يد القوات البلشفية بحلول عام 1922. ثم ، قبل أشهر من قيام الاتحاد السوفيتي ، أُنشئت مقاطعة الشيشان ذاتية الحكم التابعة لجمهورية روسيا الاتحادية الاشتراكية السوفيتية، والتي ضمت جزءًا من أراضي جيش تيريك القوزاقي السابق . وشكّلت الشيشان وإنغوشيا المجاورة جمهورية الشيشان-إنغوشيا الاشتراكية السوفيتية ذاتية الحكم عام 1936. وفي عام 1941، خلال الحرب العالمية الثانية ، اندلعت ثورة شيشانية صغيرة بقيادة حسن إسرائيلوف . في عام 1944، تم ترحيل جميع الشيشان إلى جمهورية كازاخستان الاشتراكية السوفيتية وجمهورية قيرغيزستان الاشتراكية السوفيتية في عملية تطهير عرقي ، وذلك بذريعة كاذبة هي تعاون الشيشان الجماعي مع ألمانيا النازية . وتشير التقديرات إلى أن ما بين ربع وثلث سكان الشيشان لقوا حتفهم نتيجة الظروف القاسية. ^{[ 40 ] [ 41 ] [ 42 ]} ويعترف العديد من الباحثين بأن الترحيل كان عملاً من أعمال الإبادة الجماعية ، كما فعل البرلمان الأوروبي في عام 2004. ^{[ 43 ] [ 44 ] [ 45 ]} وفي عام 1992، شيدت الحكومة الانفصالية نصبًا تذكاريًا لضحايا أحداث عام 1944 ، إلا أن الحكومة الموالية لروسيا قامت لاحقًا بهدم هذا النصب. ^{[ 46 ] [ 47 ]} عُثر على شواهد قبور كانت جزءًا لا يتجزأ من النصب التذكاري مزروعة في ساحة أحمد قديروف بجوار مسلات من الجرانيت تُخلّد ذكرى خسائر القوة المحلية الموالية لروسيا. ^{[ 48 ]}

خلال تفكك الاتحاد السوفيتي عام 1991، اندلعت ثورة مناهضة للسوفيت في الشيشان، أسفرت في نهاية المطاف عن إعلانها الاستقلال . وفي عام 1992، وقّع قادة الشيشان والإنغوش اتفاقيةً لتقسيم الجمهورية الشيشانية-الإنغوشية المشتركة إلى قسمين، حيث انضمت إنغوشيا إلى الاتحاد الروسي، بينما بقيت الشيشان مستقلة. وأدى التوتر بين الشيشان وروسيا بشأن الاستقلال في نهاية المطاف إلى تدخل روسي في الجمهورية ، حيث حاول الروس سرًا الإطاحة بحكومة جوهر دوداييف . بدأت الحرب الشيشانية الأولى عام 1994، عندما دخلت القوات الروسية الشيشان بحجة استعادة النظام الدستوري. وبعد ما يقرب من عامين من القتال الوحشي، الذي تجاوزت حصيلة قتلاه 100 ألف قتيل وفقًا لبعض التقديرات، تم توقيع اتفاقية وقف إطلاق النار في خاسافيورت عام 1996 ، وانسحبت القوات الروسية من الجمهورية. ^{[ 49 ]}

عارض أمراء الحرب المتطرفون، مثل أربي باراييف ، سلطة الحكومة في غروزني ، والذي كان، وفقًا لبعض المصادر، متعاونًا مع جهاز الأمن الفيدرالي الروسي . ^{[ 50 ]} بلغت عمليات الخطف في الشيشان مستويات واسعة، ووصل إجمالي العائدات إلى عشرات الملايين من الدولارات. ^{[ 51 ]} في عام 1998، قُتلت مجموعة من أربعة رهائن غربيين . واتُهمت أجهزة الاستخبارات الروسية بالتورط في عمليات الخطف. ^{[ 52 ]} في عام 1998، أعلنت السلطات في غروزني حالة الطوارئ . وفي يوليو/تموز من العام نفسه، وقعت مواجهة في غوديرمس بين قوات الحرس الوطني الشيشاني وفصيل أصولي، أسفرت عن سقوط العديد من الضحايا. ^{[ 53 ]}

ربط بعض الباحثين المقاومة الشيشانية لروسيا بحركة الجهاد العالمي التابعة لتنظيم القاعدة . ووفقًا لجوردون هان، فإنّ الروابط بين جمهورية الشيشان إشكيريا وتنظيم القاعدة "كانت معروفة على نطاق واسع بحلول أواخر التسعينيات بين مسؤولي الحكومة الأمريكية ومحللي الاستخبارات وخبراء مكافحة الإرهاب"، وكان هناك نحو خمسمئة مقاتل جهادي أجنبي في الشيشان مع بداية الحرب الثانية. ^{[ 54 ] [ 55 ]} وقد نظر معظم المراقبين الغربيين قبل أحداث 11 سبتمبر/أيلول إلى مزاعم الحكومة الروسية بوجود صلات لتنظيم القاعدة بعين الشك. ورفضت إدارتا كلينتون وبوش، بالإضافة إلى حكومات أخرى في حلف الناتو، بشكل موحد خطاب موسكو بشأن وجود شيشانيين في أفغانستان وأفغان في الشيشان، معتبرةً إياه " دعاية تحريضية" على الطريقة السوفيتية، إلى أن وقعت أحداث 11 سبتمبر/أيلول . ^{[ 56 ]}

تأججت التوترات السياسية جزئيًا بسبب أنشطة إرهابية وإجرامية يُزعم أنها صادرة عن شيشان أو مؤيدين للشيشان في روسيا، فضلًا عن الاشتباكات الحدودية. في 16 نوفمبر/تشرين الثاني 1996، في كاسبيسك (داغستان)، دمر انفجار قنبلة مبنى سكنيًا يضم حرس الحدود الروسي، ما أسفر عن مقتل 68 شخصًا. لم يُحدد سبب الانفجار قط، لكن الكثيرين في روسيا ألقوا باللوم على الانفصاليين الشيشان. ^{[ 57 ]} وفي 23 أبريل/نيسان 1997، لقي ثلاثة أشخاص حتفهم عندما انفجرت قنبلة في محطة قطارات أرمافير الروسية ( كراسنودار كراي )، وشخصان في 28 مايو/أيار 1997، عندما انفجرت قنبلة أخرى في محطة قطارات بياتيغورسك الروسية ( ستافروبول كراي ). في 22 ديسمبر 1997، شنت قوات من المسلحين الداغستانيين وأمير الحرب العربي ابن الخطاب، المتمركز في الشيشان ، غارة على قاعدة اللواء 136 من المشاة الآلية التابع للجيش الروسي في بويناكسك ، داغستان، مما أسفر عن خسائر فادحة. ^{[ 58 ]}

أوصلت انتخابات عام 1997 الرئيس الانفصالي أصلان مسخادوف إلى السلطة . وفي عامي 1998 و1999، نجا الرئيس مسخادوف من عدة محاولات اغتيال، ^{[ 59 ]} نُسبت إلى أجهزة المخابرات الروسية. وفي مارس/آذار 1999، اختُطف الجنرال غينادي شبيغون ، مبعوث الكرملين إلى الشيشان، من مطار غروزني، ووُجد ميتًا في نهاية المطاف عام 2000 أثناء الحرب. وفي 7 مارس/آذار 1999، ردًا على اختطاف الجنرال شبيغون، دعا وزير الداخلية سيرغي ستيباشين إلى غزو الشيشان. إلا أن رئيس الوزراء يفغيني بريماكوف رفض خطة ستيباشين . ^{[ 60 ]} وصرح ستيباشين لاحقًا: ^{[ 61 ]}

اتُخذ قرار غزو الشيشان في مارس/آذار 1999... كنتُ مستعدًا لتدخلٍ فعلي. كنا نخطط للتواجد على الضفة الشمالية لنهر تيريك بحلول أغسطس/أيلول [من عام 1999]. كان هذا [الحرب] سيحدث بغض النظر عن القصف في موسكو ... لم يكتشف بوتين أي جديد. يمكنك سؤاله عن ذلك. كان مديرًا لجهاز الأمن الفيدرالي آنذاك، وكان على درايةٍ كاملةٍ بالمعلومات. ^{[ 62 ] [ 63 ]}

بحسب روبرت بروس وير ، ينبغي اعتبار هذه الخطط خططًا احتياطية. مع ذلك، دعا ستيباشين صراحةً إلى حملة عسكرية ضد الانفصاليين الشيشان في أغسطس/آب 1999 عندما كان رئيسًا لوزراء روسيا. ولكن بعد فترة وجيزة من مقابلته التلفزيونية التي تحدث فيها عن خطط لإعادة النظام الدستوري إلى الشيشان، حلّ فلاديمير بوتين محله في منصب رئيس الوزراء. ^{[ 64 ]}

في أواخر مايو/أيار 1999، أعلنت روسيا إغلاق حدودها مع الشيشان في محاولة لمكافحة الهجمات والأنشطة الإجرامية؛ ^{[ 65 ]} وأُمرت قوات حرس الحدود بإطلاق النار على المشتبه بهم فور رؤيتهم. ^{[ 66 ]} وفي 18 يونيو/حزيران 1999، قُتل سبعة عسكريين في هجوم على مراكز حرس الحدود الروسية في داغستان. ^{[ 67 ]} وفي 29 يوليو/تموز 1999، دمرت قوات وزارة الداخلية الروسية مركزًا حدوديًا شيشانيًا بالقرب من مدينة كيزليار، وتوغلت عدة كيلومترات داخل الشيشان. ^{[ 68 ]} وفي 22 أغسطس/آب 1999، قُتل عشرة من رجال الشرطة الروس بانفجار لغم مضاد للدبابات في أوسيتيا الشمالية ، وفي 9 أغسطس/آب 1999، اختُطف ستة عسكريين في فلاديكافكاز، عاصمة أوسيتيا .

في 7 أغسطس/آب 1999، قاد شامل باساييف، برفقة ابن الخطاب، مجموعتين من المجاهدين الشيشان والداغستانيين والعرب، بلغ عددهم حوالي 2000 مجاهد ، من الشيشان إلى جمهورية داغستان المجاورة. شهدت هذه الحرب أول استخدام (غير مؤكد) من جانب روسيا للمتفجرات الهوائية التي تُلقى من الجو في المناطق الجبلية، ولا سيما في قرية تاندو . ^{[ 69 ]} وبحلول منتصف سبتمبر/أيلول 1999، تم دحر المسلحين من القرى التي استولوا عليها، وتراجعوا إلى الشيشان. ووفقًا لروسيا، قُتل مئات المسلحين في القتال، بينما أفاد الجانب الروسي بمقتل 275 جنديًا وإصابة نحو 900 آخرين. ^{[ 70 ]}

قبل أن تهدأ تداعيات حملة داغستان، وقعت سلسلة من التفجيرات في روسيا (في موسكو وفولغودونسك وبويناكسك). في 4 سبتمبر / أيلول 1999، لقي 62 شخصًا حتفهم في مبنى سكني يقطنه أفراد من عائلات جنود روس. وعلى مدى الأسبوعين التاليين، استهدفت القنابل ثلاثة مبانٍ سكنية أخرى ومركزًا تجاريًا؛ وبلغ إجمالي عدد القتلى أكثر من 350 شخصًا. سارع رئيس الوزراء آنذاك، بوتين، إلى إلقاء اللوم في الهجمات على مسلحين شيشانيين، وعلى الرغم من عدم وجود أي دليل يربط التفجيرات بالشيشان، فقد أمر بشن حملة قصف على الشيشان. ^{[ 71 ]} في فبراير/شباط 2000، صرحت وزيرة الخارجية الأمريكية ، مادلين أولبرايت، بأنهم لم يروا أي دليل يربط التفجيرات بالشيشان. ^{[ 71 ]}

في 22 سبتمبر/أيلول 1999، ألقت الشرطة المحلية القبض على عملاء من جهاز الأمن الفيدرالي الروسي (FSB) وهم يزرعون قنبلة في مجمع سكني بمدينة ريازان . أُطلق سراحهم لاحقًا بأوامر من موسكو. وأعلن رئيس جهاز الأمن الفيدرالي، نيكولاي باتروشيف، على شاشة التلفزيون أن القنبلة المزعومة كانت جزءًا من "تدريب". ^{[ 72 ]}

أُنجز تحقيق جنائي روسي في التفجيرات عام ٢٠٠٢. وخلصت نتائج التحقيق، والحكم القضائي الذي تلاه، إلى أن أشيميز غوتشيايف ، الذي لا يزال طليقًا، هو من دبرها، وأن خطاب وأبو عمر السيف (اللذان قُتلا لاحقًا) هما من أمرا بتنفيذها، ردًا على الهجوم الروسي المضاد على توغلهما في داغستان. وقد أدانت المحاكم الروسية ستة مشتبه بهم آخرين. ^{[ ٧٣ ]}

شكك العديد من المراقبين، بمن فيهم نواب مجلس الدوما يوري شيكوتشيخين ، وسيرغي كوفاليف، وسيرغي يوشينكوف ، في الرواية الرسمية، وطالبوا بإجراء تحقيق مستقل. وزعم آخرون، من بينهم ديفيد ساتير ، ويوري فيلشتينسكي ، وفلاديمير بريبيلوفسكي ، وألكسندر ليتفينينكو ، بالإضافة إلى السلطات الشيشانية الانفصالية، أن تفجيرات عام 1999 كانت عملية مدبرة من قبل جهاز الأمن الفيدرالي الروسي (FSB) بهدف كسب التأييد الشعبي لحرب شاملة جديدة في الشيشان، الأمر الذي عزز شعبية رئيس الوزراء ومدير جهاز الأمن الفيدرالي السابق فلاديمير بوتين، وأدى إلى فوز حزب الوحدة المؤيد للحرب في انتخابات مجلس الدوما البرلمانية عام 1999 ، وضمن وصول بوتين إلى الرئاسة في غضون أشهر قليلة . ويرد وصف للتفجيرات بأنها عمليات مدبرة من قبل جهاز الأمن الفيدرالي في كتاب " تفجير روسيا" ، المحظور في روسيا الاتحادية. ^{[ 74 ] [ 75 ] [ 76 ] [ 77 ] [ 78 ] [ 79 ] [ 80 ]}

في أواخر أغسطس وأوائل سبتمبر 1999، شنت روسيا حملة جوية واسعة النطاق على الشيشان، بهدف معلن هو القضاء على المسلحين الذين غزو داغستان في وقت سابق من الشهر نفسه. وفي 26 أغسطس 1999، أقرت روسيا بشن غارات جوية على الشيشان. ^{[ 81 ]} وأُفيد بأن الغارات الجوية الروسية أجبرت ما لا يقل عن 100 ألف شيشاني على الفرار من ديارهم بحثًا عن الأمان؛ كما أفادت التقارير بأن منطقة إنغوشيا المجاورة ناشدت الأمم المتحدة لتقديم المساعدة لعشرات الآلاف من اللاجئين. ^{[ 82 ]} وفي 2 أكتوبر 1999، أفادت وزارة الطوارئ الروسية بأن 78 ألف شخص فروا من الغارات الجوية على الشيشان؛ وتوجه معظمهم إلى إنغوشيا، حيث وصلوا بمعدل يتراوح بين 5000 و6000 شخص يوميًا.

في 22 سبتمبر 1999، قال نائب وزير الداخلية إيغور زوبوف إن القوات الروسية حاصرت الشيشان وكانت مستعدة لاستعادة المنطقة، لكن المخططين العسكريين كانوا ينصحون بعدم القيام بغزو بري بسبب احتمال وقوع خسائر روسية فادحة.

دخل الصراع الشيشاني مرحلة جديدة في الأول من أكتوبر/تشرين الأول عام 1999، عندما أعلن رئيس الوزراء الروسي الجديد، بوتين، عدم شرعية سلطة مسخادوف وبرلمانه. ^{[ 83 ]} في ذلك الوقت، أعلن بوتين أن القوات الروسية ستشن حربًا برية، لكنها لن تتقدم إلا حتى نهر تيريك، الذي يفصل الثلث الشمالي من الشيشان عن بقية الجمهورية. كان هدف بوتين المعلن هو السيطرة على السهل الشمالي للشيشان وفرض طوق أمني ضد أي عدوان شيشاني آخر؛ وقد ذكر لاحقًا أن الطوق الأمني ​​وحده "غير مجدٍ ومستحيل من الناحية الفنية"، على ما يبدو بسبب تضاريس الشيشان الوعرة. ووفقًا لروايات روسية، عجّل بوتين بتنفيذ خطة لشن حملة قمع واسعة النطاق ضد الشيشان، كانت قد وُضعت قبل أشهر. ^{[ 84 ]}

تحرك الجيش الروسي بسهولة في المساحات الشاسعة شمال الشيشان ووصل إلى نهر تيريك في 5 أكتوبر/تشرين الأول 1999. في ذلك اليوم، أفادت التقارير أن حافلة مكتظة باللاجئين أصيبت بقذيفة دبابة روسية ، مما أسفر عن مقتل 11 مدنياً على الأقل؛ ^{[ 85 ]} وبعد يومين، ألقت مقاتلات قاذفة روسية من طراز سو-24 قنابل عنقودية على قرية إليستانجي ، مما أسفر عن مقتل نحو 35 شخصاً . ^{[ 86 ]} في 10 أكتوبر/تشرين الأول 1999، طرح مسخادوف خطة سلام تتضمن حملة قمع ضد أمراء الحرب المتمردين؛ ^{[ 86 ]} إلا أن الجانب الروسي رفض العرض. كما ناشد حلف شمال الأطلسي (الناتو) للمساعدة في إنهاء القتال بين قواته والقوات الروسية، دون جدوى. ^{[ 87 ]}

في 12 أكتوبر/تشرين الأول 1999، عبرت القوات الروسية نهر تيريك وبدأت تقدماً مزدوجاً نحو العاصمة غروزني جنوباً. أملاً في تجنب الخسائر الفادحة التي شهدتها الحرب الشيشانية الأولى، تقدم الروس ببطء وقوة، مستخدمين المدفعية والقوة الجوية على نطاق واسع في محاولة لإضعاف الدفاعات الشيشانية. فرّ آلاف المدنيين من التقدم الروسي، تاركين الشيشان إلى الجمهوريات الروسية المجاورة. وقُدّر عددهم لاحقاً بما بين 200 ألف و350 ألفاً، من أصل حوالي 800 ألف نسمة من سكان جمهورية الشيشان. ويبدو أن الروس لم يتركوا أي مجال للمخاطرة بالسكان الشيشان في المناطق الخلفية، فأنشأوا " معسكرات تصفية " في أكتوبر/تشرين الأول في شمال الشيشان لاحتجاز المشتبه بانتمائهم إلى فصائل مسلحة تُعرف باسم "فرق قطاع الطرق".

في 15 أكتوبر/تشرين الأول 1999، سيطرت القوات الروسية على مرتفع استراتيجي يقع ضمن مدى مدفعية غروزني، عاصمة الشيشان، بعد قصف مدفعي مكثف بالدبابات على المقاتلين الشيشان. ردًا على ذلك، أعلن الرئيس مسخادوف " الغزافات " ( الحرب المقدسة ) لمواجهة الجيش الروسي المتقدم. أُعلن الأحكام العرفية في إشكيريا، واستُدعي جنود الاحتياط ، لكن لم تُعلن الحكومة الروسية الأحكام العرفية أو حالة الطوارئ في الشيشان أو روسيا. ^{[ 88 ]} في اليوم التالي، استولت القوات الروسية على مرتفعات تيرسكي الاستراتيجية ، التي تقع على مرأى من غروزني، وأجبرت 200 مقاتل شيشاني متحصنين فيها على التراجع. بعد قتال عنيف، استولت روسيا على القاعدة الشيشانية في قرية غوراغورسكي ، غرب المدينة. ^{[ 89 ]}

في 21 أكتوبر/تشرين الأول 1999، أسفرت غارة صاروخية روسية قصيرة المدى من طراز سكود على سوق غروزني المركزي عن مقتل أكثر من 140 شخصًا ، بينهم العديد من النساء والأطفال، وإصابة المئات بجروح. وصرح متحدث روسي بأن السوق المزدحم استُهدف لأنه كان يُستخدم من قبل الانفصاليين كسوق لبيع الأسلحة . وبعد ثمانية أيام، شنت طائرات روسية هجومًا صاروخيًا على قافلة كبيرة من اللاجئين متجهة إلى إنغوشيا، مما أسفر عن مقتل ما لا يقل عن 25 مدنيًا، بينهم عمال الصليب الأحمر وصحفيون. ^{[ 90 ]} وبعد يومين، شنت القوات الروسية هجومًا مدفعيًا وصاروخيًا كثيفًا على ساماشكي ؛ وزعم البعض أن المدنيين قُتلوا في ساماشكي انتقامًا للخسائر الفادحة التي تكبدتها القوات الروسية هناك خلال الحرب الأولى. ^{[ 91 ]}

في 12 نوفمبر/تشرين الثاني 1999، رُفع العلم الروسي فوق مدينة غوديرمس، ثاني أكبر مدن الشيشان، بعد انشقاق القائدين الشيشان المحليين، الأخوان ياماداييف ، وانضمامهما إلى القوات الفيدرالية. كما دخل الروس قرية أسينوفسكايا ، التي كانت معقلًا للقوزاق، والتي كانت قد دُمرت جراء القصف . واستمر القتال في كولاري ومحيطها حتى يناير/كانون الثاني 2000. وفي 17 نوفمبر/تشرين الثاني 1999، طرد الجنود الروس الانفصاليين من باموت ، المعقل الرمزي للانفصاليين في الحرب الأولى. وأُفيد بمقتل عشرات المقاتلين الشيشان والعديد من المدنيين، ودُمرت القرية بالكامل جراء قصف القوات المسلحة الروسية . وبعد يومين، وبعد محاولة فاشلة قبل خمسة أيام، تمكنت القوات الروسية من الاستيلاء على قرية أتشخوي مارتان .

في 26 نوفمبر/تشرين الثاني 1999، صرّح نائب رئيس أركان الجيش، فاليري مانيلوف، بأن المرحلة الثانية من حملة الشيشان قد أوشكت على الانتهاء، وأن المرحلة الثالثة والأخيرة على وشك البدء. ووفقًا لمانيلوف، تهدف المرحلة الثالثة إلى القضاء على "جماعات قطاع الطرق" في الجبال. وبعد بضعة أيام، قال وزير الدفاع الروسي، إيغور سيرغييف، إن القوات الروسية قد تحتاج إلى ثلاثة أشهر إضافية لإتمام حملتها العسكرية في الشيشان، بينما أشار بعض الجنرالات إلى أن الهجوم قد ينتهي بحلول رأس السنة الميلادية. وفي اليوم التالي، استعاد الشيشان لفترة وجيزة بلدة نوفوغروزينسكي . ^{[ 92 ]}

في الأول من ديسمبر/كانون الأول 1999، وبعد أسابيع من القتال العنيف، سيطرت القوات الروسية بقيادة اللواء فلاديمير شامانوف على قرية ألخان يورت ، الواقعة جنوب غروزني. وألحق المقاتلون الشيشان والأجانب خسائر فادحة بالقوات الروسية، حيث أفادت التقارير بمقتل أكثر من 70 جنديًا روسيًا قبل انسحابهم، ^{[ 93 ]} متكبدين خسائر فادحة بدورهم. ^{[ 94 ]} وفي اليوم نفسه، بدأت القوات الانفصالية الشيشانية سلسلة من الهجمات المضادة ضد القوات الفيدرالية في عدة قرى، وكذلك في ضواحي غوديرمس. وأبدى المقاتلون الشيشان في أرغون ، وهي بلدة صغيرة تقع على بعد خمسة كيلومترات شرق غروزني، مقاومة شرسة للقوات الفيدرالية منذ بدء الهجوم العسكري الذي شنته موسكو. كما أبدى الانفصاليون في بلدة أوروس مارتان مقاومة عنيفة، مستخدمين تكتيكات حرب العصابات التي كانت روسيا حريصة على تجنبها؛ وبحلول التاسع من ديسمبر/كانون الأول 1999، كانت القوات الروسية لا تزال تقصف أوروس مارتان، على الرغم من أن القادة الشيشان قالوا إن مقاتليهم قد انسحبوا بالفعل.

في 4 ديسمبر/كانون الأول 1999، أعلن قائد القوات الروسية في شمال القوقاز، الجنرال فيكتور كازانتسيف ، أن غروزني محاصرة بالكامل من قبل القوات الروسية. وكانت المهمة التالية للجيش الروسي هي الاستيلاء على بلدة شالي ، الواقعة على بُعد 20 كيلومترًا جنوب شرق العاصمة، وهي إحدى آخر البلدات التي لا تزال تحت سيطرة الانفصاليين إلى جانب غروزني. بدأت القوات الروسية بالاستيلاء على جسرين يربطان شالي بالعاصمة، وبحلول 11 ديسمبر/كانون الأول 1999، كانت القوات الروسية قد حاصرت شالي وبدأت بإخراج الانفصاليين منها تدريجيًا. وبحلول منتصف ديسمبر/كانون الأول، ركز الجيش الروسي هجماته في الأجزاء الجنوبية من الشيشان، وكان يستعد لشن هجوم آخر من داغستان.

بدأ الهجوم الروسي على غروزني في أوائل ديسمبر، وترافق مع صراع على المستوطنات المجاورة. انتهت المعركة بسيطرة الجيش الروسي على المدينة في 2 فبراير 2000. ووفقًا للأرقام الروسية الرسمية، قُتل ما لا يقل عن 134 جنديًا من القوات الفيدرالية وعدد غير معروف من الميليشيات الموالية لروسيا في غروزني. كما تكبدت القوات الانفصالية خسائر فادحة، بما في ذلك فقدان العديد من كبار القادة. وصرح وزير الدفاع الروسي إيغور سيرغييف بمقتل 1500 انفصالي أثناء محاولتهم مغادرة غروزني. وقال الانفصاليون إنهم فقدوا ما لا يقل عن 500 مقاتل في حقل ألكان قلعة . ^{[ 95 ]} دمر الحصار والقتال العاصمة بشكل لم تشهده أي مدينة أوروبية أخرى منذ الحرب العالمية الثانية. وفي عام 2003، وصفت الأمم المتحدة غروزني بأنها المدينة الأكثر تدميرًا على وجه الأرض. ^{[ 96 ]} كما تكبد الروس خسائر فادحة أثناء تقدمهم في مناطق أخرى، ومن الهجمات المضادة الشيشانية وكمائن القوافل. في 26 يناير 2000، أعلنت الحكومة الروسية أن 1173 جندياً قُتلوا في الشيشان منذ أكتوبر، ^{[ 97 ]} أي أكثر من ضعف عدد القتلى البالغ 544 الذين تم الإبلاغ عنهم قبل 19 يوماً فقط. ^{[ 98 ]}

استمر القتال العنيف المصحوب بقصف مكثف وقصف جوي طوال شتاء عام 2000 في جنوب الشيشان الجبلي، وخاصة في المناطق المحيطة بأرغون وفيدينو وشاتوي ، حيث كان القتال الذي شاركت فيه قوات المظليين الروسية مستعراً منذ عام 1999.

في 9 فبراير/شباط 2000، أصاب صاروخ تكتيكي روسي حشدًا من الناس كانوا قد قدموا إلى مبنى الإدارة المحلية في شالي، وهي بلدة أُعلنت سابقًا من "المناطق الآمنة"، لاستلام معاشاتهم التقاعدية. جاء الهجوم ردًا على تقرير يفيد بدخول مجموعة من المقاتلين إلى البلدة. وتشير التقديرات إلى أن الصاروخ أسفر عن مقتل نحو 150 مدنيًا، وأعقبه هجوم شنته مروحيات قتالية، مما أدى إلى مزيد من الخسائر في الأرواح. ^{[ 99 ]} ودعت منظمة هيومن رايتس ووتش الجيش الروسي إلى التوقف عن استخدام القنابل الهوائية، المعروفة في روسيا باسم " القنابل الفراغية "، في الشيشان، معربةً عن قلقها إزاء العدد الكبير من الضحايا المدنيين الناجمين عما وصفته بـ"القصف الجوي واسع النطاق والعشوائي في كثير من الأحيان من قبل القوات الروسية". ^{[ 100 ]} وفي 18 فبراير/شباط 2000، أُسقطت مروحية نقل تابعة للجيش الروسي في الجنوب، مما أسفر عن مقتل 15 رجلاً كانوا على متنها، حسبما أعلن وزير الداخلية الروسي فلاديمير روشايلو . ^{[ 101 ]}

في 29 فبراير/شباط 2000، صرّح قائد مجموعة الجيوش المتحدة ، غينادي تروشيف، بأن "عملية مكافحة الإرهاب في الشيشان قد انتهت. وسيستغرق الأمر أسبوعين إضافيين للقضاء على الجماعات المنشقة". وقدّر وزير الدفاع الروسي، المارشال إيغور سيرغييف، القوة العددية للانفصاليين بما يتراوح بين 2000 و2500 مقاتل، "منتشرين في جميع أنحاء الشيشان". وفي اليوم نفسه، تعرّضت سرية مظليين روسية من بسكوف لهجوم من مقاتلين شيشانيين وعرب بالقرب من قرية أولوس كيرت في السهول الجنوبية للشيشان؛ ما أسفر عن مقتل 84 جنديًا روسيًا على الأقل في قتال عنيف. وذكرت الصحيفة الرسمية لوزارة الدفاع الروسية أن 659 انفصاليًا على الأقل قُتلوا، بينهم 200 من الشرق الأوسط، وهي أرقام قالت إنها تستند إلى بيانات اعتراض لاسلكي، وتقارير استخباراتية، وشهود عيان، وسكان محليين، وأسرى شيشانيين. ^{[ 102 ]} في 2 مارس 2000، أطلقت وحدة من قوات الأمن الخاصة (OMON) من بودولسك النار على وحدة من سيرغييف بوساد في غروزني؛ وقُتل ما لا يقل عن 24 جنديًا روسيًا في الحادث .

في مارس/آذار، دخلت مجموعة كبيرة تضم أكثر من ألف مقاتل شيشاني، بقيادة القائد الميداني رسلان غيلاييف ، والذين كانوا مطاردين منذ انسحابهم من غروزني، قرية كومسومولسكوي الواقعة في سفوح جبال الشيشان، وصمدوا في وجه هجوم روسي واسع النطاق على البلدة لأكثر من أسبوعين. تكبدوا مئات الإصابات، بينما اعترف الروس بمقتل أكثر من 50 جنديًا. وفي 29 مارس/آذار 2000، قُتل نحو 23 جنديًا روسيًا في كمين نصبه الانفصاليون لقافلة تابعة لقوات الأمن الخاصة (أومون) قادمة من بيرم في جانى فيدينو.

في 23 أبريل/نيسان 2000، تعرضت قافلة مؤلفة من 22 مركبة، تحمل ذخيرة ومؤنًا أخرى لوحدة محمولة جوًا، لكمين قرب سيرجين-يورت في وادي فيدينو، نفذه ما يقدر بنحو 80 إلى 100 مسلح، وفقًا لما ذكره الجنرال تروشيف. وفي المعركة التي تلت ذلك، والتي استمرت أربع ساعات، خسر الجانب الفيدرالي 15 جنديًا حكوميًا، بحسب وزير الدفاع الروسي. وصرح الجنرال تروشيف للصحافة بأنه تم العثور على جثث أربعة مقاتلين انفصاليين. وفي وقت لاحق، أعلنت قيادة القوات المحمولة جوًا الروسية عن مقتل 20 انفصاليًا وأسر اثنين. ^{[ 103 ]} وسرعان ما سيطرت القوات الروسية على آخر معاقل المقاومة المنظمة المأهولة بالسكان.

في مايو/أيار 2000، عيّن بوتين، في الشهر التالي، أحمد قديروف رئيسًا مؤقتًا للحكومة الموالية لموسكو. لاقى هذا التطور استحسانًا مبدئيًا في بقية أنحاء روسيا، إلا أن استمرار سقوط قتلى من القوات الروسية قد أضعف الحماس الشعبي. في 23 مارس/آذار 2003، أُقرّ دستور جديد للشيشان في استفتاء شعبي. منح دستور 2003 جمهورية الشيشان درجة كبيرة من الحكم الذاتي ، ولكنه ربطها في الوقت نفسه ارتباطًا وثيقًا بروسيا وحكم موسكو، ودخل حيز التنفيذ في 2 أبريل/نيسان 2003. حظي الاستفتاء بدعم قوي من الحكومة الروسية، لكنه قوبل بردود فعل ناقدة لاذعة من الانفصاليين الشيشان؛ حيث اختار العديد من المواطنين مقاطعة الاقتراع. اغتيل أحمد قديروف في انفجار قنبلة عام 2004. ومنذ ديسمبر/كانون الأول 2005، يتولى ابنه رمضان قديروف ، زعيم ميليشيا القديروفسي الموالية لموسكو ، الحكم الفعلي للشيشان . أصبح قديروف الزعيم الأقوى في الشيشان، وفي فبراير 2007، وبدعم من بوتين، حل رمضان قديروف محل ألو ألكانوف كرئيس.

مراحل حرب العصابات حسب السنة: 2000 ، 2001 ، 2002 ، 2003 ، 2004 ، 2005 ، 2006 ، 2007 ، 2008 ، 2009

على الرغم من توقف القتال واسع النطاق داخل الشيشان، استمرت الهجمات اليومية، لا سيما في المناطق الجنوبية منها، وامتدت إلى مناطق القوقاز المجاورة، خاصة بعد تشكيل جبهة القوقاز . استهدفت وحدات انفصالية صغيرة عادةً المسؤولين الروس والموالين لروسيا، وقوات الأمن ، وقوافل الجيش والشرطة ومركباتها. استخدمت هذه الوحدات العبوات الناسفة ، وشكّلت أحيانًا مجموعات لشن غارات أكبر. ردّت القوات الروسية بالقصف المدفعي والجوي، بالإضافة إلى عمليات مكافحة التمرد . كان معظم الجنود في الشيشان من المتعاقدين (الكونتراكتنيكي)، على عكس المجندين سابقًا . وبينما حافظت روسيا على وجود عسكري داخل الشيشان، لعبت القوات الفيدرالية دورًا أقل مباشرة. هيمنت القوات الشيشانية الموالية للكرملين بقيادة قديروف، والمعروفة باسم " القاديروفسي" ، على عمليات إنفاذ القانون والأمن، وكان العديد من أعضائها (بمن فيهم قديروف نفسه) من الانفصاليين الشيشان السابقين الذين انشقوا منذ عام 1999. ومنذ عام 2004، دُمجت "القاديروفسي" جزئيًا في وحدتين تابعتين لوزارة الداخلية، هما الشمالية والجنوبية ( سيفير ويوج ) . أما الوحدتان الأخريان من القوات الشيشانية الموالية لموسكو، الشرقية والغربية ( فوستوك وزاباد ) ، فكان يقودهما سليم ياماداييف ( فوستوك ) وسعيد محمد كاكييف ( زاباد ) ورجالهما. ^{[ 104 ]} وقد حسّن دمج "القاديروفسي " من فعالية عمليات مكافحة التمرد الروسية، ربما بسبب امتلاك الجنود الشيشان مزايا محتملة على الروس فيما يتعلق بجمع المعلومات الاستخباراتية عن المتمردين المحليين. ^{[ 105 ]}

في 16 أبريل/نيسان 2009، أعلن رئيس جهاز الأمن الفيدرالي الروسي، ألكسندر بورتنيكوف ، أن روسيا أنهت "عمليتها لمكافحة الإرهاب" في الشيشان، مدعيةً استعادة الاستقرار في الإقليم. ^{[ 106 ]} وصرح بورتنيكوف قائلاً: "يهدف هذا القرار إلى تهيئة الظروف لتطبيع الأوضاع في الجمهورية مستقبلاً، وإعادة بنائها، وتنمية قطاعها الاجتماعي والاقتصادي". وبينما استقرت الأوضاع في الشيشان إلى حد كبير، استمرت الاشتباكات مع المسلحين في منطقتي داغستان وإنغوشيا المجاورتين.

بين يونيو/حزيران 2000 وسبتمبر/أيلول 2004، أضاف المتمردون الشيشان الهجمات الانتحارية إلى تكتيكاتهم. وخلال هذه الفترة، وقع 23 هجوماً انتحارياً مرتبطاً بالشيشان داخل الشيشان وخارجها، أبرزها عملية احتجاز الرهائن في مدرسة ابتدائية في بيسلان ، والتي أسفرت عن مقتل 334 شخصاً على الأقل.

نفذ كلا طرفي الحرب العديد من عمليات الاغتيال. ومن أبرزها اغتيال الرئيس الشيشاني الانفصالي السابق المنفي زليمخان يانداربييف في قطر في 13 فبراير 2004، واغتيال قديروف في 9 مايو 2004 خلال عرض عسكري في غروزني.

على الرغم من أن حركات التمرد المحلية المناهضة لروسيا في شمال القوقاز بدأت حتى قبل الحرب، إلا أنه في مايو/أيار 2005، أي بعد شهرين من وفاة ماسكاهدوف، أعلن الانفصاليون الشيشان رسميًا عن تشكيل جبهة القوقاز في إطار "إصلاح نظام السلطة العسكرية والسياسية". وإلى جانب "قطاعات" الشيشان والداغستان والإنغوش، ضمت الجبهة جماعات ستافروبول ، وكاباردين - بلقار ، وكراسنودار ، وكاراتشاي - الشركس ، والأوسيتيين، والأديغيين . وهذا يعني أن جميع مناطق جنوب روسيا تقريبًا كانت منخرطة في الأعمال العدائية.

اتخذت الحركة الانفصالية الشيشانية دوراً جديداً بصفتها المركز الأيديولوجي واللوجستي، وربما المالي، الرسمي للتمرد الجديد في شمال القوقاز. ^{[ 107 ]} استمرت الاشتباكات المتزايدة بين القوات الفيدرالية والمسلحين المحليين في داغستان، بينما اندلعت اشتباكات متفرقة في مناطق أخرى من جنوب روسيا، مثل إنغوشيا، ولا سيما في نالتشيك في 13 أكتوبر 2005.

شهدت الحرب الشيشانية الثانية موجة جديدة من جرائم الحرب وانتهاكات القانون الدولي الإنساني . وقد انتقدت المنظمات الدولية كلا الجانبين لانتهاكهما اتفاقيات جنيف . ومع ذلك، يشير تقرير صادر عن منظمة هيومن رايتس ووتش إلى أنه، دون التقليل من شأن الانتهاكات التي ارتكبها المقاتلون الشيشان، فإن السبب الرئيسي لمعاناة المدنيين في الحرب الشيشانية الثانية كان نتيجة للانتهاكات التي ارتكبتها القوات الروسية بحق السكان المدنيين. ^{[ 108 ]} ووفقًا لمنظمة العفو الدولية ، فقد استُهدف المدنيون الشيشان عمدًا من قبل القوات الروسية، في تجاهل واضح للقانون الإنساني. ووصفت منظمة العفو الدولية الوضع بأنه حملة روسية لمعاقبة جماعة عرقية بأكملها ، بذريعة "مكافحة الجريمة والإرهاب". ^{[ 109 ]} وقد أخفقت القوات الروسية طوال فترة الحملة في الوفاء بالتزاماتها بموجب اتفاقيات جنيف، ولم تتحمل سوى القليل من المسؤولية عن حماية السكان المدنيين. ^{[ 108 ]} ذكرت منظمة العفو الدولية في تقريرها لعام 2001 أن المدنيين الشيشان، بمن فيهم العاملون في المجال الطبي، كانوا هدفاً لهجمات عسكرية شنتها القوات الروسية، وأن مئات المدنيين الشيشان وأسرى الحرب أعدموا خارج نطاق القضاء. ^{[ 110 ]}

بحسب نشطاء حقوق الإنسان، ارتكبت القوات الروسية بشكل ممنهج الجرائم التالية في الشيشان: تدمير المدن والقرى دون مبرر عسكري؛ قصف المستوطنات غير المحمية؛ عمليات إعدام خارج نطاق القضاء وقتل المدنيين بإجراءات موجزة؛ التعذيب وسوء المعاملة وانتهاك الكرامة الإنسانية؛ إلحاق أذى جسدي خطير متعمد بأشخاص لا يشاركون مباشرة في الأعمال العدائية؛ شنّ هجمات متعمدة على السكان المدنيين والمركبات المدنية والطبية؛ الاحتجاز غير القانوني للسكان المدنيين والاختفاء القسري؛ نهب وتدمير الممتلكات المدنية والعامة؛ الابتزاز؛ أخذ الرهائن مقابل فدية؛ تجارة الجثث. ^{[ 111 ] [ 112 ] [ 113 ]} كما وقعت حالات اغتصاب، ^{[ 114 ] [ 115 ] [ 116 ]} والتي ارتكبت، إلى جانب النساء، ضد الرجال. ^{[ 117 ] [ 118 ] [ 119 ] [ 120 ] [ 121 ] [ 122 ]} وفقًا لوزير الصحة في إشكيريا، عمر خانبييف، ارتكبت القوات الروسية عمليات استئصال أعضاء وتجارة أعضاء خلال النزاع. ^{[ 123 ]}

منذ بداية النزاع، شنت القوات الروسية قصفاً وقصفاً مدفعياً عشوائياً وغير متناسب على الأهداف المدنية، مما أسفر عن خسائر فادحة في صفوف المدنيين. في إحدى هذه الحوادث، في أكتوبر/تشرين الأول 1999، سقطت عشرة صواريخ فرط صوتية قوية فجأة ودون سابق إنذار، مستهدفةً مستشفى الولادة الوحيد في المدينة، ومكتب البريد، والمسجد، وسوقاً مكتظاً بالسكان. ^{[ 124 ] [ 125 ] [ 126 ] [ 127 ]} وقعت معظم الخسائر في السوق المركزي، ويُقدّر أن الهجوم أسفر عن مقتل أكثر من 100 شخص على الفور وإصابة ما يصل إلى 400 آخرين. ومن الحوادث المماثلة قصف طريق باكو-روستوف السريع ، حيث شنت القوات الجوية الروسية هجمات صاروخية متكررة على قافلة كبيرة من اللاجئين كانوا يحاولون دخول إنغوشيا عبر ما يُفترض أنه "مخرج آمن". ^{[ 128 ] [ 129 ]} وتكرر هذا الأمر في ديسمبر/كانون الأول 1999 عندما أطلق الجنود الروس النار على قافلة لاجئين تحمل أعلاماً بيضاء . ^{[ 130 ]}

تسبب حصار وقصف غروزني في الفترة 1999-2000 في مقتل ما بين 5000 ^{[ 131 ]} و8000 ^{[ 132 ] مدني. ووجه الجيش الروسي إنذارًا نهائيًا خلال حصار غروزني، حث فيه الشيشان على مغادرة المدينة وإلا سيُبادون بلا رحمة. [ 133 ]} وقُتل نحو 300 شخص أثناء محاولتهم الفرار في أكتوبر/تشرين الأول 1999، ودُفنوا لاحقًا في مقبرة جماعية. ^{[ 134 ]} وشمل قصف غروزني استخدام قنابل بوراتينو الحرارية المحظورة وقنابل الوقود والهواء، مما أدى إلى اشتعال هواء المدنيين المختبئين في الأقبية. ^{[ 135 ] [ 136 ]} كما وردت تقارير عن استخدام أسلحة كيميائية، محظورة بموجب قانون جنيف. ^{[ 137 ]} وتعهد الرئيس الروسي بوتين بأن الجيش لن يتوقف عن قصف غروزني حتى "تُنهي القوات الروسية مهمتها على أكمل وجه". في عام 2003، وصفت الأمم المتحدة مدينة غروزني بأنها المدينة الأكثر تدميراً على وجه الأرض. ^{[ 138 ]}

ومن الأمثلة الأخرى على القصف العشوائي، وربما المتعمد، قصف قرية كاتير-يورت الذي وقع في الفترة من 4 إلى 6 فبراير/شباط 2000. كانت قرية كاتير-يورت بعيدة عن خط المواجهة، ومكتظة باللاجئين. لم يمسها سوء صباح يوم 4 فبراير/شباط عندما قامت الطائرات والمروحيات الروسية، بالإضافة إلى قنابل الوقود والهواء وصواريخ غراد، بتدميرها بالكامل. بعد القصف، سمح الجيش الروسي بدخول الحافلات، وسمح لموكب لاجئين يرفع الراية البيضاء بالمغادرة، ثم قام بقصفه هو الآخر. ^{[ 139 ]} تم استخدام أسلحة حرارية ضغطية محظورة على قرية كاتير-يورت . لقي مئات المدنيين حتفهم نتيجة القصف الروسي وما تلاه من عمليات تمشيط. ^{[ 140 ] [ 141 ]} وقد استخدم الجيش الروسي الأسلحة الحرارية الضغطية في عدة مناسبات، وفقًا لمنظمة هيومن رايتس ووتش. ^{[ 142 ]}

خلال مذبحة ألخان-يورت، ارتكب الجنود الروس مجزرة مروعة في أرجاء القرية، حيث قاموا بإعدام كل من اعترض طريقهم بإجراءات موجزة، واغتصاب وتعذيب ونهب وحرق وقتل. وقد ارتكب معظم هذه الجرائم جنود روس كانوا ينهبون. ^{[ 143 ]} وغالباً ما قوبلت محاولات المدنيين لوقف عمليات القتل بالموت. ^{[ 144 ]} ولم تبذل السلطات الروسية أي جهد جاد لمحاسبة المسؤولين عن الجرائم المرتكبة في ألخان-يورت. وتشير شهادات موثوقة إلى أن القيادة الروسية في المنطقة كانت على علم بما يجري، لكنها اختارت ببساطة تجاهله. ^{[ 143 ]} وقد وصفت القيادة العسكرية الروسية الحادثة بأنها "مجرد خرافات"، مدعيةً أن الجثث زُرعت وأن المذبحة مُختلقة بهدف تشويه سمعة القوات الروسية. ^{[ 145 ]} رفض الجنرال الروسي شامانوف المسؤولية عن الانتهاكات التي وقعت في القرية قائلاً: "لا تجرؤوا على المساس بجنود وضباط الجيش الروسي. إنهم يؤدون عملاً مقدساً اليوم - إنهم يدافعون عن روسيا. ولا تجرؤوا على تدنيس الجندي الروسي بأيديكم القذرة!" ^{[ 143 ]}

فيما يُعتبر إحدى أفظع جرائم الحرب في تلك الحقبة، شنت القوات الفيدرالية الروسية حملة تطهير واسعة النطاق في قرية نوفيه ألدي ، شملت إعدامات ميدانية لعشرات الأشخاص، والقتل ، والنهب ، والحرق العمد ، واغتصاب الشيشانيين (بالإضافة إلى ارتكاب جرائم أخرى) . ^{[ 146 ] [ 147 ] [ 148 ]} وكانت القوات الروسية قد قصفت القرية بقنابل عنقودية قبل يوم من دخولها، وأمرت السكان المحليين بالخروج من أقبية منازلهم للتفتيش في اليوم التالي. ^{[ 149 ]} وبمجرد دخول القرية، أطلق الجنود الروس النار على ضحاياهم بدم بارد، مستخدمين أسلحة آلية من مسافة قريبة. وتراوحت أعمار الضحايا بين طفل رضيع يبلغ من العمر عامًا واحدًا وامرأة تبلغ من العمر 82 عامًا. وكان الجنود الروس يطلبون من الضحايا المال أو المجوهرات، متخذين ذلك ذريعة لإعدامهم إذا لم يكن المبلغ كافيًا. وقام الجنود الفيدراليون بنزع أسنان ذهبية من جثث ضحاياهم ونهبوها. ترافقت عمليات القتل مع عمليات حرق متعمد في محاولة لطمس أدلة الإعدامات بإجراءات موجزة وغيرها من عمليات قتل المدنيين. ووقعت عدة حالات اغتصاب، ففي إحدى الحوادث، اغتصب جنود روس جماعياً عدداً من النساء قبل خنقهن حتى الموت. ونهبت القرية على نطاق واسع، حيث قام جنود روس بنهب منازل المدنيين جهاراً نهاراً. وقوبلت أي محاولة لمحاسبة السلطات الروسية على المجزرة بنفي شديد. ووصفت منظمة هيومن رايتس ووتش رد السلطات الروسية بأنه "نموذجي". وصرح متحدث باسم وزارة الدفاع الروسية بأن " هذه الادعاءات ليست سوى محض افتراء لا يدعمه أي دليل أو حقيقة... ويجب اعتبارها استفزازاً يهدف إلى تشويه سمعة عملية القوات الفيدرالية ضد الإرهابيين في الشيشان " . ^{[ 149 ] [ 147 ]} كما ذكرت شاهدة عيان أن محققين من جهاز الأمن الفيدرالي أخبروها أن المجزرة ارتكبها على الأرجح مقاتلون شيشان "متنكرون في زي القوات الفيدرالية". ^{[ 150 ]}

تشير تقديرات منظمات حقوق الإنسان في أوروبا الغربية إلى وقوع نحو 5000 حالة اختفاء قسري في الشيشان منذ عام 1999. ^{[ 151 ]} وقد تم الكشف عن عشرات المقابر الجماعية التي تضم مئات الجثث منذ بداية النزاع الشيشاني. وبحلول يونيو/حزيران 2008، سُجّلت 57 موقعًا لمقابر جماعية في الشيشان. ^{[ 152 ]} ووفقًا لمنظمة العفو الدولية، يُحتمل أن يكون الآلاف مدفونين في مقابر مجهولة، بمن فيهم 5000 مدني اختفوا منذ بداية الحرب الشيشانية الثانية عام 1999. ^{[ 153 ]} وفي عام 2008، تم الكشف عن أكبر مقبرة جماعية عُثر عليها حتى الآن في غروزني، وتضم نحو 800 جثة من ضحايا الحرب الشيشانية الأولى عام 1995. ^{[ 152 ]} وتتمثل السياسة العامة لروسيا تجاه المقابر الجماعية الشيشانية في عدم نبشها . ^{[ 154 ]}

أشارت وزيرة الخارجية الأمريكية أولبرايت في خطابها أمام لجنة الأمم المتحدة لحقوق الإنسان بتاريخ 24 مارس 2000 إلى ما يلي :

لا يمكننا تجاهل حقيقة مقتل آلاف المدنيين الشيشان ونزوح أكثر من 200 ألف آخرين من ديارهم. وقد أعربنا، إلى جانب وفود أخرى، عن قلقنا البالغ إزاء التقارير الموثوقة والمتواصلة عن انتهاكات حقوق الإنسان التي ترتكبها القوات الروسية في الشيشان، بما في ذلك عمليات القتل خارج نطاق القضاء . كما وردت تقارير تفيد بارتكاب الانفصاليين الشيشان انتهاكات، من بينها قتل المدنيين والأسرى... لقد ألحقت الحرب في الشيشان ضرراً بالغاً بمكانة روسيا الدولية، وعزلتها عن المجتمع الدولي. ويُعدّ سعي روسيا لإصلاح هذا الضرر، داخلياً وخارجياً، أو اختيارها المخاطرة بمزيد من العزلة، التحدي الأكبر والأكثر إلحاحاً الذي يواجهها. ^{[ 155 ]}

أخفقت الحكومة الروسية في اتخاذ أي إجراءات للمساءلة عن انتهاكات حقوق الإنسان التي ارتُكبت خلال النزاع في الشيشان. ونظرًا لعجزها عن تحقيق العدالة محليًا، لجأ مئات الضحايا إلى المحكمة الأوروبية لحقوق الإنسان . وفي مارس/آذار 2005، أصدرت المحكمة أولى أحكامها بشأن الشيشان، حيث أدانت الحكومة الروسية بانتهاك الحق في الحياة، بل وحتى حظر التعذيب، بحق المدنيين الذين لقوا حتفهم أو اختفوا قسرًا على أيدي القوات الفيدرالية الروسية. ^{[ 156 ]} وصدرت أحكام مماثلة عديدة ضد روسيا منذ ذلك الحين.

بين مايو/أيار 2002 وسبتمبر/أيلول 2004، شنّ مسلحون شيشانيون، معظمهم تحت إمرة شامل باساييف، حملة إرهابية استهدفت مدنيين في روسيا. قُتل نحو 200 شخص في سلسلة تفجيرات (معظمها هجمات انتحارية)، كان أبرزها تفجير قطار ستافروبول عام 2003 (46 قتيلاً)، وتفجير مترو موسكو عام 2004 (40 قتيلاً)، وقصف الطائرات الروسية عام 2004 (89 قتيلاً). وأسفرت عمليتا اختطاف كبيرتان، هما أزمة احتجاز الرهائن في مسرح موسكو عام 2002 وأزمة احتجاز الرهائن في مدرسة بيسلان عام 2004، عن مقتل العديد من المدنيين. وفي أزمة موسكو، اقتحمت قوات سبيتسناز التابعة لجهاز الأمن الفيدرالي الروسي المبنى في اليوم الثالث مستخدمةً مادة كيميائية مجهولة مُعطِّلة ، تبيّن أنها قاتلة في غياب الرعاية الطبية الكافية، ما أسفر عن مقتل 133 رهينة من أصل 916. في بيسلان، قُتل نحو 20 رهينة على يد خاطفيهم قبل الهجوم، وأسفر الهجوم غير المُعدّ له جيداً (الذي بدأ على عجل بعد انفجارات في صالة الألعاب الرياضية التي فخخها الإرهابيون بالمتفجرات) عن 294 ضحية أخرى من بين 1128 رهينة، فضلاً عن خسائر فادحة في صفوف القوات الخاصة.

في 8 أكتوبر/تشرين الأول 2001، أُسقطت مروحية تابعة لبعثة الأمم المتحدة في جورجيا (UNOMIG) في وادي كودوري بالقرب من أبخازيا، وسط اشتباكات بين الشيشان والأبخازيين ، ما أسفر عن مقتل تسعة أشخاص، بينهم خمسة مراقبين من الأمم المتحدة. ^{[ 157 ]} نفت جورجيا وجود قوات لها في المنطقة، ووجهت أصابع الاتهام إلى الجماعة المسلحة التي يقودها أمير الحرب الشيشاني جيلاييف، الذي يُعتقد أن الحكومة الجورجية استأجرته لشن حرب بالوكالة ضد أبخازيا الانفصالية .

اتهم مسؤولون روس جورجيا المجاورة بالسماح للانفصاليين الشيشان بالعمل على أراضيها، والسماح بتدفق المسلحين والمعدات عبر الحدود. وفي فبراير/شباط 2002، بدأت الولايات المتحدة بتقديم المساعدة لجورجيا لمكافحة "العناصر الإجرامية" والنشاط الجهادي في وادي بانكيسي، وذلك في إطار الحرب على الإرهاب .

في أغسطس 2002، اتهمت جورجيا روسيا بشن سلسلة من الغارات الجوية السرية على ما يسمى بملاذات الانفصاليين في مضيق بانكيسي، والتي أفيد بمقتل مدني جورجي فيها.

في أواخر أغسطس/آب 2002، نشرت جورجيا أكثر من 1000 جندي في المضيق. واعتقلت القوات رجلاً عربياً وستة مجرمين، وفي 2 سبتمبر/أيلول، أعلن الرئيس شيفرنادزه السيطرة على المنطقة. ^{[ 158 ]}

في 2 مارس 2004، وبعد عدد من الغارات عبر الحدود من جورجيا إلى الشيشان وإنجوشيا وداغستان، قُتل غيلايف في اشتباك مع حرس الحدود الروسي أثناء محاولته العودة من داغستان إلى جورجيا.

في 2 فبراير/شباط 2005، أطلق الرئيس الانفصالي الشيشاني مسخادوف نداءً لوقف إطلاق النار يمتد حتى 22 فبراير/شباط على الأقل (اليوم الذي يسبق ذكرى ترحيل ستالين للشعب الشيشاني). وقد نُشر النداء عبر موقع إلكتروني انفصالي، ووجه إلى الرئيس بوتين، ووُصف بأنه بادرة حسن نية . وفي 8 مارس/آذار 2005، قُتل مسخادوف في عملية نفذتها قوات الأمن الروسية في بلدة تولستوي يورت الشيشانية ، شمال شرق غروزني.

بعد وفاة مسخادوف بفترة وجيزة، أعلن مجلس الانفصاليين الشيشان تولي عبد الحليم سعدولاييف زمام القيادة، وهي خطوة أيدها سريعًا شامل باساييف (الذي توفي بدوره في يوليو/تموز 2006). وفي 2 فبراير/شباط 2006، أجرى سعدولاييف تغييرات واسعة النطاق في حكومته، وأمر جميع أعضائها بالانتقال إلى الأراضي الشيشانية. ومن بين أمور أخرى، عزل النائب الأول لرئيس الوزراء أحمد زكاييف من منصبه (مع أن زكاييف عُيّن لاحقًا وزيرًا للخارجية ^{[ 159 ]} ). قُتل سعدولاييف في يونيو/حزيران 2006، وخلفه في زعامة الانفصاليين القائد الإرهابي المخضرم دوكو عمروف.

حتى نوفمبر/تشرين الثاني 2007، صدرت سبعة قرارات عفو على الأقل في الشيشان من قبل موسكو منذ بداية الحرب الثانية، شملت مقاتلين انفصاليين، بالإضافة إلى أفراد من القوات الفيدرالية ارتكبوا جرائم. وكان أولها قد صدر عام 1999 عندما انضم نحو 400 شيشاني إلى صفوف المعارضة. (مع ذلك، ووفقًا لمستشار بوتين ومساعده أسلمبيك أسلاخانوف، فقد قُتل معظمهم منذ ذلك الحين، على يد رفاقهم السابقين وعلى يد الروس، الذين اعتبروهم حينها " طابورًا خامسًا " محتملًا. ^{[ 160 ]} ) وشملت بعض قرارات العفو الأخرى قرارًا صدر في سبتمبر/أيلول 2003 بالتزامن مع اعتماد دستور الجمهورية الجديد، ثم قرارًا آخر بين منتصف عام 2006 ويناير/كانون الثاني 2007. وفي عام 2007، نشر الاتحاد الدولي لهلسنكي لحقوق الإنسان تقريرًا بعنوان "الأشخاص المشمولون بالعفو كأهداف للاضطهاد في الشيشان"، والذي يوثق مصير العديد من الأشخاص الذين شملهم العفو ثم اختُطفوا وعُذِّبوا وقُتلوا.

أقنعت الحرب الأولى، بتغطيتها الواسعة وغير المقيدة إلى حد كبير (رغم مقتل العديد من الصحفيين)، الكرملين أكثر من أي حدث آخر بضرورة السيطرة على قنوات التلفزيون الوطنية، التي يعتمد عليها معظم الروس في الحصول على الأخبار، لتنفيذ أي سياسة وطنية رئيسية. وبحلول وقت اندلاع الحرب الثانية، كانت السلطات الفيدرالية قد صممت وطبقت نظامًا شاملًا للحد من وصول الصحفيين إلى الشيشان وتوجيه تغطيتهم. ^{[ 161 ]}

أدى سيطرة الحكومة الروسية على جميع محطات التلفزيون الروسية واستخدامها لقواعد قمعية، ومضايقات، ورقابة، وترهيب، واعتداءات على الصحفيين، إلى حرمان الجمهور الروسي بشكل شبه كامل من المعلومات المستقلة حول النزاع. وتخضع جميع وسائل الإعلام الشيشانية المحلية تقريبًا لسيطرة الحكومة الموالية لموسكو، ويواجه الصحفيون الروس في الشيشان مضايقات وعرقلة شديدة، مما أدى إلى انتشار الرقابة الذاتية ، في حين يتعرض الصحفيون ووسائل الإعلام الأجنبية أيضًا لضغوط لحجب تقاريرهم عن النزاع. ^{[ 162 ] [ 163 ] [ 164 ]} وفي بعض الحالات، سُجن صحفيون روس يغطون أحداث الشيشان ( بوريس ستوماخين ) أو اختُطفوا ( أندريه بابيتسكي )، ومُنعت وسائل الإعلام الأجنبية ( مثل هيئة الإذاعة الأمريكية ) من دخول روسيا. جاءت خطوة روسيا ردًا على بثّ قناة ABC مقابلة مع شامل باساييف، زعيم المتمردين الشيشان الذي أمر و/أو نفّذ بعضًا من أسوأ الأعمال الإرهابية في تاريخ البلاد، بما في ذلك حصار مدرسة بيسلان الذي أسفر عن مقتل 330 شخصًا. ^{[ 165 ]} وأُغلقت جمعية الصداقة الروسية الشيشانية بتهمة "التطرف والكراهية القومية". ووفقًا لاستطلاع رأي أُجري عام 2007، أعرب 11% فقط من الروس عن رضاهم عن التغطية الإعلامية للشيشان. ^{[ 166 ]}

في الحرب الشيشانية الثانية، قُتل أكثر من 60 ألف مقاتل ومدني. ^{[ 167 ]} وتتباين تقديرات الخسائر المدنية بشكل كبير. فبحسب الحكومة الشيشانية الموالية لموسكو، لقي 160 ألف مقاتل ومدني حتفهم أو فُقدوا في الحربين، من بينهم ما بين 30 و40 ألف شيشاني، ونحو 100 ألف روسي. ^{[ 168 ] [ 169 ]} بينما ادعى الزعيم الانفصالي الراحل أصلان مسخادوف مرارًا وتكرارًا أن نحو 200 ألف شيشاني سقطوا نتيجةً للصراعين. ^{[ 170 ]} وقدّر تقريرٌ لقناة الجزيرة عام 2005 إجمالي عدد القتلى في الحربين، بمن فيهم المدنيون والمقاتلون، بنحو 300 ألف. ^{[ 171 ]} وكما هو الحال في الخسائر العسكرية، لا يمكن التحقق من هذه الادعاءات بشكل مستقل. بحسب إحصاء أجرته منظمة " ميموريال " الروسية لحقوق الإنسان عام 2007، فقد لقي ما يصل إلى 25 ألف مدني حتفهم أو اختفوا منذ عام 1999. ^{[ 172 ]} ووفقًا لمنظمة العفو الدولية في العام نفسه، فقد أسفرت الحرب الثانية عن مقتل ما يصل إلى 25 ألف مدني منذ عام 1999، بالإضافة إلى فقدان ما يصل إلى 5 آلاف شخص آخر. ^{[ 30 ]} مع ذلك، قدرت جمعية الصداقة الروسية الشيشانية إجمالي عدد القتلى في الحربين بنحو 150 ألفًا إلى 200 ألف مدني. ^{[ 173 ]}

تحذر الهيئات البيئية من أن جمهورية الشيشان الروسية، التي دمرتها الحرب، تواجه كارثة بيئية. وقد صرّح أحد مساعدي يلتسين السابقين بأن القصف الروسي حوّل الشيشان إلى "أرض قاحلة بيئياً". ^{[ 174 ]} تسببت الحرب في العديد من التسربات النفطية وتلوث المجاري (حيث تلوثت المياه حتى عمق 250  متراً ^{[ 175 ]} )، بالإضافة إلى التلوث الكيميائي والإشعاعي ، نتيجة قصف المنشآت والمستودعات الكيميائية خلال النزاع. ^{[ 176 ]} كما لحقت أضرار جسيمة بالحياة البرية في الشيشان خلال الأعمال العدائية، حيث هاجرت الحيوانات التي كانت تسكن غابات الشيشان بحثاً عن مناطق أكثر أماناً. ^{[ 177 ]} وفي عام 2004، صنّفت الحكومة الروسية ثلث مساحة الشيشان "منطقة كارثة بيئية" و40% أخرى "منطقة ضائقة بيئية شديدة". ^{[ 178 ]}

تضررت أو دمرت حوالي 60 ألف وحدة سكنية، بينما تلوثت 30 ألف هكتار (300 كيلومتر ^مربع ) من الأراضي الزراعية بالمتفجرات. ^{[ 179 ]} 

في عام 2004، أصبحت الشيشان المنطقة الأكثر تضررًا من الألغام الأرضية على مستوى العالم. ^{[ 180 ]} ومنذ عام 1994، انتشر استخدام الألغام على نطاق واسع من قبل كلا الجانبين (روسيا طرف في اتفاقية الأسلحة التقليدية لعام 1980 ، ولكنها ليست طرفًا في بروتوكول عام 1996 بشأن الألغام الأرضية وغيرها من الأجهزة). وتُعدّ المناطق الأكثر تلوثًا بالألغام في الشيشان هي تلك التي واصل الانفصاليون المقاومة فيها، وتحديدًا المناطق الجنوبية، بالإضافة إلى حدود الجمهورية. ^{[ 181 ]} ولم تُجرَ أي عمليات إزالة للألغام لأغراض إنسانية منذ طرد روسيا لمنظمة "هالو ترست" في ديسمبر/كانون الأول 1999. وفي يونيو/حزيران 2002، قدّرت أولارا أوتونو ، المسؤولة في الأمم المتحدة، وجود 500 ألف لغم أرضي مزروع في المنطقة. وسجّلت اليونيسف 2340 إصابة بين المدنيين جراء الألغام الأرضية والذخائر غير المنفجرة في الشيشان بين عامي 1999 ونهاية عام 2003.

يستحيل التحقق من أرقام الخسائر العسكرية من كلا الجانبين، ويُعتقد عمومًا أنها أعلى من ذلك. في سبتمبر/أيلول 2000، جمع مركز القوقاز قائمة بالخسائر المعلنة رسميًا في النزاع، والتي، على الرغم من كونها غير مكتملة وقليلة القيمة الواقعية، إلا أنها تُقدم لمحةً بسيطة عن حجم الخسائر. ^{[ 182 ]} ووفقًا للأرقام التي نشرتها وزارة الدفاع الروسية في أغسطس/آب 2005، قُتل ما لا يقل عن 1250 جنديًا من القوات المسلحة الروسية في المعارك خلال الفترة 1999-2005. ولم يشمل هذا العدد خسائر القوات الداخلية ، وجهاز الأمن الفيدرالي، والشرطة، والميليشيات المحلية، الذين قُتل منهم جميعًا ما لا يقل عن 1720 بحلول أكتوبر/تشرين الأول 2003. ^{[ 173 ]} وتشير تقديرات روسية وغربية مستقلة إلى أرقام أعلى بكثير؛ فعلى سبيل المثال، قدّر اتحاد لجان أمهات الجنود في روسيا أن حوالي 2000 جندي من الجيش الروسي قُتلوا بين عامي 1999 و2003. ^{[ 172 ]}

ازداد تطرف الشيشان. وخلف الضابطين السابقين في القوات المسلحة السوفيتية ، جوهر دوداييف وأصلان مسخادوف، قادةٌ يعتمدون بشكل أكبر على الفكر الإسلامي ، بدلاً من المشاعر القومية العلمانية للشعب. وبينما كان دوداييف ومسخادوف يسعيان للحصول على اعتراف موسكو باستقلال جمهورية الشيشان إشكيريا، عبّر قادة آخرون عن رغبتهم في طرد روسيا من منطقة شمال القوقاز بأكملها، وهي منطقة جبلية فقيرة يسكنها في الغالب مسلمون من جماعات عرقية غير روسية.

في أبريل/نيسان 2006، رداً على سؤال حول إمكانية التفاوض مع الروس، أجاب القائد الانفصالي البارز دوكو عمروف : "لقد عرضنا عليهم ذلك مراراً وتكراراً. لكن اتضح أننا نضغط باستمرار من أجل التفاوض، وكأننا نمدّ يد العون دائماً، وهذا يُفسَّر على أنه دليل على ضعفنا. لذلك، لا نعتزم القيام بذلك بعد الآن". وفي الشهر نفسه، صرّح المتحدث الانفصالي الجديد موفلادي أودوغوف بأنه ينبغي توقع وقوع هجمات في أي مكان في روسيا: "اليوم، لدينا مهمة مختلفة تماماً - حرب شاملة ، حرب في أي مكان يمكن الوصول فيه إلى عدونا. (...) وهذا يعني شنّ هجمات في أي مكان، ليس فقط في القوقاز، بل في جميع أنحاء روسيا". وفي إشارة إلى تزايد التطرف لدى المسلحين الذين يقودهم الشيشان، قال أودوغوف إن هدفهم لم يعد الديمقراطية والاستقلال على النمط الغربي، بل إقامة " إمارة شمال القوقاز " الإسلامية .

أدى هذا التوجه في نهاية المطاف إلى إعلان دوكو عمروف قيام إمارة القوقاز في أكتوبر/تشرين الأول 2007 ، حيث دعا أيضاً إلى جهاد عالمي، وإلى الانقسام السياسي بين المعتدلين والإسلاميين المتشددين الذين يقاتلون في الشيشان والمناطق المجاورة ذات الصلات بالشرق الأوسط. ^{[ 183 ]} ​​وقد ندد بعض القادة، الذين ما زالوا يقاتلون إلى جانب دوكو عمروف، مثل أنزور أستيميروف ، علناً بفكرة الجهاد العالمي، لكنهم يواصلون القتال من أجل استقلال دول القوقاز. ^{[ 184 ]}

حظي الصراع بدعم من المتعاطفين المسلمين حول العالم، وكان بعضهم على استعداد لحمل السلاح. ورأى العديد من المعلقين أن المقاتلين الشيشان على الأرجح على صلة بجماعات انفصالية إسلامية دولية. وقالت هيئة الإذاعة البريطانية (بي بي سي) في جلسة أسئلة وأجوبة عبر الإنترنت حول الصراع: "من المعروف منذ سنوات أن متطوعين مسلمين سافروا إلى الشيشان للانضمام إلى القتال، وذلك بعد حضورهم معسكرات تدريب في أفغانستان أو باكستان ، بحسب التقارير ." ^{[ 172 ]}

أثر التطرف الإسلامي أيضًا على الدعم الذي حظيت به الحركة الانفصالية الشيشانية في الخارج. ففي عام 2013، شنّ الأخوان تسارنايف هجومًا انتحاريًا في بوسطن ، مُعلنين انتماءهم للجهاد، ومتهمين الولايات المتحدة بقتل مسلمي العراق وأفغانستان وفلسطين ، مما أدى إلى إضعاف التعاطف مع المقاومة الشيشانية عالميًا، وزيادة كراهية الأجانب ضد الشيشان والمسلمين في الولايات المتحدة. ^{[ 185 ]} كما أن تفشي الإرهاب الإسلامي في أوروبا ، والدور البارز للشيشان في تنظيم الدولة الإسلامية في العراق والشام ، والذي تجسد في شخصية أبو عمر الشيشاني ، عرّض الحركة الانفصالية الشيشانية للخطر، نظرًا لتزايد المشاعر المعادية للإسلام في أوروبا، حتى في بعض الدول الأوروبية مثل بولندا ، التي دعمت الشيشان خلال وبعد الصراعات مع روسيا. ^{[ 186 ] [ 187 ] [ 188 ]}

بحسب تقرير صادر عن منظمة أطباء بلا حدود عام 2006 ، "لا تزال غالبية الشيشانيين يعانون من حياة مثقلة بالخوف وعدم اليقين والفقر". وأظهر استطلاع أجرته المنظمة في سبتمبر/أيلول 2005 أن 77% من المشاركين يعانون من "أعراض واضحة للاضطراب النفسي". ^{[ 189 ]}

في عام 2008، بلغ معدل وفيات الرضع 17 حالة وفاة لكل 1000 مولود، وهو الأعلى في روسيا؛ ^{[ 190 ]} وتشير التقارير إلى تزايد عدد الاضطرابات الوراثية لدى الأطفال الرضع والأمراض غير المفسرة بين أطفال المدارس. ^{[ 176 ]} يُولد طفل واحد من بين كل عشرة أطفال مصابًا بنوع من التشوهات التي تتطلب علاجًا. يُرسل بعض الأطفال الذين يستطيع آباؤهم تحمل تكاليف العلاج إلى جمهورية داغستان المجاورة، حيث يكون العلاج أفضل؛ وتفتقر الشيشان إلى المعدات الطبية الكافية في معظم مرافقها الطبية. ^{[ 191 ]} ووفقًا لمنظمة الأمم المتحدة للطفولة (اليونيسف)، فقد حوالي 25000 طفل في الشيشان أحد والديهم أو كليهما منذ عام 1994 وحتى عام 2008. ^{[ 192 ]} ويُظهر جيل كامل من أطفال الشيشان أعراض الصدمة النفسية . في عام 2006، صرّح نائب وزير الصحة الشيشاني الموالي لموسكو بأن أطفال الشيشان أصبحوا "نماذج حية" لما يعنيه أن ينشأ المرء تحت وطأة التهديد المستمر بالعنف والفقر المزمن. ^{[ 193 ]} وفي عام 2007، أحصت وزارة الداخلية الشيشانية ألف طفل شوارع متورطين في التشرد ؛ وكان العدد في ازدياد. ^{[ 194 ] [ 195 ]}

بحسب الإحصاءات الرسمية، بلغ معدل البطالة في الشيشان 32.9% في أغسطس/آب 2009. وبحلول عام 2017، انخفض هذا الرقم إلى 13.9%. ^{[ 196 ] [ 197 ]} ولا يزال الكثيرون بلا مأوى بسبب تدمير القوات الفيدرالية الروسية لجزء كبير من مساكن الشيشان، ولم يتلقَّ الكثيرون منهم تعويضات حتى الآن . ^{[ 198 ]} لم تقتصر الخسائر على البنية التحتية الاجتماعية (كالمساكن والمستشفيات) والاقتصادية فحسب، بل شملت أيضاً أسس الثقافة والتعليم، بما في ذلك معظم المؤسسات التعليمية والثقافية، التي دُمرت خلال الحربين في الشيشان. ^{[ 199 ]} ومع ذلك، تُبذل جهود إعادة إعمار مستمرة لإعادة بناء المنطقة بوتيرة سريعة خلال السنوات القليلة الماضية، وتشمل هذه الجهود بناء مساكن ومرافق جديدة، وتعبيد الطرق، وتركيب إشارات المرور، وبناء مسجد جديد، وإعادة التيار الكهربائي إلى معظم أنحاء المنطقة. ^{[ 200 ]} ولا تزال الحياة الحكومية والاجتماعية والتجارية تعاني من آثار الرشوة والاختطاف والابتزاز وغيرها من الأنشطة الإجرامية. تشير تقارير الحكومة الروسية إلى أن قطاع الجريمة المنظمة يبلغ ضعف المتوسط ​​الروسي، وأن الحكومة يُنظر إليها على نطاق واسع على أنها فاسدة وغير متجاوبة. ^{[ 201 ]}

نزح مئات الآلاف من الشيشان بسبب الصراع ، بما في ذلك 300 ألف في ذروة الصراع عام 2000. ^{[ 172 ]} نزح معظمهم داخليًا في الشيشان وفي جمهورية إنغوشيا المجاورة، لكن آلاف اللاجئين ذهبوا أيضًا إلى المنفى، وكان معظمهم يقيمون في دول الاتحاد الأوروبي اعتبارًا من عام 2008 .

عزز اندلاع الحرب شعبية فلاديمير بوتين محلياً، إذ بدأت الحملة بعد شهر واحد من توليه منصب رئيس الوزراء الروسي . ^{[ 166 ]} وقد ساهم الصراع بشكل كبير في إحداث تغييرات عميقة في السياسة والمجتمع الروسيين. ^{[ 202 ]}

منذ اندلاع الصراع الشيشاني عام 1994، وردت تقارير في جميع أنحاء روسيا عن حالات عودة جنود شباب إلى ديارهم وهم يعانون من مرارة وصدمات نفسية. وبدأ الأطباء النفسيون ومسؤولو إنفاذ القانون والصحفيون يطلقون على حالة الجنود المصابين بصدمات نفسية اسم "متلازمة الشيشان"، في إشارة إلى اضطرابات ما بعد الصدمة التي عانى منها الجنود السوفييت الذين قاتلوا في أفغانستان. ووفقًا ليوري ألكساندروفسكي، نائب مدير معهد سيربسكي في موسكو عام 2003، فإن ما لا يقل عن 70% من  المحاربين الشيشانيين القدامى، والبالغ عددهم نحو 1.5 مليون جندي، عانوا من متلازمة الشيشان. ^{[ 203 ]} عاد العديد من هؤلاء المحاربين مدمنين على الكحول، وعاطلين عن العمل، ومنعزلين اجتماعيًا . ^{[ 202 ]} كما أصيب الآلاف منهم بإعاقات جسدية دائمة، ولم يتلقوا سوى دعم محدود للغاية من الحكومة. ^{[ 204 ]}

بحسب دراسة أجرتها منظمتا ميموريال وديموس لحقوق الإنسان عام 2007، فقد رجال الشرطة الروس مؤهلاتهم ومهاراتهم المهنية خلال فترة خدمتهم في الشيشان. ^{[ 205 ]} وارتبط النزاع بتصاعد وحشية قوات الشرطة الروسية وتجريمها بشكل عام. ووفقًا لنشطاء حقوق الإنسان والصحفيين، فإن عشرات الآلاف من رجال الشرطة وقوات الأمن الذين ذهبوا إلى الشيشان تعلموا أنماطًا من الوحشية والإفلات من العقاب، ونقلوها إلى مناطقهم الأصلية، وغالبًا ما عادوا بمشاكل تأديبية ونفسية. ويصعب الحصول على إحصاءات موثوقة حول وحشية الشرطة ، ولكن في بيان صدر عام 2006، ذكرت إدارة الشؤون الداخلية بوزارة الداخلية الروسية أن عدد الجرائم المسجلة التي ارتكبها ضباط الشرطة ارتفع بنسبة 46.8% عام 2005. وفي استطلاع رأي وطني أُجري عام 2005، قال 71% من المستطلَعين إنهم لا يثقون بشرطتهم على الإطلاق؛ وفي استطلاع آخر، قال 41% من الروس إنهم يعيشون في خوف من عنف الشرطة. ^{[ 206 ] [ 207 ]} وفقًا لمنظمة العفو الدولية، أصبح تعذيب المعتقلين في روسيا أمرًا متفشيًا . ^{[ 202 ]} منذ عام 2007، لم يقتصر إرسال ضباط الشرطة من خارج القوقاز على الشيشان فحسب، بل شمل جميع جمهوريات المنطقة. ^{[ 205 ]}

كانت الحروب في الشيشان وما ارتبط بها من إرهاب ضد القوقاز في روسيا من العوامل الرئيسية في تنامي التعصب وكراهية الأجانب والعنف العنصري في روسيا، والذي كان موجهاً في معظمه ضد سكان القوقاز. ^{[ 202 ]} وكان من غير المرجح أن تصنف السلطات الروسية الهجمات العشوائية على غير الروس على أنها عنصرية، مفضلةً تسميتها " أعمال شغب ". وقد تضاعف عدد جرائم القتل المصنفة رسمياً على أنها عنصرية في روسيا بين عامي 2003 و2004. وشمل هذا العنف أعمالاً إرهابية مثل تفجير سوق موسكو عام 2006 الذي أسفر عن مقتل 13 شخصاً. ^{[ 208 ] [ 209 ]} وفي عام 2007، أعلن أرتور رينو، البالغ من العمر 18 عاماً، مسؤوليته عن 37 جريمة قتل ذات دوافع عنصرية خلال عام واحد، قائلاً إنه "منذ أيام الدراسة كان يكره سكان القوقاز". ^{[ 210 ]} في 5 يونيو/حزيران 2007، اندلعت أعمال شغب معادية للشيشان شارك فيها المئات في مدينة ستافروبول جنوب روسيا. وطالب مثيرو الشغب بطرد الشيشانيين بعد مقتل شابين روسيين، يعتقد السكان المحليون أن الشيشانيين هم من قتلوهما. وأعاد هذا الحدث إلى الأذهان اشتباكًا وقع مؤخرًا بين الشيشانيين والروس المحليين في كوندوبوغا ، حيث قُتل روسيان بسبب فاتورة غير مدفوعة. ^{[ 211 ]} كما يواجه القوقازيون عنفًا ذا دوافع عرقية في صفوف الجيش الروسي. ^{[ 212 ]}