الكلاميديوتا
| الكلاميديوتا | |
|---|---|
| الكلاميديا التراخومية | |
| التصنيف العلمي | |
| اِختِصاص: | البكتيريا |
| شعبة فرعية: | شعبة البولي فينيل كلوريد |
| الشعبة: | الكلاميديوتا جاريتي وهولت 2021 [3] |
| فصل: | الكلاميديا القرن 2016 [1] [2] |
| الطلبات والعائلات | |
| |
| المرادفات | |
| |
الكلاميديوتا (مرادف الكلاميديا ) هي شعبة وفئة من البكتيريا التي يتنوع أعضاؤها بشكل ملحوظ، بما في ذلك مسببات الأمراض للإنسان والحيوان، والمتعايشات مع الأوليات المنتشرة في كل مكان ، [4] وأشكال الرواسب البحرية التي لم يتم فهمها جيدًا بعد. [5] جميع الكلاميديوتا التي عرفها البشر منذ عقود عديدة هي بكتيريا داخل الخلايا إلزامية؛ في عام 2020، تم اكتشاف العديد من الكلاميديوتا الإضافية في بيئات قاع المحيط، ولا يُعرف بعد ما إذا كانت جميعها لديها مضيفين . [5] تاريخيًا، كان يُعتقد أن جميع الكلاميديوتا لها جدار خلوي خالٍ من الببتيدوجليكان ، لكن الدراسات في العقد الأول من القرن الحادي والعشرين أظهرت وجودًا يمكن اكتشافه للببتيدوجليكان، بالإضافة إلى بروتينات مهمة أخرى. [6] [7] [8] [9] [10] [11]
من بين الكلاميديوتا، تنمو جميع الكائنات الحية المعروفة منذ فترة طويلة في العلوم فقط عن طريق إصابة الخلايا المضيفة حقيقية النواة . وهي صغيرة مثل العديد من الفيروسات أو أصغر منها . وهي بيضاوية الشكل وسلبية الجرام . وهي تعتمد على التكاثر داخل الخلايا المضيفة؛ وبالتالي، يُطلق على بعض الأنواع مسببات الأمراض داخل الخلايا الإلزامية والبعض الآخر متعايش مع الكائنات الأولية المنتشرة في كل مكان. توجد معظم الكلاميديوتا داخل الخلايا في جسم تضميني أو فجوة . وخارج الخلايا، تبقى على قيد الحياة فقط كشكل معدي خارج الخلية.
لا يمكن لهذه الكلاميديوتا أن تنمو إلا حيث تنمو خلاياها المضيفة، وتتطور وفقًا لدورة نمو ثنائية الطور مميزة. [12] [13] [14] لذلك، لا يمكن نشر الكلاميديوتا ذات الصلة السريرية في وسائط زراعة البكتيريا في المختبر السريري. يتم عزلها بنجاح أكبر أثناء وجودها داخل خلاياها المضيفة.
من بين أنواع الكلاميديا المختلفة التي تسبب أمراضًا للإنسان، فإن النوعين الأكثر أهمية هما الكلاميديا الرئوية ، التي تسبب نوعًا من الالتهاب الرئوي ، والكلاميديا التراخومية ، التي تسبب الكلاميديا . الكلاميديا هي العدوى البكتيرية المنقولة جنسيًا الأكثر شيوعًا في الولايات المتحدة، ويتم الإبلاغ عن 2.86 مليون حالة إصابة بالكلاميديا سنويًا.
تاريخ
تم وصف مرض شبيه بالكلاميديا يصيب عيون البشر لأول مرة في المخطوطات الصينية والمصرية القديمة. وقد قدم هالبرستادرتر وفون بروفاسيك وصفًا حديثًا للكائنات الحية الشبيهة بالكلاميديا في عام 1907.
تم الحصول على عزلات الكلاميديا المزروعة في أكياس صفار البيض من تفشي التهاب الرئة لدى البشر في أواخر عشرينيات وأوائل ثلاثينيات القرن العشرين، وبحلول منتصف القرن العشرين، تم الحصول على عزلات من عشرات الأنواع من الفقاريات. ظهر مصطلح الكلاميديا (عباءة) في الأدبيات في عام 1945، على الرغم من استمرار استخدام أسماء أخرى، بما في ذلك Bedsonia و Miyagawanella و ornithosis- و TRIC- و PLT-agents. في عام 1956، تم زراعة Chlamydia trachomatis لأول مرة بواسطة Tang Fei-fan ، على الرغم من أنها لم يتم التعرف عليها بعد على أنها بكتيريا. [15]
التسمية
في عام 1966، تم التعرف على الكلاميديوتا باعتبارها بكتيريا وتم التحقق من صحة جنس الكلاميديا . [16] تم إنشاء رتبة الكلاميديا بواسطة ستورز وبيج في عام 1971. تم نشر فئة الكلاميديا مؤخرًا بشكل صحيح. [17] [18] [19] بين عامي 1989 و 1999، تم التعرف على عائلات وأجناس وأنواع جديدة. تم إنشاء شعبة الكلاميديا في دليل بيرجي لعلم البكتيريا المنهجي . [20] بحلول عام 2006، تم الإبلاغ عن البيانات الجينية لأكثر من 350 سلالة كلاميديا. [21] يتضمن اكتشاف أشكال قاع المحيط المبلغ عنها في عام 2020 مجموعات جديدة . [5] في عام 2022، تمت إعادة تسمية الشعبة باسم الكلاميديوتا. [3]
التصنيف والتوقيعات الجزيئية
تحتوي الكلاميديوتا حاليًا على ثمانية أجناس تحمل أسماء صحيحة، و14 جنسًا. [22] تتكون الشعبة حاليًا من رتبتين (Chlamydiales وParachlamydiales) وتسع عائلات ضمن فئة واحدة (Chlamydiia). [17] [18] أربع عائلات فقط تحمل أسماء صحيحة ( Chlamydiaceae و Parachlamydiaceae و Simkaniaceae و Waddliaceae ) [23] [24] بينما تم وصف خمسة عائلات (Clavichlamydiaceae وCriblamydiaceae وParilichlamydiaceae وPiscichlamydiaceae و Rhabdochlamydiaceae ). [25] [26] [27]
تحتوي رتبة Chlamydiales كما تم وصفها مؤخرًا على عائلات Chlamydiaceae و Clavichlamydiaceae، بينما تضم رتبة Parachlamydiales الجديدة العائلات السبع المتبقية. [17] ويدعم هذا الاقتراح ملاحظة وجود مجموعتين فرعيتين متميزتين تستحقان رتبًا تصنيفية أعلى من مستوى العائلة. وقد وجد أن التوقيعات الجزيئية في شكل علامات حذف محفوظة (CSIs) وبروتينات (CSPs) مشتركة بشكل فريد بين كل رتبة منفصلة، مما يوفر وسيلة للتمييز بين كل مجموعة فرعية والأخرى ودعم وجهة نظر الأصول المشتركة للعائلات داخل كل رتبة. [17] [28] كما أن تميز المجموعتين مدعوم أيضًا بحقيقة عدم العثور على علامات حذف محفوظة بين أي مجموعة أخرى من العائلات.
تم العثور أيضًا على توقيعات جزيئية حصرية لعائلة Chlamydiaceae. [17] [28] تتكون Chlamydiaceae في الأصل من جنس واحد، Chlamydia ، ولكن في عام 1999 تم تقسيمها إلى جنسين، Chlamydophila و Chlamydia . تم لم شمل الأجناس منذ عام 2015 حيث تم إعادة تصنيف الأنواع التي تنتمي إلى جنس Chlamydophila على أنها أنواع Chlamydia. [29] [30]
ومع ذلك، تم العثور على CSIs وCSPs خصيصًا لأنواع Chlamydophila، مما يدعم تميزها عن Chlamydia، وربما يبرر ذلك النظر الإضافي في مجموعتين منفصلتين داخل العائلة. [17] [28] كما تم العثور على CSIs وCSPs التي يشترك فيها جميع Chlamydia حصريًا والتي تشير بشكل أكبر إلى سلالة مستقلة عن Chlamydophila، مما يدعم وسيلة للتمييز بين أنواع Chlamydia وأعضاء Chlamydophila المجاورة.
علم الوراثة التطوري
تشكل الكلاميديوتا مجموعة تطورية بكتيرية فريدة انفصلت عن البكتيريا الأخرى منذ حوالي مليار سنة، ويمكن تمييزها من خلال وجود العديد من CSIs وCSPs. [17] [28] [31] [14] يمكن تمييز الأنواع من هذه المجموعة عن جميع البكتيريا الأخرى من خلال وجود indels محفوظة في عدد من البروتينات ومن خلال أعداد كبيرة من البروتينات المميزة الموجودة بشكل فريد في أنواع مختلفة من الكلاميديا. [32] [33]
وقد تباينت التقارير حول ما إذا كانت الكلاميديوتا مرتبطة بالبلانتومايسوتا أو سبيروتشاتوتا . [ 34] [35] ومع ذلك، يشير تسلسل الجينوم إلى أن 11٪ من الجينات في بروتوكلاميديا أميبوفيلا UWE25 و4٪ في الكلاميديا تشبه إلى حد كبير جينات البلاستيدات الخضراء والنباتات والبكتيريا الزرقاء . [ 14] افترض كافاليير سميث أن الكلاميديوتا تقع في فرع بلانكتوباكتريا في الفرع الأكبر جراسيليكوتيس . ومع ذلك، يشير علم النشوء والتطور والوجود المشترك لـ CSIs في البروتينات الخاصة بالسلالة إلى أن Verrucomicrobiota هي أقرب الأقارب الأحرار لهذه الكائنات الطفيلية. [36] قدمت مقارنة جينات الحمض النووي الريبي الريبوسومي علم النشوء والتطور للسلالات المعروفة داخل الكلاميديوتا. [21]
مسببات الأمراض البشرية والتشخيص
تم وصف ثلاثة أنواع من الكلاميديوتا التي تصيب البشر بشكل شائع:
- الكلاميديا التراخومية ، التي تسبب مرض العين التراخوما والعدوى المنقولة جنسياً الكلاميديا
- الكلاميدوفيلا الرئوية ، والتي تسبب شكلاً من أشكال الالتهاب الرئوي
- الكلاميدوفيلا بسيتاسي ، التي تسبب داء الببغائيات
إن الوضع الفسيولوجي الفريد للكلاميديا بما في ذلك دورة حياتها ثنائية الطور والتزامها بالتكاثر داخل مضيف حقيقي النواة قد مكن من استخدام تحليل الحمض النووي لتشخيص الكلاميديا. [37] إن النقل الأفقي للجينات واضح ويعقد هذا المجال من البحث. في أحد الأمثلة المتطرفة، تم العثور على جينين يشفران بروتينات H1 الشبيهة بالهيستون من أصل حقيقي النواة في الجينوم البدائي لـ C. trachomatis، وهو ممرض داخل الخلايا إلزامي .
نسالة
| 16S rRNA القائم على LTP _08_2023 [38] [39] [40] | 120 بروتينًا مميزًا يعتمد على GTDB 08-RS214 [41] [42] [43] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
التصنيف
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء الكائنات الحية البدائية التي لها مكانة في التسمية (LPSN) [44] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) [45]
- "Similichlamydiales" Pallen وRodriguez-R وAlikhan 2022 [Hat2]
- عائلة "Piscichlamydiaceae" قرن 2010
- عائلة "Parilichlamydiaceae" Stride et al. 2013 ["Similichlamydiaceae" Pallen, Rodriguez-R & Alikhan 2022 ]
- طلب الكلاميديا ستورز و صفحة 1971
- عائلة "Actinochlamydiaceae" Steigen et al. 2013
- عائلة "Criblamydiaceae" Thomas, Casson & Greub 2006
- عائلة الكلاميديا Rake 1957 [قرن "الكلافيكلاميديا" 2011 ]
- الفصيلة الباراكلاميدياسية إيفرت وبوش وأندرسن 1999
- عائلة Rhabdochlamydiaceae Corsaro et al. 2009
- الفصيلة السمكانية إيفرت، بوش وأندرسن 1999
- عائلة Waddliaceae Rurangirwa وآخرون. 1999
انظر أيضا
مراجع
- ^ Horn M. (2010). "Class I. Chlamydiia class. nov.". في Krieg NR، Staley JT، Brown DR، Hedlund BP، Paster BJ، Ward NL، Ludwig W، Whitman WB. (المحررون). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . المجلد 4 (الطبعة الثانية). نيويورك، نيويورك: Springer. ص 844. doi :10.1007/978-0-387-68572-4. ISBN 978-0-387-95042-6.
- ^ Oren A, Garrity GM. (2016). "قائمة التحقق رقم 170. قائمة بالأسماء الجديدة والتركيبات الجديدة التي تم نشرها سابقًا بشكل فعال، ولكن ليس بشكل صحيح". Int J Syst Evol Microbiol . 66 (7): 2463–2466. doi : 10.1099/ijsem.0.001149 . PMID 27530111.
- ^ ab Oren A, Garrity GM (2021). "نشر صالح لأسماء اثنين وأربعين شعبة من بدائيات النوى". Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308.
- ^ Sixt BS, Siegl A, Müller C, Watzka M, Wultsch A, Tziotis D, et al. (2013). "الخصائص الأيضية للأجسام الأولية لـ Protochlamydia amoebophila - رابط بين النشاط والقدرة على العدوى في Chlamydiae". PLOS Pathogens . 9 (8): e1003553. doi : 10.1371/journal.ppat.1003553 . PMC 3738481. PMID 23950718 .
- ^ abc Dharamshi JE, Tamarit D, Eme L, Stairs CW, Martijn J, Homa F, et al. (مارس 2020). "الرواسب البحرية تضيء تنوع الكلاميديا وتطورها". علم الأحياء الحالي . 30 (6): 1032–1048.e7. رمز Bibcode : 2020CBio...30E1032D. doi : 10.1016/j.cub.2020.02.016 . PMID 32142706. S2CID 212423997.
- ^ Pilhofer M, Aistleitner K, Biboy J, Gray J, Kuru E, Hall E, et al. (2013-12-02). "اكتشاف ببتيدوغليكان الكلاميديا يكشف عن بكتيريا ذات أكياس مورين ولكن بدون FtsZ". Nature Communications . 4 (1): 2856. Bibcode :2013NatCo...4.2856P. doi : 10.1038/ncomms3856. PMC 3847603. PMID 24292151.
- ^ Jacquier N, Viollier PH, Greub G (مارس 2015). "دور الببتيدوغليكان في انقسام الخلايا الكلاميديا: نحو حل الشذوذ الكلاميديا". مراجعات علم الأحياء الدقيقة FEMS . 39 (2): 262-275. doi : 10.1093/femsre/fuv001 . PMID 25670734.
- ^ Malhotra M، Sood S، Mukherjee A، Muralidhar S، Bala M (سبتمبر 2013). "Genital Chlamydia trachomatis: an update". المجلة الهندية للأبحاث الطبية . 138 (3): 303–316. PMC 3818592. PMID 24135174 .
- ^ Liechti GW, Kuru E, Hall E, Kalinda A, Brun YV, VanNieuwenhze M, Maurelli AT (فبراير 2014). "طريقة جديدة لتصنيف جدار الخلية الأيضية تكشف عن ببتيدوغليكان في الكلاميديا تراخوماتيس". مجلة نيتشر . 506 (7489): 507-510. رمز Bibcode :2014Natur.506..507L. doi : 10.1038/nature12892. PMC 3997218. PMID 24336210.
- ^ Liechti G، Kuru E، Packiam M، Hsu YP، Tekkam S، Hall E، وآخرون. (مايو 2016). "الكلاميديا المسببة للأمراض تفتقر إلى كيس كلاسيكي ولكنها تصنع حلقة ببتيدوغليكان ضيقة في منتصف الخلية، تنظمها MreB، لانقسام الخلايا". PLOS Pathogens . 12 (5): e1005590. doi : 10.1371/journal.ppat.1005590 . PMC 4856321. PMID 27144308 .
- ^ Gupta RS (أغسطس 2011). "أصل البكتيريا السالبة الجرام: الضغط الانتقائي للمضادات الحيوية بدلاً من التعايش الداخلي أدى على الأرجح إلى تطور الخلايا البكتيرية ذات الغشائين". Antonie van Leeuwenhoek . 100 (2): 171–182. doi :10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204 .
- ^ Horn M (2008). "Chlamydiae as symbionts in eukaryotes". Annual Review of Microbiology . 62 : 113–131. doi :10.1146/annurev.micro.62.081307.162818. PMID 18473699. S2CID 13405815.
- ^ عبد الرحمن YM، بيلاند RJ (نوفمبر 2005). "دورة نمو الكلاميديا". مراجعات علم الأحياء الدقيقة FEMS . 29 (5): 949-959. doi : 10.1016/j.femsre.2005.03.002 . PMID 16043254.
- ^ abc Horn M, Collingro A, Schmitz-Esser S, Beier CL, Purkhold U, Fartmann B, et al. (أبريل 2004). "إلقاء الضوء على التاريخ التطوري لـ Chlamydiae". Science . 304 (5671): 728–730. Bibcode :2004Sci...304..728H. doi : 10.1126/science.1096330 . PMID 15073324. S2CID 39036549.
- ^ فيليب س. براشمان وإلياس أبرتين (2009-07-23). العدوى البكتيرية للإنسان: علم الأوبئة والسيطرة عليها . رقم ISBN 9780387098425.
- ^ Moulder JW (1966). "علاقة مجموعة الببغاوات (Chlamydiae) بالبكتيريا والفيروسات". المراجعة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 20 : 107-130. doi :10.1146/annurev.mi.20.100166.000543. PMID 5330228.
- ^ abcdefg Gupta RS, Naushad S, Chokshi C, Griffiths E, Adeolu M (سبتمبر 2015). "تحليل قائم على العلامات الجزيئية والتطورية لشعبة الكلاميديا: اقتراح لتقسيم فئة الكلاميديا إلى رتبتين، الكلاميديا والباراكلاميديا، حسب الترتيب، ووصف منقح لفئة الكلاميديا". أنطوني فان ليوينهوك . 108 (3): 765–781. doi :10.1007/s10482-015-0532-1. PMID 26179278. S2CID 17099157.
- ^ ab Oren A, Garrity GM (يوليو 2016). "قائمة بالأسماء الجديدة والتركيبات الجديدة التي تم نشرها سابقًا بشكل فعال، ولكن ليس بشكل صحيح". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 66 (7): 2463-2466. doi : 10.1099/ijsem.0.001149 . PMID 27530111.
- ^ Storz J, Page LA (1971). "تصنيف الكلاميديا: أسباب تصنيف الكائنات الحية من جنس الكلاميديا، عائلة الكلاميديا، في ترتيب منفصل، Chlamydiales ord. nov". المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 21 (4): 332-334. doi : 10.1099/00207713-21-4-332 .
- ^ Garrity GM, Boone DR (2001). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria (الطبعة الثانية). Springer. ISBN 978-0-387-98771-2.
- ^ ab Everett KD, Thao M, Horn M, Dyszynski GE, Baumann P (يوليو 2005). "الكلاميديا الجديدة في الذباب الأبيض والحشرات القشرية: التعايش الداخلي لسلالة 'Candidatus Fritschea bemisiae' Falk وسلالة 'Candidatus Fritschea eriococci' Elm". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 55 (الجزء 4): 1581-1587. doi : 10.1099/ijs.0.63454-0 . PMID 16014485.
- ^ Sayers; et al. "Chlamydiia". قاعدة بيانات تصنيف المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 2016-10-24 .
- ^ Everett KD, Bush RM, Andersen AA (أبريل 1999). "وصف مُعدل لرتبة Chlamydiales، اقتراح لعائلة Parachlamydiaceae fam. nov. وعائلة Simkaniaceae fam. nov.، كل منها يحتوي على جنس أحادي النمط، تصنيف مُنقح لعائلة Chlamydiaceae، بما في ذلك جنس جديد وخمسة أنواع جديدة، ومعايير لتحديد هوية الكائنات الحية". المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 49 (الجزء 2): 415-440. doi : 10.1099/00207713-49-2-415 . PMID 10319462.
- ^ Rurangirwa FR، Dilbeck PM، Crawford TB، McGuire TC، McElwain TF (أبريل 1999). "تحليل جين 16S rRNA للكائنات الحية الدقيقة WSU 86-1044 من جنين بقري مجهض يكشف أنه عضو في رتبة Chlamydiales: اقتراح من عائلة Waddliaceae nov.، Waddlia chondrophila gen. nov.، sp. nov". المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 49 (الجزء 2): 577-581. doi : 10.1099/00207713-49-2-577 . PMID 10319478.
- ^ توماس ف، كاسون ن، جروب ج (ديسمبر 2006). "كريبلاميديا سيكواينسيس، نوع جديد من الكلاميديا داخل الخلايا تم عزله من مياه نهر السين باستخدام ثقافة مشتركة مع الأميبال". علم الأحياء الدقيقة البيئي . 8 (12): 2125-2135. رمز Bibcode :2006EnvMi...8.2125T. doi :10.1111/j.1462-2920.2006.01094.x. PMID 17107554. S2CID 31211875.
- ^ Stride MC, Polkinghorne A, Miller TL, Groff JM, Lapatra SE, Nowak BF (مارس 2013). "التوصيف الجزيئي لـ "Candidatus Parilichlamydia carangidicola"، عامل جديد شبيه بالكلاميديا في سمك الملك الأصفر، Seriola lalandi (Valenciennes)، واقتراح عائلة جديدة، "Candidatus Parilichlamydiaceae" fam. nov. (رتبة Chlamydiales)". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 79 (5): 1590–1597. رمز Bibcode :2013ApEnM..79.1590S. doi :10.1128/AEM.02899-12. PMC 3591964. PMID 23275507 .
- ^ Kuo CC, Horn M, Stephens RS (2011) Order I. Chlamydiales. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 4, 2nd ed. pp. 844-845. Eds Krieg N, Staley J, Brown D, Hedlund B, Paster B, Ward N, Ludwig W, Whitman W. Springer-: New York.
- ^ abcd Griffiths E, Ventresca MS, Gupta RS (January 2006). "فحص BLAST لجينومات الكلاميديا لتحديد البروتينات المميزة الفريدة لمجموعات الأنواع Chlamydiales وChlamydiaceae وChlamydophila وChlamydia". BMC Genomics . 7 : 14. doi : 10.1186/1471-2164-7-14 . PMC 1403754. PMID 16436211 .
- ^ Sachse K, Bavoil PM, Kaltenboeck B, Stephens RS, Kuo CC, Rosselló-Móra R, Horn M (مارس 2015). "تعديل عائلة Chlamydiaceae: اقتراح جنس واحد، Chlamydia، ليشمل جميع الأنواع المعترف بها حاليًا". علم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطبيقي . 38 (2): 99-103. رمز Bibcode : 2015SyApM..38...99S. doi : 10.1016/j.syapm.2014.12.004. hdl : 10261/123714. PMID 25618261.
- ^ Oren A, Garrity GM (2015). "قائمة بالأسماء الجديدة والتركيبات الجديدة التي تم نشرها سابقًا بشكل فعال، ولكن ليس بشكل صحيح". Int J Syst Evol Microbiol . 65 (7): 2017–2025. doi :10.1099/ijs.0.000317. PMID 28056215.
- ^ Greub G, Raoult D (سبتمبر 2003). "تاريخ جين ترميز ADP/ATP-translocase، وهو جين طفيلي انتقل من أحد أسلاف Chlamydiales إلى النباتات منذ مليار عام". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 69 (9): 5530-5535. رمز Bibcode :2003ApEnM..69.5530G. doi :10.1128/AEM.69.9.5530-5535.2003. PMC 194985. PMID 12957942.
- ^ Griffiths E, Petrich AK, Gupta RS (أغسطس 2005). "الحذف المحفوظ في البروتينات الأساسية التي تعد من السمات المميزة للكلاميديا وتوفر وسائل جديدة لتحديدها". علم الأحياء الدقيقة . 151 (الجزء 8): 2647–2657. doi : 10.1099/mic.0.28057-0 . PMID 16079343.
- ^ Gupta RS, Griffiths E (ديسمبر 2006). "البروتينات والإضافات الخاصة بالكلاميديا: أدوات جديدة للدراسات". Trends in Microbiology . 14 (12): 527–535. doi :10.1016/j.tim.2006.10.002. PMID 17049238.
- ^ Ward NL, Rainey FA, Hedlund BP, Staley JT, Ludwig W, Stackebrandt E (نوفمبر 2000). "التحليلات المقارنة للتطور الوراثي لأعضاء رتبة Planctomycetales وقسم Verrucomicrobia: تحليل تسلسل جين 23S rRNA يدعم التطور الوراثي المشتق من تسلسل جين 16S rRNA". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 50 (الجزء 6): 1965-1972. doi : 10.1099/00207713-50-6-1965 . PMID 11155969.
- ^ Teeling H, Lombardot T, Bauer M, Ludwig W, Glöckner FO (مايو 2004). "تقييم الوضع التطوري للفطريات 'Rhodopirellula baltica' SH 1 من خلال تسلسلات بروتينات الريبوسوم المتسلسلة، وتسلسلات وحدات بوليميراز الحمض النووي الريبي الموجهة بالحمض النووي وأشجار الجينوم الكاملة". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 54 (الجزء 3): 791-801. doi : 10.1099/ijs.0.02913-0 . PMID 15143026.
- ^ Griffiths E, Gupta RS (أغسطس 2007). "التطور والأجزاء المشتركة المحفوظة في البروتينات توفر دليلاً على أن Verrucomicrobia هي أقرب أقارب الكلاميديا الحرة المعروفة". علم الأحياء الدقيقة . 153 (الجزء 8): 2648-2654. doi : 10.1099/mic.0.2007/009118-0 . PMID 17660429. S2CID 2094762.
- ^ Corsaro D, Greub G (أبريل 2006). "الإمكانات المسببة للأمراض لبكتيريا الكلاميديا الجديدة وطرق التشخيص للعدوى الناتجة عن هذه البكتيريا داخل الخلايا". مراجعات علم الأحياء الدقيقة السريرية . 19 (2): 283-297. doi : 10.1128/CMR.19.2.283-297.2006. PMC 1471994. PMID 16614250.
- ^ "The LTP" . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "شجرة LTP_all بتنسيق newick" . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "ملاحظات إصدار LTP_08_2023" (PDF) . تم الاسترجاع في 20 نوفمبر 2023 .
- ^ "GTDB release 08-RS214". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ^ "bac120_r214.sp_label". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ^ "تاريخ التصنيف". قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ^ JP Euzéby. "Chlamydiota". قائمة أسماء الكائنات الحية البدائية التي لها مكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 2022-09-09 .
- ^ Sayers; et al. "Chlamydiae". قاعدة بيانات تصنيف المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 2022-09-09 .
روابط خارجية
- وارد م. "www.chlamydiae.com". جامعة ساوثهامبتون.
ويكي مرجعي وتعليمي شامل عن الكلاميديا والكلاميديا
- نظرة عامة على الكلاميديا
