متحور ألفا من فيروس سارس-كوف-2

يُعرف هذا النوع بعدة أسماء. خارج المملكة المتحدة، يُشار إليه أحيانًا باسم النوع البريطاني أو النوع الإنجليزي ، ^{[ 14 ]} على الرغم من وجود أنواع أخرى أقل شيوعًا، تم تحديدها لأول مرة في المملكة المتحدة، مثل نوع إيتا (السلالة B.1.525). داخل المملكة المتحدة، يُشار إليه عادةً باسم نوع كينت نسبةً إلى ^كينت ، حيث تم اكتشاف هذا النوع. [ ^{15 ] [ 16 ] [ 17 ]}

في الاستخدام العلمي، سُمّي هذا المتغير في الأصل "المتغير الأول قيد التحقيق" في ديسمبر 2020 (VUI – 202012/01) من قِبل هيئة الصحة العامة في إنجلترا (PHE)، ^{[ 18 ] [ أ ]} ولكن أعيد تصنيفه إلى " متغير مثير للقلق" ( Varant of Concern 202012/01 ، ويُختصر إلى VOC-202012/01 ) من قِبل ميرا تشاند وزملائها في تقرير نشرته هيئة الصحة العامة في إنجلترا في 21 ديسمبر 2020. ^{[ ب ]} في تقرير كُتب نيابةً عن اتحاد علم جينوم كوفيد-19 في المملكة المتحدة (COG-UK) ، أطلق أندرو رامبوت وزملاؤه، باستخدام أداة "التصنيف التطوري لسلالات تفشي الأمراض العالمية المسماة" (بانغولين)، عليه اسم السلالة B.1.1.7 ، ^{[ 5 ]} بينما أطلق عليه موقع Nextstrain اسم 20I/501Y.V1 . ^{[ 20 ]}

يشير الاسم VOC-202102/02 إلى المتغير الذي يحمل طفرة E484K (انظر أدناه ). ^{[ 11 ]}

• 
  تم رسم طفرات الأحماض الأمينية لمتغير ألفا من فيروس SARS-CoV-2 على خريطة جينوم فيروس SARS-CoV-2 مع التركيز على بروتين سبايك. ^{[ 21 ]}

تعد الطفرات في فيروس SARS-CoV-2 شائعة: فقد تم اكتشاف أكثر من 4000 طفرة في بروتين السنبلة الخاص به وحده، وفقًا لاتحاد علم جينوم كوفيد-19 في المملكة المتحدة (COG-UK) . ^{[ 22 ]}

يتم تعريف VOC-202012/01 من خلال 23 طفرة: 14 طفرة غير مترادفة، و3 عمليات حذف، و6 طفرات مترادفة ^{[ 23 ]} (أي أن هناك 17 طفرة تغير البروتينات وستة لا تغيرها ^{[ 7 ]} ).

في 2 فبراير 2021، أفادت هيئة الصحة العامة في إنجلترا باكتشافها "عددًا محدودًا من جينومات B.1.1.7 VOC-202012/01 الحاملة لطفرة E484K "، ^{[ 1 ]} وهي طفرة موجودة أيضًا في متغيري بيتا وجاما ؛ ^{[ 15 ]} وهي طفرة قد تُقلل من فعالية اللقاح. [ ^{15 ] وفي} 9 فبراير 2021، عُلم باكتشاف حوالي 76 حالة تحمل طفرة E484K، معظمها في بريستول، بالإضافة إلى مجموعة جينومية متميزة في ليفربول تحمل الطفرة نفسها. ^{[ 31 ]} وبعد أسبوع، أفاد تقرير بحثي وتحليلي صادر عن هيئة الصحة العامة في إنجلترا بوجود 77 حالة مؤكدة ومحتملة تحمل طفرة E484K في جميع أنحاء المملكة المتحدة، ضمن متغيرين هما VUI-202102/01 وVOC-202102/02، ووُصف الأخير بأنه "B.1.1.7 مع E484K". ^{[ 11 ]}

في 5 مارس 2021، أُفيد باكتشاف سلالة B.1.1.7 تحمل طفرة E484K لدى مريضين أمريكيين (في ولايتي أوريغون ونيويورك). ورجّح الباحثون أن طفرة E484K في سلالة أوريغون نشأت بشكل مستقل. ^{[ 32 ] [ 33 ]}

وُجد أن قابلية انتقال سلالة ألفا (السلالة B.1.1.7) أعلى بكثير من قابلية انتقال سلالات فيروس سارس-كوف-2 الموجودة مسبقًا. اكتشف هذه السلالة فريق من العلماء في مركز أبحاث السرطان في المملكة المتحدة (COG-UK) ، حيث أظهرت نتائجهم الأولية أن قابلية انتقالها أعلى بنسبة 70% (50-100%). ^{[ 17 ] [ 34 ]} وأفادت دراسة أجراها مركز النمذجة الرياضية للأمراض المعدية في كلية لندن للصحة والطب الاستوائي أن هذه السلالة أكثر قابلية للانتقال بنسبة تتراوح بين 43% و90% (ضمن نطاق فترات موثوقية 95%، من 38 % إلى 130%) مقارنةً بالسلالات الموجودة مسبقًا في المملكة المتحدة ، وذلك بحسب الطريقة المستخدمة لتقييم الزيادة في قابلية الانتقال. وقد سُجلت زيادات مماثلة في قابلية انتقال السلالة B.1.1.7 في الدنمارك وسويسرا والولايات المتحدة . ^{[ 35 ]} علاوة على ذلك، أظهر نموذج بسيط لتفسير الانتشار السريع للسلالة B.1.1.7 في عدة دول حول العالم أن هذا المتغير أكثر قابلية للانتقال بنسبة 50% من النوع البري المحلي في هذه الدول الثلاث وعلى مستوى العالم ككل. ^{[ 36 ]} وخلصت دراسة أخرى إلى أنه كان أكثر قابلية للانتقال بنسبة 75% (70%–80%) في المملكة المتحدة بين أكتوبر ونوفمبر 2020. ^{[ 37 ]} وأشارت دراسة لاحقة إلى أن هذه التقديرات السابقة بالغت في تقدير قابلية انتقال هذا المتغير، وأن الزيادة في قابلية الانتقال كانت ضمن الحد الأدنى لهذه النطاقات. ^{[ 38 ] [ 39 ]}

قامت وزارة الصحة والرعاية والرياضة الهولندية ، استنادًا إلى تسلسل الجينوم للحالات الإيجابية، بحساب معدل انتقال السلالة المتحورة أسبوعيًا مقارنةً بالنمط البري المحلي، ووجدت أنه يتذبذب بين 28% و47% أعلى خلال الأسابيع الستة الأولى من عام 2021. ^{[ 40 ]} في المقابل، حسب معهد ستاتنز سيروم الدنماركي أن معدل انتقالها في الدنمارك أعلى بنسبة 55% (48%–62%) استنادًا إلى التطور الملحوظ لترددها النسبي من 4 يناير إلى 12 فبراير 2021. ^{[ 41 ]} قام معهد الطب الاجتماعي والوقائي (ISPM) التابع لجامعة برن بحساب معدل انتقال السلالة B.1.1.7 استنادًا إلى التطور الأسبوعي لنسبة الحالات الإيجابية لـكوفيد-19 خلال فترة الجائحة بأكملها، ووجد، بفترات ثقة 95%، وبافتراض أن معدل التكاثر الأساسي للنمط البري Rw≈1 وفترة جيل أسية تبلغ 5.2 يومًا، أن معدل الانتقال كان: أعلى بنسبة 52% (45%–60%) مقارنة بالنمط البري في الدنمارك، وأعلى بنسبة 51% (42%–60%) مقارنة بالنمط البري في سويسرا. ^{[ 42 ]}

في 18 ديسمبر 2020، في المراحل الأولى من تقييم مخاطر السلالة الجديدة، خلصت الهيئة الاستشارية العلمية البريطانية، المجموعة الاستشارية المعنية بتهديدات فيروسات الجهاز التنفسي الجديدة والناشئة (NERVTAG)، إلى أنها على ثقة متوسطة بأن سلالة VOC-202012/01 أكثر قابلية للانتقال بشكل ملحوظ من السلالات الأخرى، إلا أن البيانات المتوفرة غير كافية للتوصل إلى أي استنتاج بشأن الآلية الكامنة وراء زيادة قابلية الانتقال (مثل زيادة الحمل الفيروسي، وتوزيع تكاثر الفيروس في الأنسجة، والفاصل الزمني بين الأجيال، إلخ)، أو التوزيع العمري للحالات، أو شدة المرض. ^{[ 29 ]} أشارت البيانات التي اطلعت عليها NERVTAG إلى أن معدل التكاثر النسبي ("الميزة المضاعفة") بلغ 1.74، أي أن السلالة أكثر قابلية للانتقال بنسبة 74%، بافتراض فاصل زمني بين الأجيال يبلغ 6.5 أيام. وقد ثبت أن السلالة تنمو بسرعة كبيرة مقارنةً بالسلالات الأخرى. ^{[ 43 ] [ 44 ] [ 45 ]} تفوق المتغير على المتغير الأصلي بمعامل${\displaystyle 1.74^{14/6.5}=3.3}$كل أسبوعين. وتوصلت مجموعة أخرى إلى استنتاجات مماثلة، حيث حققت ميزة تكاثرية، مستقلة عن "التدابير الوقائية"، بلغت 2.24 لكل جيل مدته 6.73 يومًا، متفوقة على السلالة الأصلية بـ${\displaystyle 2.24^{14/6.73}=5.4}$كل أسبوعين. ^{[ 46 ]} وبالمثل، في أيرلندا، ارتفعت نسبة المتغير - كما يتضح من الكشف عن غياب جين S ^{[ c ]} ( فشل هدف جين S [SGTF])، والذي كان نادرًا تاريخيًا - من 16.3% إلى 46.3% من الحالات في غضون أسبوعين. وهذا يدل، استنادًا إلى إحصائيات 116 عينة إيجابية، على أن المتغير شهد نموًا نسبيًا أعلى بمعامل${\displaystyle 46.3\%\cdot (100\%-16.3\%)/((100\%-46.3\%)\cdot 16.3\%)=4.4}$بالمقارنة مع متوسط ​​نمو جميع السلالات الأخرى بنهاية هذه الفترة التي استمرت أسبوعين. ^{[ 48 ]} أصبحت هذه السلالة هي السائدة في لندن وشرق إنجلترا وجنوب شرقها، بعد أن كانت منخفضة، وذلك خلال شهر إلى شهرين. وكانت الزيادة الكبيرة في إصابات فيروس سارس-كوف-2 مع بداية العام الجديد نتيجة لارتفاع معدل انتقال هذه السلالة، بينما كانت السلالات الأخرى في انخفاض. ^{[ 49 ] [ 50 ] [ 51 ]}

يبدو أن أحد أهم التغييرات في السلالة B.1.1.7 هو N501Y ، ^{[ 22 ]} وهو تغيير من الأسباراجين (N) إلى التيروسين (Y) في الموقع 501 من الأحماض الأمينية. ^{[ 52 ]} ويعود ذلك إلى موقعه داخل نطاق ارتباط المستقبلات (RBD) لبروتين السنبلة، وتحديدًا داخل وحدة ربط المستقبلات (RBM)، ^{[ 53 ]} وهي جزء من نطاق RBD ^{[ 54 ]} الذي يرتبط بـ ACE2 البشري . ^{[ 55 ]} يمكن أن تؤدي الطفرات في نطاق RBD إلى تغيير التعرف على الأجسام المضادة وخصوصية ارتباط ACE2 ^{[ 55 ]} ، مما يجعل الفيروس أكثر عدوى . ^{[ 22 ]} (Chand et al.) خلصت الدراسة إلى أنه "من المرجح جدًا أن يؤثر الطفرة N501Y على ألفة ارتباط البروتين الشوكي بالمستقبلات، ومن المحتمل أن هذه الطفرة، منفردةً أو بالاشتراك مع الحذف في الموضع 69/70 من النطاق الطرفي الأميني (NTD)، تُعزز قابلية انتقال الفيروس". ^{[ 56 ]} وفي أوائل عام 2021، وجدت دراسة خضعت لمراجعة الأقران أن حذف HV 69-70 المذكور في المختبر "يبدو أنه يتمتع بقدرة عدوى أعلى بمرتين خلال دورة عدوى واحدة مقارنةً بفيروس SARS -CoV-2 البري" في الفيروسات الكاذبة من نوع lentiviral SARS - CoV -2 . ^{[ 57 ]}

باستخدام منهجية المحاكاة الحاسوبية، أثبت شاه حسيني وزملاؤه أن الطفرة Y501 في السلالة B.1.1.7 تُشكّل رابطة هيدروجينية أقصر (طولها 2.94 أنغستروم) من نظيرتها في الحمض الأميني N501 في النمط البري ، مما يشير إلى وجود تفاعل مستقر بين نطاق ربط المستقبلات (RBD) ومستقبل الإنزيم المحول للأنجيوتنسين البشري 2 (hACE2) في السلالة B.1.1.7. علاوة على ذلك، تُساهم الطفرة Y501 في السلالة B.1.1.7 في خفض طاقة الربط الحرة (BFE) بشكل أكبر (-7.18 كيلو كالوري/مول) مقارنةً بنظيرتها في الحمض الأميني N501 في النمط البري (-2.92 كيلو كالوري/مول). ونتيجةً لدمج نتائج طاقة الربط الحرة ونتائج التفاعل الجزيئي، تُعزز الطفرة N501Y في نطاق ربط المستقبلات (RBD) من ألفة ارتباط نطاق ربط المستقبلات (RBD) لفيروس SARS-CoV-2 بمستقبل الإنزيم المحول للأنجيوتنسين البشري 2 (hACE2). ^{[ 58 ]}

في تحليل مفصل للتقارب والحركية للتفاعل بين نطاق ربط المستقبلات (RBD) لبروتين سبايك وإنزيم ACE2، وُجد أن الطفرة N501Y تُعزز بشكل ملحوظ تقارب الارتباط بين RBD وACE2 بمقدار 10 أضعاف تقريبًا، نتيجةً لزيادة قدرها 1.8 ضعف في ثابت معدل الارتباط (kon) وانخفاض قدره 7 أضعاف في ثابت معدل الانفصال (koff). ^{[ 59 ]}

أظهرت دراسات الأتراب المتطابقة لمتغير ألفا (السلالة B.1.1.7) معدل وفيات أعلى بشكل عام مقارنةً بالمتغيرات المنتشرة سابقًا، ^{[ 60 ] [ 61 ]} ولكن ليس بين المرضى الذين تم إدخالهم إلى المستشفى. ^{[ 62 ]} ولم تجد دراسة بيئية أي فرق في معدل الوفيات بشكل عام. ^{[ 63 ]}

في البداية، صرّحت مجموعة NERVTAG في 18 ديسمبر 2020 بعدم كفاية البيانات للتوصل إلى استنتاج بشأن شدة المرض. وفي إحاطة رئيس الوزراء بوريس جونسون في اليوم التالي، قال المسؤولون إنه "لا يوجد دليل" حتى ذلك التاريخ على أن هذا المتحور يسبب معدل وفيات أعلى أو يتأثر بشكل مختلف باللقاحات والعلاجات؛ ^{[ 64 ]} وقد وافق فيفيك مورثي على ذلك. ^{[ 65 ]} وفي منتصف ديسمبر 2020، صرّحت سوزان هوبكنز ، المستشارة الطبية المشتركة لبرنامج الفحص والتتبع التابع لهيئة الخدمات الصحية الوطنية وهيئة الصحة العامة في إنجلترا: "لا يوجد حاليًا أي دليل على أن هذه السلالة تسبب مرضًا أكثر خطورة، على الرغم من رصدها في مناطق جغرافية واسعة، لا سيما في المناطق التي تشهد زيادة في عدد الحالات المُكتشفة". ^{[ 22 ]} بعد ذلك بشهر تقريبًا، وتحديدًا في 22 يناير 2021، صرّح جونسون قائلًا: "هناك بعض الأدلة التي تشير إلى أن السلالة الجديدة [VOC-202012/01]... قد تكون مرتبطة بمعدل وفيات أعلى"، على الرغم من أن السير باتريك فالانس ، كبير المستشارين العلميين للحكومة ، أكد أنه لا توجد حتى الآن أدلة كافية للتأكد من ذلك بشكل كامل. ^{[ 66 ]}

في ورقة بحثية حللت اثنتي عشرة دراسة مختلفة حول معدل الوفيات الناجمة عن السلالة B.1.1.7 مقارنةً بالسلالات الأخرى، وُجد أن معدل الوفيات فيها أعلى (71% وفقًا لكلية لندن للصحة والطب الاستوائي، و70% وفقًا لجامعة إكستر، و65% وفقًا لهيئة الصحة العامة في إنجلترا، و36% وفقًا لكلية إمبريال كوليدج لندن). وخلصت مجموعة NERVTAG إلى ما يلي: "بناءً على هذه التحليلات، من المرجح أن تكون العدوى بفيروس B.1.1.7 المرتبط بالعدوى بالمركبات العضوية المتطايرة مرتبطة بزيادة خطر دخول المستشفى والوفاة مقارنةً بالعدوى بفيروسات أخرى غير مرتبطة بالمركبات العضوية المتطايرة". ^{[ 67 ]} وارتبطت نتائج دراسات الوفيات ببعض فترات عدم اليقين والثقة المرتفعة، نظرًا لصغر حجم العينة، حيث لم تحلل المملكة المتحدة حالة المركبات العضوية المتطايرة إلا لـ 8% فقط من جميع وفيات كوفيد-19. ^{[ 68 ]}

أفادت دراسة حالة وضابطة في المملكة المتحدة شملت 54906 مشاركًا، ثبتت إصابتهم بفيروس SARS-CoV-2 بين 1 أكتوبر 2020 و29 يناير 2021 في المجتمع (باستثناء الأشخاص المعرضين للخطر من مراكز الرعاية والمؤسسات العامة الأخرى)، أن المرضى المصابين بالمتغير ألفا (VOC 202012/1) كان لديهم نسبة خطر الوفاة في غضون 28 يومًا من الاختبار تبلغ 1.64 (فاصل الثقة 95٪ 1.32-2.04)، مقارنة بالمرضى المتطابقين الذين ثبتت إصابتهم بمتغيرات أخرى من فيروس SARS-CoV-2. ^{[ 69 ]} وفي المملكة المتحدة أيضًا، أظهر تحليل البقاء على قيد الحياة لـ 1,146,534 مشاركًا ثبتت إصابتهم بفيروس SARS-CoV-2 بين 1 نوفمبر 2020 و14 فبراير 2021، بمن فيهم أفراد من المجتمع المحلي وفي دور الرعاية والتمريض، نسبة خطر بلغت 1.61 (فاصل ثقة 95%: 1.42-1.82) للوفاة خلال 28 يومًا من الاختبار بين الأفراد المصابين بالسلالة B.1.1.7؛ ولم تُلاحظ فروق ذات دلالة إحصائية في زيادة خطر الوفاة المرتبط بالسلالة B.1.1.7 بين الأفراد الذين يختلفون في العمر أو الجنس أو العرق أو مستوى الحرمان أو مكان الإقامة. ^{[ 61 ]} وقد عدّلت كلتا الدراستين معدلات الوفيات المتفاوتة بسبب كوفيد-19 حسب المنطقة الجغرافية وعلى مر الزمن، مصححةً بذلك التحيزات المحتملة الناتجة عن الاختلافات في معدلات الاختبار أو الاختلافات في توافر خدمات المستشفيات بمرور الوقت والمكان. ^{[ 61 ] [ 69 ]}

وجدت دراسة دنماركية أن الأشخاص المصابين بالسلالة B.1.1.7 أكثر عرضة بنسبة 64% (32%–104%) لدخول المستشفيات مقارنة بالأشخاص المصابين بسلالة أخرى. ^{[ 70 ]}

أظهر التسلسل الجيني لفيروس VOC-202012/01 طفرة Q27stop التي "تؤدي إلى تقصير بروتين ORF8 أو تعطيله". ^{[ 5 ]} أشارت دراسة سابقة أجريت على متغيرات فيروس SARS-CoV-2 التي حُذف منها جين ORF8 إلى أنها "ارتبطت بأعراض أخف ونتائج مرضية أفضل". ^{[ 71 ]} كما أشارت الدراسة إلى أن "بروتين ORF8 الخاص بفيروس SARS-CoV-2 هو بروتين شبيه بالغلوبولين المناعي (Ig) يُعدّل من آلية المرض "، وأن "بروتين ORF8 الخاص بفيروس SARS-CoV-2 يُحفّز تحلل معقد التوافق النسيجي الرئيسي من النوع الأول (MHC-I)"، وأن "بروتين ORF8 الخاص بفيروس SARS-CoV-2 يُثبّط الاستجابة المضادة للفيروسات التي يتوسطها الإنترفيرون من النوع الأول (IFN)". ^{[ 71 ]}

بالإشارة إلى موقع الحمض الأميني 501 داخل البروتين الشوكي، خلص تشاند وزملاؤه إلى أنه "من المحتمل أن تؤثر المتغيرات في هذا الموقع على فعالية تحييد الفيروس"، ^{[ 56 ]} لكنهم أشاروا إلى أنه "لا توجد حاليًا بيانات تحييد متاحة عن N501Y من الأمصال متعددة النسائل من العدوى الطبيعية". ^{[ 56 ]} ومع ذلك، فقد تم اكتشاف حذف HV 69–70 "في فيروسات أفلتت من الاستجابة المناعية لدى بعض المرضى الذين يعانون من نقص المناعة "، ^{[ 72 ]} كما تم العثور عليه "مرتبطًا بتغيرات أخرى في نطاق ربط المستقبلات ". ^{[ 56 ]}

يُرجّح أن تكون أول حالة قد سُجّلت في منتصف سبتمبر/أيلول 2020 في لندن أو كينت ، المملكة المتحدة. ^{[ 90 ]} وقد تمّ تحديد تسلسل السلالة في سبتمبر/أيلول. ^{[ 91 ]} وحتى 13 ديسمبر/كانون الأول 2020، تمّ رصد 1108 حالات مصابة بهذه السلالة في المملكة المتحدة، موزعة على ما يقارب 60 سلطة محلية مختلفة. وتركزت هذه الحالات بشكل رئيسي في جنوب شرق إنجلترا . كما تمّ رصد السلالة في ويلز واسكتلندا. ^{[ 92 ]} وبحلول نوفمبر/تشرين الثاني، كان حوالي ربع حالات جائحة كوفيد-19 في لندن ناتجًا عن السلالة الجديدة، وبحلول ديسمبر/كانون الأول، ارتفعت النسبة إلى الثلث. ^{[ 93 ]} وفي منتصف ديسمبر/كانون الأول، قُدّر أن ما يقارب 60% من الحالات في لندن كانت من سلالة ألفا. ^{[ 94 ]} وبحلول 25 يناير/كانون الثاني 2021، ارتفع عدد الحالات المؤكدة والمحتملة في المملكة المتحدة إلى 28122 حالة. ^{[ 95 ]}

أصبح هذا المتغير سائداً بالنسبة لما يلي:

• جنوب شرق إنجلترا في الأسبوع 48، الأسبوع الأخير من نوفمبر 2020. ^{[ 43 ]}
• إنجلترا في الأسبوع 51 من عام 2020. ^{[ 96 ]}
• المملكة المتحدة في الأسبوع 52 من عام 2020. ^{[ 77 ]}
• اسكتلندا وأيرلندا الشمالية في الأسبوع الأول من عام 2021. ^{[ 79 ]}
• ويلز في الأسبوع الثاني من عام 2021. ^{[ 79 ]}
• أيرلندا في الأسبوع الثاني من عام 2021. ^{[ 48 ]}

في بلغاريا، وجد تسلسل الجينوم أن المتغير سائد بنسبة 52.1٪ في الأسبوع 4، يليه 73.4٪ في الأسبوع 9. ^{[ 97 ]}

في سلوفاكيا أيضًا، كشف اختبار RT-PCR Multiplex DX، القادر على رصد حذفَيْن خاصَّين بالسلالة B.1.1.7 (ΔH69/ΔV70 وΔY144)، ^{[ 98 ]} عن وجود هذا المتغير لأول مرة على مستوى البلاد في 74% من الحالات في 3 فبراير (الأسبوع 5)، ثم في 72% من الحالات في 15 فبراير (الأسبوع 7)، وارتفعت النسبة إلى 90% في 3 مارس (الأسبوع 9). ^{[ 99 ]} وفي وقت سابق، في 8 يناير، كشف الاختبار نفسه عن انتشار المتغير بنسبة 36% في مقاطعة ميخالوفيتسه و29% في نيترا . ^{[ 100 ]}

في إسرائيل، تم الكشف عن هذا المتغير لأول مرة عن طريق تسلسل الجينوم في 23 ديسمبر 2020. ^{[ 101 ]} ومع ذلك، قامت خدمات الرعاية الصحية "ليئوميت" بتحليل العينات باستخدام اختبار RT-PCR البديل (SGTF) ووجدت المتغير بنسبة 3-4% في 15 ديسمبر. ^{[ 102 ]} وقدّرت وزارة الصحة الوطنية، استنادًا إلى تسلسل الجينوم، أن انتشار المتغير أصبح سائدًا (70%) في 6 فبراير ^{[ 103 ]} ، ثم وصل إلى 90% في 16 فبراير. ^{[ 104 ]}

في لوكسمبورغ، كشف تسلسل الجينوم الأسبوعي أن المتغير قد ارتفع من 0.3% (الأسبوع 51) ليصبح سائداً بنسبة 53.0% في الأسبوع 5، مع العلم أن النتائج قد لا تكون ممثلة تمثيلاً كاملاً نظراً لعدم تصحيحها من التحيز المحتمل في الاستهداف الناتج عن تتبع المخالطين، ومسافري المطارات، وتفشي المرض محلياً. أُجري تسلسل الجينوم لمجموعة اختبار عشوائية تمثل السكان - دون أي تحيز في الاستهداف - بدءاً من الأسبوع 6، وأكد هذا التسلسل سيادة المتغير بنسبة 54.1% (الأسبوع 6) والتي ارتفعت إلى 62.8% (الأسبوع 9)، بينما وُجد أن المتغير بيتا المنافس (السلالة B.1.351) بنسبة 18.5% في الأسبوع 9. ^{[ 105 ]}

في الدنمارك، ارتفعت نسبة المتغير من 0.3% (الأسبوع 46 من عام 2020) لتصبح سائدة بنسبة 65.9% (الأسبوع 7 من عام 2021)، ثم ارتفعت أكثر لتصل إلى 92.7% (الأسبوع 10)؛ حيث تراوح معدل انتشاره الإقليمي من 87.3% في منطقة شمال يوتلاند إلى 96.1% في منطقة وسط الدنمارك . ^{[ 106 ]} يتوافق النمو الملحوظ في النسبة المئوية للمتغير تمامًا مع التوقعات النموذجية السابقة، ^{[ 41 ]} التي تنبأت بسيادة المتغير (أكثر من 50%) في منتصف فبراير تقريبًا، وانتشاره بنسبة 80% تقريبًا من إجمالي المتغيرات المنتشرة بحلول أوائل مارس. ^{[ 107 ]} في المقابل، لم يكشف تسلسل الجينوم عن وجود المتغير بيتا المنافس إلا في 0.4% من الحالات الإيجابية (9 مرات من أصل 2315 اختبارًا) في الأسبوع العاشر. ^{[ 108 ] [ 109 ]}

في هولندا، أظهر تسلسل الجينوم العشوائي أن نسبة المتغير ارتفعت من 1.3% من الحالات في الأسبوع 49 إلى نسبة مهيمنة بلغت 61.3% في الأسبوع 7، ثم إلى 82.0% في الأسبوع 9؛ بينما بلغت نسبة المتغير بيتا المنافس 3.0% في الأسبوع 9. ^{[ 74 ]} وفي أمستردام، ارتفعت نسبة المتغير ألفا (السلالة B.1.1.7) من 5.2% (الأسبوع 52) إلى 54.5% (الأسبوع 6). ^{[ 110 ]}

في النرويج، كشف تسلسل الجينوم عن نمو هذا المتغير من 5.7% (الأسبوع 1) إلى 58.4% (الأسبوع 7) ليصبح سائداً، ثم إلى 65.0% (الأسبوع 8). ^{[ 111 ]} وفي دراسة استقصائية واسعة النطاق أخرى، شملت نتائج تسلسل الجينوم واختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، مع عينة تضم أكثر من 1000 اختبار أسبوعياً (منذ الأسبوع 4)، تبين في الوقت نفسه أن المتغير نما من 2.0% (الأسبوع 48) إلى 60.0% (الأسبوع 7) ليصبح سائداً، ثم إلى 72.7% في الأسبوع 10، بينما لم تتجاوز نسبة الحالات التي تنتمي إلى المتغير بيتا 2.2%. ^{[ 112 ]} سجلت هذه السلالة أعلى نسبة انتشار إقليميًا في مقاطعتي أوسلو وفيكن ، [ ^{113 ] حيث ارتفعت من 18% إلى 90% من العينات المُحللة في أوسلو خلال الفترة} من 20 يناير إلى 23 فبراير (مع العلم أن التقدير المُصحح للبيانات كان أقل قليلًا عند 50-70% في 23 فبراير)؛ بينما ارتفعت من 21% إلى 80% من العينات المُحللة في فيكن خلال الفترة من 25 يناير إلى 23 فبراير (مع العلم أن التقدير المُصحح للبيانات كان أقل قليلًا عند 50% في 23 فبراير). ^{[ 114 ]} خلال الفترة من 15 فبراير إلى 14 مارس، أظهر المسح المُدمج لتسلسل الجينوم واختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) أن سلالة ألفا كانت سائدة بنسبة تزيد عن 50% في 8 من أصل 11 منطقة، مع أعلى نسبة انتشار لها (82%) في أوسلو. بينما كانت منطقة نوردلاند مختلفة عن جميع المناطق الأخرى حيث لم تتجاوز نسبة حالات ألفا فيها 6%، إلى جانب هيمنة نسبة 88% من الحالات التي يمثلها متغير بيتا. ^{[ 112 ]}

في البرتغال، مثّل هذا المتغير، وفقًا لمسح وطني لتسلسل الجينوم، 16.0% من إصابات كوفيد-19 خلال الفترة من 10 إلى 19 يناير (الأسبوع الثاني)، ^{[ 115 ]} ثم بلغت نسبته 58.2% في الأسبوع السادس. ^{[ 116 ]} أظهر اختبار RT-PCR وطني بديل، استنادًا إلى بيانات SGTF وSGTL، أن نسبة المتغير بلغت 33.5% في الأسبوع الرابع، ولكن لوحظ بعد ذلك تباطؤ في وتيرة الزيادة الأسبوعية لنسبة المتغير (السبب غير معروف)، ووفقًا لهذه الدراسة، لم يصبح المتغير سائدًا إلا بنسبة 50.5% (91.8% من 55.0% لـ SGTFL) في الأسبوع الثامن، ثم بنسبة 64.3% (91.8% من 70% لـ SGTFL) في الأسبوع العاشر. ^{[ 75 ]}

في إيطاليا، شكّلت السلالة ألفا 17.8% من الحالات على مستوى البلاد في 4-5 فبراير (الأسبوع الخامس)، ^{[ 117 ]} تلتها 54.0% في 18 فبراير (الأسبوع السابع). تراوح معدل الانتشار الإقليمي للأسبوع السابع من 0% في وادي أوستا (على الرغم من فحص عينة واحدة فقط) إلى 93.3% في موليزي . في الأسبوع السابع، بلغ معدل انتشار السلالة غاما المنافسة 4.3% (يتراوح بين 0% و36.2% إقليميًا)، بينما بلغ معدل انتشار السلالة الجنوب أفريقية 0.4% (يتراوح بين 0% و2.9% إقليميًا). ^{[ 118 ]}

في سويسرا، أظهر مسحٌ أسبوعيٌّ لتسلسل الجينوم على مستوى البلاد أنَّ نسبةَ المتغير ألفا ارتفعت من 0.05% (الأسبوع 51) إلى 58.2% من الحالات في الأسبوع 8، ثم إلى 71.1% في الأسبوع 9. ^{[ 76 ]} وتوافق هذا تمامًا مع نموذجٍ صدر في 9 فبراير، والذي توقَّع هيمنةَ المتغير ألفا في منتصف فبراير تقريبًا. ^{[ 119 ]} في المقابل، لم يُعثر على المتغير بيتا المنافس إلا في 1.0% من الحالات الإيجابية على مستوى البلاد في الأسبوع 9. ^{[ 76 ]}

في بلجيكا، أظهر تسلسل الجينوم لعينات مختارة عشوائيًا بعد استبعاد جميع العينات من الاختبارات المستهدفة النشطة المتعلقة بتفشي المرض محليًا أو السفر (مما أدى إلى تكوين عينة وطنية تمثيلية إحصائيًا بنسبة 4.4% من إجمالي اختبارات كوفيد-19 الإيجابية) أن نسبة متغير ألفا ارتفعت من 7.1% في الأسبوع الأول إلى 51.5% في الأسبوع السابع، ثم إلى 79.3% في الأسبوع العاشر. ^{[ 120 ]} تم الكشف عن المتغير لأول مرة بواسطة تسلسل الجينوم المستهدف في الأسبوع 49، ولكن نظرًا لصغر حجم العينة (عدم عشوائيتها، وأقل من 100 اختبار أسبوعيًا)، لم يكن من الممكن تحديد بيانات موثوقة عن نسبة المتغير قبل الأسبوع الأول. ^{[ 121 ]} كما أُجري اختبار بديل للمتغير (RT-PCR SGTF) على عينة بنسبة 25.8% من إجمالي اختبارات كوفيد-19 الإيجابية، ووجد معدل SGTF مهيمنًا بنسبة 54.8% في الأسبوع العاشر. في المقابل، كان متغير بيتا المنافس هو السائد. ووجد أن نسبة انتشاره تبلغ 3.6٪، وأن نسبة انتشار متغير جاما تبلغ 1.8٪ في الأسبوع العاشر. ^{[ 120 ]}

في فرنسا، توقع العلماء بدقة أن يصبح المتغير ألفا (VOC-202012/01) هو السائد على مستوى البلاد في الفترة ما بين الأسبوعين 8 و11 من عام 2021. ^{[ 122 ]} كشف مسح وطني لعينات إيجابية مختارة عشوائيًا من مرضى كوفيد-19، والتي تم تحليلها أولاً بواسطة اختبار فحص RT-PCR ثم تأكيدها لاحقًا عن طريق تسلسل الجينوم، أن المتغير نما من نسبة 3.3% (388/11916) في 7-8 يناير (الأسبوع 1) ^{[ 123 ]} إلى 13.3% (475/3561) في 27 يناير (الأسبوع 4)، ^{[ 85 ]} ثم إلى 44.3% (273/615 ) في 16 فبراير (الأسبوع 7). ^{[ 85 ]} في الأسبوع الثامن، وُجد أن للمتغير نسبة مهيمنة بلغت 56.4% (758/1345 ) وفقًا للنتائج القابلة للتفسير لمسح تسلسل الجينوم الأسبوعي الذي شمل 0.9% من جميع اختبارات كوفيد-19 الإيجابية، أو 59.5% وفقًا لمسح RT-PCR خاص بالمتغير اختبر 54% من جميع اختبارات كوفيد-19 الإيجابية. ^{[ 124 ]} في الأسبوع العاشر، وُجد أن للمتغير نسبة 71.9% وفقًا لمسح RT-PCR خاص بالمتغير اختبر 56.9% من جميع اختبارات كوفيد-19 الإيجابية. تفاوت انتشار السلالة إقليمياً في المقاطعات الـ 96 الواقعة في فرنسا الكبرى خلال الأسبوع العاشر، حيث تجاوزت نسبة انتشارها 50% في 91 مقاطعة، بينما تراوحت بين 30% و50% في 5 مقاطعات (ومنها مقاطعة موزيل على وجه الخصوص، حيث سجلت نسبة عالية بلغت 38.3% من السلالة بيتا المنافسة، والتي - على الرغم من انخفاضها من قيمة سائدة بلغت 54.4% في الأسبوع الثامن - لا تزال أعلى بكثير من المتوسط ​​الوطني البالغ 5.0% لهذه السلالة تحديداً). ^{[ 125 ]}

في النمسا، جمعت وكالة الصحة والسلامة الغذائية (AGES) بيانات من اختبارات RT-PCR الخاصة بسلالة N501Y، بالإضافة إلى تحليل تسلسل الجينوم اللاحق، ووجدت أن السلالة ارتفعت من 7.2% (الأسبوع 1) إلى 61.3% (الأسبوع 8)، ثم إلى 61.2% في الأسبوع 9، و48.3% في الأسبوع 10. لو تم تحليل جميع الاختبارات الإيجابية لسلالة N501Y بشكل إضافي عن طريق تسلسل الجينوم، لكانت هذه النسب المذكورة أعلى، على سبيل المثال: 2.4% أعلى في الأسبوع 1، و23.0% أعلى في الأسبوع 7، و4.0% أعلى في الأسبوع 8، و6.8% أعلى في الأسبوع 9، و25.4% أعلى في الأسبوع 10. أما السلالة بيتا المنافسة، فقد وُجدت فقط على مستوى البلاد في 0.3% من الحالات الإيجابية في الأسبوع 10، وفي منطقة تيرول - حيث كانت الأكثر انتشارًا - انخفضت حصتها من 24.5% في الأسبوع الرابع إلى 1.9% فقط في الأسبوع العاشر. إقليميًا، وُجد أن ألفا هي المهيمنة بنسبة تزيد عن 50% في 7 من أصل 9 مناطق ، باستثناء منطقتي تيرول وفورارلبرغ . ^{[ 126 ]}

في ألمانيا، أجرت مؤسسة روبرت كوخ ( RKI-Testzahlerfassung ) أكبر مسح وطني، وربما الأكثر تمثيلاً ، لتحديد نسبة متحورات فيروس كوفيد-19 المنتشرة خلال الأسبوع الماضي، وذلك بتحليل 53,272 عينة إيجابية لكوفيد-19، إما عن طريق تسلسل الجينوم أو اختبارات RT-PCR. وقد جُمعت البيانات طوعاً من 84 مختبراً من قطاعات الجامعات والبحث العلمي والعيادات الخارجية، موزعة بالتساوي في جميع أنحاء البلاد. لم يستخدم المسح أوزاناً أو معايير لاختيار البيانات لضمان التمثيل الجغرافي، ولكنه مع ذلك يُمكن اعتباره ممثلاً إلى حد ما للمعدل الوطني نظراً لحجم العينة الكبير. وفقًا لمسح RKI-Testzahlerfassung ، ارتفعت نسبة المتغير من 2.0% (الأسبوع 2) إلى نسبة مهيمنة بلغت 54.5% (الأسبوع 9)، تلتها نسبة 63.5% في الأسبوع 10. في المقابل، لم يتم العثور على المتغير بيتا المنافس على مستوى البلاد إلا في 0.9% من الحالات الإيجابية في الأسبوع 10. ^{[ 127 ]}

في مالطا، تم الكشف عن هذا المتغير لأول مرة عن طريق تسلسل الجينوم في 30 ديسمبر 2020، ^{[ 128 ]} وشكّل 8% من الحالات الإيجابية في الأسبوع السابع. ^{[ 129 ]} تم استحداث اختبار جديد خاص بالمتغير بتقنية RT-PCR لأغراض المراقبة، ^{[ 130 ]} حيث كشفت النتائج الأولية التي تم الإبلاغ عنها في 10 مارس أن المتغير يمثل الآن 61% من الحالات على مستوى البلاد. ^{[ 131 ]}

في السويد، توقعت السلطات الوطنية مبدئيًا أن يصبح هذا المتحور هو السائد في الفترة ما بين الأسبوعين 12 و14، بافتراض زيادة قابليته للانتقال بنسبة 50% مقارنةً بالفيروس الأصلي. ^{[ 132 ]} في المتوسط، وُجد أن نسبة المتحور ترتفع من 10.8% (الأسبوع 4) إلى 36.9% (الأسبوع 7) في خمس من مناطقها الجنوبية ( سكانيا ، وسترا غوتالاند ، وستمانلاند ، وغافليبورغ ، وأوريبرو ) . ^{[ 133 ]} في الأسبوع 7، حُسبت نسبة المتحور لأول مرة أيضًا لتكون 30.4% كمتوسط ​​عام لـ 19 منطقة من أصل 21 منطقة سويدية (تتراوح من 3.3% في بليكينج إلى 45% في غافليبورغ). في الأسبوع التاسع، بلغت نسبة السلالة المتغيرة 56.4%، وهي النسبة السائدة في المتوسط ​​العام للمناطق التسع عشرة (تراوحت بين 16% في كرونوبيرغ و72% في غافليبورغ). وفي الأسبوع العاشر، ارتفعت نسبة السلالة المتغيرة إلى 71.3%، وهي النسبة نفسها في المتوسط ​​العام للمناطق التسع عشرة (تراوحت بين 40% في كرونوبيرغ و84% في يونشوبينغ ). ورغم عدم تطبيق أي أوزان جغرافية لضمان تمثيل جغرافي دقيق للمتوسط ​​المحسوب للمناطق التسع عشرة، إلا أن حجم العينة الإجمالي البالغ 12,417 اختبارًا للسلالة المتغيرة مثّل 43.1% من إجمالي اختبارات PCR الإيجابية لفيروس كوفيد-19 في الأسبوع العاشر، مما يشير إلى أن نتيجة المسح قد تكون قريبة من المتوسط ​​الحقيقي على مستوى الدولة ككل. ^{[ 86 ]}

في دولة ليختنشتاين الصغيرة ، تم رصد أول حالة إصابة بفيروس ألفا في 19 ديسمبر 2020. وخلال فترة الجائحة بأكملها، تم رصد 67 حالة إيجابية لفيروس VOC-N501Y بتقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، منها 58 حالة إصابة بفيروس ألفا، وحالة واحدة من فيروس بيتا (تم رصدها في 1 فبراير)، و8 حالات غير محددة من فيروس N501Y (من 10 ديسمبر إلى 22 فبراير)، وذلك حتى 18 مارس 2021. وبلغ المتوسط ​​الأسبوعي لكل يوم، محسوبًا كمتوسط ​​متحرك لمدة 7 أيام، لحصة جميع حالات الإصابة بفيروس VOC-N501Y المرصودة (وهو مؤشر جيد لفيروس ألفا في ليختنشتاين)، 10.9% في الأسبوع الخامس، ثم ارتفع إلى 52.2% في الأسبوع التاسع (حيث تبين أن 8 من أصل 15 اختبارًا كانت لفيروس ألفا)؛ ثم ازداد إلى 73.4% في الأسبوع العاشر (حيث تبين أن 6 من أصل 9 اختبارات كانت لفيروس ألفا). ^{[ 134 ]}

في إسبانيا، قُدِّرت نسبة انتشار الطفرة على مستوى البلاد بنحو 5-10% من الحالات في 29 يناير، ^{[ 135 ]} تلتها نسبة 20-25% من الحالات في 18 فبراير ^{، [ 136 ] [ 137 ]} ثم 25-30% من الحالات في 22 فبراير، ^{[ 138 ]} وقُدِّر أنها أصبحت سائدة بنسبة تزيد عن 50% اعتبارًا من 3 مارس (الأسبوع 9). ^{[ 139 ]} وفي الأسبوع 10، تراوح انتشار الطفرة بين 18.3% و97.0% في المناطق السبعة عشر ، حيث سجلت جميع المناطق باستثناء منطقتين معدل انتشار سائد يزيد عن 50%. ^{[ 140 ]}

• لم يتم الإبلاغ عن أي بيانات من إكستريمادورا .
• 18.3% للأسبوع العاشر في أراغون .
• 27.0% للأسبوع السابع في جزر الكناري .
• 51.3% للأسبوع الثامن في قشتالة وليون .
• 52.2% للأسبوع العاشر في فالنسيا .
• 52.8% للأسبوع العاشر في قشتالة-لامانشا .
• 53.3% للأسبوع الرابع في غاليسيا .
• 59.5% للأسبوع التاسع في منطقة لا ريوخا .
• 59.7% للأسبوع العاشر في مدريد .
• بلغت نسبة المشاركة 61.6% في الأسبوع الحادي عشر في الأندلس .
• 76.1% للأسبوع العاشر في جزر البليار .
• 76.7% للأسبوع العاشر في مورسيا .
• 77.4% للأسبوع العاشر في إقليم الباسك .
• 77.8% للأسبوع العاشر في نافارا .
• 83.1% للأسبوع العاشر في كانتابريا .
• بلغت نسبة المشاركة في الأسبوع التاسع في كاتالونيا 84.6% .
• 97.0% للأسبوع العاشر في أستورياس .

في بولندا، أظهر مسح وطني أُجري بين المعلمين المصابين أن نسبة السلالة المتحورة تراوحت بين 5% و10% على مستوى البلاد اعتبارًا من 11 فبراير، ^{[ 141 ]} بينما أفاد المركز الأوروبي للوقاية من الأمراض ومكافحتها (ECDC) بأنها بلغت 9% اعتبارًا من 15 فبراير. ^{[ 142 ]} ووفقًا لوزير الصحة آدم نيدزيلسكي ، فقد وُجدت السلالة المتحورة بنسبة 5% في الدراسات الأولى التي أُجريت في النصف الثاني من يناير، ثم ارتفعت بنسبة 10 نقاط مئوية كل 10 أيام، حتى أصبحت السلالة السائدة على مستوى البلاد بنسبة 52% في 16 مارس (الأسبوع 11). ^{[ 143 ] [ 144 ]} وعلى الصعيد الإقليمي، تجاوزت نسبة السلالة المتحورة 70% في منطقتي وارميان-ماسوريان وبوميرانيا في 22-23 فبراير (الأسبوع 8)، ^{[ 145 ]} بل ووصلت إلى 90% في محافظة بولندا الكبرى في 17 مارس (الأسبوع 11). ^{[ 146 ]}

في فنلندا، لم يُجرَ أي مسح وطني إحصائي تمثيلي حتى فبراير 2021، إذ استهدف تسلسل الجينوم الوطني بشكل رئيسي إجراء المزيد من التحليلات على عينات إيجابية لفيروس كوفيد-19 من المسافرين ومجموعات التفشي المحلية. ^{[ 147 ]} ووجد مستشفى جامعة هلسنكي (HUS)، الذي يعمل في منطقة هلسنكي وأوسيما الصحية ، هذا المتغير في 10% من جميع العينات التي جُمعت عشوائيًا خلال بضعة أيام قبل 14 فبراير في منطقة العاصمة (المعروفة أيضًا بدائرة هلسنكي الانتخابية ودائرة أوسيما الانتخابية ). وبالنسبة لمنطقة العاصمة، تشير التوقعات إلى أن هذا المتغير سيصبح سائدًا (أكثر من 50%) في النصف الثاني من مارس (الأسبوع 11-13). ^{[ 148 ]}

في أيسلندا ، طبّقت السلطات الوطنية نظامًا صارمًا يتضمن ثلاثة اختبارات وحجرًا صحيًا لجميع القادمين من الخارج، وقد نجح هذا النظام حتى الآن في منع ظهور سلالات جديدة معدية من الفيروس في البلاد. وحتى 4 مارس، ثبتت إصابة 90 مسافرًا بالسلالة ألفا عند حدود أيسلندا، وكانت الحالات المحلية العشرين الإضافية جميعها مرتبطة ارتباطًا وثيقًا بحالات الحدود، دون وجود أي حالات مرتبطة بانتقال العدوى داخل المجتمع. ^{[ 149 ]}

في الولايات المتحدة، ظهر هذا المتغير لأول مرة في أواخر نوفمبر 2020، ^{[ 150 ]} وارتفعت نسبته من 1.2% في أواخر يناير ، ليصبح سائداً في نهاية مارس تقريباً. ^{[ 151 ] [ 152 ]} وتركز انتشاره بشكل أساسي في منطقة الغرب الأوسط العلوي من البلاد، وخاصة ولايتي ميشيغان ومينيسوتا ، ولكنه لم ينتشر بكثافة إلى أجزاء أخرى من البلاد. ^{[ 153 ]}

في كندا، ظهر هذا المتحور لأول مرة في أونتاريو أواخر ديسمبر 2020. ^{[ 154 ]} وبحلول 13 فبراير، انتشر إلى جميع المقاطعات العشر. ^{[ 155 ]} وقد تباينت إجراءات فحص وتأكيد وجود متحور ألفا (السلالة B.1.1.7) في عينات كوفيد-19 الإيجابية في أنحاء البلاد. ^{[ 156 ]} وفي 3 فبراير، كانت مقاطعة ألبرتا أول من فحص جميع عينات كوفيد-19 الإيجابية بحثًا عن المتحورات المثيرة للقلق. ^{[ 156 ] [ 157 ]} وحتى 23 مارس، تم الكشف عن متحور ألفا في 5812 حالة، وكان أكثر انتشارًا في مقاطعة ألبرتا . ^{[ 158 ]} في أونتاريو، كشفت دراسة مشتركة باستخدام تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي (RT-PCR) (N501Y) وتسلسل الجينوم أن جميع المتغيرات الفيروسية المتطايرة (VOCs) مثّلت 4.4% من جميع حالات الإصابة المؤكدة بفيروس كوفيد-19 في 20 يناير (الأسبوع 3)، وأن النمط ألفا شكّل 99% من جميع هذه المتغيرات. ^{[ 159 ]} وجدت مختبرات الصحة العامة في أونتاريو هذا المتغير في ما يقرب من 7% من جميع حالات الإصابة المؤكدة بفيروس كوفيد-19 في الأسبوع 5، وهو ما يمثل 97% (309/319) من جميع المتغيرات الفيروسية المتطايرة المكتشفة. ^{[ 160 ]} أصبح النمط ألفا هو النمط السائد في 16 مارس تقريبًا؛ حيث كانت 53% من جميع الحالات الإيجابية من المتغيرات الفيروسية المتطايرة، وافتُرض أن 97% من هذه المتغيرات كانت من النمط ألفا. ^{[ 161 ]} في كيبيك ، حيث كان المتغير منتشرًا على نطاق واسع أيضًا، كان من المتوقع أن يصبح هو النمط السائد بحلول أواخر مارس أو في أبريل. ^{[ 162 ]}

لم تبلغ الدول الإضافية التالية عن حصص المتغيرات، ولكن من المرجح أن يكون لديها حصة كبيرة بسبب اكتشافها لأكثر من 50 حالة مؤكدة عن طريق تسلسل الجينوم الكامل حتى 13 مارس 2021: ^{[ 176 ]}

• تركيا (486 حالة)
• فنلندا (268 حالة)
• أستراليا (140 حالة)
• تشيلي (124 حالة)
• كرواتيا (121 حالة)
• نيجيريا (113 حالة)
• كوريا الجنوبية (90 حالة)
• سلوفينيا (87 حالة)
• لاتفيا (83 حالة)
• الهند (81 حالة)
• رومانيا (76 حالة)
• غانا (67 حالة)
• سنغافورة (66 حالة)
• نيوزيلندا (63 حالة)
• مقدونيا الشمالية (53 حالة)
• البرازيل (53 حالة)
• تايوان (32 حالة)

تقوم قاعدة بيانات GISAID، التي تضم جميع جينومات كوفيد-19 التي تم تسلسلها، بحساب متوسط ​​"التردد النسبي للجينوم المتغير" لكل دولة على مدى الأسابيع الأربعة الماضية للعينات المُقدمة. ومع ذلك، فإن هذه الترددات المُلاحظة عُرضة لتحيزات في أخذ العينات والإبلاغ، ولا تُمثل الانتشار الدقيق لنسبة المتغيرات بسبب غياب التمثيل الإحصائي. ^{[ 176 ]}

نشأت طفرة N501Y بشكل مستقل عدة مرات في مواقع مختلفة:

• في أبريل 2020، شوهد لأول مرة في عدد قليل من التسلسلات المعزولة في البرازيل . ^{[ 252 ]}
• في يونيو 2020، ظهرت الطفرة في سلالة أسترالية . ^{[ 252 ]}
• في يوليو 2020، (وفقًا للدكتور جوليان تانغ، جامعة ليستر ) ظهر N501Y في سلالة تنتشر في الولايات المتحدة . ^{[ 252 ]}
• في سبتمبر 2020، تم العثور عليه في سلالة في ويلز ، تطورت بشكل مستقل وكانت مختلفة عن السلالة B.1.1.7. ^{[ 52 ]}
• في سبتمبر 2020، ^{[ 2 ]} تم اكتشاف السلالة B.1.1.7 (501Y.V1) الأكثر قابلية للانتقال وانتشارًا لأول مرة في كينت (إنجلترا). ^{[ 5 ]}
• في أكتوبر 2020، تم رصد سلالة أخرى شديدة العدوى تُعرف باسم السلالة B.1.351 (501Y.V2، السلالة بيتا ) لأول مرة عن طريق تسلسل الجينوم في خليج نيلسون مينديلا (جنوب أفريقيا). ^{[ 253 ]} تشير التحليلات الجغرافية الوراثية إلى أن هذه السلالة ظهرت بالفعل في يوليو أو أغسطس 2020. ^{[ 254 ]}
• في ديسمبر 2020، ^{[ 255 ]} تم اكتشاف سلالة أخرى شديدة العدوى تسمى السلالة P.1 (501Y.V3، سلالة جاما ) في ماناوس (البرازيل). ^{[ 256 ]}

تم رصد السلالة ألفا (السلالة B.1.1.7) لأول مرة في أوائل ديسمبر 2020 من خلال تحليل بيانات الجينوم مع العلم بأن معدلات الإصابة في مقاطعة كينت لم تكن تنخفض على الرغم من القيود الوطنية. ^{[ 7 ] [ 260 ]}

تم جمع أول جينومين ينتميان إلى السلالة B.1.1.7 في 20 سبتمبر 2020 في كينت، وجينوم آخر في 21 سبتمبر 2020 في لندن الكبرى. ^{[ 5 ]} وقد أُرسلت هذه التسلسلات إلى قاعدة بيانات GISAID (برقمي الوصول EPI_ISL_601443 وEPI_ISL_581117 على التوالي). ^{[ 261 ]}

تشير عملية التتبع العكسي باستخدام الأدلة الجينية إلى أن السلالة B.1.1.7 ظهرت في سبتمبر 2020، ثم انتشرت بمستويات منخفضة للغاية بين السكان حتى منتصف نوفمبر. وقد برزت الزيادة في الحالات المرتبطة بهذا المتغير لأول مرة في أواخر نوفمبر، عندما كانت هيئة الصحة العامة في إنجلترا (PHE) تحقق في سبب عدم انخفاض معدلات الإصابة في مقاطعة كينت على الرغم من القيود الوطنية. ثم اكتشفت الهيئة بؤرة مرتبطة بهذا المتغير تنتشر بسرعة في لندن وإسكس . ^{[ 30 ]}

كان من المهم أيضًا طبيعة اختبار RT-PCR المستخدم بشكل أساسي في المملكة المتحدة، وهو اختبار TaqPath COVID-19 من شركة Thermo Fisher Scientific . يتطابق هذا الاختبار مع الحمض النووي الريبي (RNA) في ثلاثة مواقع، وتوقف عن العمل مع جين البروتين الشوكي بسبب حذف HV 69–70 - وهو حذف للأحماض الأمينية الهيستيدين والفالين في الموضعين 69 و70 على التوالي ^{[ 262 ]} - في البروتين الشوكي لسلالة B.1.1.7. وقد سهّل هذا الأمر عملية التحديد الأولي ، إذ أصبح من الممكن الاشتباه بشكل أفضل في الحالات المصابة بسلالة B.1.1.7 من خلال تسلسل الجينوم. ^{[ 263 ]}

يُعتقد أن هذا المتغير قد يكون نشأ لدى شخص مصاب بعدوى مزمنة ويعاني من نقص المناعة ، مما أتاح للفيروس وقتًا طويلاً للتكاثر والتطور. ^{[ 264 ] [ 7 ] [ 265 ] [ 266 ]}

في ظل وجود سلالة أكثر قابلية للانتقال، تم اختيار تدابير التباعد الجسدي والإغلاق الأكثر صرامة لتجنب إرهاق السكان بسبب ميلها إلى النمو بشكل متسارع. ^{[ 267 ]}

تأثرت جميع دول المملكة المتحدة بقيود السفر الداخلي استجابةً لتزايد انتشار الفيروس - الذي يُعزى جزئيًا على الأقل إلى السلالة ألفا - اعتبارًا من 20 ديسمبر 2020. ^{[ 268 ] [ 269 ]} خلال شهر ديسمبر 2020، أعلن عدد متزايد من دول العالم حظرًا مؤقتًا على سفر الركاب من المملكة المتحدة، أو كانوا يدرسون حظره، وفي بعض الحالات من دول أخرى مثل هولندا والدنمارك. حظرت بعض الدول الرحلات الجوية، بينما سمحت دول أخرى بدخول مواطنيها فقط، بشرط تقديم نتيجة سلبية لاختبار SARS-CoV-2. ^{[ 270 ]} صرح متحدث باسم منظمة الصحة العالمية قائلاً: "في جميع أنحاء أوروبا، حيث ينتشر الفيروس بكثافة وعلى نطاق واسع، تحتاج الدول إلى مضاعفة جهودها في مجال المكافحة والوقاية". كانت معظم عمليات الحظر التي فرضتها دول الاتحاد الأوروبي لمدة 48 ساعة، في انتظار اجتماع استجابة سياسية متكاملة للأزمة لممثلي الاتحاد الأوروبي في 21 ديسمبر لتقييم التهديد الذي تشكله السلالة الجديدة وتنسيق استجابة مشتركة. ^{[ 177 ] [ 271 ]}

فرضت العديد من دول العالم قيودًا على سفر الركاب من المملكة المتحدة؛ كما فرضت فرنسا المجاورة قيودًا على مركبات نقل البضائع المأهولة (حيث فرضت حظرًا تامًا قبل وضع بروتوكول فحص والسماح بمرورها مجددًا). ^{​​[ 272 ]} وفرضت بعض الدول أيضًا قيودًا على السفر من دول أخرى. ^{[ 273 ] [ 274 ] [ 275 ] [ 276 ]} اعتبارًا من 21 ديسمبر 2020  ^{[ 270 ]} وقامت 42 دولة على الأقل بتقييد الرحلات الجوية القادمة من المملكة المتحدة، ^{[ 277 ]} وقامت اليابان بتقييد دخول جميع الرعايا الأجانب بعد اكتشاف حالات من السلالة الجديدة في البلاد.

وقد تم التشكيك في جدوى حظر السفر، إذ وُجد أنه محدود في الحالات التي يُحتمل أن يكون الفيروس قد وصل فيها بالفعل، لا سيما إذا كان معدل انتشاره الأسبوعي المُقدّر أعلى محلياً. ^{[ 278 ] [ 279 ]}

في أكتوبر/تشرين الأول 2021، صرّحت الدكتورة جيني هاريس، الرئيسة التنفيذية لوكالة الصحة والأمن في المملكة المتحدة، بأنّ السلالات المتحورة التي كانت منتشرة سابقًا، مثل سلالة ألفا، قد "اختفت" وحلّت محلها سلالة دلتا. ^{[ 280 ]} وفي مارس/آذار 2022، أدرجت منظمة الصحة العالمية سلالات ألفا وبيتا وجاما ضمن السلالات التي كانت منتشرة سابقًا ، مشيرةً إلى عدم رصد أي حالات إصابة بها خلال الأسابيع والأشهر السابقة. ^{[ 281 ]}