الربيطة (الكيمياء الحيوية)

📅 آخر تحديث: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 5 صور
الموسوعة الحرة
الميوغلوبين (أزرق) مع الهيم المرتبط به (برتقالي). استنادًا إلى قاعدة بيانات البروتين : 1MBO

في الكيمياء الحيوية وعلم الأدوية ، الربيطة هي مادة تشكل مركبًا مع جزيء حيوي لخدمة غرض بيولوجي. ينبع أصل الكلمة من الكلمة اللاتينية ligare ، والتي تعني "الارتباط". في ارتباط البروتين بالربيطة، يكون الربيطة عادةً جزيئًا ينتج إشارة عن طريق الارتباط بموقع على بروتين مستهدف . يؤدي الارتباط عادةً إلى تغيير في التماثل التكويني (التكوين) للبروتين المستهدف. في دراسات ارتباط الحمض النووي بالربيطة، يمكن أن يكون الربيطة جزيئًا صغيرًا أو أيونًا [ 1] أو بروتينًا [2] يرتبط باللولب المزدوج للحمض النووي . العلاقة بين الربيطة وشريك الارتباط هي دالة للشحنة وكراهية الماء والبنية الجزيئية.

يحدث الارتباط عن طريق قوى بين الجزيئات ، مثل الروابط الأيونية والروابط الهيدروجينية وقوى فان دير فالس . يكون الارتباط أو الالتحام في الواقع قابلاً للعكس من خلال التفكك . إن الرابطة التساهمية غير القابلة للعكس بشكل قابل للقياس بين الربيطة والجزيء المستهدف غير نمطية في الأنظمة البيولوجية. وعلى النقيض من تعريف الربيطة في الكيمياء المعدنية والعضوية وغير العضوية ، فإنه من الغامض في الكيمياء الحيوية ما إذا كانت الربيطة ترتبط عمومًا بموقع معدني ، كما هو الحال في الهيموجلوبين . بشكل عام، يكون تفسير الربيطة سياقيًا فيما يتعلق بنوع الارتباط الذي تمت ملاحظته.

يؤدي ارتباط الربيطة ببروتين المستقبل إلى تغيير التكوين من خلال التأثير على اتجاه الشكل ثلاثي الأبعاد. يتكون تكوين بروتين المستقبل من الحالة الوظيفية. تشمل الربيطة ركائز ومثبطات ومنشطات ودهون إشارات وناقلات عصبية . يُطلق على معدل الارتباط الألفة، ويمثل هذا القياس ميلًا أو قوة التأثير. لا تتحقق ألفة الارتباط فقط من خلال تفاعلات المضيف والضيف ، ولكن أيضًا من خلال تأثيرات المذيبات التي يمكن أن تلعب دورًا مهيمنًا ومكانيًا يدفع الارتباط غير التساهمي في المحلول. [3] يوفر المذيب بيئة كيميائية للربيطة والمستقبل للتكيف، وبالتالي قبول أو رفض بعضهما البعض كشركاء.

المواد المشعة هي مركبات مُسمّاة بالنظائر المشعة تُستخدم في الجسم الحي كمُتتبعات في دراسات التصوير المقطعي بالإصدار البوزيتروني وفي دراسات الارتباط في المختبر .

تقارب الارتباط بالمستقبل/الربيط

يمكن وصف تفاعل الربيطة مع مواقع ارتباطها من حيث تقارب الارتباط. بشكل عام، ينتج ارتباط الربيطة عالية الألفة من قوى جذب أكبر بين الربيطة ومستقبلها بينما ينطوي ارتباط الربيطة منخفضة الألفة على قوة جذب أقل. بشكل عام، ينتج عن الارتباط عالي الألفة إشغال أعلى للمستقبل بواسطة الربيطة مما هو الحال بالنسبة للارتباط منخفض الألفة؛ لا يرتبط وقت الإقامة (عمر معقد المستقبل-الربيطة). غالبًا ما يكون ارتباط الربيطة عالية الألفة بالمستقبلات مهمًا فسيولوجيًا عندما يمكن استخدام بعض طاقة الارتباط للتسبب في تغيير تكويني في المستقبل، مما يؤدي إلى سلوك متغير على سبيل المثال لقناة أيونية أو إنزيم مرتبط .

يُطلق على الربيطة التي يمكنها الارتباط بالمستقبل الذي يحفز الاستجابة الفسيولوجية وتغيير وظيفته اسم ناهض المستقبلات . أما الربيطة التي ترتبط بالمستقبل ولكنها تفشل في تنشيط الاستجابة الفسيولوجية فهي خصوم المستقبلات .

اثنين من المحفزات ذات تقارب الارتباط المتشابه

يمكن وصف ارتباط المحفز بمستقبل من حيث مقدار الاستجابة الفسيولوجية التي يمكن تحفيزها (أي الفعالية ) ومن حيث تركيز المحفز المطلوب لإنتاج الاستجابة الفسيولوجية (غالبًا ما يتم قياسه بـ EC 50 ، وهو التركيز المطلوب لإنتاج نصف الاستجابة القصوى). يشير ارتباط الربيطة عالية الألفة إلى أن تركيزًا منخفضًا نسبيًا من الربيطة كافٍ لاحتلال موقع ارتباط الربيطة إلى أقصى حد وتحفيز استجابة فسيولوجية. يتم قياس ألفة المستقبل بواسطة ثابت التثبيط أو قيمة K i ، وهو التركيز المطلوب لاحتلال 50٪ من المستقبل. غالبًا ما يتم قياس ألفة الربيطة بشكل غير مباشر كقيمة IC 50 من تجربة ارتباط تنافسية حيث يتم تحديد تركيز الربيطة المطلوب لإزاحة 50٪ من تركيز ثابت من الربيطة المرجعية. يمكن تقدير قيمة K i من IC 50 من خلال معادلة Cheng Prusoff . يمكن أيضًا قياس تقارب الربيطة بشكل مباشر على هيئة ثابت تفكك (K· d ) باستخدام طرق مثل إخماد الفلورسنت أو قياس السعرات الحرارية بالمعايرة المتساوية الحرارة أو رنين البلازمون السطحي . [4]

يشير الارتباط منخفض الألفة (مستوى K i مرتفع ) إلى أن تركيزًا مرتفعًا نسبيًا من الربيطة مطلوب قبل أن يتم شغل موقع الارتباط إلى أقصى حد ويتم تحقيق أقصى استجابة فسيولوجية للربيطة. في المثال الموضح على اليمين، ترتبط ربيطتان مختلفتان بنفس موقع ربط المستقبل. يمكن لواحد فقط من المحفزات الموضحة تحفيز المستقبل إلى أقصى حد، وبالتالي، يمكن تعريفه على أنه محفز كامل . يسمى المحفز الذي يمكنه تنشيط الاستجابة الفسيولوجية جزئيًا فقط محفزًا جزئيًا . في هذا المثال، يكون التركيز الذي يمكن عنده للمحفز الكامل (المنحنى الأحمر) تنشيط المستقبل إلى نصف الحد الأقصى حوالي 5 × 10 −9 مولار (nM = نانومولار ).

ربيطتان لهما قدرة مختلفة على الارتباط بالمستقبلات.

يتم تحديد تقارب الارتباط عادةً باستخدام ربيطة مُوسمة إشعاعيًا ، تُعرف باسم ربيطة مُوسومة. تتضمن تجارب الترابط التنافسي المتجانس التنافس على الارتباط بين ربيطة مُوسومة وربيطة غير مُوسومة. [5] لا تستطيع الطرق القائمة على الوقت الفعلي، والتي غالبًا ما تكون خالية من العلامات، مثل رنين البلازمون السطحي ، والتداخل ثنائي الاستقطاب ، والرنين البلازموني السطحي متعدد المعلمات (MP-SPR) تحديد التقارب من الاختبارات القائمة على التركيز فحسب؛ بل وأيضًا من حركية الارتباط والتفكك، وفي الحالات اللاحقة، التغيير التكويني الناتج عن الارتباط. يتيح MP-SPR أيضًا إجراء قياسات في مخازن تفكك عالية الملوحة بفضل إعداد بصري فريد. تم تطوير الرحلان الحراري المجهري (MST)، وهي طريقة خالية من التثبيت [6] . تسمح هذه الطريقة بتحديد تقارب الارتباط دون أي قيود على الوزن الجزيئي للربيطة. [7]

لاستخدام الميكانيكا الإحصائية في دراسة كمية لتقارب الارتباط بين الربيطة والمستقبل، راجع المقالة الشاملة [8] حول دالة التقسيم التكويني .

قوة ارتباط الدواء أو الهرمون

لا تحدد بيانات تقارب الارتباط وحدها الفعالية الكلية للدواء أو الهرمون المنتج بشكل طبيعي (المصنَّع حيويًا). [9]

الفعالية هي نتيجة للتفاعل المعقد بين كل من تقارب الارتباط وفعالية الربيطة. [9]

فعالية ربط الدواء أو الهرمون

تشير فعالية الربيطة إلى قدرة الربيطة على إنتاج استجابة بيولوجية عند الارتباط بمستقبل الهدف والحجم الكمي لهذه الاستجابة. قد تكون هذه الاستجابة بمثابة ناهض أو مضاد أو ناهض معاكس ، اعتمادًا على الاستجابة الفسيولوجية الناتجة. [10]

انتقائية وغير انتقائية

تميل الربائط الانتقائية إلى الارتباط بأنواع محدودة للغاية من المستقبلات، في حين ترتبط الربائط غير الانتقائية بعدة أنواع من المستقبلات. ويلعب هذا دورًا مهمًا في علم الأدوية ، حيث تميل الأدوية غير الانتقائية إلى إحداث تأثيرات ضارة أكثر ، لأنها ترتبط بعدة مستقبلات أخرى بالإضافة إلى المستقبل الذي يولد التأثير المطلوب.

ربيطات كارهة للماء

بالنسبة للربيطات الكارهة للماء (مثل PIP2) في معقد مع بروتين كاره للماء (مثل قنوات الأيونات ذات البوابات الدهنية ) فإن تحديد الألفة معقد بسبب التفاعلات الكارهة للماء غير المحددة. يمكن التغلب على التفاعلات الكارهة للماء غير المحددة عندما تكون ألفة الربيطة عالية. [11] على سبيل المثال، يرتبط PIP2 بألفة عالية بقنوات الأيونات ذات البوابات الدهنية PIP2.

ربيطة ثنائية التكافؤ

تتكون الربائط ثنائية التكافؤ من جزيئين شبيهين بالعقاقير (فارماكوفور أو ربيطات) متصلين بواسطة رابط خامل. هناك أنواع مختلفة من الربائط ثنائية التكافؤ وغالبًا ما يتم تصنيفها بناءً على ما تستهدفه الفارماكوفورات. تستهدف الربائط المتجانسة ثنائية التكافؤ نوعين من نفس المستقبلات. تستهدف الربائط غير المتجانسة نوعين مختلفين من المستقبلات. [12] تستهدف الربائط ثنائية التكافؤ مواقع ارتباط أورثوسترية ومواقع ارتباط ألوسترية على نفس المستقبل. [13] في البحث العلمي، تم استخدام الربائط ثنائية التكافؤ لدراسة ثنائيات المستقبلات والتحقيق في خصائصها. كان فيليب س. بورتوجيس وزملاؤه رائدين في هذه الفئة من الربائط أثناء دراسة نظام مستقبلات الأفيون. [14] [15] [16] كما تم الإبلاغ عن الربائط ثنائية التكافؤ في وقت مبكر من قبل مايكل كون وزملائه لمستقبل هرمون تحرير الغدد التناسلية . [17] [18] منذ هذه التقارير المبكرة، تم الإبلاغ عن العديد من الربيطة ثنائية التكافؤ لأنظمة مستقبلات البروتين المقترن (GPCR) المختلفة بما في ذلك القنب، [19] السيروتونين، [20] [21] الأوكسيتوسين، [22] وأنظمة مستقبلات الميلانوكورتين ، [23] [24] [25] وأنظمة GPCR - LIC ( مستقبلات D2 و nACh ). [12]

تميل الربائط ثنائية التكافؤ عادةً إلى أن تكون أكبر من نظيراتها أحادية التكافؤ، وبالتالي، فهي ليست "شبيهة بالعقاقير" كما في قاعدة ليبنسكي للخمسة . يعتقد الكثيرون أن هذا يحد من قابلية تطبيقها في الإعدادات السريرية. [26] [27] وعلى الرغم من هذه المعتقدات، فقد كان هناك العديد من الربائط التي أفادت بدراسات ناجحة على الحيوانات قبل السريرية. [24] [25] [22] [ 28] [29] [30] ونظرًا لأن بعض الربائط ثنائية التكافؤ يمكن أن يكون لها العديد من المزايا مقارنة بنظيراتها أحادية التكافؤ (مثل انتقائية الأنسجة وزيادة تقارب الارتباط وزيادة القوة أو الفعالية)، فقد تقدم الربائط ثنائية التكافؤ بعض المزايا السريرية أيضًا.

الربيطات الأحادية والمتعددة

يمكن أيضًا وصف ربيطات البروتينات من خلال عدد السلاسل البروتينية التي ترتبط بها. الربيطات "المونوديزمية" (μόνος: مفردة، δεσμός: ملزمة) هي ربيطات ترتبط بسلسلة بروتينية واحدة، في حين أن الربيطات "المتعددة الترابطات" (πολοί: عديدة) [31] شائعة في المجمعات البروتينية، وهي ربيطات ترتبط بأكثر من سلسلة بروتينية، عادةً في أو بالقرب من واجهات البروتين. تُظهر الأبحاث الحديثة أن نوع الربيطات وبنية موقع الارتباط لها عواقب عميقة على تطور ووظيفة وتوافق وطي مركبات البروتين. [32] [33]

سقالة مميزة

السقالة المميزة [34] هي إطار جزيئي أو مجموعة كيميائية تتكرر إحصائيًا بين الأدوية المعروفة أو بين مجموعة محددة من المركبات النشطة بيولوجيًا. يمكن استخدام هذه العناصر المميزة [35] كأساس لتصميم مركبات بيولوجية نشطة جديدة أو مكتبات مركبات.

الأساليب المستخدمة لدراسة الارتباط

الطرق الرئيسية لدراسة تفاعلات البروتين مع الربيطة هي التقنيات الهيدروديناميكية والحرارية الأساسية، والطرق الطيفية والبنيوية الأساسية مثل

تتضمن التقنيات الأخرى: شدة الفلورسنت، التكامل الفلوري ثنائي الجزيء، رنين البلازمون السطحي لإخماد FRET (نقل طاقة الرنين الفلوري) / رنين البلازمون السطحي، قياس التداخل الطبقي الحيوي ، اختبار المناعة غير المباشر ELISA، غسيل التوازن، الرحلان الكهربائي للهلام، لطخة الغرب الأقصى، تباين الاستقطاب الفلوري، الرنين المغناطيسي الإلكتروني، الرحلان الحراري على نطاق المجهر ، switchSENSE .

لقد أتاح التطور الهائل في القدرة الحاسوبية لأجهزة الكمبيوتر العملاقة وأجهزة الكمبيوتر الشخصية إمكانية دراسة التفاعلات بين البروتينات والربيطات باستخدام الكيمياء الحاسوبية . على سبيل المثال، تم تسخير شبكة عالمية تضم أكثر من مليون جهاز كمبيوتر عادي لأبحاث السرطان في مشروع grid.org ، والذي انتهى في إبريل/نيسان 2007. وقد خلف Grid.org مشاريع مماثلة مثل World Community Grid و Human Proteome Folding Project و Compute Against Cancer و Folding@Home .

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ Teif VB (أكتوبر 2005). "تكثيف الحمض النووي الناتج عن الربيطة: اختيار النموذج". مجلة البيوفيزياء . 89 (4): 2574–2587. Bibcode :2005BpJ....89.2574T. doi :10.1529/biophysj.105.063909. PMC  1366757. PMID  16085765 .
  2. ^ Teif VB, Rippe K (أكتوبر 2010). "نماذج الشبكة الإحصائية الميكانيكية لربط البروتين بالحمض النووي في الكروماتين". مجلة الفيزياء: المادة المكثفة . 22 (41): 414105. arXiv : 1004.5514 . Bibcode :2010JPCM...22O4105T. doi :10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID  21386588. S2CID  103345.
  3. ^ Baron R, Setny P, McCammon JA (سبتمبر 2010). "الماء في التعرف على رُبائط التجاويف". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 132 (34): 12091–12097. doi :10.1021/ja1050082. PMC 2933114. PMID  20695475 . 
  4. ^ "الفرق بين قيم Ki وKd وIC50 وEC50". مجلة The Science Snail . 31 ديسمبر 2019.
  5. ^ انظر منحنيات الربط التنافسية المتجانسة المؤرشفة في 2007-12-19 على موقع Wayback Machine ، دليل كامل للانحدار غير الخطي، curvefit.com.
  6. ^ Baaske P، Wienken CJ، Reineck P، Duhr S، Braun D (مارس 2010). “الرحلان الحراري البصري لقياس الاعتماد العازل لربط الأبتمر”. أنجيواندتي كيمي . 49 (12): 2238-2241. دوى :10.1002/anie.200903998. بميد  20186894.
    • "طريق ساخن نحو أدوية جديدة". Phys.org . 24 فبراير 2010.
  7. ^ Wienken CJ, Baaske P, Rothbauer U, Braun D, ​​Duhr S (أكتوبر 2010). "اختبارات ربط البروتين في السوائل البيولوجية باستخدام الرحلان الحراري المجهري". Nature Communications . 1 (7): 100. Bibcode :2010NatCo...1..100W. doi : 10.1038/ncomms1093 . PMID  20981028.
  8. ^ Vu-Quoc, L., Configuration integration (statistical mechanics), 2008. هذا الموقع مغلق؛ راجع هذه المقالة في أرشيف الويب في 28 أبريل 2012.
  9. ^ ab Hammes, Stephen R.; Mendelson, Carole R. (2011). "Mechanisms of Hormone Action". Textbook of Endocrine Physiology. Oxford University Press. doi :10.1093/oso/9780199744121.003.0006. ISBN 978-0-19-974412-1.
  10. ^ Kenakin TP (2006). A pharmacology primer: theory, applications, and methods. Academic Press . ص 79. ISBN 978-0-12-370599-0.
  11. ^ Cabanos, C; Wang, M; Han, X; Hansen, SB (8 أغسطس 2017). "اختبار الارتباط الفلوري القابل للذوبان يكشف عن معارضة PIP2 لقنوات TREK-1". Cell Reports . 20 (6): 1287–1294. doi :10.1016/j.celrep.2017.07.034. PMC 5586213. PMID  28793254 . 
  12. ^ أب ماتيرا ، كارلو. بوتشي، لوكا؛ فيورنتيني، كيارا؛ فوسيل، سيرجيو؛ ميسال، كريستينا؛ جرازيوسو، جيوفاني؛ كليمنتي، فرانشيسكو؛ زولي، ميشيل. دي أميسي ، ماركو (28/08/2015). "المركبات ثنائية الوظيفة التي تستهدف مستقبلات D2 وغير α7 nACh: التصميم والتوليف والتوصيف الدوائي". المجلة الأوروبية للكيمياء الطبية . 101 : 367-383. دوى :10.1016/j.ejmech.2015.06.039. بميد  26164842.
  13. ^ ماتيرا، كارلو؛ فلاميني، ليزا؛ كوادري، مارتا؛ فيفو، فالنتينا؛ بالابيني، فيجيليو؛ هولزجراب، أولريك؛ موهر، كلاوس؛ دي أميسي، ماركو؛ باروسيلي، إليزابيتا (2014-03-21). "مستقبلات الأستيل كولين المسكارينية من نوع بيس (أمونيوم): التخليق والتمييز الوظيفي المختبري والتقييم الحيوي لنشاطها المسكن للألم". المجلة الأوروبية للكيمياء الطبية . 75 : 222-232. doi :10.1016/j.ejmech.2014.01.032. PMID  24534538.
  14. ^ Erez M, Takemori AE, Portoghese PS (يوليو 1982). "القوة المضادة المخدرة للربيطات ثنائية التكافؤ التي تحتوي على بيتا نالتريكسامين. دليل على الربط بين مواقع التعرف القريبة". مجلة الكيمياء الطبية . 25 (7): 847-849. doi :10.1021/jm00349a016. PMID  7108900.
  15. ^ Portoghese PS, Ronsisvalle G, Larson DL, Yim CB, Sayre LM, Takemori AE (1982). "محفزات الأفيون والربائط الثنائية التكافؤ كمجسات للمستقبلات". علوم الحياة . 31 (12–13): 1283–1286. doi :10.1016/0024-3205(82)90362-9. PMID  6292615.
  16. ^ Portoghese PS, Akgün E, Lunzer MM (يناير 2017). "تحريض المتغاير: نهج لعلم الأدوية الفريد؟". ACS Chemical Neuroscience . 8 (3): 426–428. doi : 10.1021/acschemneuro.7b00002 . PMID  28139906.
  17. ^ Blum JJ, Conn PM (ديسمبر 1982). "تحفيز هرمون تحرير الغدد التناسلية لإطلاق هرمون ملوتن: نموذج الربيطة-المستقبل-المؤثر". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 79 (23): 7307–7311. Bibcode :1982PNAS...79.7307B. doi : 10.1073/pnas.79.23.7307 . JSTOR  13076. PMC 347328. PMID  6296828 . 
  18. ^ Conn PM, Rogers DC, Stewart JM, Niedel J, Sheffield T (أبريل 1982). "تحويل مضاد هرمون إطلاق الغدد التناسلية إلى ناهض". مجلة الطبيعة . 296 (5858): 653–655. رمز Bibcode :1982Natur.296..653C. doi :10.1038/296653a0. PMID  6280058. S2CID  4303982.
  19. ^ Nimczick M, Pemp D, Darras FH, Chen X, Heilmann J, Decker M (أغسطس 2014). "التوليف والتقييم البيولوجي لمستقبلات القنب ثنائية التكافؤ المستندة إلى البنزيميدازولات الانتقائية لمستقبلات hCB₂R تكشف عن خصائص جوهرية غير متوقعة". الكيمياء العضوية والطبية . 22 (15): 3938-3946. doi :10.1016/j.bmc.2014.06.008. PMID  24984935.
  20. ^ Russo O, Berthouze M, Giner M, Soulier JL, Rivail L, Sicsic S, Lezoualc'h F, Jockers R, Berque-Bestel I (سبتمبر 2007). "تخليق مجسات ثنائية التكافؤ محددة تتفاعل وظيفيًا مع ثنائيات مستقبلات 5-HT(4)". مجلة الكيمياء الطبية . 50 (18): 4482–4492. doi :10.1021/jm070552t. PMID  17676726.
  21. ^ Soulier JL, Russo O, Giner M, Rivail L, Berthouze M, Ongeri S, Maigret B, Fischmeister R, Lezoualc'h F, Sicsic S, Berque-Bestel I (أكتوبر 2005). "تصميم وتوليف مجسات محددة لدراسات ثنائيات مستقبلات 5-HT4 البشرية" (PDF) . مجلة الكيمياء الطبية . 48 (20): 6220–6228. doi :10.1021/jm050234z. PMID  16190749.
  22. ^ ab Busnelli M, Kleinau G, Muttenthaler M, Stoev S, Manning M, Bibic L, Howell LA, McCormick PJ, Di Lascio S, Braida D, Sala M, Rovati GE, Bellini T, Chini B (أغسطس 2016). "تصميم وتوصيف الربائط ثنائية التكافؤ فائقة القدرة التي تستهدف ثنائيات مستقبلات الأوكسيتوسين عبر بنية تشبه القناة". مجلة الكيمياء الطبية . 59 (15): 7152–7166. doi : 10.1021/acs.jmedchem.6b00564 . hdl : 2434/430357 . PMID  27420737.
  23. ^ Lensing CJ, Adank DN, Wilber SL, Freeman KT, Schnell SM, Speth RC, Zarth AT, Haskell-Luevano C (فبراير 2017). "مقارنة مباشرة في الجسم الحي بين ناهض الميلانوكورتين أحادي التكافؤ Ac-His-DPhe-Arg-Trp-NH2 مقابل ناهض ثنائي التكافؤ Ac-His-DPhe-Arg-Trp-PEDG20-His-DPhe-Arg-Trp-NH2: ميزة ثنائية التكافؤ". ACS Chemical Neuroscience . 8 (6): 1262–1278. doi :10.1021/acschemneuro.6b00399. PMC 5679024. PMID  28128928 . 
  24. ^ ab Xu L, Josan JS, Vagner J, Caplan MR, Hruby VJ, Mash EA, Lynch RM, Morse DL, Gillies RJ (ديسمبر 2012). "الربيطات غير المتجانسة تستهدف تركيبات مستقبلات سطح الخلية في الجسم الحي". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 109 (52): 21295–21300. رمز Bibcode :2012PNAS..10921295X. doi : 10.1073/pnas.1211762109 . JSTOR  42553664. PMC 3535626. PMID  23236171 . 
  25. ^ ab Lensing CJ, Freeman KT, Schnell SM, Adank DN, Speth RC, Haskell-Luevano C (أبريل 2016). "دراسة في المختبر وفي الجسم الحي للربيطات ثنائية التكافؤ التي تعرض ارتباطًا تفضيليًا ونشاطًا وظيفيًا لمتماثلات مستقبلات الميلانوكورتين المختلفة". مجلة الكيمياء الطبية . 59 (7): 3112-3128. doi :10.1021/acs.jmedchem.5b01894. PMC 5679017. PMID  26959173 . 
  26. ^ Shonberg J, Scammells PJ, Capuano B (يونيو 2011). "استراتيجيات التصميم للربيطات ثنائية التكافؤ المستهدفة لمستقبلات البروتين ج". ChemMedChem . 6 (6): 963–974. doi :10.1002/cmdc.201100101. PMID  21520422. S2CID  10561038.
  27. ^ Berque-Bestel I, Lezoualc'h F, Jockers R (ديسمبر 2008). "الربيطات ثنائية التكافؤ كأدوات دوائية محددة لمستقبلات البروتين ج المقترنة". تقنيات اكتشاف الأدوية الحالية . 5 (4): 312-318. doi :10.2174/157016308786733591. PMID  19075611.
  28. ^ Akgün E, Javed MI, Lunzer MM, Powers MD, Sham YY, Watanabe Y, Portoghese PS (نوفمبر 2015). "تثبيط الألم الالتهابي والعصبي عن طريق استهداف مستقبلات الأفيون Mu/مستقبلات الكيموكين 5 (MOR-CCR5)". مجلة الكيمياء الطبية . 58 (21): 8647–8657. doi :10.1021/acs.jmedchem.5b01245. PMC 5055304. PMID  26451468 . 
  29. ^ Daniels DJ, Lenard NR, Etienne CL, Law PY, Roerig SC, Portoghese PS (December 2005). "Opioid-induced affordation and dependence in mice is modulated by the distance between pharmacophores in a bivalent ligand series". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (52): 19208–19213. Bibcode :2005PNAS..10219208D. doi : 10.1073/pnas.0506627102 . JSTOR  4152590. PMC 1323165. PMID  16365317 . 
  30. ^ Smeester BA, Lunzer MM, Akgün E, Beitz AJ, Portoghese PS (نوفمبر 2014). "استهداف مستقبلات الغلوتامات-5 الأفيونية/الأيضية المفترضة ينتج مضادًا قويًا للألم في نموذج سرطان العظام المزمن لدى الفئران". المجلة الأوروبية لعلم الأدوية . 743 : 48–52. doi :10.1016/j.ejphar.2014.09.008. PMC 4259840. PMID  25239072 . 
  31. ^ Abrusan G, Marsh JA (2019). "بنية موقع ربط الربيطة تشكل طي وتجميع وتحلل المجمعات البروتينية المتجانسة". مجلة علم الأحياء الجزيئي . 431 (19): 3871–3888. doi :10.1016/j.jmb.2019.07.014. PMC 6739599. PMID  31306664 . 
  32. ^ Abrusan G, Marsh JA (2018). "Ligand Binding Site Structure Influences the Evolution of Protein Complex Function and Topology". Cell Reports . 22 (12): 3265–3276. doi :10.1016/j.celrep.2018.02.085. PMC 5873459. PMID  29562182 . 
  33. ^ Abrusan G, Marsh JA (2019). "بنية موقع ربط الربيطة تشكل انتقال الإشارة التآزرية وتطور التآزر في المجمعات البروتينية". علم الأحياء الجزيئي والتطور . 36 (8): 1711-1727. doi :10.1093/molbev/msz093. PMC 6657754. PMID  31004156 . 
  34. ^ Welsch ME, Snyder SA, Stockwell BR (يونيو 2010). "Privileged scaffolds for library design and drug discovery". Current Opinion in Chemical Biology . 14 (3): 347–61. doi :10.1016/j.cbpa.2010.02.018. PMC 2908274. PMID 20303320  . 
  35. ^ Kombarov R, Altieri A, Genis D, Kirpichenok M, Kochubey V, Rakitina N, Titarenko Z (فبراير 2010). "BioCores: تحديد نموذج هيكلي مميز قائم على عقار/منتج طبيعي لاكتشاف جزيئات صغيرة". التنوع الجزيئي . 14 (1): 193–200. doi :10.1007/s11030-009-9157-5. PMID  19468851. S2CID  23331540.
تحتوي ويكيميديا ​​كومنز على وسائط متعلقة بـ الربائط (الكيمياء الحيوية) .
  • BindingDB، قاعدة بيانات عامة لقياس تقارب ربط البروتين بالربيط.
  • BioLiP، قاعدة بيانات شاملة للتفاعلات بين الربيطة والبروتين.
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ligand_(biochemistry)&oldid=1241556614#Receptor.2Fligand_binding_affinity"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate