عامل النسخ

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 4 صور
الموسوعة الحرة

رسم توضيحي للمنشط

في علم الأحياء الجزيئي ، يُعد عامل النسخ ( TF ) (أو عامل ربط الحمض النووي ذو التسلسل المحدد ) بروتينًا يتحكم في معدل نسخ المعلومات الوراثية من الحمض النووي (DNA) إلى الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA ) ، وذلك عن طريق الارتباط بتسلسلات الحمض النووي . [ 1 ] [ 2 ] قد تُعزى الخصوصية إلى أنماط تسلسلية، أو تعديلات فوق جينية. [ 3 ] تتمثل وظيفة عوامل النسخ في تنظيم الجينات - أي تشغيلها وإيقافها - لضمان التعبير عنها في الخلايا المطلوبة في الوقت المناسب وبالكمية المناسبة طوال حياة الخلية والكائن الحي. تعمل مجموعات عوامل النسخ بشكل منسق لتوجيه انقسام الخلايا ونموها وموتها طوال الحياة؛ وهجرة الخلايا وتنظيمها ( مخطط الجسم ) أثناء التطور الجنيني؛ وبشكل متقطع استجابةً لإشارات من خارج الخلية، مثل الهرمونات . يوجد ما يقرب من 1600 عامل نسخ في الجينوم البشري ، نصفها تقريبًا من نوع C2H2 ذي أصابع الزنك . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] عوامل النسخ هي أعضاء في البروتينوم وكذلك الريغولوم .

تعمل عوامل النسخ منفردةً أو مع بروتينات أخرى ضمن مُركّب، إما عن طريق تعزيز (كمنشط ) أو تثبيط (كمثبط ) استقطاب بوليميراز الحمض النووي الريبي (الإنزيم المسؤول عن نسخ المعلومات الوراثية من الحمض النووي إلى الحمض النووي الريبي) إلى جينات مُحددة. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

من السمات المميزة لعوامل النسخ احتواؤها على نطاق واحد على الأقل لربط الحمض النووي (DBD)، والذي يرتبط بتسلسل محدد من الحمض النووي المجاور للجينات التي تنظمها. [ 11 ] [ 12 ] تُصنف عوامل النسخ إلى فئات بناءً على نطاقات ربط الحمض النووي الخاصة بها. [ 13 ] [ 14 ] تُعد بروتينات أخرى، مثل المنشطات المساعدة ، ومُعدِّلات الكروماتين ، وإنزيمات أسيتيل ترانسفيراز الهيستون ، وإنزيمات دي أسيتيل الهيستون ، والكينيزات ، والميثيلازات، ضرورية أيضًا لتنظيم الجينات، ولكنها تفتقر إلى نطاقات ربط الحمض النووي، وبالتالي فهي ليست عوامل نسخ. [ 15 ]

تُعد عوامل النسخ ذات أهمية في الطب لأن طفرات عوامل النسخ يمكن أن تسبب أمراضًا محددة، ويمكن استهداف الأدوية لها بشكل محتمل.

رقم

تُعد عوامل النسخ ضرورية لتنظيم التعبير الجيني، ولذلك فهي موجودة في جميع الكائنات الحية. ويزداد عدد عوامل النسخ الموجودة داخل الكائن الحي مع ازدياد حجم الجينوم، وتميل الجينومات الأكبر حجماً إلى احتواء عدد أكبر من عوامل النسخ لكل جين. [ 16 ]

يحتوي الجينوم البشري على ما يقارب 2800 بروتين تحتوي على نطاقات ربط الحمض النووي، ويُفترض أن 1600 منها تعمل كعوامل نسخ، [ 4 ] حيث أن نصفها تقريبًا (حوالي 800) هي بروتينات ذات أصابع زنك C2H2. [ 7 ] وبالتالي، فإن حوالي 10% من الجينات في الجينوم تُشفّر عوامل نسخ، مما يجعل هذه العائلة أكبر عائلة من البروتينات البشرية. علاوة على ذلك، غالبًا ما تكون الجينات محاطة بعدة مواقع ربط لعوامل نسخ مختلفة، ويتطلب التعبير الفعال عن كل جين من هذه الجينات العمل التعاوني لعدة عوامل نسخ مختلفة (انظر، على سبيل المثال، عوامل النسخ النووية للخلايا الكبدية ). ومن ثم، فإن الاستخدام التوافقي لمجموعة فرعية من حوالي 2000 عامل نسخ بشري يُفسر بسهولة التنظيم الفريد لكل جين في الجينوم البشري أثناء النمو . [ 15 ]

الآلية

ترتبط عوامل النسخ بمناطق مُحسِّنة أو مُحفِّزة من الحمض النووي (DNA) المجاورة للجينات التي تُنظِّمها، وذلك بناءً على تعرُّفها على أنماط مُحدَّدة من الحمض النووي. وبحسب عامل النسخ، يتم تنظيم نسخ الجين المجاور إما بالزيادة أو النقصان . تستخدم عوامل النسخ آليات مُتنوِّعة لتنظيم التعبير الجيني. [ 17 ] تشمل هذه الآليات ما يلي:

وظيفة

عوامل النسخ هي إحدى مجموعات البروتينات التي تقرأ وتفسر "المخطط" الجيني في الحمض النووي. ترتبط هذه العوامل بالحمض النووي وتساعد في بدء برنامج لزيادة أو تقليل نسخ الجينات. ولذلك، فهي ضرورية للعديد من العمليات الخلوية الهامة. فيما يلي بعض الوظائف والأدوار البيولوجية الهامة التي تشارك فيها عوامل النسخ:

التنظيم النسخي الأساسي

في حقيقيات النوى ، تُعدّ فئة مهمة من عوامل النسخ تُسمى عوامل النسخ العامة (GTFs) ضرورية لحدوث عملية النسخ. [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] لا يرتبط العديد من هذه العوامل بالحمض النووي DNA، بل تُشكّل جزءًا من مُركّب ما قبل بدء النسخ الكبير الذي يتفاعل مباشرةً مع بوليميراز الحمض النووي الريبي RNA . ومن أكثر عوامل النسخ العامة شيوعًا: TFIIA و TFIIB و TFIID (انظر أيضًا بروتين ربط TATA ) و TFIIE و TFIIF و TFIIH . [ 23 ] يرتبط مُركّب ما قبل بدء النسخ بمناطق المُحفّز في الحمض النووي DNA الواقعة في اتجاه 5' من الجين الذي يُنظّمه.

تعزيز النسخ التفاضلي

تُنظّم عوامل النسخ الأخرى التعبير عن جينات مختلفة بشكلٍ تفاضلي عن طريق الارتباط بمناطق مُحسِّنة في الحمض النووي (DNA) المجاورة للجينات المُنظَّمة. وتُعدّ هذه العوامل ضرورية لضمان التعبير عن الجينات في الخلية المناسبة في الوقت المناسب وبالكمية المناسبة، وذلك تبعًا للاحتياجات المتغيرة للكائن الحي. [ 1 ]

تطوير

تشارك العديد من عوامل النسخ في الكائنات متعددة الخلايا في عملية النمو. [ 24 ] تستجيب هذه العوامل للمؤثرات الخارجية، فتقوم بتنشيط أو تثبيط نسخ الجينات المناسبة، مما يسمح بدوره بحدوث تغييرات في شكل الخلية أو الأنشطة اللازمة لتحديد مصيرها وتمايزها . على سبيل المثال، تُعد عائلة عوامل النسخ Hox مهمة لتكوين نمط الجسم بشكل سليم في كائنات حية متنوعة، بدءًا من ذباب الفاكهة وصولًا إلى الإنسان. [ 25 ] [ 26 ] ومن الأمثلة الأخرى عامل النسخ المشفر بواسطة جين المنطقة المحددة للجنس على الكروموسوم Y ( SRY )، والذي يلعب دورًا رئيسيًا في تحديد الجنس لدى الإنسان. [ 27 ]

الاستجابة للإشارات بين الخلايا

تستطيع الخلايا التواصل فيما بينها عن طريق إطلاق جزيئات تُنتج سلسلة من الإشارات داخل خلية مستقبلة أخرى. إذا تطلبت الإشارة زيادة أو نقصانًا في التعبير الجيني في الخلية المستقبلة، فغالبًا ما تكون عوامل النسخ في المراحل اللاحقة من سلسلة الإشارات. [ 28 ] تُعد إشارات الإستروجين مثالًا على سلسلة إشارات قصيرة نسبيًا تتضمن عامل النسخ الخاص بمستقبل الإستروجين : يُفرز الإستروجين من أنسجة مثل المبيضين والمشيمة ، ويعبر غشاء الخلية المستقبلة، ويرتبط بمستقبل الإستروجين في سيتوبلازم الخلية. ثم ينتقل مستقبل الإستروجين إلى نواة الخلية ويرتبط بمواقع ارتباطه بالحمض النووي ، مما يُغير تنظيم نسخ الجينات المرتبطة به. [ 29 ]

الاستجابة للبيئة

لا تقتصر وظيفة عوامل النسخ على التأثير في مسارات الإشارات الخلوية المرتبطة بالمحفزات البيولوجية فحسب، بل قد تؤثر أيضًا في مسارات الإشارات الخلوية المرتبطة بالمحفزات البيئية. ومن الأمثلة على ذلك عامل الصدمة الحرارية (HSF)، الذي يزيد من التعبير عن الجينات الضرورية للبقاء على قيد الحياة في درجات حرارة مرتفعة، [ 30 ] وعامل نقص الأكسجين القابل للتحفيز (HIF)، الذي يزيد من التعبير عن الجينات الضرورية لبقاء الخلية في بيئات منخفضة الأكسجين، [ 31 ] وبروتين ربط عنصر تنظيم الستيرول (SREBP)، الذي يساعد في الحفاظ على مستويات الدهون المناسبة في الخلية. [ 32 ]

التحكم في دورة الخلية

تُساهم العديد من عوامل النسخ، ولا سيما بعض الجينات الأولية المسرطنة أو الجينات الكابتة للأورام ، في تنظيم دورة الخلية ، وبالتالي تحديد حجم الخلية ووقت انقسامها إلى خليتين بنويتين. [ 33 ] [ 34 ] ومن الأمثلة على ذلك جين Myc المسرطن، الذي يلعب أدوارًا مهمة في نمو الخلايا وموتها المبرمج . [ 35 ]

التسبب في المرض

يمكن أيضًا استخدام عوامل النسخ لتغيير التعبير الجيني في الخلية المضيفة لتعزيز الإمراضية. ومن الأمثلة المدروسة جيدًا على ذلك، المؤثرات الشبيهة بمنشطات النسخ ( مؤثرات TAL ) التي تفرزها بكتيريا Xanthomonas . عند حقنها في النباتات، تستطيع هذه البروتينات دخول نواة الخلية النباتية، والارتباط بتسلسلات المحفزات النباتية، وتنشيط نسخ الجينات النباتية التي تساعد في العدوى البكتيرية. [ 36 ] تحتوي مؤثرات TAL على منطقة تكرار مركزية، حيث توجد علاقة بسيطة بين هوية اثنين من البقايا الحرجة في التكرارات المتسلسلة وقواعد الحمض النووي المتسلسلة في موقع استهداف مؤثر TAL. [ 37 ] [ 38 ] من المرجح أن هذه الخاصية تُسهّل على هذه البروتينات التطور من أجل منافسة آليات الدفاع في الخلية المضيفة بشكل أفضل. [ 39 ]

أنظمة

من الشائع في علم الأحياء أن تخضع العمليات الحيوية المهمة لمستويات متعددة من التنظيم والتحكم. وينطبق هذا أيضًا على عوامل النسخ: فهي لا تتحكم فقط في معدلات النسخ لتنظيم كميات نواتج الجينات (الحمض النووي الريبوزي والبروتين) المتاحة للخلية، بل تخضع عوامل النسخ نفسها للتنظيم (غالبًا بواسطة عوامل نسخ أخرى). فيما يلي ملخص موجز لبعض الطرق التي يمكن من خلالها تنظيم نشاط عوامل النسخ:

توليف

تُنسخ عوامل النسخ (مثل جميع البروتينات) من جين على الكروموسوم إلى الحمض النووي الريبوزي (RNA)، ثم يُترجم الحمض النووي الريبوزي إلى بروتين. يمكن تنظيم أي من هذه الخطوات للتأثير على إنتاج (وبالتالي نشاط) عامل النسخ. ومن تبعات ذلك أن عوامل النسخ قادرة على تنظيم نفسها. على سبيل المثال، في حلقة التغذية الراجعة السلبية ، يعمل عامل النسخ كمثبط ذاتي: إذا ارتبط بروتين عامل النسخ بالحمض النووي لجينه، فإنه يُقلل من إنتاج المزيد منه. هذه إحدى آليات الحفاظ على مستويات منخفضة من عامل النسخ في الخلية. [ 40 ]

التوطين النووي

في حقيقيات النوى ، تُنسخ عوامل النسخ (مثل معظم البروتينات) في النواة ، ثم تُترجم في سيتوبلازم الخلية . تحتوي العديد من البروتينات النشطة في النواة على إشارات توجيه نووية توجهها إلى النواة. لكن بالنسبة للعديد من عوامل النسخ، تُعد هذه نقطة أساسية في تنظيمها. [ 41 ] يجب على فئات مهمة من عوامل النسخ، مثل بعض المستقبلات النووية، أن ترتبط أولًا بربيطة في السيتوبلازم قبل أن تتمكن من الانتقال إلى النواة. [ 41 ]

التفعيل

قد يتم تنشيط عوامل النسخ أو تثبيطها عبر نطاقاتها الحساسة للإشارات أو نطاقاتها المؤثرة. مع ذلك، لا تمتلك جميع عوامل النسخ نطاقًا مؤثرًا؛ فعلى سبيل المثال، يحتوي ما يقارب 400 عامل نسخ من نوع C2H2 ذي أصابع الزنك على نطاقات ربط الحمض النووي (DBDs) فقط. [ 6 ] يمكن أن يحدث تنشيط عوامل النسخ أو تثبيطها عبر عدد من الآليات، بما في ذلك:

  • ربط الليجاند - لا يقتصر ربط الليجاند على التأثير على مكان وجود عامل النسخ داخل الخلية فحسب، بل يمكن أن يؤثر ربط الليجاند أيضًا على ما إذا كان عامل النسخ في حالة نشطة وقادرًا على ربط الحمض النووي أو العوامل المساعدة الأخرى (انظر، على سبيل المثال، المستقبلات النووية ).
  • الفسفرة [ 42 ] [ 43 ] - يجب فسفرة العديد من عوامل النسخ مثل بروتينات STAT قبل أن تتمكن من الارتباط بالحمض النووي.
  • التفاعل مع عوامل النسخ الأخرى ( مثل التماثل أو التغاير الثنائي )
  • تتفاعل هذه البروتينات مع البروتينات المنظمة المساعدة مثل المنشطات المساعدة (مثل COPS5 و EP300 و BCL3 )؛ والمثبطات المساعدة (مثل NCOR1 و SIN3A و TRIM24 ). ومع ذلك، توجد منظمات مساعدة للنسخ يمكنها أن تعمل كمنشطات ومثبطات في آن واحد.

إمكانية الوصول إلى موقع ارتباط الحمض النووي

في حقيقيات النوى، يُنظَّم الحمض النووي (DNA) بمساعدة الهستونات في جسيمات مُدمجة تُسمى النيوكليوسومات ، حيث تُشكِّل تسلسلاتٌ من حوالي 147 زوجًا من قواعد الحمض النووي ما يُقارب 1.65 لفة حول ثماني وحدات من بروتينات الهستون. يكون الحمض النووي داخل النيوكليوسومات غير مُتاح للعديد من عوامل النسخ. بعض عوامل النسخ، التي تُسمى العوامل الرائدة، لا تزال قادرة على الارتباط بمواقع ارتباطها بالحمض النووي على الحمض النووي للنيوكليوسوم. بالنسبة لمعظم عوامل النسخ الأخرى، يجب أن يتم فك النيوكليوسوم بنشاط بواسطة محركات جزيئية مثل مُعدِّلات الكروماتين . [ 44 ] بدلاً من ذلك، يُمكن فك النيوكليوسوم جزئيًا عن طريق التقلبات الحرارية، مما يسمح بالوصول المؤقت إلى موقع ارتباط عامل النسخ. في كثير من الحالات، يحتاج عامل النسخ إلى التنافس على الارتباط بموقع ارتباطه بالحمض النووي مع عوامل نسخ أخرى وهستونات أو بروتينات كروماتين غير هستونية. [ 45 ] يمكن لأزواج من عوامل النسخ والبروتينات الأخرى أن تلعب أدوارًا متضادة (منشط مقابل مثبط) في تنظيم نفس الجين .

توافر عوامل مساعدة/عوامل نسخ أخرى

لا تعمل معظم عوامل النسخ بمفردها. إذ تُشكّل العديد من عائلات عوامل النسخ الكبيرة تفاعلات معقدة متجانسة أو غير متجانسة من خلال عملية التضاعف. [ 46 ] ولكي يحدث نسخ الجينات، يجب أن يرتبط عدد من عوامل النسخ بتسلسلات تنظيم الحمض النووي. وتستقطب هذه المجموعة من عوامل النسخ، بدورها، بروتينات وسيطة مثل العوامل المساعدة التي تسمح بالاستقطاب الفعال لمركب ما قبل البدء وإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي . وبالتالي، لكي يبدأ عامل نسخ واحد عملية النسخ، يجب أن تكون جميع هذه البروتينات الأخرى موجودة أيضًا، ويجب أن يكون عامل النسخ في حالة تسمح له بالارتباط بها عند الضرورة. العوامل المساعدة هي بروتينات تُعدّل تأثيرات عوامل النسخ. وتُعد العوامل المساعدة قابلة للتبادل بين مُحفزات جينية مُحددة؛ ويُحدد مُركب البروتين الذي يشغل الحمض النووي للمُحفز وتسلسل الأحماض الأمينية للعامل المساعد بنيته الفراغية. على سبيل المثال، يُمكن لبعض مُستقبلات الستيرويد تبادل العوامل المساعدة مع NF-κB ، الذي يُعد مفتاحًا بين الالتهاب والتمايز الخلوي. وبالتالي، يمكن أن تؤثر الستيرويدات على الاستجابة الالتهابية ووظيفة بعض الأنسجة. [ 47 ]

التفاعل مع السيتوزين الميثيلي

تلعب عوامل النسخ والسيتوزينات الميثيلية في الحمض النووي دورًا رئيسيًا في تنظيم التعبير الجيني. (يحدث مثيلة السيتوزين في الحمض النووي بشكل أساسي عندما يليه غوانين في تسلسل الحمض النووي من 5' إلى 3'، وهو موقع CpG ). عادةً ما يؤدي مثيلة مواقع CpG في منطقة المحفز الجيني إلى تثبيط نسخ الجين، [ 48 ] بينما يؤدي مثيلة مواقع CpG في جسم الجين إلى زيادة التعبير الجيني. [ 49 ] تلعب إنزيمات TET دورًا محوريًا في إزالة مثيلة السيتوزينات الميثيلية. تؤدي إزالة مثيلة مواقع CpG في محفز الجين بواسطة نشاط إنزيمات TET إلى زيادة نسخ الجين. [ 50 ]

تم تقييم مواقع ارتباط الحمض النووي لـ 519 عامل نسخ. [ 51 ] من بين هذه العوامل، لم تحتوي 169 عامل نسخ (33%) على ثنائيات نيوكليوتيدات CpG في مواقع ارتباطها، بينما استطاعت 33 عامل نسخ (6%) الارتباط بنمط يحتوي على CpG، لكنها لم تُظهر تفضيلًا لموقع ارتباط يحتوي على CpG مثيل أو غير مثيل. كما وُجد أن 117 عامل نسخ (23%) مُنعت من الارتباط بتسلسل ارتباطها إذا احتوى على موقع CpG مثيل، و175 عامل نسخ (34%) ازداد ارتباطها إذا احتوى تسلسل ارتباطها على موقع CpG مثيل، و25 عامل نسخ (5%) إما مُنعت أو ازداد ارتباطها اعتمادًا على موقع CpG المثيل في تسلسل الارتباط.

لا ترتبط إنزيمات TET تحديدًا بالميثيل سيتوزين إلا عند استقطابها (انظر إزالة مثيلة الحمض النووي ). وقد ثبت أن العديد من عوامل النسخ المهمة في تمايز الخلايا وتحديد السلالة، بما في ذلك NANOG و SALL4A و WT1 و EBF1 و PU.1 و E2A ، تستقطب إنزيمات TET إلى مواقع جينومية محددة (المعززات بشكل أساسي) للعمل على الميثيل سيتوزين (mC) وتحويله إلى هيدروكسي ميثيل سيتوزين (hmC) (وفي معظم الحالات، تحديدها لإزالة المثيلة الكاملة اللاحقة إلى سيتوزين). [ 52 ] ويبدو أن تحويل mC إلى hmC بواسطة TET يعطل ارتباط البروتينات الرابطة لـ 5mC، بما في ذلك MECP2 وبروتينات MBD ( نطاق ربط ميثيل-CpG )، مما يسهل إعادة تشكيل النيوكليوسومات وارتباط عوامل النسخ، وبالتالي تنشيط نسخ تلك الجينات. يُعد EGR1 عامل نسخ مهمًا في تكوين الذاكرة . يلعب دورًا أساسيًا في إعادة برمجة الخلايا العصبية الدماغية فوق الجينية . يقوم عامل النسخ EGR1 بتجنيد بروتين TET1 الذي يبدأ مسار إزالة مثيلة الحمض النووي . [ 53 ] يُستخدم EGR1، جنبًا إلى جنب مع TET1، في برمجة توزيع مواقع المثيلة على الحمض النووي للدماغ أثناء نمو الدماغ وفي التعلم (انظر علم التخلق في التعلم والذاكرة ).

بناء

رسم تخطيطي لتسلسل الأحماض الأمينية (الطرف الأميني على اليسار والطرف الكربوكسيلي على اليمين) لعامل نسخ نموذجي يحتوي على: (1) نطاق ارتباط الحمض النووي (DBD)، (2) نطاق استشعار الإشارة (SSD)، ونطاق التنشيط (AD). قد يختلف ترتيب النطاقات وعددها باختلاف أنواع عوامل النسخ. إضافةً إلى ذلك، غالبًا ما تتواجد وظيفتي التنشيط واستشعار الإشارة ضمن النطاق نفسه.
مثال على بنية النطاق: مثبط اللاكتوز (LacI) . يرتبط نطاق ربط الحمض النووي الطرفي N (المُعَلَّم) لمثبط اللاكتوز بتسلسل الحمض النووي المستهدف (الذهبي) في الأخدود الكبير باستخدام نمط حلزوني-انعطافي-حلزوني . يحدث ارتباط جزيء المؤثر (الأخضر) في النطاق التنظيمي (المُعَلَّم). يؤدي هذا إلى استجابة تنظيمية غير مباشرة تتوسطها منطقة الربط (المُعَلَّمة).

عوامل النسخ ذات بنية معيارية وتحتوي على المجالات التالية : [ 1 ]

  • نطاق ربط الحمض النووي ( DBD )، الذي يرتبط بتسلسلات محددة من الحمض النووي ( المعزز أو المحفز . وهو مكون ضروري لجميع النواقل. يُستخدم لتوجيه نسخ تسلسلات محفز الجين المنقول في الناقل ) المجاورة للجينات المنظمة. غالبًا ما يُشار إلى تسلسلات الحمض النووي التي ترتبط بعوامل النسخ باسم عناصر الاستجابة . في بعض الأحيان، يمكن لنطاقات ربط الحمض النووي (DBD) استقطاب منظمات النسخ المساعدة مباشرةً [ 54 ] دون الحاجة إلى نطاق تنشيط.
  • يحتوي نطاق التنشيط ( AD ) على مواقع ارتباط لبروتينات أخرى، مثل منظمات النسخ المساعدة . تُعرف مواقع الارتباط هذه عادةً بوظائف التنشيط ( AFs )، أو نطاق التنشيط العابر ( TAD )، أو نطاق التنشيط العابر TAD ، ويجب عدم الخلط بينه وبين نطاق الارتباط الطوبولوجي ( TAD ). [ 55 ] مع ذلك، لا تحتوي جميع عوامل النسخ على نطاق تنشيط (على سبيل المثال، نصفها تقريبًا (حوالي 800) هي بروتينات ذات أصابع زنك C2H2) [ 6 ].
  • يوجد نطاق استشعار إشارة اختياري ( SSD ) ( مثل نطاق ربط الليجاند)، يستشعر الإشارات الخارجية، وينقلها استجابةً لذلك إلى باقي مُركّب النسخ، مما يؤدي إلى زيادة أو نقصان التعبير الجيني. كما قد يتواجد نطاق ربط الحمض النووي (DBD) ونطاق استشعار الإشارة على بروتينات منفصلة تتحد داخل مُركّب النسخ لتنظيم التعبير الجيني.

نطاق ربط الحمض النووي

نقاط اتصال الحمض النووي لأنواع مختلفة من نطاقات ربط الحمض النووي لعوامل النسخ

يُطلق على الجزء ( النطاق ) من عامل النسخ الذي يرتبط بالحمض النووي اسم نطاق ارتباط الحمض النووي. فيما يلي قائمة جزئية ببعض العائلات الرئيسية لنطاقات ارتباط الحمض النووي/عوامل النسخ:

عائلةإنتربروPfamسكوب
حلزون-حلقة-حلزون أساسي [ 56 ]InterPro : IPR001092 Pfam PF00010SCOP 47460
سحاب الليوسين الأساسي ( bZIP ) [ 57 ]InterPro : IPR004827 Pfam PF00170SCOP 57959
نطاق التأثير الطرفي C لمنظمات الاستجابة الثنائيةInterPro : IPR001789 Pfam PF00072SCOP 46894
صندوق AP2/ERF/GCCInterPro : IPR001471 Pfam PF00847SCOP 54176
حلزون-انعطاف-حلزون [ 58 ]
بروتينات نطاق التماثل ، التي تُشفَّر بواسطة جينات صندوق التماثل ، هي عوامل نسخ. وتلعب بروتينات نطاق التماثل أدوارًا حاسمة في تنظيم النمو . [ 59 ] [ 60 ]InterPro : IPR009057 Pfam PF00046SCOP 46689
مثبط لامدا -مثلInterPro : IPR010982 SCOP 47413
عامل الاستجابة المصلية الشبيه بـ srfInterPro : IPR002100 Pfam PF00319SCOP 55455
صندوق مزدوج [ 61 ]
حلزون مجنحInterPro : IPR013196 Pfam PF08279SCOP 46785
أصابع الزنك [ 62 ]
* أصابع الزنك متعددة المجالات Cys 2 His 2 [ 63 ]InterPro : IPR007087 Pfam PF00096SCOP 57667
* Zn 2 /Cys 6SCOP 57701
* مستقبلات الزنك النووية Zn2 / Cys8InterPro : IPR001628 Pfam PF00105SCOP 57716

عناصر الاستجابة

يُطلق على تسلسل الحمض النووي الذي يرتبط به عامل النسخ اسم موقع ارتباط عامل النسخ أو عنصر الاستجابة . [ 64 ]

تتفاعل عوامل النسخ مع مواقع ارتباطها باستخدام مزيج من القوى الكهروستاتيكية (التي تُعد الروابط الهيدروجينية حالة خاصة منها) وقوى فان دير فالس . ونظرًا لطبيعة هذه التفاعلات الكيميائية، ترتبط معظم عوامل النسخ بالحمض النووي بطريقة محددة التسلسل. مع ذلك، قد لا تتفاعل جميع القواعد في موقع ارتباط عامل النسخ معه. إضافةً إلى ذلك، قد تكون بعض هذه التفاعلات أضعف من غيرها. وبالتالي، لا ترتبط عوامل النسخ بتسلسل واحد فقط، بل هي قادرة على الارتباط بمجموعة فرعية من التسلسلات وثيقة الصلة، ولكل منها قوة تفاعل مختلفة.

فعلى سبيل المثال، على الرغم من أن موقع الارتباط المتفق عليه لبروتين ربط TATA (TBP) هو TATAAAA، إلا أن عامل النسخ TBP يمكنه أيضًا الارتباط بتسلسلات مماثلة مثل TATATAT أو TATATAA. [ 65 ]

نظرًا لقدرة عوامل النسخ على الارتباط بمجموعة من التسلسلات المتشابهة، والتي غالبًا ما تكون قصيرة، فقد تظهر مواقع ارتباط محتملة لعوامل النسخ بالصدفة إذا كان تسلسل الحمض النووي طويلًا بما يكفي. مع ذلك، من غير المرجح أن يرتبط عامل النسخ بجميع التسلسلات المتوافقة في جينوم الخلية . كما أن هناك قيودًا أخرى، مثل سهولة الوصول إلى الحمض النووي في الخلية أو توافر العوامل المساعدة ، قد تُسهم في تحديد موقع ارتباط عامل النسخ. لذا، وبالنظر إلى تسلسل الجينوم، يبقى من الصعب التنبؤ بموقع ارتباط عامل النسخ في الخلية الحية.

ومع ذلك، يمكن الحصول على خصوصية التعرف الإضافية من خلال استخدام أكثر من مجال ربط الحمض النووي (على سبيل المثال، مجالات ربط الحمض النووي المتتالية في نفس عامل النسخ أو من خلال ازدواج عاملي النسخ) التي ترتبط بتسلسلين أو أكثر من تسلسلات الحمض النووي المتجاورة.

الأهمية السريرية

تُعد عوامل النسخ ذات أهمية سريرية لسببين على الأقل: (1) يمكن أن ترتبط الطفرات بأمراض معينة، و(2) يمكن أن تكون أهدافًا للأدوية.

الاضطرابات

نظراً لأدوارها المهمة في النمو، والتواصل بين الخلايا، ودورة الخلية، فقد ارتبطت بعض الأمراض البشرية بطفرات في عوامل النسخ. [ 66 ]

تُعدّ العديد من عوامل النسخ إما مثبطات للأورام أو جينات ورمية ، وبالتالي، فإنّ الطفرات أو التنظيم غير الطبيعي لها يرتبط بالسرطان. ومن المعروف أنّ ثلاث مجموعات من عوامل النسخ مهمة في سرطان الإنسان: (1) عائلتا NF-kappaB و AP-1 ، (2) عائلة STAT، و(3) مستقبلات الستيرويد . [ 67 ]

فيما يلي بعض الأمثلة التي حظيت بدراسة أفضل:

حالةوصفالموضع
متلازمة ريتترتبط الطفرات في عامل النسخ MECP2 بمتلازمة ريت ، وهي اضطراب في النمو العصبي. [ 68 ] [ 69 ]Xq28
السكريقد ينجم نوع نادر من داء السكري يُسمى داء السكري الناضج المبكر ( MODY ) عن طفرات في عوامل نووية للخلايا الكبدية (HNFs) [ 70 ] أو عامل محفز الأنسولين-1 (IPF1/Pdx1). [ 71 ]عديد
عسر الأداء اللفظي النمائيترتبط الطفرات في عامل النسخ FOXP2 بخلل النطق النمائي ، وهو مرض يعجز فيه الأفراد عن إنتاج الحركات المنسقة بدقة اللازمة للكلام. [ 72 ]7q31
أمراض المناعة الذاتيةتسبب الطفرات في عامل النسخ FOXP3 شكلاً نادراً من أمراض المناعة الذاتية يسمى IPEX . [ 73 ]XP11.23-q13.3
متلازمة لي-فراومينيناتج عن طفرات في مثبط الورم p53 . [ 74 ]17p13.1
سرطان الثديتُعد عائلة STAT ذات صلة بسرطان الثدي . [ 75 ]عديد
أنواع متعددة من السرطانتشارك عائلة HOX في مجموعة متنوعة من أنواع السرطان . [ 76 ]عديد
هشاشة العظامطفرة أو انخفاض نشاط SOX9 [ 77 ]

أهداف دوائية محتملة

تستهدف حوالي 10% من الأدوية الموصوفة حاليًا عوامل النسخ من فئة المستقبلات النووية بشكل مباشر. [ 78 ] ومن الأمثلة على ذلك التاموكسيفين والبيكالوتاميد لعلاج سرطان الثدي وسرطان البروستاتا على التوالي، وأنواع مختلفة من الستيرويدات المضادة للالتهابات والستيرويدات الابتنائية . [ 79 ] بالإضافة إلى ذلك، غالبًا ما يتم تعديل عوامل النسخ بشكل غير مباشر بواسطة الأدوية من خلال مسارات الإشارات . قد يكون من الممكن استهداف عوامل نسخ أخرى أقل دراسة، مثل NF-κB، بشكل مباشر بالأدوية. [ 80 ] [ 81 ] [ 82 ] [ 83 ] يُعتقد أن عوامل النسخ خارج عائلة المستقبلات النووية أكثر صعوبة في الاستهداف بالعلاجات الجزيئية الصغيرة ، نظرًا لعدم وضوح إمكانية استهدافها دوائيًا، ولكن تم إحراز تقدم في Pax2 [ 84 ] [ 85 ] ومسار Notch . [ 86 ]

دورها في التطور

لعبت تضاعفات الجينات دورًا حاسمًا في تطور الأنواع، وينطبق هذا بشكل خاص على عوامل النسخ. فعندما تحدث هذه العوامل كنسخ مكررة، يمكن أن تتراكم الطفرات المشفرة لنسخة واحدة دون التأثير سلبًا على تنظيم الجينات المستهدفة. ومع ذلك، فقد تم مؤخرًا توضيح تغيرات في خصائص ارتباط الحمض النووي لعامل النسخ Leafy أحادي النسخة ، الموجود في معظم النباتات البرية. في هذا السياق، يمكن لعامل النسخ أحادي النسخة أن يخضع لتغيير في الخصوصية من خلال وسيط متعدد الوظائف دون أن يفقد وظيفته. وقد اقتُرحت آليات مماثلة في سياق جميع الفرضيات التطورية البديلة ، ودور عوامل النسخ في تطور جميع الأنواع. [ 87 ] [ 88 ]

دورها في نشاط المكافحة البيولوجية

تلعب عوامل النسخ دورًا في نشاط المقاومة ، وهو أمر بالغ الأهمية لنجاح المكافحة البيولوجية . وقد ساهمت عوامل النسخ Yap1 وRim101 في مقاومة الإجهاد التأكسدي واستشعار الرقم الهيدروجيني القلوي لدى فطر Papiliotrema terrestris LS28، حيث كشفت الأدوات الجزيئية عن فهم للآليات الجينية الكامنة وراء نشاط المكافحة البيولوجية، مما يدعم برامج إدارة الأمراض القائمة على المكافحة البيولوجية والمتكاملة. [ 89 ]

تحليل

تتوفر تقنيات مختلفة لتحليل عوامل النسخ. على المستوى الجينومي ، يُستخدم تسلسل الحمض النووي وبحوث قواعد البيانات بشكل شائع. [ 90 ] يمكن الكشف عن النسخة البروتينية لعامل النسخ باستخدام أجسام مضادة نوعية . تُفحص العينة باستخدام تقنية ويسترن بلوت . وباستخدام اختبار إزاحة الهجرة الكهربية (EMSA)، [ 91 ] يمكن الكشف عن نمط تنشيط عوامل النسخ. يُعد نظام رقاقة عوامل النسخ، الذي يسمح بالكشف عن عدة عوامل نسخ مختلفة بالتوازي، نهجًا متعددًا لتحليل أنماط التنشيط. [ 92 ]

الطريقة الأكثر شيوعًا لتحديد مواقع ارتباط عوامل النسخ هي ترسيب الكروماتين المناعي (ChIP). [ 93 ] تعتمد هذه التقنية على التثبيت الكيميائي للكروماتين باستخدام الفورمالديهايد ، يليه ترسيب مشترك للحمض النووي وعامل النسخ المطلوب باستخدام جسم مضاد يستهدف هذا البروتين تحديدًا. بعد ذلك، يمكن تحديد تسلسلات الحمض النووي بواسطة المصفوفات الدقيقة أو التسلسل عالي الإنتاجية ( ChIP-seq ) لتحديد مواقع ارتباط عامل النسخ. في حال عدم توفر جسم مضاد للبروتين المطلوب، قد يكون DamID بديلًا مناسبًا. [ 94 ]

الصفوف الدراسية

كما هو موضح بمزيد من التفصيل أدناه، يمكن تصنيف عوامل النسخ وفقًا لـ (1) آلية عملها، أو (2) وظيفتها التنظيمية، أو (3) تشابه تسلسلها (وبالتالي تشابه بنيتها) في نطاقات ارتباطها بالحمض النووي. كما تُصنف أيضًا وفقًا لبنيتها ثلاثية الأبعاد وطريقة اتصالها بالحمض النووي. [ 95 ] [ 96 ]

ميكانيكي

يوجد نوعان من عوامل النسخ من الناحية الآلية:

أمثلة على عوامل النسخ المحددة [ 98 ]
عاملالنوع الهيكليتسلسل التعرفيرتبط بـ
SP1أصابع الزنك5' -GGGCGG- 3'المونومر
AP-1سحاب أساسي5'-TGA(G/C)TCA-3'ثنائي
C/EBPسحاب أساسي5'-ATTGCGCAAT-3'ثنائي
عامل الصدمة الحراريةسحاب أساسي5'-XGAAX-3'ثلاثي
مكتب الكحول والتبغ والأسلحة النارية والمتفجرات/مجلس حماية البيئةسحاب أساسي5'-TGACGTCA-3'ثنائي
سي-مايكحلزون-حلقة-حلزون أساسي5'-CACGTG-3'ثنائي
1 أكتوبرلولب-انعطاف-لولب5'-ATGCAAAT-3'المونومر
NF-1رواية5'-TTGGCXXXXXGCCAA-3'ثنائي
(G/C) = G أو C X = A أو T أو G أو C

وظيفي

تم تصنيف عوامل النسخ وفقًا لوظيفتها التنظيمية: [ 15 ]

  • أولًا: التكويني - موجود في جميع الخلايا في جميع الأوقات، نشط باستمرار، وجميعها عوامل مُنشِّطة . من المرجح جدًا أن يلعب دورًا مُهمًا في تسهيل نسخ العديد من الجينات الكروموسومية، ربما في الجينات التي يبدو أنها تُنسخ دائمًا (مثل البروتينات التركيبية مثل التوبولين والأكتين، والإنزيمات الأيضية المنتشرة مثل جليسرالدهيد فوسفات ديهيدروجينيز (GAPDH)). مثال: عوامل النسخ العامة ، Sp1 ، NF1 ، CCAAT
  • ثانياً: التنظيمي (نشط بشروط) - يتطلب التفعيل.
    • ثانيًا: التطور (خاص بنوع الخلية) - يبدأ في البويضة المخصبة. بمجرد التعبير عنه، لا يتطلب تنشيطًا إضافيًا. مثال: GATA ، HNF ، PIT-1 ، MyoD ، Myf5 ، Hox ، Winged Helix
    • II.B تعتمد على الإشارة - قد تكون محدودة في التعبير عنها أثناء التطور أو موجودة في معظم أو كل الخلايا، ولكنها جميعًا غير نشطة (أو نشطة بشكل ضئيل) حتى تتعرض الخلايا التي تحتوي على هذه البروتينات للإشارة المناسبة داخل الخلية أو خارجها.
      • II.B.1 مستقبلات نووية تعتمد على الربيطة خارج الخلية ( الغدد الصماء أو نظيرة الصماء ) .
      • II.B.2 يعتمد على الربيطة داخل الخلوية ( ذاتية الإفراز ) - يتم تنشيطه بواسطة جزيئات صغيرة داخل الخلايا. مثال: SREBP ، p53 ، مستقبلات نووية يتيمة.
      • II.B.3 يعتمد على تفاعل مستقبلات سطح الخلية مع الربيطة - يتم تنشيطه بواسطة سلسلة إشارات الرسول الثاني.
        • II.B.3.a عوامل نووية تأسيسية يتم تنشيطها بواسطة فسفرة السيرين - تتواجد داخل النواة. يمكن تنشيط إنزيمات فسفرة السيرين عبر مسارين رئيسيين:
        • II.B.3.b العوامل السيتوبلازمية الكامنة - وهي عوامل موجودة في السيتوبلازم عندما تكون غير نشطة. وهي مجموعة متنوعة للغاية من الناحية التركيبية والكيميائية، وكذلك مسارات تنشيطها. على سبيل المثال: STAT ، وR-SMAD ، و NF-κB ، وNotch ، وTUBBY ، وNFAT

الهيكلي

تُصنَّف عوامل النسخ عادةً بناءً على تشابه تسلسلها ، وبالتالي على البنية الثلاثية لنطاقات ارتباطها بالحمض النووي. [ 99 ] [ 14 ] [ 100 ] [ 13 ] يعتمد التصنيف التالي على البنية ثلاثية الأبعاد لنطاق ارتباطها بالحمض النووي وطريقة تفاعله معه. طُوِّر هذا التصنيف أولًا لعوامل النسخ البشرية، ثم وُسِّع ليشمل القوارض [ 95 ] والنباتات أيضًا. [ 96 ]

  • 1. الفئة العليا: المجالات الأساسية
    • 1.1 الفئة: عوامل سحاب الليوسين ( bZIP )
      • 1.1.1 العائلة: مكونات AP-1 (-like)؛ تشمل ( c-Fos / c-Jun )
      • 1.1.2 العائلة: CREB
      • 1.1.3 العائلة: عوامل شبيهة بـ C/EBP
      • 1.1.4 العائلة: bZIP / PAR
      • 1.1.5 العائلة: عوامل ربط صندوق G النباتية
      • 1.1.6 العائلة: ZIP فقط
    • 1.2 الفئة: عوامل الحلزون-الحلقة-الحلزون ( bHLH )
      • 1.2.1 العائلة: العوامل المنتشرة (الفئة أ)
      • 1.2.2 العائلة: عوامل النسخ المولدة للعضلات ( MyoD )
      • 1.2.3 العائلة: أتشيتي-سكوت
      • 1.2.4 العائلة: تال/تويست/لاتونال/هين
    • 1.3 الفئة: عوامل حلزونية-حلقية-حلزونية / عوامل سحاب الليوسين ( bHLH-ZIP )
      • 1.3.1 العائلة: عوامل bHLH-ZIP المنتشرة؛ تشمل USF ( USF1 ، USF2 )؛ SREBP ( SREBP )
      • 1.3.2 العائلة: عوامل التحكم في دورة الخلية؛ تشمل c-Myc
    • 1.4 الفئة: NF-1
      • 1.4.1 العائلة: NF-1 ( A ، B ، C ، X )
    • 1.5 الفئة: RF-X
      • 1.5.1 العائلة: RF-X ( 1 ، 2 ، 3 ، 4 ، 5 ، ANK )
    • 1.6 الفئة: bHSH
  • 2 فئة فائقة: نطاقات ربط الحمض النووي المنسقة للزنك
  • 3 فئة فائقة: حلزون-انعطاف-حلزون
    • 3.1 الفئة: مجال هوميو
      • 3.1.1 العائلة: نطاق Homeo فقط؛ يشمل Ubx
      • 3.1.2 العائلة: عوامل مجال POU ؛ تشمل أكتوبر
      • 3.1.3 العائلة: نطاق Homeo مع منطقة LIM
      • 3.1.4 العائلة: نطاق التماثل بالإضافة إلى أنماط أصابع الزنك
    • 3.2 الفئة: صندوق مزدوج
      • 3.2.1 العائلة: نطاق التماثل المزدوج بالإضافة إلى نطاق التماثل
      • 3.2.2 العائلة: نطاق مزدوج فقط
    • 3.3 الفئة: رأس متشعب / حلزون مجنح
      • 3.3.1 العائلة: منظمات النمو؛ تشمل رأس الشوكة
      • 3.3.2 العائلة: منظمات خاصة بالأنسجة
      • 3.3.3 العائلة: عوامل التحكم في دورة الخلية
      • 3.3.0 العائلة: جهات تنظيمية أخرى
    • 3.4 الفئة: عوامل الصدمة الحرارية
      • 3.4.1 العائلة: HSF
    • 3.5 الفئة: تجمعات التربتوفان
    • 3.6 الفئة: نطاق TEA (عامل تعزيز النسخ)
  • 4 فئة فائقة: عوامل سقالة بيتا ذات نقاط اتصال أخدودية صغيرة
    • 4.1 الفئة: RHR ( منطقة التماثل النسبي )
      • 4.1.1 العائلة: Rel/ أنكيرين ؛ NF-kappaB
      • 4.1.2 العائلة: أنكيرين فقط
      • 4.1.3 العائلة : NFAT ( العامل النووي للخلايا التائية المنشطة ) ( NFATC1 ، NFATC2 ، NFATC3 )
    • 4.2 الفئة: الإحصاء
      • 4.2.1 العائلة: STAT
    • 4.3 الفصل: ص 53
      • 4.3.1 العائلة: ص 53
    • 4.4 الفئة: صندوق MADS
      • 4.4.1 العائلة: منظمات التمايز؛ تشمل ( Mef2 )
      • 4.4.2 العائلة: المستجيبون للإشارات الخارجية، عامل الاستجابة المصلية ( SRF )
      • 4.4.3 العائلة: منظمات الأيض (ARG80)
    • 4.5 الفئة: عوامل النسخ ذات البنية الأسطوانية بيتا والبنية الحلزونية ألفا
    • 4.6 الفئة: بروتينات ربط TATA
      • 4.6.1 العائلة: TBP
    • 4.7 الفئة: صندوق HMG
      • 4.7.1 العائلة: جينات SOX ، SRY
      • 4.7.2 العائلة: TCF-1 ( TCF1 )
      • 4.7.3 العائلة: المرتبطة بـ HMG2، SSRP1
      • 4.7.4 العائلة: UBF
      • 4.7.5 العائلة: ماتا
    • 4.8 الفئة: عوامل CCAAT غير المتجانسة
      • 4.8.1 العائلة: عوامل CCAAT غير المتجانسة
    • 4.9 الفئة: جريني هيد
      • 4.9.1 العائلة: جريني هيد
    • 4.10 الفئة: عوامل مجال الصدمة الباردة
      • 4.10.1 العائلة: csd
    • 4.11 الفئة: صغير
      • 4.11.1 العائلة: صغير الحجم
  • 0 فئة فائقة: عوامل النسخ الأخرى
    • 0.1 الفئة: بروتينات قبضة النحاس
    • 0.2 الفئة: HMGI(Y) ( HMGA1 )
      • 0.2.1 العائلة: HMGI(Y)
    • 0.3 الفئة: نطاق الجيب
    • 0.4 الفئة: عوامل شبيهة بـ E1A
    • 0.5 الفئة: عوامل متعلقة بـ AP2/EREBP
      • 0.5.1 العائلة: AP2
      • 0.5.2 العائلة: EREBP
      • 0.5.3 العائلة الفائقة: AP2/B3
        • 0.5.3.1 العائلة: ARF
        • 0.5.3.2 العائلة: ABI
        • 0.5.3.3 العائلة: RAV

قواعد بيانات عوامل النسخ

توجد قواعد بيانات عديدة تُفهرس معلومات حول عوامل النسخ، لكن نطاقها وفائدتها يختلفان اختلافًا كبيرًا. قد تحتوي بعضها على معلومات حول البروتينات نفسها فقط، وبعضها الآخر على معلومات حول مواقع ارتباطها، أو حول جيناتها المستهدفة. ومن الأمثلة على ذلك ما يلي:

  • footprintDB - قاعدة بيانات وصفية لقواعد بيانات متعددة، بما في ذلك JASPAR وغيرها
  • JASPAR : قاعدة بيانات لمواقع ارتباط عوامل النسخ في حقيقيات النوى
  • CIS-BP: "مكتبة على الإنترنت لعوامل النسخ وأنماط ربط الحمض النووي الخاصة بها" تغطي أنواعًا مختلفة (عبر عدة ممالك)، وعائلات بروتينية، وفحوصات جينومية، ودراسات [ 101 ]
  • PlantTFD: قاعدة بيانات عوامل النسخ النباتية [ 102 ]
  • YeTFaSCo: قاعدة بيانات الخميرة ( S. cerevisiae ) لأنماط ربط عوامل النسخ [ 103 ]
  • TcoF-DB : قاعدة بيانات العوامل المساعدة للنسخ وتفاعلات عوامل النسخ [ 104 ]
  • TFcheckpoint: قاعدة بيانات لمرشحي عوامل النسخ في الإنسان والفأر والجرذ
  • transcriptionfactor.org (أصبح الآن موقعًا تجاريًا يبيع الكواشف)
  • MethMotif.org: قاعدة بيانات تكاملية خاصة بالخلايا لأنماط ربط عوامل النسخ مقترنة بملامح مثيلة الحمض النووي. [ 105 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 4 لاتشمان، د.س. (ديسمبر 1997). "عوامل النسخ: نظرة عامة" . المجلة الدولية للكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 29 ( 12): 1305-1312 . doi : 10.1016/S1357-2725(97)00085-X . PMC 2002184. PMID 9570129 .  
  2. ↑ كارين م (فبراير 1990). "كثرة عوامل النسخ: التفاعلات الإيجابية والسلبية". عالم الأحياء الجديد . 2 (2): 126-131 . PMID 2128034 . 
  3. ↑ إيزبل إل، غراند آر إس، شوبيلر دي (ديسمبر 2022). "توليد الخصوصية في تنظيم الجينوم من خلال حساسية عامل النسخ للكروماتين" . مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 23 (12): 728-740 . doi : 10.1038/s41576-022-00512-6 . ISSN 1471-0064 . PMID 35831531 .  
  4. 1 2 بابو إم إم، لوسكومب إن إم، أرافيند إل، جيرستين إم، تايخمان إس إيه (يونيو 2004). "بنية وتطور شبكات تنظيم النسخ" (ملف PDF) . الرأي الحالي في علم الأحياء البنيوي . 14 (3): 283-291 . doi : 10.1016/j.sbi.2004.05.004 . PMID 15193307. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 30 أغسطس 2019. تم الاسترجاع في 25 أكتوبر 2017 . 
  5. ↑ كيف يتم تنظيم الجينات: عوامل النسخ على يوتيوب
  6. 1 2 3 لامبرت إس، جولما أ، كامبيتيللي إل، براتيوش زد، داس ك، ين واي، وآخرون . (2018). " عوامل النسخ البشرية" . مجلة الخلية . 172 (4): 650-665 . doi : 10.1016/j.cell.2018.01.029 . PMC 12908702. PMID 29425488. يشمل العدد النهائي 1639 عامل نسخ بشري معروف أو محتمل .   
  7. 1 2 لامبرت إس إيه، جولما إيه، كامبيتيللي إل إف، داس بي كيه، ين واي، ألبو إم، وآخرون . (8 فبراير 2018). "عوامل النسخ البشرية" . مجلة الخلية . 172 (4): 650-665 . doi : 10.1016 / j.cell.2018.01.029 . ISSN 0092-8674 . PMC 12908702. PMID 29425488 .    
  8. ↑ رودر، ر. ج. (سبتمبر 1996). "دور عوامل البدء العامة في عملية النسخ بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي II". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 21 (9): 327-335 . doi : 10.1016/S0968-0004(96)10050-5 . PMID 8870495 . 
  9. ↑ نيكولوف د.ب.، وبورلي س.ك. (يناير 1997). "بدء نسخ بوليميراز الحمض النووي الريبي II: نظرة هيكلية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 94 (1): 15-22 . Bibcode : 1997PNAS...94...15N . doi : 10.1073/ pnas.94.1.15 . PMC 33652. PMID 8990153 .  
  10. ↑ لي تي آي، يونغ آر إيه (2000). "نسخ الجينات المشفرة للبروتينات في حقيقيات النوى". المراجعة السنوية لعلم الوراثة . 34 : 77-137 . doi : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 . 
  11. ↑ ميتشل، بي. جيه.، وتجيان، آر. (يوليو 1989). "التنظيم النسخي في خلايا الثدييات بواسطة بروتينات ربط الحمض النووي ذات التسلسل المحدد". مجلة ساينس . 245 (4916): 371-378 . Bibcode : 1989Sci...245..371M . doi : 10.1126/science.2667136 . PMID 2667136 . 
  12. ↑ بتاشن إم، غان إيه (أبريل 1997). "تنشيط النسخ عن طريق التجنيد". نيتشر . 386 ( 6625): 569-77 . Bibcode : 1997Natur.386..569P . doi : 10.1038/386569a0 . PMID 9121580. S2CID 6203915 .  
  13. 1 2 جين جيه، تشانغ إتش، كونغ إل، غاو جي، لو جيه (يناير 2014). "PlantTFDB 3.0: بوابة لدراسة وظائف وتطور عوامل النسخ النباتية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 42 (عدد قواعد البيانات): D1182-7. doi : 10.1093/nar/gkt1016 . PMC 3965000. PMID 24174544 .  
  14. 1 2 ماتيس ف، كيل-مارغوليس أو في، فريكه إي، ليبش آي، لاند إس، بار-ديري إيه، وآخرون . (يناير 2006). "TRANSFAC ووحدته TRANSCompel: تنظيم نسخ الجينات في حقيقيات النوى" . أبحاث الأحماض النووية . 34 (عدد قواعد البيانات): D108-10. doi : 10.1093/nar/ gkj143 . PMC 1347505. PMID 16381825 .   
  15. 1 2 3 بريفانلو إيه إتش، دارنيل جيه إي (فبراير 2002). "نقل الإشارة والتحكم في التعبير الجيني". مجلة ساينس . 295 (5556): 813-818 . Bibcode : 2002Sci...295..813B . doi : 10.1126 / science.1066355 . PMID 11823631. S2CID 14954195 .  
  16. ↑ فان نيمويجن إي (سبتمبر 2003). "قوانين القياس في المحتوى الوظيفي للجينومات". اتجاهات في علم الوراثة . 19 (9): 479-84 . arXiv : physics/0307001 . doi : 10.1016 / S0168-9525(03)00203-8 . PMID 12957540. S2CID 15887416 .  
  17. ↑ جيل، ج. (2001). "تنظيم بدء النسخ في حقيقيات النوى". مقالات في الكيمياء الحيوية . 37 : 33-43 . doi : 10.1042/bse0370033 . PMID 11758455 . 
  18. ↑ نارليكار جي جي، فان إتش واي، كينغستون آر إي (فبراير 2002). "التعاون بين المركبات التي تنظم بنية الكروماتين والنسخ" . الخلية . 108 ( 4): 475-487 . Bibcode : 2002Cell..108..475N . doi : 10.1016/S0092-8674(02)00654-2 . PMID 11909519. S2CID 14586791 .  
  19. ↑ Xu L, Glass CK, Rosenfeld MG (أبريل 1999). "مركبات المنشطات والمثبطات المشتركة في وظيفة المستقبلات النووية". Current Opinion in Genetics & Development . 9 (2): 140–7 . doi : 10.1016/S0959-437X(99)80021-5 . PMID 10322133 . 
  20. ↑ واينزيرل، ر. أ. (1999). آليات التعبير الجيني: بنية ووظيفة وتطور الآلية النسخية الأساسية . دار النشر العالمية للعلوم. رقم ISBN 1-86094-126-5.
  21. ↑ ريس، ج. س. (أبريل 2003). "عوامل النسخ الأساسية". الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 13 (2): 114-118 . doi : 10.1016/S0959-437X(03)00013-3 . PMID 12672487 . 
  22. ↑ شيلاتيفارد أ، كونواي آر سي، كونواي جيه دبليو (2003). "مركب استطالة بوليميراز الحمض النووي الريبي II". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 72 : 693-715 . doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161551 . PMID 12676794 . 
  23. ↑ توماس إم سي، تشيانغ سي إم (2006). " آلية النسخ العامة والعوامل المساعدة العامة". مراجعات نقدية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 41 (3): 105-178 . doi : 10.1080/10409230600648736 . PMID 16858867. S2CID 13073440 .  
  24. ↑ لوب، سي جي (1992). عوامل النسخ وتطور الثدييات . المواضيع الحالية في علم الأحياء التنموي. المجلد 27. الصفحات 351-383 . doi : 10.1016/S0070-2153(08)60539-6 . ISBN   978-0-12-153127-0PMID 1424766​​ 
  25. ↑ ليمونز د، ماكجينيس و (سبتمبر 2006). " التطور الجينومي لمجموعات جينات هوكس". مجلة ساينس . 313 (5795): 1918-22 . Bibcode : 2006Sci...313.1918L . doi : 10.1126/science.1132040 . PMID 17008523. S2CID 35650754 .  
  26. ↑ موينز سي بي ، سيليري إل (مارس 2006). "العوامل المساعدة لجينات هوكس في نمو الفقاريات" . علم الأحياء النمائي . 291 (2): 193-206 . doi : 10.1016/j.ydbio.2005.10.032 . PMID 16515781 . 
  27. ^ أوتولينغي سي، أودا إم، كريسبوني إل، أوماري إس، تساو أ، فورابوسكو أ، وآخرون . (يناير 2007). “تحديد واستقرار الجنس”. المقالات الحيوية . 29 (1): 15-25 . دوى : 10.1002/bies.20515 . اتش دي ال : 11380/611683 . بميد 17187356 . S2CID 23824870 .   
  28. ↑ باوسون، ت. (1993). "نقل الإشارة - مسار محفوظ من الغشاء إلى النواة". علم الوراثة التنموي . 14 (5): 333-338 . doi : 10.1002/dvg.1020140502 . PMID 8293575 . 
  29. ↑ أوزبورن سي كيه، شيف آر، فوكوا إس إيه، شو جيه (ديسمبر 2001). "مستقبلات الإستروجين: الفهم الحالي لتفعيلها وتعديلها". أبحاث السرطان السريرية . 7 (12 ملحق): 4338s– 4342s، مناقشة 4411s–4412s. PMID 11916222 . 
  30. ↑ شاموفسكي ، إي.، ونودلر، إي. (مارس 2008). "رؤى جديدة حول آلية تنشيط استجابة الصدمة الحرارية" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 65 (6): 855-861 . doi : 10.1007/s00018-008-7458-y . PMC 11131843. PMID 18239856. S2CID 9912334 .   
  31. ↑ بينيزري إي، جينوفيس أ، بيرا إي (أبريل 2008). "سحر سلسلة إشارات نقص الأكسجين" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 65 ( 7-8 ): 1133-1149 . doi : 10.1007 / s00018-008-7472-0 . PMC 11131810. PMID 18202826. S2CID 44049779 .   
  32. ↑ ويبر، إل دبليو، بول، إم، ستامبفل، إيه (نوفمبر 2004). "الحفاظ على استتباب الكوليسترول: البروتينات الرابطة لعناصر تنظيم الستيرول" . المجلة العالمية لأمراض الجهاز الهضمي . 10 (21): 3081-3087 . doi : 10.3748/wjg.v10.i21.3081 . PMC 4611246. PMID 15457548 .  
  33. ↑ ويتون ك، أتادجا ب، ريابوول ك (1996). "تنظيم نشاط عامل النسخ أثناء شيخوخة الخلايا". الكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 74 (4): 523-34 . Bibcode : 1996BCB....74..523W . doi : 10.1139/o96-056 . PMID 8960358 . 
  34. ↑ ميبابان م، أتادجا ب.و، ريابوول ك.ت (1996). "تنظيم التعبير الجيني ونشاط ارتباط عامل النسخ أثناء شيخوخة الخلايا". الإشارات البيولوجية . 5 (3): 130-138 . doi : 10.1159/000109183 . PMID 8864058 . 
  35. ↑ إيفان ج، هارينغتون إي، فانيدي أ، لاند هـ، أماتي ب، بينيت م (أغسطس 1994). "التحكم المتكامل في تكاثر الخلايا وموتها بواسطة الجين الورمي c-myc". المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية في لندن. السلسلة ب، العلوم البيولوجية . 345 (1313): 269-275 . Bibcode : 1994RSPTB.345..269E . doi : 10.1098/rstb.1994.0105 . PMID 7846125 . 
  36. ↑ Boch J, Bonas U (2010). "Xanthomonas AvrBs3 family-type III effectors: discovery and function". Annual Review of Phytopathology . 48 (1): 419–36 . Bibcode : 2010AnRvP..48..419B . doi : 10.1146/annurev-phyto-080508-081936 . PMID 19400638 . 
  37. ↑ موسكو إم جيه، بوغدانوف إيه جيه (ديسمبر 2009). "شفرة بسيطة تحكم التعرف على الحمض النووي بواسطة مُؤثرات TAL". مجلة ساينس . 326 (5959): 1501. Bibcode : 2009Sci...326.1501M . doi : 10.1126/science.1178817 . PMID 19933106. S2CID 6648530 .  
  38. ↑ Boch J, Scholze H, Schornack S, Landgraf A, Hahn S, Kay S, et al. (ديسمبر 2009). "فك شفرة خصوصية ارتباط الحمض النووي لمؤثرات TAL من النوع الثالث". مجلة ساينس . 326 (5959): 1509-1512 . Bibcode : 2009Sci...326.1509B . doi : 10.1126/science.1178811 . PMID 19933107. S2CID 206522347 .   
  39. ↑ فويتاس دي إف، جونغ جيه كيه (ديسمبر 2009). "علم النبات: ربط الحمض النووي بسهولة" . مجلة ساينس . 326 (5959): 1491-1492 . رمز Bibcode : 2009Sci...326.1491V . doi : 10.1126 / science.1183604 . PMC 7814878. PMID 20007890. S2CID 33257689 .   
  40. ↑ بان جي، لي جي، تشو واي، تشنغ إتش، باي دي (أغسطس 2006). "حلقة تغذية راجعة سلبية لعوامل النسخ تتحكم في قدرة الخلايا الجذعية على التمايز الذاتي والتجديد الذاتي" . مجلة FASEB . 20 (10): 1730-1732 . doi : 10.1096/fj.05-5543fje . PMID 16790525. S2CID 44783683 .  
  41. 1 2 وايتسايد إس تي، وجودبورن إس (أبريل 1993). "نقل الإشارة والاستهداف النووي: تنظيم نشاط عامل النسخ عن طريق التموضع الخلوي الفرعي". مجلة علوم الخلية . 104 (4): 949-55 . doi : 10.1242/jcs.104.4.949 . PMID 8314906 . 
  42. ↑ بومان د (نوفمبر 1990). "فسفرة عامل النسخ: صلة بين نقل الإشارة وتنظيم التعبير الجيني". خلايا السرطان . 2 (11): 337-44 . PMID 2149275 . 
  43. ↑ ويجل، ن. ل.، ومور، ن. ل. (أكتوبر 2007). "فسفرة مستقبلات الستيرويد: مُعدِّل رئيسي لوظائف مستقبلات متعددة" . علم الغدد الصماء الجزيئي . 21 (10): 2311-2319 . doi : 10.1210/me.2007-0101 . PMID 17536004 . 
  44. ↑ تيف، ف. ب.، وريب، ك. (سبتمبر 2009). "التنبؤ بمواقع النيوكليوسومات على الحمض النووي: الجمع بين تفضيلات التسلسل الجوهرية وأنشطة إعادة التشكيل" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 37 (17): 5641-5655 . doi : 10.1093/nar/gkp610 . PMC 2761276. PMID 19625488 .  
  45. ↑ تيف، ف. ب.، وريب، ك. (أكتوبر 2010). "نماذج الشبكة الإحصائية الميكانيكية لربط البروتين بالحمض النووي في الكروماتين". مجلة الفيزياء: المادة المكثفة . 22 (41) 414105. arXiv : 1004.5514 . Bibcode : 2010JPCM...22O4105T . doi : 10.1088/0953-8984/22/41/414105 . PMID 21386588. S2CID 103345 .  
  46. ↑ أموتزياس، جي دي، روبرتسون، دي إل، فان دي بير، واي، أوليفر، إس جي (مايو 2008). "اختر شركاءك: التضاعف في عوامل النسخ حقيقية النواة". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 33 (5): 220-229 . doi : 10.1016/j.tibs.2008.02.002 . PMID 18406148 . 
  47. ↑ كوبلاند، جيه. إيه.، وشيفيلد-مور، إم.، وكولدزيتش-زيفانوفيتش، إن.، وجينتري، إس.، ولامبرو، جي.، وتزورتزاتو-ستاثوبولو، إف.، وآخرون . (يونيو 2009). "مستقبلات الهرمونات الجنسية في تمايز الهيكل العظمي والأورام الظهارية: هل التدخل النسيجي المحدد ممكن؟". مقالات بيولوجية . 31 (6): 629-41 . doi : 10.1002/bies.200800138 . PMID 19382224. S2CID 205469320 .   
  48. ↑ ويبر م، هيلمان إ، ستادلر م ب، راموس ل، بابو س، ريبان م، وآخرون (أبريل 2007). "توزيع، وإمكانية إسكات، وتأثير مثيلة الحمض النووي للمحفز في الجينوم البشري على التطور". نات . جينيت . 39 (4): 457-466 . Bibcode : 2007NaGen..39..457W . doi : 10.1038/ng1990 . PMID 17334365. S2CID 22446734 .   
  49. ↑ يانغ إكس، هان إتش، دي كارفاليو دي دي، لاي إف دي، جونز بي إيه، ليانغ جي (أكتوبر 2014). "يمكن لمثيلة جسم الجين أن تُغير التعبير الجيني وتُعد هدفًا علاجيًا في السرطان" . خلية السرطان . 26 (4): 577-90 . doi : 10.1016/j.ccr.2014.07.028 . PMC 4224113. PMID 25263941 .  
  50. ↑ مايدر إم إل، أنغستمان جيه إف، ريتشاردسون إم إي، ليندر إس جيه، كاسيو في إم، تساي إس كيو، وآخرون . (ديسمبر 2013). "إزالة مثيلة الحمض النووي المستهدفة وتنشيط الجينات الداخلية باستخدام بروتينات اندماج TALE-TET1 القابلة للبرمجة" . نات. بيوتكنولوجي . 31 (12): 1137-1142 . doi : 10.1038/ nbt.2726 . PMC 3858462. PMID 24108092 .   
  51. ↑ ين واي، مورغونوفا إي، جولما إيه، كاسينين إي، ساهو بي، خوند-سعيد إس، وآخرون . (مايو 2017). " تأثير مثيلة السيتوزين على خصوصية ارتباط عوامل النسخ البشرية بالحمض النووي" . مجلة ساينس . 356 (6337) eaaj2239. Bibcode : 2017Sci...356j2239Y . doi : 10.1126/science.aaj2239 . PMC 8009048. PMID 28473536. S2CID 206653898 .    
  52. ↑ ليو سي جيه، راو أ (2019). " إنزيمات TET و5hmC في أنظمة المناعة التكيفية والفطرية" . فرونت إيمونول . 10 210. doi : 10.3389/fimmu.2019.00210 . PMC 6379312. PMID 30809228 .  
  53. ↑ صن ز، شو إكس، هي جيه، موراي إيه، صن إم إيه، وي إكس، وانغ إكس، مكويج إي، شي إي، جيانغ إكس، لي إل، تشو جيه، تشين جيه، موروزوف إيه، بيكريل إيه إم، ثيوس إم إتش، شي إتش. يقوم EGR1 بتجنيد TET1 لتشكيل ميثيلوم الدماغ أثناء النمو وعند النشاط العصبي. نات كوميون. 2019 أغسطس 29؛10(1):3892. doi: 10.1038/s41467-019-11905-3. PMID 31467272
  54. ↑ بيانكي د، بورزا ر، دي زان إي، هولز-برينس ج، غريغوريكيو س، ديكر م، وآخرون . (3 يوليو 2025). "زينكور، منظم مشترك غير نمطي، يرتبط بعوامل النسخ ذات أصابع الزنك للتحكم في التعبير الجيني" . ساينس . 389 (6755) eadv2861. Bibcode : 2025Sci...389v2861B . doi : 10.1126/science.adv2861 . hdl : 2066/324015 . ISSN 0036-8075 . PMID 40608935 .   
  55. ↑ وارنمارك أ، تروتر إي، رايت إيه بي، غوستافسون جيه إيه (أكتوبر 2003). "وظائف التنشيط 1 و2 للمستقبلات النووية: استراتيجيات جزيئية لتنشيط النسخ" . علم الغدد الصماء الجزيئي . 17 (10): 1901-1909 . doi : 10.1210/me.2002-0384 . PMID 12893880. S2CID 31314461 .  
  56. ↑ ليتلوود تي دي، إيفان جي آي (1995). "عوامل النسخ 2: حلزون-حلقة-حلزون". ملف البروتين . 2 (6): 621-702 . PMID 7553065 . 
  57. ↑ فينسون سي، مياكيشيف إم، أشاريا إيه، مير إيه إيه، مول جيه آر، بونوفيتش إم (سبتمبر 2002). " تصنيف بروتينات B-ZIP البشرية بناءً على خصائص التضاعف" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 22 (18): 6321-35 . Bibcode : 2002MolCB..22.6321V . doi : 10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002 . PMC 135624. PMID 12192032 .  
  58. ↑ وينتجنس ر، رومان م (سبتمبر 1996). "التصنيف البنيوي لمجالات ربط الحمض النووي HTH وأنماط تفاعل البروتين مع الحمض النووي". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 262 (2): 294-313 . doi : 10.1006/jmbi.1996.0514 . PMID 8831795 . 
  59. ↑ جيرينغ دبليو جيه، أفولتر إم، بورغلين تي (1994). "بروتينات المجال المتجانس". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 63 (1): 487-526 . Bibcode : 1994ARBio..63..487G . doi : 10.1146/annurev.bi.63.070194.002415 . PMID 7979246 . 
  60. ↑ بورغلين تي آر، أفولتر إم (يونيو 2016). " بروتينات المجال المتجانس: تحديث" . كروموسوما . 125 (3): 497-521 . doi : 10.1007/s00412-015-0543-8 . PMC 4901127. PMID 26464018 .  
  61. ^ دال إي، كوسيكي إتش، بالينج آر (سبتمبر 1997). “جينات باكس وتولد الأعضاء”. المقالات الحيوية . 19 (9): 755-65 . دوى : 10.1002/bies.950190905 . بميد 9297966 . S2CID 23755557 .  
  62. ↑ لايتي جيه إتش، لي بي إم، رايت بي إي (فبراير 2001). "بروتينات أصابع الزنك: رؤى جديدة حول التنوع البنيوي والوظيفي". الرأي الحالي في البيولوجيا البنيوية . 11 (1): 39-46 . doi : 10.1016/S0959-440X(00)00167-6 . PMID 11179890 . 
  63. ↑ وولف إس إيه، نيكلودوفا إل، بابو سي أو (2000). "التعرف على الحمض النووي بواسطة بروتينات أصابع الزنك Cys2His2". المراجعة السنوية للفيزياء الحيوية وبنية الجزيئات الحيوية . 29 : 183-212 . doi : 10.1146/annurev.biophys.29.1.183 . PMID 10940247 . 
  64. ↑ وانغ جيه سي (مارس 2005). "إيجاد الأهداف الأولية لمنظمات النسخ" . دورة الخلية . 4 (3): 356-358 . doi : 10.4161/cc.4.3.1521 . PMID 15711128 . 
  65. ↑ سافينكوفا ل، دراشكوفا إ، أرشينوفا ت، بونومارينكو ب، بونومارينكو م، كولتشانوف ن (12 فبراير 2013). "تحقق تجريبي من التأثيرات المتوقعة لتعدد أشكال صندوق TATA في المحفز المرتبط بالأمراض البشرية على التفاعلات بين صناديق TATA وبروتين ربط TATA" . PLOS ONE . 8 (2) e54626. Bibcode : 2013PLoSO...854626S . doi : 10.1371/journal.pone.0054626 . ISSN 1932-6203 . PMC 3570547. PMID 23424617 .   
  66. ↑ سيمينزا، جي إل (1999). عوامل النسخ والأمراض البشرية . أكسفورد [أكسفوردشاير]: مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-511239-9.
  67. ↑ ليبرمان، تي. أ.، وزربيني، إل. إف. (فبراير 2006). "استهداف عوامل النسخ لعلاج السرطان بالجينات". العلاج الجيني الحالي . 6 (1): 17-33 . doi : 10.2174/156652306775515501 . PMID 16475943 . 
  68. ↑ موريتي ب، زغبي هـ ي (يونيو 2006). "خلل وظيفة بروتين MeCP2 في متلازمة ريت والاضطرابات ذات الصلة". الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 16 (3): 276-281 . doi : 10.1016/j.gde.2006.04.009 . PMID 16647848 . 
  69. ↑ تشادويك إل إتش، ويد بي إيه (أبريل 2007). "MeCP2 في متلازمة ريت: مثبط نسخ أم بروتين معماري للكروماتين؟" . الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 17 (2): 121-125 . doi : 10.1016/j.gde.2007.02.003 . PMID 17317146. مؤرشف من الأصل في 2 أكتوبر 2023 - عبر زينودو. 
  70. ↑ مايسترو إم إيه، كاردالدا سي، بوج إس إف، لوكو آر إف، سيرفيتجا جيه إم، فيرير جيه (2007). "أدوار متميزة لـ HNF1 بيتا، وHNF1 ألفا، وHNF4 ألفا في تنظيم نمو البنكرياس، ووظيفة خلايا بيتا، ونموها " . تطور الغدد الصماء. المجلد 12. دار نشر كارغر الطبية والعلمية. الصفحات 33-45 . doi : 10.1159/000109603 . ISBN   978-3-8055-8385-5PMID 17923767​​ 
  71. ↑ القبيلي ف، مونتينار م (أبريل 2008). "عامل هوميو بوكس ​​البنكرياسي الاثني عشري-1 وداء السكري من النوع الثاني (مراجعة)" . المجلة الدولية للطب الجزيئي . 21 (4): 399-404 . doi : 10.3892/ijmm.21.4.399 . PMID 18360684. مؤرشف من الأصل في 2 أكتوبر 2023 . 
  72. ↑ لينون، ب. أ.، كوبر، م. ل.، بيفر، د. أ.، غونديرسون، ك. ل.، باتيل، أ.، بيترز، س.، وآخرون . (أبريل 2007). "حذف 7q31.1 يدعم دور FOXP2 في اضطرابات اللغة: تقرير سريري ومراجعة". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية. الجزء أ . 143أ (8): 791-798 . doi : 10.1002/ajmg.a.31632 . PMID 17330859. S2CID 22021740 .   
  73. ↑ فان دير فليت إتش جيه، نيوفينهاوس إي إي (2007). "متلازمة IPEX نتيجة طفرات في جين FOXP3" . علم المناعة السريري والتنموي . 2007 : 1-5 . doi : 10.1155/2007/89017 . PMC 2248278. PMID 18317533 .  
  74. ↑ إيواكوما تي، لوزانو جي، فلوريس إي آر (يوليو 2005). "متلازمة لي-فراوميني: شأن عائلي متعلق ببروتين p53" . دورة الخلية . 4 (7): 865-867 . doi : 10.4161/cc.4.7.1800 . PMID 15917654 . 
  75. ↑ كليفنجر، سي في (نوفمبر 2004). "أدوار وتنظيم عوامل النسخ من عائلة Stat في سرطان الثدي البشري" . المجلة الأمريكية لعلم الأمراض (مراجعة). 165 (5): 1449-1460 . doi : 10.1016/S0002-9440(10) 63403-7 . PMC 1618660. PMID 15509516 .  
  76. ↑ ""عوامل النسخ كأهداف وعلامات في السرطان" ورشة عمل 2007. مؤرشف من الأصل في 25 مايو 2012. تم الاطلاع عليه في 14 ديسمبر 2009 .
  77. ↑ جوفينداراج ك، هندريكس ج، ليدكي د.س، كاربرين م، بوست ج.ن (يناير 2019). "تغيرات استعادة التألق بعد التبييض الضوئي (FRAP) كمؤشر على نشاط عامل النسخ SOX9" . بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - آليات تنظيم الجينات . 1862 (1): 107-117 . doi : 10.1016/j.bbagrm.2018.11.001 . PMID 30465885 . 
  78. ↑ أوفيرنجتون جيه بي، اللازيكاني بي، هوبكنز إيه إل (ديسمبر 2006). "كم عدد الأهداف الدوائية المتاحة؟". مجلة نيتشر ريفيوز. اكتشاف الأدوية . 5 (12): 993-996 . doi : 10.1038/nrd2199 . PMID 17139284. S2CID 11979420 .  
  79. ↑ غرونماير هـ، غوستافسون جيه إيه، لوديت في (نوفمبر 2004). "مبادئ تعديل عائلة المستقبلات النووية الفائقة". مراجعات الطبيعة. اكتشاف الأدوية . 3 ( 11): 950-64 . Bibcode : 2004NRvDD...3..950G . doi : 10.1038/nrd1551 . PMID 15520817. S2CID 205475111 .  
  80. ↑ بوستين إس إيه، ماكاي آي إيه (يونيو 1994). "عوامل النسخ: أهداف للأدوية المصممة حديثًا". المجلة البريطانية للعلوم الطبية الحيوية . 51 (2): 147-157 . PMID 8049612 . 
  81. ↑ بات تي آر، كاراثاناسيس إس كيه (1995). " عوامل النسخ كأهداف دوائية: فرص الانتقائية العلاجية" . التعبير الجيني . 4 (6): 319-336 . PMC 6134363. PMID 7549464 .  
  82. ↑ بابافاسيليو، أ. ج. (أغسطس 1998). "عوامل تعديل عوامل النسخ: الدقة والانتقائية في تصميم الأدوية". الطب الجزيئي اليوم . 4 (8): 358-366 . doi : 10.1016/S1357-4310(98)01303-3 . PMID 9755455 . 
  83. ↑ غوش د، بابافاسيليو أ.ج. (2005). "العلاجات القائمة على عوامل النسخ: هل هي احتمال ضعيف أم هدف واعد؟". الكيمياء الطبية الحالية . 12 (6): 691-701 . doi : 10.2174/0929867053202197 . PMID 15790306 . 
  84. ↑ غريملي إي، لياو سي، رانغيني إي، نيكولوفسكا-كوليسكا زد، دريسلر جي (2017). "تثبيط تنشيط النسخ لـ Pax2 بجزيء صغير يستهدف نطاق ارتباط الحمض النووي" . مجلة ACS للكيمياء الحيوية . 12 (3): 724-734 . doi : 10.1021/acschembio.6b00782 . PMC 5761330. PMID 28094913 .  
  85. ↑ غريملي إي، دريسلر جي آر (2018). "هل بروتينات باكس أهداف علاجية محتملة في أمراض الكلى والسرطان؟" . مجلة الكلى الدولية . 94 (2): 259-267 . doi : 10.1016/j.kint.2018.01.025 . PMC 6054895. PMID 29685496 .  
  86. ↑ مويلرينغ، ر. إي. ، كورنيخو، م.، ديفيس، ت. ن.، ديل بيانكو، س.، أستر، ج. س.، بلاكلو، س. س.، وآخرون . (نوفمبر 2009). "التثبيط المباشر لمركب عامل النسخ NOTCH" . مجلة نيتشر . 462 (7270): 182-188 . Bibcode : 2009Natur.462..182M . doi : 10.1038/nature08543 . PMC 2951323. PMID 19907488 .   
    • ملخص المقال: كاثرين باجلي (11 نوفمبر 2009). "هدف دوائي جديد لعلاج السرطان" . مجلة ساينتست . مؤرشف من الأصل في 16 نوفمبر 2009.
  87. ↑ سايو سي، مونيو إم، ناناو إم إتش، مويرود إي، بروكينغتون إس إف، ثيفينون إي، وآخرون (فبراير 2014). "وسيط متعدد الوظائف يكمن وراء تطور خصوصية ارتباط LEAFY بالحمض النووي" . مجلة ساينس . 343 (6171): 645-648 . Bibcode : 2014Sci...343..645S . doi : 10.1126/science.1248229 . hdl : 1885/64773 . PMID 24436181. S2CID 207778924 .   
  88. ↑ جين جيه، هي كيه، تانغ إكس، لي زد، ليف إل، تشاو واي، وآخرون . (يوليو 2015). "خريطة تنظيم النسخ في نبات الأرابيدوبسيس تكشف عن سمات وظيفية وتطورية مميزة لعوامل نسخ جديدة" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 32 (7): 1767-1773 . doi : 10.1093/molbev/msv058 . PMC 4476157. PMID 25750178 .   
  89. ↑ كاستوريا ر، ميكولي س، باروني ج، بالميري د، دي كورتيس ف، ليما ج، وآخرون (مارس 2021). كان آي (محرر). "الأدوات الجزيئية لخميرة بابيليوتريما تيريستريس LS28 وتحديد Yap1 كعامل نسخ يشارك في نشاط المكافحة البيولوجية" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 87 (7) e02910-20. Bibcode : 2021ApEnM..87E2910C . doi : 10.1128/AEM.02910-20 . PMC 8091616. PMID 33452020 .   
  90. ↑ غراو ج، بن غال إ، بوش س، غروس إ (يوليو 2006). "VOMBAT: التنبؤ بمواقع ارتباط عوامل النسخ باستخدام أشجار بايزية ذات ترتيب متغير" ( ملف PDF) . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (عدد خادم الويب): W529-33. doi : 10.1093/nar/gkl212 . PMC 1538886. PMID 16845064. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 30 سبتمبر 2018. تم الاطلاع عليه في 10 يناير 2014 .  
  91. ↑ وينتا ن، شتراوس هـ، ماير س، فينكماير يو (يوليو 2008). "ينظم فسفرة التيروسين توزيع STAT1 بين مختلف التكوينات الثنائية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 105 (27): 9238-43 . Bibcode : 2008PNAS..105.9238W . doi : 10.1073/pnas.0802130105 . PMC 2453697. PMID 18591661 .  
  92. ↑ تراورنيشت م، فيليبوفسكا ت، راستوجي س، ستينسل بف (18 ديسمبر 2024). "مؤشرات مُحسَّنة للكشف المتعدد عن نشاط عامل النسخ" . أنظمة الخلية . 15 (12): 1107-1122.e7. doi : 10.1016/j.cels.2024.11.003 . ISSN 2405-4712 . PMC 11667439. PMID 39644900 .   
  93. ↑ فوري، تي إس (ديسمبر 2012). "ChIP-seq وما بعده: منهجيات جديدة ومحسّنة للكشف عن تفاعلات البروتين مع الحمض النووي وتوصيفها" . مجلة Nature Reviews Genetics . 13 (12): 840-852 . doi : 10.1038/nrg3306 . PMC 3591838. PMID 23090257 .  
  94. ↑ أوغي جي إن، ساوثول تي دي (يناير 2016). "يا له من أمر رائع! تحليل تفاعلات البروتين مع الحمض النووي باستخدام DamID" . مجلة وايلي متعددة التخصصات: علم الأحياء النمائي . 5 (1): 25-37 . doi : 10.1002/wdev.205 . PMC 4737221. PMID 26383089 .  
  95. 1 2 وينغندر إي، شوبس تي، هاوبروك إم، دونيتز جيه (يناير 2015). "TFClass: تصنيف عوامل النسخ البشرية ونظائرها في القوارض" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 43 (عدد قواعد البيانات): D97-102. doi : 10.1093/nar/gku1064 . PMC 4383905. PMID 25361979 .  
  96. 1 2 بلانك-ماثيو ر، دوماس ر، تورشي ل، لوكاس ج، بارسي ف (يناير 2024). "Plant-TFClass: تصنيف بنيوي لعوامل النسخ النباتية" . اتجاهات في علوم النبات . 29 (1): 40-51 . Bibcode : 2024TPS....29...40B . doi : 10.1016/j.tplants.2023.06.023 . PMID 37482504 . 
  97. ↑ أورفانيدس جي، لاغرانج تي، رينبرغ دي (نوفمبر 1996). "عوامل النسخ العامة لبوليميراز الحمض النووي الريبي II" . الجينات والتطور . 10 (21): 2657-83 . doi : 10.1101/gad.10.21.2657 . PMID 8946909 . 
  98. 1 2 بورون، دبليو إف (2003). علم وظائف الأعضاء الطبية: منهج خلوي وجزيئي . إلسيفير/سوندرز. ص 125-126 . ISBN  1-4160-2328-3.
  99. ↑ ستيغماير، ب.، كيل، أ. إ.، وينغندر، إ. (2004). "التصنيف المنهجي لنطاقات ربط الحمض النووي لعوامل النسخ" . معلوماتية الجينوم. المؤتمر الدولي لمعلوماتية الجينوم . 15 (2): 276-286 . PMID 15706513. مؤرشف من الأصل في 19 يونيو 2013. 
  100. ↑ "قاعدة بيانات TRANSFAC" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 5 أغسطس 2007 .
  101. ↑ ويراوخ إم تي، يانغ إيه، ألبو إم، كوت إيه جي، مونتينيغرو-مونتيرو إيه، دريو بي، وآخرون . (سبتمبر 2014). "تحديد واستنتاج خصوصية تسلسل عامل النسخ حقيقي النواة" . مجلة Cell . 158 (6): 1431-1443 . doi : 10.1016/ j.cell.2014.08.009 . PMC 4163041. PMID 25215497 .   
  102. ↑ جين جيه، تيان إف، يانغ دي سي، مينغ واي كيو، كونغ إل، لو جيه، وآخرون . (يناير 2017). "PlantTFDB 4.0: نحو مركز محوري لعوامل النسخ والتفاعلات التنظيمية في النباتات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (D1): D1040– D1045 . doi : 10.1093/nar/gkw982 . PMC 5210657. PMID 27924042 .   
  103. ↑ دي بوير سي جي، تيموثي آر هيوز (نوفمبر 2011). "YeTFaSCo: قاعدة بيانات لتقييم خصائص تسلسل عوامل النسخ في الخميرة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 40 (عدد قواعد البيانات): D169– D179. doi : 10.1093/nar/gkr993 . PMC 3245003. PMID 22102575 .  
  104. ↑ شماير إس، علم تي، إيساك إم، باجيك في بي (يناير 2017). "TcoF-DB الإصدار 2 : تحديث قاعدة بيانات عوامل النسخ المساعدة وتفاعلات عوامل النسخ لدى الإنسان والفأر" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (D1): D145– D150. doi : 10.1093/nar/gkw1007 . PMC 5210517. PMID 27789689 .  
  105. ↑ Xuan Lin QX, Sian S, An O, Thieffry D, Jha S, Benoukraf T (يناير 2019). "MethMotif: قاعدة بيانات تكاملية خاصة بالخلايا لأنماط ارتباط عوامل النسخ المقترنة بملامح مثيلة الحمض النووي" . Nucleic Acids Research . 47 (D1): D145– D154 . doi : 10.1093/nar/gky1005 . PMC 6323897. PMID 30380113 .  

للمزيد من القراءة

  • كاريتيرو بوليت، لورنزو؛  جالستيان، أناهيت؛  رويغ فيلانوفا، إيرما؛  مارتينيز-غارسيا، خايمي ف.  بلباو كاسترو، خوسيه ر.  «تصنيف الجينوم على نطاق واسع والتحليل التطوري لعائلة bHLH من عوامل النسخ في الأرابيدوبسيس، والحور، والأرز، والطحالب، والطحالب». فسيولوجيا النبات , 153, 3, 2010-07, ص. 1398-1412. دوى:10.1104/pp.110.153593 . ISSN 0032-0889       
  • جين جيه، هي كيه، تانغ إكس، لي زد، ليف إل، تشاو واي، وآخرون  (2015). "خريطة تنظيم النسخ في نبات الأرابيدوبسيس تكشف عن سمات وظيفية وتطورية مميزة لعوامل نسخ جديدة" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 32 (7): 1767-1773 . doi : 10.1093/molbev/msv058 . PMC 4476157. PMID 25750178 .