SLC46A3
بروتين ناقل المذاب من العائلة 46 العضو 3 (SLC46A3) هو بروتين يُشفّر في الإنسان بواسطة جين SLC46A3 . [ 5 ] يُعرف أيضًا باسم FKSG16، وينتمي إلى عائلة SLC46A وعائلة البروتينات الناقلة الرئيسية (MFS). [ 6 ] يوجد SLC46A3 بشكل شائع في الغشاء البلازمي والشبكة الإندوبلازمية ، وهو بروتين غشائي متعدد المرور يحتوي على 11 نطاقًا غشائيًا حلزونيًا ألفا . [ 7 ] [ 8 ] يشارك بشكل أساسي في نقل الجزيئات الصغيرة عبر الغشاء من خلال مسام نقل الركائز الموجودة في نطاق MFS . [ 9 ] [ 10 ] يرتبط هذا البروتين بسرطان الثدي والبروستاتا ، وسرطان الخلايا الكبدية ، والورم الحليمي ، والورم الدبقي ، والسمنة ، وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الالتهاب الرئوي الحاد (SARS-CoV ). [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] استنادًا إلى التعبير التفاضلي لجين SLC46A3 في الخلايا المقاومة للأجسام المضادة المقترنة بالأدوية (ADC) وبعض الخلايا السرطانية، يركز البحث الحالي على إمكانية استخدام SLC46A3 كعلامة حيوية للتنبؤ بمسار المرض وهدف علاجي للسرطان. [ 17 ] على الرغم من أن وفرة البروتين منخفضة نسبيًا لدى البشر، فقد تم الكشف عن تعبير عالٍ له ، لا سيما في الكبد والأمعاء الدقيقة والكلى . [ 18 ] [ 19 ]
جين
يقع جين SLC46A3، المعروف أيضًا باسميْه البديلين ناقل المذاب من العائلة 46 العضو 3 وFKSG16، في الموقع 13q12.3 على الشريط العكسي في الإنسان. [ 5 ] يمتد الجين على 18950 قاعدة من 28700064 إلى 28719013 (GRCh38/hg38)، ويحده جين POMP من جهة 5' وجين CYP51A1P2 من جهة 3'. [ 6 ] [ 20 ] يحتوي SLC46A3 على 6 إكسونات و5 إنترونات . [ 5 ] يوجد جينان متماثلان لهذا الجين، هما SLC46A1 وSLC46A2، وجينات متماثلة أخرى بعيدة مثل الفطريات . [ 21 ] حتى الآن، تم تحديد أكثر من 4580 تعددًا في النوكليوتيدات المفردة (SNPs) لهذا الجين. [ 22 ] يُعبَّر عن جين SLC46A3 بمستويات منخفضة نسبيًا، حوالي نصف متوسط التعبير الجيني. [ 23 ] يكون التعبير الجيني مرتفعًا بشكل ملحوظ في الكبد والأمعاء الدقيقة والكلى. [ 18 ] [ 19 ]
المتغيرات
تُعدّ الطفرات النقطية المفردة (SNPs) نوعًا شائعًا جدًا من التباين الجيني، وغالبًا ما تكون غير نشطة. [ 24 ] مع ذلك، قد يكون لبعض الطفرات النقطية المفردة في المناطق المحفوظة أو ذات الأهمية الوظيفية في الجين آثار سلبية على التعبير الجيني ووظيفته. يوضح الجدول أدناه بعض الطفرات النقطية المفردة ذات التأثيرات الضارة المحتملة التي تم تحديدها في التسلسل المشفر لجين SLC46A3.
| SNP | موقع mRNA | موقع الحمض الأميني | تغيير القاعدة | تغيير الأحماض الأمينية | وظيفة | وصف |
|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1456067444 | 554 | 1 | [T/G] | [السيد] | خطأ | كودون البدء |
| rs749501877 | 679 | 46 | [A/G] | [شمال/جنوب] | خطأ | موقع الغلكزة N |
| rs776889950 | 897 | 119 | [T/G] | [C/G] | خطأ | نمط C-(X) 2 -C |
| rs1403613207 | 967 | 142 | [G/A] | [G/D] | خطأ | مسام نقل الركيزة المحفوظة |
| rs764198426 | 1322 | 261 | [CT/-] | [ج/ف] | تغيير الإطار | موقع S-بالميتويليشن |
| rs1373735793 | 1878 | 446 | [شروط وأحكام] | [Y/H] | خطأ | نمط YXXphi ونمط ربط نطاق STAP1 SH2 |
| rs1342327615 | 1906 | 455 | [G/A] | [الرقم التسلسلي] | خطأ | موقع الفسفرة و O-GlcNAc |
| rs757225275 | 1917 | 459 | [T/G] [T/-] | [S/A] [S/Q] | خطأ تغيير الإطار | موقع الفسفرة و O-GlcNAc |
f*الإحداثيات/المواقع خاصة بـ GRCh38.p7.
يحتوي جين SLC46A3 على عدة نسخ جينية ناتجة عن مناطق محفزة مختلفة وعن التضفير البديل . [ 5 ] [ 26 ] تم العثور على 4 نسخ جينية في قاعدة بيانات RefSeq . [ 27 ] النسخة الأولى هي الأكثر وفرة. [ 28 ]
| نسخة نصية بديلة | رقم الوصول | الطول (bp) | وصف |
|---|---|---|---|
| 1 [ 28 ] | NM_181785.4 | 3302 | MANE select. Variant 1 encoding isoform a. |
| 2 [ 29 ] | NM_001135919.2 | 2758 | يقوم المتغير 2 بتشفير الشكل المتساوي b. وهو يفتقر إلى جزء في منطقة الترميز 3' ويؤدي انزياح الإطار الناتج إلى أن يكون للشكل المتساوي b نهاية C أطول من الشكل المتساوي a. |
| 3 [ 30 ] | NM_001347960.1 | 3099 | يقوم المتغير 3 أيضًا بتشفير الشكل المتساوي أ. يختلف المتغيران 1 و3 في مناطقهما غير المترجمة 5' (UTRs). |
| X1 [ 31 ] | XM_005266361.2 | 1845 | المتغير X1 يشفر الشكل المتماثل X1. |
* لا تشمل الأطوال الموضحة الإنترونات.
بروتين
الأشكال المتغايرة
تم الإبلاغ عن ثلاثة أشكال متماثلة من SLC46A3. [ 5 ] الشكل المتماثل a هو الشكل الأكثر وفرة والأكثر تحديدًا لـ MANE. [ 32 ] تحتوي جميع الأشكال المتماثلة على نطاقي MFS وMFS_1 بالإضافة إلى 11 منطقة عابرة للغشاء. [ 8 ] [ 33 ] [ 34 ]
| النظير | رقم الوصول | الطول (aa) | نص |
|---|---|---|---|
| أ [ 32 ] [ 8 ] | NP_861450.1 | 461 | 1.3 |
| ب [ 33 ] | NP_001129391.1 | 463 | 2 |
| X1 [ 34 ] | XP_005266418.1 | 463 | إكس 1 |
* الأطوال الموضحة خاصة بالبروتينات السلفية .
بناء
SLC46A3 هو بروتين غشائي متكامل يتكون من 461 حمضًا أمينيًا ، ويبلغ وزنه الجزيئي 51.5 كيلو دالتون . [ 35 ] تبلغ نقطة التعادل الكهربائي الأساسية لهذا البروتين 5.56. [ 36 ]
يحتوي البروتين على 11 نطاقًا عبر غشائي بالإضافة إلى النطاقين MFS وMFS_1. [ 32 ] يتداخل نطاقا MFS وMFS_1 بشكل كبير، ويحتويان على 42 مسامًا افتراضيًا لنقل الركائز، يُتوقع أن ترتبط هذه المسام بالركائز لنقلها عبر الغشاء. [ 10 ] تصل مسام نقل الركائز إلى جانبي الغشاء بالتناوب من خلال تغيير في البنية الفراغية . يفتقر بروتين SLC46A3 إلى الأحماض الأمينية المشحونة والقطبية، بينما يحتوي على فائض من الأحماض الأمينية غير القطبية، وخاصة الفينيل ألانين (Phe). [ 35 ] تتركز الخاصية الكارهة للماء الناتجة في الغالب في المناطق عبر الغشائية للتفاعل مع سلاسل الأحماض الدهنية في الطبقة الدهنية الثنائية . [ 37 ] كما تعاني النطاقات عبر الغشائية من نقص في البرولين (Pro)، وهو حمض أميني يُكسر بنية اللولب. [ 35 ]

يحتوي تسلسل البروتين على تجمعات شحنات مختلطة، موجبة وسالبة، واحدة من كل نوع، غنية بالجلوتامين (Glu). [ 35 ] تقع هذه التجمعات خارج المناطق العابرة للغشاء، وبالتالي فهي معرضة للمذيب . كما يوجد تسلسلان من الصفر يمران عبر عدة نطاقات عابرة للغشاء، بالإضافة إلى تسلسل +/* بين نطاقين عابرين للغشاء. يحتوي البروتين على وحدة C-(X) 2 -C (CLLC)، وهي وحدة شائعة في البروتينات الرابطة للمعادن والأكسيدوريدوكتازات . [ 38 ] كما توجد وحدة تسلسل إشارة الفرز YXXphi في الموقعين Tyr246-Phe249 (YMLF) وTyr446-Leu449 (YELL). [ 39 ] [ 40 ] تُوجّه إشارة الفرز القائمة على Y هذه حركة البروتينات الغشائية المتكاملة داخل المسارات الإندوسومية والإفرازية من خلال التفاعل مع الوحدات الفرعية μ لمركب البروتين المُحَوِّل (AP). [ 41 ] يُعدّ النمط الرابط لنطاق التماثل Src 2 (SH2) لبروتين STAP1 المُحَوِّل لنقل الإشارة عند Tyr446 - Ile450 (YELLI) جيبًا من الفوسفوتيروسين (pTyr) يعمل كموقع ارتباط لنطاق SH2، وهو محوري في إشارات كيناز التيروسين . [ 39 ] [ 42 ] تشمل الدورات المتعددة النموذجية للحلزون ألفا (دورات من 3.6 بقايا في الكراهية للماء) نطاقات عبر الغشاء. [ 43 ] لوحظت 3 تكرارات متتالية بأطوال كتل أساسية من 3 أحماض أمينية (GNYT، VSTF، STFI) في جميع أنحاء التسلسل. [ 35 ]
المرحلة الثانوية

استنادًا إلى نتائج برنامج Ali2D، يتميز التركيب الثانوي لبروتين SLC46A3 بوفرة الحلزونات ألفا مع وجود لفائف عشوائية بينها. [ 44 ] وبشكل أدق، يُتوقع أن يتكون البروتين من 62.9% حلزونات ألفا، و33.8% لفائف عشوائية، و3.3% خيوط ممتدة . وتغطي مناطق حلزونات ألفا معظم نطاقات الغشاء. كما يُتوقع أن يشكل ببتيد الإشارة حلزون ألفا، على الأرجح في المنطقة h . [ 45 ] تتميز حلزونات ألفا الأمفيباثية بتوجه خاص، حيث تقع البقايا المشحونة/القطبية وغير القطبية على جانبي الحلزون، ويعود ذلك أساسًا إلى التأثير الكاره للماء . [ 46 ]

تُظهر بنية غشاء SLC46A3 وجود 11 نطاقًا حلزونيًا ألفا عبر الغشاء مُدمجة في الغشاء، حيث يتجه الطرف الأميني نحو المنطقة خارج الخلوية (أو تجويف الشبكة الإندوبلازمية) ويمتد الطرف الكربوكسيلي إلى المنطقة السيتوبلازمية . [ 47 ] [ 48 ]

يحمل التركيب الثانوي للحمض النووي الريبي أهمية هيكلية ووظيفية. [ 49 ] من بين أنماط التركيب الثانوي المختلفة، يُعد تركيب الحلقة الجذعية (حلقة الدبوس) محفوظًا غالبًا عبر الأنواع نظرًا لدوره في طي الحمض النووي الريبي، وحماية استقراره البنيوي، وتوفير مواقع تعرف للبروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي. [ 50 ] تم تحديد 7 تراكيب حلقية جذعية في منطقة 5' غير المترجمة من جين SLC46A3، و10 تراكيب في منطقة 3' غير المترجمة. [ 51 ] تقع غالبية مواقع ارتباط البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي والحمض النووي الريبي الميكروي المذكورة أعلاه في تركيب حلقي جذعي، وينطبق هذا أيضًا على إشارة ذيل البولي أدينين في الطرف 3'.
التعليم العالي


تم بناء نموذج للبنية الثلاثية لبروتين SLC46A3 باستخدام برنامج I-TASSER ، بالاعتماد على بنية بلورية مماثلة لناقل الأنيونات العضوية البشري MFSD10 (Tetran) بدرجة تطابق عبر الغشاء (TM-score) تبلغ 0.853. [ 52 ] [ 53 ] [ 54 ] تحتوي البنية على مجموعة من 17 حلزون ألفا تمتد عبر الغشاء، بالإضافة إلى لفائف عشوائية تربط بين هذه الحلزونات. كما يُتوقع وجود مواقع ارتباط متعددة للروابط في البنية، بما في ذلك مواقع ارتباط (2S)-2,3-dihydroxypropyl(7Z)-pentadec-7-enoate (78M)، وهيميسوكسينات الكوليسترول (Y01)، وأوكتيل جلوكوز نيوبنتيل جليكول (37X). [ 55 ] [ 56 ]
| الليجاند | النتيجة C | حجم المجموعة | بقايا موقع ارتباط الليجاند |
|---|---|---|---|
| 78 مليون | 0.05 | 3 | 112، 116، 197، 198، 201، 204، 208 |
| Y01 | 0.05 | 3 | 89، 241، 265، 269، 273، 391، 394، 399 |
| 37X | 0.03 | 2 | 86، 89، 90، 94، 109، 136 |
التعبير التنظيمي
مستوى الجينات
المروج
يحمل الجين SLC46A3 أربعة مناطق محفزة تؤدي إلى متغيرات نسخ مختلفة كما تم تحديدها بواسطة ElDorado في Genomatix. [ 26 ] يدعم المحفز A متغير النسخ 1 (GXT_2836199).
| المروج | اسم | يبدأ | نهاية | الطول (bp) | نص |
|---|---|---|---|---|---|
| أ | GXP_190678 | 28718802 | 28720092 | 1291 | GXT_2775378، GXT_29165870، GXT_23385588، GXT_2836199، GXT_26222267، GXT_22739111، GXT_23500299 |
| ب | GXP_190676 | 28714934 | 28715973 | 1040 | GXT_2785139 |
| ج | GXP_190679 | 28713272 | 28714311 | 1040 | GXT_2781051 |
| د | GXP_19677 | 28704518 | 28705557 | 1040 | GXT_2781071 |
* الإحداثيات خاصة بـ GRCh38.
عوامل النسخ
ترتبط عوامل النسخ (TFs) بمنطقة المحفز لجين SLC46A3 وتُعدِّل عملية نسخ هذا الجين. [ 57 ] يُبيِّن الجدول أدناه قائمة مُنسَّقة بعوامل النسخ المُتوقَّعة. يُعدُّ الجين الأولي المُسرطن MYC (c-Myc)، وهو الجين الأكثر تطابقًا في قاعدة بيانات Genomatix بتشابه مصفوفة يبلغ 0.994، مُتَكَوِّنًا ثنائيًا مع العامل X المرتبط بـ MYC (MAX) للتأثير على التعبير الجيني بطريقة تُحفِّز تكاثر الخلايا واستقلابها. [ 58 ] [ 59 ] يزداد تعبيره بشكل كبير في مُعظم أنواع السرطان البشري، بما في ذلك سرطان الغدد الليمفاوية بيركيت. يُمكن لهذا المُتَكَوِّن الثنائي غير المتجانس كبح التعبير الجيني عن طريق الارتباط ببروتين MIZ1 ( بروتين إصبع الزنك المُتفاعل مع MYC 1 )، والذي يرتبط أيضًا بمحفز جين SLC46A3. يحتوي كل من بروتين إزاحة CCAAT (CDP) وعامل النسخ النووي Y (NF-Y) على مواقع ارتباط متعددة ضمن تسلسل المحفز (3 مواقع لـ CDP وموقعان لـ NF-Y). [ 58 ] يُعرف CDP أيضًا باسم Cux1، وهو مثبط نسخ . [ 60 ] أما NF-Y فهو مُركب غير متجانس ثلاثي الوحدات الفرعية ( NF-YA ، NF-YB ، NF-YC ) يُنظم التعبير الجيني، إيجابًا وسلبًا، عن طريق الارتباط بصندوق CCAAT . [ 61 ]
| عامل النسخ | وصف | تشابه المصفوفة |
|---|---|---|
| HIF | عامل قابل للتحفيز بنقص الأكسجين | 0.989 |
| سي-مايك | جين الورم النخاعي (جين الورم الأولي c-Myc) | 0.994 |
| GATA1 | عامل ربط GATA 1 | 0.983 |
| PXR / RXR | مستقبل البريغنان X / مستقبل الريتينويد X ثنائي الوحدات | 0.833 |
| RREB1 | بروتين ربط عنصر الاستجابة لراس 1 | 0.815 |
| TFCP2L1 | عامل النسخ CP2-like 1 (LBP-9) | 0.897 |
| ZNF34 | بروتين إصبع الزنك 34 (KOX32) | 0.852 |
| ميز1 | بروتين إصبع الزنك المتفاعل مع myc 1 (ZBTB17) | 0.962 |
| RFX5 | العامل التنظيمي X5 | 0.758 |
| CEBPB | بروتين بيتا الرابط لـ CCAAT/المعزز | 0.959 |
| KLF2 | العامل الشبيه بكروپيل 2 (LKLF) | 0.986 |
| CSRNP1 | البروتين النووي الغني بالسيستين/السيرين 1 (AXUD1) | 1.000 |
| CDP | بروتين إزاحة CCAAT (CDP/Cux) | 0.983 0.949 0.955 |
| إن إف-واي | عامل النسخ النووي Y | 0.944 0.934 |
| ZNF692 | بروتين إصبع الزنك 692 | 0.855 |
| كايسو | عامل النسخ كايسو (ZBTB33) | 0.991 |
| SP4 | عامل النسخ Sp4 | 0.908 |
| ZBTB24 | يحتوي على إصبع الزنك ومجال BTB 24 | 0.864 |
| E2F4 | عامل النسخ E2F 4 | 0.982 |
التعبير النسيجي

تُظهر بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNAseq) أن جين SLC46A3 يُعبر عنه بأعلى مستوياته في الكبد والأمعاء الدقيقة والكلى، بينما يكون تعبيره منخفضًا نسبيًا في الدماغ والعضلات الهيكلية والغدة اللعابية والمشيمة والمعدة . [ 18 ] [ 19 ] [ 62 ] في الأجنة التي تتراوح أعمارها بين 10 و20 أسبوعًا، تُظهر الغدة الكظرية والأمعاء تعبيرًا عاليًا، بينما يُظهر القلب والكلى والرئة والمعدة تعبيرًا معاكسًا. [ 63 ] تُظهر بيانات المصفوفات الدقيقة من قاعدة بيانات NCBI GEO تعبيرًا عاليًا في جزر لانغرهانس في البنكرياس والغدة النخامية والعقد اللمفاوية والدم المحيطي والكبد، حيث تبلغ النسبة المئوية 75 أو أعلى. [ 64 ] في المقابل، تشمل الأنسجة التي تُظهر أدنى مستويات التعبير عن جين SLC46A3 خلايا الظهارة الشعبية ، والنواة المذنبة ، والعقدة العنقية العلوية ، والعضلات الملساء ، وسرطانة غدية قولونية مستقيمية ، وجميعها بترتيب مئوي أقل من 15. يدعم الفحص المناعي النسيجي التعبير عن الجين في الكبد والكلى، وكذلك في أنسجة الجلد ، بينما يوفر التحليل المناعي الغربي (التلطيخ الغربي) دليلاً على وفرة البروتين في الكبد واللوزتين ، بالإضافة إلى خلايا الورم الحليمي والورم الدبقي . [ 14 ]

تُظهر بيانات التهجين الموضعي التعبير الجيني الواسع النطاق في أجنة الفئران في المرحلة E14.5 وفي دماغ الفأر البالغ في اليوم 56 بعد الولادة (P56). [ 65 ] [ 66 ] في العمود الفقري للفأر الصغير (P4)، يُعبر عن جين SLC46A3 بكثافة عالية نسبيًا في السطح المفصلي ، والقوس العصبي ، والحديبات الأمامية والخلفية . [ 67 ] ويُظهر القرن الظهري تعبيرًا ملحوظًا في العمود الفقري العنقي للفأر البالغ (P56). [ 68 ]
تنظيم مستوى البروتين
التوطين الخلوي الفرعي
تتوقع خوارزمية الجوار الأقرب (k-NN) المُطوّرة بواسطة برنامج PSORTII أن يتواجد بروتين SLC46A3 بشكل رئيسي في الغشاء البلازمي (78.3%) والشبكة الإندوبلازمية (17.4%)، وربما أيضًا في الميتوكوندريا (4.3%). [ 7 ] يُظهر التلوين المناعي الفلوري لبروتين SLC46A3 وجوده في الغشاء البلازمي والسيتوبلازم وخيوط الأكتين ، مع أن وجوده في الأخيرين يُعزى على الأرجح إلى عملية نقل البروتين بواسطة الميوسين من الشبكة الإندوبلازمية إلى الغشاء البلازمي؛ إذ ينقل الميوسين الحويصلات الغشائية الحاملة للبروتين على طول خيوط الأكتين. [ 14 ] [ 69 ]
التعديل ما بعد الترجمة

يحتوي بروتين SLC46A3 على ببتيد إشارة يُسهّل عملية الانتقال أثناء الترجمة ، ويُفصل بين الثريونين 20 والجليسين 21. [ 70 ] [ 71 ] يخضع البروتين الناضج الناتج، الذي يبلغ طوله 441 حمضًا أمينيًا، لتعديلات ما بعد الترجمة . يحتوي التسلسل على 3 مواقع غلكزة N (أسباراجين 38، أسباراجين 46، أسباراجين 53)، وتقع جميعها في المنطقة غير السيتوبلازمية المحاطة بببتيد الإشارة وأول نطاق عبر غشائي. [ 72 ] تزداد رتبة المنطقة الطرفية N القريبة من الغشاء بوجود O-GalNAc عند الثريونين 25. [ 73 ] [ 74 ] يشارك O-GlcNAc عند المواقع سيرين 227، ثريونين 231، سيرين 445، وسيرين 459 في تنظيم مسارات الإشارة . [ 75 ] [ 76 ] في الواقع، يخضع كل من Ser445 وSer459 أيضًا للفسفرة ، حيث يرتبط كلا الموقعين بكازيناز الكازين II (CKII)، مما يشير إلى وجود شبكة تفاعلية تنظم نشاط البروتين. [ 77 ] [ 78 ] [ 79 ] تشمل مواقع الفسفرة الأخرى المحفوظة للغاية Thr166 وSer233 وSer253 وSer454، والتي يُرجح أن تستهدفها كينازات بروتين كيناز C (PKC) وCKII وPKC و CKI /II على التوالي. من المتوقع وجود مواقع غلكزة محفوظة عند مجموعات الأمينو إبسيلون لليسينات في Lys101 وLys239 وLys374 مع تأثيرات محتملة على التركيب الجزيئي ووظيفة البروتين. [ 80 ] [ 81 ] من المتوقع حدوث عملية البلمتة S ، التي تساعد البروتين على الارتباط بالغشاء بشكل أكثر إحكامًا من خلال المساهمة في كراهية الماء للبروتين وارتباطه بالغشاء، عند Cys261 وCys438. [ 82 ] [ 83 ] [ 84 ] [ 85 ] يمكن لعملية البلمتة S أيضًا تعديل تفاعلات البروتين-بروتين لـ SLC46A3 عن طريق تغيير ألفة البروتين لحويصلات الدهون .
تنظيم مستوى النسخ
البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي
تُنظّم البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبوزي (RBPs) التي ترتبط بمنطقة 5' أو 3' غير المترجمة (UTR) التعبير عن الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) من خلال المشاركة في معالجة الحمض النووي الريبوزي وتعديله ، ونقله من النواة ، وتحديد موقعه، وترجمته . [ 86 ] فيما يلي قائمة ببعض البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبوزي الأكثر توقّعًا في المناطق المحفوظة من منطقتي 5' و3' غير المترجمتين.
| بروتين | وصف | عزر | قيمة P |
|---|---|---|---|
| MBNL1 (منظم الربط الشبيه بـ Muscleblind 1) | ينظم عملية التضفير البديل للرنا الرسول الأولي ؛ ويرتبط على وجه التحديد بالرنا المزدوج المتوسع ذي تكرارات CUG غير العادية؛ ويساهم في ضمور العضلات التوتري | ygcuky | 8.38×10 −3 2.52×10 −3 |
| ZC3H10 (أصابع الزنك من نوع CCCH تحتوي على 10) | يعمل كمثبط للأورام عن طريق تثبيط نمو الخلايا السرطانية غير المعتمد على الالتصاق؛ منظم الميتوكوندريا | sagcgm | 6.33×10 −3 |
| FXR2 (FMR1 autosomal homolog 2) | مرتبط بالوحدة الريبوسومية الكبيرة 60S من عديدات الريبوسومات ؛ قد يساهم في متلازمة الإعاقة الإدراكية المرتبطة بمتلازمة إكس الهشة | dgacrrr | 7.01×10 −3 |
| SRSF7 (عامل الربط الغني بالسيرين/الأرجينين 7) | يُعدّ هذا البروتين بالغ الأهمية لعملية ربط الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) كجزء من الجسيم الرابط ؛ كما أنه يشارك في تصدير الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) من النواة وترجمته. | acgacg | 6.44×10 −3 |
| FMR1 (منظم الترجمة FMRP 1) | مرتبط بالريبوسومات المتعددة؛ يشارك في نقل الحمض النووي الريبوزي الرسول؛ منظم سلبي للترجمة | kgacarg | 7.53×10 −3 |
| HNRNPM (بروتين نووي ريبوزي غير متجانس M) | يؤثر على معالجة ما قبل الحمض النووي الريبوزي الرسول، واستقلاب الحمض النووي الريبوزي الرسول، ونقل الحمض النووي الريبوزي الرسول | gguugguu | 5.07×10 −3 |
| YBX2 (بروتين ربط صندوق Y 2) | ينظم استقرار وترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول للخلايا الجرثومية | aacawcd | 1.68×10 −3 |
| RBM24 (بروتين ذو وحدة ربط الحمض النووي الريبي 24) | منظم تضفير خاص بالأنسجة؛ يشارك في استقرار الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) | wgwgugd | 5.83×10 −4 |
| PABPC4 (بروتين ربط عديد الأدينين السيتوبلازمي 4) | ينظم استقرار أنواع الحمض النووي الريبوزي الرسول غير المستقرة في الخلايا التائية المنشطة ؛ ويشارك في عملية الترجمة في الصفائح الدموية والخلايا النواءية. | آآآآآآر | 5.61×10 −3 |
| HuR (مستضد بشري R) | يعمل على تثبيت الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عن طريق الارتباط بالعناصر الغنية بالأدينين واليوراسيل (AREs). | أوكرو | 4.61×10 −3 |
| بروتين | وصف | عزر | قيمة P |
|---|---|---|---|
| ENOX1 (مبادل ثنائي الكبريتيد-ثيول إكتو-NOX 1) | تشارك في مسارات نقل الإلكترون عبر غشاء البلازما (PMET) مع أنشطة تبادل متناوبة لأكسيداز الهيدروكينون ( NADH ) وتبادل ثنائي كبريتيد البروتين -ثيول | hrkacag | 5.17×10 −4 |
| CNOT4 (الوحدة الفرعية 4 من مركب النسخ CCR4-NOT) | وحدة فرعية من مركب CCR4-NOT ؛ نشاط إنزيم E3 يوبيكويتين ليغاز ؛ يتفاعل مع CNOT1 | gacaga | 5.14×10 −4 |
| SRSF3 (عامل الربط الغني بالسيرين/الأرجينين 3) | يُعدّ هذا البروتين بالغ الأهمية لعملية ربط الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) كجزء من الجسيم الرابط؛ كما أنه يشارك في تصدير الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) من النواة وترجمته. | wcwwc | 4.00×10 −4 |
| KHDRBS2 (KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2) | يؤثر على اختيار موقع الربط mRNA وإدراج الإكسون | راواام | 5.90×10 −3 |
| HuR (مستضد بشري R) | يعمل على تثبيت الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عن طريق الارتباط بعناصر الاستجابة للمضادات الحيوية (AREs). | أوكرو | 7.12×10 −3 |
| RBMS3 (بروتين 3 المتفاعل مع الحمض النووي الريبي المرتبط بالنمط أحادي السلسلة) | (قد) يشارك في تنظيم استقلاب الحمض النووي الريبي | هاواوا | 1.89×10 −3 |
| KHDRBS1 (KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1) | تشارك في التضفير البديل، وتنظيم دورة الخلية ، وتكوين النهاية 3' للحمض النووي الريبي، وتكوين الأورام ، وتنظيم التعبير الجيني لفيروس نقص المناعة البشرية (HIV). | uaaaav | 2.66×10 −4 |
| PABPN1 (بروتين ربط عديد الأدينين النووي 1) | يرتبط بذيل البولي (أ) المتكون حديثًا ويوجه بلمرة ذيل البولي (أ) عند النهايات 3' للنسخ حقيقية النواة . | أراغا | 9.11×10 −3 |
| RBM42 (بروتين ذو وحدة ربط الحمض النووي الريبي 42) | يساهم في الحفاظ على مستويات ATP الخلوية تحت الضغط عن طريق حماية mRNAs المستهدفة | aacuamg | 4.44×10 −4 |
miRNA
توجد مواقع ارتباط للعديد من جزيئات miRNA في المناطق المحفوظة من منطقة 3' غير المترجمة (3' UTR) لجين SLC46A3. ويمكن لجزيئات miRNA التالية أن تنظم سلبًا التعبير عن mRNA عبر إسكات RNA . [ 88 ] تشمل آليات الإسكات انقسام mRNA وكبح الترجمة بناءً على مستوى التكامل بين تسلسلات miRNA وmRNA المستهدفة.
| اسم | تسلسل موقع الارتباط | النتيجة المستهدفة |
|---|---|---|
| hsa-miR-494-3p | ATGTTTCA | 97 |
| hsa-miR-106b-5p | GCACTTT – GCACTTT – GCACTTTA | 94 |
| hsa-miR-7159-5p | TTGTTGA – TTGTTGAA | 94 |
| hsa-miR-5680 | ATTTCTA – CATTTCT | 91 |
| hsa-miR-4477b | TCCTTAAA – TCCTTAAA | 91 |
| hsa-miR-660-5p | AATGGGT – AATGGGTA | 89 |
| hsa-miR-4319 | CTCAGGGA | 89 |
| hsa-miR-7162-3p | ACCTCAG | 89 |
| hsa-miR-137-3p | AGCAATAA | 88 |
| hsa-miR-6071 | CAGCAGAA | 88 |
| hsa-miR-597-3p | GAGAACCA | 86 |
| hsa-miR-510-3p | TTTCAAA – GTTTCAAA | 86 |
التشابه والتطور
الموازاة
SLC46A1 : يُعرف أيضًا باسم ناقل الفولات المقترن بالبروتون، يقوم SLC46A3 بنقل الفولات ومضادات الفولات عبر أغشية الخلايا بطريقة تعتمد على درجة الحموضة . [ 91 ]
SLC46A2: تشمل الأسماء البديلة نظير ناقل السدى التيمي، وTSCOT، وLy110. يشارك SLC46A2 في نشاط الناقل المشترك [ 92 ] وهو ناقل للرسول المناعي الثاني 2'3'-cGAMP . [ 93 ]
| فقرة | التاريخ المقدر للتباعد (بالملايين من السنين) | رقم الوصول | طول التسلسل (حمض أميني) | نسبة تطابق التسلسل (%) | نسبة تشابه التسلسل (%) |
|---|---|---|---|---|---|
| SLC46A1 | 724 | NP_542400.2 | 459 | 31 | 49 |
| SLC46A2 | 810 | NP_149040.3 | 475 | 27 | 44 |
المتماثلات
يُعدّ SLC46A3 بروتينًا محفوظًا للغاية ، وله نظائر متباعدة تصل إلى الفطريات. [ 21 ] [ 94 ] وقد وُجدت نظائر وثيقة الصلة في الثدييات بتشابه تسلسلي يزيد عن 75%، بينما تأتي النظائر متوسطة الصلة من أنواع الطيور والزواحف والبرمائيات والأسماك بتشابه تسلسلي يتراوح بين 50 و70%. أما النظائر الأبعد صلةً، فلها تشابه تسلسلي أقل من 50%، وهي موجودة في اللافقاريات والبلاكووزوا والفطريات . وتبقى نطاقات MFS و MFS_1 والنطاقات عبر الغشائية محفوظةً في الغالب عبر الأنواع. ويُعرض في الجدول أدناه قائمة مختارة من النظائر التي تم الحصول عليها من خلال NCBI BLAST .
| الجنس والنوع | الاسم الشائع | مجموعة تصنيفية | تاريخ التباعد (بالملايين من السنين) | رقم الوصول | طول التسلسل (حمض أميني) | نسبة تطابق التسلسل (%) | نسبة تشابه التسلسل (%) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| الإنسان العاقل | بشر | الثدييات | 0 | NP_861450.1 | 461 | 100 | 100 |
| مكاكا مولاتا | قرد الريسوس | الثدييات | 29 | XP_014976295.2 | 460 | 95 | 96 |
| Mus musculus | فأر المنزل | الثدييات | 90 | NP_001343931.1 | 460 | 75 | 86 |
| أورنيثورينكوس أناتينوس | خلد الماء | الثدييات | 177 | XP_028904425.1 | 462 | 68 | 81 |
| Gallus gallus | فرخة | أفيس | 312 | NP_001025999.1 | 464 | 51 | 69 |
| Pseudonaja textilis | الأفعى البنية الشرقية | الزواحف | 312 | XP_026564717.1 | 461 | 44 | 63 |
| زينوبوس تروبيكاليس | الضفدع ذو المخالب الاستوائية | البرمائيات | 352 | XP_002934077.1 | 473 | 42 | 62 |
| سمكة الزيبرا (Danio rerio) | سمكة الزيبرا | شعاعيات الزعانف | 435 | XP_021329877.1 | 463 | 42 | 62 |
| Rhincodon typus | قرش الحوت | الأسماك الغضروفية | 473 | XP_020383213.1 | 456 | 39 | 56 |
| أنيسيا جابونيكا | نجمة الريش | زنبق الماء | 684 | XP_033118008.1 | 466 | 29 | 47 |
| مشط القدم | محار الإسكالوب الكبير | ذوات الصدفتين | 797 | XP_033735180.1 | 517 | 24 | 40 |
| ذبابة الفاكهة نافوخوا | ذبابة الفاكهة | الحشرات | 797 | XP_030245348.1 | 595 | 19 | 34 |
| نيماتوستيلا فيكتينسيس | شقائق النعمان البحرية النجمية | الأنثوزوا | 824 | XP_001640625.1 | 509 | 28 | 46 |
| شميدتيا مديترانيا | الديدان المسطحة | رابديتوفورا | 824 | AKN21695.1 | 483 | 23 | 38 |
| تريكوبلاكس أدهيرنس | تريكوبلاكس | تريكوبلاسيا | 948 | XP_002114167.1 | 474 | 19 | 36 |
| Chytriomyces confervae | C. confervae | الفطريات الكيتريدية | 1105 | TPX75507.1 | 498 | 23 | 40 |
| تيوبر ماغناتوم | الكمأة البيضاء | بيزيزوميسيتس | 1105 | PWW79074.1 | 557 | 21 | 34 |
| Cladophialophora bantiana | C. bantiana | يوروتيوميسيتات | 1105 | XP_016623985.1 | 587 | 21 | 32 |
| إكسوفيالا ميزوفيلا | الخميرة السوداء | يوروتيوميسيتات | 1105 | RVX69813.1 | 593 | 19 | 32 |
| Aspergillus terreus | قالب | يوروتيوميسيتات | 1105 | GES65939.1 | 604 | 19 | 31 |
التاريخ التطوري

ظهر جين SLC46A3 لأول مرة في الفطريات قبل حوالي 1105 مليون سنة. [ 21 ] ويتطور هذا الجين بسرعة معتدلة نسبيًا، إذ يتطلب تغيير بنسبة 1% في تسلسل البروتين حوالي 6.2 مليون سنة. ويتطور جين SLC46A3 أسرع بأربع مرات تقريبًا من السيتوكروم سي، وأبطأ بمرتين ونصف من سلسلة ألفا للفيبرينوجين .
وظيفة
يُعدّ البروتين SLC46A3، وهو بروتين MFS، ناقلاً غشائياً ، يشارك بشكل أساسي في نقل المواد عبر الطبقة الدهنية الثنائية. [ 9 ] يعمل هذا البروتين عبر النقل النشط الثانوي ، حيث يتم توفير الطاقة اللازمة للنقل بواسطة تدرج كيميائي كهربائي . [ 96 ]
تتمثل إحدى الوظائف المقترحة لبروتين SLC46A3، والتي تزداد أهميتها، في النقل المباشر لنواتج أيض المايتانسين من الليزوزوم إلى السيتوبلازم عن طريق الارتباط ببنية الماكروليد للمايتانسين. [ 97 ] ومن بين أنواع الأجسام المضادة المرتبطة بالأدوية (ADCs) المختلفة، تستجيب نواتج أيض الأجسام المضادة المرتبطة بالأدوية ذات الروابط غير القابلة للانفصال والمبنية على المايتانسين، مثل lysine-MCC-DM1، بشكل خاص لنشاط SLC46A3. [ 17 ] يعمل هذا البروتين بشكل مستقل عن الهدف الموجود على سطح الخلية أو نوع الخلية، وبالتالي فمن المرجح أن يتعرف على المايتانسين أو على جزء ضمن هيكله. ومن خلال نشاط النقل عبر الغشاء، ينظم البروتين تركيز نواتج الأيض في الليزوزوم. بالإضافة إلى ذلك، تم تحديد تعبير SLC46A3 كآلية لمقاومة الأجسام المضادة المرتبطة بالأدوية ذات رؤوس المايتانسينويد والبيرولوبنزوديازيبين غير القابلة للانفصال . [ 98 ] على الرغم من فشل تنبؤات التموضع الخلوي الفرعي في تحديد الليزوزوم كوجهة نهائية للبروتين، فقد ثبت أن النمط YXXphi المحدد في تسلسل البروتين يوجه عملية الفرز الليزوزومي. [ 41 ]
قد يشارك البروتين SLC46A3 في نقل الإلكترون عبر غشاء البلازما (PMET)، وهو نظير غشائي لسلسلة نقل الإلكترون في الميتوكوندريا (ETC) التي تؤكسد NADH داخل الخلايا وتساهم في إنتاج الطاقة الهوائية من خلال دعم إنتاج ATP عبر عملية تحلل الجلوكوز . [ 99 ] تحتوي منطقة 3' UTR من SLC46A3 على موقع ارتباط لبروتين ENOX1، وهو بروتين يشارك بشكل كبير في PMET. [ 87 ] [ 100 ] كما يشير النمط C-(X) 2 -C في تسلسل البروتين إلى نشاط مؤكسد-مختزل محتمل. [ 38 ]
البروتينات المتفاعلة
وُجد أن البروتين SLC46A3 يتفاعل عمومًا مع البروتينات المشاركة في نقل المواد عبر الأغشية، والاستجابة المناعية ، والنشاط التحفيزي ، أو أكسدة الركائز. [ 101 ] ومن بين التفاعلات الأكثر تحديدًا وأهمية سريرية، البروتينات التالية.
- CD79A : تم تحديد تفاعل مع CD79A في فحص التفاعل الثنائي للخميرة (Y2H) بدرجة ثقة 0.632 بواسطة شبكة تفاعلات البروتينات الثنائية البشرية (HuRI). [ 102 ] يُعرف أيضًا باسم سلسلة ألفا للبروتين المرتبط بمركب مستقبلات مستضدات الخلايا البائية ، ويشكل CD79A مع CD79B مستقبل مستضدات الخلايا البائية (BCR) من خلال الارتباط التساهمي بالغلوبولين المناعي السطحي (Ig). [ 103 ] يستجيب مستقبل مستضدات الخلايا البائية للمستضدات ويبدأ سلسلة من تفاعلات نقل الإشارة . [ 104 ]
- LGALS3 : كشف تحليل الطيف الكتلي عالي الإنتاجية بتقنية تنقية الألفة (AP-MS) عن تفاعل بين SLC46A3 وLGALS3 بدرجة تفاعل بلغت 0.761، وصُنِّف ضمن البروتينات المتفاعلة عالية الموثوقية (HCIPs) بواسطة برنامج CompPASS-Plus . [ 105 ] يُعرف LGALS3 أيضًا باسم جالاكتين-3 (Gal3)، ويشارك في وظائف خلوية متنوعة تشمل الاستماتة الخلوية ، والمناعة الفطرية ، والتصاق الخلايا ، وتنظيم الخلايا التائية . [ 106 ] يساهم هذا البروتين في النشاط المضاد للميكروبات ضد البكتيريا والفطريات، وقد حُدِّد كمثبط لتحلل حبيبات الخلايا البدينة . يرتفع مستوى LGALS3 بشكل ملحوظ في أنسجة الورم الأرومي الدبقي وفي أدمغة مرضى الزهايمر .
- NSP2: كشف فحصٌ عالي الإنتاجية للبروتينات غير البنيوية لبروتين SARS-CoV ORFeome والبروتينات المضيفة عن تفاعلٍ أحادي بين NSP2 وSLC46A3 بقيمة z-score في برنامج LUMIER تساوي -0.5. [ 16 ] يُعدّ NSP2، اختصارًا للبروتين غير البنيوي 2، أحد البروتينات غير البنيوية العديدة المشفرة في البروتين المتعدد orf1ab. [ 107 ] [ 108 ] يُغيّر NSP2 بيئة الخلية المضيفة بدلًا من المساهمة مباشرةً في تكاثر الفيروس . يتفاعل هذا البروتين مع بروتين البروهيبتين 1 (PHB1) و PHB2 .
الأهمية السريرية
سرطان
تكمن الأهمية السريرية لبروتين SLC46A3 في دوره كناقلٍ لمستقلبات الأجسام المضادة المرتبطة بالأدوية (ADC) القائمة على المايتانسين. [ 97 ] وقد حددت فحوصات shRNA باستخدام مكتبتين بروتين SLC46A3 باعتباره البروتين الوحيد المسؤول عن السمية الخلوية غير القابلة للتحلل والمعتمدة على الأجسام المضادة المرتبطة بالأدوية (ADC) القائمة على المايتانسين ، بقيم q تبلغ 1.18×10⁻⁹ و 9.01×10⁻³ . [ 17 ] وتشير الدراسات إلى فقدان أو انخفاض ملحوظ في تعبير بروتين SLC46A3 (انخفاض بمقدار 2.79 ضعفًا وفقًا لتحليل المصفوفات الدقيقة، بقيمة p تبلغ 5.80×10⁻⁸ ) في خلايا سرطان الثدي المقاومة لـ T-DM1 (حمولة DM1 مرتبطة بالجسم المضاد تراستوزوماب ) (KPL-4 TR). [ 11 ] بالإضافة إلى ذلك، يؤدي تثبيط التعبير الجيني باستخدام siRNA في خط خلايا ورم الثدي البشري BT-474M1 إلى مقاومة T-DM1 أيضًا. ينطبق هذا الارتباط بين فقدان التعبير عن SLC46A3 ومقاومة الأدوية المقترنة بالأجسام المضادة (ADCs) أيضًا على رؤوس بيرولوبنزوديازيبين، مما يدل على الدور المهم لـ SLC46A3 في علاج السرطان. [ 98 ]
يعمل CDP، وهو أحد عوامل النسخ الخاصة بـ SLC46A3، كمثبط للأورام، حيث يؤدي نقص CDP إلى تنشيط مسار إشارات فوسفاتيديل إينوزيتول 3-كيناز (PI3K) مما يؤدي إلى نمو الورم. [ 109 ] كما يرتبط فقدان التغاير الزيجوتي والطفرات في CDP بأنواع مختلفة من السرطانات. [ 110 ]
البروستات
أظهر تحليل المصفوفات الدقيقة لجين SLC46A3 في نوعين مختلفين من خلايا سرطان البروستاتا، LNCaP ( المعتمدة على الأندروجين ) و DU145 (غير المعتمدة على الأندروجين)، أن مستوى تعبير SLC46A3 في DU145 أعلى بخمس مرات تقريبًا من مستواه في LNCaP وفقًا للترتيب المئوي، وأعلى بـ 1.5 مرة وفقًا للقيم المحولة، مما يدل على وجود ارتباط بين SLC46A3 وتسارع نمو خلايا سرطان البروستاتا. [ 12 ] من المحتمل أن يساهم SLC46A3 في تطور السرطان بطريقة غير معتمدة على الأندروجين.
سرطان الخلايا الكبدية (HCC)
أظهرت نتائج تحليل التعبير الجيني لـ SLC46A3 انخفاضًا في التعبير في 83.2% من أنسجة سرطان الخلايا الكبدية البشرية، وذلك استنادًا إلى نتائج تحليل Western blot و qRT-PCR (p < 0.0001). [ 13 ] كما أدى فرط التعبير عن هذا الجين إلى تقليل مقاومة العلاج بالسورافينيب وتحسين معدل البقاء على قيد الحياة (p = 0.00085).
الورم الحليمي والورم الدبقي
أظهر تحليل لطخة ويسترن تعبيرًا قويًا لجين SLC46A3 في خلايا الورم الحليمي والورم الدبقي مقارنةً بتعبيره في الكبد، وهو أحد الأعضاء التي يُعبر فيها عن هذا الجين بأعلى مستوى. [ 14 ]
بدانة
كشفت دراسة ارتباط على مستوى الجينوم حول السمنة عن 10 متغيرات في المنطقة المجاورة 5′UTR لجين SLC46A3، والتي ارتبطت ارتباطًا وثيقًا بنسبة الدهون في النظام الغذائي (كنسبة مئوية من الطاقة) (p = 1.36×10⁻⁶ - 9.57× 10⁻⁶ ). [ 15 ] في الفئران المصابة بالسمنة الناتجة عن النظام الغذائي (DIO)، يُظهر جين SLC46A3 انخفاضًا في التعبير الجيني بعد استنفاد كيناز c-Jun الطرفي N-1 (JNK1)، مما يشير إلى أدوار محتملة في مقاومة الأنسولين ، بالإضافة إلى استتباب الجلوكوز / الدهون الثلاثية . [ 111 ]
فيروس سارس-كوف
يُعد فهم التفاعل بين البروتينين SLC46A3 وNSP2، بالإضافة إلى وظائف كل منهما، أمرًا بالغ الأهمية لفهم آلية إمراضية فيروسات كورونا ، وتحديدًا فيروس سارس-كوف وفيروس سارس-كوف-2 . يقع نطاق البروتين NSP2 في منطقة من إنزيم تضاعف فيروس كورونا غير محفوظة بشكل خاص بين فيروسات كورونا، وبالتالي فإن تغيير تسلسل البروتين يؤدي إلى تغييرات كبيرة في بنيته، مما ينتج عنه تنوع بنيوي ووظيفي. [ 107 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000139508 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000029650 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- 1 2 3 4 5 "SLC46A3" . جين المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) .
- 1 2 "جين SLC46A3" . GeneCards قاعدة بيانات الجينات البشرية .
- 1 2 ناكاي ك، هورتون ب (2007). "التنبؤ الحاسوبي بالموقع داخل الخلية". بروتوكولات استهداف البروتين . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 390. توتوا، نيوجيرسي: مطبعة هومانا. الصفحات 429-466 . doi : 10.1007/1-59745-466-4_29 . ISBN 978-1-58829-702-0.
- 1 2 3 "ناقل المذاب من العائلة 46، العضو 3، النظير أ، السلف [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) بروتين .
- 1 2 "SLC46A3" . OMIM (الوراثة المندلية عبر الإنترنت في الإنسان) .
- 1 2 "MFS" . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) CDD (قاعدة بيانات النطاقات المحفوظة) .
- 1 2 لي جي، غو جي، شين بي كيو، ياداف دي بي، سليوكوفسكي إم إكس، كروكر إل إم، وآخرون . (يوليو 2018). "آليات المقاومة المكتسبة لتراستوزوماب إمتانسين في خلايا سرطان الثدي" . العلاجات الجزيئية للسرطان . 17 (7): 1441-1453 . doi : 10.1158/1535-7163.mct-17-0296 . PMID 29695635 .
- 1 2 كاناوكا ر، كوشياما أ، سينو ي، ناكاتسو ي، ماتسوناغا ي، فوكوشيما ت، وآخرون . (2015-06-03). "يُظهر مثبط Pin1، جوغلون، تأثيرات مضادة للأورام على خلايا LNCaP وDU145 على الرغم من اختلاف أنماط تنظيم الجينات بواسطة Pin1 بين هذين النوعين من الخلايا" . PLOS ONE . 10 (6) e0127467. Bibcode : 2015PLoSO..1027467K . doi : 10.1371/journal.pone.0127467 . PMC 4454534. PMID 26039047 .
- 1 2 تشاو كيو، تشنغ بي، مينغ إس، شو واي، غو جيه، تشن إل جيه، وآخرون (يونيو 2019). "زيادة التعبير عن SLC46A3 لمقاومة تطور سرطان الخلايا الكبدية وتأثيره على علاج سورافينيب" . الطب الحيوي والعلاج الدوائي . 114 108864. doi : 10.1016/j.biopha.2019.108864 . PMID 30981107 .
- 1 2 3 4 "أجسام مضادة متعددة النسائل SLC46A3" . شركة ThermoFisher Scientific .
- 1 2 كوموزي إيه جي، كول إس إيه، لاستون إس إل، فوروجانتي في إس، هاك كيه، جيبس آر إيه، وآخرون . (14-12-2012). " تحديد مواقع جينية جديدة لآلية مرض السمنة لدى الأطفال من أصل إسباني" . PLOS ONE . 7 (12) e51954. Bibcode : 2012PLoSO...751954C . doi : 10.1371/journal.pone.0051954 . PMC 3522587. PMID 23251661 .
- 1 2 بفيفيرلي إس، شوبف جيه، كوجل إم، فريدل سي سي، مولر إم إيه، كارباجو-لوزويا جيه، وآخرون . (أكتوبر 2011). "التفاعل بين مضيف فيروس السارس والفيروس التاجي: تحديد السيكلوفيلين كهدف لمثبطات فيروس كورونا الشامل" . مسببات الأمراض PLOS . 7 (10) هـ1002331. دوى : 10.1371/journal.ppat.1002331 . بمك 3203193 . بميد 22046132 .
- هامبليت كيه جيه ، جاكوب إيه بي، جورجيل جيه إل، توميتسكو إم إي، روك بي إم، باتيل إس كيه، وآخرون (ديسمبر 2015). "يُعدّ البروتين SLC46A3 ضروريًا لنقل نواتج أيض مُقترنات المايتانسين غير القابلة للانقسام من الليزوزوم إلى السيتوبلازم" . أبحاث السرطان . 75 (24): 5329-5340 . doi : 10.1158/0008-5472.can-15-1610 . PMID 26631267 .
- 1 2 3 فاجربيرج إل، هالستروم بي إم، أوكسفولد بي، كامبف سي، ديورينوفيتش دي، أوديبيرج جيه، وآخرون . (فبراير 2014). "تحليل التعبير النسيجي البشري النوعي من خلال التكامل الجينومي الشامل لعلم النسخ وعلم البروتينات القائم على الأجسام المضادة" . علم البروتينات الجزيئي والخلوي . 13 (2): 397-406 . doi : 10.1074/mcp.m113.035600 . PMC 3916642. PMID 24309898 .
- 1 2 3 داف، م. أ.، أولسون، س.، وي، إكس.، غاريت، س. س.، عثمان، أ.، بوليسيتي، م.، وآخرون . (مايو 2015). "تحديد التضفير المتكرر الصفري النيوكليوتيدي على مستوى الجينوم في ذبابة الفاكهة" . مجلة نيتشر . 521 (7552): 376-379 . Bibcode : 2015Natur.521..376D . doi : 10.1038/nature14475 . PMC 4529404. PMID 25970244 .
- ↑ "SLC46A3" . AceView .
- 1 2 3 4 5 "BLAST: أداة البحث الأساسية للمحاذاة المحلية" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) .
- ↑ "عارض التباين (GRCh38)" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) .
- ↑ "SLC46A3" . PAXdb .
- ↑ شين إل إكس، بازيليون جيه بي، ستانتون في بي (يوليو 1999). "يمكن أن تُسبب تعددات النوكليوتيدات المفردة طيات هيكلية مختلفة للرنا المرسال" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 96 (14): 7871-7876 . Bibcode : 1999PNAS...96.7871S . doi : 10.1073/pnas.96.14.7871 . PMC 22154. PMID 10393914 .
- ↑ "متغير النوكليوتيد المفرد المرتبط بالجين (geneID:283537) عبر شرح التسلسل المتصل" . قاعدة بيانات dbSNP التابعة للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) - المتغيرات الجينية القصيرة .
- 1 2 3 "SLC46A3" . جينوماتيكس: إلدورادو . مؤرشف من الأصل بتاريخ 26-08-2021 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 01-08-2020 .
- ↑ برويت ك، براون ج، تاتوسوفا ت، ماغلوت د (2012-04-06). قاعدة بيانات التسلسل المرجعي (RefSeq) . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (الولايات المتحدة).
- 1 2 "الناقل المذاب من عائلة 46 للبشرية، العضو 3 (SLC46A3)، النسخة المتغيرة 1، mRNA" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). نيوكليوتيد . 14 ديسمبر 2020.
- ↑ "الناقل المذاب من عائلة 46 العضو 3 (SLC46A3) للإنسان العاقل، النسخة المتغيرة 2، mRNA" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). نيوكليوتيد . 13 ديسمبر 2020.
- ↑ "الناقل المذاب من عائلة 46 العضو 3 (SLC46A3) للإنسان العاقل، النسخة المتغيرة 3، mRNA" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). نيوكليوتيد . 2 يوليو 2020.
- ↑ «متوقع: ناقل المذاب من عائلة 46 العضو 3 (SLC46A3) للإنسان العاقل، النسخة المتغيرة X1، mRNA» . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). النيوكليوتيدات . 16 مايو 2021.
- 1 2 3 "ناقل المذاب من العائلة 46، العضو 3، النظير أ، السلف [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) بروتين .
- 1 2 "ناقل المذاب من العائلة 46، العضو 3، النظير ب، السلف [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) بروتين .
- 1 2 "ناقل المذاب من العائلة 46، العضو 3، النظير X1 [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) بروتين .
- 1 2 3 4 5 بريندل ف، بوخر ب، نوربخش إي آر، بليسديل بي إي، كارلين س (مارس 1992). "طرق وخوارزميات التحليل الإحصائي لتسلسلات البروتين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 89 (6): 2002-2006 . Bibcode : 1992PNAS...89.2002B . doi : 10.1073 / pnas.89.6.2002 . PMC 48584. PMID 1549558 .
- ↑ غاستايغر إي، هوغلاند سي، غاتيكر إيه، دوفود إس، ويلكنز إم آر، أبيل آر دي، وآخرون . (2005). "أدوات تحديد وتحليل البروتينات على خادم ExPASy". دليل بروتوكولات علم البروتينات . توتوا، نيوجيرسي: دار هومانا للنشر. الصفحات 571-607 . doi : 10.1385/1-59259-890-0:571 . ISBN 978-1-58829-343-5.
- ↑ ألبرتس ب، جونسون أ، لويس ج، راف م، روبرتس ك، والتر ب (2002). "بروتينات الغشاء". البيولوجيا الجزيئية للخلية ( الطبعة الرابعة). جارلاند ساينس.
- 1 2 ميسيتا أ، تشوتورا ب (أغسطس 2000). "العلاقة بين وجود السيستين في البروتينات وتعقيد الكائنات الحية" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 17 (8): 1232-1239 . doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026406 . PMID 10908643 .
- 1 2 كومار م، جو م، مايكل س، سامانو-سانشيز هـ، بانكسا ر، جلافينا ج، وآخرون . (يناير 2020). "ELM - مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة في عام 2020" . أبحاث الأحماض النووية . 48 (D1) gkz1030: D296– D306. doi : 10.1093 / nar/gkz1030 . PMC 7145657. PMID 31680160 .
- ↑ "TRG_ENDOCYTIC_2" . ELM (مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة للمواقع الوظيفية في البروتينات) .
- 1 2 Pandey KN (أكتوبر 2010). "تسلسل التعرف على الببتيدات الصغيرة للفرز داخل الخلايا" . Current Opinion in Biotechnology . 21 (5): 611–620 . doi : 10.1016/j.copbio.2010.08.007 . PMC 2997389. PMID 20817434 .
- ↑ "LIG_SH2_STAP1" . ELM (مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة للمواقع الوظيفية في البروتينات) .
- ↑ إيزنبرغ د، وايس ر.م، تيرويليجر ت.س (يناير 1984). "العزم الكاره للماء يكشف عن دورية في كراهية الماء للبروتين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 81 (1): 140-144 . Bibcode : 1984PNAS...81..140E . doi : 10.1073/pnas.81.1.140 . PMC 344626. PMID 6582470 .
- ↑ زيمرمان إل، ستيفنز أ، نام إس زد، راو د، كوبلر ج، لوزاجيتش م، وآخرون . (يوليو 2018) . "مجموعة أدوات MPI Bioinformatics مُعاد تنفيذها بالكامل مع خادم HHpred جديد في جوهرها". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 430 (15): 2237-2243 . doi : 10.1016/j.jmb.2017.12.007 . PMID 29258817. S2CID 22415932 .
- ↑ ريثماير، ر. أ. (1996). "تجميع البروتينات في الأغشية". كيمياء حيوية الدهون والبروتينات الدهنية والأغشية . الكيمياء الحيوية الشاملة الجديدة. المجلد 31. إلسيفير. الصفحات 425-471 . doi : 10.1016/s0167-7306(08)60523-2 . ISBN 978-0-444-82359-5.
- ↑ بيغين، بي سي، وسانسوم، إم إس (فبراير 1999). "تفاعلات الحلزونات ألفا مع طبقات الدهون الثنائية: مراجعة لدراسات المحاكاة". الكيمياء الفيزيائية الحيوية . 76 (3): 161-183 . doi : 10.1016/s0301-4622(98)00233-6 . PMID 10074693 .
- ↑ أوماسيتس يو، أهرنز سي إتش، مولر إس، وولشيد بي (مارس 2014). "بروتر: عرض تفاعلي لخصائص البروتين ودمجها مع بيانات البروتينات التجريبية" . المعلوماتية الحيوية . 30 (6): 884-886 . doi : 10.1093/bioinformatics/btt607 . hdl : 20.500.11850/82692 . PMID 24162465 .
- ↑ "Q7Z3Q1 (S46A3_HUMAN)" . UniProt .
- ↑ فانديفير، إل إي، أندرسون، إس جيه، فولي، إس دبليو، غريغوري، بي دي (أبريل 2016). "حفظ ووظيفة البنية الثانوية للحمض النووي الريبي في النباتات" . المراجعة السنوية لبيولوجيا النبات . 67 (1): 463-488 . Bibcode : 2016AnRPB..67..463V . doi : 10.1146/annurev-arplant- 043015-111754 . PMC 5125251. PMID 26865341 .
- ↑ التحكم في استقرار الحمض النووي الريبوزي الرسول . 1993. doi : 10.1016/c2009-0-03269-3 . ISBN 978-0-12-084782-2.
- ↑ زوكر م (يوليو 2003). " خادم ويب Mfold للتنبؤ بطي الأحماض النووية وتهجينها" . أبحاث الأحماض النووية . 31 (13): 3406-3415 . doi : 10.1093/nar/gkg595 . PMC 169194. PMID 12824337 .
- ↑ يانغ جيه، تشانغ واي (يوليو 2015). "خادم I-TASSER: تطوير جديد للتنبؤ ببنية البروتين ووظيفته" . أبحاث الأحماض النووية . 43 (W1): W174– W181 . doi : 10.1093/nar/gkv342 . PMC 4489253. PMID 25883148 .
- ↑ Zhang Y, Skolnick J (2005-04-11). "TM-align: خوارزمية لمحاذاة بنية البروتين تعتمد على درجة TM" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 33 (7): 2302-2309 . doi : 10.1093/nar/gki524 . PMC 1084323. PMID 15849316 .
- 1 2 "نتائج I-TASSER" . مختبر تشانغ .
- ↑ تشانغ سي، فريدولينو إل، تشانغ واي (يوليو 2017). "COFACTOR: تحسين التنبؤ بوظيفة البروتين من خلال دمج معلومات البنية والتسلسل وتفاعل البروتين-البروتين" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (W1): W291– W299 . doi : 10.1093/nar/gkx366 . PMC 5793808. PMID 28472402 .
- ↑ يانغ جيه، روي إيه، تشانغ واي (أكتوبر 2013). "التعرف على موقع ارتباط البروتين بالرابط باستخدام مقارنة البنية الفرعية التكميلية الخاصة بالارتباط ومحاذاة ملف تعريف التسلسل" . المعلوماتية الحيوية . 29 (20): 2588-2595 . doi : 10.1093/bioinformatics/btt447 . PMC 3789548. PMID 23975762 .
- ↑ لاتشمان، د. س. (2004). "طرق دراسة عوامل النسخ". عوامل النسخ حقيقية النواة . المجلة البيوكيميائية. المجلد 270. إلسيفير. الصفحات 281-289 . doi : 10.1016/b978-012437178-1/50008-4 . ISBN 978-0-12-437178-1. PMC 1131717 . PMID 2119171 .
- 1 2 3 "مواقع ارتباط عامل النسخ SLC46A3" . Genomatix: MatInspector .
- ↑ ميلر دي إم، توماس إس دي، إسلام إيه، مونش دي، سيدوريس كيه (أكتوبر 2012). "سي-مايك واستقلاب السرطان" . أبحاث السرطان السريرية . 18 (20): 5546-5553 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-12-0977 . PMC 3505847. PMID 23071356 .
- ↑ إليس تي، غامبارديلا إل، هورتشر إم، تشانز إس، كابول جيه، بيرترام بي، وآخرون (سبتمبر 2001). "المثبط النسخي CDP (Cutl1) ضروري لتكوين الخلايا الظهارية في الرئة وبصيلات الشعر" . الجينات والتطور . 15 (17): 2307-2319 . doi : 10.1101/gad.200101 . PMC 312776. PMID 11544187 .
- ↑ وانغ جي زد، تشانغ دبليو، فانغ زد تي، تشانغ دبليو، يانغ إم جي، يانغ جي دبليو، وآخرون . (يوليو 2014). " أكسيد الزرنيخ الثلاثي: كبح ملحوظ لقدرة الورم على الانتشار عن طريق تثبيط عامل النسخ تويست في الجسم الحي وفي المختبر" . مجلة أبحاث السرطان وعلم الأورام السريري . 140 (7): 1125-1136 . doi : 10.1007/s00432-014-1659-6 . PMC 11823520. PMID 24756364. S2CID 6332740 .
- ↑ "مخطط النسخ الجيني لـ Illumina bodyMap2" . مشروع NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) .
- ↑ سزابو إل، موري آر، بالبانت إن جيه، وانغ بي إل، أفاري إن، جيانغ سي، وآخرون . (ديسمبر 2016). " تصحيح لـ: الكشف عن التضفير القائم على الإحصاء يكشف عن إثراء عصبي وتحفيز خاص بالأنسجة للحمض النووي الريبي الدائري أثناء نمو الجنين البشري" . علم الأحياء الجينومي . 17 (1) 263. doi : 10.1186/s13059-016-1123-9 . PMC 5165717. PMID 27993159 .
- ↑ سو إيه آي، ويلتشير تي، باتالوف إس، لاب إتش، تشينغ كيه إيه، بلوك دي، وآخرون . (أبريل 2004). "أطلس جيني لنسخ البروتينات المشفرة في الفأر والإنسان" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 (16): 6062-6067 . Bibcode : 2004PNAS..101.6062S . doi : 10.1073 / pnas.0400782101 . PMC 395923. PMID 15075390 .
- ↑ "SLC46A3" . GenePaint .
- ↑ "SLC46A3 (دماغ الفأر)" . أطلس ألين للدماغ .
- ↑ "Slc46a3 ISH: Mus musculus, Male, P4, variable" . Allen Brain Atlas .
- ↑ "Slc46a3 ISH: Mus musculus, Male, P56, variable" . Allen Brain Atlas .
- ↑ "الخلية: مدخل جزيئي. الطبعة السادسة. بقلم جيفري إم. كوبر وروبرت إي. هاوسمان. سندرلاند (ماساتشوستس): سيناور أسوشيتس. 142.95 دولارًا أمريكيًا. 25 + 832 صفحة؛ رسوم توضيحية؛ فهرس. [موقع إلكتروني مصاحب متاح.] 2013". المجلة الفصلية لعلم الأحياء . 89 (4): 399. 2014. doi : 10.1086/678645 . ISBN 978-0-87893-964-0ISSN 0033-5770
- ↑ ألماجرو أرمينتيروس جيه جيه، تسيريجوس دينار كويتي، سونديربي سي كيه، بيترسن تينيسي، وينثر أو، بروناك إس، وآخرون . (أبريل 2019). “يعمل SignalP 5.0 على تحسين تنبؤات الببتيد للإشارة باستخدام الشبكات العصبية العميقة”. التكنولوجيا الحيوية الطبيعية . 37 (4): 420-423 . دوى : 10.1038 / s41587-019-0036-z . بميد 30778233 . S2CID 216678118 .
- ↑ كال إل، كروغ أ، سونهمر إي إل (مايو 2004). "طريقة مشتركة للتنبؤ ببنية الغشاء العابر وببتيد الإشارة". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 338 (5): 1027-1036 . doi : 10.1016/j.jmb.2004.03.016 . PMID 15111065 .
- ↑ جولينوس ك، جوهانسن إم بي، تشانغ واي، بروناك إس، غوبتا آر (2009). "التنبؤ بمواقع الغلكزة في البروتينات". المعلوماتية الحيوية لعلم الأحياء السكرية وعلم الجينوم السكري . تشيتشستر، المملكة المتحدة: جون وايلي وأولاده المحدودة. ص 163-192 . doi : 10.1002/9780470029619.ch9 . ISBN 978-0-470-02961-9.
- ↑ ستينتوفت سي، فاخروشيف إس واي، جوشي إتش جيه، كونغ واي، فيستر-كريستنسن إم بي، شولدجر كيه تي، وآخرون . (مايو 2013). " رسم خرائط دقيقة لبروتينات O-GalNAc السكرية البشرية باستخدام تقنية SimpleCell" . مجلة EMBO . 32 (10): 1478-1488 . doi : 10.1038/emboj.2013.79 . PMC 3655468. PMID 23584533 .
- ↑ فاركي أ، كامينغز آر دي، إسكو جيه إس، ستانلي ب (2017). أساسيات علم الأحياء السكرية ( الطبعة الثالثة). كولد سبرينغ هاربور، نيويورك: مطبعة مختبر كولد سبرينغ هاربور. ISBN 978-1-62182-132-8. OCLC 960166742 .
- ↑ غوبتا ر، بروناك س (2001). "التنبؤ بالغليكوزيل عبر البروتينوم البشري وعلاقته بوظيفة البروتين". ندوة المحيط الهادئ حول الحوسبة الحيوية. ندوة المحيط الهادئ حول الحوسبة الحيوية . وورلد ساينتيفيك: 310-322 . doi : 10.1142/9789812799623_0029 . ISBN 978-981-02-4777-5PMID 11928486
- ↑ فيسي، ف.، ميسيتا، أ.، ناجي، ت. (2017). "دور تعديل بروتين O-GlcNAc الناتج عن الإجهاد في تنظيم نقل الغشاء" . الطب التأكسدي وطول عمر الخلية . 2017 1308692. doi : 10.1155/2017/1308692 . PMC 5804373. PMID 29456783 .
- ↑ وانغ سي، شو إتش، لين إس، دينغ دبليو، تشو جيه، تشانغ واي، وآخرون . (فبراير 2020). "GPS 5.0: تحديث حول التنبؤ بمواقع الفسفرة الخاصة بالكيناز في البروتينات" . علم الجينوم، علم البروتينات والمعلوماتية الحيوية . 18 (1): 72-80 . doi : 10.1016/j.gpb.2020.01.001 . PMC 7393560. PMID 32200042 .
- ↑ بلوم ن، غاميلتوفت س، بروناك س (ديسمبر 1999). "التنبؤ بمواقع فسفرة البروتينات حقيقية النواة بناءً على التسلسل والبنية". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 294 (5): 1351-1362 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3310 . PMID 10600390 .
- ↑ بلوم ن، سيشيريتز-بونتين ت، غوبتا ر، غاميلتوفت س، بروناك س (يونيو 2004). " التنبؤ بالغلكزة والفسفرة بعد الترجمة للبروتينات من تسلسل الأحماض الأمينية". بروتيوميكس . 4 (6): 1633-1649 . doi : 10.1002/pmic.200300771 . PMID 15174133. S2CID 18810164 .
- ↑ جوهانسن إم بي، كيمر إل، بروناك إس (سبتمبر 2006). "تحليل وتوقع غلكزة البروتينات في الثدييات" . علم الأحياء السكرية . 16 (9): 844-853 . doi : 10.1093/glycob/cwl009 . PMID 16762979 .
- ↑ تشين جيه إتش، لين إكس، بو سي، تشانغ إكس (10 أكتوبر 2018). "دور نواتج الغلكزة المتقدمة في الحركة واعتبارات في استراتيجيات التدخل الغذائي والتغذوي المحتملة" . التغذية والأيض . 15 (1) 72. doi : 10.1186/s12986-018-0306-7 . PMC 6180645. PMID 30337945 .
- ↑ شي واي، تشنغ واي، لي إتش، لوه إكس، هي زد، كاو إس، وآخرون (يونيو 2016). " GPS-Lipid: أداة فعّالة للتنبؤ بمواقع تعديل الدهون المتعددة" . التقارير العلمية . 6 (1) 28249. Bibcode : 2016NatSR...628249X . doi : 10.1038/srep28249 . PMC 4910163. PMID 27306108 .
- ^ إيكارت راموس سي، فاليرو آر إيه، رودريجيز كريسبو الأول (ديسمبر 2011). "بروتين النخيل والاتجار تحت الخلوي" . الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية اكتا (BBA) - الأغشية الحيوية . 1808 (12): 2981–2994 . دوى : 10.1016/j.bbamem.2011.07.009 . بميد 21819967 .
- ↑ رين جيه، وين إل، غاو إكس، جين سي، شيو واي، ياو إكس (نوفمبر 2008). "CSS-Palm 2.0: برنامج مُحدَّث للتنبؤ بمواقع البالميتويل" . هندسة البروتين، التصميم والاختيار . 21 (11): 639-644 . doi : 10.1093/protein/gzn039 . PMC 2569006. PMID 18753194 .
- ↑ غوان إكس، فيرك سي إيه (ديسمبر 2011). " فهم بلمرة البروتين: الأهمية البيولوجية وعلم الإنزيمات" . مجلة ساينس تشاينا للكيمياء . 54 (12): 1888-1897 . doi : 10.1007/s11426-011-4428-2 . PMC 4240533. PMID 25419213 .
- ↑ برينغار إيه إي، كوبر تي إيه (سبتمبر 2016). "أدوار البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي في النمو والمرض" . أبحاث الدماغ . 1647 : 1-8 . doi : 10.1016/j.brainres.2016.02.050 . PMC 5003702. PMID 26972534 .
- باز ، إي . ، كوستي، إي.، آريس، إم.، كلاين، إم.، ماندل-غوتفروند، واي. (يوليو 2014). "RBPmap: خادم ويب لرسم خرائط مواقع ارتباط البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 42 (عدد خوادم الويب): W361– W367. doi : 10.1093/nar/gku406 . PMC 4086114. PMID 24829458 .
- ↑ ماكفارلين إل إيه، مورفي بي آر (نوفمبر 2010). " الميكرو آر إن إيه: التكوين الحيوي، والوظيفة، والدور في السرطان" . علم الجينوم الحالي . 11 (7): 537-561 . doi : 10.2174/138920210793175895 . PMC 3048316. PMID 21532838 .
- ↑ تشين ي، وانغ إكس (يناير 2020). "miRDB: قاعدة بيانات إلكترونية للتنبؤ بأهداف microRNA الوظيفية" . أبحاث الأحماض النووية . 48 (D1): D127– D131 . doi : 10.1093/nar/gkz757 . PMC 6943051. PMID 31504780 .
- ↑ "SLC46A3" . miRDB .
- ↑ "SLC46A1" . جين المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) .
- ↑ "SLC46A2" . جين المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCIB) .
- ↑ كوردوفا إيه إف، ريتشي سي، بونرت في، لي إل (يونيو 2021). "يُعدّ SLC46A2 البشري المُستورد الرئيسي لـ cGAMP في الخلايا البلعمية الكبيرة والخلايا الوحيدة المُستشعرة لـ cGAMP خارج الخلية" . مجلة ACS Central Science . 7 (6): 1073-1088 . doi : 10.1021/acscentsci.1c00440 . PMC 8228594. PMID 34235268 .
- 1 2 3 نيدلمان إس بي، وونش سي دي (مارس 1970). "طريقة عامة قابلة للتطبيق للبحث عن أوجه التشابه في تسلسل الأحماض الأمينية لبروتينين". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 48 (3): 443-453 . doi : 10.1016/0022-2836(70)90057-4 . PMID 5420325 .
- ↑ كومار إس، ستيتشر جي، سوليسكي إم، هيدجز إس بي (يوليو 2017). "تايم تري: مورد للجداول الزمنية، وأشجار الزمن، وأوقات التباعد" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 34 (7): 1812-1819 . doi : 10.1093/molbev/msx116 . PMID 28387841 .
- ↑ باو إس إس، بولسن آي تي، ساير إم إتش (مارس 1998). " عائلة البروتينات الميسرة الرئيسية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 62 (1): 1-34 . doi : 10.1128/mmbr.62.1.1-34.1998 . PMC 98904. PMID 9529885 .
- 1 2 بيسا ب، بيدل أ.م، جوفينداراجان ر (نوفمبر 2016). " ناقلات المذاب الليزوزومية تكتسب زخمًا في البحث" . علم الأدوية السريرية والعلاجات . 100 (5): 431-436 . doi : 10.1002/cpt.450 . PMC 5056150. PMID 27530302 .
- 1 2 كينير ك، ميكين ج، تيبيرغين أ.س، تاي ي.ت، فيبس س، كيفر س.م، وآخرون . (ديسمبر 2018). "SLC46A3 كعلامة حيوية تنبؤية محتملة للأجسام المضادة المقترنة بالأدوية التي تحمل رؤوسًا حربية غير قابلة للانفصال من المايتانسينويد والبيرولوبنزوديازيبين" . أبحاث السرطان السريرية . 24 (24): 6570-6582 . doi : 10.1158/1078-0432.ccr-18-1300 . PMID 30131388 .
- ↑ هيرست، بي. إم.، وبيريدج، إم. في. (ديسمبر 2006). "نقل الإلكترون عبر غشاء البلازما: هدف جديد لتطوير أدوية السرطان". الطب الجزيئي الحالي . 6 (8): 895-904 . doi : 10.2174/156652406779010777 . PMID 17168740 .
- ↑ "ENOX1 ecto-NOX مبادل ثنائي الكبريتيد-ثيول 1 [ الإنسان العاقل (Homo sapiens) ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) جين .
- ↑ رحمن، م. س.، هوك، م. ن.، إسلام، م. ر.، أختر، س.، روبايت العالم، أ. س.، صديق، م. أ.، وآخرون . (2020). "تصميم لقاح ببتيدي هجين قائم على الإبيتوب ضد بروتينات S وM و E لفيروس SARS-CoV-2، المسبب لجائحة كوفيد-19: نهج حاسوبي" . PeerJ . 8 e9572. doi : 10.7717/peerj.9572 . PMC 7394063. PMID 33194329 .
- ↑ لاك ك، كيم د.ك، لامبورن ل، سبيرون ك، بيج ب.إ، بيان و، وآخرون . (أبريل 2020). "خريطة مرجعية لتفاعلات البروتينات الثنائية البشرية" . نيتشر . 580 (7803): 402-408 . Bibcode : 2020Natur.580..402L . doi : 10.1038/s41586-020-2188- x . PMC 7169983. PMID 32296183 .
- ↑ "جزيء CD79A [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) جين .
- ↑ "P11912 (CD79A_HUMAN)" . UniProt .
- ↑ هوتلين إي إل، تينغ إل، بروكنر آر جيه، جبرياب إف، غيغي إم بي، سزبيت جيه، وآخرون . (يوليو 2015). " شبكة بيوبليكس: استكشاف منهجي للتفاعلات البشرية" . مجلة سيل . 162 (2): 425-440 . doi : 10.1016/j.cell.2015.06.043 . PMC 4617211. PMID 26186194 .
- ↑ "LGALS3 جالاكتين 3 [ الإنسان العاقل ] " . NCBI (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية) جين .
- 1 2 غراهام آر إل، سيمز إيه سي، باريك آر إس، دينيسون إم آر (2006). "بروتينات NSP2 لفيروس التهاب الكبد الفأري وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الالتهاب الرئوي الحاد غير ضرورية لتكاثر الفيروس". فيروسات نيدو . التقدم في الطب التجريبي وعلم الأحياء. المجلد 581. بوسطن، ماساتشوستس: سبرينغر الولايات المتحدة. الصفحات 67-72 . doi : 10.1007/978-0-387-33012-9_10 . ISBN 978-0-387-26202-4. PMC 7123188 . PMID 17037506 .
- ^ خونتي إس، خونتي إن، سيدو إس، خونتي ك (أكتوبر 2020). "الشكوك العلاجية لدى الأشخاص الذين يعانون من أمراض القلب والأوعية الدموية ومتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة التاجية 2 (SARS-CoV-2 أو COVID-19)" . مرض السكري والسمنة والتمثيل الغذائي . 22 (10): 1942-1945 . دوى : 10.1111/dom.14062 . بمك 7264611 . بميد 32319200 . S2CID 219115750 .
- ↑ وونغ سي سي، مارتينكورينا آي، راست إيه جي، رشيد إم، أليفرانجيس سي، ألكسندروف إل بي، وآخرون . (يناير 2014). " طفرات تعطيل جين CUX1 تعزز تكوّن الأورام" . مجلة نيتشر جينيتكس . 46 (1): 33-38 . doi : 10.1038/ng.2846 . PMC 3874239. PMID 24316979 .
- ↑ ليو ن، صن كيو، وان إل، وانغ إكس، فينغ واي، لو جيه، وآخرون . (29 مايو 2020). "CUX1، عامل مثير للجدل في تطور الأورام" . فرونتيرز إن أونكولوجي . 10738. doi : 10.3389 /fonc.2020.00738 . PMC 7272708. PMID 32547943 .
- ↑ يانغ ر، ويلكوكس د.م، هاش د.ل، جونغ ب.م، نغوين ب.ت، فورباخ م.ج، وآخرون . (أغسطس 2007). "يؤدي تثبيط JNK1 في الكبد إلى زيادة تنظيم المُنشِّط المُشارك لمستقبلات جاما المنشطة بالبروفايلر 1 بيتا، ويرفع مستوى الدهون الثلاثية في البلازما على الرغم من انخفاض مستويات الجلوكوز والأنسولين في الفئران البدينة نتيجة النظام الغذائي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 282 (31): 22765-22774 . doi : 10.1074/jbc.m700790200 . PMID 17550900 .
للمزيد من القراءة
- تشالاساني ن، غو إكس، لومبا ر، غودارزي إم أو، هاريتونيانز ت، كوون إس، وآخرون . (نوفمبر 2010). " دراسة ارتباط على مستوى الجينوم تحدد متغيرات مرتبطة بالخصائص النسيجية لمرض الكبد الدهني غير الكحولي" . مجلة أمراض الجهاز الهضمي . 139 (5): 1567-1576 ، 1576.e1-1576. doi : 10.1053/j.gastro.2010.07.057 . PMC 2967576. PMID 20708005 .
- ما ي، تشي إكس، دو جيه، سونغ إس، فينغ دي، تشي جيه، وآخرون . (مارس 2009). "تحديد الجينات المرشحة لتطور الغدة النخامية البشرية عن طريق تحليل تسلسل الحمض النووي التكميلي (EST)" . بي إم سي جينوميكس . 10 109. doi : 10.1186/1471-2164-10-109 . PMC 2664823. PMID 19284880 .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 13
- البروتينات البشرية
