الحرب الفلبينية الأمريكية

كان أندريس بونيفاسيو عامل مستودع وكاتبًا من مانيلا . في 7 يوليو 1892، أسس منظمة كاتيبونان ، وهي منظمة ثورية شُكّلت لنيل الاستقلال عن الحكم الاستعماري الإسباني عبر ثورة مسلحة. في أغسطس 1896، اكتشفت السلطات الإسبانية منظمة كاتيبونان، مما أدى إلى اندلاع ثورتها. حقق المقاتلون في مقاطعة كافيت انتصارات مبكرة. كان إميليو أغينالدو ، عمدة كافيت إل فييخو (كاويت حاليًا)، أحد أبرز قادة كافيت وأكثرهم شعبية ، حيث سيطر على جزء كبير من شرق مقاطعة كافيت. في نهاية المطاف، سيطر أغينالدو وفصيله على زمام الثورة. بعد انتخاب أغينالدو رئيسًا لحكومة ثورية حلت محل كاتيبونان في مؤتمر تيخيروس في 22 مارس 1897، أعدمت حكومته بونيفاسيو بتهمة الخيانة العظمى بعد محاكمة صورية في 10 مايو 1897. ^{[ 30 ]}

بحلول أواخر عام ١٨٩٧، وبعد سلسلة من الهزائم التي مُنيت بها القوات الثورية، استعاد الإسبان السيطرة على معظم أراضي المتمردين. دخل أغينالدو والحاكم العام الإسباني فرناندو بريمو دي ريفيرا في مفاوضات هدنة بينما كانت القوات الإسبانية تُحاصر مخبأ أغينالدو وقاعدته في بياك نا باتو بمقاطعة بولاكان . في ١٤ ديسمبر ١٨٩٧، تم التوصل إلى اتفاق يقضي بأن تدفع الحكومة الاستعمارية الإسبانية لأغينالدو ٨٠٠ ألف بيزو مكسيكي ^{على ثلاث} دفعات إذا ما نُفي أغينالدو ^خارج الفلبين . ^{[ ٣٢ ] [ ٣٣ ]}

غادر أغينالدو و25 من أقرب معاونيه مقرهم في بياك نا باتو وتوجهوا إلى هونغ كونغ ، وفقًا للاتفاق. قبل مغادرته، ندد أغينالدو علنًا بالثورة وحثّ المقاتلين المتمردين على نزع سلاحهم، ووصف من استمروا في الأعمال العدائية باللصوص. ^{[ 34 ]} إلا أن أغينالدو كان يخطط سرًا لاستخدام أموال الهدنة لتمويل إعادة إحياء الثورة، وواصل بعض الثوار المقاومة المسلحة ضد الحكومة الاستعمارية الإسبانية. ^{[ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ]}

في 22 أبريل 1898، التقى أغينالدو المنفي سرًا في سنغافورة مع القنصل الأمريكي إي. سبنسر برات . لاحقًا، وُبِّخ برات بشدة للقاء أغينالدو، وقيل له: "كان تصرفك غير مصرح به ولا يمكن الموافقة عليه" ^{[ 39 ]} . لكن اللقاء أقنع أغينالدو بالعودة إلى الفلبين واستعادة قيادة الثورة. ^{[ 40 ]} وقدّم كلٌّ من أغينالدو وبرات روايتين متناقضتين عن اللقاء. ^{[ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] [ 45 ]}

عاد أغينالدو إلى هونغ كونغ، ونقله الأمريكيون إلى كافيت، حيث وصل في 19 مايو، إيذانًا باستئناف الثورة وبدء سلسلة من الانتصارات التي دفعته إلى إصدار إعلان استقلال الفلبين . ^{[ 46 ] [ 47 ]} حُكمت الثورة بحكومة ديكتاتورية ، ولكن بعد شهر تقريبًا، استُبدلت هذه الديكتاتورية المؤقتة بحكومة ثورية عيّنت أغينالدو رئيسًا. وبعد أقل من ثلاثة أشهر من عودته، حرّر الجيش الثوري الفلبيني جميع جزر الفلبين تقريبًا، وأقام حكومة مدنية عليها، باستثناء مانيلا التي كانت محاصرة بقوات ثورية قوامها نحو 12 ألف مقاتل. ^{[ 48 ]}

في أواخر عام ١٨٩٨، قام مؤتمر مالولوس ، الذي تأسس بموجب النظام الأساسي للحكومة الثورية، بصياغة دستور أدى إصداره إلى التأسيس الرسمي لجمهورية الفلبين في أواخر يناير ١٨٩٩. ^{[ ٤٩ ]} عُرفت هذه الدولة لاحقًا باسم جمهورية الفلبين الأولى، وأيضًا باسم جمهورية مالولوس نسبةً إلى عاصمتها . أُعلن أغينالدو رئيسًا وفقًا للدستور، ^{[ ٥٠ ]} واعتبرته الحكومة الفلبينية رسميًا أول رئيس للفلبين . ^{[ ٥١ ]}

لم تعترف الولايات المتحدة ولا إسبانيا بإعلان استقلال الفلبين. ورغم الخسائر التي مُنيت بها القوات الثورية، افترضت إسبانيا سيادتها على الفلبين وتنازلت عنها للولايات المتحدة مقابل تعويض عن النفقات والأصول الإسبانية المفقودة ^{[ 52 ]} بموجب معاهدة باريس لعام 1898 ، الموقعة في 10 ديسمبر 1898، والتي أنهت الحرب الإسبانية الأمريكية . سعت الحكومة الثورية إلى تمثيل فلبيني، لكن تم استبعاد أي تمثيل فلبيني من المفاوضات. ^{[ 53 ]}

في يوليو/تموز 1898، وبعد ثلاثة أشهر من اندلاع الحرب الإسبانية الأمريكية، بدأت القيادة الأمريكية تشك في أن أغينالدو كان يتفاوض سرًا مع السلطات الإسبانية للسيطرة على مانيلا دون مساعدة أمريكية، ^{[ 54 ]} وأفادت بأن زعيم المتمردين كان يقيد وصول الإمدادات إلى القوات الأمريكية. ^{[ 55 ]} وقدّر الجنرال توماس إم. أندرسون أن مانيلا الخاضعة لسيطرة المتمردين ستكون قادرة على مقاومة أي محاولة أمريكية لتشكيل حكومة مؤقتة. ^{[ 54 ]} وتجاهل الجنرال ويسلي ميريت تحذير أغينالدو بعدم إنزال القوات الأمريكية في الأماكن التي حررها الفلبينيون دون إبلاغه كتابيًا مسبقًا بمواقع وأهداف هذه العمليات. ^{[ 56 ]} وبدأ القادة الأمريكيون يشكون في أن قوات المتمردين الفلبينية كانت تُبلغ القوات الإسبانية بتحركات القوات الأمريكية. ^{[ 57 ]}

تفاوض القادة الأمريكيون والإسبان على اتفاق سري لإجراء معركة وهمية في مانيلا، على أن تستسلم القوات الإسبانية بعدها للقوات الأمريكية. ولن يُسمح للقوات الفلبينية بدخول المدينة. وكادت الاشتباكات أن تندلع بين القوات الأمريكية والفلبينية عندما تحركت الأولى لإخراج الثانية من مواقعها الاستراتيجية حول مانيلا. عشية المعركة الوهمية، أرسل أندرسون برقية إلى أغينالدو يقول فيها: "لا تدع قواتك تدخل مانيلا دون إذن القائد الأمريكي. ستكون تحت نيران العدو على هذا الجانب من نهر باسيج ." ^{[ 58 ]} في 13 أغسطس، سيطرت القوات الأمريكية على مانيلا. ^{[ 59 ]} واستمرت العلاقات بين الولايات المتحدة والمتمردين الفلبينيين في التدهور. ^{[ 60 ]}

في 12 أغسطس/آب 1898، ذكرت صحيفة نيويورك تايمز أنه تم توقيع بروتوكول سلام في واشنطن بعد ظهر ذلك اليوم بين الولايات المتحدة وإسبانيا، يقضي بتعليق الأعمال العدائية. ^{[ 61 ]} لم يُنشر النص الكامل للبروتوكول إلا في 5 نوفمبر/تشرين الثاني، ولكن المادة الثالثة نصت على ما يلي: "ستحتل الولايات المتحدة مدينة مانيلا وخليجها ومينائها، وستحتفظ بها، ريثما يتم إبرام معاهدة سلام تحدد السيطرة على الفلبين وتصرفاتها وحكومتها." ^{[ 62 ] [ 63 ]} بعد إبرام هذا الاتفاق، أعلن الرئيس الأمريكي ويليام ماكينلي تعليق الأعمال العدائية مع إسبانيا. ^{[ 64 ]}

في اشتباكٍ وقع في كافيت بين جنود أمريكيين ومتمردين في 25 أغسطس/آب 1898، قُتل جورج هدسون من فوج يوتا، وأُصيب العريف ويليام أندرسون بجروحٍ قاتلة، وأُصيب أربعة جنود من سلاح الفرسان الرابع بجروحٍ طفيفة. ^{[ 66 ] [ 67 ]} دفع هذا الجنرال أندرسون إلى إرسال رسالة إلى أغينالدو يقول فيها: "لتجنب كارثةٍ خطيرةٍ تتمثل في مواجهةٍ بين قواتنا، أطالبكم بالانسحاب الفوري مع حراسكم من كافيت. لقد قُتل أحد رجالي وأُصيب ثلاثةٌ آخرون على يد رجالكم. هذا أمرٌ مؤكدٌ ولا يقبل أي تبريرٍ أو تأخير." ^{[ 67 ]} أفادت الاتصالات الفلبينية أن الأمريكيين كانوا في حالة سُكرٍ وقت وقوع الحادث. أعرب أغينالدو عن أسفه ووعد بمعاقبة الجناة. ^{[ 66 ]} اقترح أبوليناريو مابيني في البداية التحقيق مع أي مُرتكبين يتم التعرف عليهم ومعاقبتهم. عدّل أغينالدو هذا الأمر، فأمر قائلاً: "... قل إنه لم يُقتل على يد جنودك، بل على أيديهم [الأمريكيين] أنفسهم لأنهم كانوا سكارى وفقًا لبرقيتك". ^{[ 68 ]} وذكر ضابط فلبيني في كافيت آنذاك في سجل خدمته أنه: "شارك في التحرك ضد الأمريكيين بعد ظهر يوم 24 أغسطس، بأوامر من قائد القوات ومساعد قائد الموقع". ^{[ 69 ]}

أجرت الحكومة الثورية انتخابات بين يونيو و10 سبتمبر، أسفرت عن تشكيل هيئة تشريعية عُرفت باسم مؤتمر مالولوس. وفي جلسة عُقدت بين 15 سبتمبر و13 نوفمبر 1898، تم اعتماد دستور مالولوس . وصدر الدستور في 21 يناير 1899، مُعلناً قيام الجمهورية الفلبينية الأولى برئاسة إميليو أغينالدو. ^{[ 70 ]}

نصّت المادة الخامسة من بروتوكول السلام الموقع في 12 أغسطس/آب على بدء المفاوضات لإبرام معاهدة سلام في باريس في موعد أقصاه 1 أكتوبر/تشرين الأول 1898. [71] أرسل الرئيس ماكينلي لجنة مؤلفة من خمسة رجال، كُلّفت في البداية بالمطالبة بما لا يزيد عن لوزون وغوام وبورتوريكو ^{؛ وهو ما} كان سيُشكّل إمبراطورية أمريكية محدودة . ^{[ 72 ]} في باريس، تعرّضت اللجنة لوابل من النصائح، لا سيما من الجنرالات الأمريكيين والدبلوماسيين الأوروبيين، للمطالبة بالأرخبيل الفلبيني بأكمله. ^{[ 72 ]} وكانت التوصية بالإجماع هي أنه "سيكون من الأرخص والأكثر إنسانية بالتأكيد الاستيلاء على الفلبين بأكملها بدلاً من الاحتفاظ بجزء منها فقط". ^{[ 73 ]} زعم ماكينلي أن إعادة الفلبين إلى إسبانيا ستكون "جبانة ومخزية"، وأن تسليمها إلى "منافسين تجاريين" للولايات المتحدة سيكون "عملاً سيئاً ومُشينًا"، وأن الفلبينيين "غير مؤهلين للحكم الذاتي". ^{[ 74 ] [ 75 ]}

في 28 أكتوبر 1898، أرسل ماكينلي برقية إلى اللجنة جاء فيها: "لا يمكن تبرير التنازل عن لوزون وحدها، وترك بقية الجزر خاضعة للحكم الإسباني، أو لتكون موضع نزاع في المستقبل، لأسباب سياسية أو تجارية أو إنسانية. يجب أن يشمل التنازل الأرخبيل بأكمله أو لا يشمل أيًا منهما. الخيار الثاني غير مقبول بتاتًا، ولذا يجب اشتراط الأول." ^{[ 76 ]} استشاط المفاوضون الإسبان غضبًا من "مطالب الغازي غير العادل"، لكن كبرياءهم المجروح خُفِّف بعرضٍ قدره عشرون مليون دولار لـ"تحسينات إسبانية" في الجزر.

طوال الوقت، سعت الحكومة الفلبينية إلى تمثيلها في المحادثات من خلال الدبلوماسي المعتمد فيليبي أغونسيلو ، الذي بذل جهودًا لضمان إشراك القوة الفلبينية الجديدة. إلا أن أغونسيلو وحكومته استُبعدا تمامًا من المفاوضات. ^{[ 53 ]}

استسلم الإسبان لمطالب الأمريكيين، وفي 10 ديسمبر 1898، وقّعت الولايات المتحدة وإسبانيا معاهدة باريس، منهيةً بذلك الحرب الإسبانية الأمريكية رسميًا. في المادة الثالثة، تنازلت إسبانيا عن أرخبيل الفلبين للولايات المتحدة، على النحو التالي: "تتنازل إسبانيا للولايات المتحدة عن الأرخبيل المعروف باسم جزر الفلبين، والذي يشمل الجزر الواقعة ضمن الخط التالي: [... تم حذف الوصف الجغرافي ...]. ستدفع الولايات المتحدة لإسبانيا مبلغ عشرين مليون دولار (20,000,000 دولار أمريكي) في غضون ثلاثة أشهر من تبادل وثائق التصديق على هذه المعاهدة." ^{[ 77 ] [ 78 ]}

تصاعدت الحركة المطالبة بالاعتراف باستقلال الفلبين في الولايات المتحدة؛ إذ رأى البعض أن الولايات المتحدة لا تملك الحق في أرضٍ يرغب الكثير من سكانها في الحكم الذاتي. وفي عام ١٨٩٨، عرض الصناعي أندرو كارنيجي دفع ٢٠ مليون دولار للحكومة الأمريكية مقابل منح الفلبين استقلالها. ^{[ ٧٩ ]}

في 21 ديسمبر 1898، أصدر ماكينلي إعلانًا يدعو إلى " الاندماج السلمي ، واستبدال الحكم الاستبدادي بحكم العدل والحق" من أجل "مصلحة المحكومين". ^{[ 80 ]} وأشار إلى معاهدة باريس، مؤكدًا أنه "نتيجةً لانتصارات القوات الأمريكية، فإن السيطرة والتصرف والحكم في جزر الفلبين مستقبلًا تُنقل إلى الولايات المتحدة". وأمر القائد العسكري اللواء إلويل ستيفن أوتيس بإبلاغ الفلبينيين بأنه "بعد خلافة السيادة مع إسبانيا"، فإن سلطة الولايات المتحدة "ستُستخدم لحماية الأشخاص وممتلكات سكان الجزر، ولتأكيد جميع حقوقهم وعلاقاتهم الخاصة". نص الإعلان على أنه "سيكون من واجب قائد قوات الاحتلال أن يعلن ويعلن بأوضح صورة أننا لم نأتِ كغزاة أو فاتحين، بل كأصدقاء، لحماية السكان الأصليين في منازلهم، وفي أعمالهم، وفي حقوقهم الشخصية والدينية". ^{[ 81 ]}

استسلم الإسبان للثوار في إيلويلو في 26 ديسمبر. ووصلت لواء أمريكي بقيادة الجنرال ماركوس ب. ميلر في 28 ديسمبر، وفتحت قنوات اتصال مع الفلبينيين. ^{[ 82 ]} وأبلغه الرئيس لوبيز، رئيس الحكومة الفيدرالية لفيساياس، أن الإنزال يتطلب "أوامر صريحة من الحكومة المركزية في لوزون"، ورفض السماح له بالإنزال. ^{[ 83 ] [ 84 ]} ووصل هذا الخبر إلى واشنطن في 1 يناير 1899. ^{[ 83 ] [ 85 ]}

أرجأ أوتيس، الذي عُيّن حاكمًا عسكريًا للفلبين ، نشر إعلان ماكينلي. وفي 4 يناير، نشر أوتيس نسخةً مُعدّلةً حُذفت منها معاني مصطلحات السيادة والحماية وحق التنازل ، التي كانت واردةً في النسخة الأصلية. ^{[ 86 ]} وفي 6 يناير 1899، نُقل عن الجنرال أوتيس في صحيفة نيويورك تايمز قوله: "أنا مقتنع بأن حكومة الولايات المتحدة تعتزم السعي إلى إقامة حكومة ليبرالية، يُمثَّل فيها الشعب تمثيلًا كاملًا بما يسمح به الحفاظ على القانون والنظام، قابلة للتطوير، على أسس زيادة التمثيل ومنح المزيد من الصلاحيات، لتصبح حكومةً حرةً ومستقلةً كما تتمتع بها أكثر المقاطعات حظوةً في العالم." ^{[ 87 ]}

دون علم أوتيس، أرسلت وزارة الحرب نسخة مشفرة من إعلان الاستيعاب الخيري إلى الجنرال ميلر لأغراض إعلامية. افترض ميلر أنها للتوزيع، ودون أن يعلم أن أوتيس قد نشر نسخة منقحة سياسياً ، نشر النسخة الأصلية مترجمة إلى الإسبانية والتاغالوغية، والتي وصلت في النهاية إلى أغينالدو. ^{[ 88 ]} حتى قبل أن يتسلم أغينالدو النسخة الأصلية ويلاحظ التغييرات في النسخة التي استلمها من أوتيس، انزعج من أن أوتيس قد غيّر لقبه إلى "الحاكم العسكري للفلبين" بدلاً من "... في الفلبين"، وهو تغيير أجراه أوتيس دون إذن. ^{[ 89 ]}

تم تقديم الإعلان الأصلي من قبل المؤيدين إلى أغينالدو الذي أصدر في 5 يناير إعلانًا مضادًا: ^{[ 90 ]}

إنّ هذه الإجراءات، الغريبة عن أعراف الثقافة وتقاليد الأمم المتحضرة، منحتني الحق في التصرّف دون مراعاة قواعد التعامل المعتادة. ومع ذلك، حرصًا على الصواب حتى النهاية، أرسلتُ إلى الجنرال أوتيس مفوضين مكلفين بحثّه على التراجع عن مشروعه المتهوّر، لكن لم يُستجب لهم. لا يمكن لحكومتي أن تقف مكتوفة الأيدي إزاء هذا الاستيلاء العنيف والعدواني على جزء من أراضيها من قِبل دولة نصّبت نفسها بطلة الأمم المضطهدة. ولذلك، فإنّ حكومتي على استعداد لفتح الأعمال العدائية إذا حاولت القوات الأمريكية الاستيلاء بالقوة على جزر فيساياس. إنني أدين هذه الأعمال أمام العالم أجمع، لكي يُصدر ضمير البشرية حكمه القاطع بشأن من هم الظالمون الحقيقيون للأمم ومعذّبو البشرية. ^{[ 91 ] [ 92 ]}

بعد توزيع بعض نسخ ذلك الإعلان، أمر أغينالدو بسحب النسخ غير الموزعة وأصدر إعلانًا آخر، نُشر في اليوم نفسه في صحيفة "إل هيرالدو دي لا ريفولوسيون" ، الجريدة الرسمية للحكومة الفلبينية. وجاء في بيانه ما يلي:

كما أشار الجنرال أوتيس في بيانه إلى بعض التعليمات التي أصدرها فخامة رئيس الولايات المتحدة، والمتعلقة بإدارة شؤون جزر الفلبين، فإنني باسم الله، منبع العدل ومصدره، وباسم الحق الذي مُنح لي جليًا لتوجيه إخوتي الأعزاء في مهمة نهضتنا الشاقة، أحتج بأشد الاحتجاج على هذا التعدي من جانب حكومة الولايات المتحدة على سيادة هذه الجزر. كما أحتج باسم الشعب الفلبيني على هذا التعدي، لأنهم منحوني ثقتهم وانتخبوني رئيسًا للبلاد، مع أنني لا أرى أنني أستحق ذلك، ولذلك أعتبر من واجبي الدفاع عن حريتها واستقلالها حتى الموت. ^{[ 93 ] [ 94 ]}

اعتبر أوتيس هذين الإعلانين بمثابة إعلان حرب، فقام بتعزيز مواقع المراقبة الأمريكية وأبلغ قواته. أما إعلانات أغينالدو فقد حشدت الجماهير بعزيمة قوية لمحاربة ما اعتبروه حليفًا انقلب إلى عدو. فرّ نحو 40 ألف فلبيني من مانيلا خلال 15 يومًا. ^{[ 93 ] [ 95 ]}

في هذه الأثناء، سافر فيليبي أغونسيلو إلى واشنطن. وفي السادس من يناير، قدّم طلبًا لمقابلة الرئيس لمناقشة الشؤون في الفلبين. وفي اليوم التالي، فوجئ المسؤولون الحكوميون عندما علموا أن رسائل موجهة إلى الجنرال أوتيس تحثه على التعامل بلطف مع المتمردين وعدم تصعيد الصراع قد وصلت إلى أغونسيلو، وقام بإرسالها برقيةً إلى أغينالدو. ^{[ 83 ]}

في 8 يناير، صرح أغونسيلو بما يلي: ^{[ 83 ]}

في رأيي، لن يرضى الشعب الفلبيني، الذي أمثله، أبدًا بأن يصبح تابعًا للولايات المتحدة. لقد تعهد جنود الجيش الفلبيني بأرواحهم بأنهم لن يلقيوا أسلحتهم حتى يأمرهم الجنرال أغينالدو بذلك، وأنا على ثقة بأنهم سيوفون بهذا التعهد.

أرسلت اللجان الفلبينية في لندن وباريس ومدريد في ذلك الوقت تقريباً برقية إلى الرئيس ماكينلي:

نعترض على إنزال القوات الأمريكية في إيلويلو. لم يتم التصديق على معاهدة السلام بعد، ومطالبة أمريكا بالسيادة سابقة لأوانها. نرجو إعادة النظر في القرار المتعلق بإيلويلو. يتمنى الفلبينيون صداقة أمريكا ويكرهون النزعة العسكرية والخداع. ^{[ 96 ]}

في الثامن من يناير، تلقى أغينالدو الرسالة التالية من تيودورو سانديكو :

إلى رئيس الحكومة الثورية، مالولوس، من سانديكو، مانيلا. 8 يناير 1899، الساعة 9:40 مساءً: بناءً على أمر الجنرال ريوس لضباطه، يجب دفع الأمريكيين إلى منطقة إنتراموروس وإحراق المدينة المسورة فور بدء الهجوم الفلبيني. بيبي. ^{[ 97 ]}

ذكرت صحيفة نيويورك تايمز في 8 يناير/كانون الثاني أن أمريكيين اثنين كانا يحرسان قارباً مائياً في إيلويلو تعرضا لهجوم، توفي أحدهما، وأن الفلبينيين كانوا يهددون بتدمير المنطقة التجارية من المدينة حرقاً؛ وفي 10 يناير/كانون الثاني، ذكرت الصحيفة أن حلاً سلمياً لقضايا إيلويلو قد يُسفر عن شيء، لكن أغينالدو أصدر بياناً يهدد فيه بطرد الأمريكيين من الجزر. ^{[ 98 ] [ 99 ]}

بحلول العاشر من يناير، كان الفلبينيون مستعدين للصراع، لكنهم لن يتحركوا إلا إذا أطلق الأمريكيون الرصاصة الأولى. دفعهم هذا الموقف المتردد تجاه الأمريكيين إلى دفع خطوطهم إلى الأمام. ويتضح هذا الموقف جليًا من خلال هذا المقتطف من برقية أرسلها العقيد كايليس إلى أغينالدو في العاشر من يناير عام ١٨٩٩: "أمر عاجل للغاية. جاء مترجم أمريكي ليخبرني بسحب قواتنا من مايتوبيج، على بُعد خمسين خطوة. لن أتراجع خطوة واحدة، بل سأتقدم قليلًا بدلًا من الانسحاب. أحضر معه رسالة من قائده، يخاطبني فيها كصديق. قلتُ له إنني منذ اليوم الذي علمت فيه أن ماكينلي يعارض استقلالنا، لا أرغب في أي تعامل مع أي أمريكي. الحرب، الحرب، هي ما نريده. بعد هذا الكلام، بدا الأمريكيون شاحبين." ^{[ ١٠٠ ]}

وصل القلق إلى رئاسة الحكومة الثورية، كما يتضح من رد أغينالدو المكتوب بخط يده إلى كاييس: "أوافق وأشيد بما فعلتموه مع الأمريكيين، وأُثني على حماسكم وبسالتكم الدائمة، وكذلك على ضباطي وجنودي الأعزاء هناك. أعتقد أنهم يخدعوننا ريثما تصل تعزيزاتهم، لكنني سأرسل إنذارًا نهائيًا وسأبقى دائمًا على أهبة الاستعداد. - إي. أ.، 10 يناير 1899." ^{[ 100 ]}

في 31 يناير 1899، وقّع وزير الداخلية في جمهورية الفلبين، تيودورو سانديكو، مرسومًا ينص على أن الرئيس أغينالدو قد وجّه بزراعة جميع الأراضي غير المستغلة لتوفير الغذاء للشعب تحسبًا للحرب الوشيكة مع الأمريكيين. ^{[ 101 ]}

في يناير، تواصل الدبلوماسي الألماني غوتهارد كلوكه مع سانديكو، مما أدى إلى شحن مدافع كروب للقوات الفلبينية. وكشفت صحيفة شيكاغو تريبيون عن ذلك في 28 فبراير 1899، بينما كانت الشحنة لا تزال في طريقها. ^{[ 102 ] [ 103 ]}

في مساء الرابع من فبراير عام ١٨٩٩، أشعل الجندي ويليام دبليو. غرايسون فتيل الحرب الفلبينية الأمريكية بإطلاقه النار على مجموعة من الجنود الفلبينيين عند زاوية شارعي سوسيجو وتوماس أرغويليس. ^{[ ١٠٤ ]} أكدت دراسة أجراها روني ميرافيت كاسالمير وقوع الحادثة عند هذه الزاوية، وليس عند سوسيجو-سيلينسيو حيث وُضع النصب التذكاري خطأً. ^{[ ١٠٤ ]} تُفنّد دراسة روني ميرافيت كاسالمير النتائج السابقة للدكتور بينيتو ليغاردا، والتي استند إليها وضع النصب التذكاري في سوسيجو-سيلينسيو. ^{[ ١٠٤ ]} ووفقًا لروني ميرافيت كاسالمير، فإن الدليل القاطع على وقوع الحادثة عند زاوية سوسيجو-أرغويليس هو وجود المبنى رقم ٧ في خلفية صورة غرايسون التي أعاد فيها تمثيل الحادثة. يتطابق اتجاه صورة الحصن رقم 7 مع زاوية سوسيجو وأرغويليس عند مقارنتها بالصورة المعروفة للحصن رقم 7 الملتقطة من نفس الاتجاه. ^{[ 104 ]} إضافةً إلى ذلك، حدد تقدير الملازم ويدون للمسافة 100 ياردة من سانتول عند سوسيجو-أرغويليس، وليس سوسيجو-سيلينسيو. ^{[ 104 ]} هذا يعني أنه عندما أمر الملازم ويدون المفرزة في سانتول بالدورية لمسافة 100 ياردة، كان يقصد أن تقوم بالدورية حتى سوسيجو-أرغويليس. وقد أكد العقيد ستوتسنبرغ تقدير الملازم ويدون للمسافة. ^{[ 104 ]} ويصف البروفيسور أمبيث ر. أوكامبو الأدلة التي قدمها روني ميرافيت كاسالمير بأنها جديدة ومقنعة. ^{[ 105 ]} يتفق البروفيسور أوكامبو على أن هذه الأدلة تُظهر ضرورة نقل النصب التذكاري مسافة مبنى واحد، من سوسيجو-سيلينسيو إلى سوسيجو-أرغويليس. ^{[ 106 ]} كما تتفق الرائد المتقاعدة ليليان أ. بفلوك، خريجة ويست بوينت عام 1980 ومؤسسة جمعية النصب التذكارية الأمريكية للحرب في الخارج، مع هذا الرأي، وقد أشارت في ملاحظة على موقعهم الإلكتروني الخاص بالنصب التذكارية الأمريكية للحرب إلى أن الموقع الصحيح للنصب التذكاري يجب أن يكون عند تقاطع شارعي سوسيجو وأرغويليس المجاورين، حيث وقع الحادث بالفعل. ^{[ 107 ]}

قدم غرايسون الرواية التالية عن انضمامه إلى صفوف المتمردين:

أدى اندلاع العنف إلى اندلاع معركة مانيلا عام 1899. وفي وقت لاحق من ذلك اليوم، أعلن أغينالدو "أنه يجب قطع السلام والعلاقات الودية مع الأمريكيين، وأن يُعامل هؤلاء كأعداء، في حدود ما تنص عليه قوانين الحرب". ^{[ 108 ]}

في اليوم التالي، عبر الجنرال الفلبيني إيسيدورو توريس الخطوط الأمامية رافعًا راية الهدنة ليُبلغ الجنرال أوتيس رسالةً من أغينالدو مفادها أن القتال قد بدأ عرضيًا، وأن أغينالدو يرغب في وقف الأعمال العدائية فورًا وإنشاء منطقة محايدة. رفض أوتيس هذه المبادرات، وردّ قائلًا: "القتال، ما دام قد بدأ، لا بدّ أن يستمر حتى نهايته المأساوية". ^{[ 109 ]} وفي الخامس من فبراير، أمر الجنرال آرثر ماك آرثر قواته بالتقدم نحو القوات الفلبينية. ^{[ 110 ]}

في الولايات المتحدة، شكّل الرئيس ماكينلي لجنة برئاسة جاكوب غولد شورمان في 20 يناير ^{/ كانون الثاني ،} وكلّفها بدراسة الوضع في الفلبين وتقديم توصيات بشأن كيفية تعامل الولايات المتحدة مع الوضع. ضمّت اللجنة في عضويتها الجنرال أوتيس واثنين آخرين من المعينين المدنيين. وصل الأعضاء المدنيون الثلاثة إلى مانيلا في 4 مارس/آذار 1899، بعد شهر من بدء الأعمال العدائية. ^{[ 111 ]}

اعتبر الجنرال أوتيس وصول زملائه أعضاء اللجنة تدخلاً غير مبرر، فقاطع اجتماعاتها. ^{[ 112 ]} أمضى الأعضاء المدنيون في اللجنة شهراً كاملاً في لقاءات مع المثقفين الذين انشقوا عن الحكومة الفلبينية، بالإضافة إلى دراسة دستور مالولوس ووثائق حكومية أخرى. في غضون ذلك، ومع تقدم القوات الأمريكية شمالاً من مانيلا، نُقل مقر حكومة أغينالدو الثورية من مالولوس إلى سان إيسيدرو، نويفا إيسيا . وعندما سقطت مالولوس في نهاية مارس، انتقل المقر شمالاً إلى سان فرناندو، بامبانغا . ^{[ 113 ]}

أصدرت اللجنة بياناً تضمن تأكيدات بأن الولايات المتحدة لا تنوي استغلال الفلبينيين، بل "الارتقاء بهم إلى مكانة بين أكثر شعوب العالم تحضراً"، وأعلنت "أن الولايات المتحدة ... حريصة على إقامة نظام حكم مستنير في جزر الفلبين يتمتع بموجبه الشعب الفلبيني بأكبر قدر من الحكم الذاتي وأوسع قدر من الحرية". ^{[ 114 ]}

على الرغم من عدم تخويلهم مناقشة الهدنة، أجرى أعضاء اللجنة المدنية مناقشات غير رسمية مع ممثل عن أغينالدو. وتوقف التقدم نحو مسار سلمي بعد أن اعتقل الجنرال لونا حكومة أغينالدو آنذاك، واستبدلها بحكومة أكثر تشدداً برئاسة أبوليناريو مابيني. ^{[ هـ ]} في 2 يونيو 1899، أعلنت جمهورية الفلبين الأولى الحرب على الولايات المتحدة. ^{[ 115 ]}

قال السيناتور ألبرت ج. بيفريدج ، وهو إمبريالي أمريكي بارز: "لقد خاض الأمريكيون الحرب مع إسبانيا بدافع الإيثار لتحرير الكوبيين والبورتوريكيين والفلبينيين من نير استبدادهم. وإذا ما طال بقاؤهم في الفلبين، فذلك لحماية الفلبينيين من المفترسين الأوروبيين الذين يتربصون بهم عند انسحاب أمريكي، ولتعليمهم مبادئ الديمقراطية على النمط الأمريكي." ^{[ 116 ]}

في 11 فبراير 1899، بعد أسبوع من إطلاق أولى الطلقات، قصفت القوات البحرية الأمريكية مدينة إيلويلو من على متن سفينتي يو إس إس بيترل (PG-2)   ويو إس إس بالتيمور (C-3)   . أشعلت القوات الفلبينية النار في المدينة قبل انسحابها. استولت القوات البرية بقيادة العميد ماركوس ميلر على المدينة، دون أي خسائر في الأرواح الأمريكية. أصيب ما بين 25 و30 فلبينيًا بجروح. دُمر الجزء الذي يسكنه السكان الأصليون من المدينة تدميرًا شبه كامل. ^{[ 117 ]}

بعد أشهر، وبعد تأمين مانيلا أخيرًا، تحركت القوات الأمريكية شمالًا، وانخرطت في معارك على مستوى الألوية والكتائب لملاحقة قوات المتمردين المنسحبة. ^{[ 118 ]} ردًا على استخدام القوات الفلبينية لتكتيكات حرب العصابات، بدءًا من سبتمبر 1899، ^{[ 119 ]} تحولت الاستراتيجية العسكرية الأمريكية إلى قمع المقاومة. وتركزت التكتيكات على السيطرة على المناطق الرئيسية مع اعتقال وعزل السكان المدنيين في "مناطق حماية" من المتمردين. ^{[ 120 ]} توفي العديد من المدنيين المعتقلين بسبب الزحار . ^{[ 121 ]}

اكتسب الجنرال أوتيس سمعة سيئة بسبب بعض أفعاله. فرغم توجيهات رؤسائه له بتجنب الصراع العسكري، إلا أنه لم يبذل جهدًا يُذكر لمنع الحرب. رفض أوتيس قبول أي شيء سوى الاستسلام غير المشروط من الجيش الفلبيني. وكثيرًا ما اتخذ قرارات عسكرية مصيرية دون استشارة واشنطن أولًا. وتصرف بعدوانية في تعامله مع الفلبينيين انطلاقًا من افتراضه أن مقاومتهم ستنهار سريعًا. ^{[ 122 ]} وحتى بعد ثبوت خطأ هذا الافتراض، استمر في الإصرار على هزيمة التمرد، وأن الخسائر المتبقية ناجمة عن "عصابات معزولة من الخارجين عن القانون". ^{[ 123 ]}

كان أوتيس نشطًا أيضًا في قمع المعلومات المتعلقة بالتكتيكات العسكرية الأمريكية. فعندما كانت تصل رسائل تصف الفظائع الأمريكية إلى وسائل الإعلام الأمريكية، كان أوتيس يرسل كل قصاصة صحفية إلى الضابط القائد للكاتب الأصلي، الذي كان بدوره يقنع الجندي أو يجبره على التراجع عن تصريحاته. ^{[ 124 ]}

تتراوح تقديرات القوات الفلبينية بين 80,000 و100,000 جندي، بالإضافة إلى عشرات الآلاف من القوات المساعدة . وكانت معظم هذه القوات مسلحة فقط بسكاكين البولو ، والأقواس والسهام ، والرماح ، وغيرها من الأسلحة البدائية، التي كانت أقل كفاءة بكثير من البنادق وغيرها من أسلحة القوات الأمريكية. ^{[ 125 ]}

كان نظام الطبقات الاجتماعية الأصلي في الفلبين قبل الحقبة الاستعمارية الإسبانية نظامًا جامدًا إلى حد ما ، وقد استمر جزئيًا بين السكان الأصليين خلال الحكم الإسباني. وكان الهدف، أو الحالة النهائية، التي سعت إليها الجمهورية الفلبينية الأولى هو دولة ذات سيادة ومستقلة ومستقرة ومتساوية. عمليًا، كان زعماء القبائل المحليون وملاك الأراضي ورجال الأعمال ورؤساء القرى هم من يديرون الشؤون السياسية المحلية. بلغت الحرب ذروتها عندما توحد المثقفون والزعماء والفلاحون في معارضتهم لضم الفلبين من قبل الولايات المتحدة. وكان للفلاحين ، الذين مثلوا غالبية القوات المقاتلة، مصالح مختلفة عن مصالح قادتهم المثقفين وزعماء قراهم. وبالإضافة إلى التشرذم العرقي والجغرافي، كان توحيد مصالح الناس من مختلف الطبقات الاجتماعية مهمة شاقة. ^{[ 126 ]} تمثل التحدي الذي واجه أغينالدو وجنرالاته في الحفاظ على معارضة شعبية فلبينية موحدة؛ فقد كان هذا هو مركز الثقل الاستراتيجي للثوار . ^{[ 127 ]}

كان محور العمليات الفلبينية هو القدرة على الحفاظ على قوة قوامها 100 ألف مقاتل غير نظامي في الميدان. وصف الجنرال الفلبيني فرانسيسكو ماكابولوس هدف الفلبينيين من الحرب بأنه "ليس هزيمة الجيش الأمريكي، بل إلحاق خسائر متواصلة به". في المراحل الأولى من الحرب، استخدم الجيش الفلبيني التكتيكات العسكرية التقليدية التي تميز المقاومة المسلحة المنظمة. وكان الأمل معقودًا على إلحاق خسائر أمريكية كافية تؤدي إلى هزيمة ماكينلي أمام ويليام جينينغز برايان في الانتخابات الرئاسية عام 1900. وكانوا يأملون أن يقوم برايان، الذي كان يحمل آراءً قوية مناهضة للإمبريالية ، بسحب القوات الأمريكية من الفلبين. ^{[ 128 ]}

كان فوز ماكينلي في انتخابات عام 1900 محبطًا للفلبينيين، وأقنع الكثيرين منهم بأن الولايات المتحدة لن تنسحب سريعًا. ^{[ 128 ]} وبالتزامن مع سلسلة من الخسائر الفادحة في ساحة المعركة أمام القوات الأمريكية المجهزة بتكنولوجيا وتدريب متفوقين، اقتنع أغينالدو بضرورة تغيير نهجه. ابتداءً من 14 سبتمبر 1899، قبل أغينالدو نصيحة الجنرال غريغوريو ديل بيلار ، وأذن باستخدام تكتيكات حرب العصابات في العمليات العسكرية اللاحقة في بولاكان. ^{[ 119 ]}

خلال معظم عام ١٨٩٩، نظرت القيادة الثورية إلى حرب العصابات من منظور استراتيجي كخيار تكتيكي أخير فقط، لا كوسيلة عملياتية أنسب لوضعها غير المواتي. في ١٣ نوفمبر ١٨٩٩، أصدر أغينالدو مرسومًا يقضي بأن تكون حرب العصابات هي الاستراتيجية المتبعة من الآن فصاعدًا. ^{[ ١٢٩ ] [ و ]} وقد زاد هذا من صعوبة الاحتلال الأمريكي للأرخبيل الفلبيني خلال السنوات القليلة التالية. خلال الأشهر الأربعة الأولى من حرب العصابات، تكبد الأمريكيون ما يقرب من ٥٠٠ ضحية. ^{[ ١٣١ ]} بدأ الجيش الفلبيني بشن كمائن وغارات دموية، مثل انتصارات حرب العصابات في باي ، وكاتوبيج ، وتلة ماكاهامبوس ، وبولانغ لوبا ، ومابيتاك . في البداية، بدا أن الفلبينيين قد يتمكنون من خوض معركة مع الأمريكيين حتى الوصول إلى طريق مسدود وإجبارهم على الانسحاب. فكر الرئيس ماكينلي في الانسحاب عندما بدأت غارات حرب العصابات.

في 20 ديسمبر 1900، فرض ماك آرثر، الذي خلف إلويل أوتيس في منصب الحاكم العسكري الأمريكي في 5 مايو، ^{[ 132 ]} الأحكام العرفية على الفلبين، مستندًا إلى الأمر العام رقم 100 الصادر عن الجيش الأمريكي . وأعلن أنه لن يتم التسامح مع انتهاكات المقاومة، وحدد الحقوق التي ستنظم معاملة الجيش الأمريكي للمقاومين والمدنيين. وعلى وجه الخصوص، سيُحاسب المقاومون الذين لا يرتدون زيًا رسميًا بل ملابس فلاحية، والذين تحولوا من وضع مدني إلى عسكري؛ وستُعامل اللجان السرية التي جمعت الضرائب الثورية، وأولئك الذين قبلوا الحماية الأمريكية في المدن المحتلة أثناء مساعدتهم للمقاومين، على أنهم "متمردون حرب أو خونة حرب". وتم ترحيل القادة الفلبينيين الذين واصلوا العمل من أجل استقلال الفلبين إلى غوام. ^{[ 133 ]}

استمر الجيش الفلبيني في تكبد الهزائم على يد جيش الولايات المتحدة الأكثر تسليحاً خلال مرحلة الحرب التقليدية، مما أجبر أغينالدو على تغيير قاعدة عملياته باستمرار طوال فترة الحرب.

في 24 يونيو 1900، أصدر ماك آرثر، بصفته الحاكم العسكري الأمريكي، إعلانًا يعرض فيه العفو الكامل والشامل على جميع المتمردين الذين استسلموا في غضون تسعين يومًا.

في 3 أغسطس 1900، أصدر أغينالدو مرسومًا يحث على استمرار الحرب ويعرض مكافآت مقابل البنادق والذخيرة التي يجلبها الأسرى أو الفارين من القوات المعادية. ^{[ 134 ]}

في 23 مارس 1901، أسر الجنرال فريدريك فنستون وقواته أغوينالدو في بالانان، إيزابيلا ، بمساعدة بعض الفلبينيين (المعروفين باسم كشافة ماكابيبي نسبةً إلى موطنهم ^{[ 135 ] [ 136 ]} ) الذين انضموا إلى الأمريكيين. تظاهر الأمريكيون بأنهم أسرى لدى الكشافة، الذين كانوا يرتدون زي الجيش الفلبيني. وما إن دخل فنستون و"آسروه" معسكر أغوينالدو، حتى تمكنوا من التغلب على قواته بسرعة. ^{[ 137 ]}

في الأول من أبريل عام ١٩٠١، في قصر مالاكانانغ بمانيلا، أقسم أغينالدو يمينًا معترفًا بسلطة الولايات المتحدة على الفلبين ومتعهدًا بولائه للحكومة الأمريكية. وفي التاسع عشر من أبريل، أصدر إعلانًا رسميًا بالاستسلام للولايات المتحدة، داعيًا أتباعه إلى إلقاء أسلحتهم والتخلي عن القتال.

قال أغينالدو: "ليتوقف سفك الدماء، ولتكن نهاية للدموع واليأس". وأضاف: "إن الدرس الذي تقدمه الحرب، والذي لم أدرك أهميته إلا مؤخرًا، يدفعني إلى قناعة راسخة بأن الإنهاء الكامل للأعمال العدائية وإحلال سلام دائم ليسا مرغوبين فحسب، بل ضروريان للغاية لرفاهية الفلبين". ^{[ 138 ] [ 139 ]}

شكّل أسر أغوينالدو ضربةً قويةً للقضية الفلبينية، لكن ليس بالقدر الذي كان يأمله الأمريكيون. تولّى الجنرال ميغيل مالفار قيادة الحكومة الفلبينية. ^{[ 140 ]} كان قد اتخذ في البداية موقفًا دفاعيًا ضد الأمريكيين، لكنه شنّ هجومًا على البلدات التي يسيطر عليها الأمريكيون في منطقة باتانغاس . ^{[ 16 ]} وواصل الجنرال فيسنتي لوكبان في سامار، وضباط آخرون في الجيش، الحرب في مناطقهم. ^{[ 16 ]}

في 3 مارس 1901، أقرّ الكونغرس الأمريكي قانون مخصصات الجيش، والذي تضمن (إلى جانب تعديل بلات بشأن كوبا) تعديل سبونر الذي منح الرئيس سلطة تشريعية لإنشاء حكومة مدنية في الفلبين. ^{[ 141 ]} وحتى ذلك الحين، كان الرئيس يدير شؤون الفلبين بموجب صلاحياته الحربية. ^{[ 142 ]} وفي 4 يوليو 1901، أُلغي منصب الحاكم العسكري الأمريكي، وبدأت الحكومة المدنية برئاسة ويليام هوارد تافت . ^{[ 143 ] [ 144 ]} واستمرت الأعمال العدائية، وتقاسم الحاكم المدني السلطة والنفوذ مع الحكومة العسكرية الأمريكية.

أُنشئ نظام مدارس عامة مركزي عام ١٩٠١، وكانت اللغة الإنجليزية هي لغة التدريس. وقد أدى ذلك إلى نقص حاد في المعلمين، فأذنت اللجنة الفلبينية لوزير التعليم العام باستقدام ٦٠٠ معلم من الولايات المتحدة - ما يُعرف باسم "التوماسيتيين" . كما أُنشئت مدارس ابتدائية مجانية تُدرّس واجبات المواطنة والمهن. ^{[ ١٤٥ ]} وتم فصل الكنيسة الكاثوليكية رسميًا عن الدولة، وشراء مساحات واسعة من أراضي الكنيسة وإعادة توزيعها. 

تم سن قانون مكافحة الفتنة في عام 1901، تبعه قانون مكافحة قطاع الطرق في عام 1902. ^{[ 146 ]}

في الرابع من يوليو عام ١٩٠٢، أعلن ثيودور روزفلت ، الذي تولى رئاسة الولايات المتحدة، رسمياً انتهاء الحرب، ومنح عفواً شاملاً وكاملاً لجميع الأشخاص في الأرخبيل الفلبيني الذين شاركوا في النزاع. ^{[ ١٥ ] [ ١٤٧ ] [ ١٤٨ ] [ ١٤٩ ]}

في 9 أبريل 2002، أعلنت رئيسة الفلبين غلوريا ماكاباغال أرويو أن الحرب الفلبينية الأمريكية انتهت في 16 أبريل 1902 باستسلام مالفار. ^{[ 150 ] [ 151 ] وأعلنت الذكرى المئوية لهذا التاريخ عطلة عمل وطنية ،} وعطلة خاصة في مقاطعة باتانغاس ومدن باتانغاس وليبا وتاناوان . [ ^{150 ] [ 151 ] [ 152 ]}

ضمنت معاهدة كيرام -بيتس سلطنة سولو . ^{[ 153 ]} كما سيطرت القوات الأمريكية على المناطق الجبلية الداخلية التي قاومت الغزو الإسباني. ^{[ 154 ]}

خلص المؤرخان غلين ماي عام 1983 ورينيه إسكالانتي عام 1998 إلى أن قضية أغينالدو كانت تعاني من نقاط ضعف قاتلة متعددة: فقد ألقيا باللوم على قيادته السياسية غير الكفؤة؛ وأخطائه العسكرية الاستراتيجية والتكتيكية؛ وفقدانه للدعم الشعبي؛ ونفور الكاثوليك منه؛ وفشله في حشد النخبة الفلبينية؛ والخلافات والفساد بين جنرالاته؛ وفشله في كسب أي دعم دولي لقضيته. ^{[ 155 ]}

خلال الحرب، ارتكب الجيش الأمريكي العديد من الفظائع، بما في ذلك استهداف المدنيين. وقد أرسل الجنود الأمريكيون وشهود عيان آخرون رسائل إلى عائلاتهم يصفون فيها بعض هذه الفظائع. على سبيل المثال، في عام 1902، كتب مراسل صحيفة فيلادلفيا ليدجر في مانيلا:

إن الحرب الحالية ليست معركة بلا دماء، أو هزلة أوبرا ؛ لقد كان رجالنا بلا هوادة، وقتلوا لإبادة الرجال والنساء والأطفال والأسرى والمحتجزين، والمتمردين النشطين والمشتبه بهم من الصبية الذين يبلغون من العمر عشر سنوات فما فوق، حيث سادت فكرة أن الفلبيني في حد ذاته ليس أفضل حالاً من الكلب ... ^{[ 173 ]}

أفادت تقارير من الجنود العائدين أنه عند دخول أي قرية، كان الجنود الأمريكيون ينهبون كل منزل وكنيسة ويسلبون السكان كل شيء ذي قيمة، بينما كان يتم إطلاق النار على الفلبينيين الذين يقتربون من خط المعركة وهم يلوحون بعلم الهدنة. ^{[ 174 ]}

انتقد بعض المؤلفين قادةً مثل اللواء أوتيس، وسلوك الحرب عمومًا. في عام ١٨٩٩، نشرت الرابطة الأمريكية المناهضة للإمبريالية كتيبًا يتضمن رسائل يُزعم أنها كُتبت من قِبل جنود أمريكيين. ^{[ ١٧٥ ]} عندما انتشرت بعض هذه الرسائل في الصحف، أصبحت خبرًا وطنيًا، مما أجبر وزارة الحرب على التحقيق. أمثلة:

• جندي من نيويورك: "استسلمت لنا بلدة تيتاتيا قبل أيام، وتحتلها سريتان. الليلة الماضية، عُثر على أحد جنودنا مقتولاً برصاصة وبطنه مشقوق. على الفور، تلقينا أوامر من الجنرال ويتون بحرق البلدة وقتل كل من فيها من السكان الأصليين؛ وقد نُفذت الأوامر بالكامل. أفادت التقارير بمقتل حوالي ألف رجل وامرأة وطفل. ربما بدأت أقسو قلبي، فأنا أشعر بنشوة عارمة عندما أتمكن من توجيه بندقيتي نحو شخص أسمر البشرة وإطلاق النار عليه." ^{[ 176 ]}
• العريف سام جيليس: "نُجبر الجميع على دخول منازلهم بحلول الساعة السابعة مساءً، ولا نُخبر الرجل إلا مرة واحدة. إذا رفض، نُطلق عليه النار. قتلنا أكثر من 300 من السكان الأصليين في الليلة الأولى. حاولوا إضرام النار في البلدة. إذا أطلقوا رصاصة واحدة من المنزل، نحرق المنزل وكل منزل قريب منه، ونُطلق النار على السكان الأصليين، لذا فهم هادئون جدًا في البلدة الآن." ^{[ 124 ]}

تمثّل تحقيق اللواء أوتيس في محتوى هذه الرسائل في إرسال نسخة منها إلى رئيس كاتبها وإجباره على كتابة اعتذار. رفض جنود مثل الجندي تشارلز برينر، فتمت محاكمته عسكريًا . وُجّهت إليه تهمة "كتابة مقال والتواطؤ في نشره... يتضمن أكاذيب متعمدة بشأنه وتهمة باطلة ضد النقيب بيشوب". ^{[ 124 ]} لم تكن جميع هذه الرسائل التي تناولت الفظائع تهدف إلى انتقاد الجنرال أوتيس أو تصرفات الولايات المتحدة. فقد صوّر العديد منها تصرفات الولايات المتحدة على أنها نتيجة استفزازات فلبينية، وبالتالي مبررة تمامًا. خلال الحرب، شكّل الفرار من الخدمة مشكلة للجيش الأمريكي. حُكم على سبعة عشر جنديًا أمريكيًا بالإعدام بتهمة الفرار، لكن لم يُنفذ الحكم إلا على اثنين منهم. ^{[ 172 ]}

في سبتمبر/أيلول 1901، استشاط العميد جاكوب هـ. سميث غضبًا من مذبحة بالانجيجا في سامار، فقام خلال عملية تهدئة الجزيرة بإصدار أوامر بشن هجوم عشوائي على سكانها، متجاهلًا علنًا الأمر العام رقم 100 ، ^{[ 177 ]} وأصدر أمرًا بـ"قتل كل من يزيد عمره عن عشر سنوات" وتحويل الجزيرة إلى "برية موحشة". ^{[ 178 ]} وقد نقض الرائد ليتلتون والر هذا الأمر على رجاله قائلًا: "نحن لا نشن حربًا على النساء والأطفال". ^{[ 179 ]} ومع ذلك، قُتل ما بين 2000 و2500 مدني فلبيني في الحملة عبر سامار. ^{[ 180 ]} وقد أصبح هذا تعليقًا في رسم كاريكاتوري نشرته صحيفة نيويورك جورنال أمريكان في 5 مايو/أيار 1902. وفي نهاية المطاف، حوكم سميث عسكريًا من قبل الجيش الأمريكي وأُجبر على التقاعد. ^{[ 180 ] [ 181 ]}

في أواخر عام ١٩٠١، تولى العميد ج. فرانكلين بيل قيادة العمليات الأمريكية في مقاطعتي باتانغاس ولاغونا. ^{[ ١٨٢ ]} ردًا على تكتيكات حرب العصابات التي اتبعها مالفار، استخدم بيل تكتيكات مكافحة التمرد (التي وصفها البعض بسياسة الأرض المحروقة ) خلال عملية تهدئة باتانغاس، والتي ألحقت خسائر فادحة بالمقاتلين المدنيين والمقاتلين. ^{[ ١٨٣ ]} تم إنشاء "مناطق حماية"، ^{[ ١٢٠ ] [ ١٨٤ ]} ومُنح المدنيون وثائق هوية وأُجبروا على دخول معسكرات اعتقال (تُسمى معسكرات الاعتقال ) محاطة بمناطق إطلاق نار مفتوحة . ^{[ 184 ]} في لجنة لودج ، وفي محاولة لمواجهة ردود الفعل السلبية في أمريكا تجاه معسكرات العميد بيل، أصرّ العقيد آرثر فاغنر ، كبير مسؤولي العلاقات العامة في الجيش الأمريكي، على أن المعسكرات كانت تهدف إلى "حماية السكان المحليين من المتمردين، وضمان حصولهم على إمدادات غذائية كافية" مع تعليمهم "المعايير الصحية السليمة". وقد قوضت رسالة من قائد أحد المعسكرات، وصف فيها المعسكرات بأنها " ضاحية من ضواحي الجحيم "، مزاعم فاغنر. ^{[ 185 ] [ 186 ]}

استُخدمت أساليب تعذيب، كالعلاج بالماء ، بشكل متكرر أثناء الاستجواب، ^{[ 187 ]} وقد وصفها روزفلت سرًا بأنها "أسلوب تعذيب فلبيني قديم خفيف" ذو ضرر ضئيل، خاصةً بالمقارنة مع "التعذيب المروع" الذي زعم أن الفلبينيين مارسوه على الأمريكيين. ^{[ 65 ]} أُحرقت قرى بأكملها أو دُمرت بطرق أخرى. ^{[ 188 ] [ 65 ]}

خلال معركة بود داجو الأولى في مارس 1906، قُتل ما بين 800 و900 من المورو ، بينهم نساء وأطفال، على يد مشاة البحرية الأمريكية بقيادة اللواء ليونارد وود . ويُشكك البعض في وصف هذه المواجهة بأنها "معركة" نظرًا للقوة النارية الهائلة للمهاجمين والخسائر الفادحة؛ إذ قُتل 99% من المورو في الهجوم، ولم ينجُ سوى ستة. كتب المؤلف فيك هيرلي : "لا يمكن بأي حال من الأحوال وصف بود داجو بأنها "معركة". ^{[ 189 ]} وعلق مارك توين قائلًا: "بأي معنى كانت معركة؟ لا تشبه المعركة بأي شكل من الأشكال... لقد أنهينا عملنا الذي استمر أربعة أيام، وأتممناه بذبح هؤلاء الناس العزل". ^{[ 190 ]}

ساهم العداء العنصري بشكل كبير في تأجيج الفظائع، حيث استخدمت القوات الأمريكية بشكل شائع مصطلحات مهينة مثل "زنجي" و"هندي". وارتبط المصطلح الأخير ارتباطًا وثيقًا بحروب الهنود الحمر الأخيرة . وكان العديد من كبار المسؤولين الأمريكيين في الفلبين قد خدموا سابقًا في حروب الهنود الحمر، واستخدموا أساليب قاسية تُذكّر بأحداث تلك الحروب، مثل مذبحة ووندد ني عام 1890. وكثيرًا ما سُعي لتبرير الفظائع بتصوير المقاتلين الفلبينيين على أنهم قساة. فعلى سبيل المثال، زعم الرئيس روزفلت أن المتمردين تصرفوا "بقسوة وخيانة وتجاهل تام لقواعد الحرب المتحضرة". ^{[ 65 ]} ودافع مسؤولون آخرون، ولا سيما ديفيد بريسكوت باروز، عن سلوك الولايات المتحدة، ورفضوا روايات الفظائع بالتقليل من شأن استخدام العلاج بالماء، وتبرير حرق القرى، والدفاع عن سياسة إعادة التمركز، على الرغم من تشابهها مع التكتيكات الإسبانية خلال حرب الاستقلال الكوبية. كما أعرب عن إعجابه بالجنرال سميث، على الرغم من أفعاله في سامار. وكانت هناك انقسامات عميقة داخل المجتمع الأمريكي بشأن إدارة الحرب. ^{[ 191 ]}

زعم اللواء أوتيس، من الجيش الأمريكي، أن الفلبينيين عذبوا أسرى الحرب الأمريكيين بطريقة وحشية. ووفقًا لأوتيس، دُفن العديد منهم أحياءً أو دُفنوا حتى أعناقهم في تلال النمل. وادعى أن آخرين بُترت أعضاؤهم التناسلية وحُشرت في أفواههم، ثم أُعدموا خنقًا أو نزفًا حتى الموت. ^{[ 192 ]} ووصفت تقارير في صحف أخرى هجمات متعمدة شنها قناصة فلبينيون على جراحين أمريكيين، وقساوسة، وسيارات إسعاف، ومستشفيات، وجنود جرحى. ^{[ 193 ]} ووردت في صحيفة "سان فرانسيسكو كول" حادثة وقعت في إسكالانتي، نيغروس أوكسيدنتال ، حيث أُطلق النار على عدد من أفراد طاقم سفينة الإنزال "سي إس ريكوردر" ، ثم بُقرت أحشاؤهم على يد متمردين فلبينيين، بينما كان المتمردون يرفعون راية الهدنة . ^{[ 194 ]}

أُفيد بأن قساوسة إسبانًا مُثِّلوا بجثثهم أمام رعاياهم، وأن آلافًا من الفلبينيين الذين رفضوا دعم أغينالدو ذُبحوا. وتصدرت عناوين الصحف الأمريكية خبر "القتل والاغتصاب" على يد "الفلبينيين الأشرار". وأصر العميد جوزيف ويلر على أن الفلبينيين شوّهوا جثث موتاهم، وقتلوا النساء والأطفال، وأحرقوا القرى، لمجرد تشويه سمعة الجنود الأمريكيين. ^{[ 192 ]} ويؤكد أبوليناريو مابيني ، في سيرته الذاتية، هذه الجرائم، مصرحًا بأن أغينالدو لم يُعاقب القوات الفلبينية التي ارتكبت جرائم الاغتصاب خلال الحرب ، أو أحرقت ونهبت القرى، أو سرقت ودمرت الممتلكات الخاصة. ^{[ 195 ]}

وشملت الفظائع الأخرى التي ارتكبها الفلبينيون تلك التي نسبها الأمريكيون إلى القائد الفلبيني لوكبان، الذي يُزعم أنه دبر مذبحة بالانجيجا في مقاطعة سامار، وهي هجوم فلبيني مفاجئ أسفر عن مقتل ما يقرب من خمسين جنديًا أمريكيًا. ^{[ 196 ]} وذكرت تقارير إعلامية أن العديد من الجثث قد شُوهت. ^{[ 197 ]}

وأفادت الشهادة أمام لجنة النزل بأن السكان الأصليين خضعوا للعلاج بالماء، "... من أجل الحصول على معلومات عن مقتل الجندي أوهيرن من السرية الأولى، الذي لم يُقتل فحسب، بل تم شويه وتعذيبه بطرق أخرى قبل وفاته." ^{[ 198 ]}

يذكر أغونسيلو في كتابه "تاريخ الشعب الفلبيني " أن القوات الفلبينية كانت تضاهي، بل وتتجاوز، الوحشية الأمريكية. فقد كان الركل والصفع والبصق على الوجوه أمراً شائعاً. وفي بعض الحالات، كانت تُقطع الآذان والأنوف ويُرش الملح على الجروح. وفي حالات أخرى، كان يُدفن الأسرى أحياءً. وقد وقعت هذه الفظائع بغض النظر عن أوامر أغينالدو وتعميماته المتعلقة بمعاملة السجناء. ^{[ 199 ]}

يروي ووستر حادثتين وحشيتين محددتين ارتكبتا بحق الفلبينيين على النحو التالي:

عثرت فرقة عسكرية، أثناء سيرها في جزيرة ليتي، على جندي أمريكي اختفى قبل فترة وجيزة، وقد صُلب ورأسه إلى الأسفل. كان جدار بطنه مفتوحًا بعناية بحيث تتدلى أمعاؤه في وجهه. وفي الرحلة نفسها، عُثر على سجين أمريكي آخر مدفونًا في الأرض ورأسه فقط ظاهر. كان فمه مفتوحًا بعصا، ووُضعت أمامه خيوط من السكر عبر الغابة، ثم أُلقيت حفنة منه فيه. أما بقية المهمة، فقد قامت بها ملايين النمل. ^{[ 200 ]}

أعلنت لجنة شورمان من جانب واحد أن "... الفلبينيين غير مستعدين إطلاقاً للاستقلال... إذ لا وجود لأمة فلبينية موحدة، بل مجرد مجموعة من شعوب مختلفة." ^{[ 201 ]} وفي التقرير الذي قدمته اللجنة إلى ماكينلي في العام التالي، أقرّ المفوضون بتطلعات الفلبينيين للاستقلال؛ إلا أنهم أعلنوا أن الفلبين لم تكن مستعدة له. وقد تأثر هذا الاستنتاج جزئياً بعدم فهمهم لهيكل الحكومة الفلبينية، الذي كان قائماً على مبادئ أوروبية وأمريكية لاتينية غريبة على الأمريكيين. ^{[ 202 ]} وشملت التوصيات المحددة إرساء سيطرة مدنية على مانيلا (مع منح أوتيس حق النقض على حكومة المدينة)، وإنشاء حكومة مدنية بأسرع وقت ممكن، لا سيما في المناطق التي أُعلنت "مُسالمة" بالفعل، ^{[ 203 ]} بما في ذلك إنشاء هيئة تشريعية من مجلسين ، وحكومات ذاتية الحكم على المستويين الإقليمي والبلدي، ونظام مدارس ابتدائية عامة مجانية. ^{[ 204 ]} قُدِّمت هذه التوصيات في ظل وجود الكونغرس التمثيلي، والحكومات البلدية والإقليمية، ونظام التعليم العام الذي أنشأته وأدارته الحكومة الفلبينية منذ عهد الحكومة الثورية فصاعدًا. ^{[ 205 ]}

في الثاني من نوفمبر عام 1900، وقّع شورمان البيان التالي:

إذا ما سُحبت سلطتنا لأي سبب كان، ترى اللجنة أن حكومة الفلبين ستنزلق سريعًا إلى الفوضى ، مما سيبرر، إن لم يكن يستلزم، تدخل قوى أخرى وتقسيم الجزر فيما بينها. ولذلك، فإن فكرة قيام كومنولث فلبيني حر، يتمتع بالحكم الذاتي، وموحد، لا يمكن تصورها إلا من خلال الاحتلال الأمريكي. ويدرك جميع الفلبينيين الواعين، وحتى أولئك المتمردين الذين يرغبون في الحماية الأمريكية، الحاجة المُلحة من وجهة نظر الفلبينيين إلى الحفاظ على السيادة الأمريكية على الأرخبيل. صحيح أن هؤلاء الأخيرين سيأخذون الإيرادات ويتركون لنا المسؤوليات، إلا أنهم يُقرّون بحقيقة لا جدال فيها، وهي أن الفلبينيين لا يستطيعون الوقوف بمفردهم. وهكذا، فإن مصلحة الفلبينيين تتوافق مع مقتضيات الشرف الوطني في منعنا من التخلي عن الأرخبيل. لا يمكننا بأي حال من الأحوال التهرب من مسؤوليات الحكم التي تستلزمها سيادتنا. وتؤمن اللجنة إيماناً راسخاً بأن أداء واجبنا الوطني سيُثبت أنه أعظم نعمة لشعوب جزر الفلبين. [...] ^{[ 206 ]}

مُنحت اللجنة الفلبينية الثانية، التي عيّنها الرئيس ماكينلي في 16 مارس 1900 برئاسة ويليام هوارد تافت ، صلاحيات تشريعية بالإضافة إلى صلاحيات تنفيذية محدودة. ^{[ 207 ]} وفي الأول من سبتمبر، بدأت لجنة تافت بممارسة وظائفها التشريعية. ^{[ 208 ]} وبين سبتمبر 1900 وأغسطس 1902، أصدرت اللجنة 499 قانونًا. ^{[ 209 ]} أنشأت اللجنة جهازًا مدنيًا ونظامًا قضائيًا شمل محكمة عليا ، ووُضع قانونٌ ليحل محل القوانين الإسبانية القديمة. نصّ قانون البلديات لعام 1901 على نظام جديد للحكم المحلي برعاية أمريكية، يتألف من رؤساء ونواب رؤساء وأعضاء مجالس منتخبين شعبيًا للعمل في المجالس البلدية . كان أعضاء المجالس البلدية مسؤولين عن تحصيل الضرائب، وصيانة الممتلكات البلدية، وتنفيذ مشاريع البناء الضرورية؛ كما انتخبوا حكام الأقاليم. ^{[ 24 ] [ 210 ] [ 204 ]}

اعترض بعض الأمريكيين، ولا سيما ويليام جينينغز برايان، ومارك توين، وأندرو كارنيجي، وإرنست كروسبي ، وغيرهم من أعضاء الرابطة الأمريكية المناهضة للإمبريالية، بشدة على ضم الفلبين. وزعمت الحركات المناهضة للإمبريالية أن الولايات المتحدة أصبحت قوة استعمارية. ^{[ 211 ] [ 212 ]}

عارض بعض مناهضي الإمبريالية ضم الفلبين لأسباب عنصرية. وكان من بينهم السيناتور بنجامين تيلمان من ولاية كارولاينا الجنوبية، الذي خشي من أن يؤدي ضم الفلبين إلى تدفق المهاجرين غير البيض إلى الولايات المتحدة. كما أبدى آخرون قلقهم من أن يؤدي ضم الفلبين إلى منح السكان غير البيض دورًا في الحكومة الأمريكية. ^{[ 213 ]}

مع وصول أنباء الفظائع المرتكبة في سبيل إخضاع الفلبين إلى الولايات المتحدة، تراجع الدعم للحرب. ^{[ 214 ] [ 215 ]}

مارك توين

عارض مارك توين الحرب مستخدماً نفوذه في الصحافة، قائلاً إنها خانت مُثُل الديمقراطية الأمريكية بمنعها الشعب الفلبيني من اختيار مصيره.

هناك قضية الفلبين. لقد بذلتُ قصارى جهدي، ومع ذلك لا أستطيع بتاتًا أن أفهم كيف وقعنا في هذه الورطة. ربما لم يكن بوسعنا تجنبها - ربما كان من المحتوم أن نخوض حربًا ضد سكان تلك الجزر - لكنني عاجز عن فهمها، ولم أتمكن قط من الوصول إلى جذور عدائنا لهم. كنتُ أظن أن علينا أن نكون حماةً لهم - لا أن نسعى لإخضاعهم. كان من المفترض أن نُحررهم من الاستبداد الإسباني لتمكينهم من إقامة حكومتهم الخاصة، وأن نقف إلى جانبهم ونتأكد من حصولها على محاكمة عادلة. لم يكن من المفترض أن تكون حكومةً وفقًا لأفكارنا، بل حكومةً تُمثل شعور أغلبية الفلبينيين، حكومةً وفقًا لأفكارهم. كانت ستكون تلك مهمةً جديرةً بالولايات المتحدة. أما الآن - يا للعجب، لقد وقعنا في ورطة، في مستنقعٍ تُزيد كل خطوةٍ جديدةٍ فيه من صعوبة الخروج منه. أنا متأكد من أنني أتمنى لو أستطيع أن أرى ما كنا نحصل عليه من ذلك، وكل ما يعنيه لنا كأمة. ^{[ 217 ]}    

في مقطع من مذكراته، يشير توين إلى القوات الأمريكية بـ"قتلتنا المرتدين للزي العسكري"، ويصف قتلهم "لستمائة من المتوحشين العزل العاجزين عن الحركة" في الفلبين بأنه "نزهة طويلة وسعيدة، لا يفعلون فيها شيئًا سوى الجلوس في راحة، وإطلاق النار على هؤلاء الناس هناك، وتخيل كتابة رسائل إلى عائلاتهم المُعجبة، وتكديس المجد فوق المجد". ^{[ 218 ]}

أيد بعض المقربين من أغينالدو أمريكا حتى قبل اندلاع الأعمال العدائية. فقد دعا بيدرو باتيرنو ، رئيس الوزراء السابق ومؤلف معاهدة الهدنة مع إسبانيا عام 1897، إلى ضم الفلبين إلى الولايات المتحدة عام 1898. ومن بين المقربين الآخرين المتعاطفين مع الولايات المتحدة: ترينيداد باردو دي تافيرا وبينيتو ليغاردا ، وهما عضوان بارزان في الكونغرس؛ وغريغوريو أرانيتا ، وزير العدل في عهد أغينالدو؛ وفيليبي بوينكامينو ، وزير الخارجية في عهد أغينالدو . وقد نُقل عن بوينكامينو قوله عام 1902: "أنا أمريكي، وكل ما في الفلبين من مال وهواء وضوء وشمس أعتبره أمريكياً". وشغل العديد من المؤيدين لاحقاً مناصب في الحكومة الاستعمارية. ^{[ 219 ]}

قام الكابتن ماثيو أرلينغتون باتسون من الجيش الأمريكي بتشكيل كشافة ماكابيبي ^{[ 220 ]} كقوة حرب عصابات محلية لمحاربة القوات الفلبينية من بين قبيلة تحمل نفس الاسم ولها تاريخ من العداء مع التاغالوغ . ^{[ 221 ]}

بعد انتهاء الحكم العسكري في 4 يوليو 1901، ^{[ 148 ]} تأسست الشرطة الوطنية الفلبينية كقوة شرطة تغطي الأرخبيل بأكمله لمكافحة قطاع الطرق والتعامل مع فلول الجمهورية. وقد تولت الشرطة الوطنية الفلبينية، التي نُظمت وقادها في البداية العميد هنري تورمان ألين ، تدريجيًا مسؤولية قمع أنشطة القوات المعادية. ^{[ 24 ]} وظلت فلول جمهورية أغينالدو، وبقايا منظمة كاتيبونان ، التي سبقت الوجود الأمريكي، وجماعات المقاومة الأخرى نشطة، تقاتل لما يقرب من عقد من الزمان بعد انتهاء الحرب رسميًا. ^{[ 222 ]} إلا أنه بعد انتهاء الحرب، فضل الحاكم العام تافت الاعتماد على الشرطة الوطنية الفلبينية والتعامل مع هذا الأمر باعتباره شأنًا يتعلق بإنفاذ القانون. وهكذا تم تصنيف أعمال حركات المقاومة المتبقية هذه على أنها أعمال سطو أو قطاع طرق، ورفضتها الحكومة الأمريكية باعتبارها قطاع طرق ومتعصبين وسارقي ماشية.

على الرغم من توقف معظم القتال في الفلبين عقب استسلام أغينالدو في أبريل 1901، استمرت القوات القومية في المقاومة في بعض المناطق، لا سيما في سامار تحت قيادة لوكبان وفي باتانغاس تحت قيادة مالفار. ^{[ g ]} وبموجب المادة 3 من القانون الأساسي، ^{[ h ]} استخدم الرئيس روزفلت القوات العسكرية الأمريكية لقمع جيوب المقاومة هذه. وأدت مذبحة بالانجيجا في 28 سبتمبر 1901 إلى إطلاق عملية تهدئة أمريكية واسعة النطاق في سامار . وفي باتانغاس ، طارد العميد ج. فرانكلين بيل مالفار ورجاله بلا هوادة من عام 1901 وحتى الأشهر الأولى من عام 1902، مما أجبر العديد من الجنود الفلبينيين على الاستسلام. استسلم مالفار في 16 أبريل 1902، برفقة زوجته المريضة وأطفاله وبعض ضباطه. ^{[ 225 ] [ 152 ]} وبحلول نهاية الشهر، استسلم ما يقرب من 3000 من رجال مالفار. ^{[ 226 ]}

في عام ١٩٠٢، أسس ماكاريو ساكاي جمهورية كاتاغالوغ ، مدعيًا خلافة الجمهورية الفلبينية الأولى، في مورونغ على خطى كاتيبونان، على عكس جمهورية أغينالدو. انتهت هذه الجمهورية عام ١٩٠٦ عندما استسلم ساكاي وكبار أتباعه بناءً على عرض عفو من السلطات الأمريكية. لكن بدلًا من ذلك، ألقت قوات الشرطة بقيادة العقيد هاري هيل باندولتز القبض عليهم وأعدمتهم في العام التالي. ^{[ ٢٢٧ ] [ ٢٢٨ ] [ ٢٢٩ ] : ٢٠٠-٢٠٢ [ ٢٣٠ ]}

ابتداءً من عام ١٩٠٣، أصبحت أعمال السطو التي تقوم بها جماعات منظمة مشكلة في بعض المقاطعات النائية في فيساياس . من بين هذه الجماعات كانت جماعة بولاهان (بالإسبانية: Pulajanes )، الذين كانوا من مرتفعات سامار وليتي . يُشتق المصطلح من الكلمة المحلية "بولا " التي تعني "أحمر"، حيث تميزوا بملابسهم الحمراء. ^{[ ٢٣١ ]} كان البولاهانيون يعتنقون مزيجًا من المعتقدات الكاثوليكية والشعبية . على سبيل المثال، كانوا يعتقدون أن بعض التمائم التي تُسمى "أجيمات" ستجعلهم محصنين ضد الرصاص. هُزمت آخر هذه الجماعات أو استسلمت لقوات الشرطة الفلبينية بحلول عام ١٩١١. ^{[ ٢٣١ ] [ ٢٢٢ ]}

وقّعت الحكومة الأمريكية معاهدة كيرام-بيتس مع سلطنة سولو عند اندلاع الحرب، وكان الهدف منها منع المقاومة في ذلك الجزء من الفلبين (الذي شمل أجزاءً من مينداناو ، وأرخبيل سولو ، وبالاوان ، وصباح ). ^{[ 232 ]} واختلفت المعاهدة، المكتوبة باللغتين التاوسوغية والإنجليزية، في أن النص التاوسوغي الذي صادق عليه السلطان اعترف فقط بـ"السيادة والقوة الأمريكية"، بينما منح النص الإنجليزي الذي صادق عليه الأمريكيون الولايات المتحدة الحق في احتلال السلطنة. ^{[ 233 ]} وبعد قمع الجمهورية الفلبينية، بدأت الولايات المتحدة غزو أراضي مورو، مما أدى إلى اندلاع ثورة مورو ، ^{[ 234 ]} التي بدأت بمعركة بايان في مايو 1902. واستمرت الثورة حتى معركة بود باجساك في يونيو 1913، حيث هُزمت قوات مورو بقيادة داتو أميل على يد القوات الأمريكية بقيادة العميد جون ج. بيرشينغ . مثلت المعركة نهاية الصراع المورو؛ واستمرت المفاوضات بين السلطات الأمريكية وسلطنة سولو حتى حل الأخيرة في مارس 1915. ^{[ 235 ]}

حظر قانون صدر عام ١٩٠٧ عرض الأعلام والرموز الأخرى "المستخدمة خلال الانتفاضة الأخيرة في جزر الفلبين". ^{[ ١٤٦ ] [ ٢٣٦ ] [ ٢٣٧ ]} ويعتبر بعض المؤرخين هذه التوسعات غير الرسمية جزءًا من الحرب. ^{[ ٢٣٨ ] [ ٢٣٩ ] [ ٢٤٠ ] [ ٢٤١ ]} وبعد الحرب، ظلت حركة الاستقلال الفلبينية نشطة، مع اندلاع أعمال عنف متفرقة. ^{[ ٢٤٢ ]}

تضاءل نفوذ الكنيسة الكاثوليكية الرومانية عندما قامت حكومة الولايات المتحدة العلمانية بفصل الكنيسة عن الدولة، واشترت أراضيها وأعادت توزيعها (كانت جمهورية الفلبين قد فصلت الكنيسة عن الدولة عند تأسيسها في يناير 1899، كما استولت على جميع الأراضي المملوكة للرهبانيات لإعادة توزيعها، لكنها لم تتمكن من إتمام هذه السياسة بسبب الحرب). ^{[ 24 ] [ 243 ]} بلغت مساحة الأرض 170,917 هكتارًا (422,350 فدانًا) ، والتي طلبت الكنيسة في عهد البابا ليو الثالث عشر مبلغ 12,086,438.11 دولارًا أمريكيًا مقابلها في مارس 1903. ^{[ 244 ]} اكتملت عملية الشراء في 22 ديسمبر 1903، بسعر بيع قدره 7,239,784.66 دولارًا أمريكيًا. ^{[ 245 ]} نُصَّ على برنامج إعادة توزيع الأراضي في ثلاثة قوانين على الأقل: القانون الأساسي الفلبيني، ^{[ 210 ]} وقانون الأراضي العامة، ^{[ 246 ]} وقانون أراضي الرهبان. ^{[ 247 ] [ 248 ]} حددت المادة 10 من قانون الأراضي العامة الحد الأقصى للشراء بـ 16 هكتارًا للفرد أو 1024 هكتارًا للشركات أو الجمعيات المماثلة. ^{[ 246 ] [ 249 ]} كما عُرضت الأراضي للإيجار للمزارعين المعدمين، بأسعار تتراوح بين 50 سنتًا و1 بيزو، و50 سنتًا للهكتار الواحد سنويًا. ^{[ 246 ] [ 249 ]} ونصت المادة 28 من قانون الأراضي العامة على أن عقود الإيجار تسري لمدة أقصاها 25 عامًا، قابلة للتجديد لمدة 25 عامًا أخرى. ^{[ 246 ] [ 249 ]}

في عام ١٩٠١، وصل ما لا يقل عن خمسمائة معلم (٣٦٥ ذكراً و١٦٥ أنثى) من الولايات المتحدة على متن السفينة الأمريكية " توماس  ". أُطلق على هؤلاء المعلمين اسم "التوماسيين"، الذين أسسوا النظام التعليمي الأمريكي في البلاد. وشملت مهامهم مناطق ألباي ، وكاتاندوانيس ، وكامارينس نورتي ، وكامارينس سور ، وسورسوجون ، وماسبات ، وهي ما تُعرف اليوم بمنطقة بيكول ، التي قاومت بشدة الحكم الأمريكي. توفي سبعة وعشرون من التوماسيين الأصليين إما بسبب أمراض استوائية أو قُتلوا على يد المتمردين الفلبينيين خلال أول عشرين شهراً من إقامتهم. ورغم هذه المصاعب، ثابر التوماسيون على التدريس وبناء المؤسسات التعليمية. فافتتحوا المدرسة الفلبينية للمعلمين ( جامعة الفلبين للمعلمين حالياً ) والمدرسة الفلبينية للفنون والحرف (PSAT) في عام ١٩٠١، وأعادوا افتتاح المدرسة البحرية الفلبينية ، التي أنشأها مجلس التجارة في مانيلا عام ١٨٣٩ تحت الحكم الإسباني. بحلول نهاية عام 1904، كان يتم تدريس المقررات الابتدائية في الغالب من قبل الفلبينيين تحت إشراف أمريكي. ^{[ 250 ]}

بحسب المؤرخ دانيال إيمروار ، فإن أول 15 ضابطًا أمريكيًا شغلوا منصب رئيس أركان الجيش الأمريكي خدموا جميعًا في الحرب الفلبينية الأمريكية. ^{[ 251 ]} وقد شغل بعض قدامى المحاربين في الحرب، بمن فيهم دوغلاس ماك آرثر ، ووالتر كروجر ، وإينيس ب. سويفت ، وراب براش، مناصب قيادية عليا في الحملة الأمريكية لتحرير الفلبين من الإمبراطورية اليابانية خلال الحرب العالمية الثانية.

منذ البداية، عرّف رؤساء الولايات المتحدة وممثلوهم في الجزر مهمتهم الاستعمارية بأنها وصاية: إعداد الفلبين للاستقلال في نهاية المطاف. ^{[ 252 ]} باستثناء مجموعة صغيرة من "المؤيدين للاحتفاظ بالحكم الذاتي"، لم تكن المسألة ما إذا كانت الفلبين ستُمنح الحكم الذاتي، بل متى وتحت أي شروط. ^{[ 252 ]} وقد تسارع التطور السياسي في البلاد بفضل الفلبينيين الذين سعوا إلى استعادة الاستقلال بالوسائل السياسية. نصّ قانون الفلبين الأساسي الصادر في يوليو 1902 على أنه عند القضاء التام على القوات الفلبينية السابقة، سيتم إنشاء هيئة تشريعية تتألف من مجلس أدنى منتخب شعبيًا، وهو الجمعية الفلبينية، ومجلس أعلى يتألف من اللجنة الفلبينية، التي يعينها رئيس الولايات المتحدة. ^{[ 24 ]}

نصّ قانون جونز ، الذي أقره الكونغرس الأمريكي عام ١٩١٦ ليكون القانون الأساسي في الفلبين، على وعد بالاستقلال في نهاية المطاف، وأنشأ مجلس شيوخ فلبيني منتخب . أما قانون تايدينغز-ماكدوفي (المعروف رسميًا باسم قانون استقلال الفلبين؛ القانون العام ٧٣-١٢٧)، الذي أُقرّ في ٢٤ مارس ١٩٣٤، فقد نصّ على الحكم الذاتي والاستقلال بعد عشر سنوات. إلا أن الحرب العالمية الثانية حالت دون ذلك، وفرضت الاحتلال الياباني للفلبين بين عامي ١٩٤١ و١٩٤٥. وفي عام ١٩٤٦، نصّت معاهدة مانيلا بين حكومتي الولايات المتحدة وجمهورية الفلبين على الاعتراف باستقلال الفلبين والتخلي عن السيادة الأمريكية على الجزر.