إي جي آر 1
| إي جي آر 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| المعرفات | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| أسماء مستعارة | EGR1 ، AT225، G0S30، KROX-24، NGFI-A، TIS8، ZIF-268، ZNF225، استجابة النمو المبكر 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| معرفات خارجية | أوميم : 128990; إم جي آي : 95295; هومولوجيني : 56394؛ بطاقات الجينات : EGR1؛ OMA :EGR1 - أخصائيو تقويم العظام | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ويكي بيانات | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EGR-1 (بروتين الاستجابة للنمو المبكر 1) والمعروف أيضًا باسم ZNF268 (بروتين إصبع الزنك 268) أو NGFI-A (بروتين A المحفز بعامل نمو الأعصاب) هو بروتين يتم ترميزه في البشر بواسطة جين EGR1 .
EGR-1 هو عامل نسخ ثديي . وقد تم تسميته أيضًا Krox-24 وTIS8 و ZENK . تم اكتشافه في الأصل في الفئران .
وظيفة
ينتمي البروتين المشفر بواسطة هذا الجين إلى عائلة EGR من بروتينات إصبع الزنك من النوع Cys 2 His 2. وهو بروتين نووي ويعمل كمنظم نسخي. إن منتجات الجينات المستهدفة التي ينشطها مطلوبة للتمايز والتكاثر الخلوي . تشير الدراسات إلى أن هذا هو جين مثبط للورم . [5]
إن له نمطًا مميزًا من التعبير في الدماغ، وقد ثبت أن تحفيزه مرتبط بالنشاط العصبي. تشير العديد من الدراسات إلى أنه يلعب دورًا في مرونة الخلايا العصبية . [6]
يُعد EGR-1 عامل نسخ مهم في تكوين الذاكرة . وله دور أساسي في إعادة برمجة الخلايا العصبية في الدماغ . يجند EGR-1 بروتين TET1 الذي يبدأ مسار نزع الميثيل من الحمض النووي . [7] يسمح إزالة علامات ميثلة الحمض النووي بتنشيط الجينات الموجودة في المصب. يتم استخدام EGR-1، جنبًا إلى جنب مع TET1، في برمجة توزيع مواقع الميثيل على الحمض النووي في الدماغ أثناء نمو الدماغ، وفي التعلم وفي اللدونة العصبية طويلة المدى . كما وجد أن EGR-1 ينظم التعبير عن VAMP2 (بروتين مهم للإخراج الخلوي المشبكي ). [8]
بجانب وظيفته في الجهاز العصبي، هناك أدلة مهمة على أن EGR-1 جنبًا إلى جنب مع نظيره EGR-2 الذي يتم تحريضه في الأمراض التليفية له وظائف رئيسية في تكوين الفيبرين وهو ضروري للتليف المستحث تجريبياً في الفئران. [9]
وقد يكون له أيضًا دور في وظيفة المبيض [10]
بناء
يتكون مجال ربط الحمض النووي لـ EGR-1 من ثلاثة مجالات أصابع الزنك من نوع Cys 2 His 2. يتم تقديم بنية الأحماض الأمينية لمجال إصبع الزنك EGR-1 في هذا الجدول، باستخدام رمز الحمض الأميني المكون من حرف واحد. يتم الإشارة إلى الأصابع من 1 إلى 3 بواسطة f1 - f3. تشير الأرقام إلى بقايا (أحماض أمينية) الحلزون ألفا (لا يوجد صفر). البقايا التي تحمل علامة "x" ليست جزءًا من أصابع الزنك، بل تعمل على ربطها جميعًا معًا.
| -1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | س | س | س | س | س | |||||||||||||||||||||||
| ف1 | م | أ | هـ | هـ | ر | ص | ي | أ | ج | ص | الخامس | هـ | س | ج | د | ر | ر | ف | س | ر | س | د | هـ | ل | ت | ر | ح | أنا | ر | أنا | ح | ت | ج | س | ك | ص | |
| ف2 | ف | س | ج | ر | أنا | - | - | ج | م | ر | ن | ف | س | ر | س | د | ح | ل | ت | ت | ح | أنا | ر | ت | ح | ت | ج | هـ | ك | ص | |||||||
| ف3 | ف | أ | ج | د | أنا | - | - | ج | ج | ر | ك | ف | أ | ر | س | د | هـ | ر | ك | ر | ح | ت | ك | أنا | ح | ل | ر | س | ك | د |
مفتاح الأحماض الأمينية: ألانين (Ala, A)، أرجينين (Arg, R)، أسباراجين (Asn, N)، حمض الأسبارتيك (Asp, D)، سيستين (Cys, C)، حمض الجلوتاميك (Glu, E)، جلوتامين (Gln, Q)، جلايسين (Gly, G)، هيستيدين (His, H)، إيزوليوسين (Ile, I)، ليوسين (Leu, L)، ليسين (Lys, K)، ميثيونين (Met, M)، فينيل ألانين (Phe, F)، برولين (Pro, P)، سيرين (Ser, S)، ثريونين (Thr, T)، تريبتوفان (Trp, W)، تيروزين (Tyr, Y)، فالين (Val, V)
تم حل البنية البلورية للحمض النووي المرتبط بمجال إصبع الزنك في EGR-1 في عام 1991، مما ساعد بشكل كبير في الأبحاث المبكرة في مجالات ربط الحمض النووي بإصبع الزنك. [11]
يحتوي بروتين EGR-1 البشري (في شكله غير المعالج) على 543 حمضًا أمينيًا بوزن جزيئي يبلغ 57.5 كيلو دالتون ، ويقع الجين على الكروموسوم 5 .
خصوصية ربط الحمض النووي
يرتبط EGR-1 بتسلسل الحمض النووي 5'-GCG TGG GCG-3' (وتسلسلات مماثلة مثل 5'-GCG GGG GCG-3'). [12] [13] يرتبط موضع f1 6 بـ 5'G (عدد القواعد الأول من اليسار)؛ يرتبط موضع f1 3 بالقاعدة الثانية (C)؛ يرتبط موضع f1 -1 بالموضع الثالث (G)؛ يرتبط موضع f2 6 بالقاعدة الرابعة (T)؛ وهكذا.
التفاعلات
لقد ثبت أن EGR-1 يتفاعل مع:
- سي إي بي بي بي ، [14]
- بروتين رابط لـ CREB ، [15]
- إي بي 300 ، [15]
- ناب1 ، [16]
- ص53 ، [17] و
- PSMA3 [18]
انظر أيضا
مراجع
- ^ abc GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000120738 – Ensembl ، مايو 2017
- ^ abc GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000038418 – Ensembl ، مايو 2017
- ^ "مرجع PubMed البشري:". المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ^ "مرجع PubMed الخاص بالفأرة:". المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ^ "جين Entrez: استجابة النمو المبكر لـ EGR1 1".
- ^ Knapska E, Kaczmarek L (نوفمبر 2004). "جين المرونة العصبية في دماغ الثدييات: Zif268/Egr-1/NGFI-A/Krox-24/TIS8/ZENK؟". التقدم في علم الأعصاب . 74 (4): 183-211. doi :10.1016/j.pneurobio.2004.05.007. PMID 15556287. S2CID 39251786.
- ^ Sun Z, Xu X, He J, Murray A, Sun MA, Wei X, Wang X, McCoig E, Xie E, Jiang X, Li L, Zhu J, Chen J, Morozov A, Pickrell AM, Theus MH, Xie H. EGR1 يجند TET1 لتشكيل ميثيلوم الدماغ أثناء النمو وعند النشاط العصبي. Nat Commun. 29 أغسطس 2019؛ 10(1): 3892. doi: 10.1038/s41467-019-11905-3. PMID 31467272
- ^ Petersohn D, Thiel G (أغسطس 1996). "دور بروتينات إصبع الزنك Sp1 وzif268/egr-1 في التنظيم النسخي لجين synaptobrevin II البشري". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 239 (3): 827–34. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0827u.x . PMID 8774732.
- ^ Bhattacharyya S, Wu M, Fang F, Tourtellotte W, Feghali-Bostwick C, Varga J (مايو 2011). "عوامل النسخ للاستجابة للنمو المبكر: الوسطاء الرئيسيون للتليف والأهداف الجديدة للعلاج المضاد للتليف". Matrix Biology . 30 (4): 235–42. doi :10.1016/j.matbio.2011.03.005. PMC 3135176. PMID 21511034 .
- ^ هان ب، جيريرو-نيترو هـ، إستيان أ، كاو ب، برايس سي إيه (أكتوبر 2017). "تنظيم وعمل استجابة النمو المبكر 1 في خلايا الحبيبات البقرية". التكاثر . 154 (4): 547-557. doi : 10.1530/REP-17-0243 . PMID 28733346.
- ^ Pavletich NP, Pabo CO (مايو 1991). "التعرف على إصبع الزنك-الحمض النووي: البنية البلورية لمجمع Zif268-الحمض النووي عند 2.1 أمبير". Science . 252 (5007): 809–17. doi :10.1126/science.2028256. PMID 2028256. S2CID 38000717.
- ^ كريستي ب، ناثانز د (نوفمبر 1989). "موقع ربط الحمض النووي للبروتين القابل للتحريض بواسطة عامل النمو Zif268". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 86 (22): 8737–41. Bibcode :1989PNAS...86.8737C. doi : 10.1073/pnas.86.22.8737 . PMC 298363. PMID 2510170 .
- ^ Swirnoff AH, Milbrandt J (أبريل 1995). "خصوصية ارتباط الحمض النووي بـ NGFI-A وعوامل النسخ المرتبطة بأصابع الزنك". علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 15 (4): 2275-87. doi :10.1128/mcb.15.4.2275. PMC 230455. PMID 7891721 .
- ^ Zhang F, Lin M, Abidi P, Thiel G, Liu J (نوفمبر 2003). "التفاعل المحدد بين Egr1 وc/EBPbeta يؤدي إلى التنشيط النسخي لجين مستقبل البروتين الدهني منخفض الكثافة لدى البشر". مجلة الكيمياء الحيوية . 278 (45): 44246–54. doi : 10.1074/jbc.M305564200 . PMID 12947119.
- ^ ab Silverman ES, Du J, Williams AJ, Wadgaonkar R, Drazen JM, Collins T (نوفمبر 1998). "cAMP-response-element-binding-protein-binding protein (CBP) and p300 are copyional co-activators of early growth response factor-1 (Egr-1)". The Biochemical Journal . 336 (Pt 1) (1): 183–9. doi :10.1042/bj3360183. PMC 1219856. PMID 9806899 .
- ^ Russo MW, Sevetson BR, Milbrandt J (يوليو 1995). "تحديد NAB1، وهو مثبط للنسخ بوساطة NGFI-A وKrox20". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 92 (15): 6873–7. Bibcode :1995PNAS...92.6873R. doi : 10.1073/pnas.92.15.6873 . PMC 41432. PMID 7624335 .
- ^ Liu J, Grogan L, Nau MM, Allegra CJ, Chu E, Wright JJ (أبريل 2001). "التفاعل الفيزيائي بين p53 وجين الاستجابة الأولية Egr-1". المجلة الدولية لعلم الأورام . 18 (4): 863-70. doi :10.3892/ijo.18.4.863. PMID 11251186.
- ^ Bae MH, Jeong CH, Kim SH, Bae MK, Jeong JW, Ahn MY, et al. (أكتوبر 2002). "تنظيم Egr-1 عن طريق الارتباط بمكون البروتيازوم C8". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1592 (2): 163–7. doi : 10.1016/s0167-4889(02)00310-5 . PMID 12379479.
قراءة إضافية
- هيث آر جي (مارس 1975). "وظيفة الدماغ والسلوك. الأول. الظواهر العاطفية والحسية لدى المرضى المصابين بالذهان وفي الحيوانات التجريبية". مجلة الأمراض العصبية والعقلية . 160 (3): 159-75. doi :10.1097/00005053-197503000-00002. PMID 1090709. S2CID 23024944.
- Silverman ES, Collins T (مارس 1999). "مسارات النسخ الجيني بوساطة Egr-1 في علم الأحياء الوعائي". المجلة الأمريكية لعلم الأمراض . 154 (3): 665-70. doi :10.1016/S0002-9440(10)65312-6. PMC 1866415. PMID 10079243 .
- Adamson ED, Mercola D (2002). "عامل نسخ Egr1: أدوار متعددة في نمو خلايا ورم البروستاتا وبقائها". علم الأحياء الورمي . 23 (2): 93-102. doi :10.1159/000059711. PMID 12065847. S2CID 46795197.
- Blaschke F, Bruemmer D, Law RE (أغسطس 2004). "Egr-1 هو عامل نسخ ممرض وعائي رئيسي في تصلب الشرايين وإعادة تضيق الشرايين". مراجعات في اضطرابات الغدد الصماء والتمثيل الغذائي . 5 (3): 249-54. doi :10.1023/B:REMD.0000032413.88756.ee. PMID 15211096. S2CID 11968305.
- عبد القادر س. أ. (نوفمبر 2005). "آليات تكوّن الأورام في البروستاتا: أدوار عوامل النسخ Nkx3.1 وEgr1". حوليات أكاديمية نيويورك للعلوم . 1059 (1): 33-40. رمز Bibcode :2005NYASA1059...33A. doi :10.1196/annals.1339.018. PMID 16382041. S2CID 6774788.
- Khachigian LM (فبراير 2006). "استجابة النمو المبكر-1 في أمراض القلب والأوعية الدموية". Circulation Research . 98 (2): 186–91. doi : 10.1161/01.RES.0000200177.53882.c3 . PMID 16456111.
روابط خارجية
- Zif+268+protein,+human في المكتبة الوطنية الأمريكية للطب، العناوين الطبية (MeSH)
- فاكتوربوك إي جي آر-1
- نظرة عامة على جميع المعلومات البنيوية المتوفرة في قاعدة بيانات البروتينات لـ UniProt : P18146 (بروتين الاستجابة المبكرة للنمو البشري 1) في PDBe-KB .
- نظرة عامة على جميع المعلومات البنيوية المتوفرة في قاعدة بيانات البروتينات لـ UniProt : P08046 (بروتين الاستجابة للنمو المبكر للفأر 1) في PDBe-KB .
